##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.2d.R.2.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24210249
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.69778373613588	37.0	35.0	38.0	32.0	39.0
2	35.02088565879682	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
3	35.348877783123996	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
4	35.37433010292459	36.0	35.0	38.0	32.0	39.0
5	35.178080737624796	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
6	35.069360996658894	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	35.048175217033084	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	35.21126837646321	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	35.21315171107906	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
10-14	35.23019700458265	35.4	34.0	37.8	32.0	39.0
15-19	35.2344867580668	35.8	34.0	38.0	32.0	39.0
20-24	35.22738687239442	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
25-29	35.21239783200908	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
30-34	35.201127811614	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
35-39	35.18802507153065	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
40-44	35.167714128012484	35.8	34.0	38.0	32.0	39.0
45-49	35.12862697942512	35.4	34.0	38.0	32.0	39.0
50-54	35.1047396910292	35.2	34.0	38.0	32.0	39.0
55-59	35.0903759808501	35.4	34.0	38.0	32.0	39.0
60-64	35.07267128892396	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
65-69	35.04390313375133	35.2	34.0	38.0	32.0	39.0
70-74	35.026444544209355	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
75-79	35.01351506958891	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
80-84	34.99143165359431	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
85-89	34.97313878927887	35.0	34.0	37.8	31.4	39.0
90-94	34.950811889625754	35.0	34.0	37.8	31.0	39.0
95-99	34.92533193689995	35.0	34.0	37.8	31.0	39.0
100-104	34.8963630898633	35.0	34.0	37.4	31.0	39.0
105-109	34.865789443140386	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
110-114	34.831629794472576	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
115-119	34.798631554760135	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
120-124	34.76260938084528	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
125-129	34.73190611133326	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
130-134	34.69233186325345	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
135-139	34.64926200469891	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
140-144	34.600910432602326	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.5623780242822	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	34.540143515252566	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	9.0
22	190.0
23	2111.0
24	14448.0
25	59329.0
26	153552.0
27	286640.0
28	427161.0
29	556300.0
30	701209.0
31	893510.0
32	1166270.0
33	1584584.0
34	2305089.0
35	3932278.0
36	1.0442978E7
37	1684585.0
38	6.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	30.97928832847161	10.386996166163588	9.484496915227597	49.1492185901372
2	19.889082957960717	11.978872842094516	44.40665958259022	23.725384617354546
3	16.962066024574884	16.588248994698034	31.07520550493793	35.37447947578915
4	23.383490494825846	25.127034082899236	23.861383419037445	27.628092003237477
5	24.771432450542928	30.36170357508656	26.55040291010758	18.316461064262935
6	17.44757393329111	35.19400491618484	28.703601703692534	18.65481944683152
7	14.745284856933063	24.128016734736345	42.69928994097994	18.427408467350656
8	16.356072769400672	22.932391681847232	35.13796295458726	25.57357259416484
9	18.353901703787955	21.322291389949978	35.79929493444321	24.524511971818857
10-14	19.799587640318926	28.89441656288062	27.721080012834577	23.584915783965876
15-19	20.119380221764306	27.71736368394687	28.1698695029799	23.993386591308923
20-24	20.275517018714602	27.84233218528311	27.948237104690904	23.933913691311385
25-29	20.19707712258251	28.130608622333327	27.873118342406755	23.79919591267741
30-34	20.288519449605776	27.73677627037249	27.753471735684197	24.221232544337532
35-39	20.389718742437342	27.801548675974935	27.899965754144663	23.908766827443063
40-44	20.494838854244435	27.885354225332478	27.676174839349905	23.943632081073183
45-49	20.56228106978793	27.62500890945819	27.650961578781434	24.16174844197244
50-54	20.756173390875205	27.583367913082725	27.743644855301973	23.9168138407401
55-59	20.758016630487752	27.683492030684214	27.619497605847183	23.938993732980855
60-64	20.689706447403324	27.53281687067299	27.62935457235467	24.14812210956902
65-69	20.855165370441018	27.503323286164775	27.723706544238812	23.91780479915539
70-74	20.93613189029814	27.487425398063962	27.67811834382603	23.89832436781186
75-79	20.95983380250822	27.321362004240108	27.65272932317504	24.06607487007663
80-84	21.00717446939097	27.379666561207145	27.675662018731877	23.937496950670006
85-89	21.03707321885487	27.40961647603229	27.64644439699528	23.90686590811756
90-94	20.98312191172238	27.209142625571214	27.644524079506233	24.163211383200174
95-99	21.149000467728598	27.151666171296817	27.771876819920376	23.927456541054205
100-104	21.181604908318956	27.300556007159916	27.57505239170034	23.942786692820793
105-109	21.127932016142935	27.05364487011228	27.661493176145708	24.156929937599074
110-114	21.228168976665792	27.072055041073224	27.783269396713102	23.916506585547886
115-119	21.30117089476513	27.145662992512936	27.645702702987148	23.90746340973479
120-124	21.235813578225095	27.000149308798733	27.666602357757263	24.097434755218906
125-129	21.283517509692913	26.946650916292825	27.799647743789514	23.97018383022475
130-134	21.350394291446595	27.125161005228588	27.62305696565915	23.901387737665665
135-139	21.324008244114207	26.92215715976734	27.748100163558874	24.005734432559574
140-144	21.441562507026983	26.975886551679622	27.837449219630244	23.745101721663143
145-149	21.446170365045532	27.54827203370714	27.536717413645967	23.468840187601366
150	21.287285180615033	26.905631018170755	27.744636129317605	24.062447671896606
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.5
3	0.5
4	0.5
5	0.5
6	1.0
7	2.5
8	4.5
9	4.5
10	5.0
11	16.0
12	23.5
13	27.5
14	56.5
15	121.5
16	222.0
17	429.5
18	781.0
19	1365.0
20	2462.0
21	4177.5
22	6572.0
23	10209.0
24	15968.0
25	24429.5
26	35679.0
27	50123.5
28	67344.5
29	93077.5
30	125954.0
31	160976.0
32	192626.0
33	227342.5
34	268068.5
35	315156.5
36	390922.5
37	498554.0
38	626346.5
39	775122.5
40	944131.0
41	1114710.5
42	1287620.0
43	1462601.0
44	1605218.5
45	1688259.5
46	1701377.5
47	1645962.5
48	1546314.5
49	1414575.5
50	1243808.0
51	1059837.0
52	876764.5
53	695457.5
54	534792.0
55	400953.5
56	295533.5
57	218974.0
58	164278.5
59	121821.0
60	86234.5
61	63536.0
62	46681.5
63	29619.5
64	18945.5
65	14048.0
66	13023.0
67	9705.5
68	4905.0
69	2445.5
70	1804.5
71	1164.0
72	499.0
73	232.0
74	112.0
75	60.5
76	27.5
77	18.0
78	10.0
79	3.5
80	4.0
81	2.5
82	2.0
83	1.5
84	0.5
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	1.4456687331055538E-4
2	3.428300138507456E-4
3	0.04975991779349316
4	5.782674932422215E-5
5	4.1304820945872964E-5
6	4.956578513504756E-5
7	3.304385675669837E-5
8	7.434867770257133E-5
9	7.434867770257133E-5
10-14	1.057403416214348E-4
15-19	1.6934976587807914E-4
20-24	1.743063443915839E-4
25-29	3.816565455398662E-4
30-34	3.3952562817507573E-4
35-39	8.260964189174593E-5
40-44	9.913157027009513E-5
45-49	9.33488953376729E-5
50-54	1.2061007716194906E-4
55-59	6.195723141880945E-5
60-64	7.682696695932371E-5
65-69	0.019371134927195503
70-74	8.013135263499356E-5
75-79	6.608771351339674E-5
80-84	5.204407439179994E-5
85-89	5.121797797288248E-5
90-94	1.2721884851328873E-4
95-99	2.2800261162121878E-4
100-104	8.756622040525069E-5
105-109	1.280449449322062E-4
110-114	9.665328101334273E-5
115-119	4.87396887161301E-5
120-124	8.839231682416814E-5
125-129	1.239144628376189E-4
130-134	4.295701378370789E-5
135-139	2.8913374662111075E-5
140-144	3.2217760337780916E-5
145-149	8.178354547282847E-5
150	1.11523016553857E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4210249E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.92799934983096
#Duplication Level	Percentage of total
1	31.812511186816362
2	11.027400909908208
3	6.675361466688921
4	4.597532137751408
5	3.6017558579362534
6	2.918704161540028
7	2.3934676849059913
8	1.9894560472004525
9	1.7829376909964076
>10	20.42816946323644
>50	5.317885857322629
>100	6.202115894184965
>500	0.6782035110172194
>1k	0.5530613522511765
>5k	0.021436778243439373
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	8.260964189174593E-6	8.260964189174593E-6	0.0	0.0	8.260964189174593E-5	0.0
2	8.260964189174593E-6	1.4456687331055538E-4	0.0	0.0	0.001615018498983633	1.2391446283761889E-5
3	8.260964189174593E-6	1.4456687331055538E-4	0.0	0.0	0.0026145951658737587	1.6521928378349185E-5
4	3.304385675669837E-5	1.5695831959431728E-4	0.0	0.0	0.004080916309452249	2.8913374662111075E-5
5	3.717433885128567E-5	1.5695831959431728E-4	0.0	8.260964189174593E-6	0.005171363582423295	3.717433885128567E-5
6	4.9565785135047556E-5	1.5695831959431728E-4	0.0	8.260964189174593E-6	0.0060676781969487385	4.1304820945872964E-5
7	5.369626722963485E-5	1.9000217635101565E-4	0.0	8.260964189174593E-6	0.007137473059446849	4.543530304046026E-5
8	8.674012398633323E-5	1.9413265844560294E-4	0.0	8.260964189174593E-6	0.009157278803700037	4.9565785135047556E-5
9	1.1152301655385701E-4	1.9413265844560294E-4	0.0	8.260964189174593E-6	0.012474055925653635	4.9565785135047556E-5
10-11	1.672845248307855E-4	2.0239362263477752E-4	0.0	1.0326205236468241E-5	0.017440960644394862	8.467488293903959E-5
12-13	2.0032838158748388E-4	2.0652410472936483E-4	0.0	1.2391446283761889E-5	0.021513615989657932	1.0945777550656335E-4
14-15	2.0858934577665846E-4	2.1065458682395212E-4	0.0	1.6521928378349185E-5	0.02596214520552845	1.280449449322062E-4
16-17	2.2924175624959494E-4	2.2924175624959494E-4	0.0	2.0652410472936482E-5	0.030150454049439973	1.3217542702679348E-4
18-19	2.478289256752378E-4	2.354374793914759E-4	0.0	2.0652410472936482E-5	0.03362418949098789	1.3424066807408714E-4
20-21	2.829380234792298E-4	2.99459951857579E-4	0.0	2.0652410472936482E-5	0.03679020401648905	1.4456687331055538E-4
22-23	3.1391663918863455E-4	3.056556749994599E-4	0.0	2.0652410472936482E-5	0.040530355553137845	1.5902356064161093E-4
24-25	3.738086295601503E-4	3.242428444251028E-4	4.130482094587296E-6	2.0652410472936482E-5	0.04474964301275877	1.631540427361982E-4
26-27	4.564182714518962E-4	3.34569049661571E-4	4.130482094587296E-6	2.4782892567523778E-5	0.04912795403302131	2.065241047293648E-4
28-29	4.956578513504756E-4	3.34569049661571E-4	4.130482094587296E-6	2.6848133614817426E-5	0.05326050136865589	2.354374793914759E-4
30-31	5.328321902017613E-4	3.34569049661571E-4	4.130482094587296E-6	2.8913374662111075E-5	0.057630551424729254	2.7674230033734886E-4
32-33	5.762022521949279E-4	3.386995317561583E-4	4.130482094587296E-6	3.304385675669837E-5	0.061903535151579814	3.3250380861427737E-4
34-35	6.133765910462135E-4	3.386995317561583E-4	4.130482094587296E-6	4.1304820945872964E-5	0.0653235743258981	3.428300138507456E-4
36-37	6.257680373299753E-4	3.386995317561583E-4	4.130482094587296E-6	4.9565785135047556E-5	0.06871883060764886	3.469604959453329E-4
38-39	6.464204478029119E-4	3.386995317561583E-4	4.130482094587296E-6	7.021819560798405E-5	0.07307648921743845	3.5315621908721384E-4
40-41	6.856600277014912E-4	3.386995317561583E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.07657087706945931	3.6967814746556306E-4
42-43	7.001167150325467E-4	3.428300138507456E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.079761674487528	3.8826531689120587E-4
44-45	7.455520180730071E-4	3.5728670118180116E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.08410487640998654	4.0065676317496777E-4
46-47	7.930525621607609E-4	3.738086295601503E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.08825807615609406	4.130482094587296E-4
48-49	8.15770213680991E-4	3.800043527020313E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.09217170794071552	4.2543965574249156E-4
50-51	8.384878652012212E-4	3.9033055793849953E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.09587261989746573	4.3989634307354706E-4
52-53	8.963146145254434E-4	3.9652628108038045E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.09940211684729058	4.419615841208407E-4
54-55	9.396846765186099E-4	3.985915221276741E-4	4.130482094587296E-6	8.054440084445228E-5	0.10214269171704926	4.419615841208407E-4
56-57	9.74793774322602E-4	4.0891772736414235E-4	4.130482094587296E-6	8.260964189174593E-5	0.10551523034727978	4.5022254831001535E-4
58-59	9.995766668901259E-4	4.233744146951979E-4	4.130482094587296E-6	9.293584712821417E-5	0.10933592628477304	4.543530304046026E-4
60-61	0.0010305552825995304	4.3989634307354706E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.11264857292463204	4.543530304046026E-4
62-63	0.0010656643804035225	4.5848351249918993E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.11596948052868022	4.5848351249918993E-4
64-65	0.0011069692013493955	4.6054875354648354E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.12034779154894276	4.626139945937772E-4
66-67	0.0011482740222952684	4.915273692558883E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.12371413445603141	4.626139945937772E-4
68-69	0.0012308836641870143	4.977230923977692E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.1265166665572089	4.915273692558883E-4
70-71	0.0013424066807408712	5.059840565869438E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.1290527825632855	5.018535744923565E-4
72-73	0.0013940377069232126	5.163102618234121E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.13204118635871942	5.039188155396501E-4
74-75	0.001408494394254268	5.183755028707058E-4	4.130482094587296E-6	1.0326205236468242E-4	0.13485610990618063	5.039188155396501E-4
76-77	0.0014312120457744982	5.328321902017613E-4	4.130482094587296E-6	1.0326205236468242E-4	0.1371113531298253	5.039188155396501E-4
78-79	0.0014477339741528475	5.369626722963486E-4	4.130482094587296E-6	1.3424066807408714E-4	0.13924474713167967	5.121797797288248E-4
80-81	0.0014869735540514266	5.410931543909359E-4	4.130482094587296E-6	1.3630590912138077E-4	0.14180151554822917	5.204407439179993E-4
82-83	0.0015158869287135376	5.410931543909359E-4	4.130482094587296E-6	1.3837115016867443E-4	0.14421578233251545	5.245712260125866E-4
84-85	0.0016005618116525775	5.452236364855231E-4	4.130482094587296E-6	1.404363912159681E-4	0.1463429806112279	5.245712260125866E-4
86-87	0.0016790409714497359	5.534846006746977E-4	4.130482094587296E-6	1.4250163226326172E-4	0.14831528581139336	5.287017081071739E-4
88-89	0.0017306719976320772	5.555498417219914E-4	4.130482094587296E-6	1.4869735540514267E-4	0.15026693860108586	5.287017081071739E-4
90-91	0.0017699115775306564	5.63810805911166E-4	4.130482094587296E-6	1.507625964524363E-4	0.15278653267878411	5.390279133436422E-4
92-93	0.0018339340499967595	5.700065290530469E-4	4.130482094587296E-6	1.5282783749972996E-4	0.1554403674245564	5.431583954382294E-4
94-95	0.001920674173983093	5.741370111476342E-4	4.130482094587296E-6	1.5282783749972996E-4	0.15846181507674706	5.452236364855231E-4
96-97	0.0019908923695910767	5.762022521949279E-4	4.130482094587296E-6	1.5282783749972996E-4	0.16061379624802702	5.452236364855231E-4
98-99	0.0020879586988138783	5.782674932422215E-4	4.130482094587296E-6	1.5489307854702362E-4	0.1623362072814699	5.452236364855231E-4
100-101	0.0021746988228002117	5.823979753368088E-4	4.130482094587296E-6	1.5695831959431728E-4	0.16432503441001373	5.493541185801104E-4
102-103	0.0022036121974623227	5.844632163841025E-4	4.130482094587296E-6	1.5695831959431728E-4	0.16584092133872724	5.493541185801104E-4
104-105	0.002238721295266315	5.92724180573277E-4	4.130482094587296E-6	1.6521928378349185E-4	0.1673898521241975	5.534846006746977E-4
106-107	0.002271765152023013	6.009851447624517E-4	4.130482094587296E-6	1.6521928378349185E-4	0.16902139255155946	5.555498417219914E-4
108-109	0.0023151352140161796	6.113113499989198E-4	4.130482094587296E-6	1.6521928378349185E-4	0.17062195436321204	5.57615082769285E-4
110-111	0.002356440034962053	6.154418320935072E-4	8.260964189174593E-6	1.6521928378349185E-4	0.17210686267621617	5.596803238165787E-4
112-113	0.0024039405790498066	6.175070731408008E-4	8.260964189174593E-6	1.6521928378349185E-4	0.17362481484597703	5.617455648638724E-4
114-115	0.002436984435806505	6.237027962826818E-4	8.260964189174593E-6	1.672845248307855E-4	0.17526874671962275	5.63810805911166E-4
116-117	0.0024762240157050843	6.319637604718564E-4	8.260964189174593E-6	1.7348024797266646E-4	0.17689822190593746	5.658760469584596E-4
118-119	0.0025340507650293068	6.546814119920866E-4	8.260964189174593E-6	1.7761073006725375E-4	0.17836041256742136	5.658760469584596E-4
120-121	0.002600138478542703	6.608771351339674E-4	8.260964189174593E-6	1.7761073006725375E-4	0.17968836256083115	5.658760469584596E-4
122-123	0.0026806828793871553	6.629423761812611E-4	8.260964189174593E-6	1.7761073006725375E-4	0.18113816177603131	5.658760469584596E-4
124-125	0.002763292521278901	6.650076172285547E-4	8.260964189174593E-6	1.796759711145474E-4	0.18251567755457615	5.700065290530469E-4
126-127	0.0028045973422247744	6.670728582758484E-4	8.260964189174593E-6	1.8380645320913467E-4	0.18381264893227656	5.700065290530469E-4
128-129	0.002852097886312528	6.69138099323142E-4	8.260964189174593E-6	1.9413265844560294E-4	0.18512201175626075	5.700065290530469E-4
130-131	0.0029161203587786313	6.69138099323142E-4	8.260964189174593E-6	1.9619789949289657E-4	0.18639213500034635	5.720717701003405E-4
132-133	0.0029904690364812025	6.732685814177294E-4	8.260964189174593E-6	1.9826314054019023E-4	0.18754040902264163	5.782674932422215E-4
134-135	0.0031040572940823534	6.732685814177294E-4	8.260964189174593E-6	1.9826314054019023E-4	0.18864118250084913	5.782674932422215E-4
136-137	0.00327753754205502	6.98051473985253E-4	8.260964189174593E-6	1.9826314054019023E-4	0.18971510784544182	5.782674932422215E-4
138-139	0.003329168568237361	7.45552018073007E-4	8.260964189174593E-6	1.9826314054019023E-4	0.1907559893332778	5.782674932422215E-4
>>END_MODULE
