##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.lowPi.4d.S.1.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	23132287
Total Bases	3.4 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.977403877100436	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.878895977730174	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	35.038701793730986	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	35.03024837103223	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.93474026152278	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.87411517071356	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.84307928567547	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.98457329359609	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.955907386070386	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.97869760996827	35.2	34.0	37.4	31.6	39.0
15-19	34.976462612624516	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
20-24	34.97297689588582	35.0	34.0	37.0	31.8	39.0
25-29	34.96625867559053	35.0	34.0	37.0	31.8	39.0
30-34	34.94594553491404	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.934944720338294	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.880772774434284	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.78895668206088	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.77078639911393	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.755379353541656	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.74287924060427	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.72109716605193	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.712528830374616	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.696912190307856	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.678207390389026	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
85-89	34.6679761408805	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
90-94	34.652301305097936	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
95-99	34.63127437421125	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
100-104	34.594303840342285	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.570597295459805	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.535658934198764	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.51338743116926	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.49097635698537	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.45867399103253	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.43367382567923	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.40113073125887	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.37078885455641	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.34162333365482	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	34.32910758024055	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	12.0
22	211.0
23	2709.0
24	18422.0
25	75182.0
26	188877.0
27	336962.0
28	485792.0
29	622830.0
30	772442.0
31	975380.0
32	1270544.0
33	1732631.0
34	2536071.0
35	4215874.0
36	8497244.0
37	1401100.0
38	3.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.53378657677421	10.53212586384869	14.857600869851135	38.076486689525964
2	23.422372319458226	11.416608421899387	35.19480842860863	29.966210830033756
3	21.86725203072366	15.790438387999172	27.826455085192457	34.515854496084714
4	27.086579882221606	22.98132097448688	21.993457966226902	27.938641177064618
5	27.51293604465175	29.075537093991315	23.983359346063143	19.42816751529379
6	20.52317922707436	36.056060055340886	24.850239475046628	18.570521242538128
7	16.65453424940541	25.192090122180556	39.55350888830875	18.59986674010529
8	19.118175478349613	24.381491047734063	30.938524597959454	25.561808875956864
9	19.968476923569074	22.66143472362839	32.50655145671024	24.8635368960923
10-14	20.785647810796426	28.684958764059594	26.849827133100078	23.6795662920439
15-19	21.129896544122566	27.39902444891822	27.47536639148044	23.995712615478773
20-24	21.168489298303296	27.479269870176648	27.292400870787837	24.05983996073222
25-29	21.095608379982426	27.7252617808584	26.995783732007144	24.183346107152023
30-34	21.089366138573816	27.595984437646354	27.10165839866158	24.212991025118242
35-39	21.26179534566297	27.347685194795822	27.10369926729434	24.286820192246864
40-44	21.383494509775677	27.396180891697057	26.974691475599	24.245633122928268
45-49	21.59867360872417	27.317502642091846	26.925004535877395	24.15881921330659
50-54	21.602402509705687	27.45720486789278	26.838228135777285	24.102164486624243
55-59	21.554784585388443	27.391785176167126	26.954502605936614	24.09892763250782
60-64	21.764111078677107	27.273684069824146	26.708540424334647	24.2536644271641
65-69	21.6786927658217	27.328913587815446	26.865182602435066	24.127211043927783
70-74	21.943249024601013	27.15548579582885	26.81244142424995	24.088823755320185
75-79	21.79254003449756	27.152468944635995	26.78326823515186	24.27172278571459
80-84	22.034750120999977	27.07502292471856	26.7727607482476	24.117466206033868
85-89	21.905369813773007	27.093323835239826	26.83824500173809	24.163061349249073
90-94	21.905520229326754	26.879000830288575	26.785204297746297	24.430274642638373
95-99	22.112657233681155	26.930886335138243	26.908035882982617	24.04842054819799
100-104	22.106818501639946	26.753545957215035	26.94477288509286	24.194862656052155
105-109	22.20380478111107	26.70825018149176	26.88666311409756	24.201281923299607
110-114	22.120089808609073	26.729960621495884	26.901827435941456	24.248122133953594
115-119	22.203929974123692	26.920950616584587	26.801204132600738	24.073915276690983
120-124	22.12161601028232	26.79477955032943	26.896834631593546	24.186769807794708
125-129	22.401948259540884	26.73053701362506	26.85097348651113	24.016541240322926
130-134	22.152855223343373	26.89744209082359	26.779372028011483	24.17033065782155
135-139	22.312343404507736	26.69163335323516	26.813977039946792	24.18204620231031
140-144	22.244866846092737	26.538095937553095	27.093094563840342	24.123942652513826
145-149	22.149722688657285	27.127635117442466	26.937186263017292	23.78545593088296
150	21.94229329262122	26.732732205406833	26.968455762990963	24.356518738980988
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	0.5
9	0.5
10	0.5
11	2.5
12	10.0
13	18.0
14	34.0
15	65.5
16	109.5
17	234.5
18	561.5
19	1053.0
20	1785.5
21	2865.5
22	4546.0
23	7121.5
24	11375.0
25	17149.0
26	23912.5
27	33739.0
28	49897.0
29	72297.0
30	97650.0
31	124215.0
32	153754.0
33	187715.5
34	222783.0
35	269445.0
36	334438.0
37	408985.0
38	489077.0
39	594859.0
40	738180.0
41	897737.0
42	1055477.5
43	1205904.5
44	1338338.0
45	1430485.5
46	1484691.0
47	1494542.0
48	1445322.5
49	1376489.0
50	1277751.0
51	1135995.5
52	976008.5
53	834371.0
54	697532.0
55	574861.0
56	488484.0
57	403355.5
58	331910.0
59	268696.0
60	207645.5
61	147480.0
62	87845.5
63	49262.0
64	30455.0
65	18771.5
66	12454.0
67	5978.5
68	2334.0
69	1281.0
70	1164.0
71	894.0
72	473.5
73	185.5
74	96.0
75	55.5
76	26.0
77	28.5
78	18.5
79	1.5
80	2.0
81	2.0
82	0.5
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.5
95	0.5
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	2.2911699132904584E-4
2	9.94281283126048E-5
3	6.916739360876855E-5
4	1.3401182511698907E-4
5	9.94281283126048E-5
6	9.94281283126048E-5
7	1.988562566252096E-4
8	1.8588737032356552E-4
9	1.1671997671479694E-4
10-14	1.6859552192137337E-4
15-19	2.1096055050674409E-4
20-24	1.6946011434148297E-4
25-29	3.2940971206176027E-4
30-34	4.5304642813743406E-4
35-39	5.758185517929982E-4
40-44	3.501599301443908E-4
45-49	2.0750218082630565E-4
50-54	3.3113889690197947E-4
55-59	4.5391102055754366E-4
60-64	8.032063582818249E-4
65-69	5.429640398288331E-4
70-74	2.6283609571332053E-4
75-79	4.3056702521458424E-4
80-84	2.2047106712794976E-4
85-89	2.844509062160607E-4
90-94	3.8301444210855586E-4
95-99	6.086730637571634E-4
100-104	3.6572259370636377E-4
105-109	4.64286129598859E-4
110-114	3.138470484997873E-4
115-119	3.622642240259253E-4
120-124	3.147116409198969E-4
125-129	3.9684792083030955E-4
130-134	3.87337404209104E-4
135-139	3.2768052722154106E-4
140-144	3.700455558069118E-4
145-149	3.985771056705288E-4
150	4.5823398265809167E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.3132287E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.45617310913341
#Duplication Level	Percentage of total
1	33.09524306675391
2	9.546402063518263
3	5.814787976934544
4	3.911956970647669
5	2.940147272890759
6	2.3718626297151264
7	1.940886135404974
8	1.6372115925248338
9	1.4498099931582793
>10	16.96177470082591
>50	5.275564095818225
>100	9.877391644347139
>500	2.942107717904601
>1k	2.152446869981483
>5k	0.08240726957433012
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.729184840219214E-5	0.0	0.0	1.2968886301644103E-4	3.8906658904932314E-5
2	0.0	8.213627991041267E-5	0.0	1.729184840219214E-5	0.0017853833475263384	4.755258310602838E-5
3	1.729184840219214E-5	8.64592420109607E-5	0.0	1.729184840219214E-5	0.003263836385913766	6.052146940767249E-5
4	6.484443150822052E-5	9.94281283126048E-5	0.0	2.593777260328821E-5	0.004837394590513251	6.484443150822052E-5
5	6.916739360876855E-5	9.94281283126048E-5	0.0	2.593777260328821E-5	0.006056469902867797	6.484443150822052E-5
6	1.0375109041315284E-4	9.94281283126048E-5	0.0	2.593777260328821E-5	0.007586798486461801	6.484443150822052E-5
7	1.5130367351918122E-4	1.2104293881534497E-4	0.0	2.593777260328821E-5	0.00906092856274868	6.484443150822052E-5
8	2.4208587763068995E-4	1.2536590091589302E-4	0.0	2.593777260328821E-5	0.011888145776507096	7.349035570931659E-5
9	3.0693030913891045E-4	1.2968886301644103E-4	0.0	2.593777260328821E-5	0.014918542208991269	7.349035570931659E-5
10-11	3.3935252489302077E-4	1.361733061672631E-4	0.0	2.8099253653562228E-5	0.025107763879982987	9.94281283126048E-5
12-13	3.6529029749630894E-4	1.4049626826781111E-4	0.0	3.0260734703836243E-5	0.03261674904863492	1.1239701461424891E-4
14-15	3.890665890493232E-4	1.4265774931808515E-4	0.0	3.0260734703836243E-5	0.039189812922518205	1.2752738196616703E-4
16-17	4.4310361530617356E-4	1.5346515456945525E-4	0.0	3.458369680438428E-5	0.0436748861018368	1.3401182511698907E-4
18-19	5.101095278646681E-4	1.599495977202773E-4	0.0	3.458369680438428E-5	0.04706192690761618	1.3401182511698907E-4
20-21	7.56518367595906E-4	1.7724144612246942E-4	0.0	3.458369680438428E-5	0.049979926325486104	1.3401182511698907E-4
22-23	0.0010267034988801582	1.8372588927329149E-4	0.0	3.458369680438428E-5	0.05261909468787068	1.383347872175371E-4
24-25	0.001121808665092215	1.880488513738395E-4	0.0	3.8906658904932314E-5	0.055595454094098	1.383347872175371E-4
26-27	0.0011952990208015316	1.9453329452466157E-4	0.0	4.106813995520633E-5	0.05832756614164436	1.5778811667000326E-4
28-29	0.0012644664144103002	1.9453329452466157E-4	0.0	5.187554520657642E-5	0.06158059512230676	1.599495977202773E-4
30-31	0.0014200930500300295	1.9453329452466157E-4	0.0	6.916739360876855E-5	0.06471474264520408	1.6859552192137337E-4
32-33	0.0015216826593929082	1.9453329452466157E-4	0.0	7.997479886013865E-5	0.06768894057038113	1.988562566252096E-4
34-35	0.001597334496152499	1.9453329452466157E-4	0.0	1.0375109041315284E-4	0.07072365996496585	2.0317921872575764E-4
36-37	0.001631918192956883	1.9669477557493557E-4	0.0	1.1023553356397488E-4	0.07354655421662372	2.096636618765797E-4
38-39	0.0016470485603088014	2.0317921872575764E-4	0.0	1.383347872175371E-4	0.07647752252079529	2.1830958607767578E-4
40-41	0.0017054085486661998	2.0534069977603164E-4	0.0	1.4698071141863318E-4	0.07908210718637548	2.2479402922849783E-4
42-43	0.00172702335916894	2.0750218082630568E-4	0.0	1.5130367351918122E-4	0.08174072887821252	2.2479402922849783E-4
44-45	0.001739992245470584	2.1614810502740175E-4	0.0	1.5346515456945525E-4	0.08418752542712271	2.2479402922849783E-4
46-47	0.0017745759422749684	2.1614810502740175E-4	0.0	1.6427255982082533E-4	0.08799605503770552	2.2911699132904584E-4
48-49	0.0018048366769788044	2.204710671279498E-4	0.0	1.7075700297164737E-4	0.09084056409986613	2.377629155301419E-4
50-51	0.0018242900064312706	2.2479402922849783E-4	2.1614810502740173E-6	1.7724144612246942E-4	0.09361374428736768	2.377629155301419E-4
52-53	0.001848066297984285	2.2479402922849783E-4	4.322962100548035E-6	1.7940292717274342E-4	0.09617942229404294	2.377629155301419E-4
54-55	0.0018675196274367512	2.2479402922849783E-4	4.322962100548035E-6	1.8156440822301745E-4	0.0984554618399815	2.377629155301419E-4
56-57	0.0019302025778946976	2.3127847237931987E-4	4.322962100548035E-6	1.858873703235655E-4	0.10068827176491454	2.377629155301419E-4
58-59	0.0019734321989001782	2.5289328288206E-4	4.322962100548035E-6	1.988562566252096E-4	0.1028648831825405	2.377629155301419E-4
60-61	0.0020836677324641527	2.658621691837041E-4	4.322962100548035E-6	2.0317921872575764E-4	0.1050025879412615	2.3992439658041594E-4
62-63	0.002144189201871825	2.6802365023397814E-4	4.322962100548035E-6	2.0534069977603164E-4	0.10746451485752359	2.4208587763068995E-4
64-65	0.0021787728986762097	2.723466123345262E-4	4.322962100548035E-6	2.204710671279498E-4	0.11054678683521435	2.4208587763068995E-4
66-67	0.00221119511443032	3.047688280886365E-4	4.322962100548035E-6	2.2479402922849783E-4	0.11343452551838043	2.4208587763068995E-4
68-69	0.002239294368083882	3.2422215754110265E-4	4.322962100548035E-6	2.2911699132904584E-4	0.11553548509924678	2.46408839731238E-4
70-71	0.0022695551027877184	3.350295627924727E-4	4.322962100548035E-6	2.377629155301419E-4	0.11775100317577764	2.48570320781512E-4
72-73	0.0023084617616926507	3.3935252489302077E-4	4.322962100548035E-6	2.44247358680964E-4	0.11956448577695755	2.5505476393233406E-4
74-75	0.0023214306479942947	3.501599301443908E-4	4.322962100548035E-6	2.5289328288206E-4	0.12155953278636047	2.5937772603288207E-4
76-77	0.002343045458497035	3.5448289224493883E-4	4.322962100548035E-6	2.6370068813343013E-4	0.12319361246036763	2.6370068813343013E-4
78-79	0.002384113598452241	3.5448289224493883E-4	4.322962100548035E-6	2.8963846073671836E-4	0.12460722106724684	2.6370068813343013E-4
80-81	0.0024208587763068995	3.5448289224493883E-4	4.322962100548035E-6	2.9396142283726637E-4	0.12609432002983537	2.6802365023397814E-4
82-83	0.0024489580299604614	3.5448289224493883E-4	4.322962100548035E-6	2.9396142283726637E-4	0.12774353007119443	2.6802365023397814E-4
84-85	0.00250731801831786	3.5448289224493883E-4	4.322962100548035E-6	2.9396142283726637E-4	0.12942300084725733	2.6802365023397814E-4
86-87	0.002574323930876355	3.5448289224493883E-4	4.322962100548035E-6	3.004458659880884E-4	0.1309965590518568	2.6802365023397814E-4
88-89	0.0026175535518818353	3.5448289224493883E-4	4.322962100548035E-6	3.220606764908286E-4	0.13257011725645632	2.6802365023397814E-4
90-91	0.0026542987297364933	3.5664437329521287E-4	4.322962100548035E-6	3.242221575411026E-4	0.13500178343801458	2.723466123345262E-4
92-93	0.0026953668696917	3.609673353957609E-4	4.322962100548035E-6	3.242221575411026E-4	0.13722594743874655	2.723466123345262E-4
94-95	0.0027623727822501942	3.631288164460349E-4	4.322962100548035E-6	3.242221575411026E-4	0.13892271006321166	2.723466123345262E-4
96-97	0.002816409808507045	3.76097702747679E-4	4.322962100548035E-6	3.242221575411026E-4	0.14048546086255975	2.766695744350742E-4
98-99	0.0028942231263169096	3.8690510799904915E-4	4.322962100548035E-6	3.2854511964165066E-4	0.14179531837902581	2.8315401758589626E-4
100-101	0.0029979742167300623	3.8906658904932313E-4	4.322962100548035E-6	3.328680817421987E-4	0.14328890178476517	2.853154986361703E-4
102-103	0.0030217505082830763	3.8906658904932313E-4	4.322962100548035E-6	3.350295627924727E-4	0.14460524374438205	2.853154986361703E-4
104-105	0.0030649801292885566	3.8906658904932313E-4	4.322962100548035E-6	3.3935252489302077E-4	0.14573353685262508	2.8963846073671836E-4
106-107	0.003110371231344311	3.977125132504192E-4	4.322962100548035E-6	3.436754869935688E-4	0.14687479884716975	2.8963846073671836E-4
108-109	0.0031536008523497918	3.9987399430069324E-4	4.322962100548035E-6	3.71774740647131E-4	0.1481522341478817	2.8963846073671836E-4
110-111	0.00320115343545582	4.0203547535096727E-4	4.322962100548035E-6	3.71774740647131E-4	0.14941021611914118	2.8963846073671836E-4
112-113	0.0032854511964165063	4.063584374515153E-4	4.322962100548035E-6	3.71774740647131E-4	0.15072439659770778	2.8963846073671836E-4
114-115	0.003339488222673357	4.106813995520633E-4	4.322962100548035E-6	3.73936221697405E-4	0.15219420371189413	2.8963846073671836E-4
116-117	0.0033892022868296594	4.1500436165261135E-4	4.322962100548035E-6	3.8690510799904915E-4	0.1534348938347514	2.9396142283726637E-4
118-119	0.0034173015404832217	4.1500436165261135E-4	4.322962100548035E-6	3.955510322001452E-4	0.15454805657564252	2.9828438493781443E-4
120-121	0.0035253755929969223	4.171658427028854E-4	4.322962100548035E-6	4.106813995520633E-4	0.15565689635443308	2.9828438493781443E-4
122-123	0.003730716292772954	4.1932732375315936E-4	4.322962100548035E-6	4.3661917215535157E-4	0.15670521466381598	3.0260734703836244E-4
124-125	0.0038539207126385734	4.2365028585370743E-4	4.322962100548035E-6	4.4310361530617356E-4	0.15787673739306451	3.0260734703836244E-4
126-127	0.003886342928392683	4.2797324795425544E-4	4.322962100548035E-6	4.452650963564476E-4	0.15918227194743	3.0260734703836244E-4
128-129	0.003944702916750082	4.2797324795425544E-4	4.322962100548035E-6	4.474265774067216E-4	0.1601873606358074	3.0260734703836244E-4
130-131	0.004033323639811317	4.2797324795425544E-4	4.322962100548035E-6	4.5823398265809167E-4	0.1610627604611684	3.047688280886365E-4
132-133	0.004113298438671455	4.2797324795425544E-4	4.322962100548035E-6	4.733643500100098E-4	0.16192951436232828	3.0693030913891045E-4
134-135	0.004193273237531594	4.2797324795425544E-4	4.322962100548035E-6	4.755258310602838E-4	0.16286327417604668	3.090917901891845E-4
136-137	0.004309993214246391	4.3878065320562555E-4	4.322962100548035E-6	4.755258310602838E-4	0.1638424250918208	3.112532712394585E-4
138-139	0.0044029368994081735	4.409421342558996E-4	4.322962100548035E-6	4.7768731211055785E-4	0.1647761849055392	3.112532712394585E-4
>>END_MODULE
