##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.control.4d.R.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	23585421
Total Bases	3.5 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	71-150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.33993881220098	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.69004030074341	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.83693256948858	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.79613478173656	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.673770631442196	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.66821469924154	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.66951300127312	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.81780019953852	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.80014259656421	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.771523238868625	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.77588006591021	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.78144136583357	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.768853861035595	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.75858727304465	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.75502206214593	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.68862302691141	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.600537035145564	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.56099824548394	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.55144517454236	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
60-64	34.527027285203005	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.50760633019864	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.482295509927965	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.462271462248	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.441356937225336	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.42142914480404	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.39627640136283	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.367659084282316	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.329703161495424	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.281650526184855	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.24843660436262	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.20520713807382	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.168285652546764	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
125-129	34.12620576027349	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.071310239286824	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.03008284725422	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.00039744557114	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.012248555252	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	34.92377861394806	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	10.0
22	308.0
23	3188.0
24	22041.0
25	87273.0
26	218382.0
27	390014.0
28	569017.0
29	739131.0
30	925537.0
31	1159824.0
32	1482751.0
33	1953445.0
34	2697247.0
35	4207083.0
36	8209788.0
37	920374.0
38	7.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.30118881490392	10.905533549729725	16.087900232944747	37.70537740242161
2	22.581825634812322	12.540493278128551	36.207024041487365	28.67065704557176
3	21.519324870756964	17.45490114439393	28.279410873077893	32.746363111771224
4	26.412929586005518	25.065316860494818	22.314438361917883	26.20731519158178
5	25.8851161652627	30.80716817818747	24.37552593432032	18.932189722229513
6	19.35231856024774	36.53138504254604	25.630013935321234	18.486282461884986
7	16.086208158291974	25.03979796295824	40.21435653903872	18.65963733971107
8	18.55147378718684	24.481597571853055	31.46526326697206	25.501665373988043
9	19.630136346248868	23.261315880497904	32.59204828208509	24.516499491168137
10-14	20.291947932129112	29.308021879665237	27.135102820095682	23.264927368109976
15-19	20.459364162551626	27.96583105864434	27.939407875112703	23.63539690369133
20-24	20.628965678790973	28.138501590409675	27.649665494324076	23.582867236475277
25-29	20.627538765773227	28.30959158228561	27.53264756294301	23.53022208899816
30-34	20.58589843552445	28.067558380407192	27.555032037199993	23.791511146868363
35-39	20.67574018250577	28.02963769219312	27.58604902420262	23.70857310109849
40-44	20.70285653114019	28.112912090875398	27.501655110123252	23.68257626786116
45-49	20.817455700892456	27.89929895948515	27.45467380638471	23.82857153323768
50-54	20.91344601378487	27.86792779225008	27.554647644632585	23.663978549332466
55-59	20.910882647209394	27.89281291166222	27.49056534126826	23.705739099860136
60-64	20.86057586807111	27.828139526754907	27.459023267670734	23.85226133750324
65-69	20.95332563092393	27.745000082084864	27.546762593344397	23.754911693646807
70-74	21.083395340786485	27.66699604645883	27.52409369875948	23.72551491399521
75-79	21.09452901274567	27.587243279628648	27.53149594063533	23.78673176699035
80-84	21.132477691903535	27.577037573522762	27.5102061597157	23.780278574858006
85-89	21.098814766396657	27.59686334116288	27.576350542045418	23.72797135039505
90-94	21.101292055360176	27.498459862236313	27.504456836325318	23.89579124607819
95-99	21.188171640808264	27.3780022041291	27.63677478192203	23.79705137314061
100-104	21.249968624178717	27.44446140434784	27.488937903009703	23.81663206846374
105-109	21.21392852721456	27.275175134703005	27.628568141488746	23.88232819659369
110-114	21.308984547326773	27.250148733346148	27.644565051560654	23.79630166776643
115-119	21.334801622286356	27.280192300750045	27.62258548256335	23.76242059440025
120-124	21.29476314244831	27.21738322384176	27.59442308041952	23.893430553290404
125-129	21.31444203061858	27.121634138672988	27.68494378296853	23.878980047739905
130-134	21.386606485646208	27.245321740016536	27.56992681945487	23.798144954882382
135-139	21.369818559030822	27.105172473101995	27.670810476042956	23.85419849182423
140-144	21.42516501945583	27.037341002424363	27.78232500318593	23.755168974933877
145-149	21.044594718641108	27.134674385332907	27.914870727126328	23.905860168899657
150	20.97318210958397	25.823671907235298	28.557976883887193	24.64516909929354
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	1.5
9	1.5
10	3.5
11	5.5
12	7.5
13	17.0
14	43.5
15	93.5
16	181.0
17	343.0
18	682.0
19	1256.0
20	2337.0
21	3972.0
22	6202.0
23	9873.0
24	15527.0
25	23976.0
26	35670.5
27	49987.5
28	67380.0
29	93462.0
30	126018.5
31	159811.5
32	191936.0
33	226229.5
34	264260.5
35	310624.0
36	383137.0
37	481841.5
38	598064.5
39	741189.0
40	904514.5
41	1062719.0
42	1224355.0
43	1394689.0
44	1533920.5
45	1614698.0
46	1632246.0
47	1591460.0
48	1506752.5
49	1381704.0
50	1221655.0
51	1049069.0
52	875751.5
53	702761.0
54	544683.5
55	413107.5
56	309770.0
57	231566.5
58	173708.0
59	128307.0
60	90129.5
61	63021.5
62	44663.5
63	29725.0
64	19445.5
65	13895.5
66	12019.5
67	8782.5
68	4510.0
69	2540.0
70	2229.5
71	1609.5
72	725.0
73	260.0
74	114.0
75	80.0
76	54.0
77	35.0
78	16.0
79	3.5
80	1.5
81	0.0
82	0.5
83	1.0
84	1.0
85	0.5
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.0599768390820753E-4
3	4.6638980919611315E-5
4	4.2399073563283013E-5
5	5.935870298859621E-5
6	1.2719722068984905E-4
7	1.8231601632211696E-4
8	1.1871740597719242E-4
9	1.1447749862086413E-4
10-14	2.1623527517274338E-4
15-19	3.0612131112690334E-4
20-24	2.1793123811527466E-4
25-29	3.9176743972473504E-4
30-34	9.064921927829908E-4
35-39	0.0010082499693348699
40-44	0.0012015897447834407
45-49	0.0010625207834958723
50-54	5.978269372422905E-4
55-59	4.0363918032245425E-4
60-64	2.5693838579349504E-4
65-69	3.1290516289702864E-4
70-74	3.476724356490969E-4
75-79	2.8153001079811744E-4
80-84	2.959459776650843E-4
85-89	3.5615316020677336E-4
90-94	3.926170958440742E-4
95-99	2.815318323378894E-4
100-104	4.5791529482876257E-4
105-109	2.476148142617958E-4
110-114	2.476162295105308E-4
115-119	2.1030592482077079E-4
120-124	2.0776399462015061E-4
125-129	1.3653279594929413E-4
130-134	1.8317915358815565E-4
135-139	1.6622839476122735E-4
140-144	1.5102403031585116E-4
145-149	1.591608211106761E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
70-71	3.0
72-73	2.0
74-75	3.0
76-77	10.0
78-79	4.0
80-81	16.0
82-83	11.0
84-85	9.0
86-87	8.0
88-89	15.0
90-91	17.0
92-93	26.0
94-95	26.0
96-97	29.0
98-99	43.0
100-101	51.0
102-103	51.0
104-105	59.0
106-107	43.0
108-109	44.0
110-111	67.0
112-113	73.0
114-115	87.0
116-117	75.0
118-119	80.0
120-121	126.0
122-123	110.0
124-125	169.0
126-127	168.0
128-129	228.0
130-131	271.0
132-133	376.0
134-135	538.0
136-137	915.0
138-139	2648.0
140-141	5819.0
142-143	9407.0
144-145	74369.0
146-147	758620.0
148-149	1415370.0
150-151	2.1315435E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	50.944767945176515
#Duplication Level	Percentage of total
1	39.15862088441103
2	10.912975232943827
3	6.670869997386471
4	4.674484379365965
5	3.3670061802015776
6	2.755071086181313
7	2.224454604702988
8	1.8266752685503511
9	1.665765442172451
>10	17.795342042988306
>50	4.2209821269131735
>100	4.002206232496501
>500	0.37154145926436843
>1k	0.33127044591319926
>5k	0.022734616508522158
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	2.1199536781641507E-5	0.0	4.239907356328301E-6	2.3319490459805658E-4	4.2399073563283013E-5
2	0.0	8.479814712656603E-5	0.0	2.1199536781641507E-5	0.0019757968280489885	5.511879563226792E-5
3	4.239907356328301E-6	9.751786919555092E-5	0.0	2.1199536781641507E-5	0.003179930517246226	8.479814712656603E-5
4	2.967935149429811E-5	1.1023759126453583E-4	0.0	2.967935149429811E-5	0.004536700871271282	8.903805448289432E-5
5	2.967935149429811E-5	1.1023759126453583E-4	0.0	2.967935149429811E-5	0.0058044331708134445	1.1023759126453583E-4
6	6.359861034492451E-5	1.1023759126453583E-4	0.0	3.815916620695471E-5	0.006928008620240444	1.2295731333352073E-4
7	8.055823977023772E-5	1.4839675747149055E-4	0.0	3.815916620695471E-5	0.008132142309437682	1.2295731333352073E-4
8	8.479814712656603E-5	1.6111647954047544E-4	0.0	3.815916620695471E-5	0.010298734968521444	1.3143712804617735E-4
9	1.1447749862086413E-4	1.6111647954047544E-4	0.0	3.815916620695471E-5	0.013847537425768231	1.3991694275883394E-4
10-11	1.5263666482781885E-4	1.7383620160946035E-4	0.0	4.0279119885118866E-5	0.018526275193476514	2.0139559942559433E-4
12-13	2.0775546046008676E-4	1.801960626439528E-4	0.0	4.2399073563283013E-5	0.02236551130463179	2.2471508988539996E-4
14-15	2.2047518252907167E-4	1.8231601632211696E-4	0.0	4.2399073563283013E-5	0.026652057641879702	2.6075430241419056E-4
16-17	2.5439444137969805E-4	1.97155692069266E-4	0.0	4.2399073563283013E-5	0.03113787962487504	2.755939781613396E-4
18-19	2.9043365390848865E-4	2.1199536781641505E-4	0.0	4.2399073563283013E-5	0.03497711573603032	2.798338855176679E-4
20-21	3.51912310575249E-4	2.6075430241419056E-4	0.0	4.2399073563283013E-5	0.03853863791534609	2.798338855176679E-4
22-23	4.345905040236509E-4	2.713540708050113E-4	0.0	4.2399073563283013E-5	0.04241391323903016	2.967935149429811E-4
24-25	5.109088364375603E-4	2.81953839195832E-4	0.0	4.2399073563283013E-5	0.047171089292830516	3.0739328333380183E-4
26-27	5.681475857479924E-4	2.840737928739962E-4	0.0	4.6638980919611315E-5	0.05163147183168789	3.264728664372792E-4
28-29	6.020668445986188E-4	2.8831370023032446E-4	0.0	4.875893459777547E-5	0.056125773629395886	3.4979235689708483E-4
30-31	6.699053622998716E-4	2.8831370023032446E-4	0.0	5.935870298859622E-5	0.06072819306469026	3.94311384138532E-4
32-33	7.335039726447961E-4	2.925536075866528E-4	0.0	5.935870298859622E-5	0.0650316990313635	4.5790999448345657E-4
34-35	7.631833241390942E-4	2.967935149429811E-4	0.0	6.359861034492451E-5	0.0685911012570011	4.960691606904113E-4
36-37	7.865028145989E-4	3.0315337597747356E-4	0.0	6.571856402308866E-5	0.07229466033275386	5.193886511502169E-4
38-39	8.098223050587056E-4	3.09513237011966E-4	0.0	8.055823977023772E-5	0.07638829088528884	5.34228326897366E-4
40-41	8.691810080473018E-4	3.09513237011966E-4	0.0	8.903805448289432E-5	0.07982897570494926	5.384682342536943E-4
42-43	8.776608227599584E-4	3.1163319069013015E-4	0.0	8.903805448289432E-5	0.08329509996874765	5.405881879318585E-4
44-45	9.200598963232414E-4	3.222329590809509E-4	0.0	8.903805448289432E-5	0.08719581473656968	5.469480489663508E-4
46-47	9.666988772428527E-4	3.222329590809509E-4	0.0	8.903805448289432E-5	0.09127884552071383	5.63907678391664E-4
48-49	0.0010027380897716432	3.349526811499358E-4	0.0	8.903805448289432E-5	0.0953788359342833	5.681475857479924E-4
50-51	0.0010196977191969563	3.582721716097415E-4	0.0	8.903805448289432E-5	0.09961238342957712	5.745074467824848E-4
52-53	0.0010854162832200451	3.688719400005622E-4	0.0	8.903805448289432E-5	0.10381413161969846	5.893471225296338E-4
54-55	0.0011617346156339546	3.7735175471321884E-4	0.0	8.903805448289432E-5	0.10714033894073802	5.935870298859622E-4
56-57	0.0012020137355190734	3.837116157477113E-4	0.0	8.903805448289432E-5	0.11109193259683599	6.063067519549471E-4
58-59	0.0012359329943696998	4.0279119885118866E-4	0.0	9.115800816105848E-5	0.11503504643822131	6.169065203457678E-4
60-61	0.00129741165103646	4.133909672420094E-4	2.1199536781641507E-6	9.327796183922263E-5	0.11838033334236434	6.296262424147528E-4
62-63	0.0013546504003468924	4.3247055034548675E-4	4.239907356328301E-6	9.327796183922263E-5	0.12166838149719694	6.381060571274094E-4
64-65	0.001390689612875683	4.36710457701815E-4	4.239907356328301E-6	9.327796183922263E-5	0.12609272482352551	6.402260108055735E-4
66-67	0.001420368964369981	4.6426985551794903E-4	4.239907356328301E-6	9.327796183922263E-5	0.1298895618611175	6.402260108055735E-4
68-69	0.0014860875283930696	4.897092996559187E-4	4.239907356328301E-6	1.0175777655187923E-4	0.132698500484685	6.656654549435433E-4
70-71	0.001536966416669009	5.045489754030678E-4	4.239907356328301E-6	1.1447749862086413E-4	0.13537388202652817	6.699053622998716E-4
72-73	0.0015730056291978	5.172686974720528E-4	4.239907356328301E-6	1.1659745229902828E-4	0.13824429930676244	6.805051306906924E-4
74-75	0.0016111647954047544	5.299884195410377E-4	4.239907356328301E-6	1.1871740597719244E-4	0.14148994838803175	6.868649917251849E-4
76-77	0.0016366042395427243	5.342283268973659E-4	4.239907356328301E-6	1.2295731333352073E-4	0.14398937377458726	6.868649917251849E-4
78-79	0.001672643452071515	5.342283268973659E-4	4.239907356328301E-6	1.3567703540250564E-4	0.14640188106033808	6.911048990815131E-4
80-81	0.0016959629425313204	5.384682342536943E-4	4.239907356328301E-6	1.3567703540250564E-4	0.14913450135149167	6.932248527596772E-4
82-83	0.0017192824329911262	5.384682342536943E-4	4.239907356328301E-6	1.3567703540250564E-4	0.1517229647925301	6.974647601160056E-4
84-85	0.0017659214139107374	5.448280952881867E-4	4.239907356328301E-6	1.3567703540250564E-4	0.1542478296232236	6.995847137941697E-4
86-87	0.0018634392831062886	5.469480489663508E-4	4.239907356328301E-6	1.3567703540250564E-4	0.15627874524690485	6.995847137941697E-4
88-89	0.001916438125060392	5.469480489663508E-4	6.359861034492452E-6	1.3779698908066978E-4	0.158528016099437	7.03824621150498E-4
90-91	0.0019333977544857054	5.533079100008433E-4	8.479814712656603E-6	1.3991694275883394E-4	0.16138783361128045	7.101844821849905E-4
92-93	0.0019609571523018397	5.596677710353358E-4	8.479814712656603E-6	1.462768037933264E-4	0.16403353580162933	7.229042042539754E-4
94-95	0.002016075947934107	5.63907678391664E-4	8.479814712656603E-6	1.505167111496547E-4	0.1671456278011743	7.250241579321395E-4
96-97	0.0020754346509227035	5.745074467824848E-4	8.479814712656603E-6	1.54756618505983E-4	0.1697171316127874	7.292640652884679E-4
98-99	0.0021877921958654034	5.787473541388131E-4	1.0599768390820753E-5	1.5687657218414714E-4	0.17182648552256075	7.335039726447961E-4
100-101	0.002255630713566656	5.893471225296338E-4	1.2719722068984904E-5	1.5687657218414714E-4	0.17397823850589733	7.335039726447961E-4
102-103	0.002293789879773611	5.935870298859622E-4	1.2719722068984904E-5	1.5899652586231128E-4	0.17594979542659	7.335039726447961E-4
104-105	0.00233406899965873	5.978269372422905E-4	1.2719722068984904E-5	1.6111647954047544E-4	0.1777072370257881	7.356239263229603E-4
106-107	0.002389187795290998	6.084267056331112E-4	1.2719722068984904E-5	1.6111647954047544E-4	0.1794053199219976	7.377438800011244E-4
108-109	0.002473985942417564	6.105466593112754E-4	1.2719722068984904E-5	1.632364332186396E-4	0.1811712413359083	7.419837873574528E-4
110-111	0.0025291047380498317	6.169065203457678E-4	1.2719722068984904E-5	1.6535638689680376E-4	0.18278452608499124	7.419837873574528E-4
112-113	0.002575743718969443	6.232663813802603E-4	1.2719722068984904E-5	1.6535638689680376E-4	0.18458648671143074	7.46223694713781E-4
114-115	0.0026563019587396808	6.33866149771081E-4	1.2719722068984904E-5	1.717162479312962E-4	0.18650504479016933	7.504636020701093E-4
116-117	0.0027114207543719486	6.465858718400659E-4	1.2719722068984904E-5	1.9079583103477355E-4	0.18839392351741358	7.525835557482735E-4
118-119	0.002815298484601992	6.805051306906924E-4	1.2719722068984904E-5	1.9927564574743014E-4	0.18992665002672626	7.547035094264377E-4
120-121	0.002906456492763051	6.932248527596772E-4	1.2719722068984904E-5	2.0351555310375846E-4	0.19157597398833798	7.568234631046018E-4
122-123	0.0030718128796598542	6.953448064378414E-4	1.2719722068984904E-5	2.0775546046008676E-4	0.19313201998811044	7.58943416782766E-4
124-125	0.0031735706562117335	6.953448064378414E-4	1.2719722068984904E-5	2.0775546046008676E-4	0.1946138676091472	7.610633704609301E-4
126-127	0.003226569498165837	6.953448064378414E-4	1.2719722068984904E-5	2.0775546046008676E-4	0.19603635652719534	7.674232314954225E-4
128-129	0.0032880481548325977	6.953448064378414E-4	1.2719722068984904E-5	2.0775546046008676E-4	0.1974037266496112	7.674232314954225E-4
130-131	0.0033686063946028353	6.974647601160056E-4	1.2719722068984904E-5	2.1411532149457921E-4	0.19887497450225713	7.674232314954225E-4
132-133	0.0034809639395455352	7.080645285068263E-4	1.6959629425313205E-5	2.2471508988539996E-4	0.20009182791352337	7.674232314954225E-4
134-135	0.0036569200948331597	7.101844821849905E-4	1.6959629425313205E-5	2.2471508988539996E-4	0.20131928109318042	7.716631388517509E-4
136-137	0.0037925971302356655	7.271441116103037E-4	1.6959629425313205E-5	2.2471508988539996E-4	0.20242165700582576	7.716631388517509E-4
138-139	0.0038201565280517997	7.610633704609301E-4	1.6959629425313205E-5	2.2471508988539996E-4	0.20340743546617207	7.716631388517509E-4
>>END_MODULE
