##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.control.4d.S.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24091839
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	73-150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.48695689025649	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.827027027700126	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.98331198378007	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.957090199714514	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.82013955016053	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.778772429950244	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.77760240718859	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.91964926380257	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.905015221129446	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.88909253461307	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
15-19	34.89719624973419	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.89977152844165	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.89870134861851	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.88050346841518	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.876833885532776	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.81296128535477	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.72043631870527	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.68378502778472	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.68132224360291	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.65054240151613	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.63619946156871	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.609432346067436	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
75-79	34.59237716305797	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.56489263837193	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.5493798782684	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.52109498142989	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.490460879023516	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.44954592758485	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.398292051300594	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.367031904580536	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.31840597406824	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.28189885814332	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.230261104335646	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.17798666767741	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.12778423498846	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.097133096449134	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.10335176260407	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	35.01978264548599	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	11.0
22	301.0
23	3011.0
24	20923.0
25	84428.0
26	210710.0
27	383748.0
28	561385.0
29	732516.0
30	909594.0
31	1135841.0
32	1444049.0
33	1880820.0
34	2575641.0
35	4013410.0
36	8715438.0
37	1420005.0
38	7.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.14148758008884	11.618029657262777	15.458612354166904	36.781870408481474
2	23.37212397559054	12.288218978343966	35.057129587664384	29.28252745840111
3	21.944395926387	15.927672084049066	27.46610552489325	34.66182646467068
4	26.8307834302839	22.940481360673665	22.134220516489595	28.094514692552842
5	27.052068933570517	29.055225023983233	24.195233471659606	19.697472570786648
6	20.413170130491185	36.0929118718682	25.354175207774887	18.13974278986572
7	16.78059963729563	25.249473918446185	39.02536618584326	18.944560258414928
8	18.799969284154773	25.57013174607128	30.92014710399389	24.709751865780056
9	19.673079840601464	24.097333471969627	32.13117816154573	24.09840852588317
10-14	20.54798379076712	29.30687429493127	26.99087716990115	23.154264744400464
15-19	20.861932966871834	28.140688733249398	27.42531169791857	23.572066601960202
20-24	20.83279144746958	28.271414561439045	27.283132628439237	23.612661362652133
25-29	20.770010818885705	28.368658592243502	27.00307468609122	23.858255902779575
30-34	20.787819399475165	28.143617926243376	27.1760421788258	23.892520495455656
35-39	21.06821668715083	27.854290454688947	27.132236936115888	23.945255922044336
40-44	21.153271615515195	27.960261143476494	26.982424235782922	23.904043005225393
45-49	21.467028409981165	27.80721169586538	26.892166987976022	23.83359290617743
50-54	21.440063171945432	28.043493140606436	26.794463339604786	23.721980347843346
55-59	21.31060661316572	27.976074915914317	26.911951499251884	23.801366971668077
60-64	21.518411043384262	27.74156334239593	26.72626908482315	24.01375652939666
65-69	21.392102177062743	27.86809725906653	26.873756587479658	23.86604397639107
70-74	21.70832094251127	27.587297039081797	26.864903880565556	23.839478137841375
75-79	21.597672625151663	27.3964108959139	26.86691038815526	24.13900609077918
80-84	21.8056835766213	27.375141408435194	26.90887119136966	23.91030382357384
85-89	21.668992295973297	27.294023037905152	26.983009533537437	24.053975132584114
90-94	21.725592093915587	27.044952924878608	26.892431153698087	24.337023827507718
95-99	21.909167472964633	27.035552240429126	27.08063602277807	23.974644263828164
100-104	21.884252684352234	26.814243918671476	27.201539752605893	24.099963644370398
105-109	21.948413387851083	26.715117020433	27.120562413222082	24.215907178493833
110-114	21.914019026577126	26.76118837547324	27.09798482830323	24.226807769646406
115-119	22.070863887224068	26.86156662422733	27.04756876844604	24.020000720102566
120-124	21.963938802634527	26.727218683111737	27.000995287134515	24.30784722711922
125-129	22.35226749677294	26.65420751214474	26.921361840842362	24.072163150239955
130-134	22.142529989494147	26.837673491844377	26.815302030051996	24.20449448860948
135-139	22.224846124946293	26.733931716554444	26.7732019698511	24.268020188648162
140-144	22.170723097628432	26.490825664260285	27.077349768296717	24.261101469814566
145-149	21.696611294157716	26.720620307684396	27.283105352149473	24.29966304600842
150	21.453784631781666	25.4302838896467	28.00127141981841	25.11466005875323
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	1.5
10	3.5
11	5.0
12	16.5
13	25.5
14	27.5
15	71.0
16	148.5
17	311.5
18	725.5
19	1363.0
20	2272.5
21	3645.5
22	5872.5
23	9521.5
24	15371.0
25	23555.0
26	33524.0
27	47747.5
28	73111.5
29	108027.5
30	146758.5
31	185728.5
32	223077.5
33	262104.5
34	299143.5
35	347165.5
36	411497.5
37	473511.0
38	533199.5
39	623562.0
40	754156.5
41	897474.5
42	1049241.0
43	1208379.0
44	1356599.0
45	1473989.0
46	1546011.0
47	1552894.5
48	1510363.0
49	1460852.0
50	1367412.5
51	1209162.5
52	1013913.5
53	840082.0
54	687099.5
55	550350.0
56	453131.5
57	367551.5
58	296880.5
59	231808.0
60	166089.0
61	108694.5
62	63567.5
63	36885.0
64	23894.5
65	14832.0
66	9444.0
67	4550.5
68	1904.0
69	1126.0
70	945.5
71	686.5
72	375.0
73	177.0
74	102.0
75	64.0
76	41.5
77	26.0
78	12.5
79	2.5
80	1.0
81	1.0
82	0.0
83	0.0
84	0.5
85	0.5
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.5
91	0.5
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.328250616318663E-4
3	2.9055482231970748E-5
4	3.3206265407966573E-5
5	2.9055482231970748E-5
6	8.301566351991644E-5
7	1.743328933918245E-4
8	1.6188054386383704E-4
9	9.961879622389971E-5
10-14	1.610503872286379E-4
15-19	2.8059294269731753E-4
20-24	2.0670900216459193E-4
25-29	3.270817142684707E-4
30-34	8.542311776199401E-4
35-39	9.032104190966907E-4
40-44	0.0010584497098789344
45-49	8.608724307015333E-4
50-54	5.479033792314485E-4
55-59	4.2919098039796797E-4
60-64	2.689707498045292E-4
65-69	3.146293647404833E-4
70-74	3.4036422890832606E-4
75-79	2.8308352070460004E-4
80-84	2.9636628043083985E-4
85-89	3.6610004562885015E-4
90-94	3.777229215252488E-4
95-99	3.0383954562340055E-4
100-104	4.7651524105357787E-4
105-109	2.7312596342796857E-4
110-114	2.3909060692204167E-4
115-119	2.3826255952931938E-4
120-124	2.2083128400241393E-4
125-129	1.4030497403133424E-4
130-134	1.535928922589365E-4
135-139	1.7020927803634088E-4
140-144	1.5781399247132566E-4
145-149	1.3620436800471073E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
72-73	3.0
74-75	4.0
76-77	4.0
78-79	4.0
80-81	12.0
82-83	16.0
84-85	13.0
86-87	16.0
88-89	13.0
90-91	18.0
92-93	25.0
94-95	29.0
96-97	35.0
98-99	37.0
100-101	40.0
102-103	44.0
104-105	52.0
106-107	50.0
108-109	65.0
110-111	78.0
112-113	68.0
114-115	98.0
116-117	95.0
118-119	98.0
120-121	131.0
122-123	136.0
124-125	160.0
126-127	217.0
128-129	260.0
130-131	327.0
132-133	457.0
134-135	628.0
136-137	1046.0
138-139	2392.0
140-141	5408.0
142-143	8888.0
144-145	68801.0
146-147	738352.0
148-149	1436153.0
150-151	2.1827566E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	45.38032226045317
#Duplication Level	Percentage of total
1	35.93447094364022
2	9.024917158971505
3	4.989505174675702
4	3.4166430611222363
5	2.5994299684840674
6	2.0781584875572556
7	1.6865678722406112
8	1.435573880675996
9	1.2616032806892081
>10	15.994156915142025
>50	5.318216418152732
>100	9.842531811159189
>500	2.8863548308744704
>1k	3.047165921935758
>5k	0.41906489619805193
>10k+	0.06563937848096428
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.2452349527987464E-5	0.0	0.0	3.6111813631163647E-4	1.2452349527987464E-5
2	1.2452349527987464E-5	5.81109644639415E-5	0.0	8.301566351991643E-6	0.0027146121971012675	4.150783175995822E-5
3	2.075391587997911E-5	6.226174763993732E-5	0.0	8.301566351991643E-6	0.005134518788706831	7.886488034392061E-5
4	6.641253081593315E-5	7.471409716792479E-5	0.0	8.301566351991643E-6	0.007637441043832312	1.0376957939989554E-4
5	8.301566351991644E-5	7.471409716792479E-5	0.0	8.301566351991643E-6	0.00926869883199867	1.1207114575188718E-4
6	9.54680130479039E-5	7.886488034392061E-5	0.0	8.301566351991643E-6	0.01164294680866828	1.1207114575188718E-4
7	1.535789775118454E-4	9.961879622389971E-5	0.0	8.301566351991643E-6	0.013900972856410006	1.1207114575188718E-4
8	3.4036422043165737E-4	9.961879622389971E-5	0.0	1.2452349527987464E-5	0.018919269716188954	1.16221928927883E-4
9	4.275306671275696E-4	9.961879622389971E-5	0.0	1.2452349527987464E-5	0.02282930746797702	1.2037271210387883E-4
10-11	4.87717023179509E-4	1.0584497098789345E-4	0.0	1.6603132703983287E-5	0.04312041102383259	1.7433289339182452E-4
12-13	5.645065119354318E-4	1.0999575416388926E-4	0.0	2.075391587997911E-5	0.05909470007665252	2.1584072515178272E-4
14-15	6.350698259273607E-4	1.1829732051588091E-4	0.0	2.490469905597493E-5	0.07240211093889512	2.2414229150377436E-4
16-17	7.014823567432939E-4	1.328250616318663E-4	0.0	2.905548223197075E-5	0.08035086072092712	2.262176830917723E-4
18-19	8.260058520231685E-4	1.4527741115985375E-4	0.0	2.905548223197075E-5	0.08580498981418562	2.345192494437639E-4
20-21	0.001189199379922803	1.8263445974381614E-4	0.0	2.905548223197075E-5	0.0900035069967054	2.3659464103176184E-4
22-23	0.0015067342928864833	1.9301141768380571E-4	0.0	3.3206265407966573E-5	0.09419164722128517	2.3659464103176184E-4
24-25	0.0016644640535743245	2.0338837562379524E-4	0.0	4.150783175995822E-5	0.09832582726457703	2.3867003261975975E-4
26-27	0.0017537058918582348	2.0753915879979107E-4	2.075391587997911E-6	4.565861493595404E-5	0.10179588199970953	2.531977737357451E-4
28-29	0.001965395833834022	2.116899419757869E-4	4.150783175995822E-6	4.565861493595404E-5	0.10582629246360148	2.635747316757347E-4
30-31	0.0022974584879136874	2.116899419757869E-4	4.150783175995822E-6	6.226174763993732E-5	0.11012027765916915	2.718762980277263E-4
32-33	0.002515374604653468	2.1584072515178272E-4	4.150783175995822E-6	7.056331399192897E-5	0.11445992146967278	3.279118709036699E-4
34-35	0.0026876321064572945	2.1584072515178272E-4	4.150783175995822E-6	9.131722987190808E-5	0.11854636750644065	3.4866578678364904E-4
36-37	0.002727064546629255	2.1584072515178272E-4	4.150783175995822E-6	9.131722987190808E-5	0.12203510076586516	3.5281656995964485E-4
38-39	0.002749893854097232	2.2414229150377436E-4	4.150783175995822E-6	1.0792036257589136E-4	0.1258538212877813	3.6111813631163647E-4
40-41	0.0027810247279172005	2.262176830917723E-4	4.150783175995822E-6	1.0792036257589136E-4	0.12939443933690575	3.6111813631163647E-4
42-43	0.0027997032522091817	2.32443857855766E-4	4.150783175995822E-6	1.0792036257589136E-4	0.13315297350276997	3.631935278996344E-4
44-45	0.002814230993325167	2.448962073837535E-4	4.150783175995822E-6	1.0792036257589136E-4	0.13712527300219796	3.7357048583962395E-4
46-47	0.0028515880419091293	2.5527316532374307E-4	4.150783175995822E-6	1.1207114575188718E-4	0.14351955448481954	3.7772126901561976E-4
48-49	0.0028827189157290983	2.594239484997389E-4	4.150783175995822E-6	1.1207114575188718E-4	0.14740053675437562	3.8602283536761143E-4
50-51	0.0029034728316090774	2.614993400877368E-4	4.150783175995822E-6	1.16221928927883E-4	0.15191036267509508	3.9847518489559885E-4
52-53	0.002938754488605042	2.614993400877368E-4	4.150783175995822E-6	1.16221928927883E-4	0.15581832503529514	4.047013596595926E-4
54-55	0.0029615837960730185	2.614993400877368E-4	4.150783175995822E-6	1.2037271210387883E-4	0.15832124729042063	4.1092753442358634E-4
56-57	0.003001016236244979	2.656501232637326E-4	4.150783175995822E-6	1.2244810369187674E-4	0.16104416105387387	4.19229100775578E-4
58-59	0.0030362978932409433	2.822532559677159E-4	4.150783175995822E-6	1.2452349527987465E-4	0.163924804578015	4.275306671275696E-4
60-61	0.0031504444305808284	3.03007171847695E-4	4.150783175995822E-6	1.2452349527987465E-4	0.16665186912464425	4.379076250675592E-4
62-63	0.003229309310924749	3.1545952137568246E-4	4.150783175995822E-6	1.2452349527987465E-4	0.17008456681119277	4.441337998315529E-4
64-65	0.003239686268864739	3.1753491296368036E-4	4.150783175995822E-6	1.328250616318663E-4	0.17411497727508474	4.482845830075487E-4
66-67	0.0032521386183927263	3.25836479315672E-4	4.150783175995822E-6	1.369758448078621E-4	0.17745220694858538	4.5243536618354453E-4
68-69	0.0032666663595087115	3.3413804566766365E-4	4.150783175995822E-6	1.4735280274785165E-4	0.18014398983821867	4.6696310729953E-4
70-71	0.003301948016504676	3.4243961201965527E-4	4.150783175995822E-6	1.5772976068784123E-4	0.182790114112916	4.752646736515216E-4
72-73	0.003324777323972653	3.4866578678364904E-4	4.150783175995822E-6	1.5772976068784123E-4	0.18471815289816607	4.773400652395195E-4
74-75	0.0033351542819126424	3.5489196154764275E-4	4.150783175995822E-6	1.5980515227583913E-4	0.18680807222727996	4.794154568275174E-4
76-77	0.003360058980968618	3.6111813631163647E-4	4.150783175995822E-6	1.6188054386383704E-4	0.188761015711586	4.814908484155153E-4
78-79	0.0033828882884365946	3.6111813631163647E-4	4.150783175995822E-6	1.7848367656782033E-4	0.19058736030902412	4.814908484155153E-4
80-81	0.0033994914211405783	3.6526891948763233E-4	4.150783175995822E-6	1.8470985133181407E-4	0.19240125255693433	4.8564163159151117E-4
82-83	0.003414019162256563	3.7564587742762185E-4	4.150783175995822E-6	1.8678524291981197E-4	0.1944226839636443	4.89792414767507E-4
84-85	0.0034451500360765316	3.818720521916156E-4	4.150783175995822E-6	1.8678524291981197E-4	0.19666825766185803	4.918678063555049E-4
86-87	0.003472130126720505	3.818720521916156E-4	4.150783175995822E-6	1.8678524291981197E-4	0.19852988391629217	4.939431979435028E-4
88-89	0.0034825070846604945	3.8602283536761143E-4	4.150783175995822E-6	1.9301141768380571E-4	0.20033547459785034	4.939431979435028E-4
90-91	0.003488733259424488	3.8602283536761143E-4	4.150783175995822E-6	1.9508680927180362E-4	0.20251256037366014	4.939431979435028E-4
92-93	0.0035053363921284716	3.9017361854360724E-4	4.150783175995822E-6	1.9923759244779943E-4	0.20451946403925414	4.939431979435028E-4
94-95	0.003544768832300432	3.9432440171960305E-4	4.150783175995822E-6	1.9923759244779943E-4	0.20638316568527626	4.939431979435028E-4
96-97	0.0035945782304123816	4.0262596807159466E-4	4.150783175995822E-6	1.9923759244779943E-4	0.2081057407033145	4.939431979435028E-4
98-99	0.0036651415444043105	4.1300292601158424E-4	4.150783175995822E-6	2.0338837562379526E-4	0.20956681638126506	4.939431979435028E-4
100-101	0.0038228713050921515	4.19229100775578E-4	4.150783175995822E-6	2.0338837562379526E-4	0.2110839276320915	4.939431979435028E-4
102-103	0.0038706053116161036	4.213044923635759E-4	4.150783175995822E-6	2.0546376721179317E-4	0.212576134183862	4.939431979435028E-4
104-105	0.0038789068779680955	4.254552755395717E-4	4.150783175995822E-6	2.09614550387789E-4	0.21397494811417261	4.939431979435028E-4
106-107	0.003910037751788064	4.275306671275696E-4	4.150783175995822E-6	2.1999150832777855E-4	0.21521395689220735	4.960185895315006E-4
108-109	0.003932867059256041	4.275306671275696E-4	4.150783175995822E-6	2.3867003261975975E-4	0.21641975940483416	4.980939811194986E-4
110-111	0.003961922541488012	4.399830166555571E-4	4.150783175995822E-6	2.4282081579575558E-4	0.21762763730904894	4.980939811194986E-4
112-113	0.004047013596595926	4.399830166555571E-4	4.150783175995822E-6	2.490469905597493E-4	0.21871099171798383	4.980939811194986E-4
114-115	0.004069842904063903	4.441337998315529E-4	4.150783175995822E-6	2.490469905597493E-4	0.2200433931174785	4.980939811194986E-4
116-117	0.004094747603119878	4.462091914195508E-4	8.301566351991643E-6	2.5734855691174097E-4	0.2212408940637533	5.022447642954944E-4
118-119	0.004138330826467834	4.565861493595404E-4	8.301566351991643E-6	2.5734855691174097E-4	0.22217689566994037	5.022447642954944E-4
120-121	0.004210969532047761	4.607369325355362E-4	8.301566351991643E-6	2.635747316757347E-4	0.22314402814994738	5.022447642954944E-4
122-123	0.004457941131019513	4.607369325355362E-4	8.301566351991643E-6	2.698009064397284E-4	0.22396173243561857	5.022447642954944E-4
124-125	0.004588690801063381	4.64887715711532E-4	8.301566351991643E-6	2.739516896157242E-4	0.22483339690257767	5.022447642954944E-4
126-127	0.004621897066471347	4.64887715711532E-4	8.301566351991643E-6	2.739516896157242E-4	0.22573619224335678	5.022447642954944E-4
128-129	0.004655103331879314	4.64887715711532E-4	8.301566351991643E-6	2.7810247279172007E-4	0.226487483998212	5.022447642954944E-4
130-131	0.004750571344927217	4.690384988875278E-4	8.301566351991643E-6	2.7810247279172007E-4	0.2271785893970153	5.022447642954944E-4
132-133	0.004839813183211129	4.752646736515216E-4	8.301566351991643E-6	2.843286475557138E-4	0.22783026235564666	5.022447642954944E-4
134-135	0.004922828846731045	4.773400652395195E-4	8.301566351991643E-6	2.905548223197075E-4	0.22855664941144593	5.022447642954944E-4
136-137	0.004993392160722974	4.939431979435028E-4	8.301566351991643E-6	2.905548223197075E-4	0.229476047884929	5.022447642954944E-4
138-139	0.005005844510250961	5.209232885874757E-4	8.301566351991643E-6	2.905548223197075E-4	0.23031035530330418	5.043201558834923E-4
>>END_MODULE
