##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.2d.R.2.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24134166
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.80940223913269	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.6595075628468	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.88269319105537	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.809190547541604	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.681181690720116	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.66933313543961	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.692827835857265	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.81288866580266	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.803864695386615	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.776948107508666	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.77265482469956	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.77904780301917	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.76464845729494	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.749270598370785	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.74906312486621	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.67947576891615	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.586032001271555	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
50-54	34.54173598540757	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
55-59	34.52946197519318	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.49883270878306	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.48064850469662	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.44902467315423	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.42544673803935	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.40030055316599	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.376980866046914	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.34887585508445	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.31511613867245	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.27333991984641	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.217005659114136	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
110-114	34.17911098315973	35.0	34.0	37.0	29.4	39.0
115-119	34.123493324774515	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
120-124	34.086630198864135	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
125-129	34.03111815009477	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	33.97138386302638	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	33.918932371642754	35.0	34.0	37.0	28.4	39.0
140-144	33.881579143857714	35.0	34.0	37.0	28.0	39.0
145-149	33.80842012937178	35.0	34.0	37.0	28.0	39.0
150	33.77041058721482	35.0	33.0	37.0	28.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	38.0
22	563.0
23	5212.0
24	30671.0
25	109540.0
26	255066.0
27	433305.0
28	611431.0
29	780891.0
30	969803.0
31	1201716.0
32	1522668.0
33	1981287.0
34	2710340.0
35	4199820.0
36	8341655.0
37	980151.0
38	8.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.9000833302913	11.342582300937831	14.104618278193398	37.65271609057747
2	22.41063967660387	13.616574412065708	36.700729510841434	27.272056400488985
3	21.280107499146954	17.763334893363737	28.0250823055882	32.9314753019011
4	26.117755911123485	25.517710166834064	22.101092393520222	26.26344152852223
5	25.691620501452856	30.954734562261205	24.295217652759558	19.058427283526377
6	19.189100854109288	37.07622079718745	25.644145382716637	18.09053296598662
7	16.201247156254603	24.607384446201756	40.16811479025222	19.023253607291423
8	18.573312564970195	24.80332842963065	31.33601920996245	25.287339795436708
9	19.823736852806416	23.43887661558979	32.41590554924614	24.32148098235765
10-14	20.41391969938142	29.42074101000134	26.941063515592838	23.224275775024402
15-19	20.516701197023647	28.16221845925196	27.816925662575464	23.504154681148933
20-24	20.702011917429008	28.314732484511683	27.51132590989932	23.471929688159985
25-29	20.666268226186574	28.503559321514203	27.406347219829343	23.423825232469884
30-34	20.661212630354694	28.21811226042565	27.434074962374417	23.68660014684524
35-39	20.732327482793583	28.189722695581814	27.50314247667412	23.574807344950482
40-44	20.77526953858197	28.25601086337828	27.413941592353236	23.554778005686515
45-49	20.858883920565876	28.027946325935062	27.390187525356946	23.722982228142115
50-54	20.96520458752244	28.01090499659365	27.473873435302238	23.550016980581674
55-59	20.98489980231856	28.03409207031182	27.39412737706271	23.586880750306907
60-64	20.92355292246026	27.942412529937105	27.403994212801962	23.730040334800673
65-69	21.0334894919757	27.857403827654636	27.4808526442199	23.628254036149762
70-74	21.14639811401583	27.79725637030056	27.465158264291667	23.591187251391947
75-79	21.181149620457372	27.677770368805287	27.45198362642125	23.689096384316088
80-84	21.217439501716115	27.686556404026835	27.447047140084102	23.648956954172945
85-89	21.197540137601518	27.682435135855727	27.49280525277768	23.62721947376508
90-94	21.173714796205466	27.579281559477202	27.459357306675958	23.787646337641373
95-99	21.28292918909193	27.49456519793479	27.558464852968807	23.66404076000447
100-104	21.34825017262333	27.537200844025794	27.428524509679047	23.686024473671825
105-109	21.312271168241804	27.393319190802938	27.50692936366602	23.787480277289237
110-114	21.390900553387002	27.371986655399073	27.566640652305107	23.670472138908817
115-119	21.420599012353744	27.3908635176079	27.533227188115596	23.655310281922763
120-124	21.388628370063746	27.282617614115207	27.535919727342872	23.792834288478176
125-129	21.43526864159793	27.21673678699572	27.600719923112383	23.74727464829397
130-134	21.498503671339158	27.313907117886348	27.485118547685012	23.702470663089482
135-139	21.48807132363826	27.168701401461387	27.5754166001599	23.767810674740453
140-144	21.539232983560854	27.096285082914207	27.702179802917087	23.66230213060785
145-149	21.549450022906147	27.610147692734127	27.380021334431724	23.460380949927995
150	21.44151339672467	27.154117318112608	27.487355240143952	23.917014045018774
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.5
9	1.0
10	1.5
11	5.0
12	9.5
13	19.0
14	43.0
15	83.5
16	162.0
17	328.5
18	641.5
19	1208.0
20	2247.0
21	3856.5
22	6131.0
23	9809.5
24	15580.0
25	24562.5
26	36581.5
27	51108.0
28	69891.5
29	97732.5
30	131101.5
31	165925.5
32	200950.5
33	239334.0
34	279746.5
35	326549.5
36	397013.0
37	492539.0
38	608548.5
39	753091.5
40	919544.0
41	1085591.5
42	1256499.5
43	1429534.5
44	1570563.5
45	1655723.5
46	1678022.5
47	1638602.0
48	1549142.5
49	1418269.0
50	1251630.5
51	1072125.5
52	890890.0
53	711864.5
54	550736.0
55	414843.5
56	307988.0
57	228584.0
58	170218.0
59	125679.5
60	89178.5
61	63006.0
62	44708.0
63	29399.5
64	19238.5
65	13994.5
66	11989.0
67	8947.0
68	4856.5
69	2747.0
70	2330.5
71	1618.5
72	705.0
73	285.5
74	126.5
75	75.5
76	48.0
77	36.0
78	17.5
79	1.5
80	0.5
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.5
89	0.5
90	0.0
91	0.5
92	0.5
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	3.521977929546022E-4
2	2.0303166887971185E-4
3	8.701357237701936E-5
4	2.486102067914839E-5
5	5.386554480482151E-5
6	7.458306203744517E-5
7	2.5275371023800863E-4
8	9.11570758235441E-5
9	9.530057927006883E-5
10-14	1.4750872269628045E-4
15-19	1.6408273648237936E-4
20-24	1.4253651856045076E-4
25-29	2.983322481497807E-4
30-34	7.73177743121515E-4
35-39	7.300853072776577E-4
40-44	9.820103168263613E-4
45-49	0.001018473147155779
50-54	5.311971418444706E-4
55-59	3.505403915759923E-4
60-64	2.850730371209015E-4
65-69	3.165636633144895E-4
70-74	3.845171198374951E-4
75-79	2.701564247134125E-4
80-84	2.825869350529867E-4
85-89	4.168364467203881E-4
90-94	4.085494398273385E-4
95-99	3.165636633144895E-4
100-104	4.8396120255408867E-4
105-109	2.46952805412874E-4
110-114	2.5275371023800863E-4
115-119	2.46124104723569E-4
120-124	2.4943890748078886E-4
125-129	1.375643144246211E-4
130-134	1.2264770201713207E-4
135-139	1.23476402706437E-4
140-144	1.6242533510376947E-4
145-149	1.3922171580323098E-4
150	2.4032319989843444E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4134166E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	52.305190736791914
#Duplication Level	Percentage of total
1	40.848797781978405
2	10.673258789880457
3	6.47985938623739
4	4.342088165784711
5	3.384948401604335
6	2.758894192786315
7	2.0820527152452413
8	1.8539107450499488
9	1.5145331722601079
>10	17.249575686013767
>50	4.192973810989401
>100	4.0495157249914575
>500	0.3419247802537063
>1k	0.22766664692475988
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	8.287006893049464E-6	1.6574013786098928E-5	0.0	0.0	1.69883641307514E-4	2.486102067914839E-5
2	8.287006893049464E-6	1.2844860684226668E-4	0.0	1.6574013786098928E-5	0.0020883257370484646	4.143503446524732E-5
3	2.071751723262366E-5	1.4502262062836562E-4	0.0	1.6574013786098928E-5	0.0031780671434844692	9.530057927006883E-5
4	4.143503446524732E-5	1.69883641307514E-4	0.0	1.6574013786098928E-5	0.004611719335982026	1.2016159994921722E-4
5	4.557853791177205E-5	1.69883641307514E-4	0.0	2.071751723262366E-5	0.005759469790669377	1.3259211028879143E-4
6	6.215255169787098E-5	1.69883641307514E-4	0.0	2.071751723262366E-5	0.006820206672979709	1.4087911718184087E-4
7	7.458306203744517E-5	1.947446619866624E-4	0.0	2.071751723262366E-5	0.008038396686257979	1.4087911718184087E-4
8	1.1601809650269249E-4	2.071751723262366E-4	0.0	2.071751723262366E-5	0.010425054671456225	1.4916612407489034E-4
9	1.3673561373531615E-4	2.071751723262366E-4	0.0	2.071751723262366E-5	0.01396775011823487	1.6159663441446453E-4
10-11	2.051034206029742E-4	2.1960568266581078E-4	0.0	2.486102067914839E-5	0.01838265304050697	2.0303166887971187E-4
12-13	2.465384550682215E-4	2.237491861123355E-4	0.0	2.9004524125673122E-5	0.022360416349170714	2.3825144817517208E-4
14-15	2.6932772402410757E-4	2.3410794472864736E-4	2.071751723262366E-6	3.3148027572197856E-5	0.026990781450662103	2.610407171310581E-4
16-17	3.045475033195678E-4	2.444667033449592E-4	4.143503446524732E-6	3.3148027572197856E-5	0.03161700304870697	2.672559723008452E-4
18-19	3.2940852399871616E-4	2.5896896540779574E-4	4.143503446524732E-6	3.3148027572197856E-5	0.03585995057794829	2.6932772402410757E-4
20-21	3.9363282741984953E-4	3.0040399987304306E-4	4.143503446524732E-6	3.3148027572197856E-5	0.03972791104527913	2.734712274706323E-4
22-23	4.6821588945729467E-4	3.1904976538240433E-4	4.143503446524732E-6	3.3148027572197856E-5	0.04392113653316215	2.8797348953346884E-4
24-25	5.490142066645269E-4	3.2526502055219144E-4	4.143503446524732E-6	3.3148027572197856E-5	0.04834018295888078	3.0247575159630545E-4
26-27	6.360277790415463E-4	3.2733677227545383E-4	4.143503446524732E-6	3.5219779295460224E-5	0.05299540908105132	3.211215171056667E-4
28-29	6.712475583370065E-4	3.3148027572197855E-4	4.143503446524732E-6	3.7291531018722584E-5	0.0577252182652593	3.418390343382904E-4
30-31	7.230413514185657E-4	3.3355202744524094E-4	4.143503446524732E-6	4.350678618850968E-5	0.06230586132539239	3.7291531018722587E-4
32-33	7.686198893303378E-4	3.39767282615028E-4	4.143503446524732E-6	5.179379308155915E-5	0.06649494330982889	4.3713961360835924E-4
34-35	8.204136824118968E-4	3.480542895080775E-4	4.143503446524732E-6	5.8009048251346244E-5	0.07022202465997789	4.433548687781463E-4
36-37	8.390594479212581E-4	3.501260412313398E-4	4.143503446524732E-6	6.215255169787098E-5	0.07403819133422718	4.537136273944581E-4
38-39	8.618487168771441E-4	3.5634129640112693E-4	4.143503446524732E-6	7.043955859092043E-5	0.07869756095984423	4.578571308409829E-4
40-41	9.157142616819658E-4	3.6877180674070115E-4	4.143503446524732E-6	7.251131031418281E-5	0.08237906377208146	4.5992888256424523E-4
42-43	9.322882754680647E-4	3.6877180674070115E-4	4.143503446524732E-6	7.458306203744517E-5	0.08595076374298577	4.5992888256424523E-4
44-45	9.571492961472131E-4	3.8534582052680003E-4	4.143503446524732E-6	7.458306203744517E-5	0.09041953221006269	4.5992888256424523E-4
46-47	0.0010193018478450839	3.8534582052680003E-4	4.143503446524732E-6	7.458306203744517E-5	0.09468319725653665	4.682158894572947E-4
48-49	0.001048306371970757	3.957045791431119E-4	6.2152551697870985E-6	7.458306203744517E-5	0.0987376153789611	4.847899032433936E-4
50-51	0.0010669521374801184	4.060633377594237E-4	8.287006893049464E-6	7.458306203744517E-5	0.10306136122540965	4.93076910136443E-4
52-53	0.001110458923668628	4.060633377594237E-4	8.287006893049464E-6	7.458306203744517E-5	0.10726701722363226	5.013639170294926E-4
54-55	0.0011539657098571378	4.081350894826861E-4	8.287006893049464E-6	7.458306203744517E-5	0.11063154202221034	5.055074204760173E-4
56-57	0.0012244052684480583	4.2263735154552263E-4	8.287006893049464E-6	7.87265654839699E-5	0.11469217539980457	5.220814342621162E-4
58-59	0.0012616967994667808	4.3713961360835924E-4	8.287006893049464E-6	8.287006893049464E-5	0.11890819015664349	5.220814342621162E-4
60-61	0.0012989883304855034	4.454266205014087E-4	8.287006893049464E-6	8.4941820653757E-5	0.12247367487237802	5.282966894319033E-4
62-63	0.0013321363580577014	4.557853791177205E-4	8.287006893049464E-6	8.701357237701937E-5	0.12606816411223823	5.303684411551657E-4
64-65	0.0013611408821833744	4.5992888256424523E-4	8.287006893049464E-6	8.908532410028173E-5	0.13128483495141285	5.303684411551657E-4
66-67	0.0013756431442462109	4.723593929038194E-4	8.287006893049464E-6	9.11570758235441E-5	0.13588205202533205	5.365836963249528E-4
68-69	0.001415006426988196	4.910051584131807E-4	8.287006893049464E-6	9.11570758235441E-5	0.13904561690675368	5.469424549412646E-4
70-71	0.0014937329924721659	5.013639170294925E-4	8.287006893049464E-6	9.530057927006883E-5	0.14195228457449077	5.510859583877894E-4
72-73	0.0015475985372769873	5.055074204760173E-4	8.287006893049464E-6	9.530057927006883E-5	0.14492732004909553	5.614447170041012E-4
74-75	0.001578674813125923	5.241531859853786E-4	8.287006893049464E-6	9.737233099333119E-5	0.1483850736752204	5.655882204506259E-4
76-77	0.0016346121096540067	5.448707032180022E-4	8.287006893049464E-6	9.944408271659356E-5	0.15100583960514732	5.676599721738882E-4
78-79	0.001709195171691452	5.49014206664527E-4	8.287006893049464E-6	1.0773108960964302E-4	0.15346500890065976	5.676599721738882E-4
80-81	0.0017527019578799617	5.531577101110516E-4	8.287006893049464E-6	1.1187459305616775E-4	0.1562639454787872	5.676599721738882E-4
82-83	0.0017920652406219467	5.635164687273635E-4	8.287006893049464E-6	1.1394634477943013E-4	0.15904216453968203	5.676599721738882E-4
84-85	0.0018562895440430798	5.655882204506259E-4	8.287006893049464E-6	1.1601809650269249E-4	0.16166707397305546	5.676599721738882E-4
86-87	0.0019225855991874756	5.676599721738882E-4	8.287006893049464E-6	1.1601809650269249E-4	0.1639335703583045	5.676599721738882E-4
88-89	0.0019640206336527227	5.676599721738882E-4	8.287006893049464E-6	1.2016159994921722E-4	0.16609855090911368	5.738752273436753E-4
90-91	0.002009599171564495	5.738752273436753E-4	1.2430510339574195E-5	1.2016159994921722E-4	0.16907151463199516	5.821622342367249E-4
92-93	0.00204896245430648	5.780187307902001E-4	1.2430510339574195E-5	1.2016159994921722E-4	0.1719926845617951	5.842339859599871E-4
94-95	0.0021421912818532863	5.821622342367249E-4	1.2430510339574195E-5	1.2016159994921722E-4	0.1752018279811285	5.904492411297743E-4
96-97	0.002222989599060519	5.904492411297742E-4	1.4502262062836561E-5	1.2016159994921722E-4	0.17762163399389894	5.94592744576299E-4
98-99	0.0023141466748840627	5.966644962995613E-4	1.6574013786098928E-5	1.2016159994921722E-4	0.1797327489999033	5.966644962995613E-4
100-101	0.002378370978305196	5.966644962995613E-4	1.6574013786098928E-5	1.2016159994921722E-4	0.18208211545408282	5.987362480228237E-4
102-103	0.002411519005877394	6.090950066391356E-4	1.8645765509361292E-5	1.2016159994921722E-4	0.18396326601880503	6.028797514693485E-4
104-105	0.0024570975437891657	6.256690204252346E-4	2.071751723262366E-5	1.2016159994921722E-4	0.185842344831804	6.132385100856603E-4
106-107	0.002546182867889448	6.422430342113334E-4	2.071751723262366E-5	1.2016159994921722E-4	0.18756189876211177	6.153102618089226E-4
108-109	0.0026414834471595165	6.526017928276453E-4	2.071751723262366E-5	1.222333516724796E-4	0.18927523743724972	6.17382013532185E-4
110-111	0.0027077795023039124	6.546735445509077E-4	2.071751723262366E-5	1.2430510339574196E-4	0.19075653991938235	6.17382013532185E-4
112-113	0.002751286288492422	6.629605514439571E-4	2.071751723262366E-5	1.2430510339574196E-4	0.19240565429109918	6.194537652554474E-4
114-115	0.002796864826404194	6.712475583370065E-4	2.071751723262366E-5	1.2637685511900432E-4	0.19437589017992168	6.215255169787098E-4
116-117	0.002865232633271852	6.816063169533184E-4	2.071751723262366E-5	1.3259211028879143E-4	0.19594006273098477	6.215255169787098E-4
118-119	0.002964676715988446	7.02323834185942E-4	2.071751723262366E-5	1.3673561373531615E-4	0.19748766126826178	6.235972687019722E-4
120-121	0.003113842840063336	7.106108410789915E-4	2.071751723262366E-5	1.4087911718184087E-4	0.19902490104692244	6.256690204252345E-4
122-123	0.003277511226201063	7.230413514185657E-4	2.071751723262366E-5	1.4295086890510323E-4	0.200537279804904	6.256690204252345E-4
124-125	0.0033707400537478695	7.271848548650905E-4	2.071751723262366E-5	1.4502262062836562E-4	0.20222368570763954	6.256690204252345E-4
126-127	0.00339767282615028	7.292566065883527E-4	2.071751723262366E-5	1.4502262062836562E-4	0.20378164300353285	6.256690204252345E-4
128-129	0.0034494666192318394	7.292566065883527E-4	2.071751723262366E-5	1.4709437235162798E-4	0.20514071213399296	6.298125238717592E-4
130-131	0.0035426954467786455	7.375436134814023E-4	2.071751723262366E-5	1.4916612407489034E-4	0.20638583491967363	6.298125238717592E-4
132-133	0.00362556551570914	7.375436134814023E-4	2.071751723262366E-5	1.574531309679398E-4	0.20762474245018453	6.298125238717592E-4
134-135	0.003745727115658358	7.375436134814023E-4	2.071751723262366E-5	1.636683861377269E-4	0.2087165556083438	6.318842755950216E-4
136-137	0.003917682508689134	7.458306203744517E-4	2.071751723262366E-5	1.6781188958425164E-4	0.2098829518285405	6.33956027318284E-4
138-139	0.003971548053493956	7.665481376070754E-4	2.071751723262366E-5	1.69883641307514E-4	0.21105763505563027	6.33956027318284E-4
>>END_MODULE
