##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.2d.S.1.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24138500
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.81118081073803	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.66697495701887	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.86103523416948	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.8412504090975	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.716508772293224	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.714566936636494	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.773103548273504	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.88743140625971	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.84442691136566	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.82624527621849	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
15-19	34.84242398657746	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.83278243469975	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.83719221989768	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.81684083103755	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.80811258363195	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.76176700292065	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.65686410506039	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.63447914327734	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.62351834621042	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.59602634795037	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
65-69	34.56627967769331	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
70-74	34.56326366592787	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.54778525591896	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.52972777098826	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.51764724402925	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.49453418397995	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.47227946226982	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.43266676885473	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.399400211280735	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.37451888891191	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.33713991341632	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.29467671147752	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.27638145700852	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.23001184829215	35.0	34.0	37.0	29.6	39.0
135-139	34.19004866913851	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.14657126996292	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.10870055720115	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	34.101764981254014	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	2.0
21	16.0
22	248.0
23	3219.0
24	20417.0
25	80174.0
26	204097.0
27	378064.0
28	562351.0
29	736706.0
30	920177.0
31	1158336.0
32	1484171.0
33	1952141.0
34	2691801.0
35	4195526.0
36	8392149.0
37	1358897.0
38	8.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	37.24106714561486	11.049831743539116	13.773648008618947	37.93545310222707
2	22.793800603849125	12.868855039753955	36.49222734820088	27.84511700819604
3	21.46042212681458	16.75888219088622	27.62096225587373	34.15973342642547
4	26.92074598090774	24.54709127623773	21.649082773380073	26.883079969474455
5	26.928652768843207	30.109067456510058	23.71485152157205	19.247428253074677
6	20.046886149214416	36.61754563420585	25.121623274248677	18.213944942331064
7	16.97107141312484	24.33108867353515	39.44741167586553	19.25042823747448
8	19.27172109319927	24.438734150198073	30.868784900717827	25.42075985588483
9	20.221111260066728	22.932579393296233	32.15891866399298	24.68739068264406
10-14	21.199117964753142	28.693301372369216	26.487272018151227	23.620308644726414
15-19	21.387485011553654	27.721950285589873	27.12384168813527	23.7667230147212
20-24	21.364676117152555	27.76557408504383	27.01176314274047	23.857986655063144
25-29	21.33729121747956	27.925104556971153	26.702117262094777	24.03548696345451
30-34	21.333812005601256	27.71516491196725	26.882337970178867	24.068685112252634
35-39	21.553567639717063	27.4985072789704	26.81649715909072	24.13142792222181
40-44	21.73517898910556	27.583934458866384	26.66918276396406	24.011703788063997
45-49	21.971162128502286	27.492873942608288	26.611403196479934	23.924560732409496
50-54	21.937915802023383	27.711694147584527	26.526114487749574	23.82427556264252
55-59	21.845954261687474	27.64088001407414	26.628620714708912	23.884545009529482
60-64	22.06980747581472	27.468797371749854	26.391458704036648	24.06993644839878
65-69	21.94458437234758	27.574616518079388	26.545947960702527	23.93485114887051
70-74	22.30946549494515	27.32591588526964	26.5339372637385	23.83068135604671
75-79	22.171208476444153	27.21738345758856	26.503114237430232	24.108293828537057
80-84	22.39528418830784	27.246280918001176	26.520717953368894	23.837716940322093
85-89	22.23943402681467	27.19726478795124	26.56010101583811	24.003200169395974
90-94	22.258256181849383	26.950548080022426	26.532690509779822	24.258505228348373
95-99	22.450137756426415	27.002417128711194	26.706490392727634	23.84095472213476
100-104	22.420304012514457	26.80210352930259	26.758397380448145	24.019195077734803
105-109	22.53920630340317	26.754164643237534	26.69413517543123	24.012493877928062
110-114	22.48511575880817	26.804222343253485	26.665755479876307	24.044906418062034
115-119	22.56864055868033	26.995530904020832	26.55420740679833	23.88162113050051
120-124	22.490196313025578	26.87484379705663	26.586644084511473	24.04831580540632
125-129	22.866981967983545	26.83166553819168	26.46415600998045	23.837196483844327
130-134	22.630724151654718	27.04327444706431	26.37359696456843	23.95240443671254
135-139	22.745670542863575	26.882166547613366	26.40665872355668	23.965504185966378
140-144	22.672621185481496	26.75468671489482	26.64755323341411	23.92513886620957
145-149	22.521541762759075	27.13154623023098	26.638269191733254	23.708642815276697
150	22.280303336616612	26.745902307619907	26.74782040812539	24.225973947638092
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.5
5	0.5
6	0.0
7	0.0
8	0.5
9	0.5
10	1.5
11	5.0
12	8.0
13	10.5
14	29.0
15	58.5
16	101.0
17	240.5
18	543.0
19	942.0
20	1537.5
21	2495.5
22	4161.0
23	6899.0
24	11127.5
25	17182.5
26	24460.0
27	34717.0
28	53425.0
29	79225.5
30	108183.0
31	137359.0
32	167506.5
33	202564.0
34	239032.0
35	287196.0
36	353837.0
37	424238.5
38	495352.5
39	595378.0
40	736748.5
41	894446.5
42	1052766.0
43	1210649.0
44	1350950.0
45	1458378.5
46	1540755.0
47	1573385.0
48	1536933.0
49	1486511.0
50	1394414.0
51	1234975.5
52	1049314.0
53	884299.0
54	738360.5
55	613608.0
56	522173.0
57	427322.5
58	346387.0
59	276422.5
60	209595.5
61	145377.5
62	84890.5
63	48895.0
64	31324.0
65	18784.5
66	11556.5
67	5490.5
68	2249.0
69	1213.5
70	987.5
71	689.5
72	385.5
73	192.0
74	106.0
75	69.5
76	32.5
77	22.0
78	12.0
79	3.5
80	3.5
81	2.0
82	1.0
83	0.5
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	2.1128073409698198E-4
2	8.285518984195373E-5
3	0.12628788035710586
4	1.1185450628663754E-4
5	1.822814176522982E-4
6	1.1599726577873522E-4
7	9.942622781034446E-5
8	1.1599726577873522E-4
9	2.651366074942519E-4
10-14	2.245375644716946E-4
15-19	3.073927543136483E-4
20-24	3.595915239140792E-4
25-29	3.34734966961493E-4
30-34	2.643080555958324E-4
35-39	1.292540961534478E-4
40-44	2.4359425813534394E-4
45-49	1.9553824802701078E-4
50-54	1.2096857716925244E-4
55-59	1.6819603537916608E-4
60-64	1.516249974107753E-4
65-69	0.050486152826397665
70-74	1.8808128094123497E-4
75-79	1.599105163949707E-4
80-84	1.2345423286451104E-4
85-89	1.1516871388031567E-4
90-94	1.4831078981709716E-4
95-99	1.0522609109928123E-4
100-104	8.285518984195373E-5
105-109	9.031215692772956E-5
110-114	7.125546326408021E-5
115-119	6.794125567040205E-5
120-124	1.2593988855976967E-4
125-129	9.859767591192493E-5
130-134	6.131284048304576E-5
135-139	4.8884562006752695E-5
140-144	5.965573668620668E-5
145-149	6.545559997514345E-5
150	1.491393417155167E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.41385E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	44.171729139224055
#Duplication Level	Percentage of total
1	34.807275030946975
2	8.772089468966549
3	5.006055161283073
4	3.5484832850584387
5	2.6524720046188546
6	2.1192815225774946
7	1.6829332780322634
8	1.452690944798483
9	1.2285521831952946
>10	15.860624162443795
>50	5.036008536112015
>100	10.284789846856796
>500	3.399217694091978
>1k	3.7019129793255194
>5k	0.34111781467940694
>10k+	0.10649608701310179
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.242827847629306E-5	0.0	0.0	3.1484972139942416E-4	0.0
2	3.314207593678149E-5	4.557035441307455E-5	0.0	1.6571037968390745E-5	0.002655508834434617	1.242827847629306E-5
3	4.1427594920976863E-5	6.214139238146529E-5	0.0	1.6571037968390745E-5	0.004838743086770098	4.557035441307455E-5
4	1.1599726577873521E-4	7.871243034985604E-5	0.0	1.6571037968390745E-5	0.007212544275742072	5.3855873397269924E-5
5	1.4085382273132133E-4	7.871243034985604E-5	0.0	1.6571037968390745E-5	0.008339374857592643	5.7998632889367605E-5
6	1.9056693663649358E-4	7.871243034985604E-5	0.0	2.0713797460488432E-5	0.010340327692275825	5.7998632889367605E-5
7	2.402800505416658E-4	9.942622781034447E-5	0.0	2.0713797460488432E-5	0.011985003210638607	6.214139238146529E-5
8	3.687055947966941E-4	9.942622781034447E-5	0.0	2.0713797460488432E-5	0.01582534125981316	6.628415187356298E-5
9	4.308469871781594E-4	9.942622781034447E-5	0.0	2.0713797460488432E-5	0.018592704600534415	6.628415187356298E-5
10-11	4.909169998135758E-4	1.0356898730244216E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.03201731673467697	7.456967085775835E-5
12-13	5.302732149885039E-4	1.05640367048491E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.040889036187004166	8.699794933405141E-5
14-15	6.255566833067506E-4	1.0978312654058869E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.048261076703192	1.0771174679453985E-4
16-17	7.104832528947531E-4	1.201400252708329E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.05284089732170599	1.0771174679453985E-4
18-19	8.202663794353419E-4	1.3256830374712596E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.05633945771278248	1.0771174679453985E-4
20-21	0.001147544379311059	1.4499658222341902E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.059328458686330965	1.0771174679453985E-4
22-23	0.001400252708329018	1.5121072146156555E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.06227810344470451	1.0771174679453985E-4
24-25	0.0015162499741077531	1.636389999378586E-4	0.0	2.485655695258612E-5	0.06533338857012656	1.1806864552478405E-4
26-27	0.0016198189614101952	1.6571037968390745E-4	0.0	2.8999316444683802E-5	0.06793297015141786	1.3049692400107711E-4
28-29	0.0018269569360150795	1.6985313917600514E-4	0.0	3.1070696190732646E-5	0.07095718458064917	1.3671106323922364E-4
30-31	0.002206019429542018	1.7399589866810283E-4	0.0	4.1427594920976863E-5	0.07438946081985211	1.4499658222341902E-4
32-33	0.0024090146446548045	1.7399589866810283E-4	0.0	4.1427594920976863E-5	0.07743853180603599	1.7606727841415167E-4
34-35	0.002562296745862419	1.7606727841415167E-4	0.0	5.592725314331876E-5	0.08059738591876048	1.7813865816020051E-4
36-37	0.002622366758497836	1.8021003790624936E-4	0.0	6.214139238146529E-5	0.0833543923607515	1.864241771443959E-4
38-39	0.002657580214180666	1.864241771443959E-4	0.0	8.699794933405141E-5	0.0861196843217267	1.967810758746401E-4
40-41	0.0027093647078318865	1.864241771443959E-4	0.0	8.699794933405141E-5	0.08878140729539946	2.0920935435093317E-4
42-43	0.002728007125546326	1.864241771443959E-4	0.0	9.11407088261491E-5	0.09148248648424716	2.11280734096982E-4
44-45	0.0027466495432607657	1.9056693663649358E-4	0.0	9.11407088261491E-5	0.09411106738198313	2.154234935890797E-4
46-47	0.0027777202394514986	1.9470969612859126E-4	4.142759492097686E-6	9.735484806429563E-5	0.09851274934233692	2.154234935890797E-4
48-49	0.0028087909356422315	2.0920935435093317E-4	4.142759492097686E-6	1.0149760755639332E-4	0.10131325475899497	2.2370901257327507E-4
50-51	0.0028295047331027196	2.2370901257327507E-4	4.142759492097686E-6	1.0978312654058869E-4	0.10426497089711456	2.2370901257327507E-4
52-53	0.002860575429293452	2.2370901257327507E-4	4.142759492097686E-6	1.1185450628663754E-4	0.10684176730119932	2.2370901257327507E-4
54-55	0.0028750750875157945	2.2370901257327507E-4	4.142759492097686E-6	1.1185450628663754E-4	0.10870393769289724	2.2370901257327507E-4
56-57	0.0029123599229446736	2.2578039231932392E-4	4.142759492097686E-6	1.1806864552478405E-4	0.11088717194523272	2.361372910495681E-4
58-59	0.002955858897611699	2.2785177206537273E-4	4.142759492097686E-6	1.2842554425502827E-4	0.11297719410899601	2.361372910495681E-4
60-61	0.003065642024152288	2.2785177206537273E-4	4.142759492097686E-6	1.2842554425502827E-4	0.11499057522215547	2.3820867079561695E-4
62-63	0.003129854796279802	2.3199453155747042E-4	4.142759492097686E-6	1.2842554425502827E-4	0.11736023365163537	2.4235143028771464E-4
64-65	0.0031443544545021436	2.3199453155747042E-4	4.142759492097686E-6	1.346396834931748E-4	0.1203388777264536	2.4856556952586117E-4
66-67	0.0031754251506928765	2.361372910495681E-4	4.142759492097686E-6	1.4085382273132133E-4	0.12297781552291981	2.4856556952586117E-4
68-69	0.003185782049423121	2.464941897798123E-4	4.142759492097686E-6	1.4292520247737017E-4	0.12482962901588748	2.4856556952586117E-4
70-71	0.0032106386063757066	2.5270832901795885E-4	4.142759492097686E-6	1.491393417155167E-4	0.12712471777450962	2.4856556952586117E-4
72-73	0.003223066884852	2.5685108851005654E-4	4.142759492097686E-6	1.5121072146156555E-4	0.12882946330550782	2.4856556952586117E-4
74-75	0.003249994821550635	2.5685108851005654E-4	4.142759492097686E-6	1.5949624044576092E-4	0.130534208836506	2.5270832901795885E-4
76-77	0.003262423100026928	2.5685108851005654E-4	4.142759492097686E-6	1.6985313917600514E-4	0.1321126002029952	2.5270832901795885E-4
78-79	0.003287279656979514	2.5685108851005654E-4	4.142759492097686E-6	1.9056693663649358E-4	0.13358949396192804	2.589224682561054E-4
80-81	0.0033121362139321	2.5685108851005654E-4	4.142759492097686E-6	1.9056693663649358E-4	0.13510781531578184	2.651366074942519E-4
82-83	0.003341135530376784	2.6099384800215423E-4	4.142759492097686E-6	1.9056693663649358E-4	0.13670484909998548	2.651366074942519E-4
84-85	0.0033722062265675165	2.672079872403008E-4	4.142759492097686E-6	1.9263831638254242E-4	0.13847173602336516	2.713507467323984E-4
86-87	0.0034094910619963956	2.734221264784473E-4	4.142759492097686E-6	1.9470969612859126E-4	0.1400376991113781	2.7549350622449616E-4
88-89	0.0034322762392029332	2.734221264784473E-4	4.142759492097686E-6	1.9885245562068895E-4	0.14168444600948693	2.77564885970545E-4
90-91	0.003450918656917373	2.8585040495474035E-4	4.142759492097686E-6	1.9885245562068895E-4	0.1436771133251859	2.77564885970545E-4
92-93	0.0034695610746318124	2.982786834310334E-4	4.142759492097686E-6	1.9885245562068895E-4	0.14552064129916936	2.8170764546264266E-4
94-95	0.003502703150568594	3.044928226691799E-4	4.142759492097686E-6	1.9885245562068895E-4	0.14715288853905586	2.8585040495474035E-4
96-97	0.003556559023965864	3.127783416533753E-4	4.142759492097686E-6	1.9885245562068895E-4	0.14857799780433747	2.8585040495474035E-4
98-99	0.003633200074569671	3.1899248089152185E-4	4.142759492097686E-6	2.0299521511278664E-4	0.14983325393044306	2.8585040495474035E-4
100-101	0.003726412163141869	3.2106386063757066E-4	4.142759492097686E-6	2.154234935890797E-4	0.1511320090312157	2.8585040495474035E-4
102-103	0.003753340099840504	3.2313524038361953E-4	4.142759492097686E-6	2.2163763282722623E-4	0.15226919651179652	2.8585040495474035E-4
104-105	0.0037719825175549435	3.2313524038361953E-4	4.142759492097686E-6	2.2578039231932392E-4	0.1533670277772024	2.941359239389357E-4
106-107	0.003817552871968018	3.2313524038361953E-4	4.142759492097686E-6	2.3199453155747042E-4	0.15439443213124263	2.982786834310334E-4
108-109	0.003879694264349483	3.2313524038361953E-4	4.142759492097686E-6	2.464941897798123E-4	0.15553990513080762	3.024214429231311E-4
110-111	0.003941835656730949	3.272779998757172E-4	4.142759492097686E-6	2.4856556952586117E-4	0.15668330675062658	3.024214429231311E-4
112-113	0.004028833606064999	3.355635188599126E-4	4.142759492097686E-6	2.5270832901795885E-4	0.1578370652691758	3.024214429231311E-4
114-115	0.004059904302255732	3.397062783520103E-4	4.142759492097686E-6	2.5685108851005654E-4	0.1590281086231539	3.024214429231311E-4
116-117	0.004132402593367442	3.459204175901568E-4	4.142759492097686E-6	2.6099384800215423E-4	0.16002029952151126	3.024214429231311E-4
118-119	0.00418832984651076	3.5213455682830334E-4	4.142759492097686E-6	2.651366074942519E-4	0.16094413488824905	3.024214429231311E-4
120-121	0.004281541935082959	3.687055947966941E-4	4.142759492097686E-6	2.734221264784473E-4	0.16185139921701847	3.024214429231311E-4
122-123	0.004488679909687843	3.687055947966941E-4	4.142759492097686E-6	2.8170764546264266E-4	0.16281459079893118	3.024214429231311E-4
124-125	0.004586034757752138	3.687055947966941E-4	4.142759492097686E-6	2.8585040495474035E-4	0.16373014064668473	3.024214429231311E-4
126-127	0.004623319593181017	3.707769745427429E-4	4.142759492097686E-6	2.8585040495474035E-4	0.16478861569691572	3.024214429231311E-4
128-129	0.0046709613273401415	3.7491973403484065E-4	4.142759492097686E-6	2.8585040495474035E-4	0.16557159724092219	3.044928226691799E-4
130-131	0.0047703875551504855	3.7699111378088946E-4	4.142759492097686E-6	2.8585040495474035E-4	0.16627586635457878	3.065642024152288E-4
132-133	0.004840814466516146	3.7699111378088946E-4	4.142759492097686E-6	2.8999316444683804E-4	0.16693456511382232	3.0863558216127766E-4
134-135	0.004911241377881807	3.8113387327298715E-4	4.142759492097686E-6	2.8999316444683804E-4	0.16773411769579716	3.1070696190732647E-4
136-137	0.005010667605692151	3.894193922571825E-4	4.142759492097686E-6	2.8999316444683804E-4	0.16860616856888372	3.1070696190732647E-4
138-139	0.005081094517057813	3.935621517492802E-4	4.142759492097686E-6	2.8999316444683804E-4	0.16938915011289019	3.1070696190732647E-4
>>END_MODULE
