##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.4d.S.1.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24211874
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.802562081728986	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.68850692845998	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.87982371789974	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.82802285358002	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
5	34.69366332403679	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.68352924684805	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.70901612159389	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.84018081376105	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.82427774900861	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.79763673807322	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.80088600328913	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.803263233568785	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.80060614886729	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.77959058435543	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.77617400454009	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.70469757111738	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.60732519919772	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
50-54	34.568216636184374	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
55-59	34.56268209557014	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.52873979932326	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.513736342754804	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.48429690324673	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.46646616449433	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.436558566263805	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.41941823255812	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.39142744588874	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.3576983921195	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.319554479756505	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.26544015552038	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.234329469912154	35.0	34.0	37.0	29.4	39.0
115-119	34.18506632737309	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
120-124	34.14646754728692	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
125-129	34.093433122937945	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.04515002845299	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	33.9925925271212	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	33.9628099419318	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	33.89522043605546	35.0	34.0	37.0	28.0	39.0
150	33.86762486869046	35.0	34.0	37.0	28.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	2.0
21	29.0
22	487.0
23	5017.0
24	29078.0
25	105567.0
26	248858.0
27	428328.0
28	607127.0
29	777729.0
30	964182.0
31	1198394.0
32	1516584.0
33	1968851.0
34	2676525.0
35	4089822.0
36	8226544.0
37	1368748.0
38	2.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.730457621641555	10.845062604205422	14.452214028602262	37.972265745550764
2	23.292514046537317	12.449975402529317	35.87029056322405	28.387219987709315
3	21.663461625831307	16.763321777013417	27.921262554797526	33.65195404235775
4	27.072694951978082	24.25002457473321	21.755742846687532	26.92153762660118
5	27.13577000367382	29.948861849345356	23.823786395637015	19.091581751343814
6	20.10213674673571	36.34844733492941	25.014490835769948	18.53492508256493
7	16.92007101817289	24.308665461938837	39.762329416556724	19.008934103331548
8	19.291422943015338	24.08664964359598	30.94435418560368	25.67757322778501
9	20.25625139162234	22.644259841534613	32.22570899066816	24.87377977617488
10-14	21.08441643051904	28.617122878056033	26.620428005950615	23.67803268547432
15-19	21.347694275912524	27.483174546982664	27.274234276462174	23.894896900642635
20-24	21.270044785810857	27.56606048148334	27.187775828601275	23.97611890410453
25-29	21.2302481166161	27.752554990517766	26.884555643224495	24.132641249641644
30-34	21.20809009946506	27.545110711370118	27.094582657089404	24.152216532075414
35-39	21.507496650848086	27.29658700940016	26.99452087775358	24.201395461998175
40-44	21.652121405737233	27.39425592013871	26.83241082726054	24.121211846863517
45-49	21.892740632245687	27.318562230072107	26.724819164749903	24.063877972932303
50-54	21.870131673269842	27.534972858571884	26.65878029728447	23.93611517087381
55-59	21.798601967774868	27.501875141423966	26.723858621213452	23.975664269587714
60-64	21.982488483267268	27.325876455985448	26.544467868637422	24.147167192109862
65-69	21.844235343034985	27.43098891875533	26.729575349744444	23.995200388465243
70-74	22.184488253636765	27.21359573383261	26.648075223141767	23.953840789388863
75-79	22.048462807645393	27.072788958641823	26.661191375909038	24.21755685780374
80-84	22.29121302241325	27.084695703065385	26.66734622525922	23.956745049262146
85-89	22.17581679897652	27.087839490875215	26.660980288047746	24.07536342210052
90-94	22.179072888697675	26.849869269428222	26.657349769871537	24.31370807200257
95-99	22.378985909697157	26.86970110657281	26.83431257759749	23.91700040613254
100-104	22.34226037935724	26.71401450374277	26.87704929820851	24.066675818691476
105-109	22.411514918636012	26.667225787870436	26.779005146935642	24.142254146557914
110-114	22.365241102329588	26.726945501607375	26.770596091205885	24.137217304857153
115-119	22.48800484451059	26.868475897318266	26.69988548814442	23.94363377002672
120-124	22.39724328973696	26.741258732709483	26.69565868241338	24.165839295140174
125-129	22.779637074609287	26.688672262655743	26.61629610707759	23.915394555657382
130-134	22.523674062705286	26.963025313859934	26.49787015317096	24.01543047026382
135-139	22.614306490428895	26.80030874155929	26.533412005599246	24.051972762412564
140-144	22.613147748239562	26.61768361363323	26.781287937033888	23.98788070109332
145-149	22.45530810580233	27.08133449976043	26.681339935120143	23.7820174593171
150	22.13031719905859	26.6624981811578	26.84953897125748	24.357645648526127
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.5
6	0.5
7	0.0
8	1.0
9	1.0
10	1.5
11	4.0
12	5.5
13	8.0
14	20.0
15	47.5
16	92.0
17	218.0
18	521.0
19	913.5
20	1506.5
21	2470.0
22	3970.5
23	6418.5
24	10399.0
25	16212.0
26	23288.0
27	33714.0
28	51412.5
29	75933.5
30	104108.5
31	131928.0
32	158903.0
33	191570.0
34	227462.5
35	273475.5
36	341140.0
37	414103.0
38	488535.5
39	596278.5
40	742361.0
41	902929.5
42	1072813.5
43	1241787.0
44	1388724.5
45	1501131.0
46	1575020.0
47	1590997.0
48	1542661.0
49	1483784.0
50	1391176.0
51	1238831.0
52	1052422.0
53	881779.0
54	734221.0
55	604252.5
56	507608.5
57	415770.0
58	342743.0
59	279840.5
60	210375.5
61	143836.0
62	86075.0
63	50408.0
64	32207.5
65	19209.5
66	12357.5
67	5988.5
68	2351.5
69	1134.0
70	925.5
71	699.5
72	368.5
73	156.0
74	94.0
75	73.0
76	42.0
77	31.0
78	18.5
79	2.5
80	2.5
81	1.5
82	0.5
83	0.0
84	0.5
85	0.5
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	3.386767996562348E-4
2	1.4455717058497826E-4
3	5.7822868233991304E-5
4	5.7822868233991304E-5
5	3.7171843864708695E-5
6	8.260409747713044E-5
7	1.7759880957583045E-4
8	1.0738532672026956E-4
9	1.0325512184641303E-4
10-14	1.7512068665151653E-4
15-19	3.064612016401539E-4
20-24	2.2220502221348087E-4
25-29	3.370247177066922E-4
30-34	8.111722372254208E-4
35-39	9.177315229709191E-4
40-44	0.0010482459969847853
45-49	9.202096458952331E-4
50-54	5.840109691633121E-4
55-59	4.138465283604235E-4
60-64	2.4450812853230605E-4
65-69	3.353726357571496E-4
70-74	3.7502260254617217E-4
75-79	2.891143411699565E-4
80-84	3.2628618503466523E-4
85-89	3.9897779081454E-4
90-94	3.832830122938852E-4
95-99	3.0398307871583996E-4
100-104	4.534964951494461E-4
105-109	2.8663621824564264E-4
110-114	2.4368208755753477E-4
115-119	2.3872584170890696E-4
120-124	2.420300056079922E-4
125-129	1.346446788877226E-4
130-134	1.6107799008040436E-4
135-139	1.5694778520654784E-4
140-144	1.8338109639922957E-4
145-149	1.8585921932354348E-4
150	1.7759880957583045E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4211874E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.702134228203946
#Duplication Level	Percentage of total
1	34.22183661755327
2	8.820332613724048
3	5.161222426826398
4	3.5230080747744696
5	2.6241798489844492
6	2.1573675503813488
7	1.7251398898315666
8	1.4951854299633442
9	1.3381174209887488
>10	16.256320590258895
>50	5.331111445321849
>100	10.291430705681643
>500	3.3264573911729647
>1k	3.294667159824679
>5k	0.337862126593326
>10k+	0.09576070811906648
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	8.260409747713043E-6	0.0	0.0	2.808539314222435E-4	3.304163899085217E-5
2	1.2390614621569566E-5	5.7822868233991304E-5	0.0	1.6520819495426086E-5	0.002453341695070774	4.543225361242174E-5
3	3.304163899085217E-5	6.608327798170434E-5	0.0	1.6520819495426086E-5	0.004803428268295135	6.608327798170434E-5
4	1.1151553159412609E-4	8.260409747713044E-5	0.0	2.065102436928261E-5	0.007050259719673083	7.021348285556087E-5
5	1.321665559634087E-4	8.260409747713044E-5	0.0	2.065102436928261E-5	0.008305842001325465	7.021348285556087E-5
6	1.9411962907125651E-4	8.260409747713044E-5	0.0	2.065102436928261E-5	0.010218126857921036	7.021348285556087E-5
7	2.3955188268367828E-4	1.321665559634087E-4	0.0	2.065102436928261E-5	0.011820646348977365	7.021348285556087E-5
8	3.758486435209435E-4	1.3629676083726523E-4	0.0	2.065102436928261E-5	0.0159591116325816	7.021348285556087E-5
9	4.543225361242174E-4	1.3629676083726523E-4	0.0	2.065102436928261E-5	0.018697437463948474	7.434368772941739E-5
10-11	5.2247091654285E-4	1.4455717058497826E-4	0.0	2.4781229243139132E-5	0.03370040666823229	9.705981453562826E-5
12-13	5.947495018353391E-4	1.4662227302190652E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.043749195126325205	1.218410437787674E-4
14-15	6.773535993124696E-4	1.5694778520654784E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.050962597938515625	1.3010145352648043E-4
16-17	7.496321846049587E-4	1.6107799008040436E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.05554919045093329	1.321665559634087E-4
18-19	9.148403795592197E-4	1.734686047019739E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.059189966047237814	1.321665559634087E-4
20-21	0.0012865588182063065	2.0238003881896957E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.062054263127257314	1.383618632741935E-4
22-23	0.0016892537934073174	2.0238003881896957E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.06488345346584903	1.4868737545883478E-4
24-25	0.001860657295672363	2.065102436928261E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.06769612298494532	1.528175803326913E-4
26-27	0.001984563441888059	2.065102436928261E-4	0.0	3.923694630163696E-5	0.07011642304102525	1.693383998281174E-4
28-29	0.002158032046590033	2.106404485666826E-4	0.0	4.3367151175493476E-5	0.07286920458945062	1.734686047019739E-4
30-31	0.0025586619193541152	2.1477065344053912E-4	0.0	4.7497356049350006E-5	0.07601848580576621	1.9618473150818477E-4
32-33	0.0027569117532992285	2.1477065344053912E-4	0.0	5.162756092320652E-5	0.0790789676172939	2.3542167780982176E-4
34-35	0.002891143411699565	2.1477065344053912E-4	0.0	6.608327798170434E-5	0.08182348875597156	2.436820875575348E-4
36-37	0.0029345105628750586	2.168357558774674E-4	0.0	7.640879016634566E-5	0.08415498940726356	2.436820875575348E-4
38-39	0.0029489662799335563	2.271612680621087E-4	0.0	9.086450722484348E-5	0.08675288827291931	2.478122924313913E-4
40-41	0.0029943985335459783	2.271612680621087E-4	0.0	9.086450722484348E-5	0.08934872203613814	2.519424973052478E-4
42-43	0.0030047240457306197	2.271612680621087E-4	0.0	9.086450722484348E-5	0.09188260272624911	2.519424973052478E-4
44-45	0.003023309967662974	2.3335657537289347E-4	0.0	9.086450722484348E-5	0.09449289220652643	2.5607270217910434E-4
46-47	0.0030563516066538263	2.3542167780982173E-4	0.0	9.086450722484348E-5	0.09922610699196602	2.5607270217910434E-4
48-49	0.0030893932456446784	2.3748678024675E-4	0.0	9.705981453562827E-5	0.1020016046671976	2.581378046160326E-4
50-51	0.0031203697821986023	2.45747189994463E-4	0.0	9.912491697255653E-5	0.10490926889839258	2.684633168006739E-4
52-53	0.003163736933374096	2.478122924313913E-4	0.0	1.053202242833413E-4	0.10751749327623297	2.684633168006739E-4
54-55	0.003198843674801876	2.478122924313913E-4	0.0	1.0945042915719782E-4	0.10927489545005892	2.7259352167453046E-4
56-57	0.003285577977152863	2.519424973052478E-4	0.0	1.1151553159412609E-4	0.11135032339917182	2.746586241114587E-4
58-59	0.0033537263575714954	2.705284192376022E-4	0.0	1.1358063403105435E-4	0.11346292319214944	2.76723726548387E-4
60-61	0.0034631767867286936	2.849841362961E-4	0.0	1.1564573646798261E-4	0.11551150480958228	2.849841362961E-4
62-63	0.0035189345525257565	2.849841362961E-4	0.0	1.1564573646798261E-4	0.11802886468019783	2.849841362961E-4
64-65	0.003535455372021183	2.891143411699565E-4	0.0	1.1771083890491088E-4	0.12080229725299249	2.849841362961E-4
66-67	0.003554041293953537	3.0357005822845436E-4	0.0	1.1977594134183914E-4	0.12326802956268482	2.870492387330283E-4
68-69	0.003568497011012035	3.159606728500239E-4	0.0	1.2390614621569565E-4	0.1251947701363389	2.9737475091766956E-4
70-71	0.0035912131378182457	3.3041638990852175E-4	0.0	1.321665559634087E-4	0.12729704441713185	3.0357005822845436E-4
72-73	0.0036366453914306674	3.428070045300913E-4	0.0	1.3629676083726523E-4	0.12905857679583166	3.056351606653826E-4
74-75	0.0036490360060522373	3.469372094039478E-4	0.0	1.3629676083726523E-4	0.130747830589239	3.056351606653826E-4
76-77	0.003663491723110735	3.531325167147326E-4	0.0	1.383618632741935E-4	0.13213351432441783	3.056351606653826E-4
78-79	0.003688272952353874	3.5726272158858913E-4	0.0	1.6107799008040436E-4	0.13362451828388006	3.056351606653826E-4
80-81	0.003725444796218583	3.593278240255174E-4	0.0	1.6107799008040436E-4	0.13514443367745926	3.138955704130957E-4
82-83	0.003744030718150937	3.593278240255174E-4	0.0	1.6107799008040436E-4	0.13686053380254665	3.138955704130957E-4
84-85	0.0037873978693264304	3.7171843864708696E-4	0.0	1.6314309251733261E-4	0.1386571729226742	3.180257752869522E-4
86-87	0.0038286999180649956	3.758486435209435E-4	0.0	1.6520819495426087E-4	0.1402328460820505	3.180257752869522E-4
88-89	0.0038617415570558478	3.758486435209435E-4	0.0	1.693383998281174E-4	0.14176515209025126	3.180257752869522E-4
90-91	0.0038989134009205567	3.8204395083172823E-4	0.0	1.693383998281174E-4	0.14387568678079193	3.180257752869522E-4
92-93	0.003929889937474481	3.861741557055848E-4	0.0	1.693383998281174E-4	0.14588296634948622	3.180257752869522E-4
94-95	0.003975322191086902	3.9030436057944126E-4	0.0	1.693383998281174E-4	0.14740081664062848	3.2009087772388043E-4
96-97	0.004043470571505534	3.9236946301636955E-4	0.0	1.693383998281174E-4	0.1488050862977397	3.2628618503466523E-4
98-99	0.004130204873856522	4.0476007763793915E-4	0.0	1.734686047019739E-4	0.14994295774048716	3.2628618503466523E-4
100-101	0.0042623714298199306	4.0889028251179567E-4	0.0	1.8379411688661522E-4	0.15120473532945033	3.2835128747159346E-4
102-103	0.004297478171247711	4.0889028251179567E-4	0.0	1.9205452663432826E-4	0.15231576044051776	3.3041638990852175E-4
104-105	0.004336715117549348	4.0889028251179567E-4	0.0	1.9411962907125651E-4	0.15343298085889592	3.3041638990852175E-4
106-107	0.004371821858977129	4.1921579469643693E-4	0.0	1.9824983394511306E-4	0.15453161535534177	3.3041638990852175E-4
108-109	0.004411058805278765	4.212808971333652E-4	0.0	2.168357558774674E-4	0.15559720821279677	3.3041638990852175E-4
110-111	0.004470946775949685	4.212808971333652E-4	0.0	2.1890085831439567E-4	0.15671649373361185	3.3248149234545003E-4
112-113	0.004578332102669954	4.212808971333652E-4	0.0	2.1890085831439567E-4	0.15784816986904854	3.3454659478237826E-4
114-115	0.004634089868467018	4.212808971333652E-4	0.0	2.2096596075132393E-4	0.1589901715166699	3.3454659478237826E-4
116-117	0.004689847634264081	4.2747620444414996E-4	0.0	2.271612680621087E-4	0.15988642597429675	3.3454659478237826E-4
118-119	0.0047724517317412115	4.4193192150264785E-4	0.0	2.3335657537289347E-4	0.16077648512461284	3.3454659478237826E-4
120-121	0.004886032365772265	4.501923312503609E-4	0.0	2.3955188268367828E-4	0.1617388228602214	3.3454659478237826E-4
122-123	0.005055370765600383	4.501923312503609E-4	0.0	2.45747189994463E-4	0.1626454028300329	3.3454659478237826E-4
124-125	0.005162756092320652	4.5225743368728917E-4	0.0	2.478122924313913E-4	0.16348176931698885	3.3454659478237826E-4
126-127	0.005195797731311505	4.543225361242174E-4	0.0	2.478122924313913E-4	0.1643532425453726	3.3454659478237826E-4
128-129	0.005245360189797783	4.543225361242174E-4	0.0	2.478122924313913E-4	0.16522678087619322	3.3454659478237826E-4
130-131	0.0053692663360134785	4.543225361242174E-4	0.0	2.5607270217910434E-4	0.16599293388029362	3.3454659478237826E-4
132-133	0.005445675126179824	4.5638763856114563E-4	4.1302048738565215E-6	2.6020290705296086E-4	0.1667157197332185	3.3454659478237826E-4
134-135	0.005548930248026237	4.584527409980739E-4	4.1302048738565215E-6	2.6020290705296086E-4	0.16755828152748523	3.4074190209316306E-4
136-137	0.005685227008863502	4.6464804830885866E-4	4.1302048738565215E-6	2.6020290705296086E-4	0.16839877821931504	3.490023118408761E-4
138-139	0.005757505594155991	4.729084580565717E-4	4.1302048738565215E-6	2.6020290705296086E-4	0.16928883736963113	3.531325167147326E-4
>>END_MODULE
