##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.2d.S.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24133957
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	73-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.4428853088617	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.76956915933844	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.87686503294922	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.894360050446764	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.7599473223558	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.74907977170921	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.76863881045284	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.91367586343176	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.87562143249033	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.85710676454757	35.0	34.0	37.4	31.2	39.0
15-19	34.87497749333025	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.86397046286277	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.8636985555249	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.844663218717095	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.832783343402824	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.79139323899516	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.68501066774918	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.665417146471256	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.652860954380586	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.62522430946571	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.59057990366023	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
70-74	34.59427384895291	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
75-79	34.57958119341557	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.561022781139876	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.54635138220689	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.522503165461785	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.50290138336827	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.46504692840189	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.436082399788816	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.408107204483315	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.37382773853126	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.33366631686256	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.31682463554139	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.27455867808013	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.23848659451294	35.0	34.0	37.0	29.6	39.0
140-144	34.20155663873854	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.23735522451412	35.0	34.0	37.0	29.4	39.0
150	35.10162043213044	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	10.0
22	223.0
23	2602.0
24	18767.0
25	76622.0
26	200198.0
27	369983.0
28	556018.0
29	726593.0
30	908287.0
31	1136056.0
32	1444884.0
33	1898203.0
34	2623641.0
35	4125947.0
36	8628188.0
37	1417729.0
38	6.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.39638361003129	10.370897735501892	15.705149387644967	38.52756926682185
2	22.749233690478288	12.100470196541947	36.46755291653416	28.68274319644561
3	21.926164262172183	16.99529188769058	27.905583929767268	33.17295992036997
4	27.180862665750006	24.716594093893345	21.826825098069374	26.275718142287275
5	26.894415571559843	30.44129499414248	23.915292430202154	18.748997004095518
6	20.004082216300368	36.02918859238494	25.357714976525394	18.609014214789298
7	16.638183961974885	24.510316258295784	39.94935929245547	18.902140487273858
8	19.31259434331665	23.819696999204027	31.143245215346194	25.72446344213313
9	20.0547370240722	22.665496088309496	32.397123403684745	24.88264348393356
10-14	21.0290712870634	28.616512960432942	26.685757089732142	23.668658662771513
15-19	21.2994891153701	27.483145411524575	27.320223565332334	23.897141907772994
20-24	21.25961912026616	27.56493278840327	27.16785707173604	24.007591019594532
25-29	21.198217857569286	27.785573353061473	26.834361882983742	24.181846906385495
30-34	21.218880365016556	27.594780607326975	27.03268706586775	24.153651961788718
35-39	21.4772616781367	27.334107695358746	26.94195111534957	24.246679511154987
40-44	21.653260410424068	27.40445533508823	26.794085850933776	24.14819840355393
45-49	21.907158476654732	27.34969650678501	26.70329252150235	24.039852495057907
50-54	21.8857361527292	27.587276873633236	26.583239247976465	23.943747725661098
55-59	21.79103894052249	27.502650149818603	26.709904457869516	23.996406451789394
60-64	22.04043606391236	27.340045222175714	26.443368372631575	24.176150341280355
65-69	21.878069184318473	27.45016261209066	26.61756021511695	24.05420798847392
70-74	22.226601859163065	27.18983591935683	26.58937465640674	23.994187565073368
75-79	22.091021903844673	27.12795448914752	26.538462150431403	24.2425614565764
80-84	22.340400300364	27.087228473838827	26.57119124331476	24.001179982482412
85-89	22.184460618728306	27.06330894180022	26.6228981192074	24.12933232026408
90-94	22.19699341630014	26.813707997495932	26.59802694110071	24.391271645103217
95-99	22.42403580883225	26.86005754043798	26.756229906641316	23.95967674408845
100-104	22.369846712899005	26.656993477699526	26.833929666085453	24.139230143316016
105-109	22.50282489012659	26.62347419676782	26.721080521405728	24.152620391699866
110-114	22.43442254190593	26.698298705677036	26.67072634721377	24.196552405203267
115-119	22.542717486334798	26.909104457993422	26.557329700445447	23.990848355226333
120-124	22.496496720428443	26.750219960070183	26.594688443830332	24.158594875671042
125-129	22.871329081956095	26.72097311343005	26.452698390161878	23.95499941445198
130-134	22.60035700735227	26.927259696034312	26.373567376993122	24.098815919620296
135-139	22.698906411213883	26.75131967205846	26.436173920308057	24.113599996419598
140-144	22.65151651445629	26.572461356002325	26.707898261481272	24.068123868060113
145-149	22.125646671804788	26.5928484036739	27.0803555710833	24.20114935343801
150	22.012241035288753	25.215273929650532	27.673104155977423	25.099380879083288
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	1.0
9	1.5
10	1.5
11	3.5
12	7.5
13	12.5
14	22.0
15	51.5
16	103.5
17	233.0
18	521.0
19	918.5
20	1520.0
21	2458.0
22	4086.5
23	6716.5
24	10886.5
25	16556.0
26	23513.0
27	33863.0
28	52091.5
29	77376.5
30	105850.0
31	134708.0
32	164051.5
33	197788.0
34	233674.0
35	282654.5
36	351988.5
37	422619.0
38	494470.5
39	599746.0
40	744348.0
41	900903.5
42	1061798.0
43	1220114.5
44	1358572.5
45	1465541.0
46	1542750.0
47	1567170.5
48	1522714.5
49	1469540.0
50	1379648.0
51	1224980.5
52	1044595.0
53	886553.0
54	744555.0
55	616169.0
56	523479.5
57	431773.5
58	353756.5
59	285390.0
60	215129.5
61	146943.0
62	85524.0
63	49168.5
64	31185.5
65	18898.0
66	12070.5
67	5708.0
68	2299.0
69	1297.5
70	1182.0
71	834.0
72	420.5
73	199.0
74	120.5
75	74.0
76	36.5
77	18.0
78	8.5
79	2.0
80	2.5
81	1.5
82	0.5
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0017900089902372826
3	0.15962985265947063
4	8.701432591431235E-5
5	4.143539329252969E-5
6	3.314831463402375E-5
7	5.3866011280288595E-5
8	1.1187556188983016E-4
9	7.458370792655344E-5
10-14	1.6988511249937173E-4
15-19	2.245798316455109E-4
20-24	2.950200002428114E-4
25-29	1.5994061810916462E-4
30-34	1.5745449451161282E-4
35-39	1.0607460682887602E-4
40-44	2.0966309006020023E-4
45-49	1.6657028103596937E-4
50-54	8.618561804846175E-5
55-59	1.5911191024331402E-4
60-64	1.8728797768223423E-4
65-69	0.06454888437896861
70-74	1.8065831625255912E-4
75-79	1.441951913621843E-4
80-84	1.243062282939572E-4
85-89	7.044022405294984E-5
90-94	1.4170931633674557E-4
95-99	8.867207525995152E-5
100-104	6.961190723606743E-5
105-109	1.0193212508848517E-4
110-114	6.049655706635256E-5
115-119	5.2209656011791893E-5
120-124	1.0276270658173505E-4
125-129	9.862026110998677E-5
130-134	3.8951605762543656E-5
135-139	5.387174802675039E-5
140-144	4.725697823278086E-5
145-149	4.139103300775231E-5
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
72-73	1.0
74-75	2.0
76-77	1.0
78-79	3.0
80-81	2.0
82-83	3.0
84-85	3.0
86-87	8.0
88-89	9.0
90-91	14.0
92-93	14.0
94-95	19.0
96-97	25.0
98-99	18.0
100-101	32.0
102-103	39.0
104-105	40.0
106-107	34.0
108-109	39.0
110-111	42.0
112-113	58.0
114-115	57.0
116-117	51.0
118-119	84.0
120-121	86.0
122-123	95.0
124-125	125.0
126-127	157.0
128-129	175.0
130-131	204.0
132-133	245.0
134-135	422.0
136-137	783.0
138-139	1864.0
140-141	5264.0
142-143	7941.0
144-145	68880.0
146-147	768110.0
148-149	1352758.0
150-151	2.192625E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	44.19208838199957
#Duplication Level	Percentage of total
1	35.11270381193895
2	8.373726671607704
3	4.961841849761242
4	3.4326873542190293
5	2.5112477833452034
6	2.057964157085959
7	1.7512065631237212
8	1.4510219841979628
9	1.249595588944178
>10	15.535986076654961
>50	5.078251191451622
>100	10.467788233220757
>500	3.64934661382027
>1k	3.93555410109769
>5k	0.333122865944039
>10k+	0.09795515358669614
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	2.0717696646264847E-5	0.0	0.0	2.4032528109667223E-4	2.4861235975517814E-5
2	8.287078658505938E-6	9.115786524356532E-5	0.0	1.2430617987758907E-5	0.0022416547771258563	2.4861235975517814E-5
3	2.0717696646264847E-5	9.53014045728183E-5	0.0	1.6574157317011876E-5	0.00428441966644757	4.972247195103563E-5
4	7.458370792655344E-5	1.0358848323132423E-4	0.0	2.4861235975517814E-5	0.006037136802721576	5.800955060954157E-5
5	9.115786524356532E-5	1.1187556188983016E-4	0.0	2.4861235975517814E-5	0.007056447477717807	5.800955060954157E-5
6	1.077320225605772E-4	1.1601910121908314E-4	0.0	2.4861235975517814E-5	0.00861027472618767	6.215308993879454E-5
7	1.32593258536095E-4	1.4088033719460096E-4	0.0	2.4861235975517814E-5	0.010085374727401727	6.62966292680475E-5
8	2.2375112377966033E-4	1.4088033719460096E-4	0.0	2.4861235975517814E-5	0.013412636808791862	7.458370792655344E-5
9	2.776171350599489E-4	1.4502387652385392E-4	0.0	2.4861235975517814E-5	0.016640453946279925	7.458370792655344E-5
10-11	3.501290733218759E-4	1.4916741585310688E-4	0.0	2.4861235975517814E-5	0.029187091035257913	1.1187556188983018E-4
12-13	4.0606685426679094E-4	1.5538272484698633E-4	2.0717696646264845E-6	2.4861235975517814E-5	0.037822226997421104	1.2844971920684205E-4
14-15	4.433587082300677E-4	1.5952626417623932E-4	4.143539329252969E-6	2.4861235975517814E-5	0.04432758374434827	1.4502387652385392E-4
16-17	4.7029171387021204E-4	1.7195688216399823E-4	4.143539329252969E-6	2.4861235975517814E-5	0.048232869562169184	1.5123918551773337E-4
18-19	5.365883431382595E-4	1.864592698163836E-4	4.143539329252969E-6	2.9004775304770785E-5	0.05129701689615176	1.5745449451161282E-4
20-21	8.991480344478943E-4	2.2167935411503386E-4	4.143539329252969E-6	2.9004775304770785E-5	0.053924020830898145	1.5745449451161282E-4
22-23	0.0012907125010623	2.278946631089133E-4	4.143539329252969E-6	3.107654496939727E-5	0.0566587567882051	1.6159803384086579E-4
24-25	0.0013797985966412388	2.444688204259252E-4	4.143539329252969E-6	3.314831463402375E-5	0.05928161718362223	1.6574157317011875E-4
26-27	0.001415018680939889	2.444688204259252E-4	4.143539329252969E-6	3.522008429865023E-5	0.06182575033178355	1.740286518286247E-4
28-29	0.0014481669955739127	2.444688204259252E-4	4.143539329252969E-6	4.557893262178266E-5	0.06477387856454703	1.740286518286247E-4
30-31	0.0015745449451161284	2.444688204259252E-4	4.143539329252969E-6	6.422485960342102E-5	0.06793332730310242	1.8024396082250415E-4
32-33	0.0016491286530426817	2.444688204259252E-4	4.143539329252969E-6	8.494255624968587E-5	0.07075507758632371	2.030334271333955E-4
34-35	0.0017216405913046086	2.486123597551782E-4	4.143539329252969E-6	1.0773202256057719E-4	0.07361619149317288	2.1339227545652791E-4
36-37	0.0017506453666093795	2.527558990844311E-4	4.143539329252969E-6	1.1809087088370963E-4	0.0760111572254811	2.154640451211544E-4
38-39	0.001769291293591018	2.527558990844311E-4	4.143539329252969E-6	1.36736797865348E-4	0.07853042913766689	2.154640451211544E-4
40-41	0.0017920807599019091	2.527558990844311E-4	4.143539329252969E-6	1.4088033719460096E-4	0.08113878714543164	2.1960758445040737E-4
42-43	0.0018065831475542946	2.548276687490576E-4	4.143539329252969E-6	1.4916741585310688E-4	0.08349438925411196	2.2789466310891332E-4
44-45	0.0018190137655420533	2.568994384136841E-4	4.143539329252969E-6	1.4916741585310688E-4	0.08617940273946788	2.2789466310891332E-4
46-47	0.0018438750015175713	2.6518651707219E-4	4.143539329252969E-6	1.4916741585310688E-4	0.09021935358548952	2.2996643277353978E-4
48-49	0.0018604491588345832	2.755453653953225E-4	4.143539329252969E-6	1.5123918551773337E-4	0.09267025709874266	2.3618174176741924E-4
50-51	0.0018625209284992097	2.817606743892019E-4	4.143539329252969E-6	1.5331095518235986E-4	0.09542985429202513	2.3618174176741924E-4
52-53	0.0018832386251454744	2.838324440538284E-4	4.143539329252969E-6	1.6159803384086579E-4	0.09783517887265647	2.3618174176741924E-4
54-55	0.0018956692431332334	2.859042137184549E-4	4.143539329252969E-6	1.6159803384086579E-4	0.09968112564383869	2.3618174176741924E-4
56-57	0.00193296109709651	2.921195227123343E-4	4.143539329252969E-6	1.6366980350549228E-4	0.10187098617934887	2.3618174176741924E-4
58-59	0.001986827108376799	3.045501407000932E-4	4.143539329252969E-6	1.6988511249937173E-4	0.10393446876531684	2.3618174176741924E-4
60-61	0.0020883438219434962	3.1490898902322565E-4	4.143539329252969E-6	1.6988511249937173E-4	0.10593579826134604	2.4032528109667223E-4
62-63	0.0021318509849006526	3.1905252835247864E-4	4.143539329252969E-6	1.6988511249937173E-4	0.10835562522962977	2.444688204259252E-4
64-65	0.002146353372553038	3.2319606768173157E-4	4.143539329252969E-6	1.761004214932512E-4	0.1113306864680334	2.444688204259252E-4
66-67	0.0021649992995346765	3.356266856694905E-4	4.143539329252969E-6	1.8024396082250415E-4	0.11383959953189607	2.444688204259252E-4
68-69	0.0021815734568516884	3.501290733218759E-4	4.143539329252969E-6	1.8231573048713064E-4	0.11577256062899258	2.486123597551782E-4
70-71	0.0022292241591380974	3.5634438231575536E-4	4.143539329252969E-6	1.8438750015175714E-4	0.11774902888904626	2.5068412941980467E-4
72-73	0.002256157164778242	3.5634438231575536E-4	4.143539329252969E-6	1.885310394810101E-4	0.11948517186800325	2.568994384136841E-4
74-75	0.0022685877827660007	3.5634438231575536E-4	4.143539329252969E-6	2.0717696646264846E-4	0.12118195122333233	2.610429777429371E-4
76-77	0.0022851619400830123	3.604879216450083E-4	4.143539329252969E-6	2.1753581478578087E-4	0.12257210866829671	2.610429777429371E-4
78-79	0.00231002317605853	3.604879216450083E-4	4.143539329252969E-6	2.2996643277353978E-4	0.12386903647835289	2.631147474075635E-4
80-81	0.002330740872704795	3.604879216450083E-4	4.143539329252969E-6	2.3203820243816628E-4	0.12529855754694516	2.714018260660695E-4
82-83	0.0023535303390156866	3.729185396327672E-4	4.143539329252969E-6	2.3203820243816628E-4	0.12686895895273204	2.73473595730696E-4
84-85	0.002384606883985084	3.770620789620202E-4	4.143539329252969E-6	2.3203820243816628E-4	0.12859059954403662	2.73473595730696E-4
86-87	0.002415683428954481	3.832773879558996E-4	4.143539329252969E-6	2.3203820243816628E-4	0.1300574124665922	2.73473595730696E-4
88-89	0.002436401125600746	3.853491576205261E-4	4.143539329252969E-6	2.423970507612987E-4	0.13153872777680015	2.796889047245754E-4
90-91	0.002436401125600746	3.894926969497791E-4	4.143539329252969E-6	2.444688204259252E-4	0.13357320558746333	2.817606743892019E-4
92-93	0.0024591905919116373	3.894926969497791E-4	4.143539329252969E-6	2.444688204259252E-4	0.13534871219004824	2.838324440538284E-4
94-95	0.0025006259852041668	3.894926969497791E-4	4.143539329252969E-6	2.444688204259252E-4	0.13693568775315212	2.8797598338308134E-4
96-97	0.002560707305478335	3.894926969497791E-4	4.143539329252969E-6	2.465405900905517E-4	0.1382947686531471	2.941912923769608E-4
98-99	0.002629075704411009	3.936362362790321E-4	4.143539329252969E-6	2.527558990844311E-4	0.13960205531152642	2.941912923769608E-4
100-101	0.0027803148899287426	3.936362362790321E-4	4.143539329252969E-6	2.548276687490576E-4	0.1409010548912472	2.941912923769608E-4
102-103	0.002813463204562766	3.957080059436586E-4	4.143539329252969E-6	2.568994384136841E-4	0.14200116458316386	2.941912923769608E-4
104-105	0.002838324440538284	3.97779775608285E-4	4.143539329252969E-6	2.589712080783106E-4	0.14308055657843427	2.9833483170621375E-4
106-107	0.002894262221483199	4.06066854266791E-4	4.143539329252969E-6	2.631147474075635E-4	0.1441060825624244	3.0040660137084025E-4
108-109	0.0029191234574587168	4.06066854266791E-4	4.143539329252969E-6	2.69330056401443E-4	0.145139895625073	3.0247837103546674E-4
110-111	0.002950200002428114	4.143539329252969E-4	4.143539329252969E-6	2.73473595730696E-4	0.1460618331258318	3.0247837103546674E-4
112-113	0.0030247837103546675	4.164257025899234E-4	4.143539329252969E-6	2.776171350599489E-4	0.14723031121668112	3.0455014070009324E-4
114-115	0.0030807214912995824	4.205692419191764E-4	6.2153089938794535E-6	2.817606743892019E-4	0.14852102371774342	3.0869368002934617E-4
116-117	0.0031408028115737507	4.288563205776823E-4	8.287078658505938E-6	2.859042137184549E-4	0.1494408894488376	3.1076544969397266E-4
118-119	0.0032008841318479186	4.3299985990693526E-4	8.287078658505938E-6	2.9004775304770783E-4	0.15034003748328548	3.1076544969397266E-4
120-121	0.0033417644690425198	4.3507162957156175E-4	8.287078658505938E-6	2.962630620415873E-4	0.15126819029303815	3.1076544969397266E-4
122-123	0.003526151969194277	4.3507162957156175E-4	8.287078658505938E-6	3.1076544969397266E-4	0.15210311346788263	3.1076544969397266E-4
124-125	0.0036028074467854567	4.3507162957156175E-4	8.287078658505938E-6	3.1283721935859916E-4	0.15304576866528768	3.1076544969397266E-4
126-127	0.003656673458065745	4.3507162957156175E-4	8.287078658505938E-6	3.1490898902322565E-4	0.15393662962107707	3.1076544969397266E-4
128-129	0.0037250418569984194	4.3921516890081474E-4	8.287078658505938E-6	3.1490898902322565E-4	0.15469489731833036	3.1076544969397266E-4
130-131	0.0038638504245283936	4.4128693856544123E-4	8.287078658505938E-6	3.1490898902322565E-4	0.1553330023750353	3.1076544969397266E-4
132-133	0.0039177164358086825	4.4957401722394715E-4	8.287078658505938E-6	3.1698075868785214E-4	0.15596282035308176	3.1076544969397266E-4
134-135	0.004013017840381501	4.5164578688857365E-4	8.287078658505938E-6	3.2112429801710513E-4	0.15675423636496907	3.1076544969397266E-4
136-137	0.004120749862942078	4.5578932621782663E-4	8.287078658505938E-6	3.2319606768173157E-4	0.15758294423081967	3.1076544969397266E-4
138-139	0.0041269651719359575	4.6200463521170606E-4	8.287078658505938E-6	3.2319606768173157E-4	0.15818168566389673	3.1076544969397266E-4
>>END_MODULE
