##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.2d.R.3.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	22936848
Total Bases	3.4 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.7436269796094	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.634741181525904	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.8343569700597	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.780789714436786	35.0	34.0	38.0	30.0	39.0
5	34.65880281370832	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.653789613987065	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.6770311683628	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.80910611606268	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.79013166935579	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.76346470099118	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.76844941379914	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.77084515710267	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.76278043957914	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.74964879219674	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.74639344516736	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.67786384598267	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.59073069673741	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
50-54	34.54787907213755	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
55-59	34.53942209496266	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.51168230264246	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.49311130282591	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.464622924649454	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.44345936285579	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.422267479821116	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.39850832163164	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.37109297668102	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.34228361281375	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.30244631694817	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.25048674517091	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.21644567727876	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.16833759372692	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
120-124	34.12996919193082	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
125-129	34.083061247125144	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.02462053199289	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	33.97824610425984	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	33.94141289160568	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	33.872826152922144	35.0	34.0	37.0	28.0	39.0
150	33.83723962420643	35.0	34.0	37.0	28.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	2.0
21	23.0
22	452.0
23	4131.0
24	24810.0
25	92331.0
26	223863.0
27	395307.0
28	570524.0
29	737484.0
30	917723.0
31	1148188.0
32	1459078.0
33	1905181.0
34	2606541.0
35	4022284.0
36	7882055.0
37	946862.0
38	9.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.207639750104036	10.994127545124647	14.646084263482024	38.1521484412893
2	22.734904368970007	12.865429103848042	36.62793095567552	27.77173557150644
3	21.230038662692856	17.43323404618945	28.42215405435099	32.91457323676671
4	26.349540738828885	25.11218197450041	22.170813416320645	26.367463870350054
5	26.03263702250114	30.660847497050053	24.32751946813935	18.97899601230946
6	19.40562815595187	36.60395381748647	25.531852279435423	18.458565747126237
7	16.119055892302278	24.745764337555517	40.39774092189884	18.737438848243368
8	18.604919645556716	24.306801096839294	31.53148333803102	25.556795919572966
9	19.80440878086964	22.861232227645186	32.681121360474734	24.65323763101044
10-14	20.425497797099464	29.176672165107565	27.011644385519258	23.386185652273713
15-19	20.572291335744268	27.845022587790275	27.856563008460274	23.726123068005183
20-24	20.73802857935171	28.022087338139016	27.57161294017446	23.668271142334806
25-29	20.71252593816085	28.21323059289311	27.449032154272846	23.625211314673187
30-34	20.67225280914087	27.95321668532168	27.489741631282595	23.884788874254856
35-39	20.75629690450998	27.92634679894302	27.533970884210657	23.783385412336347
40-44	20.80753607184096	28.017454602224532	27.43732963727445	23.73767968866006
45-49	20.882921167172448	27.781268364747515	27.421666792985842	23.914143675094195
50-54	20.991508652007465	27.772462378608797	27.511064838082543	23.724964131301192
55-59	20.983807886544888	27.817212122116846	27.427964238205995	23.771015753132275
60-64	20.933703065893006	27.72242828413971	27.421083656883326	23.92278499308395
65-69	21.030505208293278	27.652059672302876	27.50993152251478	23.807503596889067
70-74	21.156874177379787	27.59363075423892	27.48055554397783	23.76893952440346
75-79	21.171536362089423	27.503010774787246	27.471219050863578	23.854233812259757
80-84	21.212304931863933	27.489093456202774	27.45820943553176	23.840392176401533
85-89	21.18592600580415	27.504084206882062	27.52926473952087	23.780725047792917
90-94	21.178846450933943	27.402266463270298	27.479337511610513	23.93954957418525
95-99	21.26620316546911	27.323127380423124	27.584777841301168	23.8258916128066
100-104	21.323240509822263	27.37699362626253	27.441593895810783	23.858171968104422
105-109	21.288079777031026	27.232503362698473	27.53015097484838	23.949265885422122
110-114	21.364462333062548	27.20604846159322	27.58970451424546	23.83978469109877
115-119	21.403419580999586	27.235260523543687	27.558701479453205	23.80261841600352
120-124	21.35553252589544	27.145415614285696	27.560828433325103	23.938223426493764
125-129	21.40507072245033	27.06713412353651	27.62337953549826	23.9044156185149
130-134	21.46611501190074	27.180016191441453	27.519211586929988	23.834657209727823
135-139	21.452363003275714	27.038843132649582	27.618772918181406	23.890020945893298
140-144	21.505692115740224	26.964128496660432	27.73969567002636	23.79048371757298
145-149	21.519409845560517	27.50007599141063	27.405877160874397	23.574637002154457
150	21.389873793216683	27.062643693745976	27.507792934690723	24.039689578346625
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.5
10	3.5
11	5.0
12	6.0
13	14.5
14	30.0
15	60.0
16	143.5
17	295.5
18	561.5
19	1101.5
20	2078.5
21	3451.5
22	5460.5
23	8703.0
24	13613.5
25	21705.0
26	32587.0
27	45690.5
28	62320.0
29	87070.0
30	117691.0
31	149050.5
32	179021.5
33	212554.0
34	250201.0
35	293310.5
36	358155.0
37	447081.5
38	556684.5
39	693574.0
40	850446.5
41	1007254.5
42	1169640.0
43	1338773.5
44	1479283.5
45	1568065.5
46	1599219.0
47	1566774.0
48	1488422.5
49	1373615.5
50	1219579.0
51	1049408.0
52	876410.0
53	705110.5
54	547875.0
55	414324.5
56	309522.0
57	231738.5
58	174009.5
59	128110.5
60	89980.5
61	63302.5
62	45213.0
63	29703.0
64	19291.0
65	14059.5
66	12320.0
67	9166.5
68	4793.0
69	2866.5
70	2767.0
71	2064.0
72	891.5
73	293.0
74	128.0
75	83.0
76	58.5
77	41.5
78	16.5
79	1.0
80	0.5
81	0.5
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.5
87	0.5
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	4.4905908606099673E-4
2	2.0055065979423153E-4
3	3.487837561638809E-5
4	3.487837561638809E-5
5	5.6677360376630657E-5
6	1.220743146573583E-4
7	2.5286822321881366E-4
8	1.4387329941760088E-4
9	1.3515370551350387E-4
10-14	1.87471268938086E-4
15-19	3.304726089652772E-4
20-24	2.206057257736547E-4
25-29	3.618631470200265E-4
30-34	9.111975629781388E-4
35-39	9.63515126402721E-4
40-44	0.0011884806491284242
45-49	0.0010498391060532817
50-54	5.94676304259417E-4
55-59	4.429553703281288E-4
60-64	2.3019727906816142E-4
65-69	3.609911876296167E-4
70-74	3.4355199982142275E-4
75-79	2.6594761407495917E-4
80-84	2.947222739584794E-4
85-89	3.5488747189674886E-4
90-94	3.915097662939563E-4
95-99	2.807709237119242E-4
100-104	4.429553703281288E-4
105-109	2.642036952941398E-4
110-114	2.3368511662980024E-4
115-119	2.1624592882160616E-4
120-124	2.1711788821201586E-4
125-129	1.2904998978063593E-4
130-134	1.7003208112989195E-4
135-139	1.6044052783538524E-4
140-144	1.482330963696494E-4
145-149	1.970628222325927E-4
150	2.0055065979423153E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.2936848E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	51.21341342894306
#Duplication Level	Percentage of total
1	39.523354683688666
2	10.953577371487885
3	6.513589837163278
4	4.4787964811506535
5	3.4433497850755628
6	2.6578117878639245
7	2.1620999465971398
8	1.7748767142702786
9	1.5450676406533577
>10	18.007320765253578
>50	4.2386648194541685
>100	4.124217121136868
>500	0.3365957169982292
>1k	0.24067732920640678
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.3079390856145534E-5	0.0	0.0	1.7003208112989195E-4	1.7439187808194046E-5
2	0.0	1.0027532989711577E-4	0.0	8.719593904097023E-6	0.0018267549229083265	3.9238172568436604E-5
3	0.0	1.1771451770530982E-4	0.0	1.3079390856145534E-5	0.002955942333488891	9.591553294506726E-5
4	1.3079390856145534E-5	1.3951350246555236E-4	0.0	1.3079390856145534E-5	0.004534188830130452	1.133547207532613E-4
5	2.179898476024256E-5	1.3951350246555236E-4	0.0	1.3079390856145534E-5	0.005667736037663065	1.1771451770530982E-4
6	3.9238172568436604E-5	1.3951350246555236E-4	0.0	1.3079390856145534E-5	0.006574573803689155	1.1771451770530982E-4
7	4.359796952048512E-5	1.525928933216979E-4	0.0	1.7439187808194046E-5	0.0076994014173176716	1.220743146573583E-4
8	6.103715732867916E-5	1.525928933216979E-4	0.0	1.7439187808194046E-5	0.009761585375636617	1.2643411160940683E-4
9	8.283614208892171E-5	1.525928933216979E-4	0.0	1.7439187808194046E-5	0.013057591871385292	1.3079390856145535E-4
10-11	1.5695269027374642E-4	1.5695269027374642E-4	0.0	1.7439187808194046E-5	0.017284415016396326	1.9401096436615875E-4
12-13	2.2016974607844982E-4	1.6349238570181917E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.020900866588120563	2.3760893388664387E-4
14-15	2.3978883236266813E-4	1.678521826538677E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.025081911865135087	2.615878171229107E-4
16-17	2.72487309503032E-4	1.8529137046206177E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.029603021304409394	2.659476140749592E-4
18-19	3.2698477140363834E-4	2.0055065979423153E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.03328922962736641	2.681275125509835E-4
20-21	3.5096365463990514E-4	2.4850842626676514E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.03701031632593982	2.7902700493110473E-4
22-23	4.0328121806448733E-4	2.6376771559893496E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.040947212973639624	2.9864609121532307E-4
24-25	4.6213847691714224E-4	2.7030741102700774E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.04515659693084246	3.095455835954443E-4
26-27	5.340751266259428E-4	2.7030741102700774E-4	4.359796952048511E-6	2.179898476024256E-5	0.049326742715476865	3.160852790235171E-4
28-29	5.645937052902823E-4	2.7030741102700774E-4	4.359796952048511E-6	2.615878171229107E-5	0.053632042205624765	3.2698477140363834E-4
30-31	6.147313702388401E-4	2.746672079790562E-4	4.359796952048511E-6	3.051857866433958E-5	0.057800008091783144	3.509636546399052E-4
32-33	6.452499489031797E-4	2.746672079790562E-4	4.359796952048511E-6	3.705827409241235E-5	0.06190475692213682	3.814822333042448E-4
34-35	6.975675123277619E-4	2.7902700493110473E-4	4.359796952048511E-6	4.577786799650938E-5	0.06561058433137806	3.9020182720834177E-4
36-37	7.23726294040053E-4	2.81206903407129E-4	4.359796952048511E-6	5.231756342458214E-5	0.06932077153757132	4.0328121806448733E-4
38-39	7.433453803242713E-4	2.8992649731122603E-4	4.359796952048511E-6	5.667736037663065E-5	0.0738200819920854	4.0764101501653585E-4
40-41	7.891232483207806E-4	2.921063957872503E-4	4.359796952048511E-6	6.321705580470342E-5	0.07716840605125866	4.1418071044460863E-4
42-43	8.043825376529503E-4	2.98646091215323E-4	4.359796952048511E-6	7.629644666084896E-5	0.08048403163329154	4.294399997767784E-4
44-45	8.283614208892173E-4	3.1390538054749283E-4	4.359796952048511E-6	7.847634513687321E-5	0.08456916137736101	4.3161989825280265E-4
46-47	8.719593904097023E-4	3.1826517749954135E-4	4.359796952048511E-6	8.719593904097023E-5	0.08859107406562575	4.4469928910894816E-4
48-49	9.264568523103087E-4	3.2698477140363834E-4	4.359796952048511E-6	8.93758375169945E-5	0.09240153660171616	4.7957766472533626E-4
50-51	9.482558370705513E-4	3.57503350067978E-4	4.359796952048511E-6	9.155573599301874E-5	0.09649320604121368	4.839374616773848E-4
52-53	9.983935020191092E-4	3.596832485440022E-4	4.359796952048511E-6	9.155573599301874E-5	0.10054999710509482	4.904771571054576E-4
54-55	0.0010354517761115216	3.6186314702002644E-4	4.359796952048511E-6	9.155573599301874E-5	0.10366943182428554	4.94836954057506E-4
56-57	0.0010877693395361038	3.684028424480992E-4	4.359796952048511E-6	9.155573599301874E-5	0.10802268908090597	5.03556547961603E-4
58-59	0.0011313673090565888	3.814822333042448E-4	4.359796952048511E-6	1.0027532989711577E-4	0.1121405173021158	5.057364464376273E-4
60-61	0.0011618858877209283	3.8366213178026904E-4	4.359796952048511E-6	1.0027532989711577E-4	0.1155651378079499	5.057364464376273E-4
62-63	0.0011924044663852679	3.858420302562933E-4	4.359796952048511E-6	1.0027532989711577E-4	0.11886768399912664	5.057364464376273E-4
64-65	0.001218563248097559	3.9674152263641455E-4	4.359796952048511E-6	1.1117482227723704E-4	0.12360242348905133	5.057364464376273E-4
66-67	0.0012381823343817773	4.0328121806448733E-4	4.359796952048511E-6	1.1771451770530982E-4	0.12780962754777814	5.057364464376273E-4
68-69	0.0012643411160940684	4.1854050739665715E-4	4.359796952048511E-6	1.1771451770530982E-4	0.13075903018583895	5.188158372937729E-4
70-71	0.001294859694758408	4.3161989825280265E-4	4.359796952048511E-6	1.220743146573583E-4	0.1334839032808693	5.231756342458214E-4
72-73	0.0013340978673268445	4.534188830130452E-4	4.359796952048511E-6	1.220743146573583E-4	0.13667309475129275	5.340751266259428E-4
74-75	0.0013776958368473297	4.59958578441118E-4	4.359796952048511E-6	1.2643411160940683E-4	0.13996474145008939	5.384349235779912E-4
76-77	0.0014082144155116694	4.68678172345215E-4	4.359796952048511E-6	1.3515370551350384E-4	0.14239750814933244	5.406148220540155E-4
78-79	0.0014518123850321544	4.839374616773848E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.14479757637143517	5.471545174820882E-4
80-81	0.001475791268268421	4.8611736015340904E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.14743525352742454	5.493344159581124E-4
82-83	0.0015041299484567366	5.013766494855788E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.1500511316986536	5.493344159581124E-4
84-85	0.0015564475118813187	5.079163449136516E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.1525580149460815	5.493344159581124E-4
86-87	0.0016262042631140948	5.231756342458214E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.1547226541327736	5.493344159581124E-4
88-89	0.0016850615219667496	5.231756342458214E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.1567717587002364	5.493344159581124E-4
90-91	0.0017308393899632592	5.297153296738941E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.15925902286138008	5.493344159581124E-4
92-93	0.001763537867103623	5.406148220540155E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.16191849900212968	5.580540098622095E-4
94-95	0.0018441941107165205	5.44974619006064E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.1649856161578958	5.580540098622095E-4
96-97	0.0019117709634732724	5.471545174820882E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.16721347240039258	5.62413806814258E-4
98-99	0.0020076864964183394	5.493344159581124E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.1692080795059548	5.62413806814258E-4
100-101	0.0020992422324113582	5.536942129101609E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.17159506833720134	5.62413806814258E-4
102-103	0.0021493798973599163	5.580540098622095E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.17349158001134246	5.645937052902823E-4
104-105	0.0021929778668804013	5.580540098622095E-4	8.719593904097023E-6	1.5695269027374642E-4	0.17519190082264136	5.733132991943793E-4
106-107	0.0022605547196371534	5.62413806814258E-4	8.719593904097023E-6	1.6131248722579494E-4	0.17681156539032739	5.798529946224521E-4
108-109	0.0023390310647740265	5.62413806814258E-4	8.719593904097023E-6	1.6131248722579494E-4	0.17842905005953738	5.798529946224521E-4
110-111	0.0024022481205787302	5.667736037663065E-4	8.719593904097023E-6	1.6349238570181917E-4	0.1799484392973263	5.798529946224521E-4
112-113	0.0024480259885752394	5.71133400718355E-4	8.719593904097023E-6	1.6567228417784343E-4	0.18153540538787194	5.798529946224521E-4
114-115	0.002498163653523797	5.754931976704035E-4	8.719593904097023E-6	1.6567228417784343E-4	0.18326188498088317	5.798529946224521E-4
116-117	0.002548301318472355	5.929323854785976E-4	8.719593904097023E-6	1.6567228417784343E-4	0.1848357716805727	5.798529946224521E-4
118-119	0.0026180580697051314	6.125514717628159E-4	8.719593904097023E-6	1.7003208112989195E-4	0.1862483458930364	5.842127915745006E-4
120-121	0.0026899947194139314	6.234509641429371E-4	8.719593904097023E-6	1.7439187808194047E-4	0.1877960738110136	5.842127915745006E-4
122-123	0.0028055293386432174	6.256308626189614E-4	8.719593904097023E-6	1.7657177655796473E-4	0.18916505005395684	5.842127915745006E-4
124-125	0.0028752860898759933	6.2999065957101E-4	8.719593904097023E-6	1.78751675033989E-4	0.19075419604297855	5.863926900505248E-4
126-127	0.0029254237548245513	6.321705580470342E-4	8.719593904097023E-6	1.78751675033989E-4	0.19215805066153815	5.885725885265491E-4
128-129	0.0029559423334888906	6.38710253475107E-4	8.719593904097023E-6	1.8093157351001325E-4	0.1935902439602861	5.929323854785976E-4
130-131	0.0029973604045333514	6.452499489031797E-4	8.719593904097023E-6	1.8965116741411026E-4	0.19489818304590065	5.972921824306461E-4
132-133	0.0030714769527181766	6.517896443312525E-4	8.719593904097023E-6	1.9401096436615875E-4	0.19602519055800516	6.016519793826947E-4
134-135	0.003204450759755656	6.583293397593253E-4	8.719593904097023E-6	1.9619086284218301E-4	0.1970257639585003	6.016519793826947E-4
136-137	0.0033417843637451846	6.714087306154708E-4	8.719593904097023E-6	1.9619086284218301E-4	0.19820508903402945	6.016519793826947E-4
138-139	0.0034202607088820573	6.953876138517377E-4	8.719593904097023E-6	1.9837076131820727E-4	0.1993081176628977	6.060117763347431E-4
>>END_MODULE
