##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.2d.R.1.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24234824
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.72760454129974	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.600031632167	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.77451492942552	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.753070911511465	35.0	34.0	38.0	30.0	39.0
5	34.627735732679554	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.632350909583664	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.6792679410422	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.79442986670751	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.756385645713785	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.73757010160256	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.750975637372065	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.74336794853554	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.73599323023761	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.72194821798582	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.7120128043843	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.66867448263705	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.5709225039142	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.5453911693355	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
55-59	34.53062136535426	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.506811850583276	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.46934746462363	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.471414696471484	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.4547039252276	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.44289277281321	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.421865172200135	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.4006962377775	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.38670331585655	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.3464445708374	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.32085458512098	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.28793727571531	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.25283756960645	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.21371386893505	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.203273000868506	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
130-134	34.15080134272896	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.11949788453178	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.07305930507273	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.042453875464496	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	34.033683141251615	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	18.0
22	342.0
23	3587.0
24	23102.0
25	89815.0
26	226146.0
27	407091.0
28	595403.0
29	772362.0
30	957044.0
31	1193327.0
32	1516149.0
33	1983317.0
34	2737513.0
35	4284234.0
36	8479771.0
37	965593.0
38	10.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.486531095139945	10.38426007840631	14.358044206212032	38.77116462024171
2	22.172598907356363	12.41345503160744	37.44817370062884	27.96577236040735
3	21.001073380361277	17.164225211589994	28.593380764625536	33.241320643423194
4	26.265147221302517	25.204198027894424	22.442146024016367	26.088508726786696
5	25.748479150445164	30.848345829820822	24.594663626411762	18.80851139332225
6	19.12270680649249	36.72007921495756	25.84417286914112	18.313041109408832
7	15.773190665243645	24.74198987778115	40.970443129210246	18.514376327764964
8	18.402491788153444	24.318718471223516	31.867262806529702	25.41152693409334
9	19.46952992033318	22.818906707200103	33.16150196698492	24.55006140548179
10-14	20.169558728157277	29.323763454264036	27.255446705147712	23.251231112430975
15-19	20.35278589146926	27.952378806702242	28.012688883684245	23.682146418144256
20-24	20.508284493310942	28.118330157107145	27.71048332073778	23.662902028844137
25-29	20.50219991421249	28.3301237290406	27.577110388270683	23.590565968476227
30-34	20.48813126672706	28.02052942154599	27.61620686663459	23.87513244509236
35-39	20.569336066043896	28.013781014813826	27.65360046445626	23.76328245468601
40-44	20.647985992816288	28.088914055307146	27.514769423425715	23.748330528450854
45-49	20.734917216509956	27.873124844025842	27.47056874944708	23.921389190017127
50-54	20.86297060425504	27.833786950996085	27.54714542723687	23.75609701751201
55-59	20.877257451185585	27.872600789783693	27.477943318141563	23.772198440889163
60-64	20.820284325114073	27.778076246744764	27.468491580204198	23.93314784793697
65-69	20.929012932460825	27.702076807177388	27.54575749013511	23.823152770226674
70-74	21.049154105695678	27.627349509943087	27.523724872535656	23.799771511825575
75-79	21.058055664870402	27.52881382603485	27.515549423470947	23.897581085623802
80-84	21.108174104331447	27.517961978810472	27.496607564608944	23.877256352249134
85-89	21.114086381857078	27.50947886664794	27.54277808018489	23.8336566713101
90-94	21.104362209576415	27.3862004243519	27.497311757366216	24.01212560870546
95-99	21.200919266327244	27.307917082955008	27.604132384016562	23.887031266701186
100-104	21.247677029465656	27.36740558422034	27.475249630797606	23.909667755516402
105-109	21.23370189835683	27.182881344889115	27.57194086305887	24.011475893695184
110-114	21.320594632266562	27.15654465621971	27.611115581265132	23.911745130248597
115-119	21.378125278292877	27.186176637540598	27.55806897234242	23.8776291118241
120-124	21.33776034440918	27.096840390009056	27.545422571900446	24.019976693681315
125-129	21.354641668035153	27.02882870254181	27.622903373333585	23.993626256089456
130-134	21.444704652270442	27.142742455436963	27.504551674672477	23.908001217620118
135-139	21.420939196675963	26.9927659273231	27.613644655614678	23.972650220386267
140-144	21.5060772286545	26.93577705757416	27.70560928198621	23.852536431785136
145-149	21.49114281511123	27.351362693535037	27.47243811781687	23.685056373536863
150	21.364892952116932	26.918796843003793	27.56757026638832	24.148739938490955
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	1.0
10	3.0
11	4.5
12	9.5
13	15.5
14	33.5
15	77.0
16	157.0
17	337.5
18	650.0
19	1166.0
20	2235.0
21	3906.0
22	6269.0
23	9966.0
24	15881.5
25	24747.0
26	36652.5
27	51707.0
28	69481.5
29	95783.5
30	129074.0
31	163492.0
32	197153.0
33	234077.0
34	273782.0
35	320643.0
36	393796.5
37	493733.0
38	613159.5
39	758282.5
40	924243.0
41	1090711.0
42	1260860.0
43	1435023.0
44	1576437.5
45	1660743.5
46	1681829.5
47	1636051.5
48	1542355.0
49	1415964.0
50	1255393.5
51	1077719.0
52	899801.5
53	721910.0
54	557016.5
55	420906.0
56	315384.5
57	236252.0
58	177524.0
59	131103.0
60	92942.0
61	67472.0
62	49351.5
63	32741.0
64	21682.0
65	16628.0
66	15410.0
67	11328.5
68	5576.5
69	2958.5
70	2345.0
71	1554.0
72	717.5
73	281.0
74	137.0
75	88.0
76	53.5
77	37.5
78	14.0
79	1.5
80	0.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.5
86	0.5
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	1.650517453726918E-4
2	9.903104722361508E-5
3	0.15447605478793655
4	6.602069814907671E-5
5	5.776811088044212E-5
6	2.888405544022106E-5
7	7.83995790520286E-5
8	7.83995790520286E-5
9	7.014699178339402E-5
10-14	1.444202772011053E-4
15-19	2.805879671335761E-4
20-24	3.672401334542392E-4
25-29	2.508786529664915E-4
30-34	2.6490805132317033E-4
35-39	1.4029398356678804E-4
40-44	2.4510184187844734E-4
45-49	1.650517453726918E-4
50-54	9.903104722361508E-5
55-59	1.501970882891495E-4
60-64	1.3204139629815342E-4
65-69	0.06206193203631271
70-74	1.931105420860494E-4
75-79	1.4359501847424188E-4
80-84	9.077845995498049E-5
85-89	7.179750923712094E-5
90-94	1.3369191375188036E-4
95-99	7.922483777889206E-5
100-104	5.694285215357867E-5
105-109	9.490475358929779E-5
110-114	5.776811088044212E-5
115-119	5.859336960730559E-5
120-124	9.407949486243432E-5
125-129	1.048078583116593E-4
130-134	3.1359831620811435E-5
135-139	4.4563971250626786E-5
140-144	4.5389229977490246E-5
145-149	5.4467075972988296E-5
150	6.189440451475942E-5
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4234824E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	50.713245847335756
#Duplication Level	Percentage of total
1	39.82340016107693
2	9.74002411707948
3	6.039371969229785
4	4.350737822608066
5	3.229365443040982
6	2.6663304412339843
7	2.233417336609286
8	1.8288993777019826
9	1.600811569280017
>10	18.257258969149653
>50	4.720647443532785
>100	4.7848165170052726
>500	0.4093133470329808
>1k	0.3156054854188684
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	2.0631468171586472E-5	0.0	0.0	1.6505174537269178E-4	2.8884055440221065E-5
2	0.0	6.602069814907671E-5	0.0	0.0	0.0022199459752627044	4.951552361180754E-5
3	0.0	7.42732854177113E-5	0.0	4.1262936343172945E-6	0.0033629293119685952	1.0315734085793238E-4
4	1.6505174537269178E-5	8.665216632066318E-5	0.0	8.252587268634589E-6	0.004955678654815071	1.2791510266383613E-4
5	2.0631468171586472E-5	8.665216632066318E-5	0.0	1.2378880902951885E-5	0.006222450800550481	1.3204139629815342E-4
6	3.3010349074538356E-5	8.665216632066318E-5	0.0	1.2378880902951885E-5	0.007270529383667073	1.40293983566788E-4
7	4.1262936343172945E-5	1.0728363449224967E-4	0.0	1.2378880902951885E-5	0.008409386426738647	1.40293983566788E-4
8	5.776811088044213E-5	1.1966251539520155E-4	0.0	1.2378880902951885E-5	0.010621079814732717	1.485465708354226E-4
9	7.83995790520286E-5	1.1966251539520155E-4	0.0	1.2378880902951885E-5	0.014272849681103523	1.526728644697399E-4
10-11	1.1966251539520154E-4	1.2585195584667748E-4	0.0	1.6505174537269178E-5	0.01920583372092985	2.0012524126438878E-4
12-13	1.9187265399575422E-4	1.2791510266383613E-4	0.0	1.6505174537269178E-5	0.023253727776195117	2.537670585105136E-4
14-15	2.0631468171586475E-4	1.3204139629815342E-4	0.0	1.8568321354427825E-5	0.02787105035299617	2.929668480365279E-4
16-17	2.3726188397324443E-4	1.6092545173837449E-4	0.0	2.475776180590377E-5	0.03258327768338652	3.053457289394798E-4
18-19	2.7233537986494144E-4	1.9187265399575422E-4	0.0	2.475776180590377E-5	0.03661260341729736	3.094720225737971E-4
20-21	3.631138398199219E-4	2.393250307904031E-4	0.0	2.475776180590377E-5	0.040633676563939555	3.2185090347674897E-4
22-23	4.477028593234265E-4	2.661459394134655E-4	0.0	2.475776180590377E-5	0.04486106439229763	3.4660866528265274E-4
24-25	5.32291878826931E-4	2.80587967133576E-4	0.0	2.475776180590377E-5	0.0494928289968188	3.486718120998114E-4
26-27	5.859336960730558E-4	2.80587967133576E-4	0.0	2.475776180590377E-5	0.054531033524320205	3.816821611743498E-4
28-29	6.333860728677047E-4	2.80587967133576E-4	0.0	2.475776180590377E-5	0.05935260763601997	4.043767761630949E-4
30-31	6.890910369309882E-4	2.847142607678933E-4	0.0	3.5073495891697E-5	0.0640008774150784	4.2294509751752274E-4
32-33	7.489222946285891E-4	2.888405544022106E-4	0.0	3.91997895260143E-5	0.06863470516641673	4.951552361180753E-4
34-35	8.025641118747139E-4	2.888405544022106E-4	0.0	4.7452376794648894E-5	0.07234011685003365	5.157867042896618E-4
36-37	8.170061395948244E-4	2.970931416708452E-4	0.0	5.157867042896619E-5	0.07599394986322161	5.26102438375455E-4
38-39	8.397007545835695E-4	3.135983162081144E-4	0.0	5.3641817246124835E-5	0.08048954677781031	5.32291878826931E-4
40-41	8.850899845610598E-4	3.177246098424317E-4	0.0	5.3641817246124835E-5	0.08419702160824441	5.384813192784069E-4
42-43	8.933425718296944E-4	3.2185090347674897E-4	0.0	5.3641817246124835E-5	0.08790243329186133	5.487970533642002E-4
44-45	9.181003336355981E-4	3.3010349074538356E-4	0.0	5.3641817246124835E-5	0.09242072482143876	5.591127874499934E-4
46-47	9.552369763444538E-4	3.3835607801401815E-4	0.0	5.3641817246124835E-5	0.09671207020112875	5.632390810843107E-4
48-49	9.861841786018334E-4	3.486718120998114E-4	0.0	5.3641817246124835E-5	0.10067537523689052	5.818074024387385E-4
50-51	0.0010088787935905786	3.589875461856047E-4	0.0	5.776811088044213E-5	0.10516478271102774	5.962494301588491E-4
52-53	0.0010563311703852274	3.589875461856047E-4	4.1262936343172945E-6	5.776811088044213E-5	0.10922711879401312	6.02438870610325E-4
54-55	0.001099657253545559	3.589875461856047E-4	4.1262936343172945E-6	5.983125769760077E-5	0.1124105543328889	6.086283110618009E-4
56-57	0.001134730749437256	3.6724013345423926E-4	4.1262936343172945E-6	6.189440451475942E-5	0.1168958355133918	6.210071919647528E-4
58-59	0.0011471096303402079	3.8374530799150844E-4	4.1262936343172945E-6	6.602069814907671E-5	0.12179787235096075	6.333860728677047E-4
60-61	0.0012028145944034912	3.8787160162582574E-4	4.1262936343172945E-6	7.221013860055265E-5	0.12565802004586457	6.437018069534979E-4
62-63	0.001223446062575078	4.1056621661457086E-4	4.1262936343172945E-6	7.42732854177113E-5	0.12941294725309332	6.457649537706566E-4
64-65	0.0012420143839295056	4.208819507003641E-4	4.1262936343172945E-6	7.633643223486995E-5	0.13455430912145266	6.478281005878152E-4
66-67	0.001268835292552568	4.3738712523763327E-4	4.1262936343172945E-6	8.252587268634589E-5	0.13895087498881775	6.478281005878152E-4
68-69	0.0013245402566158515	4.4976600614058515E-4	4.1262936343172945E-6	8.252587268634589E-5	0.14182483850511973	6.498912474049739E-4
70-71	0.0014091292761193562	4.559554465920611E-4	4.1262936343172945E-6	8.665216632066318E-5	0.14456057118467208	6.560806878564498E-4
72-73	0.001462771093365481	4.642080338606957E-4	4.1262936343172945E-6	8.665216632066318E-5	0.1476594177040444	6.72585862393719E-4
74-75	0.0015060971765258127	4.68334327495013E-4	4.1262936343172945E-6	9.077845995498049E-5	0.1510512310714532	6.767121560280363E-4
76-77	0.001551486406503303	4.7658691476364757E-4	4.1262936343172945E-6	9.284160677213914E-5	0.1536466697674388	6.767121560280363E-4
78-79	0.001592749342846476	4.8071320839796486E-4	4.1262936343172945E-6	1.0934678130940832E-4	0.1561657720311895	6.767121560280363E-4
80-81	0.0016298859855553315	4.869026488494408E-4	4.1262936343172945E-6	1.1140992812656697E-4	0.15935127071688243	6.808384496623536E-4
82-83	0.00166289633462987	4.869026488494408E-4	4.1262936343172945E-6	1.1140992812656697E-4	0.16226443402271046	6.808384496623536E-4
84-85	0.0017516116477676916	5.116604106553445E-4	4.1262936343172945E-6	1.1347307494372561E-4	0.1646370528624429	6.808384496623536E-4
86-87	0.0018444532545398309	5.219761447411378E-4	4.1262936343172945E-6	1.1553622176088426E-4	0.16648563241061706	6.808384496623536E-4
88-89	0.001889842484517321	5.281655851926137E-4	4.1262936343172945E-6	1.1553622176088426E-4	0.1684786322359923	6.829015964795122E-4
90-91	0.0019104739526889076	5.32291878826931E-4	4.1262936343172945E-6	1.1553622176088426E-4	0.17114628107057844	6.932173305653055E-4
92-93	0.0019476105953977632	5.405444660955656E-4	4.1262936343172945E-6	1.175993685780429E-4	0.17378504584972435	7.097225051025748E-4
94-95	0.0019909366785580947	5.405444660955656E-4	4.1262936343172945E-6	1.1966251539520155E-4	0.17701799691221196	7.097225051025748E-4
96-97	0.002046641642621378	5.487970533642002E-4	4.1262936343172945E-6	1.1966251539520155E-4	0.17947107847781357	7.097225051025748E-4
98-99	0.0021271043684905656	5.508602001813588E-4	4.1262936343172945E-6	1.2172566221236019E-4	0.18139393131140544	7.117856519197334E-4
100-101	0.002199314507091118	5.570496406328348E-4	4.1262936343172945E-6	1.2378880902951883E-4	0.1836056246993995	7.138487987368921E-4
102-103	0.002228198562531339	5.61175934267152E-4	6.189440451475942E-6	1.2585195584667748E-4	0.1854376990730364	7.138487987368921E-4
104-105	0.0022673983520573532	5.653022279014693E-4	8.252587268634589E-6	1.3204139629815342E-4	0.18712535316947215	7.159119455540507E-4
106-107	0.002341671637475065	5.818074024387385E-4	8.252587268634589E-6	1.3616768993247072E-4	0.18875317600821034	7.221013860055266E-4
108-109	0.00245514471241879	5.879968428902145E-4	8.252587268634589E-6	1.3616768993247072E-4	0.19057493464776143	7.262276796398439E-4
110-111	0.002539733731922295	5.900599897073731E-4	8.252587268634589E-6	1.3616768993247072E-4	0.1921614945501564	7.262276796398439E-4
112-113	0.0026346384855115926	5.983125769760077E-4	8.252587268634589E-6	1.3823083674962937E-4	0.19381820144433481	7.262276796398439E-4
114-115	0.002706848624112145	6.086283110618009E-4	8.252587268634589E-6	1.40293983566788E-4	0.19571629651612077	7.262276796398439E-4
116-117	0.002768743028626905	6.189440451475942E-4	8.252587268634589E-6	1.485465708354226E-4	0.19748647648524287	7.344802669084785E-4
118-119	0.002873963516301996	6.354492196848634E-4	8.252587268634589E-6	1.5060971765258125E-4	0.19895543701905985	7.344802669084785E-4
120-121	0.003001878618965832	6.437018069534979E-4	8.252587268634589E-6	1.526728644697399E-4	0.2004986708382945	7.344802669084785E-4
122-123	0.0031813723920586343	6.478281005878152E-4	8.252587268634589E-6	1.5886230492121584E-4	0.20187272661852218	7.365434137256372E-4
124-125	0.003288656026550884	6.478281005878152E-4	8.252587268634589E-6	1.6092545173837449E-4	0.20317250911333212	7.386065605427958E-4
126-127	0.0033319821097112156	6.478281005878152E-4	8.252587268634589E-6	1.6092545173837449E-4	0.20450117566358228	7.447960009942718E-4
128-129	0.0033773713396887057	6.498912474049739E-4	8.252587268634589E-6	1.6092545173837449E-4	0.2057576320752319	7.55111735080065E-4
130-131	0.0034598972123750515	6.519543942221325E-4	8.252587268634589E-6	1.6711489218985043E-4	0.20710280380001933	7.55111735080065E-4
132-133	0.003560991406415826	6.643332751250844E-4	8.252587268634589E-6	1.7330433264132637E-4	0.2082581660176282	7.592380287143823E-4
134-135	0.0036806539218110267	6.684595687594017E-4	8.252587268634589E-6	1.774306262756437E-4	0.2094795489333861	7.654274691658582E-4
136-137	0.0038312636394636085	6.787753028451949E-4	8.252587268634589E-6	1.774306262756437E-4	0.21062459541690914	7.674906159830169E-4
138-139	0.0039055369248813194	6.890910369309882E-4	8.252587268634589E-6	1.774306262756437E-4	0.21179439966223812	7.674906159830169E-4
>>END_MODULE
