##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.2d.S.3.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24108909
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.86013307362851	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.71146243075537	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.92912362811606	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.86615449915216	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.72717039995464	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.7139182034326	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.744240438254586	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.88045551957577	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.86903579917283	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.84492045658308	35.0	34.0	37.4	31.2	39.0
15-19	34.841403499428374	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.85128877461854	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.842040508759645	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.82762893999061	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.818918209861764	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.7546684007974	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.64963040841043	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.61585749898512	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.60542216987089	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.57507581118664	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
65-69	34.55789425394571	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.52968300639402	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.509351352232486	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.48192563172394	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.46585766282497	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.4374792571493	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.40353543994878	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.36814432374356	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.31173832876469	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.284463457056475	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.236416264211705	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.2045184458575	35.0	34.0	37.0	29.6	39.0
125-129	34.15278514676878	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.107787581760746	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.062199770217724	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.04044943717694	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	33.97720483328383	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	33.94898375534123	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	36.0
22	465.0
23	4511.0
24	27397.0
25	100390.0
26	236505.0
27	408796.0
28	578851.0
29	742788.0
30	924156.0
31	1155535.0
32	1472267.0
33	1930993.0
34	2676640.0
35	4204004.0
36	8331228.0
37	1314344.0
38	2.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.47665948050143	10.846053260579891	13.476641852101876	39.2006454068168
2	22.582844861419815	12.74327054396355	36.964098423907096	27.70978617070954
3	21.189492439468797	16.644297323045343	27.943449735217985	34.22276050226788
4	26.700186234106134	24.451892315465372	21.86096148796152	26.986959962466976
5	26.8286082792264	29.95177920846227	24.060970027867306	19.15864248444402
6	19.88624278315947	36.182398790023	25.562634825795367	18.368723601022165
7	16.736955472603128	23.955992951140587	40.037716416762045	19.269335159494236
8	19.17955893938857	24.061211289480568	31.213615593851994	25.545614177278868
9	20.05933494670743	22.638905681907033	32.45528258346141	24.846476787924125
10-14	21.04621502861034	28.504364936728393	26.63592163611737	23.813498398543892
15-19	21.264354724132595	27.486538391599275	27.26878854682853	23.980318337439595
20-24	21.23833126272561	27.49434398899923	27.153762201321474	24.113562546953684
25-29	21.165684981086233	27.714609107230604	26.83638765290377	24.283318258779392
30-34	21.192955640199497	27.50513830492796	26.9957020711934	24.30620398367914
35-39	21.435058646939215	27.270540738896443	26.92295704946867	24.371443564695674
40-44	21.597876521282817	27.358218370801296	26.760081594558876	24.283823513357007
45-49	21.834431970572197	27.27702809914259	26.69435262207449	24.19418730821072
50-54	21.818350010274674	27.504583866136766	26.613971213678205	24.063094909910355
55-59	21.741064707189807	27.446860609499357	26.676717037120017	24.13535764619082
60-64	21.953571871680783	27.28708292121635	26.435978050616633	24.323367156486235
65-69	21.840888829948764	27.388619822492803	26.609800822989527	24.160690524568903
70-74	22.20188140819014	27.135538261093593	26.55601959567089	24.10656073504538
75-79	22.053211250358736	27.040453901386996	26.538646453009846	24.367688395244418
80-84	22.297686108382788	27.02162328946345	26.56660759621488	24.114083005938884
85-89	22.17897138033869	26.98645057577232	26.57710989047335	24.257468153415633
90-94	22.175722040564857	26.74587464024471	26.577551999997212	24.500851319193217
95-99	22.40474792905177	26.81280324307992	26.75471001805421	24.027738809814096
100-104	22.337442716477614	26.598841941964036	26.81654245135046	24.247172890207892
105-109	22.48104420756822	26.55679135536027	26.699363177755377	24.26280125931613
110-114	22.400770485520706	26.616207520340396	26.66166717482031	24.321354819318593
115-119	22.544218466871378	26.834228519029562	26.53589412214499	24.085658891954072
120-124	22.475189824420553	26.659250305427157	26.556941850999326	24.30861801915296
125-129	22.895558884674564	26.65168430381886	26.402597668490692	24.050159143015883
130-134	22.591549085461075	26.88340598294321	26.306273997910314	24.218770933685402
135-139	22.703108967907205	26.685241020638507	26.34661708933754	24.265032922116752
140-144	22.68044699927347	26.522313275933772	26.60777476294473	24.189464961848028
145-149	22.53649508027462	26.784979434536655	26.641601475573346	24.036924009615383
150	22.259968153607307	26.39449500148348	26.772418414098752	24.57311843081046
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.5
4	0.5
5	0.0
6	0.5
7	0.5
8	0.0
9	0.5
10	1.0
11	3.5
12	9.5
13	17.0
14	26.0
15	43.0
16	91.5
17	210.0
18	488.5
19	892.5
20	1428.0
21	2256.5
22	3815.0
23	6354.5
24	10211.5
25	15821.0
26	22436.5
27	32009.5
28	49363.5
29	73626.0
30	100962.5
31	127922.5
32	155242.0
33	187997.0
34	223338.5
35	269491.0
36	337979.5
37	411899.5
38	484066.0
39	586367.5
40	728333.5
41	889045.5
42	1054516.5
43	1214647.5
44	1357990.0
45	1468774.0
46	1550494.5
47	1578774.0
48	1533960.5
49	1483530.0
50	1396691.0
51	1242400.0
52	1059014.5
53	895655.5
54	749116.0
55	618110.0
56	525715.5
57	436221.5
58	359754.5
59	289023.5
60	217714.0
61	147160.5
62	83097.0
63	47742.0
64	31376.0
65	19650.0
66	12691.0
67	5948.5
68	2371.5
69	1458.0
70	1434.5
71	1108.5
72	579.0
73	201.5
74	106.0
75	74.0
76	30.0
77	15.5
78	6.5
79	1.0
80	1.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.5
96	0.5
97	0.0
98	0.0
99	0.5
100	0.5
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	3.484189185002108E-4
2	2.115400576608423E-4
3	8.71047296250527E-5
4	2.4887065607157918E-5
5	5.806981975003514E-5
6	8.71047296250527E-5
7	1.8250514778582474E-4
8	9.540041816077203E-5
9	5.806981975003514E-5
10-14	1.542998067643791E-4
15-19	2.1319919536798618E-4
20-24	1.866529920536844E-4
25-29	2.8868996104303184E-4
30-34	7.474415370683095E-4
35-39	7.582259321647447E-4
40-44	0.0010062670193827518
45-49	9.257988405862746E-4
50-54	4.628994202931373E-4
55-59	3.301684037216284E-4
60-64	2.430636740965757E-4
65-69	3.003039249930389E-4
70-74	3.061109069680424E-4
75-79	2.4887065607157916E-4
80-84	2.9117866760374763E-4
85-89	3.7828339722880035E-4
90-94	3.7496512181451263E-4
95-99	3.0528133811447047E-4
100-104	4.147844267859653E-4
105-109	3.22702284039481E-4
110-114	2.438932429501476E-4
115-119	2.3393841670728442E-4
120-124	2.115400576608423E-4
125-129	1.1696920835364221E-4
130-134	1.6176592644652648E-4
135-139	1.6591377071438612E-4
140-144	1.5595894447152298E-4
145-149	1.783573035179651E-4
150	2.3227927900014057E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4108909E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	42.65744647348417
#Duplication Level	Percentage of total
1	33.43094191372235
2	8.487012005285857
3	5.040273859772812
4	3.5430980660250806
5	2.5995479788960187
6	2.137869398606606
7	1.7154679854833523
8	1.4273832739556278
9	1.190270510914582
>10	15.756727146919438
>50	5.266676578412062
>100	10.937918977118393
>500	3.799165567546175
>1k	4.2722613945823635
>5k	0.34366016765897633
>10k+	0.05172517510053888
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.147844267859653E-6	4.147844267859653E-6	0.0	4.147844267859653E-6	2.6131418887515815E-4	1.2443532803578959E-5
2	1.6591377071438612E-5	4.5626286946456186E-5	0.0	2.4887065607157918E-5	0.0025052979377872303	2.0739221339298265E-5
3	2.903490987501757E-5	4.9774131214315836E-5	0.0	2.4887065607157918E-5	0.004691211866949267	7.05133525536141E-5
4	9.954826242863167E-5	6.636550828575445E-5	0.0	2.4887065607157918E-5	0.007237988247415094	7.466119682147376E-5
5	1.1613963950007028E-4	6.636550828575445E-5	0.0	2.903490987501757E-5	0.008287392847183587	7.466119682147376E-5
6	1.6176592644652648E-4	6.636550828575445E-5	0.0	2.903490987501757E-5	0.009925791332988149	7.88090410893334E-5
7	2.1568790192870197E-4	9.125257389291237E-5	0.0	2.903490987501757E-5	0.011676181614024924	7.88090410893334E-5
8	3.3182754142877224E-4	9.125257389291237E-5	0.0	2.903490987501757E-5	0.015467311274848647	7.88090410893334E-5
9	3.981930497145267E-4	9.125257389291237E-5	0.0	3.3182754142877224E-5	0.018321028131136088	8.295688535719306E-5
10-11	4.5211502519670215E-4	9.33264960268422E-5	0.0	3.525667627680705E-5	0.031509098980795854	1.0577002883042115E-4
12-13	4.873717014735092E-4	9.540041816077202E-5	0.0	3.733059841073688E-5	0.03957250823751502	1.2443532803578958E-4
14-15	5.641068204289128E-4	1.0369610669649133E-4	0.0	3.733059841073688E-5	0.04575901796302769	1.3480493870543872E-4
16-17	6.44989783652176E-4	1.2028748376792994E-4	0.0	3.733059841073688E-5	0.0495833303779943	1.410267051072282E-4
18-19	8.088296322326323E-4	1.3687886083936854E-4	0.0	3.733059841073688E-5	0.05250756058683535	1.410267051072282E-4
20-21	0.001171766005670352	1.8250514778582472E-4	0.0	3.94045205446667E-5	0.055197437594542334	1.410267051072282E-4
22-23	0.001532628456974142	1.9080083632154406E-4	0.0	4.147844267859653E-5	0.05781057948329391	1.5554416004473698E-4
24-25	0.0016964683055545981	1.949486805894037E-4	0.0	4.147844267859653E-5	0.06060000475342953	1.576180821786668E-4
26-27	0.0017856469573135805	1.949486805894037E-4	0.0	4.147844267859653E-5	0.06295390637543988	1.576180821786668E-4
28-29	0.0019536346501618966	1.949486805894037E-4	0.0	4.355236481252636E-5	0.06561889631753971	1.5969200431259663E-4
30-31	0.002306201412929967	1.9909652485726334E-4	0.0	6.221766401789479E-5	0.0684207651204789	1.638398485804563E-4
32-33	0.002536406769796178	2.0739221339298266E-4	0.0	6.429158615182463E-5	0.07105672015270371	1.7628338138403525E-4
34-35	0.0026815813191712655	2.0739221339298266E-4	0.0	7.88090410893334E-5	0.07384614542283933	1.8457906991975457E-4
36-37	0.0027043944626444936	2.0739221339298266E-4	0.0	8.710472962505272E-5	0.07627263431953724	1.9909652485726334E-4
38-39	0.0027375772167873708	2.2398359046442125E-4	0.0	1.0369610669649133E-4	0.07879244971226197	2.1154005766084233E-4
40-41	0.002779055659465968	2.2398359046442125E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.0810198420841026	2.1568790192870197E-4
42-43	0.002795647036537406	2.281314347322809E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.0832658997551486	2.1568790192870197E-4
44-45	0.002820534102144564	2.447228118037195E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.08580023260281086	2.1568790192870197E-4
46-47	0.002845421167751722	2.4679673393764934E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.09001859022322412	2.198357461965616E-4
48-49	0.0028765299997606693	2.50944578205509E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.09249900109540418	2.2813143473228092E-4
50-51	0.0029097127539035464	2.5301850033943886E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.09508932984068255	2.3435320113407042E-4
52-53	0.002963634729385722	2.5301850033943886E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.09713006922046949	2.4057496753585988E-4
54-55	0.0030009653277964588	2.550924224733687E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.0990007469852742	2.447228118037195E-4
56-57	0.003079774368885792	2.6131418887515815E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.10100415576665042	2.4887065607157916E-4
58-59	0.0031150310451625992	2.6960987741087743E-4	0.0	1.1613963950007028E-4	0.10299512101522304	2.5301850033943886E-4
60-61	0.003237392451064459	2.737577216787371E-4	0.0	1.1613963950007028E-4	0.10499645587446532	2.5301850033943886E-4
62-63	0.003299610115082354	2.820534102144564E-4	0.0	1.1613963950007028E-4	0.10721555255777024	2.5301850033943886E-4
64-65	0.003320349336421652	2.820534102144564E-4	0.0	1.2236140590185976E-4	0.10961508046672705	2.5301850033943886E-4
66-67	0.003336940713493091	2.9657086515196517E-4	0.0	1.2443532803578958E-4	0.11189639481404987	2.571663446072985E-4
68-69	0.003370123467635968	3.1316224222340385E-4	0.0	1.2650925016971943E-4	0.11371107668123845	2.6960987741087743E-4
70-71	0.003421971520984214	3.193840086251933E-4	0.0	1.2858317230364925E-4	0.11587002962265941	2.6960987741087743E-4
72-73	0.0034510064308592315	3.2145793075912313E-4	0.0	1.3065709443757907E-4	0.11743584083377642	2.6960987741087743E-4
74-75	0.0034800413407342487	3.276796971609126E-4	0.0	1.327310165715089E-4	0.11907009147531313	2.6960987741087743E-4
76-77	0.003500780562073547	3.297536192948424E-4	0.0	1.3480493870543872E-4	0.12024393140311741	2.6960987741087743E-4
78-79	0.0035235937055467753	3.3182754142877224E-4	0.0	1.4932239364294752E-4	0.12160235040084144	2.6960987741087743E-4
80-81	0.003550554693287863	3.3182754142877224E-4	0.0	1.5347023791080716E-4	0.1229545476321637	2.6960987741087743E-4
82-83	0.003565072148225372	3.359753856966319E-4	0.0	1.5347023791080716E-4	0.12444777156859317	2.6960987741087743E-4
84-85	0.003594107058100389	3.4219715209842134E-4	0.0	1.5347023791080716E-4	0.1259264780500851	2.6960987741087743E-4
86-87	0.0036314376565111262	3.504928406341407E-4	0.0	1.5554416004473698E-4	0.12725378821580025	2.6960987741087743E-4
88-89	0.003662546488520074	3.525667627680705E-4	2.0739221339298265E-6	1.6176592644652645E-4	0.12861842897992604	2.6960987741087743E-4
90-91	0.003672916099189723	3.525667627680705E-4	4.147844267859653E-6	1.6591377071438612E-4	0.13044140653565037	2.6960987741087743E-4
92-93	0.0037143945418683195	3.5464068490200033E-4	4.147844267859653E-6	1.6591377071438612E-4	0.13215861406254426	2.6960987741087743E-4
94-95	0.0037724643616183543	3.5671460703593015E-4	4.147844267859653E-6	1.6591377071438612E-4	0.1335792507242862	2.737577216787371E-4
96-97	0.003818090648564811	3.650102955716495E-4	4.147844267859653E-6	1.6591377071438612E-4	0.13480701262757266	2.779055659465968E-4
98-99	0.003874086546180916	3.650102955716495E-4	4.147844267859653E-6	1.721355371161756E-4	0.1359518176455019	2.779055659465968E-4
100-101	0.003996447952082776	3.650102955716495E-4	4.147844267859653E-6	1.7420945925010543E-4	0.13718165347092232	2.779055659465968E-4
102-103	0.004017187173422074	3.670842177055793E-4	4.147844267859653E-6	1.7835730351796507E-4	0.1381688404066729	2.779055659465968E-4
104-105	0.004042074239029232	3.6915813983950913E-4	4.147844267859653E-6	1.8872691418761424E-4	0.1391643230309592	2.779055659465968E-4
106-107	0.004089774448109618	3.7123206197343895E-4	4.147844267859653E-6	2.0324436912512299E-4	0.1402614278398081	2.799794880805266E-4
108-109	0.004114661513716776	3.774538283752284E-4	4.147844267859653E-6	2.1568790192870197E-4	0.1412714279190319	2.820534102144564E-4
110-111	0.004170657411332881	3.8574951691094776E-4	4.147844267859653E-6	2.177618240626318E-4	0.1422378756334432	2.820534102144564E-4
112-113	0.004251540374556145	3.878234390448776E-4	4.147844267859653E-6	2.2398359046442125E-4	0.14336816319643497	2.820534102144564E-4
114-115	0.004274353518029373	3.898973611788074E-4	4.147844267859653E-6	2.2398359046442125E-4	0.14467266021867684	2.820534102144564E-4
116-117	0.004330349415645477	3.9404520544666704E-4	4.147844267859653E-6	2.2398359046442125E-4	0.145554077125597	2.820534102144564E-4
118-119	0.004400862768199091	4.1063658251810567E-4	4.147844267859653E-6	2.2398359046442125E-4	0.1463794981349011	2.820534102144564E-4
120-121	0.00453774162903846	4.3137580385740394E-4	4.147844267859653E-6	2.2813143473228092E-4	0.1472360279762141	2.820534102144564E-4
122-123	0.004720246776824285	4.3344972599133376E-4	4.147844267859653E-6	2.447228118037195E-4	0.14805937506338424	2.820534102144564E-4
124-125	0.004867495248333303	4.355236481252636E-4	4.147844267859653E-6	2.4887065607157916E-4	0.1489864182572509	2.8620125448231606E-4
126-127	0.004906899768877969	4.355236481252636E-4	4.147844267859653E-6	2.4887065607157916E-4	0.1498719830084389	2.8620125448231606E-4
128-129	0.004954599977958355	4.355236481252636E-4	4.147844267859653E-6	2.50944578205509E-4	0.15049623357075181	2.903490987501757E-4
130-131	0.005039630785449479	4.396714923931232E-4	4.147844267859653E-6	2.550924224733687E-4	0.15119514532988615	2.903490987501757E-4
132-133	0.005089404916663794	4.396714923931232E-4	4.147844267859653E-6	2.654620331430178E-4	0.15188576140048476	2.924230208841055E-4
134-135	0.005191027101226355	4.396714923931232E-4	4.147844267859653E-6	2.675359552769476E-4	0.1526510386679049	2.9449694301803534E-4
136-137	0.005307166740726426	4.6455855800028113E-4	4.147844267859653E-6	2.6960987741087743E-4	0.15350549458708396	2.9657086515196517E-4
138-139	0.00537560617114611	4.8114993507171976E-4	4.147844267859653E-6	2.6960987741087743E-4	0.15419611065768263	2.9864478728589504E-4
>>END_MODULE
