##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.lowPi.2d.S.1.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24135576
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.94701829365912	36.0	34.0	38.0	30.0	39.0
2	34.80812171211493	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.99770993656833	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.952789732467956	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.82059110584309	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.800441389921666	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.808158131382484	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.95593881828219	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.94167216063126	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.91691614900759	35.2	34.0	37.4	31.6	39.0
15-19	34.917197368730704	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
20-24	34.921131453419626	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.917064229169426	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.89467937288921	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.895763034617445	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.82694231121727	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.72666389233884	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.68911856920257	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.678694189854845	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.64770926535998	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.6321485180217	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.60422735301614	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
75-79	34.58191485465274	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.55212164814297	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.5353783974329	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.507782959064244	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.47020422466819	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.43128835209899	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.37304474523417	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.34274485928987	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.287083183761595	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.251019913508586	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
125-129	34.187936836477405	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.13979010900755	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.08051608132327	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.049788163332	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	33.97233744908346	35.0	34.0	37.0	28.8	39.0
150	33.93606384202308	35.0	34.0	37.0	28.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	2.0
21	29.0
22	456.0
23	4519.0
24	27264.0
25	98271.0
26	230603.0
27	396901.0
28	565382.0
29	726620.0
30	904815.0
31	1130849.0
32	1442221.0
33	1891972.0
34	2608266.0
35	4055496.0
36	8517854.0
37	1534050.0
38	6.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.705778946440326	10.819809117468264	14.52803160427109	37.946380331820315
2	23.24006846836201	12.5014465190671	35.9302989323581	28.32818608021279
3	21.74444714447213	16.87983557867221	27.99272276937489	33.38299450748077
4	27.010208293808336	24.39078404235806	21.789163388759274	26.80984427507433
5	27.15469929612607	30.081217880396622	23.75552566145936	19.008557162017954
6	20.087869513370748	36.418482255291266	25.02203698517718	18.471611246160798
7	16.847724847030435	24.22819976532513	39.80951725920966	19.114558128434773
8	19.312787097272455	24.064690803788668	30.933646089162757	25.688876009776116
9	20.19614379746265	22.658353289366666	32.19314009645022	24.95236281672046
10-14	21.088233977533513	28.634389188670855	26.543752000058735	23.733624833736897
15-19	21.344358594710158	27.558060811805813	27.21409737725012	23.883483216233913
20-24	21.33690269763018	27.564986365583472	27.089549719451888	24.008561217334456
25-29	21.231514551106905	27.82160294588835	26.735643962619505	24.21123854038524
30-34	21.2816278183623	27.64643634978089	26.910521182947004	24.161414648909805
35-39	21.498465791827666	27.36097010903718	26.892188629060758	24.248375470074397
40-44	21.670321472966904	27.394613260504038	26.71307164406454	24.221993622464517
45-49	21.931635321947272	27.320138837368095	26.663943578916744	24.084282261767893
50-54	21.916831187483908	27.554399222169756	26.53373278012983	23.9950368102165
55-59	21.819621056514222	27.450246366208532	26.689068639466885	24.04106393781036
60-64	22.068557516264793	27.300566980429014	26.406815704404433	24.224059798901756
65-69	21.90858406380716	27.394669194859723	26.607771011616887	24.08897572971623
70-74	22.273530439321622	27.124357449303925	26.552204126499433	24.04990798487502
75-79	22.087245549213954	27.060031707634792	26.52535898140466	24.327363761746593
80-84	22.36450454673753	26.97275726204445	26.572992659660105	24.089745531557917
85-89	22.195946940332437	26.977432000868696	26.60323524970172	24.22338580909715
90-94	22.221904478946595	26.71876577293595	26.561226797009063	24.498102951108393
95-99	22.45650979713505	26.783295620152103	26.736379675804418	24.02381490690843
100-104	22.437736420235154	26.541329896355265	26.79274331635232	24.228190367057262
105-109	22.501864535750673	26.516185582343844	26.700325138507807	24.28162474339768
110-114	22.400038727987152	26.540586418425704	26.709671670097872	24.349703183489268
115-119	22.561984107289117	26.764081718007837	26.561276867426926	24.112657307276123
120-124	22.461123249653255	26.583554797403185	26.6333884081824	24.32193354476116
125-129	22.854566928722793	26.536021440910666	26.56595571792007	24.043455912446465
130-134	22.51298141909046	26.7373169604516	26.475154141391037	24.274547479066904
135-139	22.677914612527474	26.522686105025272	26.492603491321702	24.30679579112555
140-144	22.624712078088734	26.369207974372326	26.775365082820695	24.230714864718237
145-149	22.49316020741407	26.92436649985421	26.670187672552686	23.912285620179034
150	22.185726899610543	26.484413237870687	26.76181774135068	24.56804212116809
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	1.0
9	1.5
10	1.5
11	6.0
12	10.0
13	10.5
14	16.0
15	48.0
16	109.0
17	240.5
18	558.5
19	994.0
20	1636.0
21	2646.5
22	4449.0
23	7306.0
24	11750.5
25	18030.0
26	25376.5
27	36203.5
28	56086.5
29	83311.5
30	113768.5
31	143282.5
32	173157.5
33	208504.5
34	243784.0
35	288723.0
36	355610.0
37	425320.5
38	491735.0
39	588386.5
40	725219.0
41	877960.5
42	1033460.5
43	1183615.0
44	1317496.0
45	1422806.5
46	1505385.5
47	1537168.5
48	1492566.5
49	1442625.0
50	1367994.0
51	1230703.0
52	1059232.0
53	907965.0
54	765923.0
55	635280.5
56	548451.0
57	460913.5
58	381454.0
59	310383.5
60	239494.5
61	167721.0
62	96971.0
63	53717.5
64	34661.5
65	22208.5
66	14823.5
67	7173.0
68	3200.5
69	2004.0
70	1541.5
71	1360.5
72	1285.5
73	963.5
74	515.5
75	168.0
76	46.0
77	31.5
78	14.0
79	2.5
80	2.5
81	1.5
82	0.5
83	0.5
84	0.5
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	4.308991838437997E-4
2	2.0301980777255948E-4
3	8.700848904538263E-5
4	2.0716306915567294E-5
5	1.6573045532453833E-5
6	6.214892074670188E-5
7	2.3202263745435368E-4
8	1.1601131872717684E-4
9	7.457870489604226E-5
10-14	1.4418549613234838E-4
15-19	1.8810406679335102E-4
20-24	1.5081471434532991E-4
25-29	3.264889969893406E-4
30-34	7.681606604292352E-4
35-39	8.046213606006337E-4
40-44	9.695231636485493E-4
45-49	9.504641612862274E-4
50-54	5.377953275281269E-4
55-59	3.422333902451717E-4
60-64	2.867136877114514E-4
65-69	3.2068843105298174E-4
70-74	3.621210448841163E-4
75-79	2.6516872851926134E-4
80-84	2.9997212413741445E-4
85-89	3.778654381399474E-4
90-94	3.662643062672298E-4
95-99	2.9500021047767827E-4
100-104	4.5658740441910313E-4
105-109	3.2068843105298174E-4
110-114	2.4362376932707136E-4
115-119	2.4279511705044867E-4
120-124	2.4113781249720333E-4
125-129	1.408708870258576E-4
130-134	1.6821641215440642E-4
135-139	1.6655910760116104E-4
140-144	1.607585416648022E-4
145-149	2.021911554959368E-4
150	2.610254671361479E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.4135576E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.488230107940694
#Duplication Level	Percentage of total
1	34.435953225868026
2	8.540087709764995
3	4.865016341995779
4	3.464566512479899
5	2.496297659516342
6	1.9808941529367914
7	1.6094391675902338
8	1.4436583905749498
9	1.1915709479871763
>10	14.718775262464373
>50	4.912275275940596
>100	11.116783717591607
>500	4.223498454724809
>1k	4.68341613109891
>5k	0.2748678458240896
>10k+	0.04289920364142574
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	3.314609106490767E-5	0.0	4.143261383113458E-6	3.6460700171398434E-4	3.314609106490767E-5
2	4.143261383113458E-6	1.1186805734406338E-4	0.0	1.2429784149340376E-5	0.002473527045718735	4.143261383113459E-5
3	2.0716306915567294E-5	1.1601131872717685E-4	0.0	1.6573045532453833E-5	0.0048476158182427466	5.8005659363588426E-5
4	7.04354435129288E-5	1.2844110287651723E-4	0.0	2.0716306915567294E-5	0.007060117396825333	5.8005659363588426E-5
5	8.286522766226918E-5	1.3258436425963067E-4	0.0	2.4859568298680752E-5	0.008249233413778896	6.214892074670188E-5
6	1.0772479596094993E-4	1.3258436425963067E-4	0.0	2.4859568298680752E-5	0.010080554945115046	7.04354435129288E-5
7	1.408708870258576E-4	1.6573045532453835E-4	0.0	2.4859568298680752E-5	0.012056890624860164	7.04354435129288E-5
8	2.5688220575303445E-4	1.6573045532453835E-4	0.0	2.4859568298680752E-5	0.015856261313175208	7.457870489604226E-5
9	3.231743878828498E-4	1.698737167076518E-4	0.0	2.4859568298680752E-5	0.018727541451672835	7.872196627915571E-5
10-11	3.666786324055411E-4	1.7194534739920853E-4	0.0	2.6931198990237482E-5	0.033156449218365455	1.0358153457783648E-4
12-13	4.163977690029026E-4	1.7816023947387873E-4	0.0	2.9002829681794213E-5	0.043309511237684985	1.1186805734406338E-4
14-15	4.723317976749343E-4	1.8644676224010564E-4	0.0	2.9002829681794213E-5	0.05105741002410715	1.263694721849605E-4
16-17	5.179076728891824E-4	1.926616543147758E-4	0.0	3.314609106490767E-5	0.05579730104638895	1.3672762564274414E-4
18-19	6.090594233176784E-4	2.0094817708100275E-4	0.0	3.314609106490767E-5	0.05952002139911639	1.3672762564274414E-4
20-21	9.964543626387868E-4	2.2787937607124023E-4	0.0	3.314609106490767E-5	0.06267304331166573	1.3672762564274414E-4
22-23	0.0013507032108949876	2.3409426814591044E-4	0.0	3.314609106490767E-5	0.06582192196283196	1.408708870258576E-4
24-25	0.0014397833306319268	2.465240522952508E-4	0.0	3.314609106490767E-5	0.06886100418734568	1.4501414840897104E-4
26-27	0.0014977889899955154	2.485956829868075E-4	0.0	3.314609106490767E-5	0.07140703830726891	1.553723018667547E-4
28-29	0.0016365882463298164	2.5066731367836425E-4	0.0	3.314609106490767E-5	0.07441090281002616	1.7194534739920853E-4
30-31	0.001883112298625067	2.52738944369921E-4	0.0	3.936098313957786E-5	0.0776695778878449	1.9059002362321908E-4
32-33	0.0019721924183620063	2.52738944369921E-4	0.0	4.557587521424805E-5	0.08068380054405994	2.175212226134566E-4
34-35	0.0020384846004918218	2.52738944369921E-4	0.0	5.8005659363588426E-5	0.08374774233687235	2.1959285330501333E-4
36-37	0.0020799172143229562	2.52738944369921E-4	0.0	6.629218212981533E-5	0.08644500549727921	2.2166448399657003E-4
38-39	0.0020944186291638536	2.5688220575303445E-4	0.0	8.700848904538263E-5	0.08933285868130927	2.2373611468812677E-4
40-41	0.0021089200440047506	2.5688220575303445E-4	0.0	9.115175042849609E-5	0.09207155445554728	2.2787937607124023E-4
42-43	0.0021213498281540907	2.630970978277046E-4	0.0	9.115175042849609E-5	0.09480817859909371	2.2787937607124023E-4
44-45	0.0021379228736865446	2.7759851266860174E-4	0.0	9.322338112005282E-5	0.09760695166338686	2.320226374543537E-4
46-47	0.0021586391806021118	2.817417740517152E-4	0.0	9.529501181160955E-5	0.10226190582731484	2.3823752952902388E-4
48-49	0.0021710689647514523	2.8381340474327194E-4	0.0	9.736664250316627E-5	0.1051456157499618	2.4238079091213732E-4
50-51	0.0021980001637416898	2.98314819584169E-4	0.0	9.943827319472301E-5	0.10820748591208265	2.52738944369921E-4
52-53	0.002235289516189711	3.024580809672825E-4	2.071630691556729E-6	1.0772479596094993E-4	0.11101247386845045	2.52738944369921E-4
54-55	0.0022518625617221648	3.045297116588392E-4	4.143261383113458E-6	1.0979642665250665E-4	0.11296809324128002	2.548105750614777E-4
56-57	0.0023015816983195264	3.128162344250661E-4	4.143261383113458E-6	1.1186805734406338E-4	0.11506458350113542	2.5688220575303445E-4
58-59	0.002380303664598682	3.2110275719129304E-4	4.143261383113458E-6	1.201545801102903E-4	0.11743038575089321	2.610254671361479E-4
60-61	0.002577108580296571	3.397474334153036E-4	4.143261383113458E-6	1.2429784149340376E-4	0.11955380720973885	2.610254671361479E-4
62-63	0.002670331961416624	3.52177217564644E-4	4.143261383113458E-6	1.3051273356807396E-4	0.12206876686928872	2.6516872851926134E-4
64-65	0.002684833376257521	3.583921096393142E-4	4.143261383113458E-6	1.4087088702585758E-4	0.12496283494539348	2.6516872851926134E-4
66-67	0.002707621313864645	3.7082189378865454E-4	4.143261383113458E-6	1.4501414840897104E-4	0.127666312997875	2.6516872851926134E-4
68-69	0.002726265990088656	3.894665700126651E-4	4.143261383113458E-6	1.4708577910052778E-4	0.12960535932517211	2.7345525128548827E-4
70-71	0.0027428390356211097	4.2054103038601605E-4	4.143261383113458E-6	1.491574097920845E-4	0.13185929351758582	2.7345525128548827E-4
72-73	0.0027573404504620067	4.308991838437997E-4	4.143261383113458E-6	1.491574097920845E-4	0.13352902785498055	2.7345525128548827E-4
74-75	0.002784271649452244	4.308991838437997E-4	4.143261383113458E-6	1.491574097920845E-4	0.1352650543745051	2.7345525128548827E-4
76-77	0.0028091312177509252	4.308991838437997E-4	4.143261383113458E-6	1.491574097920845E-4	0.136686193028913	2.7759851266860174E-4
78-79	0.002831919155358049	4.308991838437997E-4	4.143261383113458E-6	1.5744393255831142E-4	0.13812390472885339	2.7759851266860174E-4
80-81	0.002846420570198946	4.350424452269132E-4	4.143261383113458E-6	1.5744393255831142E-4	0.1395823327357093	2.7759851266860174E-4
82-83	0.0028754233998807407	4.4332896799314007E-4	4.143261383113458E-6	1.5744393255831142E-4	0.14123549402757157	2.7759851266860174E-4
84-85	0.002916856013711875	4.4332896799314007E-4	4.143261383113458E-6	1.5951556324986815E-4	0.14301295316092727	2.7967014336015847E-4
86-87	0.002950002104776783	4.578303828340372E-4	4.143261383113458E-6	1.6780208601609506E-4	0.14459775063996816	2.8381340474327194E-4
88-89	0.002974861673075463	4.5990201352559394E-4	4.143261383113458E-6	1.7194534739920853E-4	0.1461328289824117	2.879566661263854E-4
90-91	0.002993506349299474	4.5990201352559394E-4	4.143261383113458E-6	1.7401697809076526E-4	0.14808430509385812	2.900282968179421E-4
92-93	0.003024580809672825	4.6197364421715067E-4	4.143261383113458E-6	1.7401697809076526E-4	0.14985554933513912	2.900282968179421E-4
94-95	0.00308465809972797	4.6818853629182087E-4	8.286522766226917E-6	1.7816023947387873E-4	0.15162472194572857	2.9417155820105555E-4
96-97	0.003165451696698683	4.7647505905804775E-4	8.286522766226917E-6	1.7816023947387873E-4	0.15311836767434098	2.98314819584169E-4
98-99	0.0032669616005849625	4.909764738989449E-4	8.286522766226917E-6	1.8437513154854893E-4	0.15432612836751855	3.0038645027572576E-4
100-101	0.003374686396545912	4.97191365973615E-4	8.286522766226917E-6	1.905900236232191E-4	0.15567268831703043	3.024580809672825E-4
102-103	0.003416119010377047	5.013346273567285E-4	8.286522766226917E-6	1.9473328500633255E-4	0.15682658661222754	3.024580809672825E-4
104-105	0.003436835317292614	5.013346273567285E-4	8.286522766226917E-6	1.9680491569788928E-4	0.15782096934417475	3.024580809672825E-4
106-107	0.0034637665162828516	5.05477888739842E-4	8.286522766226917E-6	1.9887654638944601E-4	0.15877391946229086	3.024580809672825E-4
108-109	0.003480339561815305	5.137644115060689E-4	8.286522766226917E-6	2.0716306915567295E-4	0.1598532390525919	3.024580809672825E-4
110-111	0.003523843806337997	5.179076728891824E-4	8.286522766226917E-6	2.1544959192189986E-4	0.16093255864289296	3.024580809672825E-4
112-113	0.00364192675575673	5.261941956554093E-4	8.286522766226917E-6	2.1959285330501333E-4	0.1621858952112848	3.024580809672825E-4
114-115	0.0036792161082047515	5.344807184216361E-4	8.286522766226917E-6	2.258077453796835E-4	0.16351381048457264	3.024580809672825E-4
116-117	0.0037475799210261234	5.427672411878631E-4	8.286522766226917E-6	2.320226374543537E-4	0.16446468897199717	3.024580809672825E-4
118-119	0.003803513949698155	5.551970253372035E-4	8.286522766226917E-6	2.3616589883746714E-4	0.16529748451000298	3.024580809672825E-4
120-121	0.003938169944649342	5.676268094865439E-4	8.286522766226917E-6	2.4445242160369405E-4	0.16614270983215812	3.024580809672825E-4
122-123	0.004149476275188128	5.676268094865439E-4	8.286522766226917E-6	2.52738944369921E-4	0.1670065798305373	3.045297116588392E-4
124-125	0.004253057809765965	5.676268094865439E-4	1.0358153457783645E-5	2.52738944369921E-4	0.1678932377665236	3.0660134235039596E-4
126-127	0.004290347162213987	5.676268094865439E-4	1.2429784149340376E-5	2.52738944369921E-4	0.16878403896389296	3.0660134235039596E-4
128-129	0.004342137929502905	5.676268094865439E-4	1.2429784149340376E-5	2.52738944369921E-4	0.16957954514945076	3.0660134235039596E-4
130-131	0.004427074787856731	5.738417015612141E-4	1.2429784149340376E-5	2.589538364445912E-4	0.17037090807362543	3.086729730419527E-4
132-133	0.004501653492752773	5.821282243274409E-4	1.2429784149340376E-5	2.6516872851926134E-4	0.17104625967907294	3.107446037335094E-4
134-135	0.004580375459031928	5.841998550189976E-4	1.2429784149340376E-5	2.6516872851926134E-4	0.17184798075670538	3.107446037335094E-4
136-137	0.004667383948077312	5.904147470936678E-4	1.2429784149340376E-5	2.693119899023748E-4	0.17261862737396447	3.107446037335094E-4
138-139	0.004741962652973353	5.945580084767814E-4	1.2429784149340376E-5	2.693119899023748E-4	0.17327947756457107	3.128162344250661E-4
>>END_MODULE
