##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.4d.S.1.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24210574
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	73-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.53180779604812	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.90010794457	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	35.01756183062822	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.99631603116886	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.85506510502395	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.828535250754484	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.8115114081971	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.98576051934993	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.97080849879892	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.95244003715071	35.2	34.0	37.4	31.6	39.0
15-19	34.95208102046651	35.0	34.0	37.0	31.8	39.0
20-24	34.963186217724534	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
25-29	34.95543506733876	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
30-34	34.9444082655785	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
35-39	34.93916284677926	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.87908065294115	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.786279879196584	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.752642783273124	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.74325357176579	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.717299647666344	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.700513081598146	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.67560204344114	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.65847494863503	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.63112478474894	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
85-89	34.61302886547398	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
90-94	34.589211705857714	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.55441908753132	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.52010141905034	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.46441736225858	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.4360114703423	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.38806495920892	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.353287941721135	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.30377609006801	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.25469833396712	35.0	34.0	37.0	29.6	39.0
135-139	34.20485550850431	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.18096301966755	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.18622911507756	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	35.06239018407453	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	13.0
22	234.0
23	2928.0
24	20006.0
25	80190.0
26	202083.0
27	365628.0
28	534211.0
29	697027.0
30	872272.0
31	1098234.0
32	1409042.0
33	1860602.0
34	2591718.0
35	4080859.0
36	8887965.0
37	1507556.0
38	6.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.21805389661559	10.632680579981292	15.964817686685166	38.18444783671796
2	23.549463553956638	11.709811713021057	35.112392976894405	29.628331756127896
3	22.031593735609327	16.580253268832003	27.854569570244124	33.53358342531455
4	27.118585681736757	23.749126517591783	21.967581752129504	27.16470604854195
5	27.296600773117056	29.738010233879724	23.918637335338406	19.046751657664814
6	20.259721431417	35.98620932068678	25.005147548249102	18.748921699647116
7	16.679024240822883	25.085587783460934	39.5237104130299	18.711677562686273
8	19.172390685483695	24.18234626105623	30.942654182965	25.702608870495077
9	20.063329421539734	22.830346508472257	32.24291329547766	24.86341077451035
10-14	20.86447553150362	28.749685353870426	26.714979085506567	23.670860029119396
15-19	21.191604710194024	27.450786618011563	27.396373078931074	23.961235592863343
20-24	21.188028864928256	27.546331741541085	27.20443670096337	24.06120269256729
25-29	21.1435392646774	27.766868051141664	26.945564268219464	24.144028415961472
30-34	21.106165252514224	27.641607758391558	27.05636206686397	24.195864922230257
35-39	21.342446015268536	27.37398244005287	27.015239794673622	24.268331750004972
40-44	21.421034919702194	27.463037257364707	26.92769570645651	24.188232116476588
45-49	21.637086009340052	27.38962524264923	26.83407049023932	24.139218257771393
50-54	21.640980767828484	27.532622554116458	26.767900500327062	24.058496177728
55-59	21.578402867221964	27.47929294896469	26.894545182987546	24.0477590008258
60-64	21.782418813723503	27.36311564997657	26.652702816200406	24.201762720099516
65-69	21.69987964887687	27.41821595634765	26.803573366338085	24.07833102843739
70-74	21.97141392535534	27.23879569644682	26.75168695695073	24.038103421247108
75-79	21.814341336539655	27.207553084910867	26.731111143695678	24.246994434853796
80-84	22.086453596293328	27.16636644827067	26.684312519093485	24.062867436342522
85-89	21.939537873321665	27.191487247614614	26.766215255808373	24.10275962325535
90-94	21.939688034138154	26.985569222668698	26.720212790713845	24.35452995247931
95-99	22.14306204342614	27.02707672656846	26.817598540194528	24.012262689810875
100-104	22.12111323486044	26.854615315642615	26.869817984492073	24.154453465004874
105-109	22.214836427493008	26.818092265165177	26.823204173200466	24.14386713414135
110-114	22.161309728855695	26.856149350089474	26.80166193513586	24.180878985918962
115-119	22.256416289147182	27.016829721928996	26.719649093994548	24.007104894929274
120-124	22.153531404479114	26.894761674852568	26.799664466203854	24.152042454464464
125-129	22.462049197129513	26.854467235096656	26.712460801241022	23.97102276653281
130-134	22.24336479869079	27.02050931626238	26.627193724980536	24.108932160066292
135-139	22.365630147687448	26.832506607831935	26.68763345615373	24.11422978832688
140-144	22.30406166048277	26.69161026510432	26.91987237488759	24.08445569952532
145-149	21.83547939163118	26.878536662913405	27.169930346608428	24.11605359884699
150	21.734926270202877	25.51496407876897	27.752013362095674	24.998096288932484
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.5
9	1.5
10	2.5
11	4.5
12	15.0
13	20.5
14	30.5
15	57.0
16	118.0
17	270.0
18	603.0
19	1068.0
20	1801.0
21	2925.0
22	4698.0
23	7434.0
24	11798.5
25	17850.0
26	25154.5
27	35220.0
28	52631.0
29	76830.0
30	104493.5
31	133043.0
32	163030.5
33	197827.0
34	233964.5
35	280729.0
36	347927.5
37	424202.0
38	507432.0
39	620351.0
40	770479.5
41	935942.5
42	1100203.0
43	1260821.0
44	1403358.0
45	1503374.5
46	1561460.0
47	1572056.0
48	1525607.5
49	1459219.5
50	1358214.5
51	1210498.0
52	1034780.0
53	870270.0
54	721092.5
55	592338.0
56	498467.5
57	410824.0
58	338744.0
59	272358.5
60	206573.5
61	143594.0
62	85458.0
63	49146.0
64	30763.0
65	18585.5
66	12154.0
67	5840.0
68	2321.5
69	1312.5
70	1261.5
71	1019.0
72	525.5
73	190.0
74	95.5
75	54.0
76	29.0
77	19.5
78	8.0
79	2.5
80	2.5
81	1.5
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.5
87	1.0
88	0.5
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.2804322607138518E-4
3	6.195639971196057E-5
4	4.956511976956845E-5
5	4.130426647464038E-5
6	7.847810630181672E-5
7	2.106517590206659E-4
8	8.260853294928076E-5
9	1.0739109283406498E-4
10-14	1.75956175181968E-4
15-19	2.288256362695077E-4
20-24	1.833909431474033E-4
25-29	2.816950973570474E-4
30-34	8.054331962554874E-4
35-39	7.525637351679477E-4
40-44	9.7395460347202E-4
45-49	8.880417292047681E-4
50-54	5.394337201588033E-4
55-59	4.1717309139386785E-4
60-64	2.4699951351834945E-4
65-69	3.3539064377407986E-4
70-74	3.5604278289383444E-4
75-79	2.618691100205644E-4
80-84	2.5278238855516337E-4
85-89	3.510870452093797E-4
90-94	4.0560950510766454E-4
95-99	2.949143336643588E-4
100-104	4.3452529845940124E-4
105-109	2.6517746088731585E-4
110-114	2.304827953680393E-4
115-119	2.2800643335021682E-4
120-124	2.114863996937809E-4
125-129	1.321810625447412E-4
130-134	1.7349212500243096E-4
135-139	1.5036883202439055E-4
140-144	1.5703714221824964E-4
145-149	1.3558581628859615E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
72-73	2.0
74-75	1.0
76-77	5.0
78-79	6.0
80-81	12.0
82-83	13.0
84-85	11.0
86-87	7.0
88-89	17.0
90-91	25.0
92-93	18.0
94-95	25.0
96-97	24.0
98-99	37.0
100-101	38.0
102-103	54.0
104-105	48.0
106-107	57.0
108-109	53.0
110-111	71.0
112-113	73.0
114-115	96.0
116-117	77.0
118-119	87.0
120-121	120.0
122-123	134.0
124-125	159.0
126-127	177.0
128-129	229.0
130-131	274.0
132-133	393.0
134-135	541.0
136-137	917.0
138-139	2249.0
140-141	5805.0
142-143	8745.0
144-145	69998.0
146-147	770122.0
148-149	1366476.0
150-151	2.1983378E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	45.059330110987695
#Duplication Level	Percentage of total
1	35.20689840818694
2	9.246647828371449
3	5.3064749630572825
4	3.714252559063232
5	2.7914792355910842
6	2.216424509262415
7	1.8201456427695335
8	1.4964208915798771
9	1.3553313537291638
>10	16.337616978515893
>50	5.173978586007298
>100	10.163587297483645
>500	2.893888455663903
>1k	2.22082853598494
>5k	0.056024754733419245
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	3.717383982717634E-5	0.0	1.2391279942392113E-5	1.941300524308098E-4	4.130426647464038E-5
2	1.2391279942392113E-5	1.2804322607138518E-4	0.0	2.4782559884784227E-5	0.0018752136979486732	4.956511976956845E-5
3	1.2391279942392113E-5	1.528257859561694E-4	0.0	2.8912986532248264E-5	0.0036678188629480656	5.782597306449653E-5
4	6.195639971196057E-5	1.858691991358817E-4	0.0	3.30434131797123E-5	0.005402598054882962	7.021725300688864E-5
5	7.021725300688864E-5	1.858691991358817E-4	0.0	3.30434131797123E-5	0.006534334956288108	7.434767965435268E-5
6	9.499981289167287E-5	1.982604790782738E-4	0.0	3.717383982717634E-5	0.007967593002958129	7.847810630181672E-5
7	1.321736527188492E-4	2.065213323732019E-4	0.0	3.717383982717634E-5	0.009326503369973798	7.847810630181672E-5
8	2.065213323732019E-4	2.1065175902066594E-4	0.0	3.717383982717634E-5	0.012102150077069631	9.086938624420883E-5
9	2.519560254953063E-4	2.1065175902066594E-4	0.0	4.130426647464038E-5	0.015133883236308234	9.086938624420883E-5
10-11	2.788037987038226E-4	2.1065175902066594E-4	0.0	4.5434693122104415E-5	0.026511143436747927	1.1358673280526105E-4
12-13	3.2423849182592696E-4	2.1271697234439795E-4	4.130426647464038E-6	4.956511976956845E-5	0.03539982158209054	1.2184758610018912E-4
14-15	3.490210517107112E-4	2.2097782563932603E-4	4.130426647464038E-6	4.956511976956845E-5	0.0421571995773417	1.321736527188492E-4
16-17	3.6760797162429935E-4	2.395647455529142E-4	4.130426647464038E-6	5.782597306449653E-5	0.04653958225030104	1.3836929269004527E-4
18-19	3.9032531818535156E-4	2.5402123881903833E-4	4.130426647464038E-6	5.782597306449653E-5	0.049957510301077535	1.424997193375093E-4
20-21	6.092379305009456E-4	2.746733720563585E-4	4.130426647464038E-6	5.782597306449653E-5	0.05273315700817337	1.5489099927990142E-4
22-23	8.488026760538598E-4	2.8086901202755457E-4	4.130426647464038E-6	5.782597306449653E-5	0.05537043442257916	1.6934749254602556E-4
24-25	9.148895024132844E-4	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	6.195639971196057E-5	0.058003581410337485	1.7347791919348959E-4
26-27	9.747806888015129E-4	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	7.434767965435268E-5	0.06051488081199562	1.7347791919348959E-4
28-29	0.0010470631551321337	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	7.641289297808469E-5	0.06361270079759365	1.7967355916468565E-4
30-31	0.0012060845810594992	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	9.293459956794084E-5	0.06667128173004078	1.8793441245961373E-4
32-33	0.0012618453408002636	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	1.0532587951033297E-4	0.06946964578369766	2.2097782563932603E-4
34-35	0.0013361930204546161	2.849994386750186E-4	4.130426647464038E-6	1.1771715945272507E-4	0.07271203070195692	2.395647455529142E-4
36-37	0.0013671712203105965	2.8912986532248267E-4	4.130426647464038E-6	1.2597801274765315E-4	0.07571898130131074	2.457603855241103E-4
38-39	0.0013795625002529887	2.932602919699467E-4	4.130426647464038E-6	1.321736527188492E-4	0.07846158459522687	2.4782559884784227E-4
40-41	0.001410540700108969	2.932602919699467E-4	4.130426647464038E-6	1.4456493266124134E-4	0.08081799299760509	2.4782559884784227E-4
42-43	0.001422931980051361	2.932602919699467E-4	4.130426647464038E-6	1.4869535930870536E-4	0.08324048822634275	2.4782559884784227E-4
44-45	0.0014353232599937532	2.932602919699467E-4	4.130426647464038E-6	1.507605726324374E-4	0.0857270050681161	2.4782559884784227E-4
46-47	0.0014621710332022694	2.953255052936787E-4	4.130426647464038E-6	1.528257859561694E-4	0.08953319322375422	2.4782559884784227E-4
48-49	0.0014848883797633217	3.035863585886068E-4	4.130426647464038E-6	1.5489099927990142E-4	0.09223242703787196	2.581516654665024E-4
50-51	0.0015096709396481057	3.118472118835349E-4	4.130426647464038E-6	1.6108663925109749E-4	0.09507622578465096	2.622820921139664E-4
52-53	0.0015344534995328902	3.2217327850219497E-4	4.130426647464038E-6	1.652170658985615E-4	0.09778372045206363	2.6847773208516244E-4
54-55	0.0015716273393600664	3.26303705149659E-4	4.130426647464038E-6	1.652170658985615E-4	0.09996871614857211	2.6847773208516244E-4
56-57	0.0016108663925109748	3.3249934512085506E-4	4.130426647464038E-6	1.6728227922229355E-4	0.1021475162051094	2.6847773208516244E-4
58-59	0.001645975019014419	3.448906250632472E-4	4.130426647464038E-6	1.6934749254602556E-4	0.10413838184918706	2.6847773208516244E-4
60-61	0.00174923568520102	3.5315147835817524E-4	4.130426647464038E-6	1.6934749254602556E-4	0.10618913867965295	2.6847773208516244E-4
62-63	0.0018256485781791047	3.6760797162429935E-4	4.130426647464038E-6	1.7347791919348959E-4	0.10858478613518209	2.6847773208516244E-4
64-65	0.0018483659247401569	3.738036115954954E-4	4.130426647464038E-6	1.8173877248841766E-4	0.11165782356089533	2.6847773208516244E-4
66-67	0.001864887631330013	3.944557448328156E-4	4.130426647464038E-6	1.858691991358817E-4	0.11463792638704064	2.6847773208516244E-4
68-69	0.0018876049778910652	4.1304266474640383E-4	4.130426647464038E-6	1.858691991358817E-4	0.11663085724444204	2.6847773208516244E-4
70-71	0.0019330396710131696	4.233687313650639E-4	4.130426647464038E-6	1.961952657545418E-4	0.11877248346115214	2.7673858538009054E-4
72-73	0.0019557570175742223	4.274991580125279E-4	4.130426647464038E-6	1.982604790782738E-4	0.12049280615982091	2.8706465199875063E-4
74-75	0.001968148297516614	4.2956437133625993E-4	4.130426647464038E-6	2.0032569240200585E-4	0.12242171540418662	2.8912986532248267E-4
76-77	0.001988800430753934	4.2956437133625993E-4	4.130426647464038E-6	2.0652133237320192E-4	0.12401606009010774	2.932602919699467E-4
78-79	0.0020218438439336467	4.3369479798372395E-4	4.130426647464038E-6	2.271734656105221E-4	0.1255876874294678	2.932602919699467E-4
80-81	0.0020445611904946984	4.3369479798372395E-4	4.130426647464038E-6	2.3130389225798611E-4	0.12712627135564816	2.932602919699467E-4
82-83	0.0020714089637032147	4.3782522463118803E-4	4.130426647464038E-6	2.3130389225798611E-4	0.1287268116815405	2.932602919699467E-4
84-85	0.0021478218566813	4.4195565127865205E-4	4.130426647464038E-6	2.3543431890545017E-4	0.13048017779338894	2.932602919699467E-4
86-87	0.002197386976450868	4.460860779261161E-4	4.130426647464038E-6	2.3956474555291422E-4	0.13220050049205773	2.932602919699467E-4
88-89	0.0022097782563932603	4.5228171789731214E-4	4.130426647464038E-6	2.4782559884784227E-4	0.133778323471389	2.932602919699467E-4
90-91	0.0022221695363356525	4.564121445447762E-4	4.130426647464038E-6	2.519560254953063E-4	0.1364692964322118	2.932602919699467E-4
92-93	0.0022366260296017766	4.584773578685082E-4	4.130426647464038E-6	2.519560254953063E-4	0.138571683595771	2.932602919699467E-4
94-95	0.0022799955094001487	4.584773578685082E-4	4.130426647464038E-6	2.5608645214277037E-4	0.14021352818813795	2.932602919699467E-4
96-97	0.0023233649891985213	4.584773578685082E-4	6.195639971196057E-6	2.5608645214277037E-4	0.1416736340080165	2.953255052936787E-4
98-99	0.002405973522147802	4.688034244871683E-4	8.260853294928076E-6	2.5608645214277037E-4	0.14300569660182366	2.973907186174107E-4
100-101	0.002525755894924259	4.7086863781090033E-4	8.260853294928076E-6	2.643473054376984E-4	0.14446373720837846	2.973907186174107E-4
102-103	0.0025484732414853112	4.7086863781090033E-4	8.260853294928076E-6	2.643473054376984E-4	0.14557069154989882	2.973907186174107E-4
104-105	0.0025670601613989	4.7086863781090033E-4	8.260853294928076E-6	2.746733720563585E-4	0.1467932978375482	2.973907186174107E-4
106-107	0.002626951347787128	4.7086863781090033E-4	1.2391279942392113E-5	2.9119507864621466E-4	0.14802623019181618	2.9945593194114276E-4
108-109	0.0026620599742905723	4.7086863781090033E-4	1.2391279942392113E-5	3.0978199855980285E-4	0.14914764102660266	3.0152114526487474E-4
110-111	0.0027178207340313367	4.791294911058284E-4	1.2391279942392113E-5	3.1597763853099886E-4	0.1503372039010723	3.0152114526487474E-4
112-113	0.0027818423470670293	4.894555577244885E-4	1.2391279942392113E-5	3.180428518547309E-4	0.15159698402854885	3.035863585886068E-4
114-115	0.002835537893484062	4.915207710482205E-4	1.2391279942392113E-5	3.26303705149659E-4	0.15312937231475798	3.056515719123388E-4
116-117	0.0028809725866061663	4.977164110194166E-4	1.2391279942392113E-5	3.30434131797123E-4	0.1543354568958175	3.056515719123388E-4
118-119	0.002930537706375735	5.039120509906126E-4	1.2391279942392113E-5	3.3456455844458705E-4	0.15538045483762591	3.056515719123388E-4
120-121	0.0029945593194114274	5.039120509906126E-4	1.2391279942392113E-5	3.3456455844458705E-4	0.15658447420536167	3.056515719123388E-4
122-123	0.0031845589451947732	5.039120509906126E-4	1.2391279942392113E-5	3.4695583838697917E-4	0.15771414589344307	3.056515719123388E-4
124-125	0.003281623971410178	5.039120509906126E-4	1.4456493266124132E-5	3.510862650344432E-4	0.15896359995430098	3.056515719123388E-4
126-127	0.0033311890911797465	5.059772643143446E-4	1.652170658985615E-5	3.510862650344432E-4	0.16023577136171988	3.056515719123388E-4
128-129	0.003401406344186635	5.101076909618087E-4	1.652170658985615E-5	3.552166916819073E-4	0.16123120418375872	3.056515719123388E-4
130-131	0.003490210517107112	5.142381176092728E-4	1.652170658985615E-5	3.614123316531033E-4	0.16201185482012942	3.077167852360708E-4
132-133	0.003570753836732661	5.204337575804688E-4	1.652170658985615E-5	3.717383982717634E-4	0.1627904402431764	3.0978199855980285E-4
134-135	0.0036616232229768697	5.204337575804688E-4	1.652170658985615E-5	3.738036115954954E-4	0.16370326453226594	3.1597763853099886E-4
136-137	0.0037937968756957185	5.36955464170325E-4	1.652170658985615E-5	3.7586882491922745E-4	0.1646553278745064	3.180428518547309E-4
138-139	0.003799992515666915	5.43151104141521E-4	1.652170658985615E-5	3.779340382429595E-4	0.1655454348170349	3.180428518547309E-4
>>END_MODULE
