##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.4d.R.1.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	21817240
Total Bases	3.2 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.87242437631891	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.76553487058858	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.94667771908821	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.90238861560857	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.77477435275956	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.75838016174365	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.75752372894097	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.899656556008004	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.88337800748399	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.864260034724836	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
15-19	34.867466975657784	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.87201795460838	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.85900713380795	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.84740831562563	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.842421094510584	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.77689861779034	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.68900591458865	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.64873677880429	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.638562595452036	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.61252347226322	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.59426071308745	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.56652570169279	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
75-79	34.54628486462999	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.52498410431384	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.50457839763416	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.47737440666189	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.45094666419767	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.41200331480975	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.36386440264671	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.331532934505006	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.28589723539733	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.2484110455768	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.20518878648262	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
130-134	34.14797977196016	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.10180247364011	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.06525469766111	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.00503168136758	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	33.975065086142884	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	20.0
22	382.0
23	3739.0
24	22122.0
25	82258.0
26	198368.0
27	348705.0
28	505105.0
29	655389.0
30	818778.0
31	1031953.0
32	1324803.0
33	1751089.0
34	2428494.0
35	3813017.0
36	7873326.0
37	959686.0
38	5.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.35947325333303	11.048950580980565	14.93741144301641	37.65416472267
2	23.303443003527356	11.952656071693156	35.62412061932234	29.119780305457148
3	21.521755969937523	16.385333976861407	28.207856817753672	33.8850532354474
4	26.585348984020936	23.59633997549918	22.3093251384651	27.50898590201479
5	26.700249302993456	29.585964339097725	24.38374501030768	19.33004134760114
6	20.01294298367721	36.43673123246741	25.215258805129487	18.33506697872589
7	16.270134106985644	25.67537972778185	39.8939956020037	18.160490563228805
8	18.53940994288454	24.894626764833816	31.453192227603804	25.11277106467784
9	19.731936454767485	23.05700796366539	32.84817975163191	24.362875829935213
10-14	20.30593023961466	29.356550676814745	27.207272648602505	23.130246434968086
15-19	20.525615563573236	27.92459359233662	27.925425964278833	23.624364879811314
20-24	20.670745694384163	28.10653191006803	27.67142826616473	23.55129412938308
25-29	20.682151334939178	28.25295656737852	27.532552955520494	23.53233914216181
30-34	20.624356615040153	28.051206562857985	27.562933905270597	23.76150291683127
35-39	20.71302593823313	27.95642262867902	27.62127709631012	23.709274336777725
40-44	20.7329565574417	28.059940654625226	27.54122048943415	23.665882298498925
45-49	20.806932792666494	27.837486797571565	27.51642628923149	23.839154120530452
50-54	20.941320211028934	27.818309332820217	27.589011244985183	23.651359211165662
55-59	20.93132116202684	27.84696555485684	27.529538186576207	23.69217509654011
60-64	20.881214208429856	27.774481650092376	27.506718397022777	23.837585744454987
65-69	20.970368854133515	27.699586616446776	27.607273093022993	23.72277143639672
70-74	21.103630529048424	27.62467871974984	27.57492523983659	23.696765511365147
75-79	21.111129811972194	27.54661038367512	27.577864656111423	23.76439514824127
80-84	21.181288929076594	27.542632970328203	27.52010576474436	23.755972335850842
85-89	21.117599327905097	27.55647860076361	27.621897756889226	23.70402431444207
90-94	21.10382827927367	27.486455337181827	27.545362194439072	23.864354189105434
95-99	21.190487684261498	27.389692263157173	27.670681919507334	23.749138133073995
100-104	21.274390061790122	27.452179305372336	27.509074927331	23.76435570550654
105-109	21.212453282918265	27.30637731720823	27.62287284382541	23.858296556048096
110-114	21.27450048045613	27.270919523419344	27.695140166666054	23.75943982945847
115-119	21.29902377527122	27.307162422056415	27.6733369911219	23.720476811550466
120-124	21.26513583846838	27.22168320796401	27.677314703426276	23.835866250141333
125-129	21.304501446302865	27.149959830344244	27.74361581427539	23.801922909077494
130-134	21.369318858619184	27.26832724324796	27.630956575325865	23.731397322806988
135-139	21.35797308071215	27.13042489651355	27.74901469730938	23.762587325464917
140-144	21.365913477959428	27.063720010126683	27.895031766257954	23.67533474565593
145-149	21.364111535053922	27.698887314514227	27.520649030720644	23.41635211971121
150	21.22818972550214	27.270715930649708	27.600272684149918	23.90082165969823
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	1.5
9	1.5
10	3.5
11	7.0
12	13.0
13	23.0
14	39.5
15	77.5
16	167.0
17	335.0
18	680.5
19	1288.5
20	2370.0
21	3896.0
22	5979.5
23	9345.5
24	14512.0
25	22121.0
26	32275.5
27	45080.0
28	60835.0
29	83267.0
30	111631.5
31	141297.5
32	171640.5
33	205536.5
34	241111.5
35	283678.5
36	349016.0
37	437079.0
38	543833.0
39	675625.0
40	827708.0
41	981623.5
42	1135364.0
43	1291812.5
44	1422490.0
45	1499547.5
46	1516877.0
47	1479354.0
48	1400119.5
49	1282962.5
50	1132643.5
51	972993.0
52	812623.0
53	653192.5
54	508705.0
55	385033.5
56	288127.0
57	215757.0
58	161754.5
59	120653.0
60	85210.0
61	60098.0
62	43930.5
63	28879.0
64	18128.5
65	13521.5
66	12450.0
67	10260.0
68	5711.0
69	2616.0
70	1893.0
71	1312.5
72	608.5
73	240.5
74	103.5
75	63.0
76	43.0
77	37.5
78	18.0
79	2.0
80	2.0
81	1.0
82	0.5
83	1.0
84	0.5
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	3.345977768040321E-4
2	1.7875771637475686E-4
3	4.583531189096329E-5
4	4.1251780701866966E-5
5	5.9585905458252273E-5
6	6.416943664734861E-5
7	1.4667299805108254E-4
8	1.375059356728899E-4
9	1.1458827972740824E-4
10-14	2.0167537232023848E-4
15-19	3.2176388947456234E-4
20-24	2.1725937836316602E-4
25-29	3.721827325546219E-4
30-34	9.55207899807675E-4
35-39	9.643749621858677E-4
40-44	0.0012577209582880326
45-49	0.0010587957046812521
50-54	6.279437729061971E-4
55-59	4.198514569212238E-4
60-64	2.594278653028522E-4
65-69	3.1259682709636964E-4
70-74	3.327643643283935E-4
75-79	2.878457586752495E-4
80-84	2.951794085778036E-4
85-89	3.8043308869499537E-4
90-94	3.923502697866458E-4
95-99	3.061798834316348E-4
100-104	4.381855816776091E-4
105-109	2.731784588701412E-4
110-114	2.548443341137559E-4
115-119	2.31009971930455E-4
120-124	2.1817608460098528E-4
125-129	1.1642169220304676E-4
130-134	1.4117276062416696E-4
135-139	1.640904165696486E-4
140-144	1.5492335419145593E-4
145-149	1.906748974664073E-4
150	2.6126127777849074E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.181724E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	52.64086393939039
#Duplication Level	Percentage of total
1	40.621557567095614
2	11.583649693244592
3	6.673564265597561
4	4.554735847000305
5	3.381877476879859
6	2.7477291980602545
7	2.203723997051945
8	1.8076058688663144
9	1.545668837539071
>10	16.8678288418426
>50	4.033142840293454
>100	3.4633557408557105
>500	0.2902599996799574
>1k	0.22529982599267395
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.3750593567288987E-5	0.0	4.5835311890963294E-6	9.167062378192659E-5	2.2917655945481648E-5
2	0.0	1.1917181091650456E-4	0.0	9.167062378192659E-6	0.0016225700409401005	4.5835311890963296E-5
3	0.0	1.558400604292752E-4	0.0	9.167062378192659E-6	0.0026538645584867748	8.250356140373393E-5
4	1.8334124756385318E-5	1.695906539965642E-4	0.0	1.3750593567288987E-5	0.004065592164728444	9.167062378192659E-5
5	3.2084718323674305E-5	1.695906539965642E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.005170223181300659	9.625415497102292E-5
6	6.416943664734861E-5	1.695906539965642E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.00634360716570932	1.0083768616011924E-4
7	6.875296783644493E-5	2.0167537232023848E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.007452821713470632	1.0083768616011924E-4
8	1.0083768616011924E-4	2.0167537232023848E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.009671250808993255	1.1458827972740824E-4
9	1.1458827972740824E-4	2.0167537232023848E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.01293472501562984	1.1458827972740824E-4
10-11	1.5813182602382334E-4	2.1542596588752748E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.01719282549030033	1.5125652924017887E-4
12-13	2.3605185623846097E-4	2.1542596588752748E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.02077714688017366	1.7875771637475686E-4
14-15	2.452189186166536E-4	2.2459302826572015E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.025161294462544302	2.016753723202385E-4
16-17	2.795954025348761E-4	2.5438598099484627E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.029682947980587827	2.1771773148207562E-4
18-19	3.0251305848035773E-4	2.704283401566834E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.03348498710194323	2.3605185623846097E-4
20-21	3.34597776804032E-4	3.0022129288580956E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.03687680018187452	2.452189186166536E-4
22-23	4.079342758295733E-4	3.070965896694541E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.04046799686853149	2.5667774658939444E-4
24-25	4.7210371247692195E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.04453588079885448	2.658448089675871E-4
26-27	5.362731491242705E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	2.2917655945481648E-5	0.04873897889925582	2.773036369403279E-4
28-29	5.683578674479449E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	2.2917655945481648E-5	0.053361470103459464	2.933459961021651E-4
30-31	6.073178825552637E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	2.7501187134577975E-5	0.057935834230177605	2.979295272912614E-4
32-33	6.669037880135159E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	2.7501187134577975E-5	0.061682870977263854	3.3230601120948385E-4
34-35	7.081555687153829E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	3.8960015107318804E-5	0.06558116425359029	3.4147307358767655E-4
36-37	7.2419792787722E-4	3.2313894883129126E-4	0.0	5.041884308005962E-5	0.06940153749970207	3.437648391822247E-4
38-39	7.379485214445091E-4	3.300142456149357E-4	0.0	5.041884308005962E-5	0.07382464509718002	3.437648391822247E-4
40-41	7.723250053627314E-4	3.300142456149357E-4	0.0	5.271060867460779E-5	0.07730812880089324	3.48348370371321E-4
42-43	7.79200302146376E-4	3.368895423985802E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.08074577719271549	3.552236671549655E-4
44-45	7.998261924973094E-4	3.437648391822247E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.08471282343687836	3.5751543274951367E-4
46-47	8.296191452264357E-4	3.460566047767729E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.08898238273952158	3.5751543274951367E-4
48-49	8.525368011719172E-4	3.48348370371321E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.09284400776633525	3.7126602631680267E-4
50-51	8.662873947392063E-4	3.5293190156041737E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.09703106350757475	3.804330886949953E-4
52-53	9.212897690083622E-4	3.5293190156041737E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.1012112439520306	3.8501661988409166E-4
54-55	9.671250808993255E-4	3.552236671549655E-4	0.0	6.416943664734861E-5	0.1046374335158801	3.89600151073188E-4
56-57	0.0010083768616011924	3.6209896393861E-4	0.0	6.416943664734861E-5	0.10852197619863924	3.918919166677362E-4
58-59	0.0010358780487357705	3.7355779191135084E-4	0.0	7.792003021463761E-5	0.11253714952028762	3.964754478568325E-4
60-61	0.0010656710014648966	3.8501661988409166E-4	0.0	8.250356140373393E-5	0.11595646378735348	4.102260414241215E-4
62-63	0.001100047485383119	3.918919166677362E-4	0.0	8.47953269982821E-5	0.11927952389944832	4.1251780701866966E-4
64-65	0.0011229651413286006	4.010589790459288E-4	0.0	8.937885818737843E-5	0.12375992563678999	4.1710133820776595E-4
66-67	0.0011458827972740822	4.239766349914105E-4	0.0	9.167062378192659E-5	0.12779343308319474	4.216848693968623E-4
68-69	0.0011871345779759493	4.400189941532476E-4	0.0	9.167062378192659E-5	0.13094690254129304	4.3543546296415125E-4
70-71	0.0012604710770014907	4.606448845041811E-4	0.0	9.854592056557108E-5	0.133680978895589	4.468942909368921E-4
72-73	0.0013246405136488391	4.6293665009872924E-4	0.0	1.100047485383119E-4	0.1366258976845834	4.5376958772053665E-4
74-75	0.001363600528756158	4.7439547807147007E-4	0.0	1.237553421056009E-4	0.14001312723332557	4.5835311890963295E-4
76-77	0.0014140193718362175	4.904378372333072E-4	0.0	1.306306388892454E-4	0.1425982388239759	4.5835311890963295E-4
78-79	0.0014736052772944697	4.950213684224036E-4	0.0	1.443812324565344E-4	0.14496792444873868	4.6293665009872924E-4
80-81	0.001503398230023596	4.950213684224036E-4	0.0	1.5125652924017887E-4	0.14764012313198188	4.6293665009872924E-4
82-83	0.001528607651563626	5.041884308005962E-4	0.0	1.5125652924017887E-4	0.1502114841290649	4.6293665009872924E-4
84-85	0.0015744429634545892	5.133554931787889E-4	0.0	1.5813182602382336E-4	0.15243908028696573	4.6293665009872924E-4
86-87	0.0016798641808038048	5.133554931787889E-4	0.0	1.6500712280746786E-4	0.15451541991562637	4.675201812878256E-4
88-89	0.0017348665550729605	5.179390243678852E-4	2.2917655945481647E-6	1.6500712280746786E-4	0.15662384426261067	4.675201812878256E-4
90-91	0.0017669512733966349	5.225225555569816E-4	4.5835311890963294E-6	1.6500712280746786E-4	0.15924104057158467	4.7210371247692195E-4
92-93	0.0018013277573148574	5.225225555569816E-4	4.5835311890963294E-6	1.6500712280746786E-4	0.161826152162235	4.8356254044966277E-4
94-95	0.0018540383659894652	5.248143211515297E-4	4.5835311890963294E-6	1.6500712280746786E-4	0.16463585678115106	4.904378372333072E-4
96-97	0.001950292520960488	5.408566803133669E-4	4.5835311890963294E-6	1.6500712280746786E-4	0.16698720828115748	4.904378372333072E-4
98-99	0.002037379613553318	5.43148445907915E-4	4.5835311890963294E-6	1.6729888840201604E-4	0.16889395725582154	4.904378372333072E-4
100-101	0.0020900902222279263	5.454402115024632E-4	4.5835311890963294E-6	1.695906539965642E-4	0.1710757181018314	4.904378372333072E-4
102-103	0.002145092596497082	5.454402115024632E-4	4.5835311890963294E-6	1.695906539965642E-4	0.17288621292152445	4.904378372333072E-4
104-105	0.0021794690804153045	5.454402115024632E-4	4.5835311890963294E-6	1.7188241959111234E-4	0.17478379483381035	4.904378372333072E-4
106-107	0.002241346751468105	5.477319770970114E-4	4.5835311890963294E-6	1.741741851856605E-4	0.17648886843615416	4.904378372333072E-4
108-109	0.0023467679688173207	5.546072738806558E-4	4.5835311890963294E-6	1.741741851856605E-4	0.17803351844687965	5.087719619896925E-4
110-111	0.002449897420571988	5.591908050697522E-4	4.5835311890963294E-6	1.7646595078020869E-4	0.17963317083187424	5.087719619896925E-4
112-113	0.0025232339195975294	5.614825706643004E-4	9.167062378192659E-6	1.8563301315840133E-4	0.18127636676316528	5.133554931787889E-4
114-115	0.002564485700299396	5.660661018533966E-4	9.167062378192659E-6	1.879247787529495E-4	0.18300664978704914	5.156472587733371E-4
116-117	0.002603445715406715	5.70649633042493E-4	9.167062378192659E-6	1.9709184113114216E-4	0.18476901752925667	5.179390243678852E-4
118-119	0.0026676151520540637	5.775249298261375E-4	9.167062378192659E-6	2.016753723202385E-4	0.1862976251808203	5.179390243678852E-4
120-121	0.002727201057512316	5.821084610152338E-4	9.167062378192659E-6	2.0625890350933483E-4	0.1877643551613311	5.179390243678852E-4
122-123	0.0029197093674543616	5.84400226609782E-4	9.167062378192659E-6	2.0625890350933483E-4	0.1891760827675728	5.179390243678852E-4
124-125	0.003052631771938155	5.866919922043302E-4	1.1458827972740822E-5	2.0625890350933483E-4	0.1907986528085129	5.179390243678852E-4
126-127	0.0030686741310999924	5.958590545825228E-4	1.3750593567288987E-5	2.0625890350933483E-4	0.19246018286456032	5.179390243678852E-4
128-129	0.0031076341462073116	6.027343513661672E-4	1.3750593567288987E-5	2.1313420029297933E-4	0.19381919986212737	5.179390243678852E-4
130-131	0.003169511817260112	6.141931793389082E-4	1.3750593567288987E-5	2.2917655945481647E-4	0.19517363332850535	5.179390243678852E-4
132-133	0.00325889067544749	6.187767105280044E-4	1.3750593567288987E-5	2.4292715302210544E-4	0.19643639617110137	5.179390243678852E-4
134-135	0.0033918130799312834	6.187767105280044E-4	1.3750593567288987E-5	2.4292715302210544E-4	0.19752040129732268	5.179390243678852E-4
136-137	0.0035339025467932697	6.256520073116489E-4	1.3750593567288987E-5	2.4292715302210544E-4	0.1986960770473259	5.179390243678852E-4
138-139	0.0035889049210624255	6.439861320680343E-4	1.3750593567288987E-5	2.4292715302210544E-4	0.199796124532709	5.179390243678852E-4
>>END_MODULE
