##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.2d.R.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24134166
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	68-150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.39484103158982	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.69798803074446	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.87882262018087	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.8230603866734	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.69469063070172	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.67551138912362	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.684340449137544	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.81424678192733	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.804093416776865	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.776807410705636	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.772652438041575	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.77869033468984	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.76506694285602	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.749225177286014	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.748711001656325	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.67851334079661	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.585196240052376	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
50-54	34.54156112127512	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
55-59	34.52952343163629	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.49883436618443	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.480015165867044	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.44889886661862	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.42592445980428	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.399813072786344	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.37701588097099	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.349179246462455	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.313732729429276	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.27290854008267	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.217129251350066	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
110-114	34.17896191715702	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
115-119	34.12397164036905	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
120-124	34.0873501923215	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
125-129	34.03185635909488	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	33.97300242760913	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	33.92189907894757	35.0	34.0	37.0	28.6	39.0
140-144	33.88919240247467	35.0	34.0	37.0	28.0	39.0
145-149	33.89807199292001	35.0	34.0	37.0	28.2	39.0
150	34.863213700861	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	19.0
22	360.0
23	3928.0
24	26391.0
25	101740.0
26	245600.0
27	426010.0
28	607481.0
29	780445.0
30	969910.0
31	1203824.0
32	1525931.0
33	1986065.0
34	2716437.0
35	4206507.0
36	8350190.0
37	983320.0
38	8.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.917976200213424	11.555829192523163	15.049614724619031	37.47657988264438
2	22.352077522751184	13.76235760413635	36.521742156998585	27.363822716113877
3	21.396033363676228	18.003869288793297	27.86091791668992	32.73917943084055
4	26.06475237833053	25.694555053012834	22.18636110581203	26.05433146284461
5	25.523073005870728	31.071040191794573	24.391821466299525	19.014065336035173
6	19.149527986296267	36.712921867440045	25.974006709413562	18.16354343685013
7	16.248216114335087	24.628685353852227	39.929972154768144	19.193126377044546
8	18.601053345832362	24.81923949736937	31.3430258806776	25.23668127612067
9	19.79052085748221	23.774631336639438	32.241834131683554	24.193013674194795
10-14	20.424964469198652	29.365267460680766	26.956055338492284	23.253712731628294
15-19	20.518738805323082	28.168090408542067	27.81153886878177	23.50163191735308
20-24	20.703763136053862	28.314668080409973	27.507616868283062	23.4739519152531
25-29	20.66349638535009	28.501608790465543	27.410133791723307	23.42476103246106
30-34	20.661633956008664	28.218843647788045	27.433596424360857	23.68592597184244
35-39	20.733512705251187	28.190177889195745	27.500828126651715	23.575481278901357
40-44	20.77351253576697	28.253340042670715	27.416336640961745	23.556810780600564
45-49	20.85953607903551	28.02983710744858	27.39066289816178	23.71996391535413
50-54	20.967699952216037	28.009313783064886	27.47192838251282	23.551057882206255
55-59	20.982104411215712	28.03381090747617	27.395845052583233	23.58823962872488
60-64	20.924138988916802	27.942934015720578	27.403780634510582	23.729146360852035
65-69	21.035610972456155	27.856420156822487	27.479010436755818	23.62895843396554
70-74	21.144151734849245	27.796041448163304	27.46828402515246	23.591522791834986
75-79	21.1827077414164	27.679378504281043	27.450293397048025	23.687620357254527
80-84	21.218674831857136	27.68470323377495	27.44585573341815	23.650766200949757
85-89	21.195509154414406	27.68118236586291	27.494855905479348	23.628452574243333
90-94	21.175401846156397	27.580386530578842	27.458853874784143	23.785357748480614
95-99	21.285395545669587	27.493860390274033	27.555200756712672	23.66554330734371
100-104	21.34735336003449	27.535831781822907	27.430904589347698	23.685910268794903
105-109	21.312658360705626	27.394674915970857	27.50709995872558	23.78556676459794
110-114	21.391722328791882	27.37072587267624	27.564895730010097	23.672656068521782
115-119	21.419715561071914	27.39006695204892	27.53465311891869	23.655564367960483
120-124	21.389719664979964	27.283569631614984	27.535117842614582	23.791592860790473
125-129	21.43705355551552	27.216493370669475	27.597803766028374	23.748649307786636
130-134	21.49637750718377	27.312937603162535	27.48744346480177	23.703241424851925
135-139	21.48743365571659	27.169641319081162	27.576826808455323	23.766098216746922
140-144	21.53589481651222	27.091791190673263	27.705000981491246	23.66731301132327
145-149	21.146731287207892	27.229774027697996	27.80482901706548	23.81866566802863
150	21.100807651466884	25.859810174254328	28.520153637244967	24.51922853703382
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.5
9	1.0
10	1.5
11	5.0
12	9.5
13	19.5
14	43.0
15	85.0
16	166.5
17	333.5
18	649.0
19	1228.5
20	2278.5
21	3888.5
22	6181.0
23	9878.5
24	15706.0
25	24763.5
26	36827.0
27	51403.5
28	70288.0
29	98211.0
30	131672.0
31	166519.0
32	201536.5
33	239972.5
34	280478.0
35	327588.5
36	398364.0
37	494210.0
38	610586.5
39	755423.0
40	921956.5
41	1088061.5
42	1258658.0
43	1431302.5
44	1571771.0
45	1655651.5
46	1677091.5
47	1637084.0
48	1547068.0
49	1415757.5
50	1248761.0
51	1069502.0
52	888518.5
53	709791.5
54	549012.5
55	413404.5
56	307003.5
57	227890.5
58	169778.0
59	125335.5
60	88864.5
61	62834.0
62	44603.0
63	29300.0
64	19180.0
65	13976.0
66	11975.0
67	8921.0
68	4843.5
69	2740.5
70	2333.5
71	1617.0
72	700.0
73	285.5
74	127.0
75	75.0
76	48.0
77	36.5
78	17.5
79	1.5
80	0.5
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.5
89	0.5
90	0.0
91	0.5
92	0.5
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.574531309679398E-4
3	6.215255169787098E-5
4	4.143503446524732E-5
5	4.557853791177205E-5
6	6.215255169787098E-5
7	2.1546217921928604E-4
8	9.11570758235441E-5
9	8.701357237701936E-5
10-14	1.466800220069755E-4
15-19	1.6325403579307444E-4
20-24	1.4336521924975573E-4
25-29	2.9916094883908567E-4
30-34	7.748351445001248E-4
35-39	7.309140079669627E-4
40-44	9.85325119583581E-4
45-49	0.0010143296437092543
50-54	5.278823390872508E-4
55-59	3.497116908866874E-4
60-64	2.8590173781020646E-4
65-69	3.157349652416824E-4
70-74	3.8700329246158687E-4
75-79	2.668417789598887E-4
80-84	2.8258737297024263E-4
85-89	4.193239352894994E-4
90-94	4.0606574378420046E-4
95-99	3.165666356152365E-4
100-104	4.856258880696968E-4
105-109	2.4364321388304887E-4
110-114	2.519323083743609E-4
115-119	2.486200303777213E-4
120-124	2.453087945863133E-4
125-129	1.3840377812147223E-4
130-134	1.2266192285493305E-4
135-139	1.2184293355080943E-4
140-144	1.6004351724204784E-4
145-149	1.1163624122399598E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
68-69	3.0
70-71	1.0
72-73	3.0
74-75	3.0
76-77	7.0
78-79	6.0
80-81	15.0
82-83	15.0
84-85	18.0
86-87	17.0
88-89	21.0
90-91	34.0
92-93	33.0
94-95	26.0
96-97	39.0
98-99	60.0
100-101	67.0
102-103	55.0
104-105	71.0
106-107	46.0
108-109	72.0
110-111	84.0
112-113	92.0
114-115	109.0
116-117	111.0
118-119	140.0
120-121	167.0
122-123	181.0
124-125	230.0
126-127	299.0
128-129	339.0
130-131	409.0
132-133	528.0
134-135	723.0
136-137	1191.0
138-139	3057.0
140-141	6432.0
142-143	10840.0
144-145	78402.0
146-147	783689.0
148-149	1493212.0
150-151	2.1753319E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	52.42108447248243
#Duplication Level	Percentage of total
1	40.90936189335874
2	10.761351657449987
3	6.516882190372359
4	4.382706131344646
5	3.3479331134485535
6	2.7096583492001147
7	2.16757893464865
8	1.7822727744114593
9	1.5478876731433557
>10	17.250612997847963
>50	4.134566639446311
>100	3.926819755730987
>500	0.3466309515129583
>1k	0.21573693808399144
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	8.287006893049464E-6	2.071751723262366E-5	0.0	0.0	2.5689721368453336E-4	2.071751723262366E-5
2	8.287006893049464E-6	1.2844860684226668E-4	0.0	1.6574013786098928E-5	0.0021256172680671876	3.7291531018722584E-5
3	2.071751723262366E-5	1.4502262062836562E-4	0.0	1.6574013786098928E-5	0.0032070716676101422	9.11570758235441E-5
4	4.143503446524732E-5	1.69883641307514E-4	0.0	1.6574013786098928E-5	0.004661441377340324	1.1601809650269249E-4
5	4.557853791177205E-5	1.69883641307514E-4	0.0	2.071751723262366E-5	0.00578847431479505	1.2844860684226668E-4
6	6.215255169787098E-5	1.7402714475403874E-4	0.0	2.071751723262366E-5	0.006853354700551906	1.4087911718184087E-4
7	7.458306203744517E-5	1.947446619866624E-4	0.0	2.071751723262366E-5	0.008112979748295425	1.4087911718184087E-4
8	1.1601809650269249E-4	2.071751723262366E-4	0.0	2.071751723262366E-5	0.010507924740386719	1.4916612407489034E-4
9	1.4087911718184087E-4	2.071751723262366E-4	0.0	2.071751723262366E-5	0.014042333180272317	1.6574013786098928E-4
10-11	2.051034206029742E-4	2.1960568266581078E-4	0.0	2.486102067914839E-5	0.018411657564632644	2.0303166887971187E-4
12-13	2.465384550682215E-4	2.237491861123355E-4	0.0	2.9004524125673122E-5	0.02240599488708249	2.3825144817517208E-4
14-15	2.6932772402410757E-4	2.3410794472864736E-4	2.071751723262366E-6	3.3148027572197856E-5	0.027069508016146073	2.610407171310581E-4
16-17	3.045475033195678E-4	2.465384550682215E-4	4.143503446524732E-6	3.3148027572197856E-5	0.0316812273521281	2.6311246885432046E-4
18-19	3.2940852399871616E-4	2.5896896540779574E-4	4.143503446524732E-6	3.3148027572197856E-5	0.0359200313779229	2.6518422057758285E-4
20-21	3.9363282741984953E-4	3.0040399987304306E-4	4.143503446524732E-6	3.3148027572197856E-5	0.03978799184525374	2.6932772402410757E-4
22-23	4.723593929038194E-4	3.1904976538240433E-4	4.143503446524732E-6	3.3148027572197856E-5	0.04400400660209265	2.838299860869441E-4
24-25	5.510859583877893E-4	3.2526502055219144E-4	4.143503446524732E-6	3.3148027572197856E-5	0.04844998580021369	2.983322481497807E-4
26-27	6.360277790415463E-4	3.2733677227545383E-4	4.143503446524732E-6	3.5219779295460224E-5	0.05308035090170508	3.1697801365914195E-4
28-29	6.712475583370065E-4	3.3148027572197855E-4	4.143503446524732E-6	3.7291531018722584E-5	0.057808088334189794	3.3769553089176566E-4
30-31	7.230413514185657E-4	3.3355202744524094E-4	4.143503446524732E-6	4.350678618850968E-5	0.06237008562881352	3.6877180674070115E-4
32-33	7.686198893303378E-4	3.39767282615028E-4	4.143503446524732E-6	5.179379308155915E-5	0.0665550241098035	4.3299611016183446E-4
34-35	8.204136824118968E-4	3.480542895080775E-4	4.143503446524732E-6	5.8009048251346244E-5	0.07027589020478271	4.3921136533162157E-4
36-37	8.390594479212581E-4	3.501260412313398E-4	4.143503446524732E-6	6.215255169787098E-5	0.07411277439626461	4.495701239479334E-4
38-39	8.618487168771441E-4	3.5841304812438927E-4	4.143503446524732E-6	7.043955859092043E-5	0.07876800051843515	4.537136273944581E-4
40-41	9.157142616819658E-4	3.6877180674070115E-4	4.143503446524732E-6	7.251131031418281E-5	0.0824204988065467	4.557853791177205E-4
42-43	9.322882754680647E-4	3.6877180674070115E-4	4.143503446524732E-6	7.458306203744517E-5	0.08600255753606734	4.557853791177205E-4
44-45	9.571492961472131E-4	3.8534582052680003E-4	4.143503446524732E-6	7.458306203744517E-5	0.09049204352037687	4.557853791177205E-4
46-47	0.0010193018478450839	3.8534582052680003E-4	4.143503446524732E-6	7.458306203744517E-5	0.09475363681512758	4.6407238601076995E-4
48-49	0.001048306371970757	3.957045791431119E-4	6.2152551697870985E-6	7.458306203744517E-5	0.09879562442721243	4.806463997968689E-4
50-51	0.0010669521374801184	4.060633377594237E-4	8.287006893049464E-6	7.458306203744517E-5	0.10313180078400057	4.889334066899183E-4
52-53	0.001110458923668628	4.060633377594237E-4	8.287006893049464E-6	7.458306203744517E-5	0.10734781554083948	4.972204135829678E-4
54-55	0.0011539657098571378	4.081350894826861E-4	8.287006893049464E-6	7.458306203744517E-5	0.11071441209114083	5.013639170294925E-4
56-57	0.0012244052684480583	4.2263735154552263E-4	8.287006893049464E-6	7.87265654839699E-5	0.11477297371701181	5.179379308155915E-4
58-59	0.0012616967994667808	4.3713961360835924E-4	8.287006893049464E-6	8.287006893049464E-5	0.11897655796351114	5.179379308155915E-4
60-61	0.0012989883304855034	4.454266205014087E-4	8.287006893049464E-6	8.4941820653757E-5	0.12252961216890611	5.241531859853785E-4
62-63	0.0013321363580577014	4.557853791177205E-4	8.287006893049464E-6	8.701357237701937E-5	0.12618418220874092	5.262249377086409E-4
64-65	0.0013632126339066367	4.5992888256424523E-4	8.287006893049464E-6	8.908532410028173E-5	0.1314215705651482	5.262249377086409E-4
66-67	0.0013756431442462109	4.723593929038194E-4	8.287006893049464E-6	9.11570758235441E-5	0.1359462763287532	5.32440192878428E-4
68-69	0.001415006426988196	4.910051584131807E-4	8.287006893049464E-6	9.11570758235441E-5	0.13910569770672832	5.427989514947398E-4
70-71	0.0014958047441954283	5.013639170294925E-4	8.287006893049464E-6	9.530057927006883E-5	0.1420123653744654	5.469424549412646E-4
72-73	0.0015475985372769873	5.055074204760173E-4	8.287006893049464E-6	9.530057927006883E-5	0.14498325734562362	5.573012135575764E-4
74-75	0.001578674813125923	5.241531859853786E-4	8.287006893049464E-6	9.737233099333119E-5	0.14843686746830198	5.614447170041012E-4
76-77	0.0016346121096540067	5.448707032180022E-4	8.287006893049464E-6	9.944408271659356E-5	0.1510452028878893	5.635164687273635E-4
78-79	0.001709195171691452	5.510859583877894E-4	8.287006893049464E-6	1.0773108960964302E-4	0.15350230043167848	5.635164687273635E-4
80-81	0.0017527019578799617	5.531577101110516E-4	8.287006893049464E-6	1.1187459305616775E-4	0.15629502175463617	5.635164687273635E-4
82-83	0.0017920652406219467	5.635164687273635E-4	8.287006893049464E-6	1.1394634477943013E-4	0.15908152782242402	5.635164687273635E-4
84-85	0.0018562895440430798	5.655882204506259E-4	8.287006893049464E-6	1.1601809650269249E-4	0.16168364798684154	5.635164687273635E-4
86-87	0.0019225855991874756	5.676599721738882E-4	8.287006893049464E-6	1.1601809650269249E-4	0.16395635962726038	5.635164687273635E-4
88-89	0.0019640206336527227	5.676599721738882E-4	8.287006893049464E-6	1.2016159994921722E-4	0.1661234119297928	5.697317238971506E-4
90-91	0.002009599171564495	5.738752273436753E-4	1.2430510339574195E-5	1.2016159994921722E-4	0.16910880616301388	5.780187307902001E-4
92-93	0.00204896245430648	5.780187307902001E-4	1.6574013786098928E-5	1.2016159994921722E-4	0.17203826309970688	5.800904825134625E-4
94-95	0.0021421912818532863	5.821622342367249E-4	1.6574013786098928E-5	1.2016159994921722E-4	0.17522461725008437	5.863057376832495E-4
96-97	0.002225061350783781	5.904492411297742E-4	1.6574013786098928E-5	1.2016159994921722E-4	0.17765478202147114	5.904492411297743E-4
98-99	0.002316218426607325	5.966644962995613E-4	1.6574013786098928E-5	1.2016159994921722E-4	0.17975139476541263	5.925209928530367E-4
100-101	0.002378370978305196	5.966644962995613E-4	1.6574013786098928E-5	1.2016159994921722E-4	0.18211526348165502	5.94592744576299E-4
102-103	0.002411519005877394	6.090950066391356E-4	1.8645765509361292E-5	1.2016159994921722E-4	0.18400470105327027	6.008079997460861E-4
104-105	0.0024570975437891657	6.277407721484968E-4	2.071751723262366E-5	1.2016159994921722E-4	0.1858692776042064	6.090950066391356E-4
106-107	0.002546182867889448	6.443147859345958E-4	2.071751723262366E-5	1.2016159994921722E-4	0.18759090328623745	6.11166758362398E-4
108-109	0.0026414834471595165	6.526017928276453E-4	2.071751723262366E-5	1.222333516724796E-4	0.18929181145103585	6.132385100856603E-4
110-111	0.0027077795023039124	6.588170479974323E-4	2.071751723262366E-5	1.2430510339574196E-4	0.1907979749538476	6.132385100856603E-4
112-113	0.002751286288492422	6.629605514439571E-4	2.071751723262366E-5	1.2430510339574196E-4	0.19244708932556442	6.153102618089226E-4
114-115	0.002796864826404194	6.712475583370065E-4	2.071751723262366E-5	1.2637685511900432E-4	0.1944090382074939	6.17382013532185E-4
116-117	0.002865232633271852	6.816063169533184E-4	2.071751723262366E-5	1.3259211028879143E-4	0.19595663674477087	6.17382013532185E-4
118-119	0.002964676715988446	7.02323834185942E-4	2.071751723262366E-5	1.3673561373531615E-4	0.19750630703377114	6.194537652554474E-4
120-121	0.003115914591786598	7.126825928022539E-4	2.071751723262366E-5	1.4087911718184087E-4	0.1990435468124318	6.215255169787098E-4
122-123	0.003277511226201063	7.230413514185657E-4	2.071751723262366E-5	1.4295086890510323E-4	0.20054971031524355	6.215255169787098E-4
124-125	0.0033707400537478695	7.271848548650905E-4	2.071751723262366E-5	1.4502262062836562E-4	0.20224440322487217	6.215255169787098E-4
126-127	0.00339767282615028	7.292566065883527E-4	2.071751723262366E-5	1.4502262062836562E-4	0.20380650402421197	6.215255169787098E-4
128-129	0.003455681874401626	7.292566065883527E-4	2.071751723262366E-5	1.4709437235162798E-4	0.20515107089260926	6.256690204252345E-4
130-131	0.0035426954467786455	7.375436134814023E-4	2.071751723262366E-5	1.4916612407489034E-4	0.20640033718173645	6.256690204252345E-4
132-133	0.00362556551570914	7.375436134814023E-4	2.071751723262366E-5	1.574531309679398E-4	0.20763510120880083	6.256690204252345E-4
134-135	0.003749870619104882	7.375436134814023E-4	2.071751723262366E-5	1.636683861377269E-4	0.20872898611868335	6.277407721484968E-4
136-137	0.003915610756965872	7.458306203744517E-4	2.071751723262366E-5	1.6781188958425164E-4	0.20986430606303114	6.298125238717592E-4
138-139	0.003936328274198495	7.665481376070754E-4	2.071751723262366E-5	1.69883641307514E-4	0.21100169775910216	6.298125238717592E-4
>>END_MODULE
