##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.lowPi.4d.S.3.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24080481
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.9972754281777	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.86964213879283	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	35.03172669183809	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	35.02437094175984	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.933777111844236	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.87407502366751	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.862001884430796	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	35.000146051899875	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.97365060938775	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.98855316885074	35.2	34.0	37.4	31.6	39.0
15-19	34.9839414835609	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
20-24	34.984224409803105	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
25-29	34.975382094734734	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
30-34	34.95463328161925	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
35-39	34.94468325611935	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.88971814142749	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.798853328552696	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.78302970775376	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.76209990988137	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.75110824405875	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.729855445993785	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.72292787673136	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.70008967013574	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.68755056844587	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
85-89	34.67371533816123	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
90-94	34.65997769728936	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
95-99	34.635224562167174	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
100-104	34.60278016871839	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
105-109	34.57755762436805	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.543357128123816	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.51941881891811	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.49927622292927	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.46807707038742	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.44058080069082	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.41263207325468	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.38310331093469	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.35064237296589	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	34.34367299390739	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	6.0
22	213.0
23	2565.0
24	18361.0
25	74956.0
26	191600.0
27	340737.0
28	492316.0
29	635381.0
30	793920.0
31	1012031.0
32	1326724.0
33	1816977.0
34	2671831.0
35	4464256.0
36	8851691.0
37	1386912.0
38	4.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.40595893112522	10.874354963653882	14.853420782506092	37.8662653227148
2	23.30132010745308	12.343645039397911	35.50778755758195	28.847247295567062
3	21.86751987253406	16.662185857486513	27.897048695723242	33.573245574256184
4	26.954656650018578	23.917764971443216	21.851083808919803	27.276494569618396
5	27.215875050191123	29.664400416387515	23.90751951385632	19.21220501956504
6	20.127929476415623	36.31742008197104	24.984170772520702	18.57047966909263
7	16.70410023739189	24.45903074425358	39.82067184417557	19.016197174178956
8	19.118153938868833	24.2530070909074	30.885359289474067	25.743479680749704
9	20.123438738491856	22.74714833989585	32.21617937574	24.913233545872302
10-14	20.890775846123127	28.681866052815135	26.671231478544488	23.75612662251725
15-19	21.154347742020878	27.45903778350318	27.434506665394487	23.952107809081458
20-24	21.17243907216304	27.528210004680066	27.23425781038891	24.065093112767986
25-29	21.110882903481436	27.75802382303272	26.977678312141045	24.1534149613448
30-34	21.108599236113186	27.619750653538443	27.07448835366501	24.19716175668336
35-39	21.267849332099154	27.411590453902544	27.06929380335016	24.251266410648142
40-44	21.38483552778209	27.43224748791065	26.972772817928448	24.210144166378804
45-49	21.55573156389828	27.34714615201837	26.930677575023783	24.16644470905957
50-54	21.58744130444018	27.459726061848063	26.864613829696093	24.088218804015664
55-59	21.535412094838758	27.409121427740935	26.964224376503648	24.091242100916656
60-64	21.717632112753403	27.288517394839985	26.76587361736576	24.227976875040852
65-69	21.65667513412156	27.331867668438097	26.899692174824352	24.111765022615987
70-74	21.905344618783023	27.192076544436755	26.83467667353415	24.06790216324607
75-79	21.766833023440583	27.16592192463456	26.818484629848356	24.2487604220765
80-84	22.0086554591935	27.107533168715026	26.80081442391375	24.082996948177723
85-89	21.86844931823305	27.12850021088093	26.859954987317618	24.1430954835684
90-94	21.887701204352407	26.913644800224528	26.821863077852683	24.376790917570386
95-99	22.055633949152163	26.976366836816812	26.928665682699375	24.039333531331646
100-104	22.05722217718787	26.819429457603334	26.954047742760253	24.169300622448546
105-109	22.149028869109564	26.758313966467668	26.902404659619002	24.190252504803762
110-114	22.091075411699602	26.790554482848616	26.9104046046659	24.207965500785882
115-119	22.172495823219744	26.959502060568735	26.826534948315995	24.041467167895526
120-124	22.08538523750572	26.83868813988979	26.89741806912418	24.178508553480317
125-129	22.344957487860185	26.797282811697727	26.83987846344131	24.017881237000783
130-134	22.1303719698514	26.945090354633265	26.770026840746585	24.154510834768747
135-139	22.28566537342238	26.7453515596372	26.816445832209045	24.15253723473138
140-144	22.245752453159326	26.618790475108543	27.034914494753853	24.100542576978278
145-149	22.15082231878469	27.183137072975416	26.8792981855579	23.786742422681996
150	21.948955550336922	26.80383640045622	26.910558116076633	24.33664993313022
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	0.5
9	0.5
10	1.0
11	6.0
12	10.0
13	17.0
14	34.5
15	83.0
16	145.5
17	294.0
18	634.5
19	1065.0
20	1778.5
21	2897.5
22	4661.5
23	7324.5
24	11698.0
25	17762.5
26	25038.0
27	35636.0
28	52326.0
29	74703.5
30	100111.5
31	127169.0
32	156684.5
33	190385.0
34	226130.5
35	273491.5
36	340415.0
37	419468.0
38	508334.5
39	626193.0
40	779386.0
41	948472.5
42	1117043.5
43	1276933.0
44	1417350.5
45	1513775.0
46	1565121.0
47	1570106.0
48	1517330.5
49	1442292.5
50	1332540.5
51	1181089.5
52	1012877.0
53	855581.5
54	708604.5
55	582035.5
56	490927.5
57	405176.0
58	332504.0
59	267189.5
60	206440.5
61	145740.0
62	85661.5
63	48337.5
64	30040.0
65	19010.0
66	12716.0
67	5923.0
68	2211.5
69	1117.5
70	970.5
71	731.5
72	378.5
73	151.0
74	83.0
75	55.0
76	36.0
77	21.0
78	8.5
79	3.0
80	4.5
81	3.0
82	0.5
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.5
94	0.5
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	2.284007532906008E-4
2	7.059659647164024E-5
3	3.737466872028013E-5
4	1.5365141585004053E-4
5	1.1627674712976041E-4
6	1.0797126519192038E-4
7	1.9102608457032067E-4
8	2.6992816297980094E-4
9	1.4119319294328048E-4
10-14	1.8105950624491262E-4
15-19	1.9019553637653666E-4
20-24	1.445153857184165E-4
25-29	2.9401406059953705E-4
30-34	4.4517383186822555E-4
35-39	5.822142838425861E-4
40-44	2.80725289498993E-4
45-49	2.3587568703465684E-4
50-54	3.405247594514412E-4
55-59	5.132787837585138E-4
60-64	7.433406334366826E-4
65-69	5.166009765336498E-4
70-74	2.4168952439114483E-4
75-79	4.4434328367444156E-4
80-84	2.0182321108951269E-4
85-89	2.80725289498993E-4
90-94	3.629495606836093E-4
95-99	5.863670248115061E-4
100-104	4.0281587398524144E-4
105-109	3.803910727530733E-4
110-114	2.9733625337467306E-4
115-119	3.754077835903693E-4
120-124	3.4966078958306523E-4
125-129	3.687633980400973E-4
130-134	3.230832473819771E-4
135-139	2.499950063289849E-4
140-144	2.6494487381709694E-4
145-149	3.629495606836093E-4
150	3.986631330163214E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4080481E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.9353640144999
#Duplication Level	Percentage of total
1	33.425544698541216
2	9.796333954784801
3	5.794174672193768
4	4.019508117478429
5	2.9986491798646417
6	2.3549526263231773
7	1.9351694767011298
8	1.6493363328468142
9	1.3584649047826607
>10	17.031450103789112
>50	5.2275426842864965
>100	9.761818745391817
>500	2.6782256932083524
>1k	1.9130491997581414
>5k	0.05577961004975851
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	2.9069186782440103E-5	0.0	0.0	1.6195689778788057E-4	1.661096387568006E-5
2	8.30548193784003E-6	6.644385550272023E-5	0.0	2.0763704844600072E-5	0.001715082020163966	2.0763704844600072E-5
3	1.2458222906760043E-5	7.474933744056026E-5	0.0	2.4916445813520086E-5	0.0030356536482805305	3.322192775136012E-5
4	6.229111453380021E-5	1.0381852422300036E-4	0.0	3.737466872028013E-5	0.004526487656122816	4.1527409689200144E-5
5	7.059659647164024E-5	1.0797126519192037E-4	0.0	4.1527409689200144E-5	0.0057058660912960996	4.1527409689200144E-5
6	1.0381852422300036E-4	1.1212400616084039E-4	0.0	4.1527409689200144E-5	0.007051354165226184	4.1527409689200144E-5
7	1.2873497003652046E-4	1.1627674712976041E-4	0.0	4.1527409689200144E-5	0.008388536757218429	4.1527409689200144E-5
8	2.3670623522844083E-4	1.2042948809868042E-4	0.0	4.1527409689200144E-5	0.011008916308606958	4.1527409689200144E-5
9	3.2391379557576114E-4	1.2042948809868042E-4	0.0	4.1527409689200144E-5	0.013820321944565808	4.1527409689200144E-5
10-11	4.298086902832215E-4	1.2042948809868042E-4	0.0	4.1527409689200144E-5	0.02250785605154648	5.81383735648802E-5
12-13	4.837943228791817E-4	1.2250585858314042E-4	0.0	4.1527409689200144E-5	0.028757731209771098	7.059659647164024E-5
14-15	5.44009066928522E-4	1.2873497003652046E-4	0.0	4.3603780173660155E-5	0.03375140222489742	8.097844889394029E-5
16-17	5.834601061332621E-4	1.3081134052098046E-4	0.0	4.983289162704017E-5	0.03752001465419233	8.305481937840029E-5
18-19	6.415984796981423E-4	1.3288771100544047E-4	0.0	4.983289162704017E-5	0.04086089476368848	8.305481937840029E-5
20-21	8.409300462063029E-4	1.3704045197436047E-4	0.0	5.606200308042019E-5	0.043493732537983776	9.136030131624032E-5
22-23	0.0010589489470746037	1.4949867488112052E-4	0.0	6.644385550272023E-5	0.04599575897175808	9.136030131624032E-5
24-25	0.001146156507421924	1.5780415681896056E-4	0.0	6.644385550272023E-5	0.04878017179141895	9.136030131624032E-5
26-27	0.0012312876972847843	1.5780415681896056E-4	0.0	7.059659647164025E-5	0.05127389274325542	9.758941276962034E-5
28-29	0.0013392589624767045	1.5780415681896056E-4	0.0	7.682570792502026E-5	0.05453171803337317	1.0381852422300036E-4
30-31	0.0015697360862517655	1.5988052730342057E-4	0.0	9.136030131624032E-5	0.05773348132041051	1.1004763567638037E-4
32-33	0.0016735546104747658	1.6195689778788057E-4	0.0	1.1004763567638039E-4	0.06042238109778621	1.1835311761422042E-4
34-35	0.0017939840985734463	1.6195689778788057E-4	0.0	1.3288771100544044E-4	0.0632420922156829	1.2873497003652046E-4
36-37	0.0018189005443869663	1.6403326827234057E-4	0.0	1.4534593391220052E-4	0.06585624265561804	1.3911682245882048E-4
38-39	0.0018438169902004864	1.6610963875680058E-4	0.0	1.6195689778788057E-4	0.06859082258365187	1.432695634277405E-4
40-41	0.0018749625474673865	1.7026237972572058E-4	0.0	1.6195689778788057E-4	0.07113022368614647	1.4742230439666052E-4
42-43	0.0018770389179518466	1.7233875021018061E-4	0.0	1.6195689778788057E-4	0.07343707129438154	1.4949867488112052E-4
44-45	0.0018915735113430665	1.7856786166356063E-4	0.0	1.6403326827234057E-4	0.07585604290877745	1.4949867488112052E-4
46-47	0.0019061081047342867	1.8064423214802063E-4	0.0	1.6818600924126058E-4	0.0792695959852297	1.4949867488112052E-4
48-49	0.0019289481800633468	1.8479697311694064E-4	0.0	1.7441512069464062E-4	0.08200209954277907	1.5572778633450053E-4
50-51	0.0019497118849079469	1.8687334360140067E-4	0.0	1.7649149117910062E-4	0.08461417361222975	1.5988052730342057E-4
52-53	0.001982933812659307	1.9102608457032067E-4	0.0	1.7856786166356063E-4	0.08713696375084867	1.6403326827234057E-4
54-55	0.002028613963317427	1.9102608457032067E-4	0.0	1.7856786166356063E-4	0.08914481400932149	1.6610963875680058E-4
56-57	0.0020867523368823075	1.9102608457032067E-4	0.0	1.9102608457032067E-4	0.09140182872592952	1.7026237972572058E-4
58-59	0.0021345088580248875	2.0140793699262072E-4	0.0	2.0140793699262072E-4	0.0935051920266875	1.7026237972572058E-4
60-61	0.002248709234670188	2.0348430747708072E-4	0.0	2.0763704844600073E-4	0.09558156251114752	1.7026237972572058E-4
62-63	0.002302694867266148	2.0348430747708072E-4	0.0	2.0763704844600073E-4	0.09765793299560752	1.7441512069464062E-4
64-65	0.002337993165501968	2.0348430747708072E-4	0.0	2.1594253038384074E-4	0.10037382558928121	1.7441512069464062E-4
66-67	0.002362909611315488	2.1178978941492074E-4	0.0	2.2424801232168078E-4	0.10296305958340284	1.7441512069464062E-4
68-69	0.0023815969456756287	2.2217164183722075E-4	0.0	2.284007532906008E-4	0.10494184065509322	1.7856786166356063E-4
70-71	0.0024252007258492884	2.3047712377506082E-4	0.0	2.284007532906008E-4	0.10714071699813638	1.7856786166356063E-4
72-73	0.002450117171662809	2.3255349425952082E-4	0.0	2.3047712377506082E-4	0.10896792302446118	1.8894971408586067E-4
74-75	0.0024708808765074087	2.3255349425952082E-4	0.0	2.4501171716628085E-4	0.11095085683712048	2.0348430747708072E-4
76-77	0.0024895682108675484	2.3878260571290083E-4	0.0	2.5954631055750087E-4	0.11248114188416752	2.0763704844600073E-4
78-79	0.002531095620556749	2.4085897619736084E-4	0.0	2.7615727443318095E-4	0.11405087797041928	2.0971341893046073E-4
80-81	0.002578852141699329	2.4085897619736084E-4	0.0	2.7823364491764096E-4	0.11563514865006226	2.1594253038384074E-4
82-83	0.002597539476059469	2.4708808765074085E-4	0.0	2.7823364491764096E-4	0.11730662689005257	2.1594253038384074E-4
84-85	0.0026245322923574487	2.574699400730409E-4	0.0	2.7823364491764096E-4	0.11911514558201725	2.1594253038384074E-4
86-87	0.0026536014791398894	2.574699400730409E-4	0.0	2.7823364491764096E-4	0.12067657618633115	2.2009527135276078E-4
88-89	0.002680594295437869	2.574699400730409E-4	0.0	2.7823364491764096E-4	0.12226707597742753	2.2009527135276078E-4
90-91	0.0027034343707669295	2.6162268104196093E-4	0.0	2.7823364491764096E-4	0.1244534940975639	2.2424801232168078E-4
92-93	0.0027345799280338295	2.7200453346426094E-4	0.0	2.7823364491764096E-4	0.12629938745824887	2.2424801232168078E-4
94-95	0.0028031001540210097	2.7823364491764096E-4	0.0	2.84462756371021E-4	0.1279625602163013	2.2424801232168078E-4
96-97	0.00287369675049265	2.9276823830886103E-4	0.0	2.86539126855481E-4	0.1294845397814105	2.2424801232168078E-4
98-99	0.00295675156987105	3.0107372024670105E-4	0.0	2.9692097927778104E-4	0.13080095866855815	2.2424801232168078E-4
100-101	0.0030584937236095905	3.0522646121562105E-4	0.0	2.9899734976224104E-4	0.13215475222442608	2.2424801232168078E-4
102-103	0.0030896392808764904	3.1145557266900107E-4	0.0	3.0315009073116105E-4	0.13336112347589735	2.284007532906008E-4
104-105	0.003124937579112311	3.1145557266900107E-4	0.0	3.0937920218454106E-4	0.1346048693960889	2.3878260571290083E-4
106-107	0.003174770470739351	3.197610546068411E-4	0.0	3.1976105460684113E-4	0.13575933138544866	2.4501171716628085E-4
108-109	0.0032183742509130113	3.2806653654468115E-4	0.0	3.2391379557576114E-4	0.13684112040785232	2.4501171716628085E-4
110-111	0.0032432906967265313	3.2806653654468115E-4	0.0	3.3014290702914115E-4	0.13791045120734924	2.4501171716628085E-4
112-113	0.0033118109227137115	3.363720184825212E-4	0.0	3.3637201848252116E-4	0.13898808748878397	2.4501171716628085E-4
114-115	0.003345032850465072	3.4467750042036123E-4	0.0	3.426011299359012E-4	0.14050383794243976	2.4916445813520085E-4
116-117	0.003407323964998872	3.6336483478050126E-4	0.0	3.5298298235820124E-4	0.14165622356131508	2.4916445813520085E-4
118-119	0.003471691450017132	3.6959394623388127E-4	0.0	3.5713572332712125E-4	0.1426611868757937	2.4916445813520085E-4
120-121	0.0035651281218178326	3.7374668720280133E-4	0.0	3.716703167183413E-4	0.14368691389511695	2.5331719910412086E-4
122-123	0.003718779537667873	3.7374668720280133E-4	0.0	3.8205216914064135E-4	0.14461920424263952	2.5331719910412086E-4
124-125	0.0038267508028597937	3.7374668720280133E-4	0.0	3.9035765107848136E-4	0.14574252067473237	2.5331719910412086E-4
126-127	0.0038620491010956134	3.7582305768726134E-4	0.0	3.9243402156294136E-4	0.1470423285980043	2.574699400730409E-4
128-129	0.0039347220680517134	3.7997579865618134E-4	0.0	3.9658676253186137E-4	0.1480161463552161	2.574699400730409E-4
130-131	0.004005318664523354	3.8620491010956135E-4	0.0	4.1112135592308145E-4	0.1489692004075832	2.574699400730409E-4
132-133	0.004063457038088234	3.8620491010956135E-4	0.0	4.1527409689200146E-4	0.14973745748683343	2.574699400730409E-4
134-135	0.004136130005044335	3.8620491010956135E-4	0.0	4.1942683786092146E-4	0.15053063101189715	2.574699400730409E-4
136-137	0.004262788604596395	3.9243402156294136E-4	0.0	4.2150320834538147E-4	0.15147745595281092	2.574699400730409E-4
138-139	0.004360378017366015	4.007395035007814E-4	0.0	4.2357957882984147E-4	0.15227062947787462	2.574699400730409E-4
>>END_MODULE
