##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.4d.R.1.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24095793
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.90640171087127	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.76223272668386	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.9563040319943	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.906217446340115	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.779927641310664	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.77401768848197	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.76726397840486	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.918119482517135	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.902061368140075	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.8840778388161	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
15-19	34.880528264830296	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
20-24	34.890756739153595	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.87788028391512	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.86832554545933	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.86317048789388	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.8021794841946	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.71259604529305	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.673519356677744	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.66357289838936	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.63754988267039	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.620228883938374	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.59395589097234	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.573010666218785	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
80-84	34.54960131007102	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.527910735288934	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.50209969848264	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.47342277550276	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.433467800789956	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.38344481129964	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.34720466763638	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.299111749507475	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.2619281714447	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.21389337964516	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
130-134	34.154136292588504	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.1077969336805	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.06917271409162	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.00051943507317	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	33.96003567925737	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	20.0
22	420.0
23	4195.0
24	25224.0
25	92822.0
26	223440.0
27	391360.0
28	562074.0
29	725055.0
30	898910.0
31	1127073.0
32	1437487.0
33	1892970.0
34	2624060.0
35	4126953.0
36	8859545.0
37	1104181.0
38	4.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.77048838249341	10.802419385629904	14.75397440141197	38.67311783046471
2	22.42302759901986	12.938486613426011	37.029700718554196	27.608785068999936
3	20.831893592627488	17.797531633555327	28.770754572980305	32.599820200836874
4	25.98394838995847	25.634978512416453	22.294679366209248	26.08639373141583
5	25.606456664248263	31.16925507223545	24.39563913789739	18.82864912561889
6	18.94352590390024	36.77544605022632	25.66172913398545	18.61929891188799
7	15.781742903353738	24.594322616587792	40.88038271316582	18.74355176689265
8	18.360265165169626	24.040506024002383	31.690324618748498	25.90890419207949
9	19.547695828513678	22.68901819140417	32.86796407801932	24.895321902062832
10-14	20.2172143347158	29.210946833139236	27.1046980726209	23.467140759524067
15-19	20.364711616732638	27.872254693062082	27.968176215984276	23.794857474221
20-24	20.506280962149717	28.05914951561377	27.70165246146509	23.73291706077142
25-29	20.494472686710868	28.273718572075772	27.555589413111235	23.676219328102118
30-34	20.460676281520463	28.005610453423753	27.598990032724906	23.934723232330878
35-39	20.560414977768716	27.977278701205226	27.646100317824075	23.816206003201977
40-44	20.60167957082707	28.076915523656904	27.53535463937628	23.78605026613975
45-49	20.686933825453615	27.845932759896876	27.516442356580956	23.95069105806856
50-54	20.801162426847505	27.83051429572486	27.587647304857605	23.780675972570027
55-59	20.797828128452377	27.869280165818687	27.51282012121989	23.820071584509048
60-64	20.74780400822197	27.788188331071645	27.503161201754928	23.96084645895146
65-69	20.842818247626173	27.71905702055943	27.59153395519704	23.84659077661736
70-74	20.949910170731638	27.664082112542026	27.563130532364475	23.82287718436186
75-79	20.95635774833485	27.56535804764097	27.570250200325937	23.908034003698248
80-84	21.004347459289132	27.56181170166557	27.550919314795742	23.88292152424956
85-89	20.988723432356032	27.568244041277275	27.61387043783346	23.829162088533238
90-94	20.97704563969347	27.458575446975008	27.565797854735102	23.998581058596425
95-99	21.05365927834241	27.387341511797885	27.675382695541668	23.88361651431804
100-104	21.12832878308522	27.43796872090246	27.536137345502198	23.89756515051012
105-109	21.077247088505736	27.268383989093365	27.64635734185455	24.008011580546352
110-114	21.158849816614005	27.253264905838183	27.68325389658614	23.90463138096167
115-119	21.201309240695824	27.29584943102841	27.638394664775856	23.864446663499912
120-124	21.155283959757572	27.192680160608298	27.647274175223775	24.004761704410363
125-129	21.185633868966107	27.1214759322162	27.72147603845895	23.971414160358755
130-134	21.26113219062235	27.22000006009358	27.613109192244494	23.905758557039576
135-139	21.255795928117223	27.05787160181915	27.705468722317477	23.98086374774615
140-144	21.3172544163199	27.00232699106194	27.822890708512517	23.857527884105647
145-149	21.323714463929477	27.65631684399905	27.43210551484238	23.587863177229092
150	21.1893788515371	27.164713824690235	27.530658223900765	24.1152490998719
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	2.0
11	7.5
12	12.0
13	11.0
14	31.5
15	69.5
16	161.5
17	314.0
18	613.5
19	1170.5
20	2166.0
21	3779.5
22	5879.5
23	9246.5
24	14989.5
25	23601.5
26	35259.5
27	49387.0
28	67141.0
29	93778.0
30	126242.5
31	159336.5
32	192473.0
33	229360.5
34	269450.5
35	316550.5
36	388047.5
37	486721.0
38	605909.5
39	749515.0
40	916541.0
41	1084759.0
42	1256854.5
43	1435971.0
44	1582571.0
45	1668161.5
46	1689055.0
47	1647006.0
48	1557566.0
49	1428388.0
50	1259736.5
51	1077515.0
52	892214.5
53	708199.5
54	543996.0
55	408290.0
56	302909.0
57	225302.5
58	169511.0
59	125734.5
60	87750.0
61	61086.5
62	43242.5
63	28192.5
64	18447.0
65	13838.5
66	12310.0
67	8868.0
68	4380.0
69	2294.5
70	1743.5
71	1114.0
72	518.5
73	217.5
74	106.0
75	69.5
76	48.5
77	38.0
78	16.5
79	2.0
80	0.5
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	3.693590827245237E-4
2	1.909046944418887E-4
3	7.885193900860619E-5
4	7.055173490243712E-5
5	2.9050714371591753E-5
6	8.300204106169073E-5
7	1.8675459238880413E-4
8	7.885193900860619E-5
9	7.055173490243712E-5
10-14	1.4608359226857569E-4
15-19	2.2327549045594804E-4
20-24	1.7430428622955055E-4
25-29	2.9797732741146973E-4
30-34	8.31680451438141E-4
35-39	8.24210267742589E-4
40-44	0.001064916186821492
45-49	9.13852472089215E-4
50-54	5.594337567557955E-4
55-59	3.195578580875093E-4
60-64	2.1414526593916208E-4
65-69	3.0544751110702186E-4
70-74	3.444584704060165E-4
75-79	2.531562252381567E-4
80-84	2.664365518080272E-4
85-89	3.8263940929439427E-4
90-94	3.4611851122725033E-4
95-99	2.988073478220866E-4
100-104	4.5900128707114973E-4
105-109	3.0378747028578804E-4
110-114	2.481761027744553E-4
115-119	2.3074567415150025E-4
120-124	2.1248522511792826E-4
125-129	1.269931228243868E-4
130-134	1.718142249976998E-4
135-139	1.6766412294461528E-4
140-144	1.693241637658491E-4
145-149	1.8094444951448577E-4
150	2.3240571497273402E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4095793E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	50.92870298081923
#Duplication Level	Percentage of total
1	39.429176294847984
2	10.61696724150455
3	6.267391496282741
4	4.58489585447208
5	3.403197614523833
6	2.7549304779072545
7	2.2504815089578765
8	1.917282166233914
9	1.6169800150269098
>10	17.847552183142973
>50	4.413419830084176
>100	4.308407968337161
>500	0.3300369072815759
>1k	0.25928044139714457
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	8.300204106169073E-6	3.320081642467629E-5	0.0	0.0	1.245030615925361E-4	4.9801224637014434E-5
2	8.300204106169073E-6	7.885193900860619E-5	4.1501020530845364E-6	0.0	0.0021165520470731135	5.810142874318351E-5
3	1.6600408212338146E-5	7.885193900860619E-5	4.1501020530845364E-6	0.0	0.003249529907565192	9.545234722094433E-5
4	6.640163284935258E-5	9.545234722094433E-5	4.1501020530845364E-6	4.1501020530845364E-6	0.004780917565153386	1.0790265338019794E-4
5	7.055173490243712E-5	9.960244927402887E-5	4.1501020530845364E-6	8.300204106169073E-6	0.006001047568760239	1.2035295953945156E-4
6	9.960244927402887E-5	9.960244927402887E-5	4.1501020530845364E-6	8.300204106169073E-6	0.007158926041570825	1.2035295953945156E-4
7	1.037525513271134E-4	1.2035295953945156E-4	4.1501020530845364E-6	8.300204106169073E-6	0.008354155432859172	1.245030615925361E-4
8	1.1620285748636702E-4	1.245030615925361E-4	4.1501020530845364E-6	8.300204106169073E-6	0.010416756153242186	1.369533677517897E-4
9	1.369533677517897E-4	1.245030615925361E-4	4.1501020530845364E-6	8.300204106169073E-6	0.013691186673125886	1.494036739110433E-4
10-11	1.826044903357196E-4	1.3487831672524743E-4	4.1501020530845364E-6	8.300204106169073E-6	0.018258373982545418	2.344807659992763E-4
12-13	2.1995540881348044E-4	1.3902841877833197E-4	4.1501020530845364E-6	8.300204106169073E-6	0.02192913924849869	2.9050714371591755E-4
14-15	2.3033066394619178E-4	1.4732862288450104E-4	4.1501020530845364E-6	8.300204106169073E-6	0.026525377272289815	3.216329091140516E-4
16-17	2.7598178653012164E-4	1.70154184176466E-4	4.1501020530845364E-6	8.300204106169073E-6	0.03104068830604579	3.2785806219367837E-4
18-19	3.112576539813402E-4	1.9297974546843093E-4	4.1501020530845364E-6	8.300204106169073E-6	0.034788230459981126	3.320081642467629E-4
20-21	3.6728403169798143E-4	2.3863086805236085E-4	4.1501020530845364E-6	1.037525513271134E-5	0.038409194501297386	3.40308368352932E-4
22-23	4.4406091968004536E-4	2.4070591907890312E-4	4.1501020530845364E-6	1.6600408212338146E-5	0.04240781782944433	3.569087765652701E-4
24-25	5.249879097151938E-4	2.531562252381567E-4	4.1501020530845364E-6	1.6600408212338146E-5	0.04685672723035096	3.71434133751066E-4
26-27	6.34965614121934E-4	2.5730632729124126E-4	4.1501020530845364E-6	1.6600408212338146E-5	0.05130356158023104	4.004848481226577E-4
28-29	6.847668387589485E-4	2.614564293443258E-4	4.1501020530845364E-6	2.075051026542268E-5	0.05587074888965057	4.129351542819114E-4
30-31	7.407932164755897E-4	2.614564293443258E-4	4.1501020530845364E-6	3.1125765398134024E-5	0.0603985102295658	4.399108176269609E-4
32-33	7.802191859798928E-4	2.635314803708681E-4	4.1501020530845364E-6	3.320081642467629E-5	0.06453616197649109	4.917870932905175E-4
34-35	8.549210229354144E-4	2.6560653139741033E-4	4.1501020530845364E-6	4.357607155738763E-5	0.06802017265005555	5.18762756635567E-4
36-37	8.73596482174295E-4	2.7598178653012164E-4	4.1501020530845364E-6	4.56511225839299E-5	0.07155813465031012	5.291380117682784E-4
38-39	8.901968903866331E-4	2.822069396097485E-4	4.1501020530845364E-6	5.810142874318351E-5	0.07600081889813712	5.415883179275319E-4
40-41	9.233977068113094E-4	2.822069396097485E-4	4.1501020530845364E-6	5.810142874318351E-5	0.07974213589899282	5.519635730602433E-4
42-43	9.337729619440208E-4	2.884320926893753E-4	4.1501020530845364E-6	5.810142874318351E-5	0.08317012019484066	5.602637771664124E-4
44-45	9.586735742625279E-4	3.0088239884862886E-4	8.300204106169073E-6	5.810142874318351E-5	0.087262120819182	5.623388281929547E-4
46-47	0.0010063997478730001	3.071075519282557E-4	8.300204106169073E-6	6.017647976972578E-5	0.09127734455554129	5.685639812725814E-4
48-49	0.0010458257173773032	3.195578580875093E-4	8.300204106169073E-6	6.225153079626805E-5	0.09502281165845008	5.810142874318351E-4
50-51	0.0010769514827754373	3.3408321527330514E-4	8.300204106169073E-6	6.225153079626805E-5	0.09923309019130436	5.87239440511462E-4
52-53	0.0011558034217840434	3.3615826629984744E-4	8.300204106169073E-6	6.225153079626805E-5	0.10333131596872533	5.934645935910888E-4
54-55	0.0012076796974476002	3.3615826629984744E-4	8.300204106169073E-6	6.225153079626805E-5	0.10649991888625537	5.955396446176309E-4
56-57	0.0012595559731111566	3.444584704060165E-4	8.300204106169073E-6	6.225153079626805E-5	0.11093845303202929	6.225153079626804E-4
58-59	0.00129898194261546	3.548337255387279E-4	8.300204106169073E-6	7.470183695552165E-5	0.11546206426989142	6.370406651484764E-4
60-61	0.0013404829631463054	3.652089806714392E-4	8.300204106169073E-6	7.470183695552165E-5	0.11903115203554412	6.453408692546454E-4
62-63	0.0013985843918894888	3.8180938888377733E-4	8.300204106169073E-6	7.470183695552165E-5	0.12263136556659496	6.474159202811877E-4
64-65	0.0014297101572876229	3.8180938888377733E-4	8.300204106169073E-6	7.677688798206392E-5	0.12736248190711133	6.474159202811877E-4
66-67	0.0014400854124203342	3.9633474606957323E-4	8.300204106169073E-6	7.885193900860619E-5	0.13136940543936446	6.474159202811877E-4
68-69	0.0014836614839777219	4.2123535838808044E-4	8.300204106169073E-6	8.092699003514846E-5	0.13434710366245262	6.619412774669835E-4
70-71	0.0015583633209332434	4.585862768658413E-4	8.300204106169073E-6	8.715214311477526E-5	0.13729575117116916	6.681664305466103E-4
72-73	0.0015957142394110043	4.6066132789238356E-4	8.300204106169073E-6	9.13022451678598E-5	0.14030872526170857	6.868418897854908E-4
74-75	0.0016268400048091382	4.6066132789238356E-4	8.300204106169073E-6	9.545234722094433E-5	0.14337357562791148	6.930670428651176E-4
76-77	0.0016724911273930682	4.7518668507817946E-4	8.300204106169073E-6	1.0582760235365568E-4	0.14593833869671774	6.930670428651176E-4
78-79	0.0017264424540831672	4.8141183815780624E-4	8.300204106169073E-6	1.4732862288450104E-4	0.14835577314263948	6.972171449182021E-4
80-81	0.0017679434746140125	4.917870932905175E-4	1.2450306159253608E-5	1.494036739110433E-4	0.15131064580443565	7.055173490243712E-4
82-83	0.0018115195461714001	4.980122463701444E-4	1.2450306159253608E-5	1.494036739110433E-4	0.15428419392547071	7.055173490243712E-4
84-85	0.0018820712810738373	5.021623484232289E-4	1.2450306159253608E-5	1.494036739110433E-4	0.1567576547491091	7.055173490243712E-4
86-87	0.0019858238324009505	5.125376035559402E-4	1.2450306159253608E-5	1.494036739110433E-4	0.15898833460264206	7.055173490243712E-4
88-89	0.002021099699852169	5.146126545824825E-4	1.2450306159253608E-5	1.494036739110433E-4	0.16115261282332563	7.075924000509135E-4
90-91	0.002041850210117592	5.249879097151938E-4	1.2450306159253608E-5	1.494036739110433E-4	0.16399543272968853	7.096674510774557E-4
92-93	0.002089576383728064	5.291380117682784E-4	1.2450306159253608E-5	1.494036739110433E-4	0.1666556481457157	7.138175531305402E-4
94-95	0.002158053067603959	5.312130627948207E-4	1.2450306159253608E-5	1.494036739110433E-4	0.16967069728728165	7.138175531305402E-4
96-97	0.002268030772010699	5.395132669009897E-4	1.2450306159253608E-5	1.494036739110433E-4	0.172044555661646	7.138175531305402E-4
98-99	0.002313681894594629	5.478134710071587E-4	1.2450306159253608E-5	1.5147872493758558E-4	0.1740822557697105	7.158926041570825E-4
100-101	0.00235103281307239	5.561136751133279E-4	1.2450306159253608E-5	1.5355377596412784E-4	0.17635236159274775	7.221177572367093E-4
102-103	0.002367633221284728	5.561136751133279E-4	1.2450306159253608E-5	1.5355377596412784E-4	0.1782199075166358	7.221177572367093E-4
104-105	0.002398758986682862	5.581887261398701E-4	1.2450306159253608E-5	1.5355377596412784E-4	0.17992559946045353	7.262678592897939E-4
106-107	0.0024713857726118412	5.664889302460392E-4	1.2450306159253608E-5	1.5355377596412784E-4	0.18171221839430643	7.262678592897939E-4
108-109	0.002564763068806243	5.768641853787505E-4	1.2450306159253608E-5	1.6185398007029692E-4	0.18337225921554023	7.304179613428784E-4
110-111	0.0026394649057617653	5.87239440511462E-4	1.2450306159253608E-5	1.6600408212338145E-4	0.18499909922034938	7.324930123694207E-4
112-113	0.0027183168447703714	5.934645935910888E-4	1.2450306159253608E-5	1.6807913314992372E-4	0.18664461468439741	7.387181654490474E-4
114-115	0.002776418273513555	5.996897466707155E-4	1.2450306159253608E-5	1.7430428622955052E-4	0.18847688474083424	7.407932164755897E-4
116-117	0.002851120110469076	6.079899507768846E-4	1.2450306159253608E-5	1.9090469444188866E-4	0.19020747729697046	7.42868267502132E-4
118-119	0.0029258219474245983	6.183652059095959E-4	1.2450306159253608E-5	1.9712984752151547E-4	0.19187581832231043	7.42868267502132E-4
120-121	0.0030254243966986267	6.225153079626804E-4	1.2450306159253608E-5	2.075051026542268E-4	0.193423806388111	7.42868267502132E-4
122-123	0.003170677968556586	6.225153079626804E-4	1.2450306159253608E-5	2.1165520470731134E-4	0.19490954292311524	7.42868267502132E-4
124-125	0.0032682053668040725	6.26665410015765E-4	1.2450306159253608E-5	2.1165520470731134E-4	0.19630605226397818	7.42868267502132E-4
126-127	0.0033117814383614597	6.287404610423072E-4	1.2450306159253608E-5	2.137302557338536E-4	0.1977295372681862	7.42868267502132E-4
128-129	0.003355357509918848	6.308155120688495E-4	1.2450306159253608E-5	2.1788035778693815E-4	0.19914679711931454	7.42868267502132E-4
130-131	0.0034196840917416578	6.308155120688495E-4	1.2450306159253608E-5	2.282556129196495E-4	0.20036277702086833	7.42868267502132E-4
132-133	0.003504761183829891	6.370406651484764E-4	1.2450306159253608E-5	2.282556129196495E-4	0.2015891321775548	7.449433185286742E-4
134-135	0.003666615163900188	6.391157161750186E-4	1.2450306159253608E-5	2.282556129196495E-4	0.2026494832521179	7.470183695552165E-4
136-137	0.0038118687357581466	6.619412774669835E-4	1.2450306159253608E-5	2.282556129196495E-4	0.2037637856533711	7.490934205817588E-4
138-139	0.003890720674766753	6.702414815731527E-4	1.2450306159253608E-5	2.3240571497273405E-4	0.20488638825873048	7.511684716083011E-4
>>END_MODULE
