##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.2d.R.1.R2.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24234824
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.57405273502296	36.0	35.0	38.0	32.0	39.0
2	35.18413061303849	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
3	35.34884082508707	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
4	35.40010082185866	36.0	35.0	37.0	33.0	39.0
5	35.315610173195395	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
6	35.27857590383161	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
7	35.317158317304056	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
8	35.45784710464578	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
9	35.428540021582165	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
10-14	35.39326576499998	35.4	34.2	37.6	33.0	39.0
15-19	35.364921668092165	35.8	34.0	38.0	33.0	39.0
20-24	35.3326672147485	35.6	34.0	37.6	32.8	39.0
25-29	35.32393927845318	35.8	34.0	37.8	32.2	39.0
30-34	35.30738855788678	35.6	34.0	37.8	32.0	39.0
35-39	35.28375497177119	35.4	34.0	37.4	32.0	39.0
40-44	35.263130411015155	35.6	34.0	37.4	32.0	39.0
45-49	35.23730565569612	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
50-54	35.21350041576535	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
55-59	35.18549759635143	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
60-64	35.146661036201465	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
65-69	35.112497181741446	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
70-74	35.09290223027821	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
75-79	35.04378956496651	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
80-84	34.970600265139126	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
85-89	34.956750352302954	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
90-94	34.9087458939252	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
95-99	34.84743771194707	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
100-104	34.783170556551184	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
105-109	34.728340275959916	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
110-114	34.6658981719859	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
115-119	34.61030276101861	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.54068785479935	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.46234977402765	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.390667025269096	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.30513342287941	35.0	34.0	37.0	29.6	39.0
140-144	34.20683246554628	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.10776167386238	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	34.04465062341695	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
19	1.0
20	21.0
21	304.0
22	2328.0
23	11157.0
24	35455.0
25	84626.0
26	166791.0
27	282860.0
28	413879.0
29	539050.0
30	684227.0
31	885951.0
32	1170356.0
33	1618943.0
34	2412729.0
35	4079039.0
36	1.025407E7
37	1593029.0
38	8.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	warn
#Base	G	A	T	C
1	33.66023345827613	18.565887607266617	15.7362981359509	32.03758079850635
2	24.077972428352375	25.742362549955494	33.49010223841948	16.68956278327265
3	19.514232907158725	29.671707126901353	30.116232740126357	20.697827225813565
4	23.2054501406736	34.40372828785552	22.373799784970586	20.017021786500287
5	24.92846244726184	35.30963129750808	22.573574291276056	17.18833196395402
6	18.658621164321225	39.02915077906074	22.9988424921097	19.31338556450833
7	19.994306540043368	20.35990440863115	38.45370612140612	21.19208292991936
8	21.4344903020546	23.143337042596222	28.46475798627628	26.9574146690729
9	23.367696006374956	23.186205107163147	28.692826488032264	24.753272398429633
10-14	23.107138719059815	29.103775624696098	25.61572306033665	22.17336259590744
15-19	22.901963719645746	28.272958780307217	27.117724477801037	21.707353022246004
20-24	23.010825930909622	28.324611121640686	26.989194294460937	21.67536865298875
25-29	23.110581698468284	28.289840272823934	26.94493098031164	21.654647048396143
30-34	23.109089630690118	28.050460774957557	27.10505015427387	21.73539944007846
35-39	23.186616086009124	28.039937075672594	27.08023544961581	21.693211388702473
40-44	23.352901593178476	27.79874696015948	27.175868906660927	21.672482540001113
45-49	23.34858879107189	27.636390509788722	27.250651376713115	21.764369322426276
50-54	23.439758178720627	27.60593832096998	27.210923270024733	21.743380230284657
55-59	23.610804848428028	27.51028767528908	27.091318674317584	21.787588801965306
60-64	23.527428959253015	27.478530894220647	27.152117960501798	21.84192218602454
65-69	23.622912219209844	27.41121619038785	27.10375449807269	21.862117092329616
70-74	23.685066580223566	27.35670950199597	27.02059070039048	21.937633217389983
75-79	23.60709531045078	27.416928631295196	27.09810890312222	21.877867155131806
80-84	23.699417206388556	27.45583795603305	26.98108341100821	21.863661426570182
85-89	23.739134426882032	27.37292523661757	27.037125807368156	21.850814529132247
90-94	23.652076037358473	27.307321893486826	27.11290084054252	21.927701228612182
95-99	23.738384070790033	27.436365950089016	27.09518253567676	21.730067443444195
100-104	23.893269453906495	27.407410097139557	26.907269473052498	21.792050975901457
105-109	23.67771600074339	27.551510173954636	27.01687786137832	21.75389596392365
110-114	23.700134154058638	27.556515368133063	26.95732801690658	21.786022460901716
115-119	23.78955753918411	27.538459532448016	26.97785797825476	21.69412495011311
120-124	23.749068695526734	27.45429469593012	27.173754593802702	21.62288201474044
125-129	23.728798690677515	27.52753723319798	27.12647469608197	21.617189380042536
130-134	23.771476120478532	27.442206306099028	27.211939315094675	21.574378258327766
135-139	23.6970055982251	27.44916901397757	27.31387939933048	21.539945988466844
140-144	23.725936693412752	27.56503864026411	27.288038072816207	21.42098659350693
145-149	23.80959743919692	27.923014928730712	26.947060844871018	21.320326787201353
150	23.45094810674094	27.92536475610469	27.08583730585376	21.537849831300612
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	4.5
2	12.5
3	26.5
4	40.0
5	40.5
6	34.0
7	22.5
8	12.5
9	9.5
10	9.0
11	8.0
12	10.0
13	14.0
14	21.5
15	38.0
16	73.0
17	125.0
18	203.0
19	344.5
20	557.5
21	889.0
22	1421.5
23	2430.5
24	4024.5
25	6681.5
26	10521.5
27	16930.0
28	28861.0
29	44255.5
30	58604.0
31	76261.0
32	100732.5
33	133195.5
34	180899.0
35	250432.0
36	348350.5
37	470498.0
38	613904.5
39	794539.0
40	1004472.5
41	1208163.0
42	1394513.0
43	1565201.5
44	1690373.5
45	1750515.0
46	1753639.5
47	1698337.5
48	1593211.0
49	1451198.5
50	1269719.0
51	1069946.5
52	878531.5
53	702867.0
54	549905.5
55	417817.0
56	312059.0
57	231065.0
58	167166.5
59	119991.5
60	83372.0
61	55333.5
62	37141.5
63	25825.0
64	17514.0
65	11713.0
66	8286.0
67	6257.0
68	5765.5
69	4258.0
70	2055.0
71	1263.5
72	725.0
73	540.0
74	466.5
75	297.0
76	181.5
77	74.0
78	21.0
79	3.5
80	1.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	4.1262936343172945E-6
2	4.1262936343172945E-6
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10-14	0.0
15-19	0.0
20-24	0.03229484975834774
25-29	0.0
30-34	0.0
35-39	0.0
40-44	0.0
45-49	0.0
50-54	2.475776180590377E-6
55-59	0.0
60-64	0.0
65-69	0.0
70-74	0.0
75-79	0.0
80-84	0.06216839041207809
85-89	8.25258726863459E-7
90-94	0.0
95-99	0.0
100-104	0.0
105-109	0.0
110-114	0.0
115-119	0.0
120-124	0.0
125-129	0.0
130-134	0.0
135-139	0.0
140-144	0.0
145-149	0.03321253746261991
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4234824E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	40.981125309999236
#Duplication Level	Percentage of total
1	28.81415651056343
2	10.468104354296495
3	6.772035874846813
4	5.051262397009912
5	3.7902499506357907
6	3.1387620615834972
7	2.5998299819280106
8	2.1177826695535393
9	1.873240494962557
>10	21.34399141380258
>50	5.453054306843947
>100	6.530895673856953
>500	1.0555969449549922
>1k	0.8894950710814679
>5k	0.056546422810669954
>10k+	0.04499587126947312
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	8.252587268634589E-6	1.6505174537269178E-5	0.0	0.0	0.0012378880902951883	0.0
2	2.0631468171586472E-5	2.475776180590377E-5	0.0	0.0	0.005471465359104733	4.1262936343172945E-6
3	5.776811088044213E-5	3.3010349074538356E-5	0.0	0.0	0.007142614281003237	4.1262936343172945E-6
4	1.40293983566788E-4	3.3010349074538356E-5	0.0	0.0	0.008607448521185878	4.1262936343172945E-6
5	1.40293983566788E-4	3.3010349074538356E-5	0.0	4.1262936343172945E-6	0.010200197864032352	4.1262936343172945E-6
6	1.567991581040572E-4	3.3010349074538356E-5	0.0	4.1262936343172945E-6	0.011718673921461118	4.1262936343172945E-6
7	1.6917803900700907E-4	4.951552361180754E-5	0.0	8.252587268634589E-6	0.013509485358754823	4.1262936343172945E-6
8	2.2281985625313393E-4	5.3641817246124835E-5	0.0	8.252587268634589E-6	0.018919056313344798	4.1262936343172945E-6
9	2.351987371560858E-4	6.189440451475942E-5	0.0	8.252587268634589E-6	0.02492693984491078	4.1262936343172945E-6
10-11	2.4757761805903767E-4	6.808384496623536E-5	0.0	8.252587268634589E-6	0.031349515886725646	4.1262936343172945E-6
12-13	2.620196457791482E-4	7.0146991783394E-5	0.0	8.252587268634589E-6	0.03736977829919458	4.1262936343172945E-6
14-15	2.929668480365279E-4	7.83995790520286E-5	0.0	8.252587268634589E-6	0.04520148361712881	4.1262936343172945E-6
16-17	3.177246098424317E-4	9.077845995498049E-5	0.0	8.252587268634589E-6	0.051056694284225046	4.1262936343172945E-6
18-19	3.548612525512873E-4	9.077845995498049E-5	0.0	8.252587268634589E-6	0.0587976211422043	4.1262936343172945E-6
20-21	4.0231362934593627E-4	9.284160677213914E-5	0.0	8.252587268634589E-6	0.06494579865733707	4.1262936343172945E-6
22-23	4.4976600614058515E-4	1.2378880902951883E-4	0.0	8.252587268634589E-6	0.07249897915495487	4.1262936343172945E-6
24-25	5.343550256440896E-4	1.2378880902951883E-4	0.0	1.2378880902951885E-5	0.07763002528922842	4.1262936343172945E-6
26-27	5.859336960730558E-4	1.2997824948099478E-4	0.0	1.2378880902951885E-5	0.08157888829727009	4.1262936343172945E-6
28-29	6.911541837481469E-4	1.3204139629815342E-4	0.0	1.2378880902951885E-5	0.08584341276833701	4.1262936343172945E-6
30-31	8.892162781953771E-4	1.3616768993247072E-4	2.0631468171586472E-6	1.2378880902951885E-5	0.09152531910279191	4.1262936343172945E-6
32-33	0.0010583943172023861	1.526728644697399E-4	4.1262936343172945E-6	1.2378880902951885E-5	0.09756414983661528	4.1262936343172945E-6
34-35	0.0012131303284892846	1.5886230492121584E-4	4.1262936343172945E-6	1.2378880902951885E-5	0.10082598495454309	4.1262936343172945E-6
36-37	0.0012667721457354094	1.6092545173837449E-4	8.252587268634589E-6	1.2378880902951885E-5	0.10403830454885911	4.1262936343172945E-6
38-39	0.00132660340343301	1.6917803900700907E-4	1.2378880902951885E-5	1.2378880902951885E-5	0.10764468518525244	4.1262936343172945E-6
40-41	0.0013699294865933418	1.6917803900700907E-4	1.2378880902951885E-5	1.2378880902951885E-5	0.11038454415843912	4.1262936343172945E-6
42-43	0.0013905609547649282	1.7330433264132637E-4	1.2378880902951885E-5	2.0631468171586472E-5	0.11311615054435717	4.1262936343172945E-6
44-45	0.001421508157022308	1.9187265399575422E-4	1.2378880902951885E-5	2.0631468171586472E-5	0.11540211721776894	4.1262936343172945E-6
46-47	0.001468960533816957	2.3313559033892717E-4	1.2378880902951885E-5	2.0631468171586472E-5	0.11799549276693735	4.1262936343172945E-6
48-49	0.0015473601128689857	2.4757761805903767E-4	1.444202772011053E-5	2.0631468171586472E-5	0.1202484490912746	4.1262936343172945E-6
50-51	0.0016113176642009036	2.5583020532767226E-4	1.6505174537269178E-5	2.0631468171586472E-5	0.12226414353163861	8.252587268634589E-6
52-53	0.0016732120687156632	2.6820908623062414E-4	1.6505174537269178E-5	2.0631468171586472E-5	0.12447171062599835	8.252587268634589E-6
54-55	0.001749548500950533	2.702722330477828E-4	1.6505174537269178E-5	2.0631468171586472E-5	0.12642138436821326	1.2378880902951885E-5
56-57	0.0018238217863682444	2.785248203164174E-4	1.6505174537269178E-5	2.0631468171586472E-5	0.12830297426546197	1.2378880902951885E-5
58-59	0.0018877793377001626	3.012194353051625E-4	2.0631468171586472E-5	2.475776180590377E-5	0.13011648031774442	1.2378880902951885E-5
60-61	0.001972368357203667	3.135983162081144E-4	2.475776180590377E-5	2.475776180590377E-5	0.13154624106203536	1.2378880902951885E-5
62-63	0.0020136312935468397	3.2185090347674897E-4	2.475776180590377E-5	2.475776180590377E-5	0.1336341456409999	1.2378880902951885E-5
64-65	0.0020425153489870606	3.4248237164833544E-4	2.475776180590377E-5	2.475776180590377E-5	0.13541464134420783	1.2378880902951885E-5
66-67	0.0021085360471361373	3.7549272072287385E-4	2.475776180590377E-5	2.475776180590377E-5	0.1368464652353159	1.2378880902951885E-5
68-69	0.0021559884239307865	3.98187335711619E-4	2.475776180590377E-5	2.475776180590377E-5	0.13820195269418917	1.6505174537269178E-5
70-71	0.002188998773005325	4.085030697974122E-4	2.475776180590377E-5	2.475776180590377E-5	0.1394728511335589	1.6505174537269178E-5
72-73	0.0022323248561656565	4.126293634317295E-4	2.475776180590377E-5	2.475776180590377E-5	0.14033318335631403	1.6505174537269178E-5
74-75	0.0022550194711544016	4.2707139115184003E-4	2.475776180590377E-5	2.475776180590377E-5	0.14139157767351643	1.6505174537269178E-5
76-77	0.0022839035265946224	4.6214488704353704E-4	2.8884055440221065E-5	2.475776180590377E-5	0.14269342331514354	1.6505174537269178E-5
78-79	0.002323103316120637	4.745237679464889E-4	2.8884055440221065E-5	2.475776180590377E-5	0.14426347804300127	2.475776180590377E-5
80-81	0.002341671637475065	4.786500615808062E-4	3.094720225737971E-5	2.475776180590377E-5	0.1456437232636804	2.475776180590377E-5
82-83	0.002356113665195175	4.8483950203228216E-4	3.3010349074538356E-5	2.475776180590377E-5	0.1473107458919446	2.475776180590377E-5
84-85	0.0023767451333667616	4.869026488494408E-4	3.3010349074538356E-5	2.475776180590377E-5	0.1488952426475224	2.475776180590377E-5
86-87	0.0024076923356241417	4.889657956665994E-4	3.3010349074538356E-5	2.475776180590377E-5	0.15057670730350672	2.475776180590377E-5
88-89	0.0024365763910643625	4.930920893009167E-4	3.713664270885565E-5	2.475776180590377E-5	0.15226848769357682	2.475776180590377E-5
90-91	0.0024613341528702663	5.199129979239791E-4	3.713664270885565E-5	2.475776180590377E-5	0.15321340893583546	2.475776180590377E-5
92-93	0.0024716498869560596	5.26102438375455E-4	3.713664270885565E-5	2.475776180590377E-5	0.15415214073764266	2.475776180590377E-5
94-95	0.0024902182083104876	5.343550256440896E-4	3.713664270885565E-5	2.475776180590377E-5	0.15502485184130077	2.475776180590377E-5
96-97	0.002492281355127646	5.446707597298829E-4	3.713664270885565E-5	2.475776180590377E-5	0.15594501532175353	2.475776180590377E-5
98-99	0.0024984707955791217	5.570496406328348E-4	4.1262936343172945E-5	2.8884055440221065E-5	0.15685073677448616	2.8884055440221065E-5
100-101	0.0025005339423962805	5.653022279014693E-4	4.1262936343172945E-5	2.8884055440221065E-5	0.1575687118668574	2.8884055440221065E-5
102-103	0.0025067233828477567	5.67365374718628E-4	4.1262936343172945E-5	3.094720225737971E-5	0.1584496755577841	2.8884055440221065E-5
104-105	0.002510849676482074	5.756179619872626E-4	4.1262936343172945E-5	3.3010349074538356E-5	0.1593038183400878	3.094720225737971E-5
106-107	0.0025417968787394534	5.859336960730558E-4	4.1262936343172945E-5	3.3010349074538356E-5	0.16005480378153356	3.3010349074538356E-5
108-109	0.0025500494660080884	6.003757237931663E-4	4.1262936343172945E-5	3.3010349074538356E-5	0.16086149418704257	3.3010349074538356E-5
110-111	0.0025644914937281984	6.106914578789596E-4	4.1262936343172945E-5	3.3010349074538356E-5	0.16175071046523795	3.3010349074538356E-5
112-113	0.0025706809341796747	6.230703387819115E-4	4.1262936343172945E-5	3.3010349074538356E-5	0.16259453751345584	3.3010349074538356E-5
114-115	0.0025768703746311505	6.271966324162288E-4	4.1262936343172945E-5	3.3010349074538356E-5	0.1634053542125992	3.3010349074538356E-5
116-117	0.002591312402351261	6.271966324162288E-4	4.1262936343172945E-5	3.3010349074538356E-5	0.1642594969949029	3.91997895260143E-5
118-119	0.0025995649896198955	6.313229260505461E-4	4.1262936343172945E-5	3.713664270885565E-5	0.16506825054722907	4.1262936343172945E-5
120-121	0.0025995649896198955	6.313229260505461E-4	4.1262936343172945E-5	3.713664270885565E-5	0.16593683535725284	4.1262936343172945E-5
122-123	0.0026016281364370543	6.354492196848634E-4	4.1262936343172945E-5	3.713664270885565E-5	0.1666486210091726	4.332608316033159E-5
124-125	0.002603691283254213	6.37512366502022E-4	4.1262936343172945E-5	3.713664270885565E-5	0.16750895323192774	4.5389229977490246E-5
126-127	0.002614007017340006	6.416386601363393E-4	4.1262936343172945E-5	3.713664270885565E-5	0.16849720055734674	4.5389229977490246E-5
128-129	0.002636701632328751	6.437018069534979E-4	4.1262936343172945E-5	3.713664270885565E-5	0.1694916373232172	4.951552361180754E-5
130-131	0.0026470173664145443	6.540175410392912E-4	4.1262936343172945E-5	3.713664270885565E-5	0.1704840109422705	5.157867042896619E-5
132-133	0.002667648834586131	6.622701283079258E-4	4.1262936343172945E-5	3.713664270885565E-5	0.17127625932005944	5.3641817246124835E-5
134-135	0.0026779645686719243	6.684595687594017E-4	4.1262936343172945E-5	3.713664270885565E-5	0.1720520025233111	5.3641817246124835E-5
136-137	0.0026800277154890827	6.746490092108777E-4	4.1262936343172945E-5	3.713664270885565E-5	0.17293296621423782	5.776811088044213E-5
138-139	0.002690343449574876	6.890910369309882E-4	4.1262936343172945E-5	3.713664270885565E-5	0.1737767932624557	6.189440451475942E-5
>>END_MODULE
