##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.4d.R.2.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24236066
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.743216493964	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.62416598469405	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.85080536585434	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.779786909311106	35.0	34.0	38.0	30.0	39.0
5	34.65308090842796	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.653768891370405	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.6564501846133	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.7872753358569	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.77646000798975	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.75561397629467	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.75567404379902	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.76015128032742	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.74377870566948	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.72806561923044	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.72889572919961	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.65835858839466	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.56069350529084	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
50-54	34.51657685698661	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
55-59	34.50331514198715	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.474596850825534	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.45526252486687	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.42537311954836	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.40051091625183	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.376495715104916	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.35390609185501	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.3274160006001	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.29356913782955	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.25310059809211	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.198700737982804	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
110-114	34.16134880966242	35.0	34.0	37.0	29.4	39.0
115-119	34.10839755098868	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
120-124	34.074073605840155	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
125-129	34.02318293736285	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	33.96494566403641	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	33.91824774697346	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	33.88393755818292	35.0	34.0	37.0	28.0	39.0
145-149	33.81329526004756	35.0	34.0	37.0	28.0	39.0
150	33.774371178886874	35.0	33.0	37.0	28.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	36.0
22	535.0
23	5096.0
24	30230.0
25	109042.0
26	254368.0
27	434264.0
28	613475.0
29	786683.0
30	975350.0
31	1211016.0
32	1537116.0
33	2006499.0
34	2767880.0
35	4363909.0
36	8257067.0
37	883494.0
38	5.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	37.26937534295614	10.129055691641156	14.600376440457039	38.00119252494567
2	22.482318984430737	11.512565407286502	37.23022543756457	28.774890170718194
3	21.56284518581232	15.99191881215253	28.321692474443328	34.12354352759182
4	26.91382291155505	23.807063681434347	22.441557020471027	26.83755638653958
5	26.486412618424293	29.75545151679607	24.627454808751242	19.13068105602839
6	19.91612903758205	36.22274926101789	25.55119565737637	18.309926044023694
7	16.140438770170707	25.16130333973235	40.38566325304153	18.312594637055415
8	18.63493299091217	24.439647548046317	31.755512379270197	25.16990708177132
9	19.591222857263574	22.70647987819133	33.24728105356477	24.455016210980325
10-14	20.311432580761096	29.076225270202716	27.361108250356033	23.251233898680155
15-19	20.484900911699214	27.714381779093795	28.021829954288368	23.778887354918627
20-24	20.652063091688824	27.85507972448787	27.747708999688026	23.74514818413528
25-29	20.665873554125426	28.05572100280885	27.611409029863886	23.66699641320184
30-34	20.611556763387977	27.79277308038171	27.655543519225994	23.940126637004315
35-39	20.686521689003552	27.757160374611047	27.69084715016323	23.865470786222176
40-44	20.707255061528578	27.87496981223364	27.58989414466056	23.82788098157722
45-49	20.829331648577323	27.65048751902235	27.533816476328532	23.986364356071793
50-54	20.95669777741347	27.625747187013687	27.615597794709274	23.801957240863565
55-59	20.956756721428444	27.687616599373875	27.536378641552883	23.81924803764479
60-64	20.881328111988626	27.6146277643026	27.51722722083678	23.986816902871993
65-69	20.983951796634294	27.557149732397907	27.5953342765039	23.8635641944639
70-74	21.108694365011367	27.501261450689956	27.571311832384776	23.818732351913898
75-79	21.112768113057832	27.404616384170737	27.573322391156907	23.909293111614524
80-84	21.15675335230517	27.415861035057336	27.54224412972926	23.88514148290824
85-89	21.123817063172996	27.425155160884195	27.60459503730261	23.846432738640203
90-94	21.1130485254486	27.330494533257255	27.54424213704593	24.01221480424821
95-99	21.21384206934093	27.23167756610757	27.674141975803977	23.88033838874752
100-104	21.26752406486263	27.32314687127284	27.513411270971833	23.895917792892693
105-109	21.232698188152497	27.1583264668956	27.616531574667047	23.99244377028485
110-114	21.29605055685965	27.141880142840407	27.676265376970843	23.885803923329092
115-119	21.34324877510738	27.180690115473666	27.62654583045504	23.849515278963914
120-124	21.28927148657627	27.11044341034668	27.613530420589427	23.986754682487625
125-129	21.340505024956645	27.037952998077657	27.673429187866166	23.948112789099536
130-134	21.400878016469804	27.19203346335816	27.553222871326316	23.853865648845716
135-139	21.382248141715518	27.058178762746692	27.64467483342016	23.91489826211763
140-144	21.45077114505887	26.988290051109786	27.760317680493447	23.800621123337898
145-149	21.464048244338642	27.422313057784237	27.506437399406998	23.60720129847013
150	21.360121627286077	26.99604542975702	27.56738124664007	24.07645169631683
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.5
9	1.5
10	3.0
11	4.0
12	8.0
13	16.0
14	32.0
15	64.0
16	138.5
17	303.0
18	586.0
19	1139.0
20	2170.5
21	3574.5
22	5406.5
23	8474.0
24	13390.0
25	20803.5
26	30684.0
27	42881.5
28	57863.0
29	81079.0
30	111495.5
31	142546.0
32	171809.5
33	204692.0
34	242832.5
35	290387.0
36	365804.5
37	470306.0
38	595354.5
39	748006.5
40	922838.0
41	1094412.0
42	1268372.0
43	1450124.5
44	1598694.0
45	1686212.0
46	1708904.5
47	1668218.0
48	1579475.5
49	1449512.5
50	1280086.0
51	1097282.0
52	913807.0
53	730234.5
54	563492.5
55	424990.5
56	318401.0
57	238778.0
58	178912.5
59	131594.5
60	92003.0
61	66233.0
62	48612.5
63	32151.5
64	21372.5
65	16750.5
66	16497.5
67	12388.0
68	5846.0
69	3012.0
70	2249.5
71	1434.5
72	698.0
73	305.0
74	123.5
75	84.0
76	50.5
77	34.0
78	17.5
79	4.5
80	1.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	3.9197780695926477E-4
2	1.7742153367629877E-4
3	1.031520544629644E-4
4	2.8882575249630034E-5
5	5.363906832074149E-5
6	1.0727813664148298E-4
7	2.1455627328296597E-4
8	1.031520544629644E-4
9	9.902597228444582E-5
10-14	1.666937200121505E-4
15-19	1.9145021308326194E-4
20-24	1.5266504060518733E-4
25-29	3.1853354418163413E-4
30-34	7.426947921333437E-4
35-39	7.270156798549731E-4
40-44	0.0010521509555222368
45-49	9.580762818520135E-4
50-54	5.454680640001558E-4
55-59	3.5814393309541246E-4
60-64	2.541666621967443E-4
65-69	3.3833873863852327E-4
70-74	3.342126564600047E-4
75-79	2.426136320968923E-4
80-84	2.9460226754622637E-4
85-89	3.837256426022276E-4
90-94	4.0600648636622793E-4
95-99	3.4163960438133813E-4
100-104	4.456168752800062E-4
105-109	2.6324404298948517E-4
110-114	2.7644750596074463E-4
115-119	2.640692594251889E-4
120-124	2.4591449783970714E-4
125-129	1.4853895842666876E-4
130-134	1.1800595030563127E-4
135-139	1.2295724891985357E-4
140-144	1.7412066793348393E-4
145-149	1.5183982416948363E-4
150	2.3518668417555887E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4236066E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	50.13316706887301
#Duplication Level	Percentage of total
1	38.88059129100416
2	10.294048749723846
3	6.151987465600482
4	4.374917754696978
5	3.457225758577194
6	2.7229006090898977
7	2.1799773631635966
8	1.8697156565142037
9	1.5874068990071524
>10	18.211971485158138
>50	4.528490894828699
>100	4.780386308637097
>500	0.5376457394991028
>1k	0.4227340244994879
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.126082178518576E-6	2.0630410892592883E-5	0.0	4.126082178518576E-6	1.0315205446296442E-4	2.475649307111146E-5
2	4.126082178518576E-6	9.077380792740868E-5	0.0	1.6504328714074305E-5	0.001588541638729652	4.538690396370434E-5
3	2.0630410892592883E-5	9.902597228444583E-5	0.0	1.6504328714074305E-5	0.002562297032860036	1.0727813664148298E-4
4	2.8882575249630034E-5	1.1553030099852014E-4	0.0	1.6504328714074305E-5	0.003944534562663759	1.1965638317703872E-4
5	3.300865742814861E-5	1.237824653555573E-4	0.0	1.6504328714074305E-5	0.005112215819184516	1.237824653555573E-4
6	4.951298614222292E-5	1.237824653555573E-4	0.0	1.6504328714074305E-5	0.006271644911348236	1.2790854753407587E-4
7	5.776515049926007E-5	1.774215336762988E-4	0.0	1.6504328714074305E-5	0.007340300195584548	1.402867940696316E-4
8	7.839556139185295E-5	1.8154761585481737E-4	0.0	1.6504328714074305E-5	0.009238297997703093	1.402867940696316E-4
9	9.489989010592725E-5	1.8154761585481737E-4	4.126082178518576E-6	1.6504328714074305E-5	0.012233833659307579	1.402867940696316E-4
10-11	1.3203462971259444E-4	1.8773673912259522E-4	4.126082178518576E-6	2.2693451981852168E-5	0.01645481572793208	1.753584925870395E-4
12-13	1.6298024605148378E-4	1.9598890347963238E-4	4.126082178518576E-6	2.8882575249630034E-5	0.02002593985343991	1.9186282130111382E-4
14-15	1.7123241040852092E-4	2.1249323219370669E-4	4.126082178518576E-6	3.094561633888932E-5	0.02402823956660293	2.1455627328296597E-4
16-17	1.8361065694407665E-4	2.2280843764000313E-4	4.126082178518576E-6	3.300865742814861E-5	0.02805116969065854	2.2487147872926242E-4
18-19	2.104301911044474E-4	2.3312364308629955E-4	4.126082178518576E-6	3.300865742814861E-5	0.03147788093991822	2.269345198185217E-4
20-21	2.908887935855596E-4	2.785105470500039E-4	4.126082178518576E-6	3.7134739606667184E-5	0.034661153340645304	2.2899756090778099E-4
22-23	3.9197780695926477E-4	2.970779168533375E-4	4.126082178518576E-6	4.332386287444505E-5	0.03820958401417128	2.4137580744333672E-4
24-25	4.5799512181556197E-4	3.0533008121037467E-4	4.126082178518576E-6	4.951298614222292E-5	0.042251081508030225	2.475649307111146E-4
26-27	5.302015599396371E-4	3.0533008121037467E-4	4.126082178518576E-6	4.951298614222292E-5	0.04621418344049731	2.620062183359296E-4
28-29	5.735254228140821E-4	3.0533008121037467E-4	4.126082178518576E-6	5.363906832074149E-5	0.05013808759226848	2.785105470500039E-4
30-31	6.23038408956305E-4	3.0533008121037467E-4	4.126082178518576E-6	6.601731485629723E-5	0.05405373957968261	3.0120399903185604E-4
32-33	6.787405183663058E-4	3.156452866566711E-4	4.126082178518576E-6	7.633252030259365E-5	0.05782910477302711	3.672213138881533E-4
34-35	7.241274223300101E-4	3.1770832774593037E-4	4.126082178518576E-6	9.902597228444583E-5	0.06105363799553938	3.9610388913778334E-4
36-37	7.385687099548252E-4	3.1770832774593037E-4	4.126082178518576E-6	1.0315205446296442E-4	0.06408630839675053	4.022930124055612E-4
38-39	7.571360797581587E-4	3.259604921029675E-4	4.126082178518576E-6	1.0727813664148298E-4	0.06789468224752318	4.043560534948205E-4
40-41	7.922077782755667E-4	3.3008657428148613E-4	4.126082178518576E-6	1.0727813664148298E-4	0.07096655042943026	4.105451767625984E-4
42-43	8.045860248111224E-4	3.342126564600047E-4	4.126082178518576E-6	1.1346725990926085E-4	0.07399922083064141	4.1673430003037623E-4
44-45	8.23153394614456E-4	3.3833873863852327E-4	4.126082178518576E-6	1.1965638317703872E-4	0.07783854029775295	4.311755876551912E-4
46-47	8.747294218459383E-4	3.445278619063011E-4	4.126082178518576E-6	1.237824653555573E-4	0.08133333190295818	4.373647109229691E-4
48-49	9.118641614526054E-4	3.5896914953111617E-4	4.126082178518576E-6	1.2790854753407587E-4	0.08478273660419972	4.538690396370434E-4
50-51	9.201163258096425E-4	3.79599560423709E-4	4.126082178518576E-6	1.2790854753407587E-4	0.08837655418168938	4.6212120399408054E-4
52-53	0.0010047010104692734	3.79599560423709E-4	4.126082178518576E-6	1.2790854753407587E-4	0.0918465892938235	4.662472861725991E-4
54-55	0.0010748444075040892	3.79599560423709E-4	4.126082178518576E-6	1.2790854753407587E-4	0.09474309898314355	4.662472861725991E-4
56-57	0.0011119791471107562	3.899147658700055E-4	4.126082178518576E-6	1.2790854753407587E-4	0.09816774719131396	4.8275161488667344E-4
58-59	0.0011532399688959421	4.105451767625984E-4	6.189123267777865E-6	1.2997158862333515E-4	0.10194517542574773	4.910037792437106E-4
60-61	0.001231635530287795	4.311755876551912E-4	8.252164357037152E-6	1.3203462971259444E-4	0.10526667157945518	5.033820257792663E-4
62-63	0.001272896352072981	4.4767991636926555E-4	8.252164357037152E-6	1.3616071189111303E-4	0.10822094641927449	5.033820257792663E-4
64-65	0.001295589804054833	4.5799512181556197E-4	8.252164357037152E-6	1.4647591733740945E-4	0.11234702859779305	5.033820257792663E-4
66-67	0.0013079680505903887	4.930668203329699E-4	8.252164357037152E-6	1.4853895842666874E-4	0.11586245061389089	5.033820257792663E-4
68-69	0.0013492288723755746	5.178233134040813E-4	8.252164357037152E-6	1.4853895842666874E-4	0.11847219759180388	5.15760272314822E-4
70-71	0.001425561392678168	5.322646010288963E-4	8.252164357037152E-6	1.567911227837059E-4	0.12109844889843097	5.198863544933406E-4
72-73	0.0014730113377311319	5.363906832074149E-4	8.252164357037152E-6	1.567911227837059E-4	0.12377833927337878	5.260754777611184E-4
74-75	0.0014977678308022433	5.446428475644521E-4	8.252164357037152E-6	1.5885416387296519E-4	0.12665215551071696	5.446428475644521E-4
76-77	0.0015266504060518732	5.487689297429707E-4	8.252164357037152E-6	1.6298024605148378E-4	0.12876264654502922	5.446428475644521E-4
78-79	0.00159473076199743	5.487689297429707E-4	8.252164357037152E-6	1.7123241040852092E-4	0.13091439840112667	5.5083197083223E-4
80-81	0.0016380546248718748	5.487689297429707E-4	8.252164357037152E-6	1.774215336762988E-4	0.13324357179090038	5.570210941000078E-4
82-83	0.0016566219946752086	5.528950119214893E-4	8.252164357037152E-6	1.774215336762988E-4	0.13546959312621115	5.570210941000078E-4
84-85	0.0017350175560670615	5.528950119214893E-4	8.252164357037152E-6	1.774215336762988E-4	0.137545012462006	5.570210941000078E-4
86-87	0.0018711782679581746	5.528950119214893E-4	8.252164357037152E-6	1.774215336762988E-4	0.13942856897649974	5.570210941000078E-4
88-89	0.001918628213011138	5.549580530107485E-4	8.252164357037152E-6	1.7948457476555808E-4	0.14139258409347458	5.611471762785264E-4
90-91	0.0019310064595466938	5.632102173677856E-4	8.252164357037152E-6	1.8567369803333594E-4	0.14384553994860388	5.65273258457045E-4
92-93	0.0019475107882607682	5.714623817248228E-4	8.252164357037152E-6	1.8773673912259522E-4	0.14612520035223536	5.776515049926007E-4
94-95	0.0020238433085633615	5.776515049926007E-4	8.252164357037152E-6	1.897997802118545E-4	0.1486421104811317	5.797145460818599E-4
96-97	0.0021434996917404003	5.859036693496378E-4	8.252164357037152E-6	1.897997802118545E-4	0.15082068187138953	5.817775871711192E-4
98-99	0.0022074539655074386	5.94155833706675E-4	8.252164357037152E-6	1.897997802118545E-4	0.15252475381111769	5.817775871711192E-4
100-101	0.0022734712803637357	6.024079980637122E-4	8.252164357037152E-6	1.897997802118545E-4	0.15446194939393215	5.817775871711192E-4
102-103	0.0022961647323455877	6.106601624207493E-4	8.252164357037152E-6	1.939258623903731E-4	0.15612888659405366	5.817775871711192E-4
104-105	0.0023436146773985513	6.147862445992679E-4	8.252164357037152E-6	1.9805194456889167E-4	0.15775662601347926	5.817775871711192E-4
106-107	0.002440577608593738	6.147862445992679E-4	8.252164357037152E-6	1.9805194456889167E-4	0.15934310461111964	5.859036693496378E-4
108-109	0.002527225334342628	6.209753678670458E-4	8.252164357037152E-6	2.1249323219370669E-4	0.1609068897567782	5.859036693496378E-4
110-111	0.0026014948135559624	6.395427376703793E-4	8.252164357037152E-6	2.1455627328296597E-4	0.16245004449154413	5.859036693496378E-4
112-113	0.0026757642927692964	6.395427376703793E-4	8.252164357037152E-6	2.1868235546148454E-4	0.1640633426233449	5.982819158851936E-4
114-115	0.0027644750596074463	6.436688198488979E-4	8.252164357037152E-6	2.3106060199704027E-4	0.16580867538485827	5.982819158851936E-4
116-117	0.0028614379908026327	6.539840252951944E-4	8.252164357037152E-6	2.496279718003739E-4	0.1674941799547831	5.982819158851936E-4
118-119	0.0029398335521944857	6.849296416340837E-4	8.252164357037152E-6	2.5581709506815174E-4	0.16897956953904977	6.024079980637122E-4
120-121	0.0030306073601218944	7.034970114374172E-4	8.252164357037152E-6	2.599431772466703E-4	0.17040719397281723	6.024079980637122E-4
122-123	0.003226596263601527	7.096861347051951E-4	8.252164357037152E-6	2.620062183359296E-4	0.1717956206258887	6.024079980637122E-4
124-125	0.0033338744002430094	7.138122168837138E-4	8.252164357037152E-6	2.6819534160370744E-4	0.17323768634728096	6.024079980637122E-4
126-127	0.0033565678522248623	7.261904634192695E-4	8.252164357037152E-6	2.6819534160370744E-4	0.1745931043429243	6.065340802422308E-4
128-129	0.0033978286740100477	7.261904634192695E-4	8.252164357037152E-6	2.6819534160370744E-4	0.17595883754401395	6.189123267777865E-4
130-131	0.0034720981532233818	7.261904634192695E-4	8.252164357037152E-6	2.7232142378222606E-4	0.1772791838411399	6.251014500455643E-4
132-133	0.003544304591347457	7.323795866870473E-4	8.252164357037152E-6	2.8676271140704105E-4	0.17849844112489213	6.271644911348236E-4
134-135	0.003678402262149311	7.344426277763066E-4	8.252164357037152E-6	2.929518346748189E-4	0.17962692460071694	6.271644911348236E-4
136-137	0.0038908954943430176	7.530099975796402E-4	8.252164357037152E-6	2.929518346748189E-4	0.1807244624602029	6.374796965811201E-4
138-139	0.003991984507716723	7.736404084722332E-4	8.252164357037152E-6	2.929518346748189E-4	0.18178486558008217	6.395427376703793E-4
>>END_MODULE
