FastQCFastQC Report
Mon 28 Nov 2022
S1_Sudafrica.Tombus-like_virus_segment_2.15-35nt.reverse-mapped.fq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameS1_Sudafrica.Tombus-like_virus_segment_2.15-35nt.reverse-mapped.fq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences384
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length15-30
%GC55

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CATGTAACTCAGGGCCACCCA6416.666666666666664No Hit
ATGTAACTCAGGGCCACCCAC153.90625No Hit
TACGAGAACCCCCTTGATACC133.3854166666666665No Hit
CATGTAACTCAGGGCCACCCAA112.864583333333333No Hit
CCATGTAACTCAGGGCCACCC102.604166666666667No Hit
ATGTAACTCAGGGCCACCCACCA71.8229166666666667No Hit
GATGACGAGCAAACAAGAGGAGACAACA51.3020833333333335No Hit
ATGTAACTCAGGGCCACCCACA51.3020833333333335No Hit
CGTCCCATGTAACTCAGGGCCACCCACA41.0416666666666665No Hit
ATGTAACTCAGGGCCACCCA41.0416666666666665No Hit
CCAGAAACTGCTTGCCCCAAT41.0416666666666665No Hit
CATGTAACTCAGGGCCACCC41.0416666666666665No Hit
TAGCGCACTGATAGGTAGAAA41.0416666666666665No Hit
ATGTAACTCAGGGCCACCCACC41.0416666666666665No Hit
TGTCCAGAAACTGCTTGCCCCA41.0416666666666665No Hit
TTATGTGTCCAGAAACTGCTTGCC30.78125No Hit
CATGTAACTCAGGGCCACCCAC30.78125No Hit
TGGCACTTACGAGAACCCCCT30.78125No Hit
CCCATGTAACTCAGGGCCACCCA30.78125No Hit
AGAATCGCTAGTGCCTCGGGCA30.78125No Hit
AGACCGATCTGAGTCAGGAAG30.78125No Hit
ACTAAGTAGCAGGCCGAGGGC30.78125No Hit
TTGGCGGACCATATGACTGC30.78125No Hit
GTCCAGAAACTGCTTGCCCCAC30.78125No Hit
ACTATGGGAGGTTCGTCACAC30.78125No Hit
CGCAGCATACTCCCATTGGACCA30.78125No Hit
CGGACTCGCTCGCGCTGCTGC30.78125No Hit
TCCCATGTAACTCAGGGCCACCCA30.78125No Hit
ACGAGAACCCCCTTGATACCG30.78125No Hit
GCGAGCAAACCAGTGACCTGAACCTGAAC30.78125No Hit
GCATCACTGTACGGATGATGACGAGCAAAC30.78125No Hit
TGTGTCCAGAAACTGCTTGCCA30.78125No Hit
CGCATATGCCCGTCTCAGTCC30.78125No Hit
ATTTGGCGGACCATATGACTG30.78125No Hit
GACCTGAACCTGAACACACTG20.5208333333333333No Hit
TGTAGCGCACTGATAGGT20.5208333333333333No Hit
TCGAGATGCTGTATGTCATACTT20.5208333333333333No Hit
AGAATCGCTAGTGCCTCGGGC20.5208333333333333No Hit
CGACTTTGTTCGGGCCAGCCAG20.5208333333333333No Hit
ATATTTGGCGGACCATATGAC20.5208333333333333No Hit
CACACCCCGGCGCGGACTCGCA20.5208333333333333No Hit
CCATGTAACTCAGGGCCACCCA20.5208333333333333No Hit
ACCTGAACCTGAACACACTGC20.5208333333333333No Hit
AGAATCGCTAGTGCCTCGGGCC20.5208333333333333No Hit
CCTGAACCTGAACACACTGC20.5208333333333333No Hit
TGTAACTCAGGGCCACCCACA20.5208333333333333No Hit
GGAAGTTGGTGATCCCTGTGAA20.5208333333333333No Hit
AGCGCACTGATAGGT20.5208333333333333No Hit
CATATGCCCGTCTCAGTCCCCA20.5208333333333333No Hit
TGTCCAGAAACTGCTTGCCCC20.5208333333333333No Hit
TGACCTGAACCTGAACACACT20.5208333333333333No Hit
GGGAGGTTCGTCACAC20.5208333333333333No Hit
GCACTGATAGGTAGAAAACAATGAGAGC20.5208333333333333No Hit
ATGTAACTCAGGGCCACCCACCT20.5208333333333333No Hit
CGAGCAAACCAGTGACCTGAA20.5208333333333333No Hit
CACACTGGGTAGATGCGAGCAAA20.5208333333333333No Hit
ACTGTACGGATGATGACGAGCAC20.5208333333333333No Hit
GTAGGCGCGATCGCATCTGGC20.5208333333333333No Hit
ATATGCCCGTCTCAGTCCCCCCA20.5208333333333333No Hit
ATACCGGCGCGGACCACTTGC20.5208333333333333No Hit
AATGAGAGCAGTCGGTATATC20.5208333333333333No Hit
AAGGTTCCATCACGCAGCACA20.5208333333333333No Hit
AGATGCGAGCAAACCAGTGACC20.5208333333333333No Hit
TGGATCTGAGAGTCAATTCGAAA20.5208333333333333No Hit
CACTTACGAGAACCCCCTTGATACC20.5208333333333333No Hit
TGTAGCGCACTGATAGGTAGAAA20.5208333333333333No Hit
TTACGAGAACCCCCTTGATACC20.5208333333333333No Hit
CCGAGTCCGACGCATATG20.5208333333333333No Hit
CGTCCCTGATCATTCCGCAAG20.5208333333333333No Hit
TGTTCGGGCCAGCCAGCAAGC10.26041666666666663No Hit
CTCCGAACACTAACGCAGCAT10.26041666666666663No Hit
ACTAAGTAGCAGGCCGAGGG10.26041666666666663No Hit
GGTGTAGCGCACTGATAGGTACC10.26041666666666663No Hit
CGCCGAACACTAACGCAGCA10.26041666666666663No Hit
CCATAGGGTCACACACG10.26041666666666663No Hit
TGGCGGACCATATGACTGCAT10.26041666666666663No Hit
CCAAAGGAGCGCACGGATTGGTA10.26041666666666663No Hit
GTCCAGAAACTGCTTGCCCCA10.26041666666666663No Hit
TGACTTCTAGTGGACACCGGGA10.26041666666666663No Hit
ATTCCGAGTCCGACGCATATG10.26041666666666663No Hit
CCCATGTAACTCAGGGCCACC10.26041666666666663No Hit
ATCATCGCATGCATCCAACACCA10.26041666666666663No Hit
CAGAAACTGCTTGCCCCAATA10.26041666666666663No Hit
TGCGGCTGGGCACCTAGCAGT10.26041666666666663No Hit
TACTAAGTAGCAGGCCGAGGG10.26041666666666663No Hit
AACCTGAACACACTGCATCAAA10.26041666666666663No Hit
TGACTTCTAGTGGACAC10.26041666666666663No Hit
CCGGTTTGGATCTTTGGCGACCA10.26041666666666663No Hit
ATGCCCGTCTCAGTCCC10.26041666666666663No Hit
CACACCCCGGCGCGGACTCGC10.26041666666666663No Hit
TCCAGAAACTGCTTGCCCCAAC10.26041666666666663No Hit
ATGTAACTCAGGGCCACC10.26041666666666663No Hit
TCTACTAAGTAGCAGGCCGAG10.26041666666666663No Hit
TGCGAGCAAACCAGTGACCTGAC10.26041666666666663No Hit
ACGGATGATGACGAGCAGACAA10.26041666666666663No Hit
CTTGATTCCGAGTCCGACGCA10.26041666666666663No Hit
CATATGCCCGTCTCAGTCCCCC10.26041666666666663No Hit
TGCCAGGGCGGCCGTAGGCGC10.26041666666666663No Hit
AGAAACTGCTTGCCCCAATA10.26041666666666663No Hit
GGTAGATGCGAGCAAACCAG10.26041666666666663No Hit
CTCTGGCCAGTATCGTGTTG10.26041666666666663No Hit
CGCATATGCCCGTCTCAGTCCA10.26041666666666663No Hit
TCTCATTATATTTGGCGGACCA10.26041666666666663No Hit
TGTAGCGCACTGATAGGTAGAAAACA10.26041666666666663No Hit
TGCGGGCAGCTCACAC10.26041666666666663No Hit
GGTAGCGTCCCTGATCATTCC10.26041666666666663No Hit
TTGTTGTTGGATCTGAGAGTC10.26041666666666663No Hit
ATTGTTGTTGGATCTGAGAGT10.26041666666666663No Hit
AAGTAACTCAGGGCCACCCAC10.26041666666666663No Hit
GTCCAGAAACTGCTTGCCCCAA10.26041666666666663No Hit
TGATTCCGAGTCCGACGCATA10.26041666666666663No Hit
GTACGGATGATGACGAGCAAAC10.26041666666666663No Hit
TGACCTGAACCTGAACACACTC10.26041666666666663No Hit
TGATACATCTTCCAGACCGA10.26041666666666663No Hit
CAGAAACTGCTTGCCCCAA10.26041666666666663No Hit
ATGTAACTCAGGGCCACCCACTA10.26041666666666663No Hit
GATGCGAGCAAACCAGTGACCTGATA10.26041666666666663No Hit
ACACTGGGTAGATGCGAGCAAA10.26041666666666663No Hit
TGTAGCGCACTGATAGGTAGAAAAC10.26041666666666663No Hit
TGTAACTCAGGGCCACCCA10.26041666666666663No Hit
TTGCCCCAATAGCCATAGACAC10.26041666666666663No Hit
TAGGTAACTCAGGGCCACCCA10.26041666666666663No Hit
TCCGAGTCCGACGCATATGCCT10.26041666666666663No Hit
GTGACCTGAACCTGAACACACCA10.26041666666666663No Hit
CTATCATCGCATGCATCCAAC10.26041666666666663No Hit
GTGTAGCGCACTGATAGGTAG10.26041666666666663No Hit
CTGGCCAGTATCGTGTTGTC10.26041666666666663No Hit
TGATACCGGCGCGGACCACTAAA10.26041666666666663No Hit
CGGGGCTGACTTCTAGTGGACC10.26041666666666663No Hit
CCAGAAACTGCTTGCCCCAACC10.26041666666666663No Hit
AAACCTCTAGCACTATTTTCCC10.26041666666666663No Hit
CCCATGTAACTCAGGGCCACCC10.26041666666666663No Hit
TCATTATATTTGGCGGACCAT10.26041666666666663No Hit
GATCCTGATGATAGTTGTTGT10.26041666666666663No Hit
CTTCTAGTGGACACCGGGTG10.26041666666666663No Hit
ATATTTGGCGGACCATATGA10.26041666666666663No Hit
GGGGTTGAGGTCGGTTGGTGC10.26041666666666663No Hit
TTGCGAGATAGGTTTTG10.26041666666666663No Hit
CCATGTAACTCAGGGCCACCCCA10.26041666666666663No Hit
GCAAACCAGTGACCTGAACCT10.26041666666666663No Hit
CATATGCCCGTCTCAGTCCC10.26041666666666663No Hit
ACCCAGAGCGTATGTGTCCA10.26041666666666663No Hit
GAGAACCCCCTTGATACCGGC10.26041666666666663No Hit
TGACTTCTAGTGGACACCGGG10.26041666666666663No Hit
CGGGGCTGACTTCTAGTGGAC10.26041666666666663No Hit
TCATTGTTGTTGGATCTGAG10.26041666666666663No Hit
AGCGCACTGATAGGTAGAAAA10.26041666666666663No Hit
GATGCGAGCAAACCAGTGACC10.26041666666666663No Hit
AAGTATATCCGAAACTTCTAGCACTATT10.26041666666666663No Hit
GAGCAAACCAGTGACCTGAACC10.26041666666666663No Hit
GTAGATGCGAGCAAACCAGTGACCTGT10.26041666666666663No Hit
TGGCACTTACGAGAACCCCCTT10.26041666666666663No Hit
AATTCGAGATGCTGTATGTCA10.26041666666666663No Hit
CCCTGATCATTCCGCAAGTCG10.26041666666666663No Hit
TCCATCACGCAGCACATTCATC10.26041666666666663No Hit
ATCGCACTGATAGGTAGAAA10.26041666666666663No Hit
GCGCACTGATAGGTAGAAAA10.26041666666666663No Hit
CATGTAACTCAGGGCCACCCACA10.26041666666666663No Hit
AGCAAGCGCCGAACACTAACG10.26041666666666663No Hit
AGCCCATTTTGATACATCTTC10.26041666666666663No Hit
GATGTAACTCAGGGCCACCCA10.26041666666666663No Hit
TATTTGGCGGACCATATGACT10.26041666666666663No Hit
GACCGATCTGAGTCAGGAAGT10.26041666666666663No Hit
GCATATGCCCGTCTCAGTCCC10.26041666666666663No Hit
ATGTAACTCAGGGCCACCC10.26041666666666663No Hit
CCGAACACTAACGCAGCATACC10.26041666666666663No Hit
CCCAGAGCGTATGTGTCCA10.26041666666666663No Hit
ATGCATCCAACACTTGTAGACCA10.26041666666666663No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)