##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.lowPi.2d.S.1.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24190034
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.98596938722781	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.84492398811841	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	35.02162307833052	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.97219681460555	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.83620568701971	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.81764895411061	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.81698281201258	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.975917520413574	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.95996872100304	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.94117104589436	35.2	34.0	37.4	31.6	39.0
15-19	34.939097274522226	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
20-24	34.94782814277979	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
25-29	34.94122144681566	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.924964884299044	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.92298850840805	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.858502786726135	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.75931934614065	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.724600271334886	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.71590722857189	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.686001871679885	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.670046011510365	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.64314743005322	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
75-79	34.62289361809083	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
80-84	34.59242943602312	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.57442755971323	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.54778010646864	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.51088659900189	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.47394352566846	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.4124161793241	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.383212466753875	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.328853055766686	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.291337432597246	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
125-129	34.232053696162644	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.18297751875835	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.125432423947814	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.09674432867685	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.02421216935867	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	33.99370848341925	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	25.0
22	409.0
23	4144.0
24	25078.0
25	92234.0
26	220813.0
27	387233.0
28	559543.0
29	721545.0
30	898469.0
31	1123411.0
32	1429406.0
33	1874387.0
34	2581230.0
35	3998896.0
36	8641068.0
37	1632141.0
38	2.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.772734689416254	10.366439041522963	14.803279399429108	38.05754686963168
2	23.56453956514494	11.747958070757447	35.528268695924694	29.159233668172924
3	22.051692731414484	16.43385849765457	27.80649669681905	33.707952074111894
4	27.39399061464501	23.87956309930687	21.634410675341094	27.092035610707022
5	27.482951441714278	29.798852601291557	23.607179852916214	19.111016104077954
6	20.308687734425266	36.284909656101036	24.6410626005477	18.765340008926
7	16.92457709878058	24.51963285470141	39.595399534526415	18.960390511991594
8	19.421792763062705	23.848958818209766	30.754449398371523	25.974799020356006
9	20.267376458210254	22.373324065596822	32.19676235808554	25.162537118107377
10-14	21.16881205070013	28.508450827835986	26.518754012247292	23.80398310921659
15-19	21.494773393993157	27.351859433043792	27.159755933665263	23.993611239297792
20-24	21.443456331572467	27.38350079789189	27.070658223396006	24.10238464713964
25-29	21.36572860607954	27.637008297357813	26.717522905448032	24.279740191114616
30-34	21.376366276089463	27.465407791039542	26.91560258356401	24.24262334930698
35-39	21.614665431305472	27.170279413574168	26.876857979812723	24.338197175307638
40-44	21.795045782308208	27.242280756839264	26.69456020866464	24.268113252187884
45-49	22.073623939044023	27.21167226628315	26.604834959564837	24.109868835107992
50-54	22.032823308510697	27.43658764533685	26.501713466652514	24.02887557949994
55-59	21.944197507661013	27.371917293361452	26.63027712192465	24.053608077052886
60-64	22.18322112514148	27.22248887998015	26.356439197282672	24.237850797595705
65-69	22.01107591882036	27.312638050576115	26.562069539850775	24.114216490752753
70-74	22.374894075843795	27.086736055043293	26.493498771076396	24.044871098036516
75-79	22.189339166495728	27.033205420793067	26.45965934801231	24.317796064698893
80-84	22.49091805149997	27.003698790248677	26.48371370817133	24.021669450080026
85-89	22.33382123866839	27.002443296837832	26.51197408588688	24.1517613786069
90-94	22.31708285324747	26.76529740428748	26.47218634712165	24.4454333953434
95-99	22.544966589444545	26.82289925241712	26.66209948259526	23.970034675543076
100-104	22.50531380465768	26.610540584630833	26.70826476792303	24.175880842788462
105-109	22.596505966967236	26.620766412009228	26.594989602339236	24.187738018684296
110-114	22.525764994897596	26.675086078438504	26.58170027300321	24.217448653660686
115-119	22.627514379531906	26.89619696901036	26.459491245914453	24.016797405543283
120-124	22.53203565282547	26.73007051939121	26.53330219425732	24.204591633526004
125-129	22.93625191243287	26.663555022659484	26.44652980024464	23.953663264663
130-134	22.61647500892518	26.901929210736537	26.35187620535365	24.129719574984634
135-139	22.780863144524265	26.688168946555713	26.392500402955882	24.13846750596414
140-144	22.705095749557056	26.51902345828823	26.699975152533952	24.07590563962076
145-149	22.52304060595514	27.161850525536412	26.572515816956475	23.74259305155197
150	22.255388841927303	26.668971752937082	26.6749535675592	24.40068583757641
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	1.5
10	1.5
11	1.5
12	4.5
13	10.5
14	20.5
15	38.0
16	67.5
17	203.5
18	478.0
19	848.0
20	1385.0
21	2277.5
22	3861.0
23	6222.0
24	10044.5
25	15338.0
26	21662.5
27	30949.5
28	47490.5
29	71275.5
30	97852.5
31	123699.5
32	151712.0
33	184816.0
34	219040.0
35	264891.0
36	331645.0
37	402893.5
38	473309.0
39	576317.5
40	718754.5
41	875743.5
42	1038450.5
43	1199011.0
44	1339862.0
45	1448991.5
46	1532654.0
47	1564726.5
48	1525703.0
49	1475311.0
50	1391193.5
51	1247944.5
52	1073307.5
53	918150.0
54	777225.0
55	649034.5
56	556643.5
57	460193.5
58	381005.5
59	314292.0
60	245122.5
61	174227.5
62	102556.0
63	56983.5
64	35658.0
65	21758.5
66	14134.5
67	6447.5
68	2402.0
69	1250.5
70	1168.0
71	903.5
72	451.0
73	177.0
74	104.0
75	61.5
76	34.0
77	20.0
78	10.0
79	4.5
80	3.0
81	1.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.5
86	1.0
87	0.5
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	4.8367025858665595E-4
2	1.7775915486518127E-4
3	7.441080901333168E-5
4	2.4803603004443893E-5
5	4.9607206008887786E-5
6	9.094654434962762E-5
7	1.942948902014772E-4
8	9.094654434962762E-5
9	8.681261051555363E-5
10-14	1.5295555186073737E-4
15-19	2.1909849320592107E-4
20-24	1.653573533629593E-4
25-29	2.827610742506604E-4
30-34	8.019831638103527E-4
35-39	7.672581196041311E-4
40-44	0.0010467120467875324
45-49	9.202136714648685E-4
50-54	5.225292366269514E-4
55-59	3.3980936116088136E-4
60-64	2.4472888297717975E-4
65-69	3.183129052236967E-4
70-74	3.4890401559584415E-4
75-79	2.8110750071703083E-4
80-84	2.92682515452438E-4
85-89	3.952040745374728E-4
90-94	3.728808318334732E-4
95-99	3.0591110372147473E-4
100-104	4.787095379857672E-4
105-109	3.050843169546599E-4
110-114	2.571306844794017E-4
115-119	2.4886281681125376E-4
120-124	2.6209140508029054E-4
125-129	1.430341106589598E-4
130-134	1.5708948569481134E-4
135-139	1.694912871970333E-4
140-144	1.7445200779792207E-4
145-149	1.8685380930014403E-4
150	2.0669669170369912E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4190034E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	42.68286331019204
#Duplication Level	Percentage of total
1	33.486625740296155
2	8.592435298032159
3	4.972191228009111
4	3.394778241406635
5	2.6146643682662423
6	2.050259674482906
7	1.7066690456047997
8	1.4099280176648084
9	1.2541347616472556
>10	15.555538012701067
>50	5.169557623252608
>100	10.951896421952048
>500	4.060994872251012
>1k	4.320989543177861
>5k	0.34666724741660454
>10k+	0.11266990383853064
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.2401801502221948E-5	0.0	4.1339338340739824E-6	1.9842882403555117E-4	2.8937536838517878E-5
2	4.1339338340739824E-6	9.094654434962762E-5	0.0	1.2401801502221948E-5	0.002133109858382175	3.720540450666584E-5
3	8.267867668147965E-6	1.0334834585184957E-4	0.0	1.653573533629593E-5	0.004154603503244352	5.7875073677035756E-5
4	6.614294134518372E-5	1.3228588269036744E-4	0.0	1.653573533629593E-5	0.006068614868420606	7.027687517925771E-5
5	7.441080901333168E-5	1.3228588269036744E-4	0.0	1.653573533629593E-5	0.007147571599113916	7.027687517925771E-5
6	9.921441201777559E-5	1.3228588269036744E-4	0.0	1.653573533629593E-5	0.008631653845546476	7.441080901333168E-5
7	1.240180150222195E-4	1.4055375035851542E-4	0.0	1.653573533629593E-5	0.01013227182731533	7.441080901333168E-5
8	2.3563422854221703E-4	1.446876841925894E-4	0.0	1.653573533629593E-5	0.01294334683448564	7.854474284740567E-5
9	3.0177716988740073E-4	1.446876841925894E-4	0.0	1.653573533629593E-5	0.015555993017620397	8.681261051555363E-5
10-11	3.4725044206221454E-4	1.4675465110962636E-4	0.0	1.653573533629593E-5	0.027608477110863096	1.1368318043703454E-4
12-13	3.9272371423702834E-4	1.4882161802666336E-4	0.0	1.653573533629593E-5	0.035859809043674765	1.3228588269036744E-4
14-15	4.2372821799258325E-4	1.5708948569481134E-4	0.0	1.860270225333292E-5	0.04233354942783462	1.3641981652444144E-4
16-17	4.6093362249924905E-4	1.6329038644592232E-4	0.0	2.0669669170369915E-5	0.04624218386795157	1.4055375035851542E-4
18-19	5.374113984296178E-4	1.7362522103110727E-4	0.0	2.0669669170369915E-5	0.04929716097133224	1.4262071727555242E-4
20-21	7.895813623081307E-4	1.8396005561629222E-4	0.0	2.2736636087406906E-5	0.05195321345972478	1.446876841925894E-4
22-23	0.0010830906645273833	1.9016095636740322E-4	0.0	2.6870569921480887E-5	0.054563792675942496	1.446876841925894E-4
24-25	0.0012050417126325658	1.942948902014772E-4	0.0	2.8937536838517878E-5	0.0571847067267454	1.446876841925894E-4
26-27	0.0012732516208947867	1.942948902014772E-4	0.0	3.307147067259186E-5	0.05948524090540758	1.4675465110962636E-4
28-29	0.0013786669336636732	1.942948902014772E-4	0.0	3.9272371423702835E-5	0.062445137530604544	1.5708948569481134E-4
30-31	0.0015874305922844094	1.942948902014772E-4	0.0	5.7875073677035756E-5	0.0655104494685704	1.5915645261184832E-4
32-33	0.001672176235882926	1.942948902014772E-4	0.0	6.82099082622207E-5	0.06820784129530368	1.8189308869925524E-4
34-35	0.0017362522103110728	1.942948902014772E-4	0.0	9.094654434962762E-5	0.07116360398666657	1.8189308869925524E-4
36-37	0.0017631227802325537	2.0049579095258817E-4	0.0	1.0334834585184956E-4	0.07355301774276134	1.8396005561629222E-4
38-39	0.0017796585155688497	2.149645593718471E-4	0.0	1.1575014735407151E-4	0.07615326212439388	1.922279232844402E-4
40-41	0.0018147969531584784	2.149645593718471E-4	0.0	1.1575014735407151E-4	0.07845793023689013	1.942948902014772E-4
42-43	0.0018313326884947744	2.1909849320592107E-4	0.0	1.1575014735407151E-4	0.0807315938456308	1.942948902014772E-4
44-45	0.0018375335892458853	2.2736636087406905E-4	0.0	1.1781711427110851E-4	0.08306519949496557	1.9842882403555117E-4
46-47	0.0018540693245821813	2.37701195459254E-4	4.1339338340739824E-6	1.2608498193925646E-4	0.08696970000124846	2.0049579095258817E-4
48-49	0.0018685380930014402	2.48036030044439E-4	4.1339338340739824E-6	1.2815194885629346E-4	0.08930743958441728	2.0256275786962515E-4
50-51	0.001883006861420699	2.48036030044439E-4	4.1339338340739824E-6	1.2815194885629346E-4	0.0917836659510276	2.0256275786962515E-4
52-53	0.00190987743134218	2.521699638785129E-4	4.1339338340739824E-6	1.2815194885629346E-4	0.09403872685751496	2.0876365862073612E-4
54-55	0.0019470828358488458	2.521699638785129E-4	4.1339338340739824E-6	1.3228588269036744E-4	0.0958907292151801	2.1083062553777312E-4
56-57	0.0020070248764429187	2.521699638785129E-4	4.1339338340739824E-6	1.4262071727555242E-4	0.09787501745553562	2.1083062553777312E-4
58-59	0.0020338954463643994	2.6043783154666093E-4	4.1339338340739824E-6	1.5295555186073737E-4	0.0998737744643104	2.1083062553777312E-4
60-61	0.0021289759245481012	2.687056992148089E-4	4.1339338340739824E-6	1.5295555186073737E-4	0.10195521014976663	2.1083062553777312E-4
62-63	0.0022075206673955066	2.728396330488829E-4	6.200900751110974E-6	1.5295555186073737E-4	0.10424540949384362	2.1083062553777312E-4
64-65	0.002219922468897729	2.7904053379999383E-4	8.267867668147965E-6	1.6122341952888532E-4	0.10690766288298727	2.1083062553777312E-4
66-67	0.0022343912373169877	2.8730840146814183E-4	8.267867668147965E-6	1.6122341952888532E-4	0.10952444299995609	2.1083062553777312E-4
68-69	0.002257127873404394	2.9350930221925273E-4	8.267867668147965E-6	1.694912871970333E-4	0.11149632943880938	2.170315262888841E-4
70-71	0.0022901993440769862	2.9764323605332673E-4	8.267867668147965E-6	1.694912871970333E-4	0.11336073359797676	2.2529939395703208E-4
72-73	0.0023232708147495782	2.9971020297036373E-4	8.267867668147965E-6	1.694912871970333E-4	0.11498743656168486	2.3150029470814302E-4
74-75	0.002350141384671059	3.0177716988740073E-4	8.267867668147965E-6	1.7569218794814427E-4	0.11673609057349815	2.3150029470814302E-4
76-77	0.002383212855343651	3.0177716988740073E-4	8.267867668147965E-6	1.8396005561629222E-4	0.1181746995477559	2.3150029470814302E-4
78-79	0.002422485226767354	3.0591110372147473E-4	8.267867668147965E-6	1.942948902014772E-4	0.11955336648141958	2.3150029470814302E-4
80-81	0.0024390209621036494	3.1004503755554874E-4	8.267867668147965E-6	1.942948902014772E-4	0.12098784152184325	2.3770119545925403E-4
82-83	0.0024782933335273528	3.141789713896227E-4	8.267867668147965E-6	1.942948902014772E-4	0.12233963788558544	2.39768162376291E-4
84-85	0.0025279005395362404	3.2451380597480763E-4	8.267867668147965E-6	1.942948902014772E-4	0.12384232283427134	2.39768162376291E-4
86-87	0.0025671729109599433	3.348486405599926E-4	8.267867668147965E-6	1.9636185711851417E-4	0.1252375255032713	2.39768162376291E-4
88-89	0.002598177414715498	3.348486405599926E-4	8.267867668147965E-6	1.9842882403555117E-4	0.1267071389812846	2.39768162376291E-4
90-91	0.0026229810177199418	3.410495413111036E-4	8.267867668147965E-6	1.9842882403555117E-4	0.12860874854495863	2.4390209621036498E-4
92-93	0.002647784620724386	3.4725044206221454E-4	8.267867668147965E-6	2.0256275786962515E-4	0.1305062241747986	2.4390209621036498E-4
94-95	0.0026870569921480887	3.4725044206221454E-4	8.267867668147965E-6	2.0256275786962515E-4	0.1321267262377556	2.45969063127402E-4
96-97	0.0027531999334932727	3.4725044206221454E-4	8.267867668147965E-6	2.0256275786962515E-4	0.13347645563458077	2.501029969614759E-4
98-99	0.002856548279345122	3.5138437589628854E-4	8.267867668147965E-6	2.1289759245481012E-4	0.13466496161187702	2.521699638785129E-4
100-101	0.0029888341620354893	3.5138437589628854E-4	8.267867668147965E-6	2.1909849320592107E-4	0.13594028019968885	2.542369307955499E-4
102-103	0.0030322404672932664	3.5138437589628854E-4	8.267867668147965E-6	2.1909849320592107E-4	0.13688488408077476	2.6043783154666093E-4
104-105	0.003050843169546599	3.5138437589628854E-4	8.267867668147965E-6	2.2736636087406905E-4	0.13789563090320583	2.645717653807349E-4
106-107	0.003100450375555487	3.5345134281332554E-4	8.267867668147965E-6	2.3563422854221703E-4	0.13895391796472878	2.666387322977719E-4
108-109	0.0031583254492325227	3.7205404506665844E-4	8.267867668147965E-6	2.521699638785129E-4	0.14007628100067987	2.687056992148089E-4
110-111	0.003193463886822152	3.7618797890073244E-4	8.267867668147965E-6	2.521699638785129E-4	0.14097127767575687	2.687056992148089E-4
112-113	0.0032637407620014092	3.7618797890073244E-4	8.267867668147965E-6	2.521699638785129E-4	0.1419220824575939	2.707726661318459E-4
114-115	0.00331128100109326	3.7618797890073244E-4	8.267867668147965E-6	2.521699638785129E-4	0.143269744887502	2.7697356688295683E-4
116-117	0.0033670891078532586	3.7618797890073244E-4	8.267867668147965E-6	2.521699638785129E-4	0.14423295147084125	2.7904053379999383E-4
118-119	0.003422897214613258	3.823888796518434E-4	8.267867668147965E-6	2.521699638785129E-4	0.14507420700607532	2.8110750071703083E-4
120-121	0.0035262455604651074	3.844558465688804E-4	8.267867668147965E-6	2.5630389771258693E-4	0.1459113286074753	2.8110750071703083E-4
122-123	0.0036936698807451037	3.865228134859174E-4	8.267867668147965E-6	2.687056992148089E-4	0.14684353068705897	2.8317446763406783E-4
124-125	0.003813553961933249	3.885897804029544E-4	8.267867668147965E-6	2.7490659996591983E-4	0.14779226850197896	2.8524143455110483E-4
126-127	0.003848692399522878	3.885897804029544E-4	8.267867668147965E-6	2.7697356688295683E-4	0.14865832764021747	2.8730840146814183E-4
128-129	0.0038962326386147287	3.9065674731999134E-4	8.267867668147965E-6	2.8110750071703083E-4	0.14952852071229003	2.914423353022158E-4
130-131	0.003993380083715467	4.0512551573925035E-4	8.267867668147965E-6	2.8317446763406783E-4	0.15022302159641446	2.9971020297036373E-4
132-133	0.00405332212430954	4.092594495733243E-4	8.267867668147965E-6	2.914423353022158E-4	0.1508885849437004	3.0177716988740073E-4
134-135	0.004152536536327316	4.092594495733243E-4	8.267867668147965E-6	2.935093022192528E-4	0.1517236395781833	3.0177716988740073E-4
136-137	0.004243483080676944	4.1959428415850924E-4	8.267867668147965E-6	2.935093022192528E-4	0.1525669620803344	3.0177716988740073E-4
138-139	0.004334429625026571	4.4439788716295315E-4	8.267867668147965E-6	2.935093022192528E-4	0.1532655968982929	3.0177716988740073E-4
>>END_MODULE
