##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.4d.S.1.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24210574
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.9819036921636	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.8629327830063	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	35.019802793605805	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.982710281879314	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.84223017595535	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.822007937523495	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.81881838076206	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.98468702146426	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.97000157864907	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.95261931418892	35.2	34.0	37.4	31.6	39.0
15-19	34.95194756638153	35.0	34.0	37.0	31.8	39.0
20-24	34.96347740454233	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
25-29	34.954892610146295	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
30-34	34.94479803741952	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
35-39	34.939257507897175	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.87990766348621	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.786984455634965	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.75280131730871	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.74316214064153	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.717198402648364	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.70106018965102	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.675534714707716	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.658361458096785	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.63128798185454	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
85-89	34.61295862708583	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
90-94	34.5891221331638	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.55557172663482	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.5206312663219	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.46431343593919	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.43621512649803	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.38750541808716	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.35318116786492	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.30307555698597	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.25383308962439	35.0	34.0	37.0	29.6	39.0
135-139	34.20247160600158	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.17514258026266	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.109152975885664	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	34.07797254208017	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	30.0
22	377.0
23	3800.0
24	23204.0
25	86538.0
26	210372.0
27	373040.0
28	537987.0
29	698437.0
30	872492.0
31	1096751.0
32	1406396.0
33	1856344.0
34	2585885.0
35	4074568.0
36	8880732.0
37	1503614.0
38	6.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.089466805289725	10.49603314661131	15.124607716676966	38.289892331421996
2	23.635872490193314	11.54817346006056	35.22948898681689	29.58646506292923
3	21.916359796416092	16.36143619655524	28.018982462114256	33.70322154491441
4	27.158609535788553	23.55780093002385	21.900222720976075	27.383366813211524
5	27.46998862108434	29.61030198094906	23.843510149927507	19.07619924803909
6	20.30943612442739	36.30029696966042	24.68590764176648	18.70435926414571
7	16.63269313910149	25.09842726613397	39.74362877091803	18.525250823846513
8	19.150699248823404	24.178321089085454	30.929166753405706	25.741812908685436
9	20.100891561810165	22.501047890365804	32.40993140675709	24.988129141066942
10-14	20.852642699641144	28.801323576124542	26.704105582090016	23.641928142144298
15-19	21.1903177154709	27.44764118549865	27.398101558968733	23.963939540061713
20-24	21.18641634340787	27.545484176438666	27.20836804825616	24.0597314318973
25-29	21.147224616407843	27.767939716219725	26.942808662368456	24.14202700500398
30-34	21.102734924396312	27.64321951752563	27.05634976309583	24.19769579498222
35-39	21.34099539851313	27.373391784597224	27.01676558575975	24.268847231129897
40-44	21.42276357919257	27.463786070303044	26.92679316760981	24.18665718289458
45-49	21.637144729540967	27.388135276644814	26.834798560186513	24.139921433627705
50-54	21.639858290574374	27.533116783256574	26.76755872027985	24.0594662058892
55-59	21.580661928761042	27.48052615445868	26.893709847644274	24.045102069136
60-64	21.781030986942028	27.361447779576693	26.65411377342824	24.203407460053036
65-69	21.698867870205994	27.42043422941341	26.803887501239853	24.076810399140744
70-74	21.972813237423168	27.240331921598077	26.750551632820425	24.036303208158326
75-79	21.811950264575177	27.20646859566362	26.731312971102223	24.250268168658984
80-84	22.086046765352002	27.167505218332046	26.68564266488223	24.06080535143372
85-89	21.941773253733125	27.192527998918152	26.764798513569882	24.100900233778837
90-94	21.93545562406355	26.98446767359996	26.72133115934322	24.358745542993272
95-99	22.143698725662155	27.026676207649846	26.818021309330263	24.011603757357737
100-104	22.12062503735987	26.85712878530865	26.868851812771116	24.153394364560363
105-109	22.215492270604535	26.817044393267036	26.82375305018368	24.14371028594475
110-114	22.159355238237453	26.855467972316294	26.804417432198974	24.18075935724728
115-119	22.259209083945777	27.018014169940052	26.717724859328502	24.005051886785672
120-124	22.14758121621397	26.895008644753432	26.80207219647483	24.155337942557768
125-129	22.466191153144702	26.852851347589418	26.71208456805374	23.968872931212136
130-134	22.241707681254525	27.02169678037891	26.62848278899049	24.108112749376076
135-139	22.36753865087623	26.83117844660188	26.685107341977343	24.11617556054455
140-144	22.306480305157063	26.696256759422894	26.91679793389785	24.08046500152219
145-149	22.2150765719621	27.25449148314489	26.770450091044673	23.759981853848338
150	22.010097757487614	26.851434524919824	26.819708652319957	24.318759065272605
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.5
9	1.5
10	2.5
11	4.5
12	14.0
13	20.0
14	30.5
15	57.5
16	116.0
17	265.0
18	596.0
19	1052.0
20	1783.0
21	2895.0
22	4645.5
23	7353.5
24	11696.0
25	17744.0
26	25036.5
27	34952.0
28	52250.5
29	76434.0
30	104033.5
31	132571.0
32	162515.0
33	197327.0
34	233490.0
35	279864.0
36	346757.0
37	423107.0
38	506073.0
39	618449.5
40	768171.5
41	933532.5
42	1098018.5
43	1258939.5
44	1402123.5
45	1502844.0
46	1561880.5
47	1573333.5
48	1526811.5
49	1461019.0
50	1360517.0
51	1212595.5
52	1036821.5
53	872410.0
54	722867.5
55	593517.0
56	499456.5
57	411531.5
58	339388.5
59	272999.5
60	207112.0
61	144090.5
62	85802.0
63	49268.0
64	30846.5
65	18648.5
66	12176.5
67	5858.0
68	2327.5
69	1310.5
70	1260.0
71	1022.5
72	530.5
73	191.0
74	95.5
75	54.0
76	28.5
77	19.5
78	8.5
79	2.5
80	2.5
81	1.5
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.5
87	1.0
88	0.5
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	3.0978199855980285E-4
2	1.8173877248841766E-4
3	6.60868263594246E-5
4	4.956511976956845E-5
5	2.8912986532248264E-5
6	8.260853294928076E-5
7	2.3543431890545014E-4
8	9.086938624420883E-5
9	1.0739109283406498E-4
10-14	1.8008660182943203E-4
15-19	2.3295606291697175E-4
20-24	1.833909431474033E-4
25-29	2.8252118268654015E-4
30-34	7.996505989490378E-4
35-39	7.525637351679477E-4
40-44	9.723024328130345E-4
45-49	8.921721558522322E-4
50-54	5.402598054882961E-4
55-59	4.196513473823462E-4
60-64	2.4699951351834945E-4
65-69	3.362167291035727E-4
70-74	3.5356452102292164E-4
75-79	2.643473054376984E-4
80-84	2.486516841773351E-4
85-89	3.5108626503444325E-4
90-94	4.089122380989398E-4
95-99	2.940863772994395E-4
100-104	4.3121654199524556E-4
105-109	2.676516467556697E-4
110-114	2.3295606291697175E-4
115-119	2.2799955094001488E-4
120-124	2.1147784435015873E-4
125-129	1.3299973804834202E-4
130-134	1.726518338639968E-4
135-139	1.4952144463819818E-4
140-144	1.5778229793312625E-4
145-149	1.7017357787551835E-4
150	2.065213323732019E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4210574E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	44.965384879003075
#Duplication Level	Percentage of total
1	35.1392587188558
2	9.198500217045241
3	5.3010846858874565
4	3.6880580858106624
5	2.8292158088761945
6	2.1928431445795162
7	1.8207919940614203
8	1.5323267271760508
9	1.2765356094640796
>10	16.4030165922366
>50	5.158429808730528
>100	10.186319159938021
>500	2.9491468185637486
>1k	2.267191576776742
>5k	0.05728105199809154
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	3.30434131797123E-5	0.0	1.2391279942392113E-5	1.6108663925109749E-4	4.130426647464038E-5
2	1.2391279942392113E-5	1.2804322607138518E-4	0.0	2.4782559884784227E-5	0.001858691991358817	4.956511976956845E-5
3	1.2391279942392113E-5	1.528257859561694E-4	0.0	2.8912986532248264E-5	0.0036347754497683534	5.782597306449653E-5
4	5.782597306449653E-5	1.858691991358817E-4	0.0	3.30434131797123E-5	0.005357163361760857	7.021725300688864E-5
5	6.60868263594246E-5	1.858691991358817E-4	0.0	3.30434131797123E-5	0.0064889002631660034	7.434767965435268E-5
6	9.499981289167287E-5	1.941300524308098E-4	0.0	3.717383982717634E-5	0.007905636603246169	7.847810630181672E-5
7	1.197823727764571E-4	2.065213323732019E-4	0.0	3.717383982717634E-5	0.00924802526367198	7.847810630181672E-5
8	2.065213323732019E-4	2.1065175902066594E-4	0.0	3.717383982717634E-5	0.011974106850998246	9.086938624420883E-5
9	2.519560254953063E-4	2.1065175902066594E-4	0.0	4.130426647464038E-5	0.014729101424856759	9.086938624420883E-5
10-11	2.788037987038226E-4	2.1065175902066594E-4	0.0	4.5434693122104415E-5	0.026372774144057882	1.1358673280526105E-4
12-13	3.2217327850219497E-4	2.1271697234439795E-4	4.130426647464038E-6	4.956511976956845E-5	0.03521188716963092	1.2184758610018912E-4
14-15	3.490210517107112E-4	2.2097782563932603E-4	4.130426647464038E-6	4.956511976956845E-5	0.04207665625771615	1.321736527188492E-4
16-17	3.6760797162429935E-4	2.395647455529142E-4	4.130426647464038E-6	5.782597306449653E-5	0.04647349542394162	1.3836929269004527E-4
18-19	3.882601048616196E-4	2.5402123881903833E-4	4.130426647464038E-6	5.782597306449653E-5	0.04990794518130797	1.424997193375093E-4
20-21	6.071727171772136E-4	2.746733720563585E-4	4.130426647464038E-6	5.782597306449653E-5	0.05270011359499366	1.5489099927990142E-4
22-23	8.488026760538598E-4	2.8086901202755457E-4	4.130426647464038E-6	5.782597306449653E-5	0.05534152143604691	1.6934749254602556E-4
24-25	9.148895024132844E-4	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	6.195639971196057E-5	0.05796847278383403	1.7347791919348959E-4
26-27	9.747806888015129E-4	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	7.434767965435268E-5	0.06047151133219725	1.7347791919348959E-4
28-29	0.0010449979418084014	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	7.641289297808469E-5	0.06354041833126303	1.7967355916468565E-4
30-31	0.0012060845810594992	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	9.086938624420883E-5	0.06663617310353731	1.8793441245961373E-4
32-33	0.0012597801274765316	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	1.0532587951033297E-4	0.06941801545060436	2.2097782563932603E-4
34-35	0.0013361930204546161	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	1.1771715945272507E-4	0.07266040036886362	2.395647455529142E-4
36-37	0.0013671712203105965	2.8912986532248267E-4	4.130426647464038E-6	1.2597801274765315E-4	0.07565909011492251	2.457603855241103E-4
38-39	0.0013774972869292565	2.932602919699467E-4	4.130426647464038E-6	1.321736527188492E-4	0.07841821511542849	2.4782559884784227E-4
40-41	0.001410540700108969	2.932602919699467E-4	4.130426647464038E-6	1.4456493266124134E-4	0.08077875394445419	2.4782559884784227E-4
42-43	0.001422931980051361	2.932602919699467E-4	4.130426647464038E-6	1.4869535930870536E-4	0.08319505353322065	2.4782559884784227E-4
44-45	0.0014353232599937532	2.932602919699467E-4	4.130426647464038E-6	1.507605726324374E-4	0.08564026610851935	2.4782559884784227E-4
46-47	0.0014601058198785374	2.953255052936787E-4	4.130426647464038E-6	1.528257859561694E-4	0.08947949767733718	2.4782559884784227E-4
48-49	0.0014848883797633217	3.035863585886068E-4	4.130426647464038E-6	1.528257859561694E-4	0.09219731841136852	2.581516654665024E-4
50-51	0.0015096709396481057	3.118472118835349E-4	4.130426647464038E-6	1.5695621260363344E-4	0.09500394331832032	2.622820921139664E-4
52-53	0.0015344534995328902	3.2217327850219497E-4	4.130426647464038E-6	1.652170658985615E-4	0.09774654661223646	2.6847773208516244E-4
54-55	0.0015716273393600664	3.26303705149659E-4	4.130426647464038E-6	1.652170658985615E-4	0.09993154230874493	2.6847773208516244E-4
56-57	0.0016108663925109748	3.3249934512085506E-4	4.130426647464038E-6	1.6728227922229355E-4	0.10212066843190087	2.6847773208516244E-4
58-59	0.001645975019014419	3.448906250632472E-4	4.130426647464038E-6	1.6934749254602556E-4	0.10411772971594974	2.6847773208516244E-4
60-61	0.00174923568520102	3.5315147835817524E-4	4.130426647464038E-6	1.6934749254602556E-4	0.1061540300531495	2.6847773208516244E-4
62-63	0.0018256485781791047	3.6760797162429935E-4	4.130426647464038E-6	1.7347791919348959E-4	0.10853522101541252	2.6847773208516244E-4
64-65	0.0018483659247401569	3.738036115954954E-4	4.130426647464038E-6	1.8173877248841766E-4	0.11159380194785964	2.6847773208516244E-4
66-67	0.001864887631330013	3.944557448328156E-4	4.130426647464038E-6	1.858691991358817E-4	0.11460901340050839	2.6847773208516244E-4
68-69	0.0018876049778910652	4.1304266474640383E-4	4.130426647464038E-6	1.858691991358817E-4	0.11659368340461486	2.6847773208516244E-4
70-71	0.0019309744576894378	4.233687313650639E-4	4.130426647464038E-6	1.961952657545418E-4	0.11874357047461989	2.7673858538009054E-4
72-73	0.0019557570175742223	4.274991580125279E-4	4.130426647464038E-6	1.982604790782738E-4	0.12045563231999373	2.8706465199875063E-4
74-75	0.001968148297516614	4.2956437133625993E-4	4.130426647464038E-6	2.0032569240200585E-4	0.12238660677768318	2.8912986532248267E-4
76-77	0.001988800430753934	4.2956437133625993E-4	4.130426647464038E-6	2.0652133237320192E-4	0.12397269061030936	2.932602919699467E-4
78-79	0.0020218438439336467	4.3162958465999197E-4	4.130426647464038E-6	2.271734656105221E-4	0.12555670922961182	2.932602919699467E-4
80-81	0.0020445611904946984	4.3369479798372395E-4	4.130426647464038E-6	2.3130389225798611E-4	0.12709322794246844	2.932602919699467E-4
82-83	0.0020714089637032147	4.3782522463118803E-4	4.130426647464038E-6	2.3130389225798611E-4	0.1286772465617709	2.932602919699467E-4
84-85	0.0021478218566813	4.4195565127865205E-4	4.130426647464038E-6	2.3336910558171815E-4	0.1304553952335042	2.932602919699467E-4
86-87	0.002197386976450868	4.460860779261161E-4	4.130426647464038E-6	2.3956474555291422E-4	0.1321798483588204	2.932602919699467E-4
88-89	0.0022097782563932603	4.5228171789731214E-4	4.130426647464038E-6	2.4782559884784227E-4	0.13375560612482795	2.932602919699467E-4
90-91	0.0022221695363356525	4.564121445447762E-4	4.130426647464038E-6	2.519560254953063E-4	0.13642592695241346	2.932602919699467E-4
92-93	0.0022366260296017766	4.584773578685082E-4	4.130426647464038E-6	2.519560254953063E-4	0.1385448358225625	2.932602919699467E-4
94-95	0.0022799955094001487	4.584773578685082E-4	4.130426647464038E-6	2.5608645214277037E-4	0.14018874562825318	2.932602919699467E-4
96-97	0.0023233649891985213	4.584773578685082E-4	6.195639971196057E-6	2.5608645214277037E-4	0.1416612427280741	2.953255052936787E-4
98-99	0.002405973522147802	4.6673821116343625E-4	8.260853294928076E-6	2.5608645214277037E-4	0.1429829792552626	2.973907186174107E-4
100-101	0.002523690681600527	4.7086863781090033E-4	8.260853294928076E-6	2.643473054376984E-4	0.14444928071511232	2.973907186174107E-4
102-103	0.0025484732414853112	4.7086863781090033E-4	8.260853294928076E-6	2.643473054376984E-4	0.14554384377669027	2.973907186174107E-4
104-105	0.0025670601613989	4.7086863781090033E-4	8.260853294928076E-6	2.7260815873262647E-4	0.14676438485101592	2.973907186174107E-4
106-107	0.002622820921139664	4.7086863781090033E-4	1.2391279942392113E-5	2.9119507864621466E-4	0.14800970848522632	2.9945593194114276E-4
108-109	0.0026620599742905723	4.7086863781090033E-4	1.2391279942392113E-5	3.0978199855980285E-4	0.14914351059995523	3.0152114526487474E-4
110-111	0.0027178207340313367	4.791294911058284E-4	1.2391279942392113E-5	3.1597763853099886E-4	0.15033307347442487	3.0152114526487474E-4
112-113	0.0027818423470670293	4.894555577244885E-4	1.2391279942392113E-5	3.180428518547309E-4	0.15156600582869287	3.035863585886068E-4
114-115	0.002835537893484062	4.915207710482205E-4	1.2391279942392113E-5	3.26303705149659E-4	0.1531107853948444	3.056515719123388E-4
116-117	0.0028809725866061663	4.977164110194166E-4	1.2391279942392113E-5	3.30434131797123E-4	0.15432100040255137	3.056515719123388E-4
118-119	0.0029284724930520025	5.039120509906126E-4	1.2391279942392113E-5	3.3456455844458705E-4	0.15537219398433097	3.056515719123388E-4
120-121	0.0029883636794402315	5.039120509906126E-4	1.2391279942392113E-5	3.3456455844458705E-4	0.15656382207212435	3.056515719123388E-4
122-123	0.003182493731871041	5.039120509906126E-4	1.2391279942392113E-5	3.4695583838697917E-4	0.15771827632009056	3.056515719123388E-4
124-125	0.003279558758086446	5.039120509906126E-4	1.4456493266124132E-5	3.510862650344432E-4	0.15894914346103484	3.056515719123388E-4
126-127	0.0033311890911797465	5.059772643143446E-4	1.652170658985615E-5	3.510862650344432E-4	0.16024816264166228	3.056515719123388E-4
128-129	0.003401406344186635	5.101076909618087E-4	1.652170658985615E-5	3.552166916819073E-4	0.16123533461040618	3.056515719123388E-4
130-131	0.003490210517107112	5.142381176092728E-4	1.652170658985615E-5	3.614123316531033E-4	0.16202011567342434	3.077167852360708E-4
132-133	0.003570753836732661	5.204337575804688E-4	1.652170658985615E-5	3.717383982717634E-4	0.16280283152311878	3.0978199855980285E-4
134-135	0.0036616232229768697	5.204337575804688E-4	1.652170658985615E-5	3.738036115954954E-4	0.1637073949589134	3.1597763853099886E-4
136-137	0.0038041229423143785	5.36955464170325E-4	1.652170658985615E-5	3.7586882491922745E-4	0.16467391479442	3.180428518547309E-4
138-139	0.0038887966885873915	5.43151104141521E-4	1.652170658985615E-5	3.779340382429595E-4	0.16558260865686208	3.180428518547309E-4
>>END_MODULE
