##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.2d.S.3.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24108909
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	73-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.43544587604524	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.7482404118743	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.926217067723805	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.87839640524588	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.741182025283685	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.72033520886408	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.73713717198899	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.88138111102415	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.869417940065226	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.84466525631666	35.0	34.0	37.4	31.2	39.0
15-19	34.84155821401955	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.851029111271686	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.84255471701353	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.8271247363371	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.81868815382729	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.753677945360366	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.648890067982755	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.61578578275774	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.60536410005115	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.57518023731393	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
65-69	34.55737135181024	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.529518109020884	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.509634028716825	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.481701796913796	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.465843628687786	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.43782308094687	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.402314054935644	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.36767805118251	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.31174213784136	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.28408908805726	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.23695603403682	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.20458781817133	35.0	34.0	37.0	29.4	39.0
125-129	34.15367039827113	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.10856145042035	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.06487445361711	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.04642841654278	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.057669103670364	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	34.971319172610066	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	17.0
22	302.0
23	3470.0
24	23899.0
25	93162.0
26	227790.0
27	401624.0
28	575041.0
29	741604.0
30	924831.0
31	1156919.0
32	1475282.0
33	1935430.0
34	2682620.0
35	4210393.0
36	8338614.0
37	1317908.0
38	2.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.53856377325079	11.029785711165943	14.412402485736706	39.01924802984656
2	22.50533050588217	12.879555765252423	36.78880495253304	27.826308776332365
3	21.316917316903876	16.892641362975837	27.774160855325842	34.01628046479445
4	26.6610897501678	24.630358528978217	21.938647392568935	26.769904328285044
5	26.652479371305876	30.06942997882856	24.158175816775337	19.119914833090228
6	19.84102627043494	35.8359731964422	25.88151200165217	18.441488531470696
7	16.787228799492834	23.970087522562757	39.805413518153834	19.43727015979057
8	19.192798074834396	24.064794032175772	31.22799074050992	25.51441715247991
9	20.031426572522168	22.972539971447056	32.27699301216476	24.719040443866014
10-14	21.057645456923684	28.45413056014688	26.64621610475114	23.842007878178293
15-19	21.26534659025934	27.490787306922098	27.266753459112557	23.977112643706004
20-24	21.24027507093573	27.493627986996717	27.148768116199317	24.117328825868235
25-29	21.161453035224575	27.712887607013243	26.840944326194588	24.28471503156759
30-34	21.197438461099615	27.50285910999313	26.996382745430985	24.303319683476268
35-39	21.436215133374105	27.27195561706947	26.920097153196963	24.371732096359462
40-44	21.598132634869103	27.357046334643965	26.759737436807367	24.285083593679563
45-49	21.833078598055604	27.280043609175248	26.69506113314835	24.191816659620795
50-54	21.819633645775287	27.503740335789452	26.61254700462462	24.064079013810645
55-59	21.738346850317445	27.445111644905403	26.67824986410788	24.138291640669276
60-64	21.955162705439392	27.289258735188604	26.43457922243972	24.320999336932285
65-69	21.842955578131328	27.38523117158052	26.609213653821513	24.162599596466645
70-74	22.20067604095614	27.132886121350236	26.55806448915458	24.108373348539043
75-79	22.055111308733373	27.04279611901773	26.53837543855792	24.363717133690976
80-84	22.297836799437746	27.019127527384796	26.565341621533108	24.11769405164435
85-89	22.1769348568736	26.985629289934447	26.57869338779763	24.25874246539432
90-94	22.180272990535464	26.748347380022096	26.57690483806966	24.494474791372777
95-99	22.403483533719484	26.812406388961683	26.75414186912006	24.02996820819877
100-104	22.337334732792666	26.596296220005545	26.81806651769987	24.248302529501924
105-109	22.481418967685034	26.557605348098605	26.698024128961222	24.262951555255135
110-114	22.402928852906236	26.617195417322225	26.65806842236779	24.32180730740375
115-119	22.540685306129006	26.833074533027883	26.538088973945555	24.08815118689756
120-124	22.483228795395714	26.658667794463014	26.553785986141488	24.304317423999784
125-129	22.89124439355019	26.65366158633939	26.402426099560213	24.052667920550206
130-134	22.593307771621124	26.88296058786186	26.304252958739426	24.21947868177759
135-139	22.700403997236737	26.685570415712945	26.351367463018388	24.26265812403193
140-144	22.677352189148223	26.51800990720441	26.609785426904363	24.194852476743005
145-149	22.159421632825023	26.400420270457765	27.042368474925105	24.397789621792114
150	21.964578926750328	25.050973859232922	27.735792510815543	25.248654703201208
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.5
5	0.5
6	0.5
7	0.5
8	0.0
9	0.5
10	1.0
11	3.5
12	9.5
13	17.0
14	26.5
15	44.5
16	92.0
17	213.0
18	494.5
19	898.0
20	1444.0
21	2284.0
22	3864.0
23	6424.0
24	10299.0
25	15942.5
26	22585.5
27	32250.0
28	49707.5
29	74060.0
30	101455.5
31	128418.5
32	155799.5
33	188535.5
34	223888.5
35	270284.0
36	338968.0
37	413025.0
38	485373.5
39	588226.5
40	730734.5
41	891596.0
42	1056960.5
43	1216210.0
44	1359146.5
45	1469882.0
46	1550653.5
47	1577765.0
48	1533003.0
49	1481993.5
50	1394257.0
51	1239734.5
52	1056448.0
53	893530.0
54	747247.0
55	616865.5
56	524699.0
57	435407.5
58	359001.0
59	288347.0
60	217114.5
61	146529.5
62	82750.0
63	47601.0
64	31266.0
65	19592.0
66	12655.0
67	5924.5
68	2362.0
69	1460.5
70	1434.0
71	1103.0
72	577.0
73	201.5
74	106.0
75	74.5
76	30.0
77	15.5
78	6.5
79	1.0
80	1.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.5
96	0.5
97	0.0
98	0.0
99	0.5
100	0.5
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.410267051072282E-4
3	6.221766401789479E-5
4	2.903490987501757E-5
5	6.221766401789479E-5
6	8.295688535719306E-5
7	1.6591377071438612E-4
8	9.125257389291237E-5
9	4.9774131214315836E-5
10-14	1.4932239364294752E-4
15-19	2.1568790192870194E-4
20-24	1.8333471663939665E-4
25-29	2.9117866760374763E-4
30-34	7.582259321647447E-4
35-39	7.507598124825972E-4
40-44	0.0010129035702113273
45-49	9.166735831969834E-4
50-54	4.604107137324215E-4
55-59	3.2933883486805645E-4
60-64	2.4555238065729145E-4
65-69	2.978152184323231E-4
70-74	3.052813406469894E-4
75-79	2.5052983118843713E-4
80-84	2.9034939983119915E-4
85-89	3.7994343952907323E-4
90-94	3.7330753872258956E-4
95-99	3.0611302230347775E-4
100-104	4.172776299719024E-4
105-109	3.185594106332344E-4
110-114	2.4389847926560543E-4
115-119	2.331155157813107E-4
120-124	2.1320767630594889E-4
125-129	1.1531666757495826E-4
130-134	1.6260886207015217E-4
135-139	1.6510787547059582E-4
140-144	1.5437964341389964E-4
145-149	1.4970488726321224E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
72-73	1.0
74-75	1.0
76-77	3.0
78-79	8.0
80-81	12.0
82-83	15.0
84-85	12.0
86-87	13.0
88-89	13.0
90-91	21.0
92-93	25.0
94-95	27.0
96-97	33.0
98-99	30.0
100-101	50.0
102-103	41.0
104-105	50.0
106-107	43.0
108-109	55.0
110-111	61.0
112-113	71.0
114-115	59.0
116-117	89.0
118-119	90.0
120-121	128.0
122-123	162.0
124-125	175.0
126-127	180.0
128-129	221.0
130-131	261.0
132-133	369.0
134-135	574.0
136-137	976.0
138-139	2241.0
140-141	5769.0
142-143	8728.0
144-145	70985.0
146-147	765531.0
148-149	1416084.0
150-151	2.1835702E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	42.747519520914715
#Duplication Level	Percentage of total
1	33.48380767774417
2	8.576386340757628
3	5.030976982633635
4	3.554379984813173
5	2.588324072870702
6	2.1109226996865136
7	1.6993291843547915
8	1.4622073617547096
9	1.197273109026479
>10	15.752343406188803
>50	5.2328961410378545
>100	10.982899430310681
>500	3.7645947073858648
>1k	4.175847974258479
>5k	0.33659456321128534
>10k+	0.051216363965161896
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.147844267859653E-6	4.147844267859653E-6	0.0	4.147844267859653E-6	3.276796971609126E-4	1.2443532803578959E-5
2	1.6591377071438612E-5	4.5626286946456186E-5	0.0	2.4887065607157918E-5	0.002534332847662248	2.4887065607157918E-5
3	2.903490987501757E-5	4.9774131214315836E-5	0.0	2.4887065607157918E-5	0.004778316596574321	7.05133525536141E-5
4	9.954826242863167E-5	6.636550828575445E-5	0.0	2.4887065607157918E-5	0.0072711710015579715	7.466119682147376E-5
5	1.1613963950007028E-4	6.636550828575445E-5	0.0	2.903490987501757E-5	0.008328871289862183	7.466119682147376E-5
6	1.6176592644652648E-4	7.05133525536141E-5	0.0	2.903490987501757E-5	0.010004600374077483	7.88090410893334E-5
7	2.1568790192870197E-4	9.125257389291237E-5	0.0	2.903490987501757E-5	0.011804764786328572	7.88090410893334E-5
8	3.3182754142877224E-4	9.125257389291237E-5	0.0	2.903490987501757E-5	0.015600042291420155	7.88090410893334E-5
9	3.981930497145267E-4	9.125257389291237E-5	0.0	3.3182754142877224E-5	0.018810473754743526	8.295688535719306E-5
10-11	4.5833679159849167E-4	9.33264960268422E-5	0.0	3.525667627680705E-5	0.03166049529657273	1.0577002883042115E-4
12-13	4.915195457413689E-4	9.540041816077202E-5	0.0	3.733059841073688E-5	0.039738422008229406	1.2443532803578958E-4
14-15	5.661807425628427E-4	1.0369610669649133E-4	0.0	3.733059841073688E-5	0.045841974848384884	1.3480493870543872E-4
16-17	6.470637057861058E-4	1.2028748376792994E-4	0.0	3.733059841073688E-5	0.04962066097640503	1.410267051072282E-4
18-19	8.088296322326323E-4	1.3687886083936854E-4	0.0	3.733059841073688E-5	0.05256355648445145	1.410267051072282E-4
20-21	0.001171766005670352	1.8250514778582472E-4	0.0	3.94045205446667E-5	0.05523476819295307	1.410267051072282E-4
22-23	0.001532628456974142	1.9080083632154406E-4	0.0	4.147844267859653E-5	0.05783339262676714	1.576180821786668E-4
24-25	0.0016964683055545981	1.949486805894037E-4	0.0	4.147844267859653E-5	0.060633187507572406	1.576180821786668E-4
26-27	0.0017877208794475105	1.949486805894037E-4	0.0	4.147844267859653E-5	0.06299331089598456	1.576180821786668E-4
28-29	0.0019640042608315457	1.949486805894037E-4	0.0	4.562628694645618E-5	0.06567904005942368	1.5969200431259663E-4
30-31	0.002306201412929967	1.9909652485726334E-4	0.0	6.221766401789479E-5	0.06845809571888964	1.638398485804563E-4
32-33	0.002536406769796178	2.0739221339298266E-4	0.0	6.429158615182463E-5	0.07110234643965017	1.7628338138403525E-4
34-35	0.0026815813191712655	2.0739221339298266E-4	0.0	7.88090410893334E-5	0.073885549943384	1.8457906991975457E-4
36-37	0.0027043944626444936	2.115400576608423E-4	0.0	8.710472962505272E-5	0.07632448237288547	1.9909652485726334E-4
38-39	0.0027375772167873708	2.2398359046442125E-4	0.0	1.0369610669649133E-4	0.0788360020770745	2.1154005766084233E-4
40-41	0.002779055659465968	2.2398359046442125E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.08104887699397761	2.1568790192870197E-4
42-43	0.002797720958671336	2.281314347322809E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.08328249113222004	2.1568790192870197E-4
44-45	0.002820534102144564	2.447228118037195E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.0858935590988377	2.1568790192870197E-4
46-47	0.002845421167751722	2.4679673393764934E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.09005799474376878	2.198357461965616E-4
48-49	0.0028765299997606693	2.50944578205509E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.09251559247247562	2.2813143473228092E-4
50-51	0.0029097127539035464	2.5301850033943886E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.09512043867269149	2.3435320113407042E-4
52-53	0.002963634729385722	2.5301850033943886E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.09715910413034451	2.4057496753585988E-4
54-55	0.0030030392499303888	2.550924224733687E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.0990214862066135	2.447228118037195E-4
56-57	0.003079774368885792	2.6131418887515815E-4	0.0	1.0784395096435098E-4	0.10104563420932901	2.4887065607157916E-4
58-59	0.0031150310451625992	2.6960987741087743E-4	0.0	1.1613963950007028E-4	0.10302208200296414	2.5301850033943886E-4
60-61	0.0032415402953323187	2.737577216787371E-4	0.0	1.1613963950007028E-4	0.10504623000567964	2.5301850033943886E-4
62-63	0.003299610115082354	2.820534102144564E-4	0.0	1.1613963950007028E-4	0.10725703100044884	2.5301850033943886E-4
64-65	0.003322423258555582	2.820534102144564E-4	0.0	1.2236140590185976E-4	0.10965241106513779	2.5301850033943886E-4
66-67	0.003339014635627021	2.9657086515196517E-4	0.0	1.2443532803578958E-4	0.11192957756819275	2.571663446072985E-4
68-69	0.003370123467635968	3.1316224222340385E-4	0.0	1.2650925016971943E-4	0.11374633335751527	2.6960987741087743E-4
70-71	0.0034240454431181434	3.193840086251933E-4	0.0	1.2858317230364925E-4	0.1158845470775969	2.6960987741087743E-4
72-73	0.0034510064308592315	3.2145793075912313E-4	0.0	1.3065709443757907E-4	0.11745450613298179	2.6960987741087743E-4
74-75	0.0034800413407342487	3.276796971609126E-4	0.0	1.327310165715089E-4	0.11908460893025063	2.6960987741087743E-4
76-77	0.003500780562073547	3.297536192948424E-4	0.0	1.3480493870543872E-4	0.12027296631299242	2.6960987741087743E-4
78-79	0.0035235937055467753	3.3182754142877224E-4	0.0	1.4932239364294752E-4	0.1216334592328504	2.6960987741087743E-4
80-81	0.003550554693287863	3.3182754142877224E-4	0.0	1.5347023791080716E-4	0.12297943469777085	2.6960987741087743E-4
82-83	0.003565072148225372	3.359753856966319E-4	0.0	1.5347023791080716E-4	0.12446436294566461	2.6960987741087743E-4
84-85	0.003594107058100389	3.4219715209842134E-4	0.0	1.5347023791080716E-4	0.125959660804228	2.6960987741087743E-4
86-87	0.0036314376565111262	3.504928406341407E-4	0.0	1.5554416004473698E-4	0.12728074920354132	2.6960987741087743E-4
88-89	0.003662546488520074	3.525667627680705E-4	2.0739221339298265E-6	1.6176592644652645E-4	0.1286433160455332	2.6960987741087743E-4
90-91	0.0036770639434575824	3.525667627680705E-4	4.147844267859653E-6	1.6591377071438612E-4	0.1304787371340611	2.6960987741087743E-4
92-93	0.0037143945418683195	3.5464068490200033E-4	4.147844267859653E-6	1.6591377071438612E-4	0.1321752054396157	2.6960987741087743E-4
94-95	0.0037745382837522843	3.5671460703593015E-4	4.147844267859653E-6	1.6591377071438612E-4	0.1335999899456255	2.737577216787371E-4
96-97	0.003818090648564811	3.650102955716495E-4	4.147844267859653E-6	1.6591377071438612E-4	0.1348236040046441	2.779055659465968E-4
98-99	0.0038782343904487752	3.650102955716495E-4	4.147844267859653E-6	1.721355371161756E-4	0.13596011333403762	2.779055659465968E-4
100-101	0.003996447952082776	3.650102955716495E-4	4.147844267859653E-6	1.7420945925010543E-4	0.1371878752373241	2.779055659465968E-4
102-103	0.004017187173422074	3.670842177055793E-4	4.147844267859653E-6	1.7835730351796507E-4	0.13817298825094076	2.779055659465968E-4
104-105	0.004042074239029232	3.6915813983950913E-4	4.147844267859653E-6	1.8872691418761424E-4	0.13918713617443246	2.779055659465968E-4
106-107	0.004089774448109618	3.7123206197343895E-4	4.147844267859653E-6	2.0324436912512299E-4	0.14027387137261166	2.799794880805266E-4
108-109	0.004114661513716776	3.774538283752284E-4	4.147844267859653E-6	2.1568790192870197E-4	0.1412755757632998	2.820534102144564E-4
110-111	0.00417480525560074	3.8574951691094776E-4	4.147844267859653E-6	2.177618240626318E-4	0.14223994955557714	2.820534102144564E-4
112-113	0.004251540374556145	3.878234390448776E-4	4.147844267859653E-6	2.2398359046442125E-4	0.14338890241777427	2.820534102144564E-4
114-115	0.004274353518029373	3.898973611788074E-4	4.147844267859653E-6	2.2398359046442125E-4	0.14467473414081078	2.820534102144564E-4
116-117	0.004330349415645477	3.9404520544666704E-4	4.147844267859653E-6	2.2398359046442125E-4	0.14556029889199879	2.820534102144564E-4
118-119	0.004405010612466951	4.1063658251810567E-4	4.147844267859653E-6	2.2398359046442125E-4	0.14636912852423145	2.820534102144564E-4
120-121	0.00453774162903846	4.3137580385740394E-4	4.147844267859653E-6	2.2813143473228092E-4	0.14723810189834802	2.820534102144564E-4
122-123	0.0047223206989582146	4.3344972599133376E-4	4.147844267859653E-6	2.447228118037195E-4	0.14806144898551815	2.820534102144564E-4
124-125	0.004867495248333303	4.355236481252636E-4	4.147844267859653E-6	2.4887065607157916E-4	0.14899056610151873	2.8620125448231606E-4
126-127	0.004906899768877969	4.355236481252636E-4	4.147844267859653E-6	2.4887065607157916E-4	0.1498657612420371	2.8620125448231606E-4
128-129	0.004954599977958355	4.355236481252636E-4	4.147844267859653E-6	2.50944578205509E-4	0.15049623357075181	2.903490987501757E-4
130-131	0.005041704707583408	4.396714923931232E-4	4.147844267859653E-6	2.550924224733687E-4	0.1511909974856183	2.903490987501757E-4
132-133	0.005101848449467374	4.396714923931232E-4	4.147844267859653E-6	2.654620331430178E-4	0.15188161355621693	2.924230208841055E-4
134-135	0.005191027101226355	4.396714923931232E-4	4.147844267859653E-6	2.675359552769476E-4	0.15264689082363703	2.9449694301803534E-4
136-137	0.005296797130056777	4.6455855800028113E-4	4.147844267859653E-6	2.6960987741087743E-4	0.15348060752147683	2.9657086515196517E-4
138-139	0.005309240662860356	4.770020908038601E-4	4.147844267859653E-6	2.6960987741087743E-4	0.15415048437073614	2.9864478728589504E-4
>>END_MODULE
