##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.control.2d.S.1.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24154014
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	72-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	36.59427919516814	37.0	35.0	39.0	33.0	39.0
2	35.76725537212987	36.0	35.0	39.0	33.0	39.0
3	36.041955800803954	37.0	35.0	39.0	34.0	39.0
4	36.05864118485648	37.0	35.0	39.0	34.0	39.0
5	35.849820075454126	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
6	35.69704215622298	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
7	35.56112727267609	35.0	34.0	38.0	33.0	39.0
8	35.84467513349955	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
9	35.816925501492214	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
10-14	35.841078282061105	36.2	35.0	38.4	33.0	39.0
15-19	35.837387897514674	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
20-24	35.82773792380844	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
25-29	35.81715812535341	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
30-34	35.80587472541831	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
35-39	35.79786681418666	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
40-44	35.784671251743084	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
45-49	35.7708360523431	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
50-54	35.75173277617542	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
55-59	35.7340966019147	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
60-64	35.72765124670376	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
65-69	35.70322504574188	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
70-74	35.69091166692358	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
75-79	35.67426514758556	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
80-84	35.65106041096733	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
85-89	35.63568872823089	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
90-94	35.61724145317128	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
95-99	35.58767904763901	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
100-104	35.555425131190596	36.0	34.4	38.0	33.0	39.0
105-109	35.530938229610015	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
110-114	35.50427757854433	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
115-119	35.47369702323391	36.0	34.0	38.0	32.6	39.0
120-124	35.447229697267936	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
125-129	35.41514803203401	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
130-134	35.37912793609174	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
135-139	35.34068066721976	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
140-144	35.30464861252614	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
145-149	35.28850219364697	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
150	35.763378935441835	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	6.0
22	133.0
23	1569.0
24	10363.0
25	39811.0
26	97394.0
27	175302.0
28	259976.0
29	341425.0
30	429770.0
31	549358.0
32	729131.0
33	1029386.0
34	1619952.0
35	3115077.0
36	1.1605617E7
37	4149726.0
38	18.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.59015433211225	10.721021359017179	13.978678657717097	38.71014565115347
2	22.705318489778197	13.020882453984154	36.59932892168995	27.674470134547697
3	21.366379689913746	17.504798068757918	27.874406169515105	33.25441607181323
4	26.61564651197914	25.455187848099925	21.731835211946816	26.19733042797412
5	26.26757581632756	30.875727866015062	23.97639413663965	18.880302181017726
6	19.443892661117996	36.54794571136564	25.47859762889849	18.529563998617867
7	16.62837693130076	23.766753596392945	40.10050015332868	19.504369318977613
8	19.159738756183863	23.99151229188323	30.96225352103346	25.88649543089944
9	20.105690995987125	22.902880214814964	32.07292358279253	24.918505206405385
10-14	20.92718688745642	28.87001188325132	26.44518656780744	23.757614661484826
15-19	21.135600261045273	27.832256420012623	27.11177530922948	23.92036800971262
20-24	21.090045841315973	27.91907004954671	26.975963997644282	24.014920111493034
25-29	21.01410376288857	28.137346700470534	26.6654185050223	24.1831310316186
30-34	21.063267518190976	27.868730169707362	26.868095706329704	24.19990660577196
35-39	21.344167249566507	27.668217043890824	26.737557653925055	24.250058052617614
40-44	21.526737748333776	27.746969859638277	26.57813146658878	24.148160925439168
45-49	21.775839845958494	27.682305755140487	26.47347847546444	24.06837592343658
50-54	21.776750076101525	27.862039377114396	26.407121806018207	23.954088740765876
55-59	21.68710538254148	27.84449321025545	26.430448179743937	24.037953227459134
60-64	21.90039010895731	27.689531089170767	26.2140471070396	24.196031694832325
65-69	21.748193645965017	27.782000002931202	26.413790391531556	24.05601595957223
70-74	22.130440450601824	27.51656533273698	26.362341893682522	23.99065232297867
75-79	22.020024502329196	27.398098379657892	26.33260219821781	24.249274919795102
80-84	22.240184222255678	27.374993906794877	26.391350425076975	23.99347144587247
85-89	22.105410990393914	27.36352941024504	26.374313441111596	24.156746158249447
90-94	22.101932882980282	27.10561651030799	26.395489637760168	24.396960968951557
95-99	22.326674494749536	27.106072405275906	26.58677720830065	23.980475891673905
100-104	22.259420536258688	26.981372313819747	26.6095913037042	24.149615846217362
105-109	22.359482567681738	26.911278640108577	26.508167331886344	24.22107146032334
110-114	22.356370423086506	26.988638412542652	26.46339763830484	24.191593526066
115-119	22.473609258969123	27.126419569900523	26.389224898627596	24.010746272502754
120-124	22.468785901711215	26.979988378303705	26.34342576260592	24.207799957379166
125-129	22.835631024557884	26.948390960330325	26.222360991703418	23.993617023408373
130-134	22.617296888353206	27.2360979930682	26.08837700059344	24.058228117985163
135-139	22.67402344475544	27.03737510398047	26.17630490805391	24.112296543210174
140-144	22.665946671153577	26.849486817659535	26.435445222065145	24.04912128912174
145-149	22.152276455737795	26.785570531897562	26.801718100640837	24.260434911723806
150	22.72636129432505	24.99322666884493	27.06771447473631	25.212697562093712
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10	0.0
11	2.5
12	6.5
13	14.5
14	24.0
15	40.0
16	88.0
17	187.5
18	476.5
19	894.5
20	1432.0
21	2330.5
22	3904.5
23	6474.5
24	10436.5
25	16359.0
26	23730.0
27	34182.5
28	52187.0
29	77862.5
30	106706.5
31	135250.5
32	164501.0
33	198868.0
34	234067.5
35	277831.0
36	347649.0
37	424887.0
38	501240.0
39	607564.5
40	752732.0
41	916733.0
42	1083642.0
43	1246160.0
44	1389629.5
45	1497406.5
46	1569911.0
47	1587302.0
48	1537124.5
49	1482922.5
50	1387792.5
51	1226440.0
52	1034997.5
53	862048.0
54	717197.0
55	588069.0
56	495570.0
57	405738.5
58	332975.5
59	270412.5
60	201971.5
61	135866.0
62	79188.5
63	47622.5
64	31752.0
65	19475.0
66	12139.0
67	5895.0
68	2439.5
69	1215.0
70	950.0
71	635.5
72	338.5
73	190.0
74	133.0
75	85.0
76	46.0
77	32.0
78	23.0
79	8.0
80	7.5
81	5.0
82	2.0
83	1.0
84	0.0
85	0.0
86	0.5
87	0.5
88	0.5
89	0.5
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	2.1528512817786726E-4
3	1.0350246547012849E-4
4	1.242029585641542E-4
5	6.21014792820771E-5
6	3.312078895044112E-5
7	8.694207099490793E-5
8	1.0764256408893363E-4
9	7.038167651968737E-5
10-14	7.617781458601457E-5
15-19	1.7719622088485995E-4
20-24	1.6146384613340044E-4
25-29	3.7757699403502873E-4
30-34	2.4343779878574222E-4
35-39	2.6662235105105096E-4
40-44	2.0866097038777903E-4
45-49	4.4878669027847713E-4
50-54	3.966214476815323E-4
55-59	4.785954003338741E-4
60-64	3.949654082340103E-4
65-69	3.4528422480834865E-4
70-74	3.179595791897708E-4
75-79	2.583421859003045E-4
80-84	2.1611321232218914E-4
85-89	2.409539291533347E-4
90-94	2.492343970593918E-4
95-99	1.606363810617225E-4
100-104	1.6891693697585706E-4
105-109	1.7885370721464308E-4
110-114	1.8465057561380626E-4
115-119	2.2439700550062476E-4
120-124	1.7720008269116384E-4
125-129	1.9790261975538803E-4
130-134	1.697515252526468E-4
135-139	2.1695761234537172E-4
140-144	1.656581097240134E-4
145-149	1.2963832565502647E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
72-73	1.0
74-75	2.0
76-77	1.0
78-79	2.0
80-81	1.0
82-83	2.0
84-85	3.0
86-87	11.0
88-89	8.0
90-91	13.0
92-93	13.0
94-95	17.0
96-97	18.0
98-99	17.0
100-101	21.0
102-103	26.0
104-105	22.0
106-107	29.0
108-109	40.0
110-111	37.0
112-113	41.0
114-115	52.0
116-117	36.0
118-119	43.0
120-121	58.0
122-123	94.0
124-125	59.0
126-127	100.0
128-129	140.0
130-131	148.0
132-133	184.0
134-135	283.0
136-137	498.0
138-139	1512.0
140-141	4343.0
142-143	4912.0
144-145	54160.0
146-147	730091.0
148-149	635512.0
150-151	2.2721464E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	36.38217425436259
#Duplication Level	Percentage of total
1	26.258835255419587
2	8.891243448139798
3	5.5986805900435135
4	3.9145324598758817
5	3.026335872934345
6	2.4395975802693917
7	1.987007909927461
8	1.6810091904965463
9	1.501498037309057
>10	18.762867433127145
>50	6.182581637905237
>100	11.380948500094561
>500	3.667030320084975
>1k	4.156623243667715
>5k	0.4053788869015151
>10k+	0.14582963380355335
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	8.28019723761028E-6	0.0	4.14009861880514E-6	2.939470019351649E-4	8.28019723761028E-6
2	0.0	3.312078895044112E-5	0.0	2.0700493094025696E-5	0.0025999819326096275	1.2420295856415418E-5
3	8.28019723761028E-6	4.140098618805139E-5	0.0	2.0700493094025696E-5	0.004641050551680561	4.5541084806856534E-5
4	9.52222682325182E-5	5.3821282044466814E-5	0.0	2.0700493094025696E-5	0.006988486468543075	5.796138066327195E-5
5	1.159227613265439E-4	6.210147928207709E-5	0.0	2.4840591712830835E-5	0.008189115067996565	5.796138066327195E-5
6	1.4490345165817987E-4	6.210147928207709E-5	0.0	2.4840591712830835E-5	0.009874135205850258	5.796138066327195E-5
7	1.904445364650364E-4	9.108216961371307E-5	0.0	2.8980690331635975E-5	0.011331449919669667	6.210147928207709E-5
8	2.8566680469755464E-4	9.52222682325182E-5	0.0	2.8980690331635975E-5	0.014891934731842086	6.624157790088224E-5
9	3.8502917154887797E-4	9.52222682325182E-5	0.0	2.8980690331635975E-5	0.017905926526332227	7.038167651968737E-5
10-11	4.636910453061756E-4	1.0557251477953105E-4	0.0	2.8980690331635975E-5	0.02899104057818299	1.0557251477953105E-4
12-13	5.009519328754218E-4	1.2420295856415417E-4	0.0	2.8980690331635975E-5	0.03596710675086965	1.2420295856415417E-4
14-15	5.423529190634733E-4	1.2834305718295932E-4	0.0	3.5190838259843687E-5	0.04165974235172672	1.366232544205696E-4
16-17	6.023843490361478E-4	1.4076335303937475E-4	0.0	4.140098618805139E-5	0.04553280460961892	1.366232544205696E-4
18-19	7.224472089814968E-4	1.6146384613340044E-4	0.0	4.140098618805139E-5	0.048998067153558825	1.366232544205696E-4
20-21	0.0011405971694808158	1.759541912992184E-4	0.0	4.140098618805139E-5	0.05170569165025739	1.366232544205696E-4
22-23	0.0015297664396484991	1.8009428991802356E-4	0.0	4.3471035497453966E-5	0.05448783792209444	1.511135995863876E-4
24-25	0.0016684597433784712	1.8216433922742614E-4	0.0	4.76111341162591E-5	0.0573589963142358	1.5525369820519272E-4
26-27	0.001751261715754574	1.8216433922742614E-4	0.0	5.3821282044466814E-5	0.05989480671825395	1.759541912992184E-4
28-29	0.0019065154139597668	1.8216433922742614E-4	0.0	5.796138066327195E-5	0.06273905446937308	1.8630443784623126E-4
30-31	0.002258423796558204	1.8216433922742614E-4	0.0	7.038167651968737E-5	0.06599731208237272	2.049348816308544E-4
32-33	0.0024053972975257862	1.8216433922742614E-4	0.0	9.315221892311563E-5	0.06915827737783045	2.463358678189058E-4
34-35	0.0025254601574711353	1.8216433922742614E-4	0.0	1.097126133983362E-4	0.07183899123350679	2.546160650565161E-4
36-37	0.0025523707984933686	1.8216433922742614E-4	0.0	1.159227613265439E-4	0.07430027986238644	2.628962622941264E-4
38-39	0.0025647910943497835	1.904445364650364E-4	0.0	1.159227613265439E-4	0.07720662909278764	2.670363609129315E-4
40-41	0.0025813514888250047	1.9458463508384156E-4	0.0	1.221329092547516E-4	0.07981696127194429	2.6910641022233404E-4
42-43	0.0025917017353720173	2.0079478301204926E-4	0.0	1.2420295856415417E-4	0.08255977660690268	2.6910641022233404E-4
44-45	0.0026165423270848483	2.1942522679667238E-4	0.0	1.2834305718295932E-4	0.08527775135014826	2.732465088411392E-4
46-47	0.0026475930667258867	2.2149527610607495E-4	0.0	1.2834305718295932E-4	0.0899767632824921	2.732465088411392E-4
48-49	0.00267450370774812	2.380556705812955E-4	0.0	1.3455320511116702E-4	0.0926429867930026	2.8980690331635974E-4
50-51	0.0027034843980797557	2.442658185095032E-4	0.0	1.366232544205696E-4	0.09556175631926023	2.939470019351649E-4
52-53	0.002728324989792587	2.442658185095032E-4	0.0	1.366232544205696E-4	0.09807272613156554	2.9808710055397004E-4
54-55	0.002757305680124223	2.442658185095032E-4	0.0	1.366232544205696E-4	0.09999373189069113	2.9808710055397004E-4
56-57	0.002790426469074664	2.4840591712830835E-4	0.0	1.366232544205696E-4	0.10225629578586815	2.9808710055397004E-4
58-59	0.0028256173073345076	2.587561636753212E-4	0.0	1.366232544205696E-4	0.1043180648980331	2.9808710055397004E-4
60-61	0.0029042791810918052	2.6496631160352895E-4	0.0	1.366232544205696E-4	0.10623907065715868	2.9808710055397004E-4
62-63	0.0029456801672798566	2.732465088411392E-4	0.0	1.366232544205696E-4	0.10855338578507076	3.022271991727752E-4
64-65	0.002968450709683285	2.732465088411392E-4	0.0	1.4283340234877732E-4	0.1112465199366035	3.022271991727752E-4
66-67	0.002989151202777311	2.9394700193516494E-4	0.0	1.4490345165817987E-4	0.11370987861479256	3.042972484821778E-4
68-69	0.003005711597252531	3.084373471009829E-4	0.0	1.4490345165817987E-4	0.11567228536010618	3.084373471009829E-4
70-71	0.0030471125834405826	3.167175443385932E-4	0.0	1.5318364889579017E-4	0.11775268491605577	3.1050739641038543E-4
72-73	0.0030574628299875955	3.229276922668009E-4	0.0	1.5318364889579017E-4	0.11951222682904797	3.1050739641038543E-4
74-75	0.0030698831258440112	3.2706779088560603E-4	0.0	1.573237475145953E-4	0.12109995464935973	3.146474950291906E-4
76-77	0.003074023224462816	3.2706779088560603E-4	0.0	1.573237475145953E-4	0.12238959536911753	3.146474950291906E-4
78-79	0.0030967937668662446	3.2706779088560603E-4	0.0	1.7802424060862101E-4	0.12380964919536769	3.146474950291906E-4
80-81	0.0031402648023636983	3.2706779088560603E-4	0.0	1.8216433922742614E-4	0.12527110400780592	3.208576429573983E-4
82-83	0.003173385591314139	3.3120788950441113E-4	0.0	1.842343885368287E-4	0.12708239715353314	3.229276922668009E-4
84-85	0.003202366281645775	3.353479881232163E-4	0.0	1.8837448715563384E-4	0.1288874801513322	3.229276922668009E-4
86-87	0.0032354870705962164	3.353479881232163E-4	0.0	1.904445364650364E-4	0.13039033594995847	3.229276922668009E-4
88-89	0.0032603276623090474	3.3948808674202143E-4	0.0	1.966546843932441E-4	0.1318807714527283	3.229276922668009E-4
90-91	0.003264467760927852	3.3948808674202143E-4	0.0	1.9872473370264668E-4	0.13394668066351206	3.229276922668009E-4
92-93	0.0032810281554030733	3.41558136051424E-4	0.0	1.9872473370264668E-4	0.13559858001241532	3.249977415762035E-4
94-95	0.0033410595853757474	3.456982346702292E-4	0.0	1.9872473370264668E-4	0.13706417492347234	3.2706779088560603E-4
96-97	0.003396950916729617	3.519083825984368E-4	0.0	2.0079478301204926E-4	0.13852148963729174	3.2706779088560603E-4
98-99	0.0034569823467022914	3.5397843190783937E-4	0.0	2.0700493094025696E-4	0.13976972937086152	3.2706779088560603E-4
100-101	0.0035480645163160044	3.601885798360471E-4	0.0	2.111450295590621E-4	0.1410573000413099	3.2706779088560603E-4
102-103	0.0035708350587194326	3.601885798360471E-4	0.0	2.111450295590621E-4	0.1421813368163155	3.3120788950441113E-4
104-105	0.0035915355518134585	3.601885798360471E-4	0.0	2.1528512817786726E-4	0.14329709339408347	3.3120788950441113E-4
106-107	0.003630866488692107	3.663987277642549E-4	0.0	2.2356532541547753E-4	0.14438593933082924	3.3120788950441113E-4
108-109	0.0036536370310955354	3.7053882638305997E-4	0.0	2.3391557196249038E-4	0.145485135514122	3.3120788950441113E-4
110-111	0.003697108066592989	3.7674897431126767E-4	0.0	2.3598562127189295E-4	0.1465201601688233	3.3120788950441113E-4
112-113	0.0037861201868973	3.808890729300728E-4	0.0	2.3598562127189295E-4	0.1475800254152374	3.332779388138137E-4
114-115	0.0038420115182511696	3.8502917154887797E-4	0.0	2.546160650565161E-4	0.1488820864308516	3.353479881232163E-4
116-117	0.003908253096152051	3.953794180958908E-4	0.0	2.6910641022233404E-4	0.14980739847215457	3.353479881232163E-4
118-119	0.003966214476815324	4.181499604993191E-4	0.0	2.753165581505418E-4	0.15061264765351218	3.353479881232163E-4
120-121	0.004129748372258126	4.3471035497453966E-4	0.0	2.877368540069572E-4	0.15139305624315694	3.353479881232163E-4
122-123	0.00439885478248046	4.367804042839422E-4	0.0	3.084373471009829E-4	0.15214655419177947	3.353479881232163E-4
124-125	0.004498217149331784	4.3885045359334476E-4	0.0	3.1050739641038543E-4	0.15295801352106528	3.353479881232163E-4
126-127	0.0045292678889728225	4.429905522121499E-4	0.0	3.1050739641038543E-4	0.1536908109765938	3.353479881232163E-4
128-129	0.004576879023089082	4.429905522121499E-4	0.0	3.1050739641038543E-4	0.1544049779883377	3.374180374326189E-4
130-131	0.004678311439249808	4.429905522121499E-4	2.07004930940257E-6	3.146474950291906E-4	0.1551481256904132	3.41558136051424E-4
132-133	0.004775603756791728	4.512707494497602E-4	4.14009861880514E-6	3.146474950291906E-4	0.15589334344179812	3.436281853608266E-4
134-135	0.004858405729167832	4.512707494497602E-4	4.14009861880514E-6	3.146474950291906E-4	0.156756554003819	3.436281853608266E-4
136-137	0.004982608687731985	4.719712425437859E-4	4.14009861880514E-6	3.146474950291906E-4	0.15753903264277316	3.436281853608266E-4
138-139	0.004992958934278998	4.7611134116259105E-4	4.14009861880514E-6	3.146474950291906E-4	0.15816418753421274	3.4776828397963173E-4
>>END_MODULE
