##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.lowPi.4d.S.2.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24035536
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.00009173916488	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.89453482543514	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	35.03318977367511	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	35.044548413648855	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.955920100970495	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.89618346767886	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.86322647433367	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	35.009722271223744	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.981519488477396	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	35.00593888149613	35.2	34.0	37.4	32.0	39.0
15-19	35.001162495398475	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
20-24	35.00127819907989	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
25-29	34.992742695648644	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
30-34	34.972968807518996	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
35-39	34.963599322270156	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
40-44	34.90881112033449	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
45-49	34.81951911536318	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.80493195575085	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.78473910463241	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.77388237982294	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.752977574537965	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.74609897611602	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.725409943011044	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.71196728876777	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
85-89	34.699076309344626	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
90-94	34.685312247665294	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
95-99	34.66181905824776	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
100-104	34.629235903039564	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
105-109	34.60331864452699	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
110-114	34.57044498612388	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.54559294205047	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.52476639588982	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.493551606255004	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.468171943409125	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.438608533631204	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.40597600985474	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.37455141420603	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	34.36752673208536	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	14.0
22	205.0
23	2536.0
24	17176.0
25	72137.0
26	185685.0
27	334988.0
28	488648.0
29	633055.0
30	792730.0
31	1002110.0
32	1312295.0
33	1791564.0
34	2627898.0
35	4393444.0
36	8943160.0
37	1437884.0
38	7.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.48839062762762	10.741601566416733	15.181452064184741	38.5885557417709
2	23.514977979048425	11.776633573005018	35.29389151114232	29.414496936804234
3	21.86870242016369	16.34708760029894	28.090310329423662	33.69389965011371
4	26.931974021420153	23.49679186955758	21.95097799945364	27.620256109568626
5	27.38623731762303	29.53016448407727	23.906462094971285	19.177136103328415
6	20.18664883749086	36.303269620657105	24.78856907966588	18.72151246218616
7	16.531904202870578	25.00205009248611	39.799611416462675	18.666434288180636
8	18.970991621965368	24.249719269063597	31.011933613114284	25.767355495856748
9	19.931431421498676	22.565414597799695	32.476704561032825	25.0264494196688
10-14	20.719475610204217	28.799659723246634	26.74056415498572	23.74030051156343
15-19	21.057154713415965	27.45242474277005	27.447939709840835	24.04248083397315
20-24	21.07751831559248	27.534917282908506	27.256158828571607	24.131405572927402
25-29	21.007178441818322	27.768571567746708	26.995969140070958	24.228280850364012
30-34	21.001487345910295	27.640279885141233	27.092375418605975	24.2658573503425
35-39	21.17509209208238	27.404820013893172	27.085362042410143	24.3347258516143
40-44	21.270532650005606	27.46073603737196	26.98566741879936	24.283063893823076
45-49	21.477303011097334	27.36638115628662	26.92711310312153	24.22920272949451
50-54	21.497770409845646	27.472076993211793	26.872009146756604	24.15814345018596
55-59	21.435830240189706	27.41622633731604	26.976144121978656	24.171799300515598
60-64	21.642060393102536	27.284611663237285	26.771033898182807	24.30229404547737
65-69	21.56485992164045	27.330356409044033	26.908867472099935	24.19591619721558
70-74	21.810008309217455	27.20998199145327	26.833326257681335	24.146683441647944
75-79	21.660510894040858	27.170643142953026	26.836228544905826	24.332617418100295
80-84	21.92855778623696	27.08715256637441	26.804701740083715	24.179587907304917
85-89	21.785110716274176	27.13715472384602	26.856461159696863	24.22127340018294
90-94	21.801324006032523	26.909421547990693	26.815317212250665	24.473937233726115
95-99	21.98126723859168	26.969140827621153	26.9260651770781	24.12352675670906
100-104	21.98418901553797	26.795399061103183	26.96375460871491	24.256657314643935
105-109	22.07003047341835	26.742762189735547	26.907706958750254	24.279500378095857
110-114	22.004821856990343	26.776575396473834	26.906396863415637	24.31220588312019
115-119	22.100116576129018	26.95558665665057	26.81858403464043	24.12571273257998
120-124	21.991759143356443	26.832975761681205	26.909464408723004	24.26580068623935
125-129	22.272334039149158	26.774306180413877	26.86278549425535	24.090574286181617
130-134	22.038669165663247	26.923246288221712	26.7880552019715	24.250029344143538
135-139	22.202268840289896	26.737269214403675	26.81471808862742	24.24574385667901
140-144	22.17313653176816	26.601170916013768	27.047432160352592	24.17826039186548
145-149	22.073288922945242	27.195567102496103	26.87145178380128	23.859692190757375
150	21.902280291293213	26.79927863182689	26.89752522920531	24.400915847674586
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	0.5
9	2.5
10	3.5
11	4.0
12	5.0
13	13.5
14	27.5
15	54.0
16	117.5
17	269.5
18	561.0
19	1028.5
20	1774.5
21	2866.5
22	4666.0
23	7355.0
24	11859.0
25	17940.5
26	24820.0
27	35186.5
28	52339.5
29	75126.5
30	100793.5
31	128351.5
32	158895.0
33	193317.5
34	229805.0
35	277007.0
36	343406.5
37	421923.0
38	507813.0
39	622695.5
40	776679.0
41	945468.5
42	1111230.0
43	1269959.0
44	1412037.5
45	1509173.5
46	1560671.0
47	1567377.0
48	1514633.0
49	1439811.0
50	1331169.0
51	1181270.5
52	1014003.0
53	857620.5
54	708989.5
55	578596.0
56	484779.0
57	399656.0
58	329798.5
59	265859.5
60	205049.5
61	145353.5
62	86312.0
63	48264.5
64	29585.0
65	18273.0
66	12206.0
67	5753.5
68	2145.5
69	1115.5
70	1033.5
71	828.0
72	430.0
73	170.0
74	87.0
75	51.5
76	28.5
77	19.5
78	11.5
79	3.5
80	2.5
81	2.0
82	0.5
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	1.7474126643150377E-4
2	7.072860784132295E-5
3	5.408658246689402E-5
4	1.7474126643150377E-4
5	7.488911418493018E-5
6	1.0817316493378804E-4
7	1.4561772202625314E-4
8	2.7459341867807735E-4
9	1.5393873471346758E-4
10-14	1.7307706389406086E-4
15-19	1.580992410570748E-4
20-24	1.3230410172670998E-4
25-29	2.8790703897762045E-4
30-34	4.368531660787594E-4
35-39	5.674930652680265E-4
40-44	2.529587856913197E-4
45-49	2.1884263367374042E-4
50-54	3.6279615316255065E-4
55-59	4.909397485456534E-4
60-64	7.846714964043239E-4
65-69	5.183990904134611E-4
70-74	2.47966178078991E-4
75-79	4.243716470479377E-4
80-84	2.504624818851554E-4
85-89	3.0038855800844214E-4
90-94	3.602998493563863E-4
95-99	6.13258635047706E-4
100-104	3.910875962990798E-4
105-109	4.0190491279245866E-4
110-114	2.737613174093559E-4
115-119	3.478183303255646E-4
120-124	3.062132668894923E-4
125-129	3.6362825443127207E-4
130-134	3.145342795767068E-4
135-139	2.79586026290406E-4
140-144	2.629440009159771E-4
145-149	3.26183697338807E-4
150	4.077296216735088E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4035536E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.64961175285072
#Duplication Level	Percentage of total
1	33.343009931585556
2	9.55434256054625
3	5.645600582343532
4	3.9748007134549104
5	2.922846561098088
6	2.340038453743345
7	1.9226949638195139
8	1.5872289831198192
9	1.514268784513319
>10	16.77618121865711
>50	5.458607092816407
>100	10.102344408790117
>500	2.785149120893791
>1k	2.0112510629131326
>5k	0.0616355617052364
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.160506343607232E-6	1.2481519030821697E-5	0.0	8.321012687214464E-6	1.5809924105707483E-4	1.2481519030821697E-5
2	8.321012687214464E-6	8.737063321575187E-5	0.0	1.2481519030821697E-5	0.0017099681072225725	2.9123544405250625E-5
3	1.6642025374428928E-5	9.569164590296634E-5	0.0	1.2481519030821697E-5	0.003332565581229393	4.1605063436072326E-5
4	6.240759515410848E-5	1.0817316493378803E-4	0.0	1.2481519030821697E-5	0.0046888906492453504	4.576556977967955E-5
5	7.488911418493018E-5	1.0817316493378803E-4	0.0	1.6642025374428928E-5	0.005866313944486197	4.576556977967955E-5
6	9.985215224657358E-5	1.0817316493378803E-4	0.0	1.6642025374428928E-5	0.007006292682634579	4.576556977967955E-5
7	1.3313620299543143E-4	1.2481519030821696E-4	0.0	1.6642025374428928E-5	0.008354296737963323	4.576556977967955E-5
8	1.9970430449314715E-4	1.2481519030821696E-4	0.0	2.0802531718036163E-5	0.010992057759810308	4.576556977967955E-5
9	2.704329123344701E-4	1.2481519030821696E-4	0.0	2.0802531718036163E-5	0.013804560048088797	4.576556977967955E-5
10-11	3.2451949480136416E-4	1.2689544348002058E-4	0.0	2.0802531718036163E-5	0.02293687147230667	5.20063292950904E-5
12-13	3.744455709246509E-4	1.289756966518242E-4	0.0	2.0802531718036163E-5	0.029872435547099927	5.4086582466894016E-5
14-15	4.160506343607232E-4	1.289756966518242E-4	0.0	2.2882784889839777E-5	0.0355536069592956	6.032734198230487E-5
16-17	4.6389645731220643E-4	1.4769797519805677E-4	0.0	2.4963038061643394E-5	0.039580977099907405	6.240759515410848E-5
18-19	5.117422802636896E-4	1.5809924105707483E-4	0.0	2.4963038061643394E-5	0.04281577078206203	7.072860784132295E-5
20-21	7.343293696466765E-4	1.78901772775111E-4	0.0	2.4963038061643394E-5	0.04581549585580284	7.488911418493018E-5
22-23	9.631572185450743E-4	1.78901772775111E-4	0.0	2.4963038061643394E-5	0.04842621358641638	7.488911418493018E-5
24-25	0.0010255648136991828	1.809820259469146E-4	0.0	2.4963038061643394E-5	0.051180468785884364	7.488911418493018E-5
26-27	0.0010713303834788623	1.830622791187182E-4	0.0	2.9123544405250625E-5	0.05359148221200476	8.321012687214464E-5
28-29	0.001171182535725436	1.830622791187182E-4	0.0	3.744455709246509E-5	0.056759707792661665	8.737063321575187E-5
30-31	0.0013500843085005468	1.830622791187182E-4	0.0	6.032734198230487E-5	0.059865525778164466	8.737063321575187E-5
32-33	0.001435374688544495	1.9138329180593268E-4	0.0	7.280886101312657E-5	0.06247624350877801	1.0401265859018081E-4
34-35	0.001501942790042211	1.9138329180593268E-4	0.0	1.040126585901808E-4	0.06528666554388468	1.1025341810559164E-4
36-37	0.001533146587619265	1.9346354497773628E-4	0.0	1.2065468396460974E-4	0.06790986479352905	1.1441392444919889E-4
38-39	0.0015414676003064796	1.955437981495399E-4	0.0	1.5809924105707483E-4	0.070643317461279	1.2065468396460974E-4
40-41	0.0015685108915399265	1.955437981495399E-4	0.0	1.78901772775111E-4	0.07314170152061514	1.2689544348002058E-4
42-43	0.0015809924105707482	1.9762405132134353E-4	0.0	1.9138329180593268E-4	0.07548198633889422	1.3313620299543143E-4
44-45	0.001610115954975999	2.0802531718036162E-4	0.0	1.9346354497773628E-4	0.07784931444840673	1.3313620299543143E-4
46-47	0.0016392394993812495	2.184265830393797E-4	0.0	1.955437981495399E-4	0.08134830028338041	1.3313620299543143E-4
48-49	0.001657961777927482	2.225870893829869E-4	0.0	1.955437981495399E-4	0.08415456181214348	1.3937696251084227E-4
50-51	0.0016725235501301072	2.2466734255479053E-4	0.0	1.955437981495399E-4	0.08675279802372621	1.4561772202625312E-4
52-53	0.0016870853223327326	2.2882784889839778E-4	0.0	1.955437981495399E-4	0.08908268157614625	1.4977822836986036E-4
54-55	0.001718289119909787	2.32988355242005E-4	0.0	1.9762405132134353E-4	0.09118165702649611	1.5393873471346758E-4
56-57	0.0017702954492048774	2.3506860841380863E-4	0.0	2.0386481083675437E-4	0.0934200094393568	1.5393873471346758E-4
58-59	0.0018181412721563605	2.3714886158561225E-4	0.0	2.1218582352396884E-4	0.09554186767459648	1.5393873471346758E-4
60-61	0.0019159131712311304	2.4130936792921947E-4	0.0	2.1218582352396884E-4	0.09767204692252338	1.560189878852712E-4
62-63	0.0019387959561209703	2.496303806164339E-4	0.0	2.1426607669577247E-4	0.09992080060124309	1.5809924105707483E-4
64-65	0.0019491972219799884	2.496303806164339E-4	0.0	2.3922911475741585E-4	0.10270417934511633	1.5809924105707483E-4
66-67	0.0019762405132134355	2.6211189964725566E-4	0.0	2.496303806164339E-4	0.10541890973432005	1.5809924105707483E-4
68-69	0.0019908022854160604	2.6627240599086285E-4	0.0	2.5379088696004116E-4	0.10748668138709284	1.664202537442893E-4
70-71	0.002032407348852133	2.6627240599086285E-4	0.0	2.6211189964725566E-4	0.10970631152140731	1.7058076008789652E-4
72-73	0.002076092665460009	2.683526591626665E-4	0.0	2.641921528190593E-4	0.11156605785699973	1.7474126643150374E-4
74-75	0.0021010557035216525	2.7459341867807735E-4	0.0	2.683526591626665E-4	0.11341748317990495	1.7474126643150374E-4
76-77	0.002123938488411492	2.7875392502168454E-4	0.0	2.766736718498809E-4	0.1148840616660265	1.7682151960330737E-4
78-79	0.0021530620328167427	2.7875392502168454E-4	0.0	3.1619848211414967E-4	0.11636104141800707	1.78901772775111E-4
80-81	0.0021759448177065825	2.7875392502168454E-4	0.0	3.1619848211414967E-4	0.11789626825879815	1.78901772775111E-4
82-83	0.002200907855768226	2.8083417819348817E-4	0.0	3.1619848211414967E-4	0.11940445180835577	1.78901772775111E-4
84-85	0.0022341919065170836	2.8915519088070266E-4	0.0	3.1619848211414967E-4	0.12119138928293507	1.78901772775111E-4
86-87	0.0022778772231249597	2.9123544405250623E-4	0.0	3.182787352859533E-4	0.12284935106086255	1.78901772775111E-4
88-89	0.0022945192484993887	2.9955645673972073E-4	0.0	3.2659974797316773E-4	0.12430136777478147	1.830622791187182E-4
90-91	0.002309081020702014	3.03716963083328E-4	0.0	3.328405074885786E-4	0.12666245512477858	1.830622791187182E-4
92-93	0.0023486058309662825	3.03716963083328E-4	4.160506343607232E-6	3.328405074885786E-4	0.128649096903851	1.830622791187182E-4
94-95	0.002383970134886944	3.03716963083328E-4	4.160506343607232E-6	3.328405074885786E-4	0.13021344728904735	1.830622791187182E-4
96-97	0.0024401369705256415	3.0787746942693517E-4	4.160506343607232E-6	3.328405074885786E-4	0.13165714299027906	1.8930303863412909E-4
98-99	0.0024900630466489285	3.1619848211414967E-4	4.160506343607232E-6	3.390812670039894E-4	0.13292817767825107	1.955437981495399E-4
100-101	0.0025857546925518947	3.2868000114497136E-4	4.160506343607232E-6	3.474022796912039E-4	0.13440099692388802	1.955437981495399E-4
102-103	0.0026252795028161636	3.2868000114497136E-4	4.160506343607232E-6	3.515627860348111E-4	0.13545568528199248	1.955437981495399E-4
104-105	0.002656483300393218	3.2868000114497136E-4	4.160506343607232E-6	3.661245582374364E-4	0.1365228551591277	2.0178455766495078E-4
106-107	0.002671045072595843	3.2868000114497136E-4	4.160506343607232E-6	3.8276658361186536E-4	0.13763579060604264	2.0386481083675437E-4
108-109	0.002708489629688308	3.30760254316775E-4	4.160506343607232E-6	4.0356911532990155E-4	0.13870296048317793	2.1218582352396884E-4
110-111	0.0027521749462961842	3.328405074885786E-4	4.160506343607232E-6	4.0356911532990155E-4	0.13978053162617218	2.1218582352396884E-4
112-113	0.002822903554137507	3.349207606603822E-4	4.160506343607232E-6	4.0356911532990155E-4	0.141064047833175	2.1634632986757606E-4
114-115	0.002872829630260794	3.4116152017579305E-4	4.160506343607232E-6	4.056493685017052E-4	0.1425451880914992	2.1634632986757606E-4
116-117	0.0029165149468686697	3.4324177334759667E-4	4.160506343607232E-6	4.11890128017116E-4	0.14358739493057282	2.1634632986757606E-4
118-119	0.0029456384912739204	3.474022796912039E-4	4.160506343607232E-6	4.2853215339154493E-4	0.14448606430079197	2.1634632986757606E-4
120-121	0.003030928871317869	3.494825328630075E-4	4.160506343607232E-6	4.38933419250563E-4	0.14545130177250884	2.1634632986757606E-4
122-123	0.0031994293782339617	3.494825328630075E-4	4.160506343607232E-6	4.4309392559417025E-4	0.14643318126960014	2.1634632986757606E-4
124-125	0.0032743184924188917	3.494825328630075E-4	4.160506343607232E-6	4.4933468510958106E-4	0.14748994988087638	2.1634632986757606E-4
126-127	0.0033096827963395533	3.57803545550222E-4	4.160506343607232E-6	4.4933468510958106E-4	0.1486403298848838	2.1634632986757606E-4
128-129	0.003376250897837269	3.5988379872202555E-4	4.160506343607232E-6	4.5557544462499194E-4	0.14959100558439803	2.184265830393797E-4
130-131	0.003494825328630075	3.702850645810437E-4	4.160506343607232E-6	4.638964573122064E-4	0.15029621140963945	2.225870893829869E-4
132-133	0.00355515267061238	3.702850645810437E-4	4.160506343607232E-6	4.722174699994209E-4	0.15104510255148876	2.2466734255479053E-4
134-135	0.003602998493563863	3.702850645810437E-4	4.160506343607232E-6	4.742977231712245E-4	0.15192921014950528	2.309081020702014E-4
136-137	0.0037132519116694547	3.786060772682581E-4	4.160506343607232E-6	4.742977231712245E-4	0.15289652787439398	2.32988355242005E-4
138-139	0.0038068633044006173	3.910875962990798E-4	4.160506343607232E-6	4.742977231712245E-4	0.1538264010421902	2.32988355242005E-4
>>END_MODULE
