##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.2d.S.2.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	22339575
Total Bases	3.3 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.813576757838945	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.56996984051845	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.84622746851719	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.85074760822442	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.696259082816034	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.657169126986524	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.72503612982789	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.8014471627146	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.78279886703306	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.78575456337016	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.79783394267797	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.783431072435356	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.787554436465335	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.76367140377558	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.7484053210502	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.70139408650344	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.59384745681151	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
50-54	34.56683228754352	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
55-59	34.556178942526884	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.52488957377211	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.49148952923231	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.49026795720151	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.4723280366793	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.447696690738304	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.43822034215064	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.412099666175386	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.38643808577378	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.34532547731996	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.31247946301575	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.2858851432939	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.248458844897456	35.0	34.0	37.0	29.6	39.0
120-124	34.20037375822951	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
125-129	34.17859159809441	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.13585218161044	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.09083707277332	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.03991506552833	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.003044193992054	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	33.9953677722159	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	17.0
22	342.0
23	3463.0
24	21180.0
25	82337.0
26	207473.0
27	379153.0
28	557259.0
29	720546.0
30	896622.0
31	1112731.0
32	1403106.0
33	1816736.0
34	2466693.0
35	3819568.0
36	7567385.0
37	1284963.0
38	1.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	34.78200088211397	10.298745492125008	9.30965069656609	45.60960292919493
2	21.805220058283155	10.95087418690763	41.93930148755399	25.304604267255232
3	18.876835226269147	14.413512591582881	28.969602100952365	37.740050081195605
4	25.499906287225198	22.569402400774912	23.01660504423167	28.91408626776822
5	27.330662909379804	28.157247217980114	25.386570456917525	19.125519415722554
6	19.735578415557377	34.359067077125495	27.4736652071776	18.431689300139535
7	16.657497577166954	23.99909129772086	40.55626456217784	18.78714656293435
8	18.0379029341566	23.13197448989207	33.517310587054695	25.312811988896637
9	19.356335117958928	21.370725494329264	34.53319685169502	24.739742536016788
10-14	21.064141794230686	27.954636831558126	27.040853357096545	23.94036801711464
15-19	21.446056273321236	27.070493078326123	27.141653995842415	24.341796652510222
20-24	21.33813972419088	26.993126625675796	27.254713749185587	24.414019900947732
25-29	21.190433451763266	27.297322098828484	26.921249391772694	24.590995057635553
30-34	21.299513647510455	27.052960176722884	27.0382302257055	24.60929595006116
35-39	21.644928544322887	26.794764078541526	26.963362890282532	24.596944486853054
40-44	21.883592848458182	26.91374140965831	26.661912219800442	24.540753522083065
45-49	22.029473631587244	26.907903296725177	26.58844970916699	24.47417336252059
50-54	22.007749360222043	27.170152068524	26.50723263981615	24.314865931437804
55-59	21.99402095081767	27.189094227756343	26.50586346487926	24.31102135654673
60-64	22.22597142856478	26.882442732892457	26.32824786369397	24.563337974848796
65-69	22.0493587320292	27.061046629189857	26.631557219327114	24.258037419453828
70-74	22.497847940361286	26.871367067639596	26.399917570332367	24.230867421666748
75-79	22.27732891087176	26.700155159006762	26.457336313532693	24.56517961658879
80-84	22.60213472364261	26.780555097548664	26.480653766512745	24.13665641229598
85-89	22.47279537665139	26.775874305498494	26.422509060210007	24.328821257640104
90-94	22.322063016542558	26.437410296958795	26.55417633509755	24.68635035140109
95-99	22.731269551306564	26.55376009359828	26.7029000344125	24.012070320682653
100-104	22.614327495010844	26.459370755091367	26.694728161161947	24.23157358873584
105-109	22.75005584042101	26.348633792220777	26.523292619983675	24.378017747374543
110-114	22.713832607790863	26.421386282772275	26.563908333989346	24.30087277544752
115-119	22.804975363839077	26.720236864824226	26.39950181293184	24.07528595840486
120-124	22.728428239997186	26.55079409426647	26.396466915688077	24.324310750048262
125-129	23.184784339589402	26.53792496341981	26.284765009748046	23.99252568724274
130-134	22.831318871421463	26.925655790339608	26.14297890760946	24.10004643062947
135-139	22.908562004725592	26.641479719014345	26.20413001684787	24.245828259412196
140-144	22.933806849033118	26.558626350865786	26.519333727313004	23.988233072788088
145-149	22.699236932082542	26.895031674306182	26.573698548556777	23.8320328450545
150	22.338361592869038	26.372169094447294	26.845173483660517	24.44429582902315
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	1.0
11	3.0
12	6.5
13	10.5
14	21.5
15	44.5
16	82.0
17	192.0
18	445.0
19	810.5
20	1210.0
21	1856.0
22	3049.5
23	5034.5
24	8067.0
25	12201.0
26	16934.0
27	23940.5
28	36716.5
29	53634.0
30	73698.0
31	94413.0
32	113974.0
33	140301.5
34	171730.5
35	211708.5
36	270653.0
37	342761.0
38	418091.0
39	517789.5
40	654896.0
41	808583.5
42	972674.5
43	1128436.5
44	1262015.5
45	1372118.0
46	1453630.0
47	1480785.0
48	1431770.5
49	1385336.5
50	1313032.0
51	1164947.0
52	990338.5
53	842982.0
54	706408.0
55	587742.5
56	519068.0
57	439146.5
58	363799.0
59	306267.0
60	239663.5
61	165543.5
62	96358.0
63	53908.5
64	34196.0
65	20753.5
66	13409.0
67	6497.5
68	2491.0
69	1189.0
70	927.0
71	658.5
72	324.5
73	134.5
74	83.5
75	45.0
76	16.5
77	11.0
78	6.5
79	1.5
80	0.5
81	0.5
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	2.596289320633897E-4
2	7.162177436231442E-5
3	0.12268809948264459
4	1.7010171411049673E-4
5	2.2829440577987718E-4
6	9.847993974818231E-5
7	1.1190902244111626E-4
8	1.7010171411049673E-4
9	2.7753437565396834E-4
10-14	2.6679110949962123E-4
15-19	2.927540027059601E-4
20-24	4.3062591835341536E-4
25-29	2.909634583469023E-4
30-34	2.569431155248029E-4
35-39	1.5398681487897598E-4
40-44	3.0349726886030735E-4
45-49	2.4351403283186902E-4
50-54	1.2354756077499236E-4
55-59	1.6293953667426527E-4
60-64	1.4413882090415775E-4
65-69	0.048890813724074875
70-74	2.0322678475306717E-4
75-79	1.808449802648439E-4
80-84	1.2354756077499236E-4
85-89	1.190711998773477E-4
90-94	1.4055773218604205E-4
95-99	8.684140141430622E-5
100-104	8.415558487571944E-5
105-109	1.0206102846629804E-4
110-114	6.445959692608297E-5
115-119	6.625014128514084E-5
120-124	1.0385157282535591E-4
125-129	1.0206102846629804E-4
130-134	5.103051423314902E-5
135-139	6.625014128514084E-5
140-144	5.8192691669380456E-5
145-149	7.609813525995906E-5
150	1.6114899231520744E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.2339575E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	40.74711780594714
#Duplication Level	Percentage of total
1	31.705908702962315
2	8.278596239944354
3	4.844389911300863
4	3.3534459103011978
5	2.503826562322911
6	2.1219262571869657
7	1.7535793107753046
8	1.5282059520341367
9	1.2981560702124475
>10	16.221507958359673
>50	5.606182164840552
>100	10.964275892040488
>500	3.823340063215009
>1k	5.198434261297283
>5k	0.5831951289844173
>10k+	0.21502961422215008
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.4763608976446505E-6	0.0	0.0	8.952721795289301E-6	1.1638538333876093E-4	4.4763608976446505E-6
2	1.7905443590578602E-5	4.0287248078801854E-5	0.0	2.6858165385867906E-5	0.0014324354872462882	1.3429082692933953E-5
3	2.2381804488223252E-5	4.4763608976446505E-5	0.0	2.6858165385867906E-5	0.0033080307033593968	1.7905443590578602E-5
4	1.0295630064582697E-4	5.819269166938046E-5	0.0	3.133452628351255E-5	0.005098575062417257	1.7905443590578602E-5
5	1.2981446603169488E-4	5.819269166938046E-5	0.0	3.133452628351255E-5	0.0059087963848909394	2.2381804488223252E-5
6	1.656253532128521E-4	6.26690525670251E-5	0.0	3.133452628351255E-5	0.00737256639842074	2.2381804488223252E-5
7	1.9695987949636465E-4	9.847993974818232E-5	0.0	3.133452628351255E-5	0.008715474667714135	2.2381804488223252E-5
8	3.2229798463041483E-4	1.1190902244111627E-4	0.0	3.133452628351255E-5	0.011311763988348033	2.2381804488223252E-5
9	3.8049067629979534E-4	1.1190902244111627E-4	0.0	3.133452628351255E-5	0.013626042572430316	2.2381804488223252E-5
10-11	4.1630156348095254E-4	1.2086174423640557E-4	0.0	3.133452628351255E-5	0.024170110666832292	5.3716330771735806E-5
12-13	4.655415333550437E-4	1.2086174423640557E-4	0.0	3.8049067629979526E-5	0.03062502308123588	6.26690525670251E-5
14-15	5.282105859220688E-4	1.320526464805172E-4	0.0	4.0287248078801854E-5	0.03604141976738591	6.714541346466976E-5
16-17	5.975941798355608E-4	1.4100536827580648E-4	4.4763608976446505E-6	4.0287248078801854E-5	0.0393695940947847	6.714541346466976E-5
18-19	7.296468263160781E-4	1.4324354872462882E-4	4.4763608976446505E-6	4.0287248078801854E-5	0.04199945612215093	6.714541346466976E-5
20-21	0.0012198083446081673	1.7681625545696368E-4	4.4763608976446505E-6	4.923996987409116E-5	0.04416377661616212	6.714541346466976E-5
22-23	0.001692064419309678	1.835307968034307E-4	4.4763608976446505E-6	5.371633077173581E-5	0.046341526192866245	6.714541346466976E-5
24-25	0.0018599279529713524	1.9248351859871998E-4	4.4763608976446505E-6	5.595451122055814E-5	0.048586421183035036	6.714541346466976E-5
26-27	0.0019494551709242454	1.947216990475423E-4	4.4763608976446505E-6	6.26690525670251E-5	0.05034339283536056	7.385995481113674E-5
28-29	0.002063602373814184	1.9919805994518698E-4	4.4763608976446505E-6	7.162177436231441E-5	0.05236446978064713	8.057449615760372E-5
30-31	0.002316516764531107	2.014362403940093E-4	4.4763608976446505E-6	9.176539840171534E-5	0.054602650229469446	8.505085705524837E-5
32-33	0.0025022857417833595	2.014362403940093E-4	4.4763608976446505E-6	9.624175929935999E-5	0.056784876167071216	1.0071812019700465E-4
34-35	0.002636576568712699	2.014362403940093E-4	4.4763608976446505E-6	1.0071812019700465E-4	0.058868622164924805	1.0743266154347163E-4
36-37	0.002661196553649745	2.036744208428316E-4	4.4763608976446505E-6	1.0967084199229395E-4	0.06073078829834498	1.1190902244111627E-4
38-39	0.0026791019972403234	2.0591260129165394E-4	4.4763608976446505E-6	1.3876718782698417E-4	0.06281229611574973	1.1190902244111627E-4
40-41	0.0027216274257679477	2.0591260129165394E-4	4.4763608976446505E-6	1.3876718782698417E-4	0.06471251131679989	1.1414720288993859E-4
42-43	0.002757438312949105	2.0591260129165394E-4	4.4763608976446505E-6	1.3876718782698417E-4	0.06674925552522822	1.1638538333876093E-4
44-45	0.0027842964783349727	2.193416839845879E-4	4.4763608976446505E-6	1.3876718782698417E-4	0.06890238511699529	1.1638538333876093E-4
46-47	0.00282010736551613	2.193416839845879E-4	4.4763608976446505E-6	1.3876718782698417E-4	0.07194631052739364	1.1862356378758325E-4
48-49	0.0028447273504531756	2.2605622533105487E-4	4.4763608976446505E-6	1.3876718782698417E-4	0.07398529291627079	1.230999246852279E-4
50-51	0.002873823696287866	2.3277076667752185E-4	4.4763608976446505E-6	1.3876718782698417E-4	0.07604665710963615	1.253381051340502E-4
52-53	0.00291634912481549	2.3277076667752185E-4	4.4763608976446505E-6	1.4100536827580648E-4	0.0778953941603634	1.2757628558287255E-4
54-55	0.0029633509142407586	2.3277076667752185E-4	4.4763608976446505E-6	1.4548172917345115E-4	0.07934349691075143	1.2981446603169488E-4
56-57	0.0030081145232172053	2.372471275751665E-4	4.4763608976446505E-6	1.4995809007109582E-4	0.0808542687137065	1.2981446603169488E-4
58-59	0.0030439254103983623	2.5291439071692276E-4	4.4763608976446505E-6	1.5219627051991813E-4	0.082447853193268	1.2981446603169488E-4
60-61	0.0031244999065559663	2.6858165385867906E-4	4.4763608976446505E-6	1.5219627051991813E-4	0.08407948674045948	1.2981446603169488E-4
62-63	0.0031603107937371233	2.7305801475632367E-4	4.4763608976446505E-6	1.6114899231520744E-4	0.08600432192644668	1.2981446603169488E-4
64-65	0.0031670253350835906	2.7305801475632367E-4	4.4763608976446505E-6	1.678635336616744E-4	0.0881731187813555	1.3429082692933953E-4
66-67	0.0031894071395718137	2.797725561027906E-4	4.4763608976446505E-6	1.7010171411049673E-4	0.09018524300484677	1.3429082692933953E-4
68-69	0.0032632670943829505	2.9320163879572464E-4	4.4763608976446505E-6	1.7457807500814138E-4	0.0917609220408177	1.3876718782698417E-4
70-71	0.003328174327398798	3.0886890193748093E-4	4.4763608976446505E-6	1.7905443590578602E-4	0.0935671336630173	1.4324354872462882E-4
72-73	0.003361747034131133	3.1334526283512555E-4	4.4763608976446505E-6	1.8129261635460835E-4	0.09480932381211371	1.4324354872462882E-4
74-75	0.0033796524777217115	3.1334526283512555E-4	4.4763608976446505E-6	1.835307968034307E-4	0.0961208975551236	1.4324354872462882E-4
76-77	0.0033886051995170004	3.1334526283512555E-4	4.4763608976446505E-6	1.835307968034307E-4	0.09721312961414888	1.4324354872462882E-4
78-79	0.003415463364902869	3.1334526283512555E-4	4.4763608976446505E-6	2.036744208428316E-4	0.09824716898150479	1.4324354872462882E-4
80-81	0.0034691796956746045	3.1334526283512555E-4	4.4763608976446505E-6	2.1038896218929858E-4	0.09940430827354593	1.4324354872462882E-4
82-83	0.0035206578459975177	3.178216237327702E-4	4.4763608976446505E-6	2.1038896218929858E-4	0.10051668395661063	1.4324354872462882E-4
84-85	0.0035810887181157206	3.178216237327702E-4	4.4763608976446505E-6	2.1038896218929858E-4	0.10172977775987233	1.4324354872462882E-4
86-87	0.0036661395751709687	3.178216237327702E-4	4.4763608976446505E-6	2.1262714263812091E-4	0.10281753345799999	1.4324354872462882E-4
88-89	0.0037041886428009485	3.178216237327702E-4	4.4763608976446505E-6	2.193416839845879E-4	0.10396572002824583	1.4324354872462882E-4
90-91	0.0037198559059427047	3.178216237327702E-4	4.4763608976446505E-6	2.193416839845879E-4	0.10547873001164973	1.4771990962227349E-4
92-93	0.0037601431540215066	3.2005980418159255E-4	4.4763608976446505E-6	2.193416839845879E-4	0.1070611235889671	1.4771990962227349E-4
94-95	0.0038362412892814658	3.267743455280595E-4	4.4763608976446505E-6	2.193416839845879E-4	0.10828540829447292	1.5219627051991813E-4
96-97	0.003948150311722583	3.312507064257042E-4	4.4763608976446505E-6	2.193416839845879E-4	0.10939106943619116	1.5667263141756277E-4
98-99	0.004039915710124298	3.357270673233488E-4	4.4763608976446505E-6	2.193416839845879E-4	0.11015205078879074	1.6114899231520742E-4
100-101	0.004277162837699464	3.357270673233488E-4	8.952721795289301E-6	2.2157986443341023E-4	0.11100032117889441	1.6114899231520742E-4
102-103	0.00432192644667591	3.357270673233488E-4	8.952721795289301E-6	2.3277076667752185E-4	0.11178368433598221	1.6114899231520742E-4
104-105	0.004348784612061778	3.4020342822099346E-4	8.952721795289301E-6	2.4172348847281114E-4	0.11254018932768417	1.6114899231520742E-4
106-107	0.004393548221038225	3.4467978911863813E-4	8.952721795289301E-6	2.641052929610344E-4	0.1133257906652208	1.6114899231520742E-4
108-109	0.004422644566872915	3.4467978911863813E-4	8.952721795289301E-6	2.7753437565396834E-4	0.11415615561173388	1.6114899231520742E-4
110-111	0.004451740912707605	3.4691796956746047E-4	8.952721795289301E-6	2.7753437565396834E-4	0.11495518603196345	1.6114899231520742E-4
112-113	0.00454350631110932	3.4915615001628275E-4	8.952721795289301E-6	2.7753437565396834E-4	0.11583479094835063	1.6338717276402975E-4
114-115	0.004594984461432234	3.536325109139274E-4	8.952721795289301E-6	2.797725561027907E-4	0.11683301942852539	1.656253532128521E-4
116-117	0.0046777971380386595	3.536325109139274E-4	8.952721795289301E-6	2.999161801421916E-4	0.11764100257055024	1.656253532128521E-4
118-119	0.004744942551503329	3.536325109139274E-4	8.952721795289301E-6	3.111070823863032E-4	0.11843555662988217	1.656253532128521E-4
120-121	0.004939664250550872	3.625852327092167E-4	8.952721795289301E-6	3.1334526283512555E-4	0.11925249249370232	1.656253532128521E-4
122-123	0.005324631287748312	3.625852327092167E-4	8.952721795289301E-6	3.155834432839479E-4	0.12002914110944367	1.656253532128521E-4
124-125	0.005461160295126474	3.625852327092167E-4	8.952721795289301E-6	3.2453616507923717E-4	0.12077221701845267	1.7233989455931907E-4
126-127	0.0055260675281423215	3.6482341315803904E-4	8.952721795289301E-6	3.267743455280595E-4	0.12156005653643814	1.7457807500814138E-4
128-129	0.005599927482953458	3.670615936068614E-4	8.952721795289301E-6	3.267743455280595E-4	0.12224046339288012	1.7457807500814138E-4
130-131	0.005731980129433975	3.7377613495332833E-4	8.952721795289301E-6	3.2901252597688184E-4	0.1228291048509204	1.7457807500814138E-4
132-133	0.005828221888733335	3.78252495850973E-4	8.952721795289301E-6	3.4020342822099346E-4	0.12344460447434653	1.7457807500814138E-4
134-135	0.005964750896111497	3.8049067629979534E-4	8.952721795289301E-6	3.424416086698158E-4	0.12438687844330074	1.7905443590578602E-4
136-137	0.0061706634974031515	3.939197589927293E-4	1.3429082692933953E-5	3.4467978911863813E-4	0.12519933794622323	1.835307968034307E-4
138-139	0.006278096158946623	4.1182520258330787E-4	1.3429082692933953E-5	3.4467978911863813E-4	0.12596031929882284	1.835307968034307E-4
>>END_MODULE
