##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.4d.S.2.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	22996710
Total Bases	3.4 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.87513566070973	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.74981490830645	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.956433246320884	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.90729743515485	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.77239596446622	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.75680756073369	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.77518475468882	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.920628168116224	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.89692973473162	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.87633920678219	35.0	34.0	37.4	31.2	39.0
15-19	34.8790820860897	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.88344023123308	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.87855575862808	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.86167930108263	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.85565326518446	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.788743572450144	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.69255726580019	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.653842319183916	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.6504281003674	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.61857782265376	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
65-69	34.602109371297026	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
70-74	34.574883172419014	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.556663357497655	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.5291072331651	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.51349308661979	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.48402605416165	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.452415845570954	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.41362556643972	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.359654811492604	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.32972604342099	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.28403174193178	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.24471752698538	35.0	34.0	37.0	29.4	39.0
125-129	34.19173832256875	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.14431456499646	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.093585438960616	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.062440427348086	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	33.99581894105722	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	33.97023891678418	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	27.0
22	418.0
23	4129.0
24	24253.0
25	89440.0
26	214869.0
27	380198.0
28	549318.0
29	707307.0
30	885509.0
31	1104200.0
32	1403584.0
33	1834614.0
34	2506462.0
35	3803906.0
36	7959795.0
37	1528670.0
38	11.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	37.168391571876676	10.358223854229747	14.470257506470732	38.003127067422845
2	23.211882416019364	11.959183655720588	35.99386345936173	28.835070468898323
3	21.867766894473345	16.393505639854634	27.730170930671243	34.00855653500077
4	27.365503425904436	23.98695360695432	21.60828198792514	27.039260979216106
5	27.27167929623291	29.776925810091264	23.65184237963892	19.299552514036904
6	20.304358676423032	36.14320813136399	24.81166523015515	18.740767962057834
7	17.07374228850274	24.32371836112439	39.48597946946143	19.11655988091145
8	19.480205149541536	23.87052431202267	30.737895822215787	25.911374716220003
9	20.24959508297869	22.42452141041012	32.241178914162724	25.08470459244847
10-14	21.21279464300833	28.36910261635205	26.573867774463082	23.844234966176536
15-19	21.44849732050426	27.319207026431563	27.199451272891146	24.032844380173028
20-24	21.37867729343783	27.390402768972272	27.126412284300983	24.10450765328892
25-29	21.34816750170177	27.579340945402542	26.795911645867537	24.276579907028147
30-34	21.309083429063072	27.35653373928708	27.050354255037135	24.284028576612712
35-39	21.641918858012048	27.079509033250133	26.944610090613107	24.33396201812471
40-44	21.822674611379814	27.19586979280475	26.726488138917244	24.254967456898193
45-49	22.081444989510608	27.185431756316802	26.615652237680855	24.117471016491738
50-54	22.06422393953184	27.423880914388736	26.515549604908383	23.996345541171042
55-59	21.95966973140329	27.401275899715905	26.595873488031074	24.043180880849725
60-64	22.152687555702677	27.22809010084199	26.396683816236404	24.22253852721893
65-69	21.966885280655116	27.333893368828843	26.617900870864702	24.08132047965134
70-74	22.362497164367277	27.114517538551475	26.507191192421264	24.01579410465999
75-79	22.19740846246932	26.975734995551136	26.515923663209822	24.310932878769723
80-84	22.448999789995412	27.014440535284095	26.54184802975092	23.99471164496957
85-89	22.33370204827254	27.011113177501088	26.52313553180529	24.13204924242108
90-94	22.2987789540169	26.794486798625318	26.514852755933198	24.391881491424584
95-99	22.515599716139356	26.790292688195045	26.73178934985466	23.96231824581094
100-104	22.47616901050186	26.637212529818306	26.75390102694783	24.132717432732
105-109	22.535862924154664	26.62541305804636	26.657335972999334	24.181388044799647
110-114	22.485128118167946	26.67862017448574	26.67476657015726	24.161485137189054
115-119	22.57149850455693	26.870691864038637	26.5725799136386	23.985229717765833
120-124	22.483943845631043	26.710164510464146	26.596862863348775	24.20902878055604
125-129	22.912762316680595	26.63750970303147	26.512060284878526	23.937667695409413
130-134	22.617197517073905	26.940830728507287	26.399911618520544	24.042060135898264
135-139	22.70734379326578	26.74849086619442	26.457903559126823	24.086261781412983
140-144	22.666238604765194	26.58640984344084	26.755604745277513	23.991746806516456
145-149	22.46611366754504	27.234111943468665	26.58538820048702	23.71438618849928
150	22.12526945771365	26.71692065075041	26.751021268270758	24.40678862326519
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.5
10	1.0
11	1.5
12	4.0
13	11.5
14	22.5
15	44.0
16	86.5
17	194.0
18	474.0
19	885.5
20	1421.5
21	2228.5
22	3666.0
23	5952.0
24	9487.0
25	14566.5
26	20826.0
27	30096.5
28	46369.5
29	68529.0
30	93676.5
31	118714.0
32	143569.0
33	173300.0
34	205855.0
35	247880.5
36	310065.0
37	378365.0
38	445457.5
39	541384.5
40	674375.0
41	824590.5
42	982993.5
43	1140012.5
44	1280894.0
45	1390649.5
46	1470353.0
47	1499338.5
48	1462678.5
49	1420671.5
50	1346324.5
51	1206504.5
52	1031445.5
53	873918.5
54	735925.5
55	611150.5
56	518594.0
57	424335.5
58	350070.5
59	289230.0
60	220455.5
61	154450.0
62	93479.0
63	53596.0
64	33500.0
65	19739.0
66	12508.5
67	5902.0
68	2335.0
69	1180.0
70	955.0
71	689.5
72	339.5
73	146.5
74	90.5
75	66.5
76	41.5
77	26.0
78	12.5
79	2.5
80	2.5
81	2.0
82	0.5
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	3.65269640744263E-4
2	1.7393792416393474E-4
3	7.827206587377064E-5
4	3.913603293688532E-5
5	4.783292914508206E-5
6	1.1740809881065597E-4
7	1.7828637226803313E-4
8	9.566585829016412E-5
9	1.0001430639426248E-4
10-14	1.8176513075131181E-4
15-19	3.0265198804524645E-4
20-24	2.0785581937590204E-4
25-29	3.130882634950826E-4
30-34	8.636017934739359E-4
35-39	0.0010271034421880346
40-44	0.001239307709668035
45-49	0.0010253640629463952
50-54	6.305249750942635E-4
55-59	4.6267487827606645E-4
60-64	2.574281277626235E-4
65-69	3.148276427367219E-4
70-74	3.4265771060295144E-4
75-79	2.6351595510836113E-4
80-84	3.017822984244268E-4
85-89	3.6005150301934494E-4
90-94	3.574424341568859E-4
95-99	3.2004578046163995E-4
100-104	4.2962667268491884E-4
105-109	2.748219201790169E-4
110-114	2.496009211752464E-4
115-119	2.05246750513443E-4
120-124	1.9654985430524627E-4
125-129	1.3480189122704942E-4
130-134	1.6002289023081998E-4
135-139	1.8002575150967247E-4
140-144	1.565441317475413E-4
145-149	2.1307395710082008E-4
150	2.5655843814180375E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.299671E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	41.97859064781653
#Duplication Level	Percentage of total
1	32.56901689684873
2	8.755911939735546
3	5.156681431246734
4	3.5446842008100297
5	2.6323123453992117
6	2.084587321179885
7	1.721383305509674
8	1.4480116555750917
9	1.233344196946356
>10	15.88651933896952
>50	5.35380621635037
>100	11.261783877955423
>500	3.83493625881369
>1k	3.9742352792888083
>5k	0.47346845071572646
>10k+	0.0693172846550875
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	8.696896208196738E-6	0.0	0.0	2.3916464572541028E-4	8.696896208196738E-6
2	4.348448104098369E-6	6.087827345737717E-5	0.0	1.3045344312295107E-5	0.0022568445660270534	1.7393792416393476E-5
3	4.348448104098369E-6	6.95751696655739E-5	0.0	1.3045344312295107E-5	0.004396281033243451	7.827206587377064E-5
4	3.478758483278695E-5	7.827206587377064E-5	0.0	1.3045344312295107E-5	0.006548762844772143	8.696896208196738E-5
5	3.913603293688532E-5	7.827206587377064E-5	0.0	1.7393792416393476E-5	0.007535860564402473	8.696896208196738E-5
6	5.65298253532788E-5	7.827206587377064E-5	0.0	1.7393792416393476E-5	0.00924914911741723	8.696896208196738E-5
7	7.392361776967227E-5	1.0001430639426248E-4	0.0	1.7393792416393476E-5	0.010862423364037725	8.696896208196738E-5
8	1.826348203721315E-4	1.0001430639426248E-4	0.0	1.7393792416393476E-5	0.014193334611777075	9.131741018606574E-5
9	2.0437706089262333E-4	1.0001430639426248E-4	0.0	1.7393792416393476E-5	0.016676298479217245	9.131741018606574E-5
10-11	2.522099900377054E-4	1.108854266545084E-4	0.0	1.7393792416393476E-5	0.03103704834300211	9.78400823422133E-5
12-13	3.043913672868858E-4	1.130596507065576E-4	0.0	1.7393792416393476E-5	0.04065364132521565	1.1523387475860678E-4
14-15	3.391789521196728E-4	1.130596507065576E-4	0.0	2.1742240520491845E-5	0.04788293629827919	1.2175654691475433E-4
16-17	3.7179231290041057E-4	1.2175654691475433E-4	0.0	2.1742240520491845E-5	0.05235314094929231	1.3262766717500027E-4
18-19	4.631097230864763E-4	1.3262766717500027E-4	0.0	2.1742240520491845E-5	0.055623173923574284	1.391503393311478E-4
20-21	8.109855714143458E-4	1.5436990769549208E-4	0.0	2.1742240520491845E-5	0.05847575587986281	1.4349878743524617E-4
22-23	0.0012306108134598386	1.5871835579959047E-4	0.0	2.1742240520491845E-5	0.061152225687935366	1.4567301148729535E-4
24-25	0.0013501931363225435	1.65241027955738E-4	0.0	2.6090688624590214E-5	0.06364171222753168	1.521956836434429E-4
26-27	0.001426290978144265	1.65241027955738E-4	0.0	2.6090688624590214E-5	0.06591595058597513	1.565441317475413E-4
28-29	0.0015176083883303307	1.65241027955738E-4	0.0	3.261336078073777E-5	0.06844674738256037	1.6306680390368883E-4
30-31	0.0017089401049106589	1.65241027955738E-4	0.0	4.783292914508206E-5	0.07140804054145136	1.674152520077872E-4
32-33	0.0018176513075131183	1.6958947605983637E-4	0.0	5.218137724918043E-5	0.07414104017487719	2.0002861278852496E-4
34-35	0.0019263625101155774	1.6958947605983637E-4	0.0	8.044628992581982E-5	0.07697187989064522	2.0437706089262333E-4
36-37	0.001956801646844266	1.7176370011188558E-4	0.0	1.000143063942625E-4	0.07942223039730466	2.0655128494467253E-4
38-39	0.001978543887364758	1.7393792416393476E-4	0.0	1.1740809881065596E-4	0.08218349494340713	2.0872550899672172E-4
40-41	0.0020133314721975447	1.7393792416393476E-4	0.0	1.2393077096680352E-4	0.08459688364118172	2.1524818115286926E-4
42-43	0.002024202592457791	1.7393792416393476E-4	0.0	1.3045344312295106E-4	0.08703853725163295	2.1959662925696762E-4
44-45	0.00205246750513443	1.7393792416393476E-4	0.0	1.3045344312295106E-4	0.08961281852925918	2.261193014131152E-4
46-47	0.0020937777621233646	1.804605963200823E-4	0.0	1.3045344312295106E-4	0.09389821413584812	2.261193014131152E-4
48-49	0.0021220426748000043	1.826348203721315E-4	0.0	1.3262766717500027E-4	0.09635726153871577	2.261193014131152E-4
50-51	0.0021437849153204958	1.826348203721315E-4	0.0	1.3480189122704945E-4	0.09919244970258789	2.261193014131152E-4
52-53	0.0021763982761012334	1.826348203721315E-4	0.0	1.391503393311478E-4	0.10167976201813216	2.2829352546516437E-4
54-55	0.0022068374128299223	1.826348203721315E-4	0.0	1.391503393311478E-4	0.10346045151676045	2.3046774951721355E-4
56-57	0.002276412582495496	1.8915749252827903E-4	0.0	1.391503393311478E-4	0.10536289756230346	2.3481619762131192E-4
58-59	0.0023198970635364795	2.0437706089262335E-4	0.0	1.41324563383197E-4	0.10735666101803258	2.3481619762131192E-4
60-61	0.0024329567142430376	2.0872550899672172E-4	0.0	1.4349878743524617E-4	0.10927432663193995	2.3481619762131192E-4
62-63	0.0025025318839086113	2.0872550899672172E-4	0.0	1.6089257985163965E-4	0.11150073206123833	2.3481619762131192E-4
64-65	0.0025242741244291033	2.0872550899672172E-4	0.0	1.7176370011188558E-4	0.11402065773756333	2.3481619762131192E-4
66-67	0.0025329710206372998	2.1742240520491844E-4	0.0	1.7393792416393476E-4	0.11632098678463137	2.3916464572541028E-4
68-69	0.002574281277626234	2.2829352546516437E-4	0.0	1.7611214821598394E-4	0.11811037317946785	2.500357659856562E-4
70-71	0.0026242884308233655	2.3046774951721355E-4	0.0	1.7828637226803313E-4	0.12008239439467645	2.522099900377054E-4
72-73	0.002656901791604103	2.3481619762131192E-4	0.0	1.7828637226803313E-4	0.1215826089905904	2.5873266219385294E-4
74-75	0.0026851667042807428	2.4786154193360703E-4	0.0	1.804605963200823E-4	0.12325676151066826	2.609068862459021E-4
76-77	0.0027047347207491855	2.609068862459021E-4	0.0	1.913317165803282E-4	0.12460912887104286	2.609068862459021E-4
78-79	0.0027416965296340216	2.609068862459021E-4	0.0	2.217708533090168E-4	0.12581582321993018	2.630811102979513E-4
80-81	0.0027656129942065623	2.630811102979513E-4	0.0	2.2394507736106598E-4	0.12726385643859492	2.652553343500005E-4
82-83	0.002780832562570907	2.7395223055819726E-4	0.0	2.261193014131152E-4	0.12894453163082892	2.652553343500005E-4
84-85	0.0028373623879241854	2.82649126766394E-4	0.0	2.261193014131152E-4	0.13074913759402976	2.696037824540989E-4
86-87	0.0029047633335377103	2.82649126766394E-4	0.0	2.261193014131152E-4	0.13228196555072444	2.696037824540989E-4
88-89	0.002937376694318448	2.82649126766394E-4	0.0	2.3046774951721355E-4	0.13373869566559737	2.696037824540989E-4
90-91	0.002961293158890989	2.82649126766394E-4	0.0	2.3481619762131192E-4	0.13577159515426335	2.696037824540989E-4
92-93	0.002987383847515579	2.82649126766394E-4	0.0	2.3481619762131192E-4	0.1378197142112937	2.696037824540989E-4
94-95	0.003067830137441399	2.82649126766394E-4	0.0	2.3481619762131192E-4	0.13923295984512568	2.696037824540989E-4
96-97	0.003185238236252055	2.8699757487049234E-4	0.0	2.3916464572541028E-4	0.14064620547895762	2.696037824540989E-4
98-99	0.0032569876299696782	2.9569447107868907E-4	0.0	2.3916464572541028E-4	0.14177245353791912	2.696037824540989E-4
100-101	0.003380918400936482	2.9569447107868907E-4	0.0	2.3916464572541028E-4	0.14296610254249414	2.696037824540989E-4
102-103	0.0034113575376651705	2.9569447107868907E-4	0.0	2.4351309382950867E-4	0.1440880021533515	2.717780065061481E-4
104-105	0.003433099778185662	2.9569447107868907E-4	0.0	2.500357659856562E-4	0.14532513563896748	2.7395223055819726E-4
106-107	0.0035026749478512358	3.043913672868858E-4	0.0	2.5655843814180375E-4	0.146540526884063	2.7395223055819726E-4
108-109	0.0035439852048401704	3.043913672868858E-4	0.0	2.6742955840204966E-4	0.1476863429594929	2.7395223055819726E-4
110-111	0.003596166582089351	3.087398153909842E-4	0.0	2.696037824540989E-4	0.14875823541715316	2.7395223055819726E-4
112-113	0.0036896582163274657	3.130882634950826E-4	0.0	2.696037824540989E-4	0.14991492261284334	2.7395223055819726E-4
114-115	0.003728794249264351	3.1743671159918094E-4	0.0	2.9569447107868907E-4	0.15115423032251135	2.7395223055819726E-4
116-117	0.0037788014024614826	3.1743671159918094E-4	0.0	3.130882634950826E-4	0.1520934951129966	2.7395223055819726E-4
118-119	0.0038135889872942695	3.2613360780737766E-4	0.0	3.239593837553285E-4	0.15289578378820276	2.7395223055819726E-4
120-121	0.003924474413948778	3.30482055911476E-4	0.0	3.30482055911476E-4	0.15376329918497036	2.7395223055819726E-4
122-123	0.004159290611570089	3.30482055911476E-4	0.0	3.348305040155744E-4	0.1546221176855298	2.7395223055819726E-4
124-125	0.004278872934432795	3.30482055911476E-4	0.0	3.348305040155744E-4	0.1555026784266097	2.7612645461024644E-4
126-127	0.004318008967369681	3.30482055911476E-4	0.0	3.348305040155744E-4	0.1562440888283585	2.783006786622956E-4
128-129	0.004370190344618861	3.30482055911476E-4	0.0	3.3700472806762357E-4	0.15705942284787694	2.783006786622956E-4
130-131	0.004489772667481566	3.30482055911476E-4	2.1742240520491845E-6	3.3917895211967275E-4	0.15768342515081507	2.783006786622956E-4
132-133	0.004568044733355337	3.30482055911476E-4	4.348448104098369E-6	3.3917895211967275E-4	0.15837700262341875	2.783006786622956E-4
134-135	0.004661536367593451	3.30482055911476E-4	4.348448104098369E-6	3.3917895211967275E-4	0.15934018387847654	2.783006786622956E-4
136-137	0.004794164034768452	3.30482055911476E-4	4.348448104098369E-6	3.3917895211967275E-4	0.1601533436739429	2.783006786622956E-4
138-139	0.004857216532277878	3.3700472806762357E-4	6.522672156147554E-6	3.3917895211967275E-4	0.16090127674784785	2.783006786622956E-4
>>END_MODULE
