##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.lowPi.4d.R.3.R1.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	22697696
Total Bases	3.4 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	34.92748528308776	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.82528350014028	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	35.00697625873569	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
4	34.98751877723625	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.90956905934417	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.87428464104903	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.849565259839586	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.983390120301195	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.957642352774485	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.97172438999976	35.2	34.0	37.0	32.0	39.0
15-19	34.9704425770792	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
20-24	34.970664220720906	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
25-29	34.96040683600661	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
30-34	34.94717203895937	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
35-39	34.93709233747778	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
40-44	34.88575072994193	35.0	34.0	37.0	31.4	39.0
45-49	34.801196597222905	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.78351284641401	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.76580860894427	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.76055411086658	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.73479020954373	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.72981561652777	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.70862172971213	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.69842101154232	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
85-89	34.681655556581596	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
90-94	34.66614976251334	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
95-99	34.647033293599485	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
100-104	34.611312848669755	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
105-109	34.59036404399812	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
110-114	34.55076821013023	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
115-119	34.53001432392081	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.50564726040916	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.47846597293399	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.44359660998192	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.417485880505225	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.37774500107852	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.345214483443606	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	34.32138698130418	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	12.0
22	181.0
23	2128.0
24	14951.0
25	62425.0
26	163698.0
27	301770.0
28	446236.0
29	582280.0
30	734274.0
31	941437.0
32	1249676.0
33	1732085.0
34	2598226.0
35	4475991.0
36	8502272.0
37	890048.0
38	6.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.52653265399147	10.93309907711167	14.904121809240726	37.636246459656135
2	22.669046116691565	12.973399662573474	36.017968707112914	28.33958551362205
3	21.833429268227135	17.72797534197871	28.0602360989678	32.37835929082635
4	26.51208161614143	25.228368184271975	22.029942548720978	26.229607650865617
5	26.001325422622752	30.856159395419773	24.1377725797886	19.004742602168875
6	19.45639978159876	36.97431009777963	25.22270895346849	18.346581167153126
7	16.183733262524218	24.843112564595362	40.16642609102628	18.80672808185414
8	18.72371256382274	24.53959290022791	31.224361309969368	25.512333225979983
9	19.905329489767013	23.061825288675006	32.376270339642794	24.65657488191519
10-14	20.37451025004179	29.316565750068847	26.969353986710292	23.33957001317907
15-19	20.518448699604683	27.942488202109512	27.870882580958988	23.668180517326824
20-24	20.693869339797835	28.11600824025155	27.587398603959844	23.602723815990768
25-29	20.67976454528305	28.299754893350144	27.44766504210056	23.572815519266246
30-34	20.64451345695126	28.046864952128313	27.49306701810247	23.81555457281796
35-39	20.71447849773469	28.000446920246326	27.565737677024522	23.719336904994464
40-44	20.753761764913367	28.076480204274485	27.482952703951675	23.686805326860476
45-49	20.83610678538112	27.854345531211955	27.461159386650408	23.848388296756514
50-54	20.943088509054313	27.854301892643953	27.515535150560872	23.687074447740862
55-59	20.929012922778252	27.86228286026414	27.47292180193885	23.735782415018754
60-64	20.889078748129144	27.799439912304063	27.44327672493868	23.868204614628112
65-69	20.99493823432353	27.711888748215017	27.534024804007906	23.759148213453546
70-74	21.107795777910745	27.666376938975155	27.49290247634084	23.73292480677326
75-79	21.142254632084164	27.564719578649903	27.488299132507926	23.804726656758007
80-84	21.176364155872722	27.573217948475182	27.45055063361224	23.799867262039857
85-89	21.128612329375706	27.57619576589675	27.544421527027446	23.750770377700096
90-94	21.117328474955126	27.491843922952363	27.493825628924878	23.89700197316763
95-99	21.19577493657006	27.41026787449447	27.595638442616536	23.798318746318934
100-104	21.265048144793646	27.471328353473893	27.457212333038406	23.80641116869406
105-109	21.218331560899088	27.325452675653167	27.552782457421266	23.90343330602648
110-114	21.27088891458908	27.29196380678595	27.63917722669222	23.797970051932747
115-119	21.287249639851822	27.303989205555723	27.62794413260044	23.780817021992014
120-124	21.254538867071922	27.20420380205076	27.65285075384365	23.888406577033674
125-129	21.30454142244231	27.144691987039728	27.694871581746423	23.85589500877154
130-134	21.36282930197928	27.22320894421213	27.616463716879476	23.797498036929117
135-139	21.35002878891438	27.100128922736307	27.703054543291085	23.846787745058233
140-144	21.370283447576284	27.029408393272135	27.85088386923631	23.749424289915268
145-149	21.388541223806172	27.76797395581366	27.39303933604359	23.450445484336576
150	21.26281820657851	27.284640427590617	27.497927313718396	23.954614052112476
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	1.0
9	1.0
10	1.5
11	4.5
12	6.5
13	16.0
14	33.5
15	61.0
16	144.0
17	322.0
18	649.0
19	1139.5
20	2079.0
21	3629.0
22	5890.0
23	9130.0
24	14178.0
25	22148.5
26	32433.0
27	45595.5
28	62253.5
29	86177.5
30	115556.0
31	147025.5
32	180226.5
33	216635.5
34	255617.5
35	301108.0
36	366854.0
37	455169.5
38	564835.5
39	701860.0
40	859307.5
41	1018644.0
42	1179259.0
43	1341349.5
44	1475691.5
45	1557169.0
46	1578302.0
47	1539414.5
48	1454513.0
49	1332239.0
50	1176607.0
51	1009734.5
52	842229.5
53	677561.5
54	527463.0
55	398971.0
56	299972.5
57	225778.0
58	170358.0
59	127940.0
60	90095.0
61	61785.0
62	44595.5
63	31034.5
64	21230.5
65	16631.0
66	14689.0
67	11370.5
68	6922.0
69	4416.0
70	3777.0
71	3159.0
72	2294.5
73	1364.0
74	700.0
75	225.0
76	65.0
77	34.5
78	15.5
79	2.5
80	1.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.5
85	0.5
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.5
94	0.5
95	0.0
96	0.5
97	0.5
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	1.8504080766611729E-4
2	6.16802692220391E-5
3	4.8463068674459294E-5
4	1.2776627195993813E-4
5	1.3217200547579807E-4
6	1.0133187086477852E-4
7	2.3350387634057658E-4
8	2.9077841204675577E-4
9	1.1454907141235832E-4
10-14	1.859219543692893E-4
15-19	1.6124984668047364E-4
20-24	1.7358590052488147E-4
25-29	2.916595587499278E-4
30-34	4.5467169883674533E-4
35-39	5.903682911252313E-4
40-44	3.4717180104976294E-4
45-49	2.194055290898248E-4
50-54	3.1897510654825935E-4
55-59	4.4057335158599354E-4
60-64	7.886262993389286E-4
65-69	5.383806356380841E-4
70-74	2.696308911706281E-4
75-79	4.6436431257163723E-4
80-84	1.947334214010092E-4
85-89	2.793235049055199E-4
90-94	3.551021213783108E-4
95-99	5.894871444220594E-4
100-104	3.5598326808148283E-4
105-109	4.317618845542737E-4
110-114	3.1280707962605544E-4
115-119	4.141389504908339E-4
120-124	3.154505197355714E-4
125-129	3.9387257631787827E-4
130-134	4.176635373035219E-4
135-139	3.1016363951653946E-4
140-144	3.2514313347046327E-4
145-149	3.762496422544385E-4
150	4.317618845542737E-4
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	pass
#Length	Count
150	2.2697696E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	50.193933667240564
#Duplication Level	Percentage of total
1	38.06952952172374
2	11.324535787656298
3	6.776809450346309
4	4.715690091218512
5	3.5770828460019257
6	2.7625170462397826
7	2.3330176031917387
8	1.8985806837848314
9	1.6451459038220546
>10	18.178807258107796
>50	4.231303360308186
>100	3.9742182018370347
>500	0.32448222874901406
>1k	0.1882800170129571
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.4057335158599355E-6	1.3217200547579807E-5	0.0	0.0	1.7622934063439742E-4	1.3217200547579807E-5
2	8.811467031719871E-6	1.101433378964984E-4	0.0	8.811467031719871E-6	0.0020795062194858896	3.965160164273942E-5
3	8.811467031719871E-6	1.101433378964984E-4	0.0	8.811467031719871E-6	0.0031897510654825935	7.930320328547885E-5
4	2.6434401095159613E-5	1.2776627195993813E-4	0.0	8.811467031719871E-6	0.0045643399224308935	1.0573760438063845E-4
5	3.5245868126879484E-5	1.2776627195993813E-4	0.0	1.3217200547579807E-5	0.005965363180474353	1.1454907141235833E-4
6	4.4057335158599355E-5	1.3217200547579807E-4	0.0	1.7622934063439742E-5	0.007009522023733158	1.233605384440782E-4
7	4.8463068674459294E-5	1.630121400868176E-4	0.0	1.7622934063439742E-5	0.00819025860598362	1.233605384440782E-4
8	6.16802692220391E-5	1.6741787360267756E-4	0.0	1.7622934063439742E-5	0.01023011322382677	1.233605384440782E-4
9	9.252040383305866E-5	1.6741787360267756E-4	0.0	2.2028667579299678E-5	0.013287692283833566	1.3217200547579807E-4
10-11	1.5199780629716777E-4	1.718236071185375E-4	0.0	2.4231534337229647E-5	0.01774409173512589	1.5420067305509777E-4
12-13	2.1808380903506682E-4	1.718236071185375E-4	0.0	2.6434401095159613E-5	0.021383227619226196	1.8504080766611729E-4
14-15	2.2469240930885672E-4	1.7622934063439745E-4	0.0	2.6434401095159613E-5	0.025872670071887472	2.0046087497162707E-4
16-17	2.4892394364608636E-4	1.8944654118197723E-4	0.0	2.6434401095159613E-5	0.03066170240362722	2.114752087612769E-4
18-19	2.687497444674561E-4	2.0046087497162707E-4	0.0	2.6434401095159613E-5	0.034624659701143236	2.114752087612769E-4
20-21	3.3703861396328506E-4	2.268952760667867E-4	0.0	3.084013461101955E-5	0.0382902299863387	2.1588094227713685E-4
22-23	4.0973321697497403E-4	2.3790960985643653E-4	0.0	3.5245868126879484E-5	0.04239417075636223	2.2909814282471666E-4
24-25	4.581962856494333E-4	2.401124766143665E-4	0.0	3.5245868126879484E-5	0.04680871573925389	2.3790960985643653E-4
26-27	5.044564875659627E-4	2.4231534337229647E-4	0.0	3.965160164273942E-5	0.051106508783975255	2.5112681040401636E-4
28-29	5.330937554190523E-4	2.4231534337229647E-4	0.0	4.185446840066939E-5	0.05562458850448962	2.533296771619463E-4
30-31	6.035854916728112E-4	2.4231534337229647E-4	0.0	4.626020191652932E-5	0.060010496219528184	2.5773541067780625E-4
32-33	6.520485603472704E-4	2.4231534337229647E-4	0.0	5.066593543238926E-5	0.06418272585904755	2.9077841204675577E-4
34-35	6.961058955058698E-4	2.4231534337229647E-4	0.0	5.2868802190319226E-5	0.06802672835163534	2.9958987907847566E-4
36-37	7.115259628113796E-4	2.4231534337229647E-4	0.0	5.2868802190319226E-5	0.07183328210933831	3.017927458364056E-4
38-39	7.335546303906793E-4	2.4231534337229647E-4	0.0	5.2868802190319226E-5	0.07613768375433348	3.061984793522655E-4
40-41	7.599890314858389E-4	2.467210768881564E-4	0.0	5.50716689482492E-5	0.07943757815771257	3.1280707962605544E-4
42-43	7.665976317596288E-4	2.5112681040401636E-4	0.0	5.7274535706179165E-5	0.0827991528303137	3.3043001368949517E-4
44-45	8.040463666444382E-4	2.555325439198763E-4	0.0	5.7274535706179165E-5	0.0869449480687379	3.3924148072121506E-4
46-47	8.481037018030376E-4	2.6214114419366615E-4	0.0	5.7274535706179165E-5	0.0911788579774793	3.480529477529349E-4
48-49	8.635237691085474E-4	2.73155477983316E-4	0.0	5.7274535706179165E-5	0.09492593433271818	3.656758818163747E-4
50-51	8.723352361402672E-4	2.863726785308958E-4	0.0	5.7274535706179165E-5	0.09901445503543618	3.7228448209016457E-4
52-53	9.009725039933569E-4	2.9077841204675577E-4	0.0	5.947740246410913E-5	0.10311619293870179	3.832988158798144E-4
54-55	9.384212388781663E-4	2.9077841204675577E-4	0.0	6.388313597996908E-5	0.10649098481185051	3.965160164273942E-4
56-57	9.758699737629757E-4	2.951841455626157E-4	0.0	7.269460301168894E-5	0.11072930045410775	3.965160164273942E-4
58-59	0.0010067101083739952	3.1280707962605544E-4	0.0	9.031753707512868E-5	0.11460414308130658	3.965160164273942E-4
60-61	0.0010639846440801746	3.2161854665777533E-4	0.0	9.912900410684856E-5	0.11807145535828835	3.965160164273942E-4
62-63	0.0011080419792387738	3.260242801736352E-4	0.0	1.0353473762270848E-4	0.12141540709682605	3.965160164273942E-4
64-65	0.0011498964476394432	3.3043001368949517E-4	0.0	1.101433378964984E-4	0.12608328175687963	3.965160164273942E-4
66-67	0.001169722248460813	3.524586812687949E-4	0.0	1.101433378964984E-4	0.1301079193236177	4.075303502170441E-4
68-69	0.0012005623830718326	3.678787485743046E-4	0.0	1.1234620465442837E-4	0.13290776297294668	4.2074755076462386E-4
70-71	0.0012556340520200816	3.744873488480945E-4	0.0	1.1895480492821826E-4	0.13573844675688668	4.2735615103841376E-4
72-73	0.0012842713198731714	3.7889308236395446E-4	0.0	1.1895480492821826E-4	0.13873434554767144	4.3616761807013365E-4
74-75	0.0013261257882738408	3.7889308236395446E-4	0.0	1.233605384440782E-4	0.14189105361178508	4.4277621834392354E-4
76-77	0.0013878060574958797	3.899074161536043E-4	0.0	1.2776627195993815E-4	0.14431200417875012	4.449790851018535E-4
78-79	0.0014560949269917089	3.965160164273942E-4	0.0	1.4538920602337788E-4	0.14688935828552818	4.449790851018535E-4
80-81	0.0014935436618765184	4.11936083732904E-4	4.4057335158599355E-6	1.4538920602337788E-4	0.14973105640325785	4.4938481861771343E-4
82-83	0.0015331952635192576	4.185446840066939E-4	4.4057335158599355E-6	1.4538920602337788E-4	0.1522202958397187	4.537905521335734E-4
84-85	0.0015904697992254369	4.185446840066939E-4	4.4057335158599355E-6	1.4538920602337788E-4	0.1545927833380093	4.537905521335734E-4
86-87	0.001656555801963336	4.2735615103841376E-4	4.4057335158599355E-6	1.4538920602337788E-4	0.15663043508909452	4.603991524073633E-4
88-89	0.001702816003879865	4.2735615103841376E-4	4.4057335158599355E-6	1.4538920602337788E-4	0.15870773844182245	4.648048859232232E-4
90-91	0.0017490762057963945	4.3837048482806365E-4	4.4057335158599355E-6	1.4759207278130786E-4	0.16144149608841354	4.736163529549431E-4
92-93	0.001775510606891554	4.449790851018535E-4	4.4057335158599355E-6	1.4979493953923783E-4	0.16419948526934186	4.80224953228733E-4
94-95	0.0018327851425977333	4.449790851018535E-4	4.4057335158599355E-6	1.4979493953923783E-4	0.16702135758625014	4.8463068674459294E-4
96-97	0.0018966682785777024	4.4938481861771343E-4	4.4057335158599355E-6	1.4979493953923783E-4	0.16937181641696145	4.956450205342428E-4
98-99	0.0019561456810418118	4.603991524073633E-4	4.4057335158599355E-6	1.4979493953923783E-4	0.171462336970237	4.978478872921727E-4
100-101	0.0020266374172955705	4.736163529549431E-4	4.4057335158599355E-6	1.4979493953923783E-4	0.17383262160176963	4.978478872921727E-4
102-103	0.00205747755190659	4.7581921971287305E-4	4.4057335158599355E-6	1.4979493953923783E-4	0.1756698124778832	4.978478872921727E-4
104-105	0.002101534887065189	4.82427819986663E-4	4.4057335158599355E-6	1.4979493953923783E-4	0.17742990301746925	4.978478872921727E-4
106-107	0.0021588094227713685	4.890364202604528E-4	4.4057335158599355E-6	1.4979493953923783E-4	0.17904460435103192	5.000507540501027E-4
108-109	0.002220489691993408	4.890364202604528E-4	6.608600273789903E-6	1.4979493953923783E-4	0.18052493081236087	5.022536208080327E-4
110-111	0.0022755613609416565	4.890364202604528E-4	8.811467031719871E-6	1.5199780629716777E-4	0.18208015474345943	5.044564875659627E-4
112-113	0.002326227296374046	4.956450205342428E-4	8.811467031719871E-6	1.5420067305509775E-4	0.18364419014158972	5.066593543238926E-4
114-115	0.0023680817647747155	5.022536208080327E-4	8.811467031719871E-6	1.586064065709577E-4	0.185428512215513	5.066593543238926E-4
116-117	0.002401124766143665	5.044564875659627E-4	8.811467031719871E-6	1.630121400868176E-4	0.18697272181282187	5.088622210818226E-4
118-119	0.002467210768881564	5.132679545976826E-4	8.811467031719871E-6	1.6521500684474758E-4	0.18842661387305565	5.154708213556125E-4
120-121	0.0025729483732622026	5.198765548714724E-4	8.811467031719871E-6	1.6741787360267756E-4	0.1899201575349322	5.154708213556125E-4
122-123	0.0027051203787380007	5.220794216294023E-4	8.811467031719871E-6	1.6741787360267756E-4	0.19154807606904245	5.176736881135425E-4
124-125	0.002797640782571059	5.242822883873324E-4	8.811467031719871E-6	1.6741787360267756E-4	0.19332799240944984	5.198765548714724E-4
126-127	0.0028416981177296586	5.242822883873324E-4	1.1014333789649839E-5	1.6962074036060753E-4	0.19488762207406424	5.198765548714724E-4
128-129	0.002903378386951698	5.242822883873324E-4	1.3217200547579807E-5	1.7622934063439742E-4	0.19619392206151673	5.198765548714724E-4
130-131	0.0029716672564475263	5.50716689482492E-4	1.3217200547579807E-5	1.784322073923274E-4	0.19748480198166368	5.220794216294023E-4
132-133	0.0030355503924274956	5.50716689482492E-4	1.3217200547579807E-5	1.8944654118197723E-4	0.1986192783619976	5.242822883873324E-4
134-135	0.003141287996808134	5.50716689482492E-4	1.3217200547579807E-5	1.9385227469783718E-4	0.19963039420388745	5.242822883873324E-4
136-137	0.0032668514020101425	5.595281565142119E-4	1.3217200547579807E-5	1.9385227469783718E-4	0.2007935078520745	5.286880219031923E-4
138-139	0.0033527632055694112	5.727453570617916E-4	1.3217200547579807E-5	1.9385227469783718E-4	0.20199847596866222	5.374994889349122E-4
>>END_MODULE
