##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.control.2d.S.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	20724830
Total Bases	3.1 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	63-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.433366063798836	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.65443417388707	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.83104580351202	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.83033322830634	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.69136721507486	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.675301462062656	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.72628002256231	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.83968939672847	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.80992968337979	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.79552866778642	35.0	34.0	37.4	31.0	39.0
15-19	34.807653939742806	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.79868597233367	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.80232777783944	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.78164446222237	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.76812697619233	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.723155673653295	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.61865832433849	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
50-54	34.59424413131495	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
55-59	34.58275749427137	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.55414335880386	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.52010760619545	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.519195126655326	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.49895662812406	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.478181312998956	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.46386006945973	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.43982093145383	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.413363488416394	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.37556131916855	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.341012890569154	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.31527479092102	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.27776077155428	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.2302401125631	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
125-129	34.21547682104732	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.17117501899751	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.13429857264414	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.09566103952325	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.13714882760761	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	35.030805331882725	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	8.0
22	167.0
23	2202.0
24	15668.0
25	65095.0
26	172770.0
27	327884.0
28	495639.0
29	653709.0
30	817862.0
31	1022910.0
32	1301534.0
33	1697415.0
34	2331104.0
35	3609853.0
36	7055723.0
37	1155284.0
38	2.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	34.90065298484957	11.078286287511165	12.919319482958363	41.101741244680895
2	22.169640413093063	13.028574687649144	38.49498451858814	26.306800380669653
3	20.379971648377076	17.114134242929786	28.31628604850403	34.18960806018911
4	26.08166964313114	25.167572087023032	22.249601106152376	26.50115716369345
5	26.273995406469542	30.39819925885895	24.43740349725932	18.89040183741218
6	19.36030776639207	35.645890119137405	26.488011229053487	18.505790885417046
7	16.757982340972006	23.662991361561335	40.0397156837626	19.539310613704057
8	18.860608436328306	23.657789089186778	31.848445519227734	25.633156955257174
9	19.901515016996076	22.564466775624776	32.79410776971186	24.739910437667287
10-14	21.11410689202038	28.306464414317777	26.687106034949608	23.892322658712235
15-19	21.310055393434975	27.46695374091165	27.228171797391166	23.994819068262213
20-24	21.2211128278659	27.483938126303347	27.199083700910542	24.09586534492021
25-29	21.17646763638234	27.654485316579404	26.882537508620725	24.286509538417533
30-34	21.235689869596758	27.34908761041289	27.10946523996722	24.305757280023123
35-39	21.54355484879527	27.1290046993743	26.976085503274494	24.351354948555937
40-44	21.761257989336997	27.25095877737625	26.756645202087988	24.231138031198768
45-49	21.922140322544987	27.196876420430787	26.67291059103113	24.208072665993097
50-54	21.919452321559778	27.39069264222791	26.644899319044928	24.044955717167383
55-59	21.883216577368955	27.355767904320132	26.64984050842831	24.111175009882608
60-64	22.08591426461298	27.1395305947324	26.451931717357226	24.322623423297397
65-69	21.954397986637073	27.264331142268826	26.67295159499704	24.108319276097056
70-74	22.346101467034536	27.017598182257903	26.56733543843888	24.06896491226868
75-79	22.243782014856585	26.843691103450485	26.567370841961928	24.345156039731002
80-84	22.477904635138756	26.886757001727666	26.61345350935897	24.0218848537746
85-89	22.369230863655066	26.84967339006953	26.57336651898004	24.207729227295367
90-94	22.322875813272113	26.579213170406206	26.63697015266806	24.46094086365362
95-99	22.602092607410984	26.609719740178832	26.820202402080906	23.967985250329278
100-104	22.514701820421884	26.483447847507886	26.830639155214524	24.171211176855703
105-109	22.647217702216544	26.401531694540587	26.692710494607812	24.258540108635056
110-114	22.62417933996387	26.437326255985234	26.70664678922518	24.23184761482572
115-119	22.752307037208013	26.62309897976228	26.59513208499975	24.02946189802996
120-124	22.737003520116758	26.469339038127742	26.549040377556675	24.244617064198827
125-129	23.097931540358722	26.507269635512444	26.401586298112363	23.993212526016475
130-134	22.85477037899125	26.82044666259194	26.26964429632389	24.05513866209292
135-139	22.920343668398456	26.60084136272317	26.358316079357184	24.120498889521187
140-144	22.917214526517355	26.445921597479337	26.606918176362377	24.02994569964093
145-149	22.355444689970753	26.299047932838292	27.04972607161785	24.2957813055731
150	22.233460442665073	24.78764555654963	27.807210141682514	25.171683859102785
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.5
9	1.5
10	1.5
11	3.0
12	7.0
13	7.5
14	13.0
15	36.5
16	81.0
17	193.0
18	414.0
19	724.5
20	1199.5
21	1980.0
22	3317.0
23	5561.5
24	9031.5
25	13813.5
26	19638.5
27	28227.5
28	43238.0
29	63677.0
30	86924.5
31	110102.5
32	132217.5
33	159673.5
34	190236.0
35	228707.0
36	285605.0
37	349573.5
38	413297.0
39	502535.0
40	623906.0
41	758027.0
42	899887.5
43	1041081.0
44	1167219.0
45	1268274.5
46	1338667.0
47	1358813.5
48	1319107.0
49	1276878.0
50	1204637.5
51	1067502.0
52	905102.5
53	761453.0
54	635010.0
55	527883.5
56	454758.5
57	377450.0
58	310357.5
59	254319.0
60	194785.0
61	132959.0
62	77151.5
63	45451.5
64	30204.5
65	19294.0
66	12536.5
67	6109.0
68	2437.5
69	1195.5
70	941.0
71	657.5
72	337.5
73	160.0
74	106.5
75	70.0
76	32.5
77	20.5
78	12.0
79	3.5
80	2.0
81	2.5
82	1.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0014427138847459785
3	0.11616500593732253
4	8.685234088771777E-5
5	1.4475390147952963E-4
6	9.65026009863531E-5
7	9.65026009863531E-5
8	1.5440416157816493E-4
9	2.219559822686121E-4
10-14	2.595919966532898E-4
15-19	3.068782711366028E-4
20-24	3.3100392138319106E-4
25-29	2.943329330083769E-4
30-34	2.595919966532898E-4
35-39	1.3703369340062137E-4
40-44	2.4222152847574625E-4
45-49	2.094106441403862E-4
50-54	1.2834845931184962E-4
55-59	1.7273965576557204E-4
60-64	2.0844562014207712E-4
65-69	0.047649126562154025
70-74	1.930052187356612E-4
75-79	1.679145500225406E-4
80-84	1.1001300759060802E-4
85-89	1.312436614619162E-4
90-94	1.3896397473793203E-4
95-99	1.0325808797442411E-4
100-104	7.334233912922456E-5
105-109	1.090487441613686E-4
110-114	6.176231548773634E-5
115-119	7.334307947054635E-5
120-124	1.244909670512363E-4
125-129	9.554050229695292E-5
130-134	5.983443560748807E-5
135-139	5.21160979117871E-5
140-144	5.599474908275049E-5
145-149	5.5090414289556284E-5
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
62-63	1.0
64-65	0.0
66-67	0.0
68-69	0.0
70-71	1.0
72-73	0.0
74-75	0.0
76-77	2.0
78-79	1.0
80-81	2.0
82-83	5.0
84-85	5.0
86-87	7.0
88-89	5.0
90-91	2.0
92-93	11.0
94-95	10.0
96-97	17.0
98-99	10.0
100-101	24.0
102-103	21.0
104-105	15.0
106-107	25.0
108-109	25.0
110-111	28.0
112-113	34.0
114-115	37.0
116-117	53.0
118-119	39.0
120-121	49.0
122-123	70.0
124-125	82.0
126-127	98.0
128-129	127.0
130-131	173.0
132-133	182.0
134-135	310.0
136-137	650.0
138-139	1588.0
140-141	4395.0
142-143	6924.0
144-145	59154.0
146-147	661241.0
148-149	1209249.0
150-151	1.8780158E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.30691222849113
#Duplication Level	Percentage of total
1	33.92153069118814
2	8.652778639798408
3	5.156581943034399
4	3.579140974274321
5	2.6639974612917916
6	2.092162413954908
7	1.6829581847870165
8	1.4777585712429904
9	1.2437723944218022
>10	16.23196881293499
>50	5.4928866998213515
>100	10.316692344394374
>500	3.217347139111947
>1k	3.7482497658673437
>5k	0.4537148942801195
>10k+	0.06845906959630327
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.825130049317654E-6	9.650260098635308E-6	0.0	0.0	3.136334532056475E-4	1.9300520197270616E-5
2	9.650260098635308E-6	4.825130049317654E-5	0.0	1.4475390147952962E-5	0.0024463409350040507	1.9300520197270616E-5
3	1.4475390147952962E-5	4.825130049317654E-5	0.0	1.4475390147952962E-5	0.00485408082961356	5.790156059181185E-5
4	9.650260098635308E-5	5.30764305424942E-5	0.0	1.4475390147952962E-5	0.007092941172496952	6.27266906411295E-5
5	1.158031211836237E-4	6.27266906411295E-5	0.0	1.9300520197270616E-5	0.008135169263149566	7.237695073976482E-5
6	1.495790315288473E-4	6.27266906411295E-5	0.0	1.9300520197270616E-5	0.009891516601101191	7.237695073976482E-5
7	1.785298118247532E-4	8.202721083840012E-5	0.0	1.9300520197270616E-5	0.011628563418855547	7.237695073976482E-5
8	3.3293397340291816E-4	8.685234088771778E-5	0.0	2.412565024658827E-5	0.015512793108556258	7.720208078908247E-5
9	4.728627448331301E-4	9.167747093703543E-5	4.825130049317654E-6	2.412565024658827E-5	0.018620176860316827	8.202721083840012E-5
10-11	5.910784310414127E-4	1.0132773103567073E-4	4.825130049317654E-6	2.412565024658827E-5	0.03091702079100287	1.1339055615896487E-4
12-13	6.634553817811775E-4	1.0374029606032957E-4	4.825130049317654E-6	2.8950780295905925E-5	0.0384152728876425	1.2786594630691782E-4
14-15	7.599579827675305E-4	1.1339055615896488E-4	9.650260098635308E-6	4.1013605419200065E-5	0.044309169242884014	1.3510364138089433E-4
16-17	8.419851936059307E-4	1.4475390147952963E-4	9.650260098635308E-6	4.342617044385889E-5	0.048121021981844966	1.3992877143021197E-4
18-19	9.819139650361426E-4	1.6405442167680023E-4	9.650260098635308E-6	4.342617044385889E-5	0.05114155339271782	1.3992877143021197E-4
20-21	0.0015368039207076729	2.0506802709600028E-4	9.650260098635308E-6	4.342617044385889E-5	0.05393047856122342	1.3992877143021197E-4
22-23	0.002009666665540803	2.1954341724395325E-4	9.650260098635308E-6	4.825130049317654E-5	0.056661502169137214	1.6405442167680023E-4
24-25	0.002166483392143627	2.219559822686121E-4	9.650260098635308E-6	4.825130049317654E-5	0.05966032049478813	1.6405442167680023E-4
26-27	0.002255748298056003	2.219559822686121E-4	9.650260098635308E-6	5.5488995567153024E-5	0.06220075146575388	1.8335494187407086E-4
28-29	0.0024246278497821214	2.219559822686121E-4	9.650260098635308E-6	6.755182069044716E-5	0.06493660020371698	1.95417766997365E-4
30-31	0.0027696246483083333	2.219559822686121E-4	9.650260098635308E-6	9.167747093703543E-5	0.06802468343528029	2.123057221699768E-4
32-33	0.002969867545355016	2.219559822686121E-4	9.650260098635308E-6	9.409003596169425E-5	0.07083773425403248	2.2919367734258858E-4
34-35	0.00312668427195784	2.219559822686121E-4	9.650260098635308E-6	1.061528610849884E-4	0.07331302596933244	2.412565024658827E-4
36-37	0.003170110442401699	2.219559822686121E-4	9.650260098635308E-6	1.1821568620828252E-4	0.07570146534374467	2.4608163251520036E-4
38-39	0.0031869983975743106	2.2678111231792976E-4	9.650260098635308E-6	1.4234133645487078E-4	0.07839871304131324	2.484941975398592E-4
40-41	0.0032424873931414635	2.2678111231792976E-4	9.650260098635308E-6	1.495790315288473E-4	0.0808981304068598	2.6055702266315333E-4
42-43	0.003254550218264758	2.3401880739190622E-4	9.650260098635308E-6	1.5440416157816493E-4	0.08334688390688849	2.6538215271247097E-4
44-45	0.0032714381734373697	2.4608163251520036E-4	9.650260098635308E-6	1.5922929162748257E-4	0.08587766461775562	2.6538215271247097E-4
46-47	0.003307626648807252	2.4608163251520036E-4	9.650260098635308E-6	1.6405442167680023E-4	0.09027094552765932	2.7020728276178866E-4
48-49	0.0033438151241771343	2.50906762564518E-4	9.650260098635308E-6	1.6405442167680023E-4	0.0926111336015784	2.7985754286042393E-4
50-51	0.0033582905143250876	2.6296958768781215E-4	9.650260098635308E-6	1.688795517261179E-4	0.09528425564890038	2.7985754286042393E-4
52-53	0.0034017166847689463	2.6538215271247097E-4	9.650260098635308E-6	1.688795517261179E-4	0.09762926885286877	2.7985754286042393E-4
54-55	0.003447555420237464	2.6538215271247097E-4	9.650260098635308E-6	1.688795517261179E-4	0.09925292511446415	2.7985754286042393E-4
56-57	0.0035151072409279113	2.7020728276178866E-4	9.650260098635308E-6	1.688795517261179E-4	0.10132049334059676	2.943329330083769E-4
58-59	0.0035633585414210876	2.8227010788508275E-4	9.650260098635308E-6	1.7370468177543556E-4	0.1032867338356937	2.943329330083769E-4
60-61	0.0036381480571855114	2.919203679837181E-4	9.650260098635308E-6	1.7370468177543556E-4	0.10510822042931112	2.9674549803303577E-4
62-63	0.003683986792654029	2.9674549803303577E-4	9.650260098635308E-6	1.7852981182475323E-4	0.10726264099633145	2.991580630576946E-4
64-65	0.003708112442900617	2.991580630576946E-4	9.650260098635308E-6	1.8576750689872968E-4	0.10965831806581766	2.991580630576946E-4
66-67	0.0037201752680239113	3.1845858325496514E-4	9.650260098635308E-6	1.8818007192338853E-4	0.11173794911707358	2.991580630576946E-4
68-69	0.0037611888734431116	3.401716684768946E-4	9.650260098635308E-6	1.8818007192338853E-4	0.11344604515453202	2.991580630576946E-4
70-71	0.003823915564084241	3.474093635508711E-4	9.650260098635308E-6	1.9300520197270616E-4	0.11547259977524545	2.991580630576946E-4
72-73	0.003848041214330829	3.5223449360018876E-4	9.650260098635308E-6	1.9300520197270616E-4	0.11691772622501609	2.991580630576946E-4
74-75	0.0038721668645774173	3.546470586248476E-4	9.650260098635308E-6	1.9300520197270616E-4	0.11839662858513195	2.991580630576946E-4
76-77	0.003905942774922641	3.618847536988241E-4	9.650260098635308E-6	1.95417766997365E-4	0.11962703674770794	3.015706280823534E-4
78-79	0.003937306120243206	3.642973187234829E-4	9.650260098635308E-6	2.1713085221929443E-4	0.12078506795954419	3.039831931070122E-4
80-81	0.003954194075415817	3.6912244877280054E-4	9.650260098635308E-6	2.1713085221929443E-4	0.1221554048935504	3.0880832315632986E-4
82-83	0.0039807322906870645	3.811852738960947E-4	9.650260098635308E-6	2.1713085221929443E-4	0.12366325803396216	3.0880832315632986E-4
84-85	0.004021745896106264	3.811852738960947E-4	9.650260098635308E-6	2.1713085221929443E-4	0.12519764938964517	3.0880832315632986E-4
86-87	0.004055521806451488	3.811852738960947E-4	9.650260098635308E-6	2.1713085221929443E-4	0.12662106275419388	3.0880832315632986E-4
88-89	0.004077234891673418	3.811852738960947E-4	9.650260098635308E-6	2.219559822686121E-4	0.12798898712317544	3.0880832315632986E-4
90-91	0.0040941228468460295	3.811852738960947E-4	9.650260098635308E-6	2.2678111231792976E-4	0.12967295751038732	3.136334532056475E-4
92-93	0.00413513645226523	3.811852738960947E-4	9.650260098635308E-6	2.2919367734258858E-4	0.13130626403208132	3.136334532056475E-4
94-95	0.0041930380128570414	3.835978389207535E-4	9.650260098635308E-6	2.316062423672474E-4	0.13272967739663002	3.136334532056475E-4
96-97	0.004255764703498171	3.9083553399472997E-4	9.650260098635308E-6	2.3884393744122388E-4	0.13410483946068558	3.136334532056475E-4
98-99	0.004371567824681795	3.9566066404404766E-4	9.650260098635308E-6	2.412565024658827E-4	0.13514948011636285	3.136334532056475E-4
100-101	0.004506671466062689	4.004857940933653E-4	9.650260098635308E-6	2.412565024658827E-4	0.13632681184839635	3.136334532056475E-4
102-103	0.004530797116309277	4.004857940933653E-4	9.650260098635308E-6	2.412565024658827E-4	0.13733526402870372	3.136334532056475E-4
104-105	0.004545272506457231	4.004857940933653E-4	9.650260098635308E-6	2.50906762564518E-4	0.13832924081886316	3.136334532056475E-4
106-107	0.004615236892172336	4.0531092414268293E-4	9.650260098635308E-6	2.65382152712471E-4	0.13946555894547746	3.136334532056475E-4
108-109	0.0046803761478381245	4.0772348916734175E-4	9.650260098635308E-6	2.8227010788508275E-4	0.14050296190608075	3.136334532056475E-4
110-111	0.004738277708429936	4.1496118424131826E-4	9.650260098635308E-6	2.8709523793440044E-4	0.14149935126126487	3.136334532056475E-4
112-113	0.00479135413897243	4.1496118424131826E-4	9.650260098635308E-6	2.8950780295905926E-4	0.1426284316928052	3.136334532056475E-4
114-115	0.004839605439465607	4.173737492659771E-4	9.650260098635308E-6	2.8950780295905926E-4	0.14386849011547984	3.136334532056475E-4
116-117	0.0048999195650820775	4.2219887931529477E-4	1.2062825123294135E-5	2.943329330083769E-4	0.14463568579332137	3.20871148279624E-4
118-119	0.00497712164587116	4.414993995125653E-4	1.4475390147952962E-5	2.991580630576946E-4	0.14538599351599024	3.2328371330428283E-4
120-121	0.005117050417301372	4.511496596112007E-4	1.4475390147952962E-5	2.991580630576946E-4	0.1462207410145222	3.2569627832894165E-4
122-123	0.005430683870507019	4.5597478966051834E-4	1.4475390147952962E-5	3.112208881809887E-4	0.14696381104211712	3.2810884335360047E-4
124-125	0.005519948776419396	4.5838735468517716E-4	1.4475390147952962E-5	3.136334532056475E-4	0.14775995750025453	3.3052140837825934E-4
126-127	0.005573025206961891	4.5838735468517716E-4	1.4475390147952962E-5	3.136334532056475E-4	0.1484596013574056	3.4258423350155343E-4
128-129	0.00563575189760302	4.5838735468517716E-4	1.4475390147952962E-5	3.136334532056475E-4	0.14911581904411278	3.474093635508711E-4
130-131	0.005799806319279821	4.5838735468517716E-4	1.4475390147952962E-5	3.136334532056475E-4	0.14977203673081999	3.4982192857552994E-4
132-133	0.005893896355241514	4.632124847344948E-4	1.4475390147952962E-5	3.136334532056475E-4	0.15038724081210797	3.570596236495064E-4
134-135	0.006014524606474456	4.680376147838125E-4	1.4475390147952962E-5	3.2328371330428283E-4	0.15130160295645367	3.570596236495064E-4
136-137	0.006205117243422503	4.825130049317654E-4	1.4475390147952962E-5	3.2569627832894165E-4	0.15203019759390066	3.570596236495064E-4
138-139	0.006214767503521138	5.042260901536948E-4	1.4475390147952962E-5	3.2810884335360047E-4	0.15273466658110102	3.570596236495064E-4
>>END_MODULE
