##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.2d.S.1.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24138500
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	63-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.408209457919924	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.70960415933053	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.85871491600555	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.854797729767796	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.7313458168486	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.722811359446524	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.76463272365723	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.88503270708619	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.84669751641569	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.82583660128011	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
15-19	34.84235581332726	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.832676048636	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.837335368809164	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.816481405224025	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.80786157383433	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.76103193653292	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.6565750978727	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.634110404540465	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.62380847194316	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.595802676872516	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
65-69	34.5656047213209	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
70-74	34.56351865126328	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.547723794082884	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.529744555475965	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.517931022235324	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.49418258869511	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.47151796918577	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.43209708661884	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.39919336512487	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.37414613063187	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.3375510533828	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.29446055206622	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.27653374509809	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.230472877236124	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
135-139	34.19153388332366	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.15061841680077	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.18265267064656	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	35.05605172377401	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	8.0
22	166.0
23	2554.0
24	17805.0
25	74427.0
26	195423.0
27	369920.0
28	557145.0
29	735415.0
30	920388.0
31	1159404.0
32	1487194.0
33	1956945.0
34	2698692.0
35	4202496.0
36	8398518.0
37	1361991.0
38	8.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.2246369906995	11.232889367607763	14.722986101041904	37.819487540650826
2	22.723077180569113	13.015919862617464	36.32065724346375	27.940345713349675
3	21.59128471097538	17.01616612580205	27.441532222021326	33.95101694120124
4	26.868905656866172	24.735551808563187	21.72633469617856	26.669207838392083
5	26.749504587326236	30.2348633479631	23.82169584789619	19.193936216814475
6	20.00782982517119	36.255877029488616	25.445485981505872	18.290807163834327
7	17.012715177740102	24.347644165590413	39.212916308921756	19.426724347747733
8	19.297385518022846	24.440266972988184	30.87635787385382	25.385989635135147
9	20.191157356577918	23.27296405840345	31.98300983684197	24.552868748176664
10-14	21.209442748873606	28.64250712150247	26.497006087251947	23.651044042371975
15-19	21.389479993434534	27.725643751585128	27.122060899911205	23.762815355069133
20-24	21.36692795227378	27.764185197027075	27.007685600413154	23.861201250285983
25-29	21.333158386776212	27.923734956098535	26.705888014406508	24.03721864271874
30-34	21.33830856863876	27.71366108629688	26.88246142473803	24.06556892032633
35-39	21.5554801830088	27.49936702692759	26.814644190586478	24.13050859947713
40-44	21.73366147491222	27.5827239989377	26.66935024217345	24.01426428397663
45-49	21.97023065231231	27.495905392114402	26.61114032452701	23.92272363104628
50-54	21.939240011336924	27.710362892668105	26.525161871688756	23.825235224306216
55-59	21.843928267899912	27.63924173520998	26.630130946715425	23.886699050174684
60-64	22.070751033005358	27.470382338274074	26.390694203511426	24.06817242520914
65-69	21.947287302842216	27.57172147378707	26.54528826310455	23.935702960266163
70-74	22.308202231382396	27.323555037705937	26.535581604412155	23.832661126499513
75-79	22.172050650192286	27.219028130842748	26.503376818682778	24.105544400282184
80-84	22.39582998459753	27.243787491617528	26.519861513631454	23.84052101015349
85-89	22.23660121747831	27.19634705965759	26.561030391900964	24.00602133096314
90-94	22.263071618224604	26.952662980510368	26.532077924063223	24.252187477201804
95-99	22.44976343912827	27.00258542448305	26.706173019947144	23.84147811644154
100-104	22.42015113542134	26.798973683041826	26.759908050060748	24.020967131476084
105-109	22.538389237077247	26.755673851769696	26.69260969590372	24.01332721524934
110-114	22.487895970976663	26.804903473714376	26.663733888184925	24.043466667124033
115-119	22.56559822661817	26.994359806213136	26.556247567849855	23.883794399318838
120-124	22.496678510030325	26.874286621641268	26.58372605634683	24.045308811981577
125-129	22.86408641462214	26.833052046178757	26.463728167178342	23.83913337202076
130-134	22.630867588862	27.043071886671015	26.37228350978843	23.953777014678558
135-139	22.743222210232915	26.88252106174464	26.41228118308476	23.96197554493768
140-144	22.67052030289242	26.748913569309078	26.650402595686444	23.930163532112058
145-149	22.138617204258672	26.74789945454589	27.042535972585867	24.070947368609566
150	22.011396035866657	25.379928017053395	27.676966909938898	24.931709037141054
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.5
5	0.5
6	0.0
7	0.0
8	0.5
9	0.5
10	1.5
11	5.0
12	8.0
13	10.5
14	29.0
15	59.5
16	104.0
17	247.5
18	547.5
19	951.5
20	1555.5
21	2528.0
22	4224.5
23	6976.5
24	11203.0
25	17291.0
26	24661.5
27	35064.0
28	53867.5
29	79722.5
30	108652.0
31	137920.0
32	168223.0
33	203163.0
34	239538.0
35	287991.5
36	354977.0
37	425201.0
38	496491.5
39	597301.0
40	739178.5
41	896888.0
42	1055093.5
43	1212574.0
44	1352331.0
45	1459304.5
46	1540618.5
47	1572136.0
48	1535844.5
49	1484921.5
50	1392211.5
51	1232490.0
52	1046630.0
53	882049.0
54	736434.5
55	612365.5
56	521036.0
57	426428.5
58	345692.0
59	275728.5
60	209054.5
61	144801.5
62	84538.5
63	48747.5
64	31206.5
65	18734.0
66	11532.5
67	5463.0
68	2242.0
69	1214.5
70	988.0
71	687.0
72	383.5
73	191.0
74	105.0
75	69.0
76	33.0
77	22.0
78	12.0
79	3.5
80	3.5
81	2.0
82	1.0
83	0.5
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0014582513412183856
3	0.12378151086438677
4	1.2014002527083291E-4
5	1.5742486069971208E-4
6	1.242827847629306E-4
7	1.0356898730244215E-4
8	1.1599726577873522E-4
9	2.5685108851005654E-4
10-14	2.2536611637011413E-4
15-19	3.065642024152288E-4
20-24	3.5876297201565963E-4
25-29	3.34734966961493E-4
30-34	2.643080555958324E-4
35-39	1.3422540754396504E-4
40-44	2.377943948464072E-4
45-49	1.9470969612859124E-4
50-54	1.2179712906767197E-4
55-59	1.673674834807465E-4
60-64	1.9885245726828475E-4
65-69	0.050438927457751206
70-74	1.8890984066573485E-4
75-79	1.5991053096932984E-4
80-84	1.2179717044293545E-4
85-89	1.1516881693752494E-4
90-94	1.4913959503380064E-4
95-99	1.0605498745618064E-4
100-104	8.119851796465011E-5
105-109	9.031291344827141E-5
110-114	7.125629158876565E-5
115-119	6.95994447555153E-5
120-124	1.2428539831672164E-4
125-129	9.942930149531976E-5
130-134	5.965852059397216E-5
135-139	4.8888954184644644E-5
140-144	5.88520763257054E-5
145-149	4.3082288361869734E-5
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
62-63	1.0
64-65	0.0
66-67	0.0
68-69	0.0
70-71	0.0
72-73	0.0
74-75	1.0
76-77	0.0
78-79	2.0
80-81	5.0
82-83	3.0
84-85	6.0
86-87	7.0
88-89	4.0
90-91	13.0
92-93	11.0
94-95	20.0
96-97	13.0
98-99	15.0
100-101	27.0
102-103	29.0
104-105	23.0
106-107	37.0
108-109	39.0
110-111	19.0
112-113	35.0
114-115	42.0
116-117	47.0
118-119	46.0
120-121	57.0
122-123	80.0
124-125	109.0
126-127	106.0
128-129	146.0
130-131	153.0
132-133	248.0
134-135	373.0
136-137	759.0
138-139	1919.0
140-141	5293.0
142-143	7927.0
144-145	68889.0
146-147	779046.0
148-149	1384988.0
150-151	2.1887962E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	44.24230221945354
#Duplication Level	Percentage of total
1	34.86837615690221
2	8.771026133224263
3	5.054101966615591
4	3.5140532555683524
5	2.658892446999536
6	2.1331727263938136
7	1.6677000607834995
8	1.4964484356625385
9	1.2109422487259185
>10	15.8123641089807
>50	5.09738354013867
>100	10.276318621252006
>500	3.3511611014764764
>1k	3.66870374091137
>5k	0.35590531836094524
>10k+	0.06345013800410333
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.242827847629306E-5	0.0	0.0	3.894193922571825E-4	0.0
2	3.314207593678149E-5	4.557035441307455E-5	0.0	1.6571037968390745E-5	0.0026762226318951055	1.242827847629306E-5
3	4.1427594920976863E-5	6.214139238146529E-5	0.0	1.6571037968390745E-5	0.004917455517119954	4.557035441307455E-5
4	1.1599726577873521E-4	7.871243034985604E-5	0.0	1.6571037968390745E-5	0.0072291153137104625	5.3855873397269924E-5
5	1.4085382273132133E-4	7.871243034985604E-5	0.0	1.6571037968390745E-5	0.008389087971497814	5.7998632889367605E-5
6	1.9056693663649358E-4	7.871243034985604E-5	0.0	2.0713797460488432E-5	0.010406611844149387	5.7998632889367605E-5
7	2.444228100337635E-4	9.942622781034447E-5	0.0	2.0713797460488432E-5	0.012101000476417342	6.214139238146529E-5
8	3.728483542887918E-4	9.942622781034447E-5	0.0	2.0713797460488432E-5	0.015953766804068188	6.628415187356298E-5
9	4.349897466702571E-4	9.942622781034447E-5	0.0	2.0713797460488432E-5	0.019044265385173065	6.628415187356298E-5
10-11	4.909169998135758E-4	1.0356898730244216E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.032170598835884585	7.456967085775835E-5
12-13	5.323445947345528E-4	1.05640367048491E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.04110653106033929	8.699794933405141E-5
14-15	6.255566833067506E-4	1.0978312654058869E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.04835428879176419	1.0771174679453985E-4
16-17	7.125546326408021E-4	1.201400252708329E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.052911324233071655	1.0771174679453985E-4
18-19	8.202663794353419E-4	1.3256830374712596E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.056391242206433705	1.0771174679453985E-4
20-21	0.0011516871388031567	1.4499658222341902E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.05937402904074404	1.0771174679453985E-4
22-23	0.0014023240880750667	1.5121072146156555E-4	0.0	2.0713797460488432E-5	0.06233403069784784	1.0771174679453985E-4
24-25	0.001518321353853802	1.636389999378586E-4	0.0	2.485655695258612E-5	0.0653603165068252	1.1806864552478405E-4
26-27	0.0016218903411562443	1.6571037968390745E-4	0.0	2.8999316444683802E-5	0.06799096878430723	1.3049692400107711E-4
28-29	0.001835242454999275	1.6985313917600514E-4	0.0	3.1070696190732646E-5	0.07099446941607804	1.3671106323922364E-4
30-31	0.0022101621890341155	1.7399589866810283E-4	0.0	4.1427594920976863E-5	0.07442881703502705	1.4499658222341902E-4
32-33	0.0024090146446548045	1.7399589866810283E-4	0.0	4.1427594920976863E-5	0.07749238767943327	1.7606727841415167E-4
34-35	0.002562296745862419	1.7606727841415167E-4	0.0	5.592725314331876E-5	0.08065538455164985	1.7813865816020051E-4
36-37	0.002622366758497836	1.8021003790624936E-4	0.0	6.214139238146529E-5	0.0834103196138948	1.864241771443959E-4
38-39	0.002657580214180666	1.864241771443959E-4	0.0	8.699794933405141E-5	0.08617146881537793	1.967810758746401E-4
40-41	0.0027093647078318865	1.864241771443959E-4	0.0	8.699794933405141E-5	0.0888290490295586	2.0920935435093317E-4
42-43	0.002728007125546326	1.864241771443959E-4	0.0	9.11407088261491E-5	0.09150941442094579	2.11280734096982E-4
44-45	0.0027466495432607657	1.9056693663649358E-4	0.0	9.321208857219794E-5	0.09417113739461855	2.154234935890797E-4
46-47	0.0027777202394514986	1.9470969612859126E-4	4.142759492097686E-6	9.735484806429563E-5	0.09854382003852766	2.154234935890797E-4
48-49	0.0028087909356422315	2.0920935435093317E-4	4.142759492097686E-6	1.0149760755639332E-4	0.10138368167036063	2.2370901257327507E-4
50-51	0.0028295047331027196	2.2370901257327507E-4	4.142759492097686E-6	1.0978312654058869E-4	0.10433539780848022	2.2370901257327507E-4
52-53	0.002860575429293452	2.2370901257327507E-4	4.142759492097686E-6	1.1185450628663754E-4	0.1068914804151045	2.2370901257327507E-4
54-55	0.0028750750875157945	2.2370901257327507E-4	4.142759492097686E-6	1.1185450628663754E-4	0.10873707976883401	2.2370901257327507E-4
56-57	0.0029144313026907226	2.2578039231932392E-4	4.142759492097686E-6	1.201400252708329E-4	0.1109368850591379	2.361372910495681E-4
58-59	0.002960001657103797	2.2785177206537273E-4	4.142759492097686E-6	1.2842554425502827E-4	0.11302276446340909	2.361372910495681E-4
60-61	0.0030677134038983368	2.2785177206537273E-4	4.142759492097686E-6	1.2842554425502827E-4	0.11505478799428298	2.3820867079561695E-4
62-63	0.0031319261760258507	2.3199453155747042E-4	4.142759492097686E-6	1.2842554425502827E-4	0.11742237504401681	2.4235143028771464E-4
64-65	0.0031464258342481927	2.3199453155747042E-4	4.142759492097686E-6	1.346396834931748E-4	0.1204196615365495	2.4856556952586117E-4
66-67	0.0031754251506928765	2.361372910495681E-4	4.142759492097686E-6	1.4085382273132133E-4	0.12299645794063427	2.4856556952586117E-4
68-69	0.003185782049423121	2.464941897798123E-4	4.142759492097686E-6	1.4292520247737017E-4	0.12486069971207822	2.4856556952586117E-4
70-71	0.0032106386063757066	2.5270832901795885E-4	4.142759492097686E-6	1.491393417155167E-4	0.12715785985044636	2.4856556952586117E-4
72-73	0.003223066884852	2.5685108851005654E-4	4.142759492097686E-6	1.5121072146156555E-4	0.12886674814093668	2.4856556952586117E-4
74-75	0.003249994821550635	2.5685108851005654E-4	4.142759492097686E-6	1.5949624044576092E-4	0.130577707811173	2.5270832901795885E-4
76-77	0.0032644944797729767	2.5685108851005654E-4	4.142759492097686E-6	1.6985313917600514E-4	0.1321415995194399	2.5270832901795885E-4
78-79	0.003287279656979514	2.5685108851005654E-4	4.142759492097686E-6	1.9056693663649358E-4	0.13362470741761087	2.589224682561054E-4
80-81	0.0033121362139321	2.5685108851005654E-4	4.142759492097686E-6	1.9056693663649358E-4	0.13512438635375024	2.651366074942519E-4
82-83	0.003341135530376784	2.6099384800215423E-4	4.142759492097686E-6	1.9056693663649358E-4	0.13673799117592228	2.651366074942519E-4
84-85	0.0033722062265675165	2.672079872403008E-4	4.142759492097686E-6	1.9263831638254242E-4	0.13851109223854008	2.713507467323984E-4
86-87	0.0034094910619963956	2.734221264784473E-4	4.142759492097686E-6	1.9470969612859126E-4	0.14006876980756883	2.7549350622449616E-4
88-89	0.0034322762392029332	2.734221264784473E-4	4.142759492097686E-6	1.9885245562068895E-4	0.1417217308449158	2.77564885970545E-4
90-91	0.0034550614164094704	2.8585040495474035E-4	4.142759492097686E-6	1.9885245562068895E-4	0.14370196988213849	2.77564885970545E-4
92-93	0.003471632454377861	2.982786834310334E-4	4.142759492097686E-6	1.9885245562068895E-4	0.14554549785612197	2.8170764546264266E-4
94-95	0.003502703150568594	3.044928226691799E-4	4.142759492097686E-6	1.9885245562068895E-4	0.1471756737162624	2.8585040495474035E-4
96-97	0.003560701783457961	3.127783416533753E-4	4.142759492097686E-6	1.9885245562068895E-4	0.1486090685005282	2.8585040495474035E-4
98-99	0.0036352714543157194	3.1899248089152185E-4	4.142759492097686E-6	2.0506659485883548E-4	0.14984982496841145	2.8585040495474035E-4
100-101	0.003726412163141869	3.2106386063757066E-4	4.142759492097686E-6	2.154234935890797E-4	0.15114858006918408	2.8585040495474035E-4
102-103	0.003753340099840504	3.2313524038361953E-4	4.142759492097686E-6	2.2163763282722623E-4	0.15228783892951095	2.8585040495474035E-4
104-105	0.0037719825175549435	3.2313524038361953E-4	4.142759492097686E-6	2.2578039231932392E-4	0.15337945605567868	2.941359239389357E-4
106-107	0.003817552871968018	3.2313524038361953E-4	4.142759492097686E-6	2.3406591130351926E-4	0.1544027176502268	2.982786834310334E-4
108-109	0.003879694264349483	3.2313524038361953E-4	4.142759492097686E-6	2.464941897798123E-4	0.1555481906497918	3.024214429231311E-4
110-111	0.003941835656730949	3.272779998757172E-4	4.142759492097686E-6	2.4856556952586117E-4	0.1566957350291029	3.024214429231311E-4
112-113	0.004028833606064999	3.355635188599126E-4	4.142759492097686E-6	2.5270832901795885E-4	0.1578536363071442	3.024214429231311E-4
114-115	0.004061975682001781	3.397062783520103E-4	4.142759492097686E-6	2.5685108851005654E-4	0.15903639414213808	3.024214429231311E-4
116-117	0.004132402593367442	3.459204175901568E-4	4.142759492097686E-6	2.6099384800215423E-4	0.16002029952151128	3.024214429231311E-4
118-119	0.00419040122625681	3.5213455682830334E-4	4.142759492097686E-6	2.651366074942519E-4	0.160942063508503	3.024214429231311E-4
120-121	0.004281541935082959	3.687055947966941E-4	4.142759492097686E-6	2.734221264784473E-4	0.16185554197651056	3.024214429231311E-4
122-123	0.004494894048925989	3.687055947966941E-4	4.142759492097686E-6	2.8170764546264266E-4	0.16281044803943906	3.024214429231311E-4
124-125	0.004586034757752138	3.687055947966941E-4	4.142759492097686E-6	2.8585040495474035E-4	0.1637239265074466	3.024214429231311E-4
126-127	0.004625390972927067	3.707769745427429E-4	4.142759492097686E-6	2.8585040495474035E-4	0.1647761874184394	3.024214429231311E-4
128-129	0.0046730327070861905	3.7491973403484065E-4	4.142759492097686E-6	2.8585040495474035E-4	0.16555709758269982	3.044928226691799E-4
130-131	0.0047703875551504855	3.7699111378088946E-4	4.142759492097686E-6	2.8585040495474035E-4	0.16626136669635644	3.065642024152288E-4
132-133	0.004840814466516146	3.7699111378088946E-4	4.142759492097686E-6	2.8999316444683804E-4	0.166922136835346	3.0863558216127766E-4
134-135	0.004913312757627856	3.8113387327298715E-4	4.142759492097686E-6	2.8999316444683804E-4	0.16772583217681297	3.1070696190732647E-4
136-137	0.0050003107069619065	3.894193922571825E-4	4.142759492097686E-6	2.8999316444683804E-4	0.16858131201193116	3.1070696190732647E-4
138-139	0.005004453466454005	3.935621517492802E-4	4.142759492097686E-6	2.8999316444683804E-4	0.16934357975847714	3.1070696190732647E-4
>>END_MODULE
