##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.lowPi.2d.R.2.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24165536
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.83869689461885	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.713116191587886	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.91672487628662	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.841876008874785	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.70700616779202	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.706362358360266	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.71477822796896	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.85685846157106	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.840346226957266	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.822295404496714	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
15-19	34.81933261484455	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.82663383092351	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.81199174725526	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.802636614391666	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.79628569380791	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.73326821304523	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.6417951499193	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.60241798071435	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.59163361408578	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.564568474707116	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.54592131538071	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.51695735612899	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.49743566209332	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.47117235057398	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.45001774427847	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.42388614926646	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.395634576448046	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.35445738095774	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.30617720211131	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.269550528488175	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.22242517608548	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.18477232203746	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
125-129	34.14152858020613	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.083086822489676	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.04035246724923	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.00473190414647	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	33.9432072601245	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	33.90962571655766	35.0	34.0	37.0	28.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	19.0
22	434.0
23	4492.0
24	26511.0
25	96519.0
26	230714.0
27	404435.0
28	581953.0
29	752728.0
30	939150.0
31	1175004.0
32	1493747.0
33	1964480.0
34	2707024.0
35	4201223.0
36	8512034.0
37	1075057.0
38	12.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.111962648163995	10.617856434053044	14.656940826101659	38.6132400916813
2	22.14747467783709	12.38031124631401	37.02135412849671	28.450859947352196
3	21.288108629467338	16.972696309006167	28.33900477390848	33.40019028761802
4	26.519631600848946	24.738743552385863	22.255061010874662	26.486563835890532
5	26.073350361723985	30.51037376593308	24.395530409540036	19.0207454628029
6	19.558986358699386	36.607994757487226	25.425901401381495	18.407117482431882
7	16.04717918575363	25.04406387506281	40.36027910383101	18.548477835352543
8	18.607738110731447	24.387181384246333	31.601458789760333	25.403621715261888
9	19.626364920839226	22.804928877129978	32.940777895631726	24.62792830639907
10-14	20.335609829251634	29.16988358032041	27.135241800480703	23.359264789947257
15-19	20.499024177741507	27.821905394716488	27.909001582522734	23.77006884501927
20-24	20.65758037691272	27.986740655299602	27.64793253953373	23.707746428253945
25-29	20.668622444433975	28.20845535288124	27.499072581225505	23.623849621459282
30-34	20.636509019839814	27.907466452568002	27.540686923276525	23.915337604315663
35-39	20.695373739737587	27.903112279345194	27.587877942991735	23.813636037925484
40-44	20.7420882865336	27.98626738487438	27.49589239573603	23.775751932855997
45-49	20.846601696575497	27.76916759476688	27.454178932215168	23.93005177644245
50-54	20.978022793737612	27.755533431905704	27.530719365369443	23.735724408987235
55-59	20.94793990861514	27.798695752680334	27.470471744711006	23.78289259399352
60-64	20.895499881545884	27.749392883855993	27.432749407988048	23.92235782661007
65-69	21.024865373144465	27.661209754378035	27.528060213939725	23.785864658537776
70-74	21.144080830695277	27.616335971581645	27.49532851719637	23.744254680526705
75-79	21.158181344101976	27.51204745713026	27.48031292414595	23.849458274621814
80-84	21.21644057366122	27.528784234356362	27.448317347312972	23.806457844669445
85-89	21.184455093605244	27.537377596844724	27.500573815062275	23.777593494487753
90-94	21.171604710285646	27.463589190572986	27.45932194079717	23.905484158344198
95-99	21.25609564168737	27.372245109615612	27.57320298576203	23.798456262934987
100-104	21.318687663226964	27.45842499181227	27.421141154725188	23.80174619023558
105-109	21.281257241481004	27.29555097890485	27.520686318949338	23.90250546066481
110-114	21.352848877559005	27.282455426326564	27.576757108422186	23.787938587692246
115-119	21.394247608257256	27.311653279634246	27.545348663369136	23.748750448739365
120-124	21.341437697645553	27.228073120628395	27.557691215224946	23.87279796650111
125-129	21.39641561633271	27.134607402321738	27.623452977679598	23.84552400366595
130-134	21.46536468343518	27.276516146391057	27.4880913871693	23.77002778300447
135-139	21.45265753975335	27.117093811609273	27.61241405277261	23.817834595864763
140-144	21.49947706847456	27.046049614391123	27.75964637118196	23.694826945952354
145-149	21.49877875423	27.652531577264238	27.396904213148932	23.45178545535683
150	21.387022175610255	27.177967337524766	27.487855811441353	23.947154675423626
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	1.0
9	1.5
10	1.5
11	6.0
12	7.5
13	15.0
14	45.5
15	77.0
16	148.5
17	314.5
18	611.5
19	1147.5
20	2107.5
21	3555.5
22	5613.5
23	8920.0
24	14113.0
25	22044.0
26	32892.5
27	46318.5
28	63067.0
29	88875.0
30	120970.5
31	153636.5
32	185392.5
33	221271.5
34	261684.0
35	308284.0
36	379866.5
37	479450.5
38	600051.0
39	747372.0
40	917906.5
41	1085454.0
42	1253437.5
43	1429888.0
44	1573778.0
45	1658423.5
46	1680324.0
47	1639496.0
48	1553229.0
49	1425258.0
50	1260260.5
51	1083628.5
52	904130.5
53	728314.0
54	567640.5
55	429350.0
56	319811.5
57	238993.0
58	181552.0
59	137803.5
60	98604.0
61	72149.0
62	54511.0
63	35150.5
64	22006.0
65	17789.5
66	19256.5
67	15000.5
68	6871.0
69	3046.5
70	2045.5
71	1342.5
72	643.0
73	278.5
74	125.5
75	81.0
76	47.5
77	31.0
78	14.0
79	1.5
80	0.5
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	3.4760246989762615E-4
2	1.8621560887372828E-4
3	4.965749569966087E-5
4	3.310499713310725E-5
5	4.5519371058022466E-5
6	1.0345311604096015E-4
7	2.027681074402819E-4
8	1.0345311604096015E-4
9	1.32419988532429E-4
10-14	1.4069623781570582E-4
15-19	2.8801347505803305E-4
20-24	2.4083885414335525E-4
25-29	3.2029084726281263E-4
30-34	9.468029180068673E-4
35-39	8.756271741706867E-4
40-44	9.658382913584039E-4
45-49	9.178360455153985E-4
50-54	5.967175733242582E-4
55-59	3.666378432491628E-4
60-64	2.5242560313994274E-4
65-69	3.1118697305120816E-4
70-74	3.418090953993323E-4
75-79	2.607018524232196E-4
80-84	2.8056485070308395E-4
85-89	3.5008534468260915E-4
90-94	3.666378432491628E-4
95-99	3.045659736245867E-4
100-104	4.33675462443705E-4
105-109	2.971173492696375E-4
110-114	2.515979782116151E-4
115-119	2.515979782116151E-4
120-124	2.2511398050512928E-4
125-129	1.2993711374744595E-4
130-134	1.7793935959045144E-4
135-139	1.5973161116724247E-4
140-144	1.6304211088055318E-4
145-149	1.986299827986435E-4
150	2.8139247563141164E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4165536E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	49.427185243495664
#Duplication Level	Percentage of total
1	37.92779810616694
2	10.640213041279935
3	6.294916642267665
4	4.462665132755634
5	3.3350933064650907
6	2.72499127542661
7	2.244290499267809
8	1.8763372820703492
9	1.5350385964437367
>10	18.582293612431943
>50	4.49873140699225
>100	4.839568368998233
>500	0.5272678258597845
>1k	0.5107949035738972
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	2.8966872491468844E-5	0.0	0.0	1.0345311604096015E-4	2.8966872491468844E-5
2	0.0	1.8207748423208986E-4	0.0	8.276249283276813E-6	0.0017752554712628763	4.138124641638406E-5
3	0.0	1.8621560887372828E-4	0.0	8.276249283276813E-6	0.002834615379522308	6.20718696245761E-5
4	1.6552498566553625E-5	2.1518248136519712E-4	0.0	8.276249283276813E-6	0.004353307123003603	9.103874211604493E-5
5	3.310499713310725E-5	2.2759685529011233E-4	0.0	1.2414373924915218E-5	0.005586468266211848	1.0759124068259856E-4
6	4.965749569966087E-5	2.2759685529011233E-4	0.0	1.2414373924915218E-5	0.006558927556996874	1.1172936532423697E-4
7	5.379562034129928E-5	2.4001122921502756E-4	0.0	1.2414373924915218E-5	0.007705188082730712	1.1586748996587537E-4
8	6.62099942662145E-5	2.4414935385666596E-4	0.0	1.2414373924915218E-5	0.009753559780341724	1.2828186389079058E-4
9	9.517686675768334E-5	2.4414935385666596E-4	0.0	1.2414373924915218E-5	0.012790943267304313	1.32419988532429E-4
10-11	1.262128015699714E-4	2.4414935385666596E-4	0.0	1.2414373924915218E-5	0.017384261619522945	1.8207748423208986E-4
12-13	1.6759404798635544E-4	2.4414935385666596E-4	0.0	1.2414373924915218E-5	0.021108573796997508	2.1932060600683554E-4
14-15	1.8621560887372828E-4	2.5035654081912356E-4	0.0	1.6552498566553625E-5	0.02533773718075196	2.4414935385666596E-4
16-17	2.2138966832765472E-4	2.64839977064858E-4	0.0	1.6552498566553625E-5	0.02967449180518901	2.607018524232196E-4
18-19	2.565637277815812E-4	2.731162263481348E-4	0.0	1.6552498566553625E-5	0.03340914929426767	2.607018524232196E-4
20-21	3.1863559740615726E-4	3.227737220477957E-4	0.0	1.6552498566553625E-5	0.03685413805843164	2.64839977064858E-4
22-23	3.993290279181062E-4	3.289809090102533E-4	0.0	1.6552498566553625E-5	0.04061155523303932	2.8139247563141164E-4
24-25	4.634699598635015E-4	3.3104997133107247E-4	0.0	1.6552498566553625E-5	0.04513038734170846	2.8139247563141164E-4
26-27	5.276108918088968E-4	3.3104997133107247E-4	0.0	1.6552498566553625E-5	0.049415415408125024	2.8553060027305E-4
28-29	5.60715888942004E-4	3.3104997133107247E-4	0.0	1.8621560887372826E-5	0.05383079440075321	3.0001403651878445E-4
30-31	6.331330701706762E-4	3.3104997133107247E-4	0.0	2.4828747849830436E-5	0.05801650747577045	3.227737220477957E-4
32-33	6.910668151536138E-4	3.3104997133107247E-4	0.0	2.4828747849830436E-5	0.06190220651426892	3.6829309310581815E-4
34-35	7.572768094198283E-4	3.331190336518917E-4	0.0	3.724312177474565E-5	0.06525408747399603	3.7450028006827575E-4
36-37	7.924508688737547E-4	3.351880959727109E-4	0.0	4.758843337884167E-5	0.06872804311065148	3.993290279181062E-4
38-39	8.131414920819468E-4	3.351880959727109E-4	0.0	6.000280730375689E-5	0.07270478089126597	4.055362148805638E-4
40-41	8.421083645734157E-4	3.3725715829353007E-4	0.0	6.62099942662145E-5	0.0758207887464197	4.096743395222022E-4
42-43	8.524536761775116E-4	3.413952829351685E-4	0.0	7.034811890785291E-5	0.07898024691031061	4.200196511262982E-4
44-45	8.793514863481613E-4	3.5380965686008375E-4	0.0	7.034811890785291E-5	0.08315354561140295	4.3036496273039424E-4
46-47	9.310780443686414E-4	3.6001684382254136E-4	0.0	7.034811890785291E-5	0.0870164849643724	4.324340250512134E-4
48-49	9.828046023891215E-4	3.7656934238909493E-4	0.0	7.034811890785291E-5	0.09060837715331455	4.4898652361776705E-4
50-51	9.89011789351579E-4	3.8070746703073335E-4	0.0	7.034811890785291E-5	0.09468236086300755	4.5105558593858624E-4
52-53	0.0010345311604096014	3.8070746703073335E-4	0.0	7.44862435494913E-5	0.09855357646526028	4.531246482594054E-4
54-55	0.001080050531467624	3.8277652935155254E-4	0.0	7.44862435494913E-5	0.10179165899734233	4.5519371058022466E-4
56-57	0.0011255699025256465	3.931218409556486E-4	0.0	7.44862435494913E-5	0.10596081957379302	4.5519371058022466E-4
58-59	0.0011483295880546575	4.055362148805638E-4	0.0	7.655530587031051E-5	0.109794792054271	4.6140089754268226E-4
60-61	0.0011979870837543186	4.1174340184302143E-4	0.0	7.862436819112971E-5	0.11314253488935647	4.7381527146759747E-4
62-63	0.0012372992678498834	4.138124641638406E-4	0.0	8.276249283276812E-5	0.11643855116642146	4.758843337884167E-4
64-65	0.001266266140341352	4.1795058880547903E-4	0.0	8.483155515358733E-5	0.12098428108526126	4.800224584300551E-4
66-67	0.0012910948881911827	4.3036496273039424E-4	0.0	8.690061747440652E-5	0.12519482290812833	4.800224584300551E-4
68-69	0.0013241998853242899	4.510555859385863E-4	0.0	8.690061747440652E-5	0.12798598797891345	4.882987077133319E-4
70-71	0.0013986861288737813	4.696771468259591E-4	0.0	9.103874211604493E-5	0.1306012827524289	4.98644019317428E-4
72-73	0.0014442054999318037	4.7795339610923594E-4	0.0	9.103874211604493E-5	0.1332062322143403	5.027821439590663E-4
74-75	0.0014855867463481878	4.820915207508743E-4	0.0	1.0138405372014096E-4	0.13625189195058615	5.048512062798855E-4
76-77	0.0015186917434812952	4.862296453925127E-4	0.0	1.1379842764505616E-4	0.1388423579762518	5.08989330921524E-4
78-79	0.0015745564261434135	4.882987077133319E-4	0.0	1.2207467692833298E-4	0.14135626869604712	5.234727671672584E-4
80-81	0.001630421108805532	4.924368323549703E-4	0.0	1.241437392491522E-4	0.1439922540927708	5.276108918088968E-4
82-83	0.0016738714175427351	4.965749569966088E-4	0.0	1.2621280156997137E-4	0.14634891607618386	5.379562034129927E-4
84-85	0.0017566339103755033	5.007130816382471E-4	0.0	1.32419988532429E-4	0.1485276387000065	5.379562034129927E-4
86-87	0.0018414654655290906	5.048512062798855E-4	0.0	1.32419988532429E-4	0.1506091153947506	5.379562034129927E-4
88-89	0.0018683632756997404	5.069202686007047E-4	4.138124641638406E-6	1.365581131740674E-4	0.15257265553720803	5.379562034129927E-4
90-91	0.0018993992105120283	5.151965178839816E-4	4.138124641638406E-6	1.365581131740674E-4	0.15518381218608185	5.420943280546312E-4
92-93	0.0019304351453243165	5.193346425256199E-4	4.138124641638406E-6	1.365581131740674E-4	0.15782186664512635	5.462324526962696E-4
94-95	0.001990437952628073	5.234727671672584E-4	4.138124641638406E-6	1.4069623781570582E-4	0.16072683014355651	5.50370577337908E-4
96-97	0.0020918220063482146	5.420943280546311E-4	4.138124641638406E-6	1.4069623781570582E-4	0.16302762744430746	5.545087019795464E-4
98-99	0.0021642391875768864	5.545087019795464E-4	4.138124641638406E-6	1.4069623781570582E-4	0.16515669257243043	5.545087019795464E-4
100-101	0.0022387254311263777	5.586468266211848E-4	4.138124641638406E-6	1.42765300136525E-4	0.16736645113106535	5.545087019795464E-4
102-103	0.002271830428259485	5.586468266211848E-4	4.138124641638406E-6	1.4690342477816342E-4	0.16912515410376167	5.545087019795464E-4
104-105	0.002323556986279965	5.627849512628233E-4	4.138124641638406E-6	1.489724870989826E-4	0.17085695926628733	5.545087019795464E-4
106-107	0.0023897669805461796	5.710612005461E-4	4.138124641638406E-6	1.5311061174062103E-4	0.17258255724185056	5.545087019795464E-4
108-109	0.002445631663208298	5.710612005461E-4	4.138124641638406E-6	1.5724873638225942E-4	0.17414469929406906	5.545087019795464E-4
110-111	0.0024932200965871397	5.710612005461E-4	4.138124641638406E-6	1.5724873638225942E-4	0.17561994072881312	5.545087019795464E-4
112-113	0.0025718444647782695	5.731302628669192E-4	4.138124641638406E-6	1.5724873638225942E-4	0.17726070714922276	5.545087019795464E-4
114-115	0.0026318472720820263	5.751993251877385E-4	4.138124641638406E-6	1.5931779870307863E-4	0.17899458137406926	5.545087019795464E-4
116-117	0.002691850079385783	5.81406512150196E-4	4.138124641638406E-6	1.8621560887372828E-4	0.18056499967557102	5.565777643003656E-4
118-119	0.0027477147620479014	5.834755744710152E-4	4.138124641638406E-6	1.9035373351536668E-4	0.18197816924069055	5.586468266211848E-4
120-121	0.0028490988157680425	5.834755744710152E-4	4.138124641638406E-6	1.986299827986435E-4	0.18341616755365991	5.586468266211848E-4
122-123	0.0029794497419796525	5.834755744710152E-4	4.138124641638406E-6	1.986299827986435E-4	0.18475898899987156	5.586468266211848E-4
124-125	0.0030766956710581547	5.876136991126537E-4	4.138124641638406E-6	1.986299827986435E-4	0.18629837136656102	5.586468266211848E-4
126-127	0.003130491291399454	5.876136991126537E-4	4.138124641638406E-6	1.986299827986435E-4	0.1878336156086089	5.627849512628233E-4
128-129	0.0032070465972697648	5.876136991126537E-4	4.138124641638406E-6	2.0276810744028188E-4	0.1891722989301789	5.627849512628233E-4
130-131	0.0032773947161776175	5.91751823754292E-4	4.138124641638406E-6	2.0276810744028188E-4	0.19043856507052026	5.669230759044616E-4
132-133	0.003393262206143493	5.91751823754292E-4	4.138124641638406E-6	2.0690623208192028E-4	0.19157034216000837	5.710612005461E-4
134-135	0.0035339584439591986	5.938208860751112E-4	4.138124641638406E-6	2.110443567235587E-4	0.19263590925523028	5.731302628669192E-4
136-137	0.003691207180341458	6.000280730375689E-4	4.138124641638406E-6	2.131134190443779E-4	0.19382148196505966	5.751993251877385E-4
138-139	0.0037946602963824187	6.289949455290377E-4	8.276249283276813E-6	2.1932060600683551E-4	0.19494912092990613	5.751993251877385E-4
>>END_MODULE
