##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.2d.R.3.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	22936848
Total Bases	3.4 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	68-150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.34972141769436	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.67538316511493	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.8316289143129	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.79505383651668	35.0	34.0	38.0	30.0	39.0
5	34.67300014369891	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.66133729447045	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.66911791890499	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.80983551009275	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.79094119645384	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.76319848306969	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.76837547164284	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.770542168653684	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.76341434533638	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.749414958847005	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.74612108865176	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.67689885724491	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.589955690511616	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
50-54	34.54772647052464	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
55-59	34.539563657569694	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.511717320531574	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.492562417381755	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.46446346461869	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.44378798826439	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.421946658154695	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.398523700279455	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.371536643328135	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.34081966916689	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.301868371269926	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.250667710371616	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.2161316851054	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.16868945763241	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
120-124	34.13042769097415	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
125-129	34.08340375466558	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.02587238773566	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	33.98044829440309	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	33.94762665086198	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	33.95799173839815	35.0	34.0	37.0	28.4	39.0
150	34.8956715299988	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	15.0
22	280.0
23	3141.0
24	21607.0
25	85238.0
26	215351.0
27	387304.0
28	566384.0
29	736596.0
30	917803.0
31	1150013.0
32	1461787.0
33	1909941.0
34	2612902.0
35	4028911.0
36	7889876.0
37	949690.0
38	9.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.20638929987241	11.199677479660675	15.617001952491465	37.976931267975445
2	22.663752574191317	13.032406635358921	36.456984110479155	27.846856679970607
3	21.356390617645566	17.67953341793666	28.243214280046548	32.72086168437122
4	26.293329857120685	25.30415262084925	22.256644768852205	26.145872753177855
5	25.85498940263508	30.77669306932247	24.423253008675914	18.945064519366536
6	19.3536131834823	36.241270205555494	25.880279932403887	18.524836678558316
7	16.170495151610776	24.74809359791493	40.152657784372906	18.928753466101387
8	18.631013067856195	24.319727913400357	31.5417942726573	25.50746474608615
9	19.76970997195077	23.222259794035928	32.49541697505007	24.51261325896323
10-14	20.43708633732629	29.118545753155644	27.02719953391241	23.417168375605655
15-19	20.574690950861388	27.852081652008486	27.84932886723578	23.723898529894345
20-24	20.74048333129963	28.021907958448534	27.568590962647566	23.669017747604272
25-29	20.70966349664376	28.21080365312913	27.45303241078848	23.626500439438626
30-34	20.67228732732311	27.954586930463755	27.48942549970943	23.883700242503703
35-39	20.756955816176863	27.927063760652427	27.531348181672794	23.784632241497913
40-44	20.806294749761026	28.01422008298972	27.43975506369194	23.73973010355731
45-49	20.884087276232396	27.78315423856381	27.422139230974718	23.910619254229072
50-54	20.992328255444942	27.77252046136725	27.508269864269913	23.7268814189179
55-59	20.982105448362887	27.81503347283757	27.430209937182546	23.772651141616997
60-64	20.9341931489275	27.723689477058656	27.420915691871183	23.92120168214266
65-69	21.032922610213863	27.65095766029926	27.507835476961624	23.808284252525265
70-74	21.15464976789405	27.591767251028028	27.484223757015723	23.769359224062203
75-79	21.173262281224208	27.504693880104625	27.46985987266478	23.85218396600639
80-84	21.21277735084546	27.487849112504154	27.457062725265025	23.842310811385364
85-89	21.183287019825432	27.503192173835068	27.53182311919671	23.781697687142795
90-94	21.180815646699557	27.40314581832734	27.478108745597822	23.937929789375275
95-99	21.26880035996192	27.32329778989595	27.580964901733722	23.82693694840841
100-104	21.322341593807174	27.374362246354956	27.444846344004425	23.85844981583345
105-109	21.287835111843908	27.234750307408216	27.52959206039626	23.94782252035161
110-114	21.36609042544147	27.203912408320207	27.588834173285825	23.841162992952498
115-119	21.40203984347339	27.234851234250996	27.559399690430542	23.803709231845076
120-124	21.357068534893106	27.146234702159305	27.560448529560837	23.93624823338675
125-129	21.40619542433719	27.06767224136409	27.620476140127902	23.90565619417082
130-134	21.465023052284693	27.17758325550408	27.522188532545712	23.83520515966552
135-139	21.45158981942982	27.040395892128355	27.62023451563011	23.88777977281171
140-144	21.502690208939082	26.959496579810043	27.741309747821653	23.796503463429218
145-149	21.119179931770823	27.120275295259905	27.82705003712656	23.933494735842707
150	21.02185173971332	25.777845060897025	28.526316980055196	24.673986219334463
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	1.0
10	3.5
11	4.5
12	6.0
13	15.0
14	30.5
15	62.0
16	147.5
17	300.0
18	574.5
19	1109.5
20	2101.0
21	3500.5
22	5513.0
23	8786.5
24	13738.5
25	21886.5
26	32857.0
27	45973.0
28	62660.5
29	87553.0
30	118218.5
31	149574.5
32	179705.5
33	213205.0
34	250811.0
35	294199.0
36	359389.5
37	448734.0
38	558787.5
39	695784.0
40	852769.0
41	1009643.0
42	1171708.0
43	1340789.5
44	1480687.0
45	1568245.5
46	1598173.5
47	1565047.5
48	1486388.5
49	1371257.0
50	1217156.5
51	1046824.5
52	873967.5
53	703033.0
54	546095.0
55	412877.0
56	308479.5
57	231068.0
58	173481.0
59	127725.0
60	89726.5
61	63087.5
62	45077.0
63	29624.5
64	19239.0
65	14033.0
66	12308.0
67	9150.0
68	4781.0
69	2869.0
70	2764.0
71	2057.0
72	888.0
73	290.0
74	127.0
75	83.0
76	57.5
77	41.5
78	17.0
79	1.0
80	0.5
81	0.5
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.5
87	0.5
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.4387329941760088E-4
3	1.7439187808194046E-5
4	3.487837561638809E-5
5	6.103715732867916E-5
6	1.0899492380121278E-4
7	2.3978883236266816E-4
8	1.4387329941760088E-4
9	1.3951350246555236E-4
10-14	1.883432283284957E-4
15-19	3.2611281201322867E-4
20-24	2.214776851640644E-4
25-29	3.670949033624847E-4
30-34	9.094536441973196E-4
35-39	9.704908015259987E-4
40-44	0.0011902245679092436
45-49	0.0010428634309300041
50-54	5.903165073073684E-4
55-59	4.412114515473094E-4
60-64	2.3455707602020994E-4
65-69	3.57503353185262E-4
70-74	3.4355204176030274E-4
75-79	2.6420376901412616E-4
80-84	2.973383984333667E-4
85-89	3.548881805328556E-4
90-94	3.8889537677601045E-4
95-99	2.8164453832905755E-4
100-104	4.438316835045856E-4
105-109	2.642077038780982E-4
110-114	2.3194622977158562E-4
115-119	2.1712437633311863E-4
120-124	2.153830178878997E-4
125-129	1.299295579489491E-4
130-134	1.70918860491631E-4
135-139	1.5959315779655745E-4
140-144	1.5093586079183814E-4
145-149	1.5301828387005446E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
68-69	1.0
70-71	2.0
72-73	1.0
74-75	1.0
76-77	3.0
78-79	3.0
80-81	6.0
82-83	13.0
84-85	13.0
86-87	6.0
88-89	20.0
90-91	19.0
92-93	16.0
94-95	17.0
96-97	25.0
98-99	35.0
100-101	43.0
102-103	46.0
104-105	48.0
106-107	57.0
108-109	64.0
110-111	55.0
112-113	64.0
114-115	78.0
116-117	92.0
118-119	107.0
120-121	133.0
122-123	121.0
124-125	149.0
126-127	196.0
128-129	248.0
130-131	280.0
132-133	405.0
134-135	579.0
136-137	961.0
138-139	2583.0
140-141	5871.0
142-143	9662.0
144-145	73585.0
146-147	739850.0
148-149	1412694.0
150-151	2.0688696E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	51.34175457872805
#Duplication Level	Percentage of total
1	39.62275324703792
2	11.001344105054919
3	6.521654018676015
4	4.485526513217515
5	3.448429941690783
6	2.6477354392412367
7	2.1741879023914072
8	1.799494454655746
9	1.569589022796405
>10	17.929299749458867
>50	4.2133382383345666
>100	4.032505657084527
>500	0.3218401777857417
>1k	0.23230153257426991
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.7439187808194046E-5	0.0	0.0	2.8338680188315325E-4	2.179898476024256E-5
2	0.0	1.0027532989711577E-4	0.0	8.719593904097023E-6	0.0018921518771890542	3.9238172568436604E-5
3	4.359796952048511E-6	1.1771451770530982E-4	0.0	1.3079390856145534E-5	0.0030300588816737158	9.591553294506726E-5
4	1.3079390856145534E-5	1.3951350246555236E-4	0.0	1.3079390856145534E-5	0.004590866190507083	1.133547207532613E-4
5	2.179898476024256E-5	1.3951350246555236E-4	0.0	1.3079390856145534E-5	0.005689535022423308	1.1771451770530982E-4
6	3.9238172568436604E-5	1.3951350246555236E-4	0.0	1.3079390856145534E-5	0.0066312511640657865	1.1771451770530982E-4
7	4.359796952048512E-5	1.525928933216979E-4	0.0	1.7439187808194046E-5	0.007782237559406593	1.220743146573583E-4
8	6.103715732867916E-5	1.525928933216979E-4	0.0	1.7439187808194046E-5	0.009927257659814462	1.2643411160940683E-4
9	8.719593904097023E-5	1.525928933216979E-4	0.0	1.7439187808194046E-5	0.013166586795186504	1.3079390856145535E-4
10-11	1.5913258874977068E-4	1.5913258874977068E-4	0.0	1.7439187808194046E-5	0.017347632072201028	1.9401096436615875E-4
12-13	2.2016974607844982E-4	1.6349238570181917E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.020966263542401293	2.3760893388664387E-4
14-15	2.3978883236266813E-4	1.678521826538677E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.02517564749960413	2.615878171229107E-4
16-17	2.72487309503032E-4	1.8529137046206177E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.029681497649546265	2.659476140749592E-4
18-19	3.2698477140363834E-4	2.0055065979423153E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.03333500749536292	2.681275125509835E-4
20-21	3.5314355311592946E-4	2.4850842626676514E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.03707789317869657	2.81206903407129E-4
22-23	4.0328121806448733E-4	2.6376771559893496E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.0410169697248724	2.9864609121532307E-4
24-25	4.6431837539316644E-4	2.7030741102700774E-4	4.359796952048511E-6	1.7439187808194046E-5	0.045219813986647164	3.095455835954443E-4
26-27	5.340751266259428E-4	2.7030741102700774E-4	4.359796952048511E-6	2.179898476024256E-5	0.04942483814689795	3.160852790235171E-4
28-29	5.645937052902823E-4	2.7030741102700774E-4	4.359796952048511E-6	2.615878171229107E-5	0.053741037129425975	3.2698477140363834E-4
30-31	6.147313702388401E-4	2.746672079790562E-4	4.359796952048511E-6	3.051857866433958E-5	0.05784360606130363	3.509636546399052E-4
32-33	6.452499489031797E-4	2.746672079790562E-4	4.359796952048511E-6	3.705827409241235E-5	0.061965794079465494	3.814822333042448E-4
34-35	6.997474108037861E-4	2.7902700493110473E-4	4.359796952048511E-6	4.577786799650938E-5	0.06566290189480264	3.9020182720834177E-4
36-37	7.23726294040053E-4	2.8338680188315325E-4	4.359796952048511E-6	5.231756342458214E-5	0.06941014737508833	4.0328121806448733E-4
38-39	7.455252788002955E-4	2.8992649731122603E-4	4.359796952048511E-6	5.667736037663065E-5	0.07387675935246203	4.0764101501653585E-4
40-41	7.891232483207806E-4	2.921063957872503E-4	4.359796952048511E-6	6.321705580470342E-5	0.07722072361468324	4.1418071044460863E-4
42-43	8.043825376529503E-4	2.98646091215323E-4	4.359796952048511E-6	7.629644666084896E-5	0.08053852909519216	4.294399997767784E-4
44-45	8.283614208892173E-4	3.1390538054749283E-4	4.359796952048511E-6	7.847634513687321E-5	0.08466943670725813	4.3161989825280265E-4
46-47	8.719593904097023E-4	3.1826517749954135E-4	4.359796952048511E-6	8.719593904097023E-5	0.0886673705122866	4.4469928910894816E-4
48-49	9.264568523103087E-4	3.2916466987966265E-4	4.359796952048511E-6	8.93758375169945E-5	0.09249309233770917	4.7957766472533626E-4
50-51	9.482558370705513E-4	3.57503350067978E-4	4.359796952048511E-6	9.155573599301874E-5	0.09658040198025465	4.839374616773848E-4
52-53	9.983935020191092E-4	3.596832485440022E-4	4.359796952048511E-6	9.155573599301874E-5	0.1006110342624235	4.904771571054576E-4
54-55	0.0010354517761115216	3.6186314702002644E-4	4.359796952048511E-6	9.155573599301874E-5	0.10376098756027854	4.94836954057506E-4
56-57	0.001089949238012128	3.684028424480992E-4	4.359796952048511E-6	9.155573599301874E-5	0.10811642471537501	5.03556547961603E-4
58-59	0.0011313673090565888	3.814822333042448E-4	4.359796952048511E-6	1.0027532989711577E-4	0.1122037343579205	5.057364464376273E-4
60-61	0.0011618858877209283	3.8366213178026904E-4	4.359796952048511E-6	1.0027532989711577E-4	0.11560873577747038	5.057364464376273E-4
62-63	0.0011924044663852679	3.858420302562933E-4	4.359796952048511E-6	1.0027532989711577E-4	0.11895270003969159	5.057364464376273E-4
64-65	0.0012207431465735832	3.9674152263641455E-4	4.359796952048511E-6	1.1117482227723704E-4	0.1236983390219964	5.057364464376273E-4
66-67	0.0012381823343817773	4.0328121806448733E-4	4.359796952048511E-6	1.1771451770530982E-4	0.12787284460358284	5.057364464376273E-4
68-69	0.0012643411160940684	4.1854050739665715E-4	4.359796952048511E-6	1.1771451770530982E-4	0.13080044825688342	5.188158372937729E-4
70-71	0.001294859694758408	4.3161989825280265E-4	4.359796952048511E-6	1.220743146573583E-4	0.1335776389153383	5.231756342458214E-4
72-73	0.0013340978673268445	4.534188830130452E-4	4.359796952048511E-6	1.220743146573583E-4	0.13674503140100158	5.340751266259428E-4
74-75	0.0013776958368473297	4.59958578441118E-4	4.359796952048511E-6	1.2643411160940683E-4	0.14000397962265784	5.384349235779912E-4
76-77	0.0014103943139876936	4.708580708212393E-4	4.359796952048511E-6	1.3515370551350384E-4	0.14244546591580498	5.406148220540155E-4
78-79	0.0014518123850321544	4.839374616773848E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.14484553413790768	5.471545174820882E-4
80-81	0.001475791268268421	4.8611736015340904E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.147478851496945	5.493344159581124E-4
82-83	0.0015041299484567366	5.013766494855788E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.1500925497696981	5.493344159581124E-4
84-85	0.0015564475118813187	5.079163449136516E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.15257327423541367	5.493344159581124E-4
86-87	0.0016262042631140948	5.231756342458214E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.15477933149315024	5.493344159581124E-4
88-89	0.0016850615219667496	5.231756342458214E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.15681317677128087	5.493344159581124E-4
90-91	0.0017308393899632592	5.297153296738941E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.15930044093242454	5.493344159581124E-4
92-93	0.001763537867103623	5.406148220540155E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.16198389595641038	5.580540098622095E-4
94-95	0.0018441941107165205	5.44974619006064E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.1650313940258923	5.580540098622095E-4
96-97	0.0019117709634732724	5.471545174820882E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.16724835077600897	5.62413806814258E-4
98-99	0.0020098663948943636	5.493344159581124E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.16924513778004718	5.62413806814258E-4
100-101	0.0020992422324113582	5.536942129101609E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.17162776681434172	5.62413806814258E-4
102-103	0.0021493798973599163	5.580540098622095E-4	4.359796952048511E-6	1.482330963696494E-4	0.17352209859000678	5.645937052902823E-4
104-105	0.0021929778668804013	5.580540098622095E-4	8.719593904097023E-6	1.5695269027374642E-4	0.17522459929978174	5.733132991943793E-4
106-107	0.0022605547196371534	5.62413806814258E-4	8.719593904097023E-6	1.6131248722579494E-4	0.17682900457813558	5.798529946224521E-4
108-109	0.0023390310647740265	5.62413806814258E-4	8.719593904097023E-6	1.6131248722579494E-4	0.17843340985648942	5.798529946224521E-4
110-111	0.0024022481205787302	5.667736037663065E-4	8.719593904097023E-6	1.6349238570181917E-4	0.17996805838361052	5.798529946224521E-4
112-113	0.0024480259885752394	5.71133400718355E-4	8.719593904097023E-6	1.6567228417784343E-4	0.18154412498177605	5.798529946224521E-4
114-115	0.002498163653523797	5.754931976704035E-4	8.719593904097023E-6	1.6567228417784343E-4	0.18327278447326328	5.798529946224521E-4
116-117	0.002548301318472355	5.929323854785976E-4	8.719593904097023E-6	1.6567228417784343E-4	0.1848379515790487	5.798529946224521E-4
118-119	0.0026180580697051314	6.147313702388401E-4	8.719593904097023E-6	1.7003208112989195E-4	0.18624398609608434	5.842127915745006E-4
120-121	0.0026899947194139314	6.234509641429371E-4	8.719593904097023E-6	1.7439187808194047E-4	0.18780697330339374	5.842127915745006E-4
122-123	0.0028055293386432174	6.256308626189614E-4	8.719593904097023E-6	1.7657177655796473E-4	0.18917376964786095	5.842127915745006E-4
124-125	0.0028752860898759933	6.2999065957101E-4	8.719593904097023E-6	1.78751675033989E-4	0.19075419604297852	5.842127915745006E-4
126-127	0.0029254237548245513	6.321705580470342E-4	8.719593904097023E-6	1.78751675033989E-4	0.19216677025544227	5.842127915745006E-4
128-129	0.002958122231964915	6.38710253475107E-4	8.719593904097023E-6	1.8093157351001325E-4	0.19360550324961825	5.885725885265491E-4
130-131	0.0029973604045333514	6.452499489031797E-4	8.719593904097023E-6	1.8965116741411026E-4	0.19490036294437668	5.929323854785976E-4
132-133	0.003075836749670225	6.517896443312525E-4	8.719593904097023E-6	1.9401096436615875E-4	0.1960186508625771	5.972921824306461E-4
134-135	0.003204450759755656	6.583293397593253E-4	8.719593904097023E-6	1.9619086284218301E-4	0.19701704436459622	5.972921824306461E-4
136-137	0.0033352446683171115	6.714087306154708E-4	8.719593904097023E-6	1.9619086284218301E-4	0.19817675035384114	5.972921824306461E-4
138-139	0.00333960446526916	6.953876138517377E-4	8.719593904097023E-6	1.9837076131820727E-4	0.1992383609116649	5.972921824306461E-4
>>END_MODULE
