##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.4d.R.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	23004401
Total Bases	3.4 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	23-150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.35019373032143	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.838447217121626	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.96946558182497	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.97710438102692	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.89151975745858	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.84173002374632	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.79884309963124	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.936845562725146	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.912453621374446	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.92636049076001	35.2	34.0	37.0	31.6	39.0
15-19	34.924482606610795	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
20-24	34.92068954910293	35.0	34.0	37.0	31.4	39.0
25-29	34.90879450018257	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.890861052668185	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.88021113352228	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.82220323938029	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.736933812661924	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.713017648797624	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.6962922745214	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.68564904105301	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.66124467493175	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.65328413619635	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.63115728064124	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.617292417184615	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
85-89	34.602048319106395	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
90-94	34.58458557916942	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
95-99	34.565158441586945	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.5271399429542	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.50821215164609	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.46722297214355	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.445396535315226	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.420041012482145	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.39244167949904	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.356815877180836	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.33144846573016	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.29368880141194	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.31957687775194	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	35.0766037551342	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	7.0
22	158.0
23	2254.0
24	16229.0
25	70128.0
26	182751.0
27	330933.0
28	481703.0
29	627167.0
30	785140.0
31	996538.0
32	1300527.0
33	1775730.0
34	2615986.0
35	4404388.0
36	8476481.0
37	938277.0
38	4.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.32660989521092	11.22847319519426	16.015844098700942	37.429072810893885
2	23.200198570837692	12.517670000741163	35.461913022234675	28.82021840618647
3	21.697245243789283	17.28232800732208	28.163487890031448	32.85693885885719
4	26.450093416992765	24.498717200811324	22.261595400528073	26.789593981667835
5	26.258033854351755	30.295971169650425	24.347448956326513	19.098546019671307
6	19.578734951179076	36.422555585834814	25.48440238133812	18.514307081647985
7	16.166543689882545	25.25000715082396	40.036928680681235	18.546520478612255
8	18.515588315355718	24.69045631638474	31.41059954497294	25.383355823286607
9	19.705039507929996	23.289806384169896	32.52949907037224	24.475655037527872
10-14	20.226716631214554	29.33645669427841	27.15042629041296	23.286400384094073
15-19	20.440529673811685	27.934391989957312	27.939749234860322	23.68532910137068
20-24	20.5731261876554	28.11631517819363	27.694199507762836	23.61635912638814
25-29	20.57989197840347	28.256703789162994	27.549723713267877	23.613680519165662
30-34	20.522695189197297	28.040358127508537	27.59653063443596	23.84041604885821
35-39	20.617022526317193	27.954369107877824	27.648286002073213	23.780322363731766
40-44	20.626044331030382	28.039130285434478	27.580565977004024	23.754259406531116
45-49	20.716430643663635	27.829438095322633	27.5382453907486	23.915885870265132
50-54	20.838755611565126	27.79515716911941	27.632345153509373	23.733742065806087
55-59	20.833042807837774	27.820953585530912	27.569421393190453	23.776582213440868
60-64	20.793449236420503	27.753301253131003	27.529318861031538	23.92393064941696
65-69	20.876264869959993	27.669015948152747	27.62307319674722	23.831645985140035
70-74	20.99736428828498	27.60145991255005	27.598419616252535	23.802756182912432
75-79	21.01575113882443	27.508580333543147	27.607746175298537	23.867922352333885
80-84	21.08561530161362	27.491189549737538	27.553621276175953	23.86957387247289
85-89	21.047469109545425	27.50778476509261	27.640509569632115	23.804236555729855
90-94	21.041519304364183	27.42712281635617	27.574843386071223	23.956514493208424
95-99	21.125798630670076	27.347210807980677	27.67759718693621	23.84939337441304
100-104	21.18148750764493	27.392969538187163	27.547490465756823	23.878052488411083
105-109	21.135691513188235	27.25264692252519	27.649196474030845	23.96246509025573
110-114	21.20314476479357	27.215534381897776	27.71516462835487	23.86615622495378
115-119	21.234683613679206	27.250043521050376	27.69322661698493	23.822046248285492
120-124	21.203696650075628	27.151731979202125	27.70443534123588	23.940136029486368
125-129	21.249642324933188	27.07344924171842	27.76356573682785	23.913342696520534
130-134	21.313565211822286	27.17669665449729	27.667188299119843	23.84254983456058
135-139	21.311643063413598	27.042989738761076	27.766540231262336	23.878826966562983
140-144	21.335199948662805	26.95255871974713	27.92014626857005	23.79209506302001
145-149	20.969228020722618	27.23094764265405	27.9234375683819	23.87638676824143
150	21.08666219266682	25.847061574691445	28.416386638570668	24.649889594071066
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.5
8	2.5
9	2.0
10	3.5
11	10.0
12	13.0
13	14.5
14	33.0
15	80.5
16	169.0
17	361.5
18	688.5
19	1268.5
20	2342.5
21	4033.0
22	6312.0
23	9690.0
24	15072.0
25	23290.0
26	34041.0
27	47489.5
28	64321.5
29	88777.5
30	119302.5
31	150400.0
32	182604.5
33	219025.0
34	256755.5
35	301478.5
36	370118.5
37	463615.0
38	576290.5
39	716545.0
40	879882.0
41	1042158.0
42	1203690.5
43	1367617.0
44	1502313.5
45	1580575.0
46	1597436.0
47	1557657.0
48	1474271.0
49	1350563.0
50	1190756.0
51	1021913.5
52	851325.0
53	683098.5
54	532061.0
55	403044.5
56	302338.5
57	226004.0
58	169292.5
59	125358.5
60	87994.0
61	61188.0
62	43824.0
63	29230.0
64	18538.0
65	13485.0
66	11659.0
67	9120.0
68	5142.0
69	2813.5
70	2598.0
71	1929.5
72	833.5
73	254.0
74	113.0
75	82.5
76	52.5
77	35.5
78	20.0
79	2.5
80	0.5
81	0.5
82	1.5
83	1.0
84	0.5
85	0.5
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	6.955190878475819E-5
3	2.608196579428432E-5
4	9.128688027999512E-5
5	1.3910381756951639E-4
6	1.0432786317713728E-4
7	2.5647266364379584E-4
8	2.3908468644760628E-4
9	1.3910381756951639E-4
10-14	1.5909999134513435E-4
15-19	1.7040217652265755E-4
20-24	1.8605135761675653E-4
25-29	3.225469910104154E-4
30-34	4.425240388795187E-4
35-39	5.425049121037715E-4
40-44	3.4862895793848133E-4
45-49	2.008311453461077E-4
50-54	3.399349689624594E-4
55-59	4.694754047051868E-4
60-64	7.86806002329989E-4
65-69	5.13814748482899E-4
70-74	2.695136723155747E-4
75-79	4.4687113049484675E-4
80-84	2.1734991903324285E-4
85-89	2.912491649734295E-4
90-94	3.8079785270351304E-4
95-99	5.668508656669081E-4
100-104	3.8079968350851506E-4
105-109	4.6861123287902993E-4
110-114	3.086414037504869E-4
115-119	4.0601803937279513E-4
120-124	3.138621186671982E-4
125-129	4.129803533160818E-4
130-134	4.1733436179590487E-4
135-139	3.1562161625151876E-4
140-144	3.096365199506203E-4
145-149	3.683919233825562E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
20-24	1.0
25-29	0.0
30-34	0.0
35-39	0.0
40-44	0.0
45-49	0.0
50-54	0.0
55-59	0.0
60-64	0.0
65-69	0.0
70-74	3.0
75-79	9.0
80-84	21.0
85-89	29.0
90-94	29.0
95-99	61.0
100-104	74.0
105-109	91.0
110-114	118.0
115-119	164.0
120-124	182.0
125-129	279.0
130-134	557.0
135-139	2809.0
140-144	24360.0
145-149	1889337.0
150-151	2.1086277E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	50.916095437113576
#Duplication Level	Percentage of total
1	38.697405725767396
2	11.50592446973217
3	6.804657117386601
4	4.8531833330671725
5	3.5730261412827016
6	2.7291519408932907
7	2.2941703467227694
8	1.8847074458943716
9	1.5856451533579712
>10	17.772920830271723
>50	4.052149377608886
>100	3.6888916257140467
>500	0.30575917703814426
>1k	0.2524073152628466
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	4.7816937289521256E-5	0.0	4.346994299047386E-6	1.3910381756951636E-4	1.7387977196189545E-5
2	8.693988598094772E-6	1.2171584037332683E-4	0.0	8.693988598094772E-6	0.0016127348849465804	2.608196579428432E-5
3	1.7387977196189545E-5	1.3475682327046898E-4	0.0	1.304098289714216E-5	0.002821199300081754	4.7816937289521256E-5
4	3.0428960093331708E-5	1.956147434571324E-4	0.0	1.7387977196189545E-5	0.004020969726618833	5.216393158856864E-5
5	3.477595439237909E-5	1.956147434571324E-4	0.0	1.7387977196189545E-5	0.005168576221567343	6.0857920186663416E-5
6	4.346994299047387E-5	1.956147434571324E-4	0.0	1.7387977196189545E-5	0.006385734625300611	6.52049144857108E-5
7	4.346994299047387E-5	2.0865572635427455E-4	4.346994299047386E-6	1.7387977196189545E-5	0.007489871177258647	6.955190878475818E-5
8	5.651092588761603E-5	2.1300272065332193E-4	4.346994299047386E-6	1.7387977196189545E-5	0.009480794566222351	7.389890308380558E-5
9	6.0857920186663416E-5	2.1300272065332193E-4	4.346994299047386E-6	1.7387977196189545E-5	0.012606283467237422	7.824589738285296E-5
10-11	8.693988598094773E-5	2.1517621780284564E-4	4.346994299047386E-6	2.1734971495236934E-5	0.017003268200723853	1.260628346723742E-4
12-13	1.1954234322380313E-4	2.1952321210189302E-4	4.346994299047386E-6	2.1734971495236934E-5	0.02063735543472747	1.4779780616761115E-4
14-15	1.4997130331713483E-4	2.303906978495115E-4	4.346994299047386E-6	2.3908468644760628E-5	0.025003911208120566	1.8257376055999023E-4
16-17	1.8040026341046656E-4	2.499521721952248E-4	4.346994299047386E-6	2.608196579428432E-5	0.029394375450158428	1.9126774915808502E-4
18-19	2.0865572635427455E-4	2.6516665224189055E-4	4.346994299047386E-6	2.608196579428432E-5	0.033067585632853475	1.9344124630760873E-4
20-21	2.5647266364379584E-4	2.8690162373712754E-4	4.346994299047386E-6	2.608196579428432E-5	0.03670384636400661	2.0430873205522717E-4
22-23	3.281980695780777E-4	2.912486180361749E-4	4.346994299047386E-6	2.608196579428432E-5	0.04068351964478449	2.2169670925141673E-4
24-25	3.847089954656937E-4	2.955956123352223E-4	4.346994299047386E-6	2.8255462943808013E-5	0.04508050437827092	2.2387020640094043E-4
26-27	4.651283899980704E-4	2.955956123352223E-4	4.346994299047386E-6	3.0428960093331708E-5	0.0492058019680669	2.4343168074665366E-4
28-29	4.977308472409258E-4	2.955956123352223E-4	4.346994299047386E-6	3.0428960093331708E-5	0.05373971702197332	2.499521721952247E-4
30-31	5.368537959323523E-4	2.955956123352223E-4	4.346994299047386E-6	3.694945154190279E-5	0.058199733172795934	2.608196579428432E-4
32-33	5.67282756025684E-4	2.955956123352223E-4	4.346994299047386E-6	3.912294869142648E-5	0.06220766191651762	2.9776910948474595E-4
34-35	6.064057047171104E-4	2.9994260663426966E-4	4.346994299047386E-6	4.346994299047387E-5	0.06583305516192314	3.26024572428554E-4
36-37	6.216201847637764E-4	2.9994260663426966E-4	4.346994299047386E-6	4.346994299047387E-5	0.06957581725340295	3.26024572428554E-4
38-39	6.346611676609185E-4	3.086365952323645E-4	4.346994299047386E-6	4.346994299047387E-5	0.07410103831871129	3.3471856102664877E-4
40-41	6.52049144857108E-4	3.086365952323645E-4	4.346994299047386E-6	4.7816937289521256E-5	0.07741779496888443	3.4341254962474353E-4
42-43	6.607431334552028E-4	3.1515708668093553E-4	4.346994299047386E-6	4.7816937289521256E-5	0.08061283577868425	3.4775954392379094E-4
44-45	6.716106192028212E-4	3.325450638771251E-4	4.346994299047386E-6	5.651092588761603E-5	0.08468596943689166	3.4775954392379094E-4
46-47	7.020395792961529E-4	3.3471856102664877E-4	4.346994299047386E-6	5.651092588761603E-5	0.08857435583738954	3.4775954392379094E-4
48-49	7.172540593428188E-4	3.4341254962474353E-4	4.346994299047386E-6	5.651092588761603E-5	0.09228668896877601	3.54280035372362E-4
50-51	7.36815533688532E-4	3.54280035372362E-4	4.346994299047386E-6	5.651092588761603E-5	0.09627940323245104	3.608005268209331E-4
52-53	7.954999567256717E-4	3.564535325218857E-4	4.346994299047386E-6	5.651092588761603E-5	0.10066769397733938	3.608005268209331E-4
54-55	8.759193512580484E-4	3.608005268209331E-4	4.346994299047386E-6	5.651092588761603E-5	0.10414746291372681	3.6297402397045676E-4
56-57	9.21562791398046E-4	3.694945154190278E-4	4.346994299047386E-6	6.0857920186663416E-5	0.10832275093796183	3.7818850401712264E-4
58-59	9.628592372389962E-4	3.847089954656937E-4	6.52049144857108E-6	6.0857920186663416E-5	0.11216332040117019	3.847089954656937E-4
60-61	9.954616944818516E-4	3.912294869142648E-4	8.693988598094772E-6	6.0857920186663416E-5	0.11550181202283859	3.912294869142648E-4
62-63	0.0010302376488742306	3.999234755123596E-4	1.304098289714216E-5	6.0857920186663416E-5	0.11903809188511363	3.934029840637885E-4
64-65	0.0010454521289208966	3.999234755123596E-4	1.304098289714216E-5	6.737841163523449E-5	0.12384369408271054	3.999234755123596E-4
66-67	0.0010758810890142282	4.194849498580728E-4	1.304098289714216E-5	6.955190878475818E-5	0.12790596025517031	4.0427046981140693E-4
68-69	0.0011041365519580363	4.4121992135330975E-4	1.5214480046665852E-5	6.955190878475818E-5	0.13072715955525205	4.0861746411045434E-4
70-71	0.0011432595006494626	4.5643440139997557E-4	1.7387977196189545E-5	7.389890308380558E-5	0.1335548793467824	4.0861746411045434E-4
72-73	0.0011780354550418417	4.629548928485467E-4	1.7387977196189545E-5	7.607240023332927E-5	0.13643258957275176	4.1513795555902545E-4
74-75	0.0012062909179856498	4.7164888144664145E-4	1.7387977196189545E-5	7.824589738285296E-5	0.13969935578848586	4.216584470075965E-4
76-77	0.0012367198780789815	4.825163671942599E-4	1.7387977196189545E-5	8.476638883142404E-5	0.14221191849333525	4.216584470075965E-4
78-79	0.0012867103125180266	4.846898643437836E-4	1.956147434571324E-5	1.1736884607427944E-4	0.14476795114117513	4.2383194415712016E-4
80-81	0.0013127922783123108	4.912103557923547E-4	2.1734971495236934E-5	1.1736884607427944E-4	0.1474543936179864	4.32525932755215E-4
82-83	0.001354088724153261	4.95557350091402E-4	2.1734971495236934E-5	1.1954234322380313E-4	0.1500060792715272	4.346994299047387E-4
84-85	0.0014432021072837324	4.977308472409257E-4	2.1734971495236934E-5	1.238893375228505E-4	0.15232954772436805	4.346994299047387E-4
86-87	0.0014997130331713484	5.129453272875917E-4	2.1734971495236934E-5	1.260628346723742E-4	0.1544356664622565	4.346994299047387E-4
88-89	0.0015301419932646802	5.129453272875917E-4	2.1734971495236934E-5	1.260628346723742E-4	0.1566200310975278	4.368729270542624E-4
90-91	0.0015714384391056304	5.129453272875917E-4	2.1734971495236934E-5	1.260628346723742E-4	0.1592782181113953	4.3904642420378604E-4
92-93	0.001608387890647533	5.17292321586639E-4	2.1734971495236934E-5	1.260628346723742E-4	0.16199726304544942	4.520874071009282E-4
94-95	0.0016648988165351491	5.17292321586639E-4	2.1734971495236934E-5	1.260628346723742E-4	0.16484889130562452	4.520874071009282E-4
96-97	0.0017192362452732415	5.17292321586639E-4	2.1734971495236934E-5	1.260628346723742E-4	0.16739405646771677	4.520874071009282E-4
98-99	0.001821390611300855	5.281598073342574E-4	2.1734971495236934E-5	1.260628346723742E-4	0.1694349702911195	4.542609042504519E-4
100-101	0.0019039835029827554	5.303333044837812E-4	2.1734971495236934E-5	1.260628346723742E-4	0.17171062180667082	4.60781395699023E-4
102-103	0.0019365859602256108	5.303333044837812E-4	2.1734971495236934E-5	1.260628346723742E-4	0.17352983892082216	4.60781395699023E-4
104-105	0.001964841423169419	5.346802987828286E-4	2.1734971495236934E-5	1.260628346723742E-4	0.1751751762630116	4.629548928485467E-4
106-107	0.002008311366159893	5.433742873809233E-4	2.1734971495236934E-5	1.260628346723742E-4	0.17686833054249054	4.651283899980704E-4
108-109	0.002043087320552272	5.433742873809233E-4	2.1734971495236934E-5	1.304098289714216E-4	0.17845715695879238	4.651283899980704E-4
110-111	0.002086557263542746	5.564152702780655E-4	2.1734971495236934E-5	1.304098289714216E-4	0.179846021637338	4.6730188714759404E-4
112-113	0.0021734971495236933	5.651092588761603E-4	2.1734971495236934E-5	1.3910381756951636E-4	0.18138485761920076	4.6947538429711774E-4
114-115	0.0022430490583084514	5.694562531752077E-4	2.1734971495236934E-5	1.4779780616761115E-4	0.18300845998989498	4.6947538429711774E-4
116-117	0.002282172006999878	5.824972360723498E-4	2.1734971495236934E-5	1.608387890647533E-4	0.18472552273801868	4.6947538429711774E-4
118-119	0.0023212949556913045	5.998852132685393E-4	2.1734971495236934E-5	1.63012286214277E-4	0.18619045981679766	4.6947538429711774E-4
120-121	0.002432143310317013	6.107526990161579E-4	2.1734971495236934E-5	1.651857833638007E-4	0.18760323296398806	4.6947538429711774E-4
122-123	0.00255385915069034	6.129261961656815E-4	2.1734971495236934E-5	1.651857833638007E-4	0.18905512905986988	4.7382237859616515E-4
124-125	0.002651666522418906	6.129261961656815E-4	2.1734971495236934E-5	1.651857833638007E-4	0.1907526303336479	4.7382237859616515E-4
126-127	0.0026973099625589034	6.216201847637762E-4	2.1734971495236934E-5	1.651857833638007E-4	0.19239796767583733	4.7382237859616515E-4
128-129	0.002751647391296996	6.281406762123473E-4	2.1734971495236934E-5	1.651857833638007E-4	0.1937433624113925	4.7382237859616515E-4
130-131	0.002812505311483659	6.303141733618711E-4	2.1734971495236934E-5	1.651857833638007E-4	0.19503876671250864	4.803428700447362E-4
132-133	0.0028798837231188935	6.303141733618711E-4	2.1734971495236934E-5	1.651857833638007E-4	0.19623201664759712	4.868633614933073E-4
134-135	0.002955956123352223	6.324876705113948E-4	2.1734971495236934E-5	1.651857833638007E-4	0.19730572423946183	4.868633614933073E-4
136-137	0.003053763495080789	6.477021505580606E-4	2.1734971495236934E-5	1.6735928051332438E-4	0.1983946463113732	4.868633614933073E-4
138-139	0.0030733249694265023	6.629166306047265E-4	2.1734971495236934E-5	1.695327776628481E-4	0.1993966284973036	4.912103557923547E-4
>>END_MODULE
