##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.4d.S.3.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24113794
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.962130057178065	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.81848053441943	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.97480885836546	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.987523987307846	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.85091806789094	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.836521453239584	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.86780972749456	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	35.002180162939105	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.9642310123409	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.951114212885784	35.2	34.0	37.4	31.6	39.0
15-19	34.96461556402115	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
20-24	34.95487500639676	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
25-29	34.95529437632253	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
30-34	34.93600098765047	35.0	34.0	37.0	31.8	39.0
35-39	34.92665248778356	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.88771915360975	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.78400688833952	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.76266234172856	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.752584060392984	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.7256108101446	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.68891036391868	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.694133299803426	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.68008708210745	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.66052218078997	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
85-89	34.649079999605206	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
90-94	34.62429646699313	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
95-99	34.60628903108321	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
100-104	34.56807588221082	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.541048065683896	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.51003266429164	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.47376835018164	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.43505304059577	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.413975055107464	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.36757743721291	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.32824508660893	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.28361276537404	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.24801538074017	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
150	34.24516643876115	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	8.0
22	252.0
23	2890.0
24	18666.0
25	72954.0
26	187297.0
27	350034.0
28	526347.0
29	691312.0
30	865557.0
31	1089016.0
32	1393885.0
33	1839054.0
34	2561891.0
35	4042037.0
36	8886248.0
37	1586341.0
38	5.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	37.0400242649719	10.651659972566714	14.3328675414199	37.97544822104149
2	22.979547829367057	12.51283654366324	36.14106759651424	28.36654803045546
3	21.74659736049875	16.841830052759864	27.813634638149505	33.597937948591884
4	27.052434163998	24.546589166311612	21.636933600876045	26.764043068814342
5	26.938350501449605	30.20037622457425	23.674160041791854	19.18711323218429
6	19.954857352743037	36.38298063808569	25.000295474169278	18.661866535001995
7	16.91177473797664	23.883048637947134	39.82299336251028	19.382183261565945
8	19.37766784708444	23.848331694505454	30.81606578545818	25.957934672951925
9	20.251079714765535	22.603863451331723	32.060926501100454	25.084130332802296
10-14	21.1600743081061	28.49977097310846	26.478928286022494	23.861226432762948
15-19	21.38221437298278	27.43404400312738	27.174850898815496	24.00889072507435
20-24	21.309906466141733	27.494346669243786	27.104736579079958	24.091010285534527
25-29	21.227329482888873	27.707307941654708	26.765552421474997	24.299810153981426
30-34	21.240922915916922	27.483090350209377	27.002876284754763	24.27311044911894
35-39	21.511929114710195	27.249528236473626	26.8919077626001	24.34663488621608
40-44	21.69665727084309	27.328853197589225	26.721132214476317	24.253357317091368
45-49	21.949297545035638	27.30226876195837	26.61109988515519	24.1373338078508
50-54	21.911214340637848	27.541178687237018	26.53228636650575	24.01532060561938
55-59	21.839018311819558	27.46388754622527	26.614754892547072	24.0823392494081
60-64	22.04337295604385	27.32918495832965	26.375539539381894	24.251902546244605
65-69	21.870985013083803	27.44667497278795	26.57864742283081	24.103692591297442
70-74	22.229922395457873	27.192636769889795	26.52232275576361	24.055118078888725
75-79	22.087323433217747	27.09258980273077	26.497717137965378	24.322369626086104
80-84	22.326584547052125	27.086690060217883	26.54019977300934	24.04652561972065
85-89	22.1934025429736	27.081168370446996	26.518089262011618	24.207339824567786
90-94	22.170582277212343	26.843147301886344	26.518897603110602	24.46737281779071
95-99	22.38470477178412	26.876671995987024	26.729263268632952	24.0093599635959
100-104	22.341513371302998	26.68225792065511	26.770489644931423	24.205739063110464
105-109	22.417029042618765	26.67788764170379	26.649136433213737	24.255946882463707
110-114	22.363068849556928	26.739697664144636	26.64416639133999	24.253067094958446
115-119	22.468006241974038	26.920733768935406	26.549196858039082	24.062063131051474
120-124	22.403776763235282	26.77030758773929	26.567162247960397	24.258753401065032
125-129	22.818109293033988	26.699615589723237	26.465180218998047	24.017094898244725
130-134	22.526682372537678	26.983833297146564	26.36706160922425	24.122422721091503
135-139	22.64652580885423	26.79839537078683	26.383945254611362	24.17113356574758
140-144	22.614239175279245	26.635754440404774	26.67348639064962	24.07651999366636
145-149	22.39427322947371	27.203160257849586	26.572142619602324	23.83042389307438
150	22.11005578970024	26.70886800363444	26.682791616574264	24.498284590091053
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	0.5
9	1.0
10	1.5
11	2.5
12	6.0
13	10.5
14	16.0
15	42.0
16	88.0
17	195.0
18	461.5
19	815.5
20	1309.0
21	2129.0
22	3561.5
23	5828.0
24	9595.5
25	14997.0
26	21317.0
27	31029.5
28	48459.5
29	72443.5
30	99252.0
31	125175.0
32	151703.0
33	184516.0
34	219348.5
35	264965.0
36	332585.5
37	404467.5
38	476002.0
39	580996.5
40	725260.0
41	884343.5
42	1050747.0
43	1216523.0
44	1361696.5
45	1473955.5
46	1558222.0
47	1583525.5
48	1538197.0
49	1487592.5
50	1400808.5
51	1248959.5
52	1061035.5
53	894760.5
54	752696.5
55	623282.5
56	527735.0
57	430926.0
58	353380.0
59	289606.5
60	221697.0
61	155247.0
62	92148.5
63	52511.0
64	33222.5
65	20136.5
66	12788.5
67	6058.5
68	2287.5
69	1010.5
70	801.5
71	612.5
72	338.5
73	148.5
74	81.5
75	61.0
76	38.0
77	18.5
78	5.5
79	1.5
80	3.0
81	2.5
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	9.123408784200446E-5
2	8.708708384918607E-5
3	0.18317731336678084
4	4.976404791382061E-5
5	2.0735019964091924E-5
6	4.561704392100223E-5
7	3.7323035935365464E-5
8	6.220505989227577E-5
9	7.464607187073093E-5
10-14	1.318747269716246E-4
15-19	1.4597454054720712E-4
20-24	1.857857788782636E-4
25-29	1.7002716370555376E-4
30-34	1.9905619165528244E-4
35-39	7.464607187073093E-5
40-44	1.2689832218024257E-4
45-49	1.434863381515161E-4
50-54	8.874588544631342E-5
55-59	1.4597454054720712E-4
60-64	1.2689832218024257E-4
65-69	0.07327507235070516
70-74	2.1066780283517393E-4
75-79	1.1777491339604212E-4
80-84	1.07822103813278E-4
85-89	1.003574966262049E-4
90-94	1.33533528568752E-4
95-99	1.0367509982045961E-4
100-104	7.630487346785828E-5
105-109	1.0367509982045961E-4
110-114	6.220505989227577E-5
115-119	5.0593448712384294E-5
120-124	9.952809582764122E-5
125-129	1.1031030620896902E-4
130-134	3.649363513680178E-5
135-139	4.727584551812958E-5
140-144	5.225225030951165E-5
145-149	6.137565909371209E-5
150	9.952809582764122E-5
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4113794E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	44.366776718168275
#Duplication Level	Percentage of total
1	35.402051004311794
2	8.371925577516603
3	4.8422208726851705
4	3.3308629350845185
5	2.549942938418833
6	2.024438471933102
7	1.6772788706540092
8	1.3275756585805967
9	1.234512915708118
>10	15.219695509846371
>50	5.091264300752303
>100	10.475114515610866
>500	3.775860821687653
>1k	4.108605742022245
>5k	0.4523887335242345
>10k+	0.1162611316637343
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.147003992818384E-6	8.294007985636768E-6	0.0	0.0	2.69555259533195E-4	4.147003992818384E-6
2	1.6588015971273536E-5	4.5617043921002225E-5	0.0	0.0	0.002189618108208107	2.073501996409192E-5
3	1.6588015971273536E-5	4.5617043921002225E-5	0.0	0.0	0.0042962961365598466	4.5617043921002225E-5
4	9.123408784200445E-5	4.5617043921002225E-5	0.0	0.0	0.006245388013184487	5.3911051906638993E-5
5	9.952809582764122E-5	4.5617043921002225E-5	0.0	8.294007985636768E-6	0.00726555099541781	5.8058055899457384E-5
6	1.4514513974864346E-4	4.5617043921002225E-5	0.0	8.294007985636768E-6	0.008824824496717521	5.8058055899457384E-5
7	1.7832117169119054E-4	6.220505989227577E-5	0.0	8.294007985636768E-6	0.010234805854275773	6.220505989227577E-5
8	2.5296724356192144E-4	6.635206388509415E-5	0.0	8.294007985636768E-6	0.013336764840903924	6.220505989227577E-5
9	3.566423433823811E-4	6.635206388509415E-5	0.0	8.294007985636768E-6	0.01570470412080322	6.635206388509415E-5
10-11	4.3750892124233955E-4	6.842556588150334E-5	0.0	8.294007985636768E-6	0.02769783966803399	1.0367509982045961E-4
12-13	4.97640479138206E-4	7.049906787791254E-5	0.0	8.294007985636768E-6	0.03511268280719326	1.1611611179891477E-4
14-15	5.432575230592084E-4	7.049906787791254E-5	0.0	1.036750998204596E-5	0.040684182671544764	1.2026311579173315E-4
16-17	5.743600530053463E-4	7.464607187073091E-5	0.0	1.2441011978455152E-5	0.04447661782297717	1.2441011978455154E-4
18-19	6.655941408473507E-4	7.87930758635493E-5	0.0	1.2441011978455152E-5	0.047528812761691505	1.2441011978455154E-4
20-21	9.268553923949089E-4	1.0782210381327799E-4	0.0	1.2441011978455152E-5	0.04998798612943281	1.2441011978455154E-4
22-23	0.0012129986678993774	1.1611611179891476E-4	0.0	1.2441011978455152E-5	0.05254254058900893	1.389246337594159E-4
24-25	0.0013436292936731566	1.2441011978455154E-4	0.0	1.6588015971273536E-5	0.05516344711247015	1.4514513974864344E-4
26-27	0.0014410838875043887	1.2441011978455154E-4	0.0	2.4882023956910305E-5	0.057450519814509486	1.5343914773428022E-4
28-29	0.001606964047217124	1.2441011978455154E-4	0.0	2.69555259533195E-5	0.05991798719023643	1.5965965372350782E-4
30-31	0.001961532888603096	1.2441011978455154E-4	0.0	5.3911051906639E-5	0.06278564045127034	1.6795366170914457E-4
32-33	0.0021191190403301945	1.2855712377736993E-4	0.0	5.8058055899457384E-5	0.06547289903861665	1.9076218366964568E-4
34-35	0.0022414556581183366	1.2855712377736993E-4	0.0	7.671957386714011E-5	0.06819333365790552	2.0320319564810083E-4
36-37	0.0022746316900608835	1.2855712377736993E-4	0.0	8.294007985636768E-5	0.07049906787791253	2.0735019964091922E-4
38-39	0.002289146204035748	1.327041277701883E-4	0.0	1.0782210381327799E-4	0.07315522393531271	2.114972036337376E-4
40-41	0.002311954725996249	1.327041277701883E-4	0.0	1.0782210381327799E-4	0.07564549983300015	2.1771770962296518E-4
42-43	0.002320248733981886	1.327041277701883E-4	0.0	1.0782210381327799E-4	0.07794916055101075	2.2393821561219276E-4
44-45	0.0023472042599352056	1.327041277701883E-4	0.0	1.0989560580968718E-4	0.08035856987083824	2.2393821561219276E-4
46-47	0.0023783067898813437	1.3685113176300668E-4	0.0	1.1196910780609638E-4	0.08415929903025629	2.2393821561219276E-4
48-49	0.002403188813838254	1.389246337594159E-4	0.0	1.1196910780609638E-4	0.08655004683211609	2.2808521960501115E-4
50-51	0.002425997335798755	1.4721864174505265E-4	0.0	1.2026311579173315E-4	0.08913570382163835	2.3223222359782954E-4
52-53	0.002457099865744893	1.4929214374146183E-4	0.0	1.2441011978455154E-4	0.09142899702966692	2.3430572559423872E-4
54-55	0.0024757613837125755	1.4929214374146183E-4	0.0	1.2441011978455154E-4	0.09297168251499535	2.363792275906479E-4
56-57	0.002523451929629987	1.575861517270986E-4	0.0	1.2441011978455154E-4	0.09488967186167385	2.4674673757269384E-4
58-59	0.00256699547155458	1.6795366170914455E-4	0.0	1.2648362178096075E-4	0.09680144070236313	2.5296724356192144E-4
60-61	0.00269555259533195	1.7002716370555376E-4	0.0	1.327041277701883E-4	0.09854110887735044	2.5296724356192144E-4
62-63	0.002790933687166773	1.7002716370555376E-4	0.0	1.327041277701883E-4	0.1007867115394616	2.5711424755473986E-4
64-65	0.0028095952051344552	1.7002716370555376E-4	0.0	1.4099813575582507E-4	0.10331845747707723	2.5711424755473986E-4
66-67	0.0028261832211057287	1.7624766969478133E-4	0.0	1.4721864174505265E-4	0.10546867904735356	2.5711424755473986E-4
68-69	0.0028427712370770026	1.845416776804181E-4	0.0	1.4929214374146183E-4	0.10729543430619005	2.654082555403766E-4
70-71	0.0028655797590375035	1.866151796768273E-4	0.0	1.61733155719917E-4	0.10913463057700501	2.69555259533195E-4
72-73	0.002882167775008777	1.866151796768273E-4	0.0	1.61733155719917E-4	0.11061718450443758	2.716287615296042E-4
74-75	0.002898755790980051	1.8868868167323647E-4	0.0	1.783211716911905E-4	0.11209766492987375	2.7370226352601336E-4
76-77	0.002913270304954915	1.9076218366964568E-4	0.0	1.824681756840089E-4	0.11330236958978748	2.7370226352601336E-4
78-79	0.0029360788269154163	1.9076218366964568E-4	0.0	2.0735019964091922E-4	0.1145900143295576	2.7370226352601336E-4
80-81	0.002969254858857963	1.9490918766246407E-4	0.0	2.114972036337376E-4	0.11591498210526308	2.7370226352601336E-4
82-83	0.002998283886807692	2.0112969365169162E-4	0.0	2.114972036337376E-4	0.11735399249077105	2.7370226352601336E-4
84-85	0.0030293864167538296	2.0735019964091922E-4	0.0	2.114972036337376E-4	0.11896717704397741	2.7370226352601336E-4
86-87	0.003045974432725103	2.0735019964091922E-4	0.0	2.15644207626556E-4	0.1204518044734064	2.7370226352601336E-4
88-89	0.0030604889466999676	2.0735019964091922E-4	0.0	2.2393821561219276E-4	0.12173115520519086	2.7370226352601336E-4
90-91	0.003072929958678423	2.114972036337376E-4	0.0	2.2393821561219276E-4	0.12360145400595195	2.7370226352601336E-4
92-93	0.003099885484631742	2.114972036337376E-4	0.0	2.2393821561219276E-4	0.1252146385591583	2.7370226352601336E-4
94-95	0.0031455025285527446	2.114972036337376E-4	0.0	2.2393821561219276E-4	0.12665157544266986	2.7577576552242255E-4
96-97	0.003203560584452202	2.114972036337376E-4	0.0	2.2393821561219276E-4	0.12791641166047946	2.8199627151165015E-4
98-99	0.003303088680279843	2.114972036337376E-4	2.073501996409192E-6	2.2393821561219276E-4	0.1289552361606805	2.8199627151165015E-4
100-101	0.0034129842860895305	2.1979121161937436E-4	4.147003992818384E-6	2.2393821561219276E-4	0.13007492723874145	2.8199627151165015E-4
102-103	0.003452380824021305	2.1979121161937436E-4	4.147003992818384E-6	2.2808521960501115E-4	0.13118839781081318	2.8199627151165015E-4
104-105	0.0034689688399925783	2.1979121161937436E-4	4.147003992818384E-6	2.3223222359782954E-4	0.13215879674513267	2.861432755044685E-4
106-107	0.0035228798918992173	2.2601171760860196E-4	4.147003992818384E-6	2.384527295870571E-4	0.1332473852932475	2.861432755044685E-4
108-109	0.0035643499318274013	2.3223222359782954E-4	4.147003992818384E-6	2.4467323557628466E-4	0.13420119621159574	2.861432755044685E-4
110-111	0.003601672967762767	2.384527295870571E-4	4.147003992818384E-6	2.5089374156551226E-4	0.13519025666388293	2.861432755044685E-4
112-113	0.003661804525658633	2.48820239569103E-4	4.147003992818384E-6	2.612612515475582E-4	0.1362456691800552	2.861432755044685E-4
114-115	0.0037032745655868173	2.550407455583307E-4	4.147003992818384E-6	2.612612515475582E-4	0.13741097730203716	2.9029027949728693E-4
116-117	0.0037592591194898655	2.654082555403766E-4	4.147003992818384E-6	2.612612515475582E-4	0.13829428915250747	2.9029027949728693E-4
118-119	0.0037965821554252306	2.757757655224226E-4	4.147003992818384E-6	2.6748175753678576E-4	0.13909880792711427	2.944372834901053E-4
120-121	0.003885742741270826	2.861432755044685E-4	4.147003992818384E-6	2.7370226352601336E-4	0.13995309074963486	2.944372834901053E-4
122-123	0.004103460450893792	2.861432755044685E-4	4.147003992818384E-6	2.8199627151165015E-4	0.1408198145841339	2.9858428748292366E-4
124-125	0.004246532088646025	2.861432755044685E-4	4.147003992818384E-6	2.8199627151165015E-4	0.1416409213747119	2.9858428748292366E-4
126-127	0.004279708120588572	2.861432755044685E-4	4.147003992818384E-6	2.8199627151165015E-4	0.14232725053552336	2.9858428748292366E-4
128-129	0.00433776617648803	2.882167775008777E-4	4.147003992818384E-6	2.8199627151165015E-4	0.14303638821829529	2.9858428748292366E-4
130-131	0.004412412248358762	2.9029027949728693E-4	4.147003992818384E-6	2.8406977350805933E-4	0.14372479088110315	2.9858428748292366E-4
132-133	0.004472543806254628	2.9029027949728693E-4	4.147003992818384E-6	2.944372834901053E-4	0.14434891498202232	3.006577894793329E-4
134-135	0.004557557388107404	2.9029027949728693E-4	4.147003992818384E-6	2.944372834901053E-4	0.14533382843031667	3.027312914757421E-4
136-137	0.0046923350178740015	2.9029027949728693E-4	4.147003992818384E-6	2.944372834901053E-4	0.14614042070691985	3.0480479347215126E-4
138-139	0.004758687081759096	2.9858428748292366E-4	4.147003992818384E-6	2.944372834901053E-4	0.14679564733778516	3.13098801457788E-4
>>END_MODULE
