##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.control.4d.R.3.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	22805127
Total Bases	3.4 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	69-150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.4135630992101	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.67810790968189	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.86322645780486	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.814126226966415	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.681941214359384	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.66354859589249	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.67391893936833	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.79902120255677	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.78467210465436	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.75687257518891	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.758759528065774	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.76013207907152	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.74905066742228	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.73383660612809	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.72926138056587	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.65884851244196	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
45-49	34.56875329832629	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
50-54	34.526744306225524	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
55-59	34.51638416221054	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.48905060690958	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.46774790598623	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.44117898415169	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.42004921538497	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.3980646472247	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.375847137929085	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.34802123536255	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.31680832374015	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.27842665746358	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.22819104532583	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
110-114	34.192021214307196	35.0	34.0	37.0	29.4	39.0
115-119	34.14623055602319	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
120-124	34.10733669521604	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
125-129	34.06247149523887	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.00509057903746	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	33.961473578851574	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	33.92618341087565	35.0	34.0	37.0	28.6	39.0
145-149	33.93912894740863	35.0	34.0	37.0	28.4	39.0
150	34.88763587669371	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	12.0
22	265.0
23	3168.0
24	22111.0
25	87703.0
26	219939.0
27	393951.0
28	571728.0
29	742947.0
30	922400.0
31	1153762.0
32	1463902.0
33	1907970.0
34	2600168.0
35	3970131.0
36	7730272.0
37	1014693.0
38	5.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	34.68254748153781	11.38764541850611	13.61388603536389	40.31592106459219
2	21.969118483946	13.478534492594592	37.83462364423954	26.717723379219855
3	20.229008303050648	18.00069651050168	28.48688925535643	33.283405931091245
4	25.445900983897516	25.919610417292716	22.587437495941153	26.04705110286861
5	25.254665388532686	31.197918221964265	24.812790951646342	18.7346254378567
6	18.601597072514608	36.40795101060942	26.65302819750722	18.33742371936875
7	15.840640474616894	24.40517659918699	40.6691436577662	19.085039268429924
8	18.034441317513544	24.28534325356656	32.19358434112286	25.486631087797036
9	19.39792074616279	23.15608383105817	33.032684262259885	24.413311160519154
10-14	20.26930553763923	29.192707019892783	27.109482269792956	23.42850517267503
15-19	20.405063790695483	28.033502228673036	27.92447374594662	23.63696023468486
20-24	20.57752669067266	28.168567754553386	27.636822261395167	23.61708329337879
25-29	20.529592285131713	28.363679805379206	27.567976054702143	23.53875185478694
30-34	20.53511000680388	28.065310346241073	27.54688989165665	23.852689755298393
35-39	20.619697330929696	28.081107280990008	27.607237337122225	23.691958050958068
40-44	20.66414944897801	28.141025475743742	27.516614747034723	23.678210328243523
45-49	20.756844528334817	27.92135460391289	27.467013551257306	23.85478731649499
50-54	20.86473241591374	27.888277023835155	27.586769356579737	23.660221203671362
55-59	20.877357656837205	27.929190941761618	27.494218401629695	23.699232999771482
60-64	20.81341959334598	27.83592660062655	27.48238674295299	23.868267063074484
65-69	20.93209966765789	27.76980566606663	27.5552163987784	23.74287826749708
70-74	21.029409194324437	27.715799221945613	27.547710926439052	23.707080657290895
75-79	21.04326952759949	27.60086008997303	27.551388604351594	23.80448177807588
80-84	21.080580859548053	27.633961120245793	27.52816078171523	23.757297238490928
85-89	21.079502109262293	27.643761820276207	27.55887775671387	23.717858313747634
90-94	21.0561890728936	27.52489397492625	27.522510280427976	23.896406671752175
95-99	21.155309436091102	27.4300084081943	27.645969047243728	23.768713108470862
100-104	21.22182066984589	27.510640776450064	27.48882955374896	23.77870899995509
105-109	21.173426082986015	27.310290709212243	27.638572574552185	23.87771063324956
110-114	21.28005860874429	27.312146499829996	27.654754090102294	23.753040801323415
115-119	21.306795907312505	27.360894928700645	27.60571891401401	23.72659024997284
120-124	21.247223713333508	27.26654893655335	27.621768743137288	23.864458606975862
125-129	21.280512498215852	27.184887482001326	27.720710237322464	23.813889782460354
130-134	21.36347944607143	27.325146669683818	27.56324052951067	23.748133354734083
135-139	21.347583475601876	27.17079237763111	27.681237301471846	23.80038684529517
140-144	21.41309560445703	27.126388851228945	27.794915319530222	23.6656002247838
145-149	21.01152852577822	27.28424866729055	27.914075683654143	23.790147123277087
150	20.89364577976648	25.898207570889298	28.647595625080243	24.56055102426398
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	1.0
9	2.0
10	2.5
11	6.0
12	16.0
13	27.0
14	51.5
15	91.5
16	173.5
17	356.0
18	676.5
19	1271.0
20	2477.5
21	4225.0
22	6512.5
23	10062.0
24	15660.5
25	24174.5
26	35603.5
27	49446.5
28	66364.0
29	92356.0
30	125260.5
31	158947.5
32	189157.5
33	221354.0
34	259085.0
35	304347.0
36	375585.0
37	472787.5
38	587019.5
39	728973.5
40	888792.0
41	1041786.0
42	1198203.5
43	1359565.0
44	1489311.0
45	1562996.0
46	1575512.5
47	1530657.5
48	1445674.5
49	1325611.5
50	1169113.5
51	1002635.0
52	836064.5
53	668635.5
54	516911.5
55	390689.5
56	291855.0
57	217912.0
58	163568.5
59	121168.5
60	85646.5
61	59682.0
62	42117.5
63	27667.0
64	17804.5
65	12741.5
66	11328.5
67	8425.5
68	4426.5
69	2411.0
70	1905.5
71	1222.0
72	536.0
73	249.0
74	108.0
75	68.0
76	37.0
77	21.0
78	9.0
79	2.0
80	0.5
81	0.5
82	0.5
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.271643872011763E-4
3	6.577468303509118E-5
4	3.507983095204863E-5
5	2.6309873214036477E-5
6	1.1400945059415807E-4
7	1.710141758912371E-4
8	7.892961964210942E-5
9	1.0085451398713982E-4
10-14	1.7890713785544804E-4
15-19	3.376433729134681E-4
20-24	1.9381606601006872E-4
25-29	3.586912714846973E-4
30-34	8.822577484440231E-4
35-39	9.646953511813374E-4
40-44	0.0011655273833818158
45-49	0.0010173150976094103
50-54	5.910951515420194E-4
55-59	4.4375986154341523E-4
60-64	2.648527236879672E-4
65-69	3.165954743422389E-4
70-74	3.797392066891912E-4
75-79	2.63975852927248E-4
80-84	2.946709521294673E-4
85-89	3.525532162636236E-4
90-94	3.771099223417537E-4
95-99	3.0431968461886485E-4
100-104	4.2359372496148895E-4
105-109	2.727503931267181E-4
110-114	2.403027112548055E-4
115-119	2.0434699378954406E-4
120-124	2.3066054101263258E-4
125-129	1.4295953621540868E-4
130-134	1.8155520663626907E-4
135-139	1.55253635671749E-4
140-144	1.4829952351363095E-4
145-149	1.3870299580305315E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
68-69	1.0
70-71	2.0
72-73	0.0
74-75	3.0
76-77	8.0
78-79	6.0
80-81	9.0
82-83	10.0
84-85	15.0
86-87	12.0
88-89	17.0
90-91	23.0
92-93	17.0
94-95	25.0
96-97	30.0
98-99	36.0
100-101	43.0
102-103	48.0
104-105	57.0
106-107	62.0
108-109	59.0
110-111	71.0
112-113	86.0
114-115	93.0
116-117	89.0
118-119	100.0
120-121	124.0
122-123	143.0
124-125	179.0
126-127	194.0
128-129	251.0
130-131	309.0
132-133	407.0
134-135	619.0
136-137	949.0
138-139	2674.0
140-141	5762.0
142-143	9670.0
144-145	72756.0
146-147	740569.0
148-149	1422845.0
150-151	2.0546754E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	50.70737724331662
#Duplication Level	Percentage of total
1	38.960431988667466
2	10.827851720543242
3	6.650358739811576
4	4.683593810052116
5	3.4407956110785993
6	2.729481040795494
7	2.228495314294914
8	1.8209920879658725
9	1.6713396856735971
>10	17.74963167711374
>50	4.248063855963191
>100	4.158745399734266
>500	0.42264667324657973
>1k	0.3599339462052167
>5k	0.04763844885405964
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.384978869006079E-6	2.6309873214036474E-5	0.0	4.384978869006079E-6	1.7539915476024316E-4	1.7539915476024316E-5
2	4.384978869006079E-6	9.208455624912766E-5	0.0	8.769957738012158E-6	0.0020346301952188207	2.6309873214036474E-5
3	8.769957738012158E-6	1.0962447172515197E-4	0.0	1.3154936607018237E-5	0.0031089500181253104	5.700472529707903E-5
4	2.6309873214036474E-5	1.3154936607018237E-4	0.0	1.3154936607018237E-5	0.004792781903823645	6.577468303509118E-5
5	3.507983095204863E-5	1.3154936607018237E-4	0.0	1.7539915476024316E-5	0.00589341159994417	6.577468303509118E-5
6	3.946480982105471E-5	1.4031932380819453E-4	0.0	1.7539915476024316E-5	0.0069940412960646965	7.892961964210942E-5
7	4.384978869006079E-5	1.5347426041521276E-4	0.0	1.7539915476024316E-5	0.008090286013316217	8.769957738012158E-5
8	5.700472529707903E-5	1.5347426041521276E-4	0.0	1.7539915476024316E-5	0.010366090046330372	9.646953511813374E-5
9	6.13897041660851E-5	1.5347426041521276E-4	0.0	1.7539915476024316E-5	0.014018777444212436	1.0085451398713982E-4
10-11	1.3374185550468542E-4	1.66629197022231E-4	0.0	1.7539915476024316E-5	0.01857257799967525	1.6443670758772795E-4
12-13	1.732066653257401E-4	1.8197662306375226E-4	0.0	1.7539915476024316E-5	0.022473016703656156	2.060940068432857E-4
14-15	1.7978413362924924E-4	1.9513155967077053E-4	0.0	1.7539915476024316E-5	0.02714959666745114	2.3678885892632827E-4
16-17	2.1267147514679484E-4	2.170564540158009E-4	0.0	2.1924894345030395E-5	0.03168585730743793	2.6309873214036474E-4
18-19	2.345963694918252E-4	2.21441432884807E-4	0.0	2.1924894345030395E-5	0.035347314663058	2.6748371100937085E-4
20-21	2.872161159198982E-4	2.609062427058617E-4	4.384978869006079E-6	2.1924894345030395E-5	0.03882241041674532	2.76253668747383E-4
22-23	3.814931616035289E-4	2.872161159198982E-4	4.384978869006079E-6	2.1924894345030395E-5	0.04289386329661747	2.9160109478890427E-4
24-25	4.757702072871596E-4	2.937935842234073E-4	4.384978869006079E-6	2.1924894345030395E-5	0.04744108638377677	3.0475603139592253E-4
26-27	5.525073374947659E-4	2.937935842234073E-4	4.384978869006079E-6	2.1924894345030395E-5	0.05195103715054952	3.376433729134681E-4
28-29	5.722397424052933E-4	2.937935842234073E-4	4.384978869006079E-6	2.1924894345030395E-5	0.05628120378369303	3.705307144310137E-4
30-31	6.160895310953541E-4	2.937935842234073E-4	4.384978869006079E-6	3.727232038655167E-5	0.06030880687487511	3.9684058764505016E-4
32-33	6.511693620474027E-4	3.025635419614195E-4	4.384978869006079E-6	4.384978869006079E-5	0.0644109546068303	4.5823029181113527E-4
34-35	6.950191507374636E-4	3.025635419614195E-4	4.384978869006079E-6	5.042725699356991E-5	0.06801102225828429	4.8454016502517174E-4
36-37	7.037891084754758E-4	3.0475603139592253E-4	4.384978869006079E-6	5.261974642807295E-5	0.07169659699768391	4.998875910666931E-4
38-39	7.125590662134879E-4	3.0694852083042553E-4	4.384978869006079E-6	6.577468303509118E-5	0.0760311486096964	5.086575488047052E-4
40-41	7.520238760345425E-4	3.091410102649286E-4	4.384978869006079E-6	6.577468303509118E-5	0.0797693430955241	5.152350171082143E-4
42-43	7.629863232070578E-4	3.1352598913393463E-4	4.384978869006079E-6	6.577468303509118E-5	0.08341764551453715	5.174275065427174E-4
44-45	7.805262386830821E-4	3.2448843630644985E-4	4.384978869006079E-6	6.577468303509118E-5	0.08758776041896194	5.218124854117234E-4
46-47	8.24376027373143E-4	3.2887341517545595E-4	4.384978869006079E-6	6.577468303509118E-5	0.09194204443588497	5.327749325842386E-4
48-49	8.528783900216823E-4	3.376433729134681E-4	4.384978869006079E-6	6.577468303509118E-5	0.09601130482632261	5.50314848060263E-4
50-51	8.704183054977067E-4	3.551832883894924E-4	4.384978869006079E-6	6.577468303509118E-5	0.1002647343292585	5.56892316363772E-4
52-53	9.296155202292889E-4	3.595682672584985E-4	4.384978869006079E-6	7.015966190409726E-5	0.10460805589900903	5.590848057982751E-4
54-55	9.822352666573617E-4	3.595682672584985E-4	4.384978869006079E-6	7.015966190409726E-5	0.10801079950135774	5.656622741017842E-4
56-57	0.0010063526504368952	3.7272320386551674E-4	4.384978869006079E-6	7.015966190409726E-5	0.11208882984953339	5.722397424052933E-4
58-59	0.0010260850553474225	3.9464809821054716E-4	4.384978869006079E-6	7.673713020760638E-5	0.11604408078937689	5.744322318397963E-4
60-61	0.001065549865168477	4.056105453830623E-4	4.384978869006079E-6	7.892961964210942E-5	0.11958714371553379	5.744322318397963E-4
62-63	0.001102822185555029	4.209579714245836E-4	4.384978869006079E-6	7.892961964210942E-5	0.1228407980363363	5.744322318397963E-4
64-65	0.0011181696115965503	4.209579714245836E-4	4.384978869006079E-6	7.892961964210942E-5	0.12719288956382485	5.744322318397963E-4
66-67	0.0011466719742450897	4.2753543972809274E-4	4.384978869006079E-6	7.892961964210942E-5	0.1312051452289654	5.744322318397963E-4
68-69	0.0012058691889766718	4.516528235076261E-4	4.384978869006079E-6	8.112210907661246E-5	0.13412334866628894	5.897796578813177E-4
70-71	0.001278221340315272	4.7796269672166264E-4	8.769957738012158E-6	9.208455624912766E-5	0.1369757774205774	5.963571261848267E-4
72-73	0.0013220711290053329	4.889251438941778E-4	8.769957738012158E-6	9.646953511813374E-5	0.1400123752873641	6.029345944883359E-4
74-75	0.0013681134071298969	4.976951016321899E-4	8.769957738012158E-6	1.0085451398713982E-4	0.14312132530548943	6.05127083922839E-4
76-77	0.001394423280343933	5.108500382392082E-4	8.769957738012158E-6	1.0743198229064894E-4	0.1455637585355258	6.05127083922839E-4
78-79	0.001449235516206509	5.174275065427173E-4	8.769957738012158E-6	1.2497189776667326E-4	0.147861487462885	6.11704552226348E-4
80-81	0.0015062402415035882	5.261974642807295E-4	8.769957738012158E-6	1.2935687663567932E-4	0.15053413208354421	6.204745099643602E-4
82-83	0.001552282519628152	5.327749325842386E-4	8.769957738012158E-6	1.3154936607018237E-4	0.15326597391893498	6.226669993988633E-4
84-85	0.0016268271604012554	5.349674220187417E-4	8.769957738012158E-6	1.3154936607018237E-4	0.1557105996384059	6.226669993988633E-4
86-87	0.0016860243751328375	5.415448903222507E-4	8.769957738012158E-6	1.3154936607018237E-4	0.1578855491574329	6.226669993988633E-4
88-89	0.0017386441215609103	5.459298691912568E-4	8.769957738012158E-6	1.3374185550468542E-4	0.1600648836553289	6.292444677023724E-4
90-91	0.0017759164419474621	5.546998269292691E-4	8.769957738012158E-6	1.3593434493918845E-4	0.16311025147985364	6.336294465713784E-4
92-93	0.0018022263151614985	5.612772952327781E-4	8.769957738012158E-6	1.3593434493918845E-4	0.1658333233575064	6.358219360058815E-4
94-95	0.0018855409136726141	5.634697846672812E-4	8.769957738012158E-6	1.3593434493918845E-4	0.16887869118203114	6.358219360058815E-4
96-97	0.0019622780438802202	5.700472529707903E-4	8.769957738012158E-6	1.3593434493918845E-4	0.17149433107739326	6.358219360058815E-4
98-99	0.002052170110694845	5.744322318397964E-4	8.769957738012158E-6	1.3593434493918845E-4	0.17351799882543956	6.358219360058815E-4
100-101	0.002117944793729936	5.875871684468146E-4	8.769957738012158E-6	1.3593434493918845E-4	0.175660061002949	6.358219360058815E-4
102-103	0.0021398696880749668	5.875871684468146E-4	8.769957738012158E-6	1.4251181324269758E-4	0.17782185558536903	6.467843831783966E-4
104-105	0.0021859119661995306	5.897796578813177E-4	8.769957738012158E-6	1.556667498497158E-4	0.1797512462877317	6.533618514819058E-4
106-107	0.002251686649234622	5.963571261848267E-4	8.769957738012158E-6	1.66629197022231E-4	0.1815556650923277	6.577468303509119E-4
108-109	0.002339386226614743	5.963571261848267E-4	8.769957738012158E-6	1.66629197022231E-4	0.18345436094260734	6.577468303509119E-4
110-111	0.002422700825125859	6.007421050538328E-4	8.769957738012158E-6	1.7101417589123708E-4	0.1850746106347051	6.59939319785415E-4
112-113	0.002486283018726447	6.07319573357342E-4	1.0962447172515197E-5	1.7101417589123708E-4	0.18688560690760458	6.643242986544211E-4
114-115	0.002532325296851011	6.11704552226348E-4	1.3154936607018237E-5	1.7539915476024316E-4	0.1887777252895807	6.687092775234271E-4
116-117	0.002558635170065047	6.314369571368754E-4	1.3154936607018237E-5	1.8416911249825532E-4	0.19046813464358256	6.752867458269362E-4
118-119	0.0026507197263141748	6.621318092199179E-4	1.3154936607018237E-5	1.9074658080176442E-4	0.19210592425115633	6.752867458269362E-4
120-121	0.0027362268142597933	6.752867458269362E-4	1.3154936607018237E-5	1.9732404910527355E-4	0.193691094112302	6.752867458269362E-4
122-123	0.002909433479585534	6.774792352614393E-4	1.3154936607018237E-5	2.0170902797427963E-4	0.1951732169700261	6.796717246959423E-4
124-125	0.002992748078096649	6.818642141304453E-4	1.3154936607018237E-5	2.0170902797427963E-4	0.19672330700021973	6.818642141304453E-4
126-127	0.0030387903562212127	6.928266613029605E-4	1.3154936607018237E-5	2.0170902797427963E-4	0.19827120454097888	6.840567035649483E-4
128-129	0.003093602592083789	6.972116401719666E-4	1.3154936607018237E-5	2.104789857122918E-4	0.1995976606488532	6.862491929994514E-4
130-131	0.0031725322117258986	7.015966190409726E-4	1.3154936607018237E-5	2.1924894345030395E-4	0.20099208392919715	6.884416824339544E-4
132-133	0.00326023178910602	7.081740873444818E-4	1.3154936607018237E-5	2.280189011883161E-4	0.2022637278012089	6.884416824339544E-4
134-135	0.0034268609861282506	7.103665767789849E-4	1.3154936607018237E-5	2.324038800573222E-4	0.20343232466979905	6.884416824339544E-4
136-137	0.0035825277359779664	7.235215133860031E-4	1.3154936607018237E-5	2.324038800573222E-4	0.2046338088799067	6.884416824339544E-4
138-139	0.0035869127148469727	7.410614288620274E-4	1.3154936607018237E-5	2.345963694918252E-4	0.20584625553718688	6.884416824339544E-4
>>END_MODULE
