##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.4d.S.3.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24025985
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.90082849881077	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.80746978739894	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.9705295745419	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.963043596339546	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.86708628179032	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.807725635390184	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.7901680201665	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.92315178753337	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.89736067012445	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.92116090974001	35.2	34.0	37.0	31.4	39.0
15-19	34.91872218350257	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.9201099642741	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.90984068291061	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.89272055235197	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.88142180226951	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.8257879042212	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.733677199915014	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.715426576683534	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.698296606778044	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.686768238638294	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.66408974283469	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.66036110486209	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.64190450464362	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.6262600929785	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
85-89	34.61416979990622	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
90-94	34.59902098498771	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.576852944842834	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.54160692267144	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.51469074004666	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.48091934628279	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.45718849820309	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.431521762791405	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.40085109517882	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.37240626763065	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.340771751917764	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.30592735323859	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.27441437260533	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	34.262846164267565	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	10.0
22	278.0
23	3086.0
24	20661.0
25	83705.0
26	207579.0
27	367341.0
28	523033.0
29	669405.0
30	832895.0
31	1047937.0
32	1360565.0
33	1841168.0
34	2661228.0
35	4344906.0
36	8643606.0
37	1418578.0
38	4.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.55770397057279	10.614469892090334	14.856116489813983	37.971709647522886
2	23.58461430885592	11.327551531759813	35.0860028069638	30.001831352420467
3	21.877372692965157	15.449141075261478	27.79856546894881	34.874920762824566
4	27.10919348076532	22.55730668536756	22.02702170057882	28.306478133288305
5	27.718663274837052	28.63508409295924	24.023145620212393	19.623107011991316
6	20.71087374927963	35.82411753556175	24.867208186613528	18.59780052854509
7	16.78260177197638	25.23675971734052	39.39178906665924	18.588849444023857
8	19.127779498142004	24.483270567786793	30.91568605905622	25.473263875014986
9	19.973104092406714	22.667214962482248	32.54322407928757	24.816456865823465
10-14	20.84146180103339	28.622027073975136	26.8763521577148	23.660158967276676
15-19	21.16600739876872	27.345142023891206	27.49288481639489	23.995965760945182
20-24	21.211669982927546	27.448098982089974	27.2864038459475	24.05382718903498
25-29	21.154402860351105	27.654248676853864	27.027050155204062	24.164298307590965
30-34	21.13411264559037	27.54323597236897	27.11390985181191	24.20874153022875
35-39	21.340623693880442	27.27444307659333	27.099613007562912	24.285320221963314
40-44	21.433903352885704	27.34966734442134	26.99232465829273	24.224104644400224
45-49	21.642164490736015	27.262732618322076	26.91822655536949	24.176876335572416
50-54	21.666467076505487	27.412328738364373	26.846092311279207	24.075111873850936
55-59	21.59798122247144	27.346980879790777	26.98047339544894	24.074564502288844
60-64	21.796637248877875	27.2212244144211	26.745781793626982	24.236356543074038
65-69	21.716686898618256	27.28567839462234	26.890524143691152	24.107110563068254
70-74	21.9856137877087	27.115728050550068	26.82700571603478	24.07165244570645
75-79	21.831818397873025	27.083250956905395	26.817164619860428	24.267766025361144
80-84	22.08773691458746	27.044495895877063	26.77577797048433	24.09198921905115
85-89	21.943518215581793	27.06437198819538	26.859392527555055	24.13271726866777
90-94	21.936667266186483	26.85384770768246	26.807989686194745	24.401495339936307
95-99	22.154711695944158	26.898653741699047	26.901496513130652	24.045138049226146
100-104	22.125318160902868	26.726939305183638	26.9680358527851	24.179706681128398
105-109	22.244195016299262	26.68010295967271	26.91361539215341	24.16208663187462
110-114	22.17094609417557	26.713181009214203	26.9163009045685	24.199571992041726
115-119	22.25069723510198	26.88336804282219	26.823762364303306	24.04217235777252
120-124	22.14510501371228	26.778343879586664	26.91012078210565	24.166430324595407
125-129	22.459127960206608	26.72338046538862	26.84550700891567	23.971984565489098
130-134	22.233571730727423	26.880878722166635	26.759931773311123	24.12561777379482
135-139	22.367728981998898	26.68929473118549	26.827165015179233	24.115811271636375
140-144	22.30240775815517	26.547798090378897	27.090553626296405	24.05924052516953
145-149	22.186123292369135	27.14278229502532	26.934447862183596	23.73664655042195
150	21.96491926439529	26.756612126758412	26.972058853337938	24.30640975550836
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.5
7	0.5
8	0.0
9	1.0
10	2.0
11	6.0
12	9.0
13	14.5
14	24.0
15	60.5
16	122.5
17	255.5
18	570.5
19	1029.5
20	1709.0
21	2747.5
22	4472.5
23	7212.0
24	11580.5
25	17427.5
26	24261.5
27	33786.0
28	50207.5
29	73908.5
30	100844.5
31	128726.5
32	158784.0
33	192217.0
34	227491.0
35	274070.5
36	339723.0
37	415320.5
38	497945.0
39	608612.5
40	757056.5
41	920471.0
42	1082157.5
43	1241181.5
44	1385097.5
45	1488335.5
46	1546854.5
47	1557864.5
48	1513335.5
49	1450657.5
50	1353013.0
51	1205673.5
52	1033894.5
53	875491.5
54	727089.0
55	596901.5
56	503685.5
57	417356.5
58	344856.5
59	277428.5
60	211133.5
61	147831.0
62	88564.5
63	50242.5
64	31231.5
65	19305.5
66	12901.5
67	6276.5
68	2587.5
69	1408.5
70	1185.0
71	904.0
72	459.5
73	182.0
74	93.5
75	57.0
76	33.5
77	20.5
78	11.0
79	3.5
80	2.5
81	3.0
82	1.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.5
89	0.5
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.5
95	0.5
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	2.3308097461977105E-4
2	1.0405400652668351E-4
3	6.243240391601011E-5
4	1.4983776939842425E-4
5	5.827024365494276E-5
6	1.2902696809308754E-4
7	1.8313505148696296E-4
8	2.705404169693771E-4
9	1.0405400652668351E-4
10-14	1.4151344887628956E-4
15-19	1.7231343480818788E-4
20-24	1.2652967193644714E-4
25-29	2.805296015959387E-4
30-34	4.1621602610673403E-4
35-39	5.860321647582816E-4
40-44	3.4962146192965657E-4
45-49	2.1143774126222085E-4
50-54	3.52118758086297E-4
55-59	4.919673428581596E-4
60-64	8.515779894143777E-4
65-69	5.277619211033387E-4
70-74	2.663782567083098E-4
75-79	4.1205386584566666E-4
80-84	1.9895126047901886E-4
85-89	2.7303771312601756E-4
90-94	3.754268555482741E-4
95-99	5.61891635244091E-4
100-104	3.804214478615549E-4
105-109	4.6699438129175564E-4
110-114	3.1882147599775825E-4
115-119	3.5877821450400475E-4
120-124	3.121620195800505E-4
125-129	3.5794578245179127E-4
130-134	3.2964309267653335E-4
135-139	2.830268977525791E-4
140-144	2.788647374915118E-4
145-149	3.987349530102512E-4
150	3.8291874401819525E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4025985E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.22712176908789
#Duplication Level	Percentage of total
1	32.95151836968383
2	9.598996389748546
3	5.646585071124461
4	3.888135898972954
5	2.877932229402855
6	2.315033840546216
7	1.902042999306985
8	1.6171320441633712
9	1.355656487715528
>10	16.808384315400886
>50	5.287520532659616
>100	10.405668873549562
>500	3.078155925796388
>1k	2.212789254863697
>5k	0.054447767065191076
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	8.32432052213468E-6	4.5783762871740746E-5	0.0	4.16216026106734E-6	1.9978369253123232E-4	8.32432052213468E-6
2	1.248648078320202E-5	1.456756091373569E-4	0.0	2.0810801305336702E-5	0.001748107309648283	2.0810801305336702E-5
3	2.0810801305336702E-5	1.6232425018162627E-4	0.0	2.497296156640404E-5	0.0032131877215439866	3.745944234960606E-5
4	4.1621602610673404E-5	1.9978369253123232E-4	0.0	3.329728208853872E-5	0.004765673498922105	4.5783762871740746E-5
5	5.410808339387542E-5	1.9978369253123232E-4	0.0	3.745944234960606E-5	0.00591442973097669	4.5783762871740746E-5
6	8.740536548241414E-5	1.9978369253123232E-4	0.0	3.745944234960606E-5	0.007358699341567057	4.994592313280808E-5
7	1.1237832704881819E-4	2.1643233357550168E-4	0.0	3.745944234960606E-5	0.008948644561294782	5.410808339387542E-5
8	1.6648641044269362E-4	2.1643233357550168E-4	0.0	3.745944234960606E-5	0.011808048660648045	6.659456417707744E-5
9	2.4140529514190574E-4	2.1643233357550168E-4	0.0	3.745944234960606E-5	0.014629993317651701	6.659456417707744E-5
10-11	2.871890580136465E-4	2.2683773422817004E-4	0.0	3.954052248013974E-5	0.025549420762561868	8.32432052213468E-5
12-13	3.288106606243199E-4	2.289188143587037E-4	0.0	4.5783762871740746E-5	0.03444187616033224	9.364860587401515E-5
14-15	3.6002686258232496E-4	2.3099989448923736E-4	0.0	5.2027003263341754E-5	0.04237911577818766	9.989184626561616E-5
16-17	3.891619844097963E-4	2.4140529514190574E-4	0.0	5.410808339387542E-5	0.04732792432859673	1.0405400652668351E-4
18-19	4.3494574728153706E-4	2.538917759251077E-4	0.0	5.410808339387542E-5	0.05104265236159933	1.0821616678775084E-4
20-21	6.368105199433031E-4	2.809458176220455E-4	0.0	5.827024365494276E-5	0.05392702942251899	1.1029724691828452E-4
22-23	8.844590554768098E-4	2.871890580136465E-4	0.0	5.827024365494276E-5	0.056917541570095875	1.1237832704881819E-4
24-25	9.448103792622862E-4	2.934322984052475E-4	0.0	6.451348404654377E-5	0.059570918736526306	1.1237832704881819E-4
26-27	9.989184626561618E-4	2.9551337853578113E-4	0.0	7.908104496027947E-5	0.062328349909483424	1.186215674404192E-4
28-29	0.0010779995076164411	2.9551337853578113E-4	0.0	8.948644561294782E-5	0.06545205118541446	1.2070264757095287E-4
30-31	0.0012153507962316633	2.9551337853578113E-4	0.0	1.2694588796255385E-4	0.06850707681703788	1.331891283541549E-4
32-33	0.0012507291584507357	2.996755387968485E-4	0.0	1.4983776939842425E-4	0.07146429168252623	1.5608100979002526E-4
34-35	0.0013027561617140774	3.0383769905791583E-4	0.0	1.872972117480303E-4	0.07486061445555718	1.6024317005109258E-4
36-37	0.0013277291232804815	3.0383769905791583E-4	0.0	2.0602693292283333E-4	0.0779281265679638	1.7064857070376097E-4
38-39	0.001350621004716352	3.163241798411179E-4	0.0	2.2475665409763638E-4	0.08073134150379266	1.810539713564293E-4
40-41	0.0013901615271964918	3.204863401021852E-4	0.0	2.372431348808384E-4	0.08334934030800402	1.8313505148696298E-4
42-43	0.0014026480079796936	3.2464850036325254E-4	0.0	2.4556745540297307E-4	0.08592779858973523	1.8313505148696298E-4
44-45	0.0014109723285018283	3.3297282088538724E-4	0.0	2.538917759251077E-4	0.08877055404804424	1.8313505148696298E-4
46-47	0.0014276209695460976	3.3297282088538724E-4	0.0	2.6013501631670877E-4	0.09253730908431018	1.872972117480303E-4
48-49	0.001456756091373569	3.4129714140752193E-4	0.0	2.6221609644724246E-4	0.09523855109374288	1.89378291878564E-4
50-51	0.0014775668926789057	3.4545930166858925E-4	0.0	2.6221609644724246E-4	0.09804800926996333	1.9770261240069866E-4
52-53	0.0015171074151590453	3.4545930166858925E-4	0.0	2.6221609644724246E-4	0.10062230539143348	1.9978369253123232E-4
54-55	0.00156497225816132	3.4545930166858925E-4	0.0	2.6221609644724246E-4	0.10288443949332357	2.0394585279229967E-4
56-57	0.001633647902468931	3.4962146192965657E-4	0.0	2.6221609644724246E-4	0.1050050601463374	2.0602693292283333E-4
58-59	0.0016856749057322729	3.621079427128586E-4	0.0	2.767836573609781E-4	0.10713608620000387	2.0810801305336702E-4
60-61	0.0017876478321284224	3.745944234960606E-4	0.0	2.830268977525791E-4	0.10910270692335819	2.1227017331443436E-4
62-63	0.0018521613161749664	3.78756583757128E-4	0.0	2.871890580136465E-4	0.11132738158289868	2.1643233357550168E-4
64-65	0.0018958639989161735	3.78756583757128E-4	0.0	2.892701381441801E-4	0.11421800188420995	2.1643233357550168E-4
66-67	0.0019229180406131112	3.84999824148729E-4	0.0	3.0175661892738214E-4	0.1171877032304815	2.1643233357550168E-4
68-69	0.0019437288419184478	3.9332414467086363E-4	0.0	3.100809394495169E-4	0.11927086444114571	2.1643233357550168E-4
70-71	0.0019811882842680536	4.016484651929983E-4	0.0	3.204863401021852E-4	0.12132072836972137	2.1643233357550168E-4
72-73	0.002026972047139795	4.03729545323532E-4	0.0	3.204863401021852E-4	0.1231583221249826	2.1643233357550168E-4
74-75	0.0020457017683145977	4.09972785715133E-4	0.0	3.2672958049378617E-4	0.1253288887011292	2.1643233357550168E-4
76-77	0.0020623504093588672	4.2037818636780135E-4	0.0	3.3713498114645456E-4	0.12699375280555614	2.1643233357550168E-4
78-79	0.002072755810011535	4.245403466288687E-4	0.0	3.537836221907239E-4	0.12865237366959148	2.1643233357550168E-4
80-81	0.0021102152523611415	4.245403466288687E-4	2.08108013053367E-6	3.5794578245179127E-4	0.13034637289584589	2.1851341370603534E-4
82-83	0.0021289449735359444	4.245403466288687E-4	4.16216026106734E-6	3.5794578245179127E-4	0.13202996672144762	2.2059449383656903E-4
84-85	0.0021851341370603536	4.3286466715100337E-4	4.16216026106734E-6	3.5794578245179127E-4	0.1338196956337066	2.2059449383656903E-4
86-87	0.002226755739671027	4.3494574728153706E-4	4.16216026106734E-6	3.6002686258232496E-4	0.13552618134074418	2.2059449383656903E-4
88-89	0.002253809781367965	4.4535114793420544E-4	4.16216026106734E-6	3.829187440181953E-4	0.13720353192595433	2.2059449383656903E-4
90-91	0.0022621341018900995	4.5159438832580645E-4	4.16216026106734E-6	3.870809042792626E-4	0.13965088215946192	2.2059449383656903E-4
92-93	0.0022933503038481042	4.578376287174074E-4	4.16216026106734E-6	3.9332414467086363E-4	0.14190469194082989	2.2059449383656903E-4
94-95	0.0023516205475030473	4.599187088479411E-4	4.16216026106734E-6	3.954052248013973E-4	0.14355290740421256	2.2059449383656903E-4
96-97	0.0024223772719411917	4.6408086910900846E-4	4.16216026106734E-6	3.954052248013973E-4	0.14513452830341816	2.2059449383656903E-4
98-99	0.002516025877815207	4.703241095006094E-4	4.16216026106734E-6	4.03729545323532E-4	0.14653093307100623	2.2059449383656903E-4
100-101	0.002649215006169362	4.869727505448788E-4	4.16216026106734E-6	4.1205386584566666E-4	0.1479481486398997	2.2059449383656903E-4
102-103	0.0027137284902159055	4.890538306754125E-4	4.16216026106734E-6	4.1205386584566666E-4	0.1490698508302573	2.2059449383656903E-4
104-105	0.00273870145178231	4.911349108059461E-4	4.16216026106734E-6	4.1621602610673403E-4	0.15032682322909965	2.2059449383656903E-4
106-107	0.002776160894131916	4.994592313280808E-4	4.16216026106734E-6	4.328646671510034E-4	0.15156298482663666	2.2059449383656903E-4
108-109	0.0028240257371341905	5.015403114586145E-4	4.16216026106734E-6	4.4118898767313806E-4	0.15266387621568897	2.2059449383656903E-4
110-111	0.002865647339744864	5.036213915891481E-4	4.16216026106734E-6	4.4118898767313806E-4	0.15368984872004207	2.2475665409763638E-4
112-113	0.0029405662244440757	5.057024717196818E-4	6.24324039160101E-6	4.453511479342054E-4	0.15481779415079133	2.2475665409763638E-4
114-115	0.0029801067469242158	5.140267922418165E-4	8.32432052213468E-6	4.536754684563401E-4	0.15621627999850995	2.2475665409763638E-4
116-117	0.00302797158992649	5.161078723723502E-4	8.32432052213468E-6	4.661619492395421E-4	0.15731717138756224	2.2475665409763638E-4
118-119	0.003059187791884495	5.161078723723502E-4	8.32432052213468E-6	4.828105902838115E-4	0.15838476549452601	2.289188143587037E-4
120-121	0.0031320255964531734	5.202700326334175E-4	8.32432052213468E-6	5.036213915891481E-4	0.1594773325630562	2.289188143587037E-4
122-123	0.003350539010159209	5.202700326334175E-4	8.32432052213468E-6	5.265132730250185E-4	0.1605886293527612	2.289188143587037E-4
124-125	0.0034858092186438976	5.244321928944849E-4	8.32432052213468E-6	5.327565134166196E-4	0.16177484502716538	2.3099989448923736E-4
126-127	0.0035336740616461718	5.244321928944849E-4	8.32432052213468E-6	5.327565134166196E-4	0.16304014174652987	2.3932421501137206E-4
128-129	0.0035752956642568453	5.244321928944849E-4	8.32432052213468E-6	5.431619140692878E-4	0.1640328169687944	2.4556745540297307E-4
130-131	0.0036731064303919276	5.348375935471533E-4	8.32432052213468E-6	5.452429941998216E-4	0.16471333017147893	2.4556745540297307E-4
132-133	0.003760511795874342	5.369186736776869E-4	8.32432052213468E-6	5.535673147219562E-4	0.165368870412597	2.4556745540297307E-4
134-135	0.003841673920965155	5.389997538082206E-4	8.32432052213468E-6	5.556483948524898E-4	0.16629911323094557	2.4556745540297307E-4
136-137	0.003939484687100238	5.49405154460889E-4	8.32432052213468E-6	5.577294749830236E-4	0.1673271668154292	2.4556745540297307E-4
138-139	0.004006079251277314	5.49405154460889E-4	8.32432052213468E-6	5.577294749830236E-4	0.16835105823965177	2.4556745540297307E-4
>>END_MODULE
