##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.lowPi.4d.R.2.R2.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24010193
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	36.02889801843742	37.0	35.0	38.0	33.0	39.0
2	35.53718197933686	35.0	34.0	38.0	33.0	39.0
3	35.64404097043285	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
4	35.75193073208533	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
5	35.68188914599729	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
6	35.61030917160891	36.0	35.0	37.0	33.0	39.0
7	35.56048895566978	35.0	34.0	38.0	33.0	39.0
8	35.73483807481264	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
9	35.70960762372881	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
10-14	35.63081849446191	36.0	35.0	37.8	33.0	39.0
15-19	35.64297348213736	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
20-24	35.62326815115564	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
25-29	35.60539020240279	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
30-34	35.57723241958114	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
35-39	35.557838547986684	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
40-44	35.53391136006279	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
45-49	35.50042055888514	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
50-54	35.47994304752153	36.0	34.8	38.0	33.0	39.0
55-59	35.44724199426469	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
60-64	35.40921172936844	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
65-69	35.37074891484629	36.0	34.0	38.0	32.4	39.0
70-74	35.33722207897288	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
75-79	35.29107890136493	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
80-84	35.251439944693495	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
85-89	35.20633107780517	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
90-94	35.14929246091441	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
95-99	35.08390453171284	36.0	34.0	37.6	32.0	39.0
100-104	35.02916832863443	36.0	34.0	37.4	31.8	39.0
105-109	34.96302098029783	35.4	34.0	37.0	31.2	39.0
110-114	34.899356094305446	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
115-119	34.82540313607642	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
120-124	34.74674374337599	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
125-129	34.68220876025445	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
130-134	34.58767098623489	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.4917028946831	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.38993195931412	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.30078242186558	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	34.22734248741774	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	6.0
21	214.0
22	1617.0
23	8191.0
24	27108.0
25	65770.0
26	132444.0
27	230491.0
28	334473.0
29	433618.0
30	551422.0
31	719421.0
32	975851.0
33	1400392.0
34	2208558.0
35	4028040.0
36	1.1145768E7
37	1746807.0
38	2.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	warn
#Base	G	A	T	C
1	33.31998761192747	19.10709418733511	16.8144303052637	30.758487895473724
2	25.170305794709773	25.028486859726616	32.46751910740576	17.33368823815785
3	20.38865326905119	29.197537062696664	30.462245763705443	19.951563904546706
4	24.012631802361266	33.355380914904806	22.644175440163078	19.987811842570853
5	25.82563687953849	35.00938268215431	22.38276978376516	16.782210654542038
6	19.161037147848	39.50098610202758	22.453497145982958	18.884479604141458
7	20.573696370274757	21.12566196888388	38.074510191338746	20.22613146950262
8	21.571589265092094	23.656732940744497	28.498476813513197	26.27320098065022
9	23.706303556423038	23.08971956575774	28.991846462535577	24.212130415283642
10-14	23.08924283374571	29.567402839937046	25.70476568077368	21.638588645543567
15-19	23.03211326149784	28.470055434123793	27.124921712415407	21.37290959196296
20-24	23.110427308935	28.54825032018693	27.022242595051193	21.319079775826875
25-29	23.236396308850995	28.418311339688106	26.941082897584373	21.404209453876526
30-34	23.191313789106154	28.237620580559263	27.1692276692653	21.401837961069283
35-39	23.308345945476955	28.164574338611725	27.11089100459035	21.41618871132097
40-44	23.410701446673084	27.951686185946112	27.26079961123178	21.376812756149025
45-49	23.43537449645136	27.770257638247703	27.337723835353795	21.456644029947146
50-54	23.477202319105135	27.74225522442923	27.302726881128425	21.47781557533721
55-59	23.637279383801705	27.616247816083778	27.248535653170304	21.497937146944217
60-64	23.534306450597878	27.590654519103612	27.304860898036097	21.57017813226241
65-69	23.644513811280067	27.515885440820902	27.271824928687575	21.567775819211448
70-74	23.711479734556733	27.45011443639886	27.181905844587806	21.6564999844566
75-79	23.6319041667012	27.542566609106387	27.25354852416222	21.571980700030192
80-84	23.76466111705141	27.57672710086087	27.093797205211974	21.564814576875747
85-89	23.76524920062075	27.57187666088315	27.1600690590034	21.5028050794927
90-94	23.71975768791196	27.48912930437502	27.200866731891743	21.590246275821272
95-99	23.7624203195648	27.595783347233127	27.221757174330563	21.42003915887151
100-104	23.9749963521742	27.540162255924592	27.032684444188927	21.452156947712282
105-109	23.72679342855417	27.70475402183987	27.156477703556615	21.41197484604934
110-114	23.760333788237354	27.70797469224841	27.05958840064301	21.47210311887122
115-119	23.82266334820935	27.694174117585597	27.114556114684763	21.368606419520297
120-124	23.80023267618049	27.613548962309466	27.2675792318704	21.31863912963965
125-129	23.752788222115303	27.720507331540524	27.234296321304814	21.292408125039366
130-134	23.824432398356816	27.608940919383695	27.330771560228605	21.23585512203088
135-139	23.70189630463942	27.61002735471579	27.4382186552038	21.249857685440993
140-144	23.73905219120106	27.72254873355286	27.400473852088354	21.137925223157726
145-149	23.86675025894211	28.358186875049274	26.807230579112794	20.967832286895817
150	23.453618219562	28.26468325348322	26.979216701839924	21.302481825114857
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	1.0
1	3.0
2	13.5
3	33.5
4	46.5
5	50.5
6	49.0
7	43.5
8	37.0
9	27.5
10	18.5
11	15.5
12	23.0
13	22.0
14	23.5
15	44.5
16	70.5
17	120.0
18	222.0
19	431.0
20	723.0
21	1144.5
22	1738.0
23	2905.5
24	5058.5
25	8101.0
26	12174.5
27	19033.5
28	30122.0
29	44091.0
30	60857.5
31	81463.5
32	109959.0
33	146964.0
34	193893.0
35	265936.5
36	370694.0
37	494940.5
38	642280.0
39	831205.5
40	1050724.0
41	1250800.0
42	1424768.0
43	1584074.0
44	1693640.5
45	1738500.0
46	1724010.0
47	1658175.5
48	1546025.0
49	1395096.5
50	1211872.5
51	1014470.5
52	827319.0
53	656836.0
54	510647.5
55	386725.5
56	285279.5
57	212111.5
58	156703.5
59	112472.5
60	78398.5
61	52863.5
62	36062.5
63	24627.0
64	16343.5
65	10841.5
66	7340.0
67	5403.0
68	4749.5
69	3503.5
70	1967.5
71	1233.0
72	650.5
73	448.5
74	391.5
75	262.0
76	181.0
77	71.0
78	16.5
79	4.0
80	1.5
81	0.5
82	1.0
83	0.5
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	4.164897799863583E-6
2	0.0
3	0.0
4	4.164897799863583E-6
5	4.164897799863583E-6
6	0.0
7	4.164897799863583E-6
8	4.164897799863583E-6
9	4.164897799863583E-6
10-14	0.10705286708857359
15-19	8.329795599727166E-7
20-24	0.0
25-29	0.0
30-34	0.0
35-39	8.329795599727166E-7
40-44	0.0
45-49	8.329795599727166E-7
50-54	3.3319182398908665E-6
55-59	0.0
60-64	0.0
65-69	0.0
70-74	8.329795599727166E-7
75-79	0.0
80-84	0.0
85-89	0.0
90-94	0.0
95-99	6.663836479781733E-6
100-104	1.6659591199454332E-6
105-109	1.6659591199454332E-6
110-114	0.0
115-119	8.329795599727166E-7
120-124	0.0
125-129	1.6659591199454332E-6
130-134	0.0
135-139	8.329795599727166E-7
140-144	8.329795599727166E-7
145-149	0.0
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4010193E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	39.00571056089605
#Duplication Level	Percentage of total
1	25.893742125020808
2	11.416749601457415
3	7.360934716017435
4	5.411413084388528
5	4.0677193822372
6	3.4055166608549006
7	2.6886882177147364
8	2.237795325919271
9	1.915430927419358
>10	22.218695220305584
>50	5.413586256052808
>100	5.967863377960966
>500	0.894012196823986
>1k	0.9862153781323154
>5k	0.07568188520903658
>10k+	0.045955644485797656
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.001578496266148298	0.0
2	1.6659591199454332E-5	1.2494693399590749E-5	0.0	0.0	0.005743394066011881	0.0
3	5.830856919809016E-5	1.2494693399590749E-5	0.0	0.0	0.007384363799158133	0.0
4	7.49681603975445E-5	1.6659591199454332E-5	0.0	0.0	0.00862550334351748	0.0
5	7.49681603975445E-5	1.6659591199454332E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.010358100828260731	0.0
6	8.746285379713524E-5	1.6659591199454332E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.011907442809809984	0.0
7	1.0828734279645316E-4	1.6659591199454332E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.013977397016342184	0.0
8	1.3327672959563466E-4	2.4989386799181498E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.019420918440763886	0.0
9	1.457714229952254E-4	2.915428459904508E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.025068519857378905	0.0
10-11	1.6659591199454332E-4	3.123673349897687E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.03136168043297278	0.0
12-13	2.0407999219331557E-4	3.3319182398908664E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.03743618387407381	0.0
14-15	2.4156407239208781E-4	3.3319182398908664E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.046336570472382294	0.0
16-17	2.7696570369092823E-4	3.748408019877225E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.05196334739999799	0.0
18-19	3.165322327896323E-4	4.9978773598362996E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.060022424642734024	0.0
20-21	3.7067590418785886E-4	5.830856919809016E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.06566794361044911	0.0
22-23	4.2273712668615366E-4	7.28857114976127E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.07140300788086126	0.0
24-25	4.706334513845849E-4	8.538040489720345E-5	0.0	4.164897799863583E-6	0.07694856930137962	0.0
26-27	4.935403892838345E-4	1.0412244499658958E-4	0.0	4.164897799863583E-6	0.08065324589435828	0.0
28-29	5.747558963811744E-4	1.0828734279645316E-4	0.0	4.164897799863583E-6	0.08448286942133285	0.0
30-31	6.892905858774229E-4	1.1453468949624853E-4	2.0824488999317915E-6	4.164897799863583E-6	0.08934747005157351	0.0
32-33	7.892481330741489E-4	1.2286448509597569E-4	4.164897799863583E-6	1.2494693399590749E-5	0.09417666905051533	0.0
34-35	8.892056802708749E-4	1.3119428069570285E-4	4.164897799863583E-6	1.2494693399590749E-5	0.09718164281311692	0.0
36-37	9.246073115697154E-4	1.3744162739549824E-4	4.164897799863583E-6	1.2494693399590749E-5	0.10071347614740123	0.0
38-39	9.849983296677375E-4	1.4160652519536182E-4	4.164897799863583E-6	1.2494693399590749E-5	0.1039600139823949	4.164897799863583E-6
40-41	0.0010245648587664414	1.457714229952254E-4	1.2494693399590749E-5	1.2494693399590749E-5	0.10682754611760098	4.164897799863583E-6
42-43	0.0010349771032661004	1.49936320795089E-4	1.457714229952254E-5	1.2494693399590749E-5	0.10967633621270767	4.164897799863583E-6
44-45	0.0010599664900652818	1.5618366749488435E-4	1.6659591199454332E-5	1.457714229952254E-5	0.11202117367403086	4.164897799863583E-6
46-47	0.0011120277125635765	1.8742040099386124E-4	1.6659591199454332E-5	1.6659591199454332E-5	0.11452011235394902	8.329795599727166E-6
48-49	0.0011661713839618032	1.8742040099386124E-4	1.6659591199454332E-5	1.6659591199454332E-5	0.11672334329007684	1.0412244499658958E-5
50-51	0.0012036554641605755	1.957501965935884E-4	1.6659591199454332E-5	1.6659591199454332E-5	0.11874956606971049	1.2494693399590749E-5
52-53	0.0012328097487596206	1.9783264549352018E-4	1.6659591199454332E-5	2.0824488999317915E-5	0.1208007782361433	1.2494693399590749E-5
54-55	0.0012827885223579837	2.1240978779304273E-4	1.6659591199454332E-5	2.0824488999317915E-5	0.12253337572088654	1.2494693399590749E-5
56-57	0.0013369321937562102	2.144922366929745E-4	1.6659591199454332E-5	2.0824488999317915E-5	0.12438467279292591	1.2494693399590749E-5
58-59	0.0013848285184546415	2.1865713449283812E-4	1.6659591199454332E-5	2.4989386799181498E-5	0.12638798863466028	1.2494693399590749E-5
60-61	0.0014514668832524588	2.2906937899249707E-4	1.6659591199454332E-5	2.4989386799181498E-5	0.12783945551791276	1.457714229952254E-5
62-63	0.0014806211678515036	2.39481623492156E-4	1.6659591199454332E-5	2.707183569911329E-5	0.12969908238555183	2.0824488999317915E-5
64-65	0.001497280759050958	2.519763168917468E-4	1.6659591199454332E-5	2.915428459904508E-5	0.13141710272799556	2.0824488999317915E-5
66-67	0.0015243525947500713	2.665534591912693E-4	1.6659591199454332E-5	2.915428459904508E-5	0.13289147654914726	2.2906937899249707E-5
68-69	0.0015451770837493894	2.8113060149079184E-4	1.6659591199454332E-5	2.915428459904508E-5	0.13424506833410293	2.707183569911329E-5
70-71	0.0015618366749488436	2.89460397090519E-4	1.6659591199454332E-5	2.915428459904508E-5	0.1355778356300593	2.915428459904508E-5
72-73	0.001628475039746661	2.9779019269024617E-4	1.6659591199454332E-5	2.915428459904508E-5	0.13648786579932948	3.5401631298840456E-5
74-75	0.001668041568845365	3.0611998828997334E-4	1.8742040099386124E-5	2.915428459904508E-5	0.13756865677839408	3.956652909870404E-5
76-77	0.0017117729957439325	3.186146816895641E-4	2.0824488999317915E-5	2.915428459904508E-5	0.1387681473447548	4.164897799863583E-5
78-79	0.0017555044226425002	3.3319182398908664E-4	2.2906937899249707E-5	2.915428459904508E-5	0.14028625259280508	4.164897799863583E-5
80-81	0.0017638342182422274	3.519338640884728E-4	2.915428459904508E-5	2.915428459904508E-5	0.1416252672354612	4.373142689856762E-5
82-83	0.001786741156141477	3.79005699787586E-4	2.915428459904508E-5	2.915428459904508E-5	0.1429871888160166	4.7896324698431205E-5
84-85	0.0018117305429406587	3.79005699787586E-4	2.915428459904508E-5	3.123673349897687E-5	0.14441991365916967	4.9978773598362996E-5
86-87	0.001838802378639772	3.8317059758744964E-4	3.123673349897687E-5	3.3319182398908664E-5	0.1460921201258149	5.206122249829479E-5
88-89	0.0018429672764396355	3.89417944287245E-4	3.3319182398908664E-5	3.3319182398908664E-5	0.14771851271666164	5.414367139822658E-5
90-91	0.0018554619698392262	4.0815998438663113E-4	3.3319182398908664E-5	3.3319182398908664E-5	0.14872433553532868	6.455591589788554E-5
92-93	0.0018617093165390216	4.123248821864947E-4	3.5401631298840456E-5	3.748408019877225E-5	0.1495968816244001	6.663836479781733E-5
94-95	0.0018700391121387488	4.164897799863583E-4	3.748408019877225E-5	4.373142689856762E-5	0.15071515668366348	6.663836479781733E-5
96-97	0.0018742040099386124	4.206546777862219E-4	3.748408019877225E-5	4.581387579849941E-5	0.15186675092532576	6.663836479781733E-5
98-99	0.0018742040099386124	4.269020244860172E-4	3.956652909870404E-5	5.414367139822658E-5	0.1529558716999901	6.872081369774912E-5
100-101	0.0018825338055383394	4.3314937118581263E-4	4.164897799863583E-5	5.414367139822658E-5	0.15382008799346178	7.080326259768091E-5
102-103	0.001886698703338203	4.3314937118581263E-4	4.373142689856762E-5	5.414367139822658E-5	0.154698881429233	7.080326259768091E-5
104-105	0.0018908636011380666	4.3314937118581263E-4	4.581387579849941E-5	5.414367139822658E-5	0.1555318609892057	7.705060929747629E-5
106-107	0.0019200178857371117	4.3314937118581263E-4	4.581387579849941E-5	5.414367139822658E-5	0.15626904789978158	8.121550709733987E-5
108-109	0.0019221003346370435	4.4356161568547155E-4	4.581387579849941E-5	5.414367139822658E-5	0.15709578011305447	8.329795599727166E-5
110-111	0.001926265232436907	4.560563090850623E-4	4.581387579849941E-5	5.414367139822658E-5	0.15797665599772565	8.538040489720345E-5
112-113	0.0019304301302367707	4.706334513845849E-4	4.581387579849941E-5	5.414367139822658E-5	0.15869301841930217	8.746285379713524E-5
114-115	0.0019387599258364977	4.8312814478417563E-4	4.581387579849941E-5	5.414367139822658E-5	0.15947810165457646	8.746285379713524E-5
116-117	0.0019450072725362931	4.872930425840392E-4	4.581387579849941E-5	5.414367139822658E-5	0.160438110597445	8.954530269706703E-5
118-119	0.001961666863735748	4.914579403839027E-4	4.9978773598362996E-5	5.414367139822658E-5	0.1611773799569208	9.371020049693062E-5
120-121	0.0019679142104355426	4.914579403839027E-4	4.9978773598362996E-5	5.414367139822658E-5	0.16207908033059126	1.0203999609665778E-4
122-123	0.001978326454935202	4.977052870836982E-4	4.9978773598362996E-5	5.414367139822658E-5	0.16285375132136587	1.1036979169638495E-4
124-125	0.001984573801634997	5.060350826834254E-4	5.414367139822658E-5	5.414367139822658E-5	0.16368464843243868	1.1453468949624853E-4
126-127	0.00199915094393452	5.081175315833571E-4	5.622612029815837E-5	5.414367139822658E-5	0.16466756431320648	1.1661713839618032E-4
128-129	0.0020158105351339743	5.122824293832207E-4	5.830856919809016E-5	5.414367139822658E-5	0.16563798550057468	1.2078203619604391E-4
130-131	0.0020241403307337015	5.268595716827432E-4	5.830856919809016E-5	5.414367139822658E-5	0.1667396009686386	1.249469339959075E-4
132-133	0.0020387174730332235	5.331069183825386E-4	5.830856919809016E-5	5.414367139822658E-5	0.16765796093350854	1.270293828958393E-4
134-135	0.002059541962032542	5.414367139822657E-4	5.830856919809016E-5	5.830856919809016E-5	0.16849094049348123	1.3119428069570285E-4
136-137	0.0020741191043320644	5.49766509581993E-4	6.0391018098021954E-5	5.830856919809016E-5	0.1693780637248522	1.3744162739549824E-4
138-139	0.0020824488999317916	5.622612029815837E-4	6.247346699795375E-5	6.455591589788554E-5	0.17021520818262476	1.457714229952254E-4
>>END_MODULE
