##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.2d.S.1.R2.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24138500
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	62-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.920534043126125	37.0	35.0	38.0	33.0	39.0
2	35.25182927688133	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
3	35.40069055657974	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
4	35.45111204093046	36.0	35.0	38.0	33.0	39.0
5	35.374061229985294	36.0	34.0	37.0	33.0	39.0
6	35.31846717898792	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
7	35.36356061892827	35.0	34.0	37.0	33.0	39.0
8	35.48340244837086	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
9	35.474193756861446	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
10-14	35.44204151045011	35.8	34.4	37.8	33.0	39.0
15-19	35.41296020050956	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
20-24	35.38899432027673	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
25-29	35.38029659672308	36.0	34.0	38.0	33.0	39.0
30-34	35.36780258093917	36.0	34.0	38.0	32.8	39.0
35-39	35.3378655343124	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
40-44	35.32350063177082	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
45-49	35.294127099861214	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
50-54	35.27740375748286	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
55-59	35.24870282743335	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
60-64	35.20947897669922	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
65-69	35.17401951647942	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
70-74	35.15902072030083	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
75-79	35.1016825254406	35.4	34.0	38.0	32.0	39.0
80-84	35.032424599120375	35.4	34.0	38.0	32.0	39.0
85-89	35.01442276644495	35.0	34.0	38.0	31.6	39.0
90-94	34.96936470396243	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
95-99	34.904746115892216	35.0	34.0	37.2	31.0	39.0
100-104	34.843580755491885	35.0	34.0	37.2	31.0	39.0
105-109	34.78980673077236	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
110-114	34.718730010367686	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
115-119	34.65501410689091	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.58480475816269	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.507460896949944	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.43265904472538	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.35061868754642	35.0	34.0	37.0	29.6	39.0
140-144	34.26292430727179	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.23077260106362	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	35.03618743335815	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	4.0
21	210.0
22	1793.0
23	9298.0
24	32379.0
25	79800.0
26	157667.0
27	271844.0
28	396150.0
29	521877.0
30	666864.0
31	860838.0
32	1144540.0
33	1581516.0
34	2344122.0
35	3946212.0
36	1.0062774E7
37	2060610.0
38	2.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	warn
#Base	G	A	T	C
1	32.21063860637571	19.38891811835864	15.104525964745116	33.29591731052054
2	23.036858131201193	26.281463222652608	33.542403214781366	17.13927543136483
3	19.45584854071297	29.49843196553224	29.52548832777513	21.52023116597966
4	22.99160676926901	34.30717733082006	21.821442923131098	20.879772976779833
5	25.117579799904714	34.73880729954222	22.246349193197588	17.89726370735547
6	19.247745303146427	38.314626012386846	22.73099405514013	19.706634629326594
7	20.27251486214968	20.517455517119952	37.287482652194626	21.92254696853574
8	21.600124282784762	23.187290013878243	28.633113076620337	26.579472626716655
9	23.351894276777763	23.18785342916917	28.316220974791307	25.14403131926176
10-14	22.995679930401643	28.359672722000123	25.63631294405203	23.0083344035462
15-19	22.86812022288046	27.618831327547277	27.015216355614474	22.497832093957783
20-24	22.81486792328672	27.55893356377413	26.93502455484871	22.691173958090445
25-29	22.91228866748141	27.213382770263273	26.90008658367338	22.974241978581933
30-34	22.817716925243907	26.948852662758664	27.025155664187917	23.208274747809515
35-39	23.137060712140357	26.733299086521534	27.051361103631127	23.078279097706982
40-44	23.283667170702405	26.34626923793939	27.116626136669638	23.25343745468857
45-49	23.202520454874993	26.170224330426496	27.197657683783167	23.42959753091534
50-54	23.43316361828614	26.174849307123477	26.905497027570064	23.486490047020318
55-59	23.50174451602212	26.189632330095076	26.890402469084655	23.418220684798143
60-64	23.16818896233302	26.200822357658055	26.989744631849444	23.64124404815948
65-69	23.399944274906133	26.10561068574908	26.945898304653337	23.54854673469145
70-74	23.56537351214815	26.067471820526322	26.651054258070474	23.716100409255063
75-79	23.40728489507448	26.249047739022725	26.872311787063673	23.471355578839123
80-84	23.74091290058394	26.199510386414072	26.568052313540868	23.49152439946112
85-89	23.503765865094387	26.2837025142105	26.776882161368825	23.43564945932629
90-94	23.515698810422027	26.045834891232573	26.76990735062806	23.66855894771734
95-99	23.535755159110327	26.255425390331684	26.778688071256568	23.430131379301418
100-104	23.742432493623618	26.031641934128086	26.745599504182323	23.480326068065974
105-109	23.54767938723735	26.229081898712035	26.652128720087326	23.57110999396329
110-114	23.63272615340672	26.30482503847913	26.58870434857895	23.473744459535197
115-119	23.787045211505113	26.38892587677263	26.764193206644798	23.059835705077457
120-124	23.74378249658418	26.54041651907576	26.89742879765584	22.818372186684215
125-129	23.710906603229212	26.578904200426596	26.75329731560093	22.956891880743267
130-134	23.875953677700753	26.544324555414466	26.76757465570564	22.812147111179137
135-139	23.630965565697775	26.556823627832838	27.0411167745796	22.771094031889792
140-144	23.62800559589552	26.713587932061987	26.812498442032588	22.8459080300099
145-149	23.42486875083886	26.912218815394073	26.687148192490067	22.975764241277
150	23.644259817879266	25.84529550012598	26.961736329835716	23.548708352159032
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	1.0
2	10.5
3	21.0
4	27.5
5	26.5
6	20.0
7	16.5
8	13.0
9	8.5
10	7.0
11	8.5
12	8.5
13	9.0
14	20.5
15	37.5
16	52.5
17	99.5
18	199.0
19	318.0
20	476.5
21	736.0
22	1146.5
23	1887.5
24	2932.0
25	4574.5
26	7139.0
27	10950.0
28	16461.5
29	23720.0
30	34107.5
31	49706.0
32	71828.5
33	98371.5
34	133234.0
35	189270.5
36	270126.0
37	366060.5
38	482626.5
39	626037.5
40	797448.5
41	986668.0
42	1178515.5
43	1373492.5
44	1526596.0
45	1617315.0
46	1646491.0
47	1617385.0
48	1563921.5
49	1501556.5
50	1384930.5
51	1219431.5
52	1041748.5
53	867289.5
54	732260.0
55	630922.5
56	513239.5
57	401873.0
58	334833.0
59	274660.0
60	204266.0
61	135765.0
62	82952.5
63	50011.5
64	30360.5
65	14659.0
66	7725.5
67	4196.5
68	2237.0
69	1264.0
70	667.5
71	482.0
72	318.0
73	247.5
74	211.5
75	151.0
76	99.5
77	39.0
78	13.5
79	3.5
80	1.0
81	1.0
82	1.0
83	0.5
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10-14	0.0
15-19	0.0
20-24	0.02568096609151356
25-29	0.0
30-34	0.0
35-39	0.0
40-44	0.0
45-49	0.0
50-54	0.0
55-59	0.0
60-64	0.0
65-69	8.285520013942873E-7
70-74	0.0
75-79	5.592730921311942E-4
80-84	0.0500040532854248
85-89	2.485667516814671E-6
90-94	0.0
95-99	0.0
100-104	0.0
105-109	0.0
110-114	0.0
115-119	0.0
120-124	0.0
125-129	0.0
130-134	0.0
135-139	0.0
140-144	2.686786874727683E-4
145-149	0.025616959586201037
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
62-63	1.0
64-65	0.0
66-67	3.0
68-69	2.0
70-71	0.0
72-73	8.0
74-75	5.0
76-77	12.0
78-79	11.0
80-81	15.0
82-83	20.0
84-85	18.0
86-87	34.0
88-89	46.0
90-91	52.0
92-93	45.0
94-95	63.0
96-97	84.0
98-99	80.0
100-101	96.0
102-103	91.0
104-105	101.0
106-107	103.0
108-109	119.0
110-111	117.0
112-113	134.0
114-115	125.0
116-117	154.0
118-119	190.0
120-121	227.0
122-123	264.0
124-125	293.0
126-127	335.0
128-129	386.0
130-131	506.0
132-133	645.0
134-135	929.0
136-137	1513.0
138-139	4659.0
140-141	8700.0
142-143	9828.0
144-145	62452.0
146-147	782909.0
148-149	1097060.0
150-151	2.2166065E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	34.450408347355236
#Duplication Level	Percentage of total
1	24.8302443958994
2	8.412102177527624
3	5.36348165180728
4	3.772407938568614
5	2.8859832453414493
6	2.3278814709476103
7	1.9054810037870524
8	1.6316683076916978
9	1.3386454861183184
>10	17.465152900648278
>50	6.029526691659301
>100	12.641365731918574
>500	3.848225354752359
>1k	5.779468780006987
>5k	0.90364987644143
>10k+	0.8647149868839361
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	warn
#Sequence	Count	Percentage	Possible Source
AGAACAATGGCTTCCTCTATGCTCTCTTCCGCTACTATGGTTGCCTCTCC	35099	0.14540671541313668	No Hit
GAACAATGGCTTCCTCTATGCTCTCTTCCGCTACTATGGTTGCCTCTCCG	26218	0.10861486836381713	No Hit
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	2.2785177206537273E-4	0.0	0.0	0.0	0.0025560826066242724	0.0
2	0.0011558298982952545	2.0713797460488432E-5	0.0	0.0	0.00979348343931893	0.0
3	0.001636389999378586	2.485655695258612E-5	0.0	0.0	0.013666963564430267	0.0
4	0.004080618099716221	2.8999316444683802E-5	0.0	0.0	0.01944611305590654	0.0
5	0.004246328479400129	3.314207593678149E-5	0.0	0.0	0.022946744826729083	0.0
6	0.005315160428361332	3.314207593678149E-5	0.0	0.0	0.029533732419164405	0.0
7	0.007444538807299542	3.7284835428879176E-5	4.142759492097686E-6	0.0	0.03785653623878866	0.0
8	0.015245354930919485	4.1427594920976863E-5	4.142759492097686E-6	0.0	0.05001139258860327	0.0
9	0.015924767487623507	4.1427594920976863E-5	4.142759492097686E-6	0.0	0.05968059324315927	0.0
10-11	0.016552395550676308	4.1427594920976863E-5	4.142759492097686E-6	0.0	0.09683700312778341	0.0
12-13	0.01729602087950784	4.1427594920976863E-5	4.142759492097686E-6	0.0	0.11409159641237028	0.0
14-15	0.01972989208111523	4.1427594920976863E-5	4.142759492097686E-6	0.0	0.12426621372496219	0.0
16-17	0.02257803923193239	4.1427594920976863E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.1310644820514945	0.0
18-19	0.029568945874847236	4.971311390517223E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.13840959463098368	0.0
20-21	0.035600803695341465	5.7998632889367605E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.14320069598359467	0.0
22-23	0.03821074217536301	6.214139238146529E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.14832321809557347	0.0
24-25	0.044126602730078505	6.628415187356298E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.1535493091948547	2.071379746048843E-6
26-27	0.04880170681691075	7.042691136566067E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.1576464983325393	4.142759492097686E-6
28-29	0.05881475650931085	7.249829111170951E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.16130041220456948	4.142759492097686E-6
30-31	0.07917020527373284	7.66410506038072E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.16524846200053855	4.142759492097686E-6
32-33	0.09646001201400253	7.871243034985604E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.16827267642976987	4.142759492097686E-6
34-35	0.1082109493133376	8.492656958800257E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.17131553327671561	4.142759492097686E-6
36-37	0.10993848002154236	8.699794933405141E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.17342834061768544	4.142759492097686E-6
38-39	0.11152101414752366	8.699794933405141E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.17499016094620626	4.142759492097686E-6
40-41	0.11261470265343745	9.528346831824679E-5	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.17647948298361538	4.142759492097686E-6
42-43	0.11289433891915404	1.0356898730244216E-4	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.17794809122356403	4.142759492097686E-6
44-45	0.11374981875427222	1.0356898730244216E-4	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.17923441804586035	4.142759492097686E-6
46-47	0.11497814694367918	1.0771174679453985E-4	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.18050624520993436	4.142759492097686E-6
48-49	0.11622304617105454	1.0771174679453985E-4	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.18160614785508628	4.142759492097686E-6
50-51	0.11739130434782609	1.0978312654058869E-4	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.18272883567744475	6.214139238146529E-6
52-53	0.11859063322078836	1.1185450628663754E-4	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.1839944487022806	1.0356898730244216E-5
54-55	0.11913747747374526	1.1392588603268637E-4	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.1850342813347971	1.242827847629306E-5
56-57	0.11980653313171905	1.1599726577873521E-4	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.18606375706858339	1.242827847629306E-5
58-59	0.11995981523292665	1.1599726577873521E-4	4.142759492097686E-6	4.142759492097686E-6	0.1870559479669408	1.242827847629306E-5
60-61	0.120229094599913	1.201400252708329E-4	8.285518984195372E-6	4.142759492097686E-6	0.187913499181805	1.242827847629306E-5
62-63	0.12054394432131244	1.201400252708329E-4	8.285518984195372E-6	4.142759492097686E-6	0.18887876214346377	1.6571037968390745E-5
64-65	0.12057294363775711	1.3049692400107711E-4	8.285518984195372E-6	4.142759492097686E-6	0.18987509580131323	1.6571037968390745E-5
66-67	0.12067444124531351	1.4499658222341902E-4	8.285518984195372E-6	4.142759492097686E-6	0.190585579054208	1.6571037968390745E-5
68-69	0.12076143919464755	1.5535348095366324E-4	8.285518984195372E-6	4.142759492097686E-6	0.19139755991465918	1.6571037968390745E-5
70-71	0.12093957785280776	1.5742486069971208E-4	8.285518984195372E-6	4.142759492097686E-6	0.1922053980156182	1.6571037968390745E-5
72-73	0.12100379062493527	1.6156762019180977E-4	8.285518984195372E-6	4.142759492097686E-6	0.19277088468628953	2.2785177206537275E-5
74-75	0.1210390040806181	1.6571037968390745E-4	8.285518984195372E-6	4.142759492097686E-6	0.19343994034426332	2.692793669863496E-5
76-77	0.12109493133376142	1.7813865816020051E-4	1.242827847629306E-5	4.142759492097686E-6	0.19416699463512646	2.8999316444683802E-5
78-79	0.12116121548563498	1.822814176522982E-4	1.242827847629306E-5	4.142759492097686E-6	0.195080473103134	2.8999316444683802E-5
80-81	0.12123164239700064	1.967810758746401E-4	1.242827847629306E-5	4.142759492097686E-6	0.19591731052053774	2.8999316444683802E-5
82-83	0.12126064171344533	1.9885245562068895E-4	1.242827847629306E-5	4.142759492097686E-6	0.19676036207717962	2.8999316444683802E-5
84-85	0.12129792654887421	2.0299521511278664E-4	1.242827847629306E-5	4.142759492097686E-6	0.1975578432794084	3.1070696190732646E-5
86-87	0.12134349690328727	2.0920935435093317E-4	1.242827847629306E-5	4.142759492097686E-6	0.1982911117095097	3.7284835428879176E-5
88-89	0.1213787103589701	2.11280734096982E-4	1.242827847629306E-5	4.142759492097686E-6	0.1991735194813265	3.7284835428879176E-5
90-91	0.1214118524349069	2.1956625308117738E-4	1.242827847629306E-5	4.142759492097686E-6	0.19977214822793463	4.1427594920976863E-5
92-93	0.12142842347287529	2.1956625308117738E-4	1.4499658222341901E-5	4.142759492097686E-6	0.20030656420241522	4.1427594920976863E-5
94-95	0.12149470762474884	2.3199453155747042E-4	1.6571037968390745E-5	4.142759492097686E-6	0.20101083331607184	4.1427594920976863E-5
96-97	0.12150299314373304	2.3406591130351926E-4	2.0713797460488432E-5	4.142759492097686E-6	0.20174824450566523	4.1427594920976863E-5
98-99	0.12151542142220934	2.361372910495681E-4	2.0713797460488432E-5	4.142759492097686E-6	0.20235308739151148	4.349897466702571E-5
100-101	0.12154234935890798	2.402800505416658E-4	2.0713797460488432E-5	4.142759492097686E-6	0.20286886094827766	4.557035441307455E-5
102-103	0.12154856349814612	2.402800505416658E-4	2.0713797460488432E-5	4.142759492097686E-6	0.20346748969488576	4.557035441307455E-5
104-105	0.12156306315636846	2.402800505416658E-4	2.0713797460488432E-5	4.142759492097686E-6	0.20415933053006607	4.971311390517224E-5
106-107	0.1215817055740829	2.402800505416658E-4	2.2785177206537275E-5	4.142759492097686E-6	0.20467510408683223	6.214139238146529E-5
108-109	0.12160656213103549	2.402800505416658E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.20515359280816953	6.214139238146529E-5
110-111	0.1216500611057025	2.444228100337635E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.20563622428899891	6.214139238146529E-5
112-113	0.1216583466246867	2.444228100337635E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.20621413923814652	6.214139238146529E-5
114-115	0.1216666321436709	2.444228100337635E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.20673612693415083	6.214139238146529E-5
116-117	0.12167491766265509	2.444228100337635E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.2073243987820287	6.214139238146529E-5
118-119	0.12168734594113138	2.464941897798123E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.20784431509828696	6.421277212751414E-5
120-121	0.12169356008036952	2.4856556952586117E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.20845951488286346	6.628415187356298E-5
122-123	0.12170184559935374	2.4856556952586117E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.20896700292064546	6.835553161961182E-5
124-125	0.12171220249808398	2.5270832901795885E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.2094786337179195	7.249829111170951E-5
126-127	0.12172463077656026	2.5685108851005654E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.21005033452782898	7.456967085775835E-5
128-129	0.12173291629554446	2.6306522774820304E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.2107504608819935	7.871243034985604E-5
130-131	0.12173705905503657	2.692793669863496E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.21144851585641194	7.871243034985604E-5
132-133	0.12175363009300495	2.692793669863496E-4	2.485655695258612E-5	4.142759492097686E-6	0.21206371564098847	8.285518984195373E-5
134-135	0.1217639869917352	2.77564885970545E-4	2.485655695258612E-5	6.214139238146529E-6	0.21264784472937423	8.285518984195373E-5
136-137	0.1217639869917352	2.8377902520869153E-4	2.485655695258612E-5	8.285518984195372E-6	0.21319468898233113	8.285518984195373E-5
138-139	0.1217639869917352	2.941359239389357E-4	2.485655695258612E-5	8.285518984195372E-6	0.21378088945046297	8.285518984195373E-5
>>END_MODULE
