##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.2d.S.3.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24116217
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.82317869340784	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.67393202673537	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.84012351522629	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.83677046030893	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.6971514230445	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.701368999955506	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.75340597573823	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.882052106265256	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.84311146312873	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.82258595533454	35.0	34.0	37.2	31.2	39.0
15-19	34.83874747021889	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.82670879101809	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.82663744483639	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.80881608421421	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.793791389420655	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.75500805951448	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.64478143483284	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.62631590186803	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.61231577904611	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.5866365856635	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
65-69	34.54825723288192	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
70-74	34.55277380361937	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.536391657116035	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.51779646036523	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.50353646262182	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.478299925730475	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.45874331782634	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.421845383129536	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.39355126054804	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.36401121286975	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.327927336198705	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.28773382657819	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.268907474169765	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.22986341514509	35.0	34.0	37.0	29.6	39.0
135-139	34.19415909219924	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.15397871067423	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.1270758344893	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	34.12650114236408	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	17.0
22	330.0
23	3164.0
24	20483.0
25	80557.0
26	206117.0
27	379772.0
28	563607.0
29	736497.0
30	925444.0
31	1160231.0
32	1483282.0
33	1946304.0
34	2693432.0
35	4220077.0
36	8359753.0
37	1337147.0
38	3.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.420942262399564	10.323719861067612	13.948160387351386	39.30717748918144
2	22.891811563443	12.261778819051482	37.13566126591053	27.710748351594994
3	21.32657149774323	16.70194628440936	28.26308774829039	33.70839446955702
4	26.91899811209822	24.636257856806658	21.87931336254552	26.565430668549606
5	26.84961257783617	30.276122700762254	23.994361632195854	18.879903089205722
6	19.766518810340134	36.177285612611335	25.38919060396072	18.667004973087806
7	16.633883734955347	23.940617032329463	40.38734033144846	19.038158901266733
8	19.152762324823204	23.641888475999213	31.35043452934226	25.85491466983532
9	19.96758858114913	22.257187204348018	32.68731647185426	25.08790774264859
10-14	20.970591500857964	28.482101364557465	26.72933821605149	23.817968918533083
15-19	21.221672149818364	27.437046535747196	27.296669404358536	24.044611910075904
20-24	21.14260682114556	27.457243183205467	27.250501367004183	24.149648628644798
25-29	21.07835172136177	27.71454125582527	26.86235321566146	24.344753807151495
30-34	21.118838161319967	27.450130958168316	27.10449238669042	24.326538493821296
35-39	21.41942363572556	27.214377283439163	26.97330696356231	24.39289211727297
40-44	21.61436922870308	27.292870974058403	26.77321815444207	24.31954164279645
45-49	21.857693698938274	27.226718931217803	26.691923623957663	24.223663745886256
50-54	21.814667046892488	27.47489500292144	26.61168502420622	24.09875292597985
55-59	21.746766621132924	27.414458367185084	26.677232186970233	24.161542824711756
60-64	21.958536044023084	27.227586029136404	26.44721215887877	24.36666576796175
65-69	21.79370568254081	27.36903278145429	26.650704649141545	24.186556886863357
70-74	22.201699064056246	27.096959511574877	26.559739080308574	24.1416023440603
75-79	22.053084547499914	26.97055623920891	26.54649415204368	24.429865061247497
80-84	22.31443828352086	26.923485681365566	26.621306930024357	24.140769105089213
85-89	22.19738147102863	26.905640444931183	26.60669363918941	24.290284444850773
90-94	22.18002529769819	26.650388857919832	26.614417996158945	24.555167848223032
95-99	22.404514490288623	26.690765605576587	26.80943939361043	24.095280510524354
100-104	22.328119147475864	26.52292067443304	26.870885156560963	24.278075021530135
105-109	22.450672873616494	26.484680231245456	26.709744776051508	24.354902119086542
110-114	22.41090225874748	26.54300492753292	26.688229262196305	24.35786355152329
115-119	22.537056487916956	26.735361488493997	26.597524731996845	24.1300572915922
120-124	22.538371087262625	26.552824977946976	26.55455493599118	24.35424899879922
125-129	22.93925482777517	26.546537526651075	26.415135351762054	24.099072293811698
130-134	22.646225122571302	26.85792619753548	26.278912287711965	24.216936392181253
135-139	22.738231596701752	26.67069162244295	26.332244535801173	24.258832245054123
140-144	22.7386801076093	26.47587999063899	26.61894810366808	24.166491798083626
145-149	22.522200425904508	26.742897016462457	26.657896906163174	24.077005651469857
150	22.23358802517909	26.32595713039723	26.826603956958067	24.613850887465613
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	0.5
9	0.5
10	1.5
11	3.5
12	8.0
13	9.5
14	14.5
15	45.0
16	93.0
17	210.5
18	476.5
19	857.0
20	1376.0
21	2234.5
22	3795.0
23	6308.0
24	10137.0
25	15651.5
26	22540.5
27	32783.5
28	50456.0
29	74617.0
30	102047.5
31	128576.0
32	154823.0
33	187321.5
34	223605.0
35	269460.5
36	336733.5
37	410649.5
38	483312.0
39	586551.5
40	729003.5
41	887264.5
42	1051253.0
43	1211770.0
44	1354679.5
45	1468582.5
46	1552872.5
47	1578002.0
48	1532186.0
49	1484300.0
50	1399078.5
51	1247460.0
52	1061002.5
53	891963.5
54	743691.0
55	610709.0
56	520839.0
57	434110.0
58	360909.5
59	296963.0
60	225714.5
61	152215.0
62	87058.0
63	50063.5
64	32739.0
65	20835.0
66	13753.0
67	6531.5
68	2459.0
69	1143.5
70	934.0
71	640.0
72	357.0
73	171.5
74	110.5
75	75.5
76	35.0
77	24.0
78	12.5
79	4.0
80	1.0
81	0.0
82	0.5
83	0.5
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	1.078112707312262E-4
2	1.078112707312262E-4
3	0.16387313151146385
4	1.078112707312262E-4
5	7.463857204469507E-5
6	5.39056353656131E-5
7	3.7319286022347537E-5
8	3.7319286022347537E-5
9	1.0366468339540982E-4
10-14	1.3352011221328785E-4
15-19	1.583996362281862E-4
20-24	2.1064663665947274E-4
25-29	1.542530488923698E-4
30-34	1.774739379729416E-4
35-39	7.132130217604195E-5
40-44	1.6088758862967605E-4
45-49	1.5259441395804326E-4
50-54	9.205423885512392E-5
55-59	1.4927714408939015E-4
60-64	1.3600806461477768E-4
65-69	0.0653286541583201
70-74	1.890843825132275E-4
75-79	1.3020284234463472E-4
80-84	1.1444581046853245E-4
85-89	8.376106418349114E-5
90-94	1.277148899431449E-4
95-99	9.868877859243015E-5
100-104	8.293174671632785E-5
105-109	9.951809605959343E-5
110-114	4.4783143226817045E-5
115-119	3.400201615369442E-5
120-124	1.044940008625731E-4
125-129	1.0615263579689965E-4
130-134	3.648996855518426E-5
135-139	4.146587335816392E-5
140-144	4.810041309547015E-5
145-149	5.39056353656131E-5
150	6.219881003724589E-5
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4116217E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.11928806153368
#Duplication Level	Percentage of total
1	34.172336338342305
2	8.040061184913498
3	4.982247124514564
4	3.363876340908371
5	2.654099417053655
6	2.109126197608276
7	1.708961056002659
8	1.4749977416653428
9	1.2541032264546257
>10	15.788450986997942
>50	5.2210276461632645
>100	10.476004169909322
>500	3.737658791199159
>1k	4.296021046070091
>5k	0.5659943324450104
>10k+	0.1550343997518004
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	4.146587335816393E-6	0.0	0.0	2.819679388355147E-4	4.146587335816393E-6
2	8.293174671632786E-6	3.3172698686531144E-5	0.0	4.146587335816393E-6	0.0024133138294451404	2.0732936679081965E-5
3	2.0732936679081965E-5	3.7319286022347537E-5	0.0	4.146587335816393E-6	0.00473540273750232	4.9759048029796715E-5
4	4.561246069398032E-5	3.7319286022347537E-5	0.0	8.293174671632786E-6	0.006933094025485009	7.049198470887867E-5
5	4.9759048029796715E-5	4.561246069398032E-5	0.0	8.293174671632786E-6	0.007915835224073494	7.463857204469507E-5
6	7.049198470887867E-5	4.9759048029796715E-5	0.0	8.293174671632786E-6	0.009615936031758214	8.293174671632786E-5
7	8.293174671632786E-5	7.463857204469507E-5	0.0	8.293174671632786E-6	0.01118334604469681	8.293174671632786E-5
8	1.6586349343265572E-4	7.878515938051146E-5	0.0	8.293174671632786E-6	0.01458769424740207	9.122492138796064E-5
9	2.363554781415344E-4	7.878515938051146E-5	0.0	8.293174671632786E-6	0.01735761458772742	9.537150872377703E-5
10-11	2.964809945108721E-4	8.293174671632786E-5	0.0	1.0366468339540982E-5	0.030811217198783707	1.4720385042148195E-4
12-13	3.358735742011278E-4	8.500504038423605E-5	0.0	1.2439762007449179E-5	0.039373920047244555	1.7622996177219668E-4
14-15	3.6075309821602614E-4	8.915162772005244E-5	0.0	1.6586349343265572E-5	0.04564563339266685	2.0318277945500325E-4
16-17	3.835593285630163E-4	9.744480239168524E-5	0.0	2.0732936679081965E-5	0.04984197977651304	2.0732936679081963E-4
18-19	4.872240119584262E-4	1.181777390707672E-4	0.0	2.0732936679081965E-5	0.05306387813644238	2.1147595412663602E-4
20-21	9.309088568907802E-4	1.4098396941775735E-4	0.0	2.0732936679081965E-5	0.05553524418858895	2.1147595412663602E-4
22-23	0.0013269079474612457	1.4927714408939015E-4	0.0	2.0732936679081965E-5	0.05823259925053751	2.1976912879826882E-4
24-25	0.0014243527498529309	1.5342373142520653E-4	0.0	2.0732936679081965E-5	0.06097556677318006	2.1976912879826882E-4
26-27	0.0014513055675357375	1.5342373142520653E-4	0.0	2.280623034699016E-5	0.06318984441050601	2.2806230346990162E-4
28-29	0.0015197242585767079	1.5342373142520653E-4	0.0	3.109940501862295E-5	0.06573170244736146	2.4672194648107536E-4
30-31	0.0017125405696921702	1.5342373142520653E-4	0.0	4.9759048029796715E-5	0.06881676342520886	2.6538158949224915E-4
32-33	0.001805838784748039	1.5342373142520653E-4	0.0	5.390563536561311E-5	0.07162400305155656	2.944077008429639E-4
34-35	0.0019032835871397244	1.596436124289311E-4	0.0	7.878515938051147E-5	0.074165861088412	2.985542881787803E-4
36-37	0.0019302364048225309	1.617169060968393E-4	0.0	8.915162772005244E-5	0.07655636868751015	3.0684746285041306E-4
38-39	0.001950969341501613	1.617169060968393E-4	0.0	9.537150872377703E-5	0.07928689644814524	3.0892075651832126E-4
40-41	0.0019882886275239603	1.617169060968393E-4	0.0	9.951809605959343E-5	0.0816276449992136	3.1514063752204584E-4
42-43	0.0019986550958635014	1.700100807684721E-4	2.0732936679081965E-6	1.0366468339540982E-4	0.08401815259831175	3.192872248578622E-4
44-45	0.002019388032542583	1.8452313644382948E-4	4.146587335816393E-6	1.0366468339540982E-4	0.08670721448558869	3.192872248578622E-4
46-47	0.002038047675553757	1.8659643011173768E-4	4.146587335816393E-6	1.0366468339540982E-4	0.0911876021019383	3.234338121936786E-4
48-49	0.0020546340248970224	1.9074301744755406E-4	4.146587335816393E-6	1.0366468339540982E-4	0.0937937322424989	3.2758039952949505E-4
50-51	0.0020629271995686554	2.0732936679081963E-4	4.146587335816393E-6	1.0781127073122622E-4	0.09661341163085405	3.2965369319740324E-4
52-53	0.002089880017251462	2.1147595412663602E-4	8.293174671632786E-6	1.0988456439913441E-4	0.0991075839133476	3.3172698686531144E-4
54-55	0.00211475954126636	2.1147595412663602E-4	8.293174671632786E-6	1.119578580670426E-4	0.10091134940442774	3.3172698686531144E-4
56-57	0.0021790316449715142	2.197691287982688E-4	8.293174671632786E-6	1.119578580670426E-4	0.10301366918368665	3.3172698686531144E-4
58-59	0.0022267173993334027	2.342821844736262E-4	8.293174671632786E-6	1.181777390707672E-4	0.10518026106665071	3.3172698686531144E-4
60-61	0.0023179423207213634	2.4257535914525897E-4	8.293174671632786E-6	1.2025103273867539E-4	0.10722452862320819	3.3172698686531144E-4
62-63	0.0023801411307586093	2.570884148206164E-4	8.293174671632786E-6	1.3061750107821638E-4	0.10959844987296308	3.3380028053321963E-4
64-65	0.0023905075990981505	2.570884148206164E-4	8.293174671632786E-6	1.3476408841403277E-4	0.1122107998945274	3.358735742011278E-4
66-67	0.0024133138294451404	2.757480578317901E-4	8.293174671632786E-6	1.3891067574984915E-4	0.11453288880258458	3.358735742011278E-4
68-69	0.0024423399407958553	2.861145261713311E-4	8.293174671632786E-6	1.4098396941775735E-4	0.11621018337992231	3.400201615369442E-4
70-71	0.0024630728774749375	2.9026111350714747E-4	8.293174671632786E-6	1.4513055675357376E-4	0.11808858744304715	3.400201615369442E-4
72-73	0.0024838058141540193	3.006275818466885E-4	8.293174671632786E-6	1.4513055675357376E-4	0.11959172535228058	3.462400425406688E-4
74-75	0.002510758631836826	3.0684746285041306E-4	8.293174671632786E-6	1.4513055675357376E-4	0.12127109322328622	3.48313336208577E-4
76-77	0.0025252716875121834	3.192872248578622E-4	8.293174671632786E-6	1.4927714408939015E-4	0.12266641986178844	3.48313336208577E-4
78-79	0.002556371092530806	3.213605185257704E-4	8.293174671632786E-6	1.6586349343265572E-4	0.12403272038893995	3.5245992354439337E-4
80-81	0.002583323910213613	3.255071058615868E-4	8.293174671632786E-6	1.741566681042885E-4	0.1254384134957817	3.5660651088020975E-4
82-83	0.002616496608900144	3.2758039952949505E-4	8.293174671632786E-6	1.7622996177219668E-4	0.127012043389724	3.5660651088020975E-4
84-85	0.0026579624822583078	3.400201615369442E-4	8.293174671632786E-6	1.7830325544010488E-4	0.1286043329266775	3.5660651088020975E-4
86-87	0.002691135180944839	3.441667488727606E-4	8.293174671632786E-6	1.9074301744755406E-4	0.13009917766123932	3.5660651088020975E-4
88-89	0.0027056482366201963	3.441667488727606E-4	8.293174671632786E-6	1.9074301744755406E-4	0.13140120608468567	3.5660651088020975E-4
90-91	0.0027160147049597374	3.441667488727606E-4	8.293174671632786E-6	1.9074301744755406E-4	0.13304947455067268	3.5660651088020975E-4
92-93	0.00274711410997836	3.441667488727606E-4	8.293174671632786E-6	2.0732936679081963E-4	0.1347475020646895	3.58679804548118E-4
94-95	0.0028155328010193307	3.441667488727606E-4	8.293174671632786E-6	2.0732936679081963E-4	0.136182221282882	3.607530982160262E-4
96-97	0.002898464547735659	3.5660651088020975E-4	8.293174671632786E-6	2.0732936679081963E-4	0.1374572968886455	3.607530982160262E-4
98-99	0.0029689565324445373	3.6697297921975077E-4	8.293174671632786E-6	2.0940266045872783E-4	0.13861626804900617	3.607530982160262E-4
100-101	0.003095427446186937	3.7941274122719993E-4	8.293174671632786E-6	2.135492477945442E-4	0.13974413980434824	3.607530982160262E-4
102-103	0.003122380263869744	3.814860348951081E-4	8.293174671632786E-6	2.1562254146245243E-4	0.14081395933698887	3.607530982160262E-4
104-105	0.0031472597878846424	3.814860348951081E-4	8.293174671632786E-6	2.1769583513036063E-4	0.14184645958360717	3.607530982160262E-4
106-107	0.0031928722485786223	3.814860348951081E-4	8.293174671632786E-6	2.1976912879826882E-4	0.142889326298565	3.607530982160262E-4
108-109	0.003244704590276327	3.814860348951081E-4	8.293174671632786E-6	2.21842422466177E-4	0.1439570725375377	3.607530982160262E-4
110-111	0.003290317050970308	3.814860348951081E-4	8.293174671632786E-6	2.239157161340852E-4	0.1449418870297941	3.607530982160262E-4
112-113	0.00337946867869036	3.835593285630163E-4	8.293174671632786E-6	2.239157161340852E-4	0.14608634513447943	3.607530982160262E-4
114-115	0.003418861258380616	3.980723842383737E-4	8.293174671632786E-6	2.2806230346990162E-4	0.14735520085923925	3.607530982160262E-4
116-117	0.0035453321721230155	4.022189715741901E-4	8.293174671632786E-6	2.4464865281316716E-4	0.14836904146284635	3.607530982160262E-4
118-119	0.00360960427582817	4.3124508292490487E-4	8.293174671632786E-6	2.4464865281316716E-4	0.14912994023896867	3.607530982160262E-4
120-121	0.0037651013009212847	4.3539167026072125E-4	8.293174671632786E-6	2.4879524014898355E-4	0.1500504826275199	3.607530982160262E-4
122-123	0.0040221897157419004	4.3539167026072125E-4	8.293174671632786E-6	2.5294182748479994E-4	0.15087565350734736	3.648996855518426E-4
124-125	0.00413829416114476	4.3953825759653764E-4	8.293174671632786E-6	2.5294182748479994E-4	0.15170911756184646	3.6697297921975077E-4
126-127	0.004175613447167107	4.3953825759653764E-4	8.293174671632786E-6	2.5294182748479994E-4	0.15244306352028597	3.6904627288765897E-4
128-129	0.004258545193883436	4.3953825759653764E-4	8.293174671632786E-6	2.5294182748479994E-4	0.1531604231293822	3.6904627288765897E-4
130-131	0.004370503051950478	4.519780196039868E-4	8.293174671632786E-6	2.6330829582434096E-4	0.15387985603214632	3.7111956655556716E-4
132-133	0.00447209444167798	4.581979006077114E-4	8.293174671632786E-6	2.6538158949224915E-4	0.15456196964888813	3.7319286022347535E-4
134-135	0.004594418768084563	4.6234448794352776E-4	8.293174671632786E-6	2.6538158949224915E-4	0.15537055417937234	3.7319286022347535E-4
136-137	0.004758208967849311	4.7685754361888517E-4	8.293174671632786E-6	2.6538158949224915E-4	0.15619779835286768	3.7319286022347535E-4
138-139	0.00485150718290518	4.955171866300589E-4	8.293174671632786E-6	2.6538158949224915E-4	0.1569047914936244	3.7319286022347535E-4
>>END_MODULE
