##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.4d.R.1.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	21817240
Total Bases	3.2 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	65-150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.4468503807081	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.80530960836476	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.944169106633105	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.9165105668728	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.78743874110566	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.76542665341721	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.75015584006043	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.90030347560003	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.88430149734797	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.864026897994435	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
15-19	34.8674369535285	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.87173574659306	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.85948476525904	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.84722876037482	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.84197032255226	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.77630703975389	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.6880003978505	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.64868523241253	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.63872397241814	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.6124898749796	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.593589238257756	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.566551219433094	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
75-79	34.54666043697692	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.524692206069275	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.50462985849672	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.477724709311794	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.44971614749879	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.41140973485402	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.364009192368954	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.33133724915665	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.2861486138181	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.24900623336076	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.20564299565113	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
130-134	34.149382997293	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.10406585256487	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.07105117048114	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.08405611249874	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	34.97987417620222	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
20	1.0
21	9.0
22	244.0
23	2915.0
24	19088.0
25	76223.0
26	190686.0
27	341830.0
28	501460.0
29	654555.0
30	818710.0
31	1032955.0
32	1326961.0
33	1754961.0
34	2434152.0
35	3819564.0
36	7880485.0
37	962436.0
38	5.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.410629392168765	11.21426449908421	15.832447183970109	37.542658924776916
2	23.219813461007476	12.108607114164196	35.494133804838825	29.177445619989506
3	21.644149682578934	16.605353519820454	28.048128005221564	33.70236879237905
4	26.540912847322968	23.795018891032456	22.386815374820728	27.277252886823856
5	26.53044040919396	29.72568061220229	24.46196545638945	19.281913522214296
6	19.958453929935914	36.126760569835966	25.533154398272263	18.381631101955858
7	16.311476871308333	25.66637189935706	39.676715752230265	18.345435477104335
8	18.562606375306174	24.894300192632322	31.46965485185068	25.073438580210826
9	19.69624174814589	23.38978324367479	32.678758584160455	24.235216424018866
10-14	20.317026074294787	29.303633702516123	27.21976737982278	23.159572843366306
15-19	20.52837998211152	27.930132753880244	27.919046989879558	23.622440274128678
20-24	20.6729188305755	28.106623065579516	27.668506209758515	23.551951894086468
25-29	20.679198265152607	28.251244013988952	27.53521217075833	23.534345550100106
30-34	20.62461901322739	28.05071307963159	27.56407948168785	23.76058842545317
35-39	20.713564809521635	27.95843951033332	27.619632605517758	23.708363074627282
40-44	20.73106391534236	28.056539229388328	27.54289767121231	23.669499184057003
45-49	20.80843831058879	27.83894930871284	27.516317587693816	23.836294793004555
50-54	20.942506052384573	27.81830698936872	27.587124145912057	23.652062812334655
55-59	20.929443206783947	27.84535082220646	27.53115301780049	23.6940529532091
60-64	20.881935658110663	27.775166431428538	27.506975075435264	23.83592283502553
65-69	20.972472893782438	27.69895342437514	27.6052520025098	23.723321679332624
70-74	21.10171876135144	27.62389247182207	27.577016537208205	23.697372229618285
75-79	21.11240945641185	27.547291235496356	27.5773620444916	23.7629372636002
80-84	21.181793005632173	27.54143826458758	27.51927222038218	23.757496509398063
85-89	21.11532738471063	27.55648776188292	27.623617654664027	23.704567198742428
90-94	21.10558162755024	27.486290938856094	27.5446425047811	23.863484928812564
95-99	21.19316946023685	27.38870248709031	27.66838677260007	23.74974128007277
100-104	21.273948433485398	27.45083109265628	27.51043346288295	23.764787010975372
105-109	21.21227663835514	27.30786918588774	27.62335760577742	23.856496569979697
110-114	21.275763315758844	27.270436533688592	27.694450271275688	23.75934987927688
115-119	21.297692798900474	27.306195211230992	27.673489970530525	23.722622019338008
120-124	21.26610905589669	27.221989908338685	27.676576341476387	23.835324694288243
125-129	21.305456421581372	27.15040782397759	27.741777481553893	23.80235827288714
130-134	21.368630781649568	27.267495919449846	27.632712687179602	23.731160611720988
135-139	21.356819980669954	27.130860030115088	27.750856022398036	23.761463966816923
140-144	21.363550991702308	27.060087743970545	27.896511398592395	23.67984986573476
145-149	20.96373571783408	27.322197738190873	27.94240927225561	23.771657271719445
150	20.860323292772268	26.017523559119272	28.603127628216196	24.519025519892264
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	1.5
9	1.5
10	3.5
11	7.5
12	13.0
13	22.5
14	41.0
15	80.0
16	171.5
17	338.0
18	689.5
19	1305.0
20	2409.5
21	3938.5
22	6026.5
23	9429.5
24	14630.0
25	22271.0
26	32506.0
27	45388.0
28	61196.5
29	83713.5
30	112117.0
31	141817.0
32	172129.0
33	206055.5
34	241708.5
35	284531.5
36	350275.5
37	438603.5
38	545709.0
39	677767.5
40	830032.0
41	983833.5
42	1137364.5
43	1293574.5
44	1423259.0
45	1499268.5
46	1515924.5
47	1477943.5
48	1398285.5
49	1280799.0
50	1130394.0
51	970621.5
52	810339.0
53	651324.0
54	507190.5
55	383803.0
56	287293.5
57	215122.0
58	161249.0
59	120355.0
60	84972.5
61	59920.5
62	43818.5
63	28793.5
64	18081.5
65	13493.5
66	12449.0
67	10247.0
68	5687.0
69	2608.0
70	1892.5
71	1312.0
72	604.5
73	238.5
74	104.0
75	63.0
76	43.0
77	37.5
78	18.0
79	2.0
80	2.0
81	1.0
82	0.5
83	1.0
84	0.5
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.4667299805108254E-4
3	2.2917655945481645E-5
4	4.583531189096329E-5
5	3.2084718323674305E-5
6	6.416943664734861E-5
7	1.4208946686198622E-4
8	1.3292240448379354E-4
9	1.0083768616011924E-4
10-14	2.0167537232023848E-4
15-19	3.1993047699892377E-4
20-24	2.154259658875275E-4
25-29	3.7493285126807976E-4
30-34	9.607081372345907E-4
35-39	9.680417871371447E-4
40-44	0.0012595543707636713
45-49	0.0010468785235896016
50-54	6.261103604305586E-4
55-59	4.216848693968623E-4
60-64	2.594278653028522E-4
65-69	3.098467197444487E-4
70-74	3.3459780747682174E-4
75-79	2.8692912871604965E-4
80-84	2.9792981406108634E-4
85-89	3.7676715483650497E-4
90-94	3.9235184874403543E-4
95-99	3.061819155466673E-4
100-104	4.4369040706138054E-4
105-109	2.6859914554119873E-4
110-114	2.5393328215615133E-4
115-119	2.3285033664704116E-4
120-124	2.1543508798245234E-4
125-129	1.1917881615244797E-4
130-134	1.4210178217087627E-4
135-139	1.604477853809348E-4
140-144	1.5317478404052297E-4
145-149	1.5707853228175614E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
64-65	1.0
66-67	0.0
68-69	0.0
70-71	1.0
72-73	1.0
74-75	0.0
76-77	5.0
78-79	3.0
80-81	10.0
82-83	10.0
84-85	15.0
86-87	11.0
88-89	10.0
90-91	20.0
92-93	24.0
94-95	21.0
96-97	26.0
98-99	24.0
100-101	45.0
102-103	44.0
104-105	53.0
106-107	41.0
108-109	66.0
110-111	56.0
112-113	54.0
114-115	63.0
116-117	86.0
118-119	111.0
120-121	126.0
122-123	110.0
124-125	169.0
126-127	155.0
128-129	227.0
130-131	278.0
132-133	363.0
134-135	528.0
136-137	856.0
138-139	2428.0
140-141	5325.0
142-143	8511.0
144-145	67619.0
146-147	701370.0
148-149	1275195.0
150-151	1.9753179E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	52.792210830345866
#Duplication Level	Percentage of total
1	40.77506481714151
2	11.559724059127417
3	6.687759177657747
4	4.624362935983654
5	3.3386417544711176
6	2.7549872219751355
7	2.1616021894577204
8	1.826208004302653
9	1.5464114833421079
>10	16.847982219443175
>50	3.9694907389017002
>100	3.40852676649042
>500	0.2816812530705859
>1k	0.21755737863500124
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.8334124756385318E-5	0.0	4.5835311890963294E-6	1.4208946686198622E-4	2.2917655945481648E-5
2	0.0	1.1917181091650456E-4	0.0	9.167062378192659E-6	0.0016546547592637749	4.5835311890963296E-5
3	0.0	1.558400604292752E-4	0.0	9.167062378192659E-6	0.002676782214432256	8.250356140373393E-5
4	1.8334124756385318E-5	1.695906539965642E-4	0.0	1.3750593567288987E-5	0.004079342758295733	9.167062378192659E-5
5	3.2084718323674305E-5	1.695906539965642E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.00520689143081343	9.625415497102292E-5
6	6.416943664734861E-5	1.695906539965642E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.0064123601335457645	1.0083768616011924E-4
7	6.875296783644493E-5	2.0167537232023848E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.007526158212496172	1.0083768616011924E-4
8	1.0083768616011924E-4	2.0167537232023848E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.00977667202634247	1.1458827972740824E-4
9	1.1458827972740824E-4	2.0625890350933483E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.01299889445227719	1.1458827972740824E-4
10-11	1.5813182602382334E-4	2.1542596588752748E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.017224910208624006	1.5125652924017887E-4
12-13	2.3605185623846097E-4	2.1542596588752748E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.020820690426470077	1.7875771637475686E-4
14-15	2.452189186166536E-4	2.2459302826572015E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.025218588602408006	2.016753723202385E-4
16-17	2.818871681294242E-4	2.5438598099484627E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.029715032698911504	2.1771773148207562E-4
18-19	3.0251305848035773E-4	2.704283401566834E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.033507904757888715	2.3605185623846097E-4
20-21	3.34597776804032E-4	3.0022129288580956E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.0369088849001982	2.452189186166536E-4
22-23	4.079342758295733E-4	3.070965896694541E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.04051841571161155	2.5667774658939444E-4
24-25	4.7210371247692195E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	1.8334124756385318E-5	0.04458171611074545	2.658448089675871E-4
26-27	5.362731491242705E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	2.2917655945481648E-5	0.04880544010149772	2.773036369403279E-4
28-29	5.683578674479449E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	2.2917655945481648E-5	0.05342334777451227	2.933459961021651E-4
30-31	6.073178825552637E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	2.7501187134577975E-5	0.05796791894850128	2.979295272912614E-4
32-33	6.669037880135159E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	2.7501187134577975E-5	0.061724122757965724	3.3230601120948385E-4
34-35	7.081555687153829E-4	3.1626365204764673E-4	0.0	3.8960015107318804E-5	0.06562470779988669	3.4147307358767655E-4
36-37	7.2419792787722E-4	3.2313894883129126E-4	0.0	5.041884308005962E-5	0.06946570693634943	3.437648391822247E-4
38-39	7.379485214445091E-4	3.300142456149357E-4	0.0	5.041884308005962E-5	0.07387048040907099	3.437648391822247E-4
40-41	7.723250053627314E-4	3.3230601120948385E-4	0.0	5.729413986370411E-5	0.07734250528481146	3.48348370371321E-4
42-43	7.79200302146376E-4	3.368895423985802E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.08080765486376829	3.552236671549655E-4
44-45	7.998261924973094E-4	3.437648391822247E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.08477011757674206	3.5751543274951367E-4
46-47	8.296191452264357E-4	3.460566047767729E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.08903280158260166	3.5751543274951367E-4
48-49	8.525368011719172E-4	3.48348370371321E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.09293567839011718	3.7126602631680267E-4
50-51	8.685791603337544E-4	3.5293190156041737E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.09707919058506026	3.804330886949953E-4
52-53	9.212897690083622E-4	3.5293190156041737E-4	0.0	5.958590545825228E-5	0.10128228868546159	3.8501661988409166E-4
54-55	9.694168464938737E-4	3.552236671549655E-4	0.0	6.416943664734861E-5	0.10467639353098743	3.89600151073188E-4
56-57	0.0010083768616011924	3.6209896393861E-4	0.0	6.416943664734861E-5	0.10861593858801571	3.918919166677362E-4
58-59	0.0010358780487357705	3.7355779191135084E-4	0.0	7.792003021463761E-5	0.11260819425371862	3.964754478568325E-4
60-61	0.0010656710014648966	3.8501661988409166E-4	0.0	8.250356140373393E-5	0.11599313203686626	4.102260414241215E-4
62-63	0.001100047485383119	3.918919166677362E-4	0.0	8.47953269982821E-5	0.11937119452323025	4.1251780701866966E-4
64-65	0.0011229651413286006	4.010589790459288E-4	0.0	8.937885818737843E-5	0.12383555390141007	4.1710133820776595E-4
66-67	0.0011458827972740822	4.2626840058595866E-4	0.0	9.167062378192659E-5	0.12783239309830208	4.216848693968623E-4
68-69	0.0011871345779759493	4.400189941532476E-4	0.0	9.167062378192659E-5	0.13096982019723852	4.3543546296415125E-4
70-71	0.0012604710770014907	4.606448845041811E-4	0.0	9.854592056557108E-5	0.13373827303545271	4.468942909368921E-4
72-73	0.0013246405136488391	4.6293665009872924E-4	0.0	1.1229651413286008E-4	0.1366877753556362	4.5376958772053665E-4
74-75	0.0013658922943507062	4.7439547807147007E-4	0.0	1.237553421056009E-4	0.14006125431081107	4.5835311890963295E-4
76-77	0.001416311137430766	4.904378372333072E-4	0.0	1.306306388892454E-4	0.14262574001111047	4.5835311890963295E-4
78-79	0.0014736052772944697	4.950213684224036E-4	0.0	1.443812324565344E-4	0.14499313387027873	4.6293665009872924E-4
80-81	0.001503398230023596	4.950213684224036E-4	0.0	1.5125652924017887E-4	0.14769283374065648	4.6293665009872924E-4
82-83	0.001528607651563626	5.041884308005962E-4	0.0	1.5125652924017887E-4	0.15024586061298312	4.6293665009872924E-4
84-85	0.0015744429634545892	5.133554931787889E-4	0.0	1.5813182602382336E-4	0.1524803320676676	4.6293665009872924E-4
86-87	0.0016798641808038048	5.133554931787889E-4	0.0	1.6500712280746786E-4	0.1545314622747882	4.675201812878256E-4
88-89	0.0017371583206675088	5.179390243678852E-4	2.2917655945481647E-6	1.6500712280746786E-4	0.15664447015296162	4.675201812878256E-4
90-91	0.0017669512733966349	5.225225555569816E-4	4.5835311890963294E-6	1.6500712280746786E-4	0.15925479116515195	4.7210371247692195E-4
92-93	0.0018013277573148574	5.225225555569816E-4	4.5835311890963294E-6	1.6500712280746786E-4	0.1618651121773423	4.8356254044966277E-4
94-95	0.0018540383659894652	5.293978523406261E-4	4.5835311890963294E-6	1.6500712280746786E-4	0.1646794003274475	4.904378372333072E-4
96-97	0.001950292520960488	5.408566803133669E-4	4.5835311890963294E-6	1.695906539965642E-4	0.1669986671091302	4.904378372333072E-4
98-99	0.002037379613553318	5.43148445907915E-4	4.5835311890963294E-6	1.695906539965642E-4	0.1689260419741452	4.904378372333072E-4
100-101	0.0020923819878224744	5.454402115024632E-4	4.5835311890963294E-6	1.695906539965642E-4	0.17109634399218232	4.904378372333072E-4
102-103	0.002145092596497082	5.454402115024632E-4	4.5835311890963294E-6	1.695906539965642E-4	0.17290225528068628	4.904378372333072E-4
104-105	0.0021794690804153045	5.454402115024632E-4	4.5835311890963294E-6	1.7188241959111234E-4	0.17479067013059396	4.904378372333072E-4
106-107	0.002243638517062653	5.477319770970114E-4	4.5835311890963294E-6	1.741741851856605E-4	0.17648886843615416	4.904378372333072E-4
108-109	0.0023490597344118687	5.546072738806558E-4	4.5835311890963294E-6	1.741741851856605E-4	0.17804497727485236	5.087719619896925E-4
110-111	0.002452189186166536	5.591908050697522E-4	4.5835311890963294E-6	1.7646595078020869E-4	0.17963775436306334	5.087719619896925E-4
112-113	0.0025232339195975294	5.614825706643004E-4	9.167062378192659E-6	1.8563301315840133E-4	0.18128095029435437	5.133554931787889E-4
114-115	0.002564485700299396	5.660661018533966E-4	9.167062378192659E-6	1.879247787529495E-4	0.18302498391180552	5.133554931787889E-4
116-117	0.002603445715406715	5.70649633042493E-4	9.167062378192659E-6	1.9709184113114216E-4	0.18477818459163486	5.133554931787889E-4
118-119	0.0026676151520540637	5.775249298261375E-4	9.167062378192659E-6	2.0396713791478665E-4	0.18629991694641485	5.133554931787889E-4
120-121	0.002727201057512316	5.821084610152338E-4	9.167062378192659E-6	2.0625890350933483E-4	0.1877689386925202	5.133554931787889E-4
122-123	0.0029197093674543616	5.84400226609782E-4	9.167062378192659E-6	2.0625890350933483E-4	0.18918754159554554	5.133554931787889E-4
124-125	0.003052631771938155	5.866919922043302E-4	1.1458827972740822E-5	2.0625890350933483E-4	0.19081469516767474	5.133554931787889E-4
126-127	0.0030686741310999924	5.958590545825228E-4	1.3750593567288987E-5	2.0625890350933483E-4	0.1924693499269385	5.133554931787889E-4
128-129	0.003109925911801859	6.027343513661672E-4	1.3750593567288987E-5	2.1313420029297933E-4	0.1938237833933165	5.133554931787889E-4
130-131	0.00317180358285466	6.141931793389082E-4	1.3750593567288987E-5	2.2917655945481647E-4	0.19516904979731625	5.133554931787889E-4
132-133	0.00325889067544749	6.187767105280044E-4	1.3750593567288987E-5	2.4292715302210544E-4	0.196418062046345	5.133554931787889E-4
134-135	0.0033918130799312834	6.187767105280044E-4	1.3750593567288987E-5	2.4292715302210544E-4	0.19751581776613358	5.133554931787889E-4
136-137	0.0035270272500096253	6.256520073116489E-4	1.3750593567288987E-5	2.4292715302210544E-4	0.1986777429225695	5.133554931787889E-4
138-139	0.0035339025467932697	6.439861320680343E-4	1.3750593567288987E-5	2.4292715302210544E-4	0.19976403981438534	5.133554931787889E-4
>>END_MODULE
