##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.lowPi.4d.R.2.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24010193
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.979788917148646	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.866867459166194	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	35.01997693229705	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	35.02965965329808	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.949936595678345	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.89427669323608	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.84921953771884	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.98872570495372	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.960388073515276	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.98337008786227	35.2	34.0	37.0	32.0	39.0
15-19	34.98119238774965	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
20-24	34.976169879184226	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
25-29	34.96519900527247	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
30-34	34.94664708442785	35.0	34.0	37.0	31.8	39.0
35-39	34.94072794833428	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
40-44	34.88375087197342	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.80255687240832	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.781364073166756	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.763113049528584	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.75258391300728	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.73376108222037	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.72165788921397	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.69948618905313	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.689624777276876	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
85-89	34.67185524081377	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
90-94	34.658743759369194	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
95-99	34.638335926745775	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
100-104	34.602018559367686	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
105-109	34.5789157463249	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
110-114	34.5414860680212	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.51853030918993	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.49452697860446	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.46584155321034	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.42977971064205	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.40115658378922	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.364242411545796	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.33760678225285	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	34.3197339563243	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	14.0
22	227.0
23	2658.0
24	18166.0
25	73915.0
26	187223.0
27	340344.0
28	496855.0
29	642838.0
30	799557.0
31	1008346.0
32	1313515.0
33	1787645.0
34	2622628.0
35	4442220.0
36	9134847.0
37	1139182.0
38	12.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.78658227340931	11.150975298637453	15.413221576073735	37.64922085187949
2	23.275943212735005	12.314559845718723	35.37469452530369	29.034802416242584
3	21.77232196368658	16.937986236341526	28.224691803720305	33.06499999625159
4	26.522869087810403	24.02181744879455	22.231103192234613	27.224210271160437
5	26.477180048757663	29.951952867980047	24.326329330224763	19.244537753037523
6	19.715363043750973	36.68219842230149	25.168516133417494	18.433922400530044
7	16.120050571949825	25.312438723826276	40.16975238969789	18.39775831452601
8	18.473077370323935	24.85813907926219	31.314466523638185	25.354317026775693
9	19.68029298916697	23.092850942211115	32.707513828202224	24.519342240419697
10-14	20.13513420309674	29.39371331779968	27.205784967641844	23.265367511461736
15-19	20.38266191313364	27.964766941908252	27.954872795200654	23.697698349757452
20-24	20.502318335160837	28.14326258073207	27.72961104033922	23.62480804376787
25-29	20.532508807908503	28.263093554341413	27.59386593493542	23.61053170281466
30-34	20.45967634594874	28.061751729795436	27.634944560440566	23.843627363815255
35-39	20.543159906139024	27.96782739077936	27.694740236383712	23.7942724666979
40-44	20.55606887585165	28.043062617527458	27.64591447337886	23.754954033242033
45-49	20.6417786381996	27.83315166144377	27.59547869938293	23.929591000973698
50-54	20.78467141808358	27.809898009175388	27.67720885472327	23.72822171801776
55-59	20.747721662525194	27.834981962195915	27.615203375429914	23.802092999848973
60-64	20.724592244788212	27.774145727195116	27.565233657711154	23.936028370305518
65-69	20.803416093444664	27.691103031056652	27.670748237576927	23.83473263792176
70-74	20.94740214979397	27.616156435015892	27.63780979242706	23.79863162276308
75-79	20.95983403915168	27.53692544493969	27.6521752936221	23.85106522228653
80-84	21.02036993961092	27.537164618191447	27.581178531482642	23.861286910714995
85-89	20.968939776978576	27.55154307034435	27.672601171677425	23.806915980999648
90-94	20.96887874160737	27.496166947814913	27.589762525357653	23.945191785220064
95-99	21.058011076185952	27.38640911917375	27.715211159317736	23.840368645322567
100-104	21.124677918908	27.448564317659883	27.56160506837322	23.865152695058896
105-109	21.08125707910492	27.30865200647914	27.678812934104858	23.931277980311084
110-114	21.14302041682764	27.29101069516262	27.72332829676386	23.842640591245882
115-119	21.149950325067397	27.307928522407533	27.731035500146646	23.811085652378427
120-124	21.12655669390541	27.208056877627975	27.74697307574768	23.91841335271894
125-129	21.17308040830769	27.132827712407764	27.78558111144903	23.908510767835512
130-134	21.22274231790339	27.255520507359567	27.68630650286013	23.835430671876917
135-139	21.226359948594702	27.09766132978912	27.830236233855242	23.845742487760937
140-144	21.263573122915517	27.02049892766113	27.953681557962152	23.762246391461204
145-149	21.252918677073474	27.691907783802748	27.55158604580003	23.50358749332375
150	21.17211428099246	27.27718714163492	27.584399753403595	23.96629882396903
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	1.0
9	1.0
10	2.0
11	8.0
12	15.0
13	23.0
14	43.5
15	85.5
16	177.0
17	350.0
18	686.0
19	1347.5
20	2525.5
21	4214.5
22	6560.5
23	10204.5
24	15686.5
25	23965.5
26	35205.0
27	49339.0
28	66442.5
29	92025.5
30	124455.0
31	157385.5
32	190029.0
33	226989.5
34	267433.0
35	316107.5
36	390661.5
37	491159.0
38	611581.5
39	761274.0
40	933876.5
41	1103492.0
42	1270491.5
43	1443080.5
44	1583361.0
45	1659594.0
46	1668650.0
47	1617337.5
48	1525845.0
49	1392984.0
50	1224233.5
51	1046941.5
52	870154.5
53	699396.5
54	545513.0
55	413391.0
56	308989.0
57	231216.0
58	175545.0
59	132707.0
60	94112.5
61	67069.0
62	49544.0
63	32326.0
64	19912.5
65	14871.0
66	14185.0
67	11498.5
68	6106.5
69	2779.0
70	2194.5
71	1581.0
72	703.0
73	250.0
74	121.0
75	72.0
76	39.0
77	27.5
78	14.5
79	2.0
80	0.5
81	0.5
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	2.49893867991815E-4
2	8.746285379713524E-5
3	2.9154284599045078E-5
4	2.2073958339276993E-4
5	7.913305819740808E-5
6	1.207820361960439E-4
7	1.8742040099386124E-4
8	2.3739917459222423E-4
9	9.162775159699883E-5
10-14	1.9408423747364298E-4
15-19	1.566001572748707E-4
20-24	1.3410970915560735E-4
25-29	2.757162343509692E-4
30-34	4.148238208664129E-4
35-39	5.38104795742375E-4
40-44	2.4739492931189687E-4
45-49	2.398981132721424E-4
50-54	3.8317059758744964E-4
55-59	4.981217768636845E-4
60-64	7.796688681344627E-4
65-69	5.156143476231116E-4
70-74	2.4822790887186954E-4
75-79	4.014961479068494E-4
80-84	2.415640723920878E-4
85-89	2.882109277505599E-4
90-94	3.506843947485137E-4
95-99	5.122824293832207E-4
100-104	3.773397406676406E-4
105-109	3.973312501069858E-4
110-114	2.798811321508328E-4
115-119	3.956652909870404E-4
120-124	3.2402904882938675E-4
125-129	3.515173743084864E-4
130-134	3.373567217889502E-4
135-139	2.5489174535165126E-4
140-144	2.4572897019195137E-4
145-149	3.565152516683227E-4
150	4.623036557848577E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4010193E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	50.683848545563606
#Duplication Level	Percentage of total
1	38.51387511134967
2	11.528717472430161
3	6.717045791460015
4	4.7017426980713255
5	3.561316456204666
6	2.836738104856266
7	2.263591012072318
8	1.8987868058530672
9	1.603144389379372
>10	17.690384740520372
>50	4.104269789724556
>100	3.8331902219198493
>500	0.37260844519341
>1k	0.3745889609648424
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.2494693399590749E-5	0.0	0.0	1.3327672959563466E-4	4.9978773598362996E-5
2	4.164897799863583E-6	9.579264939686241E-5	0.0	8.329795599727166E-6	0.001507693003550617	5.830856919809016E-5
3	8.329795599727166E-6	1.0828734279645316E-4	0.0	8.329795599727166E-6	0.0024489599063197867	9.995754719672599E-5
4	1.2494693399590749E-5	1.1661713839618032E-4	0.0	8.329795599727166E-6	0.0036734398594796803	1.249469339959075E-4
5	1.2494693399590749E-5	1.1661713839618032E-4	0.0	1.2494693399590749E-5	0.0048312814478417565	1.249469339959075E-4
6	2.0824488999317915E-5	1.1661713839618032E-4	0.0	1.2494693399590749E-5	0.0059599687516047875	1.2911183179577107E-4
7	2.4989386799181498E-5	1.3744162739549824E-4	0.0	1.2494693399590749E-5	0.007226097682763316	1.2911183179577107E-4
8	4.9978773598362996E-5	1.4160652519536182E-4	0.0	1.2494693399590749E-5	0.009121126181701246	1.3744162739549824E-4
9	6.247346699795375E-5	1.4160652519536182E-4	0.0	1.2494693399590749E-5	0.012203150553600299	1.5410121859495257E-4
10-11	1.1245224059631674E-4	1.49936320795089E-4	0.0	1.457714229952254E-5	0.016484665491860062	1.8325550319399765E-4
12-13	1.6034856529474796E-4	1.49936320795089E-4	0.0	2.0824488999317915E-5	0.020024828621744106	2.1657468559290632E-4
14-15	1.770081564942023E-4	1.49936320795089E-4	0.0	2.0824488999317915E-5	0.02429176641770435	2.3531672569229243E-4
16-17	2.2490448119263348E-4	1.6034856529474796E-4	0.0	2.0824488999317915E-5	0.028694063392160157	2.519763168917468E-4
18-19	2.7071835699113287E-4	1.6867836089447513E-4	0.0	2.0824488999317915E-5	0.0323779154961395	2.582236635915421E-4
20-21	2.9570774379031437E-4	1.9158529879372482E-4	0.0	2.0824488999317915E-5	0.03582645087442654	2.728008058910647E-4
22-23	3.540163129884046E-4	2.0824488999317915E-4	0.0	2.0824488999317915E-5	0.039389520942209835	2.873779481905872E-4
24-25	4.0607753548669933E-4	2.2906937899249707E-4	0.0	2.0824488999317915E-5	0.043421142012477786	2.873779481905872E-4
26-27	4.664685535847213E-4	2.3323427679236065E-4	0.0	2.0824488999317915E-5	0.04742777369594656	2.99872641590178E-4
28-29	4.977052870836982E-4	2.3323427679236065E-4	0.0	2.2906937899249707E-5	0.05183007067040236	3.206971305894959E-4
30-31	5.39354265082334E-4	2.3323427679236065E-4	0.0	2.915428459904508E-5	0.05653432273534828	3.3110937508915484E-4
32-33	5.768383452811063E-4	2.3323427679236065E-4	0.0	3.123673349897687E-5	0.060465986258419493	3.8525304648738144E-4
34-35	6.164048743798103E-4	2.3323427679236065E-4	0.0	4.164897799863583E-5	0.06418315754479775	4.0815998438663113E-4
36-37	6.205697721796738E-4	2.3323427679236065E-4	0.0	4.373142689856762E-5	0.06792740066687511	4.102424332865629E-4
38-39	6.372293633791282E-4	2.3739917459222423E-4	0.0	4.581387579849941E-5	0.0724129955973282	4.123248821864947E-4
40-41	6.851256880775594E-4	2.4156407239208781E-4	0.0	4.581387579849941E-5	0.07590317995361387	4.144073310864265E-4
42-43	6.892905858774229E-4	2.4572897019195137E-4	0.0	4.581387579849941E-5	0.0791872018688063	4.2065467778622186E-4
44-45	7.184448704764681E-4	2.665534591912693E-4	0.0	4.581387579849941E-5	0.08319799845007493	4.28984473385949E-4
46-47	7.475991550755131E-4	2.665534591912693E-4	0.0	4.581387579849941E-5	0.08701304483474998	4.4980896238526696E-4
48-49	7.809183374744218E-4	2.7696570369092823E-4	0.0	4.7896324698431205E-5	0.0907489581612276	4.7271590028451666E-4
50-51	7.871656841742172E-4	2.915428459904508E-4	0.0	4.9978773598362996E-5	0.09488053677869229	4.8312814478417563E-4
52-53	8.371444577725802E-4	2.915428459904508E-4	0.0	4.9978773598362996E-5	0.09904335212965593	4.893754914839709E-4
54-55	9.246073115697154E-4	2.915428459904508E-4	0.0	5.414367139822658E-5	0.10271054464243581	4.9978773598363E-4
56-57	9.516791472688286E-4	3.019550904901098E-4	0.0	5.414367139822658E-5	0.1071565730437902	5.143648782831525E-4
58-59	9.80833431867874E-4	3.165322327896323E-4	0.0	6.663836479781733E-5	0.11098411412186482	5.185297760830161E-4
60-61	0.001037059552166032	3.248620283893595E-4	0.0	6.663836479781733E-5	0.11436184623755419	5.206122249829479E-4
62-63	0.0010662138367650772	3.3527427288901845E-4	0.0	7.080326259768091E-5	0.11760005427694813	5.247771227828114E-4
64-65	0.0010849558768644633	3.373567217889502E-4	0.0	7.705060929747629E-5	0.12210855614530045	5.331069183825386E-4
66-67	0.0010912032235642587	3.519338640884728E-4	0.0	7.913305819740808E-5	0.12629844333196322	5.331069183825386E-4
68-69	0.0011307697526629628	3.7275835308779067E-4	0.0	8.329795599727166E-5	0.12928051015666553	5.476840606820612E-4
70-71	0.0011640889350618714	3.89417944287245E-4	0.0	8.538040489720345E-5	0.1319377149529785	5.580963051817201E-4
72-73	0.0011890783218610529	3.9358284208710855E-4	0.0	8.746285379713524E-5	0.13496976055127918	5.643436518815155E-4
74-75	0.0012140677086602343	4.019126376868358E-4	0.0	8.954530269706703E-5	0.13822046328407273	5.664261007814473E-4
76-77	0.0012473868910591432	4.102424332865629E-4	0.0	9.162775159699883E-5	0.14074230890189013	5.747558963811745E-4
78-79	0.0012911183179577107	4.123248821864947E-4	0.0	1.0412244499658958E-4	0.14334953492460473	5.78920794181038E-4
80-81	0.0013119428069570285	4.123248821864947E-4	0.0	1.1245224059631674E-4	0.14619624257081149	5.872505897807651E-4
82-83	0.0013369321937562102	4.144073310864265E-4	0.0	1.1661713839618032E-4	0.14868268655733005	5.914154875806287E-4
84-85	0.0013660864783552552	4.2273712668615366E-4	0.0	1.1661713839618032E-4	0.1508942472890576	5.914154875806287E-4
86-87	0.001436889740952936	4.28984473385949E-4	0.0	1.1869958729611212E-4	0.15281010027699488	5.914154875806287E-4
88-89	0.001478538718951572	4.3314937118581263E-4	0.0	1.249469339959075E-4	0.1548238283632289	5.914154875806287E-4
90-91	0.0014910334123511627	4.3314937118581263E-4	0.0	1.249469339959075E-4	0.15733942663434652	5.955803853804923E-4
92-93	0.001528517492549935	4.3523182008574444E-4	0.0	1.249469339959075E-4	0.16001745591965877	6.018277320802878E-4
94-95	0.0015764138172483662	4.39396717885608E-4	0.0	1.249469339959075E-4	0.1630557488646593	6.080750787800832E-4
96-97	0.0016347223864464563	4.4356161568547155E-4	2.0824488999317915E-6	1.249469339959075E-4	0.1654214108149818	6.122399765799467E-4
98-99	0.0017013607512442737	4.4980896238526696E-4	4.164897799863583E-6	1.249469339959075E-4	0.16749344747041392	6.143224254798785E-4
100-101	0.0017555044226425002	4.5189141128519877E-4	4.164897799863583E-6	1.249469339959075E-4	0.16963628738844372	6.184873232797421E-4
102-103	0.001786741156141477	4.5813875798499413E-4	4.164897799863583E-6	1.249469339959075E-4	0.17147717221598344	6.205697721796739E-4
104-105	0.0018221427874403175	4.5813875798499413E-4	4.164897799863583E-6	1.270293828958393E-4	0.1733013974523237	6.268171188794692E-4
106-107	0.0018991933967377936	4.5813875798499413E-4	4.164897799863583E-6	1.2911183179577107E-4	0.1749777688167688	6.28899567779401E-4
108-109	0.0019616668637357474	4.5813875798499413E-4	4.164897799863583E-6	1.2911183179577107E-4	0.1765375230428177	6.28899567779401E-4
110-111	0.0020158105351339743	4.623036557848577E-4	4.164897799863583E-6	1.2911183179577107E-4	0.17797441278377063	6.28899567779401E-4
112-113	0.002065789308732337	4.623036557848577E-4	4.164897799863583E-6	1.2911183179577107E-4	0.1794342094626228	6.28899567779401E-4
114-115	0.0021240978779304273	4.685510024846531E-4	4.164897799863583E-6	1.3327672959563466E-4	0.1811668069473661	6.309820166793328E-4
116-117	0.0021594995092292677	4.7063345138458485E-4	4.164897799863583E-6	1.3744162739549824E-4	0.18272031382671516	6.330644655792646E-4
118-119	0.002217808078427358	4.852105936841074E-4	4.164897799863583E-6	1.3744162739549824E-4	0.18419052275006703	6.330644655792646E-4
120-121	0.002303188483324561	4.977052870836982E-4	4.164897799863583E-6	1.4160652519536182E-4	0.18565448432671905	6.330644655792646E-4
122-123	0.0024093933772210826	5.039526337834936E-4	4.164897799863583E-6	1.4160652519536182E-4	0.18703306549847393	6.351469144791964E-4
124-125	0.0024531248041196503	5.039526337834936E-4	4.164897799863583E-6	1.457714229952254E-4	0.18875316828981759	6.372293633791282E-4
126-127	0.0024822790887186956	5.081175315833571E-4	4.164897799863583E-6	1.457714229952254E-4	0.19041912740976302	6.434767100789235E-4
128-129	0.0025093509244178084	5.081175315833571E-4	4.164897799863583E-6	1.457714229952254E-4	0.19183311021281668	6.455591589788553E-4
130-131	0.002548917453516513	5.185297760830161E-4	4.164897799863583E-6	1.520187696950208E-4	0.19316171261097317	6.455591589788553E-4
132-133	0.002607226022714603	5.247771227828114E-4	4.164897799863583E-6	1.6034856529474796E-4	0.1943612031773339	6.455591589788553E-4
134-135	0.002684276632012079	5.247771227828114E-4	4.164897799863583E-6	1.6867836089447513E-4	0.19548364313439712	6.476416078787871E-4
136-137	0.0027800692814089418	5.28942020582675E-4	4.164897799863583E-6	1.707608097944069E-4	0.1966872985985577	6.518065056786508E-4
138-139	0.002840460299506964	5.456016117821293E-4	4.164897799863583E-6	1.707608097944069E-4	0.19783472794242013	6.538889545785826E-4
>>END_MODULE
