##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.4d.S.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	20058847
Total Bases	3 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	69-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.44784617979288	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.92398770477685	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	35.057774656738744	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
4	35.06660417719922	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.9651248648539	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.903944279549066	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.860522990179845	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	35.01398659653768	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.98522816391191	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	35.00561215706964	35.2	34.0	37.4	32.0	39.0
15-19	35.00080294744758	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
20-24	35.000129429174066	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
25-29	34.988605965238186	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
30-34	34.971580360526204	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
35-39	34.95711743551362	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
40-44	34.90564148577433	35.0	34.0	37.0	31.4	39.0
45-49	34.813067381190955	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.79754678820772	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.77861764437408	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.76968462843353	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.74286167096244	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.73908897018616	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.71998124442157	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.70258298342746	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
85-89	34.69094978305786	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
90-94	34.67436058676751	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
95-99	34.65390573971864	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
100-104	34.617492485494935	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
105-109	34.59677576817468	35.0	34.0	37.0	30.6	39.0
110-114	34.56198591222515	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.542618153961016	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.52140825563981	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.493783286533144	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.470835611586914	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.446217610891736	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.41908128777679	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.445176687578055	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	35.17445086562382	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	6.0
22	124.0
23	1672.0
24	12848.0
25	55517.0
26	147044.0
27	270308.0
28	400124.0
29	522881.0
30	654719.0
31	834068.0
32	1096792.0
33	1512315.0
34	2236420.0
35	3736493.0
36	7427291.0
37	1150222.0
38	3.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.326207932091016	10.845389069471441	15.509395928888633	38.31900706954891
2	23.32971514453055	11.95441570671164	35.302835822153014	29.413033326604793
3	21.70581799520351	16.373548931109354	27.8129925199042	34.107640553782936
4	26.774621821031076	23.643615580036776	21.99173401151204	27.590028587420107
5	27.05204276879772	29.524285789564285	24.09914855946975	19.324522882168246
6	20.123975326576872	35.86582068844494	25.24837689935056	18.761827085627626
7	16.574884893482224	24.896080585430482	39.61515268202324	18.913881839064047
8	19.02460123344423	24.24045895886746	31.01472067783148	25.72021912985683
9	19.86097684624173	22.794061085456836	32.43499853455964	24.909963533741795
10-14	20.693187784274052	28.625631323504848	26.881723528523082	23.799457363698014
15-19	20.977510950848156	27.42455889061743	27.550773745738756	24.047156412795662
20-24	21.038144807862615	27.488226793290206	27.348924402219982	24.124703996627197
25-29	20.989706055960323	27.700807785756105	27.082612784503784	24.226873373779785
30-34	20.966423373762925	27.559677250994618	27.182829381046304	24.291069994196153
35-39	21.15576304502691	27.322105478651515	27.155212481497948	24.366918994823628
40-44	21.267702182422447	27.39727919097468	27.058117052939174	24.276901573663704
45-49	21.446222743578193	27.303872788034976	26.98854991610916	24.261354552277666
50-54	21.46104319502212	27.44386722224825	26.936340052685736	24.158749530043895
55-59	21.39149810567898	27.397892185052985	27.041449126041485	24.169160583226553
60-64	21.606901061318634	27.27376305148882	26.794341879358953	24.324994007833592
65-69	21.538786553033507	27.334487955218894	26.932939415713015	24.193786076034584
70-74	21.804638318312687	27.164915533876343	26.877708738043744	24.152737409767226
75-79	21.653351280613197	27.123242475229013	26.872270704804635	24.351135539353148
80-84	21.909060725992624	27.07539485511682	26.832716182380672	24.182828236509884
85-89	21.764976065021447	27.111939579277294	26.904587783001787	24.21849657269948
90-94	21.778456629182383	26.92650447551035	26.838925598335845	24.45611329697142
95-99	21.983107614555383	26.955237539648238	26.943737262600642	24.11791758319574
100-104	21.959562148229555	26.77660704272396	26.99818136244536	24.265649446601127
105-109	22.06424545854347	26.72157412093036	26.96779499170624	24.246385428819927
110-114	21.993435986369523	26.768173057950705	26.945501194051197	24.29288976162858
115-119	22.08963725311219	26.91112265671247	26.881181134761245	24.118058955414092
120-124	22.010754823876823	26.786727401478927	26.95112179726865	24.251395977375605
125-129	22.280306593347547	26.764560302889322	26.878787027627464	24.076346076135668
130-134	22.08105651683902	26.915514945736753	26.78341065582775	24.22001788159648
135-139	22.204855198535924	26.72522397484343	26.851015599449763	24.218905227170886
140-144	22.15852310983492	26.57788184653262	27.105717365324765	24.157877678307692
145-149	21.70843660365202	26.759252445639348	27.32896736866482	24.20334358204381
150	21.780271258705763	25.342931291502325	27.76383439772617	25.112963052065734
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	1.5
9	3.0
10	4.0
11	6.0
12	11.5
13	19.0
14	27.5
15	57.0
16	105.0
17	225.5
18	507.0
19	940.5
20	1580.5
21	2500.0
22	4048.0
23	6442.0
24	10090.5
25	15225.0
26	21360.0
27	30055.0
28	44532.5
29	64764.0
30	88744.5
31	113085.5
32	137958.0
33	165548.5
34	195313.0
35	235282.5
36	291560.5
37	356267.0
38	427351.0
39	523133.0
40	648127.0
41	785509.0
42	922497.0
43	1054998.0
44	1169972.0
45	1250318.5
46	1295321.5
47	1298622.0
48	1256008.5
49	1197008.0
50	1110465.0
51	988652.5
52	845145.0
53	710653.5
54	588131.0
55	482965.5
56	409547.0
57	339667.0
58	279793.0
59	224998.0
60	171388.0
61	119940.0
62	71080.5
63	39975.0
64	24801.5
65	15283.5
66	10247.5
67	5013.0
68	2033.0
69	1141.0
70	1121.0
71	898.0
72	440.0
73	163.5
74	78.5
75	53.0
76	28.0
77	13.0
78	7.0
79	4.0
80	4.0
81	1.5
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	3.988265128100334E-5
3	6.480930833163042E-5
4	1.1964795384301003E-4
5	8.973596538225751E-5
6	8.475063397213209E-5
7	1.7448659935438961E-4
8	2.7917855896702337E-4
9	1.4955994230376253E-4
10-14	1.7049833422628927E-4
15-19	1.7648073191843977E-4
20-24	1.9143672614881603E-4
25-29	3.140758788379013E-4
30-34	4.466856943472374E-4
35-39	6.301458902398528E-4
40-44	3.150729451199264E-4
45-49	2.0938391922526754E-4
50-54	2.9313748691537457E-4
55-59	5.144862015249431E-4
60-64	7.89676495363866E-4
65-69	5.055126049867174E-4
70-74	2.86158057179425E-4
75-79	4.556594180958029E-4
80-84	2.2134887792720056E-4
85-89	2.9612908731549604E-4
90-94	4.0181868120456625E-4
95-99	5.783008595465148E-4
100-104	3.7390227526613715E-4
105-109	4.4170438386715324E-4
110-114	3.180683142937707E-4
115-119	3.559587494660619E-4
120-124	2.9513809052595166E-4
125-129	4.2276841219999957E-4
130-134	3.529761679166261E-4
135-139	3.460075362036809E-4
140-144	3.042126671960299E-4
145-149	3.825986579859869E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
68-69	1.0
70-71	1.0
72-73	2.0
74-75	0.0
76-77	2.0
78-79	3.0
80-81	5.0
82-83	7.0
84-85	3.0
86-87	4.0
88-89	13.0
90-91	5.0
92-93	13.0
94-95	17.0
96-97	16.0
98-99	19.0
100-101	20.0
102-103	17.0
104-105	20.0
106-107	28.0
108-109	30.0
110-111	39.0
112-113	30.0
114-115	34.0
116-117	27.0
118-119	39.0
120-121	47.0
122-123	42.0
124-125	56.0
126-127	82.0
128-129	95.0
130-131	114.0
132-133	138.0
134-135	229.0
136-137	457.0
138-139	1322.0
140-141	3852.0
142-143	5301.0
144-145	50780.0
146-147	612130.0
148-149	928215.0
150-151	1.8455592E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	44.92030795330707
#Duplication Level	Percentage of total
1	34.43900403504882
2	9.937131511852792
3	5.775507677807719
4	3.8886734691189107
5	2.9490384706499846
6	2.3493052657335536
7	1.8931072546815555
8	1.5844190750196163
9	1.3367779132708975
>10	16.471253164362928
>50	5.178705811187986
>100	9.967225926924538
>500	2.56918383180631
>1k	1.6333330588243142
>5k	0.02733353371000997
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.4955994230376252E-5	0.0	4.985331410125417E-6	1.994132564050167E-4	9.970662820250835E-6
2	4.985331410125417E-6	6.480930833163043E-5	0.0	9.970662820250835E-6	0.00196920590699954	1.4955994230376252E-5
3	3.489731987087792E-5	7.477997115188127E-5	0.0	9.970662820250835E-6	0.003948382476819331	3.988265128100334E-5
4	6.979463974175584E-5	9.472129679238294E-5	0.0	9.970662820250835E-6	0.005877705732537868	4.4867982691128756E-5
5	8.47506339721321E-5	9.472129679238294E-5	0.0	9.970662820250835E-6	0.007094126596608469	4.4867982691128756E-5
6	1.0967729102275918E-4	9.472129679238294E-5	0.0	9.970662820250835E-6	0.008679461985028352	4.4867982691128756E-5
7	1.5953060512401336E-4	1.146626224328846E-4	0.0	9.970662820250835E-6	0.010180046739476102	4.4867982691128756E-5
8	2.3929590768602003E-4	1.2463328525313543E-4	0.0	9.970662820250835E-6	0.013495292127209506	4.4867982691128756E-5
9	3.041052160176505E-4	1.2961861666326087E-4	0.0	9.970662820250835E-6	0.016631065584178394	4.4867982691128756E-5
10-11	3.439878672986538E-4	1.3709661377844898E-4	0.0	9.970662820250835E-6	0.029057004123915996	8.47506339721321E-5
12-13	3.9134851569484525E-4	1.420819451885744E-4	0.0	9.970662820250835E-6	0.03857649445155048	9.970662820250835E-5
14-15	4.262458355657232E-4	1.470672765986998E-4	0.0	1.4955994230376252E-5	0.0462215001689778	9.970662820250835E-5
16-17	4.6862115255178925E-4	1.4955994230376253E-4	0.0	1.994132564050167E-5	0.050855365714689384	9.970662820250835E-5
18-19	5.109964695378553E-4	1.4955994230376253E-4	0.0	1.994132564050167E-5	0.054367531693122736	9.970662820250835E-5
20-21	7.129023916479346E-4	1.670086022392015E-4	0.0	1.994132564050167E-5	0.05743849584176	9.970662820250835E-5
22-23	9.322569736934531E-4	1.7947193076451503E-4	0.0	2.2433991345564378E-5	0.060494503996166876	9.970662820250835E-5
24-25	0.0010419342647162123	1.8944259358476587E-4	0.0	2.4926657050627087E-5	0.06350564416788262	1.0219929390757105E-4
26-27	0.0011067435730478426	1.96920590699954E-4	0.0	2.7419322755689796E-5	0.06603569985852129	1.121699567278219E-4
28-29	0.001189001541314912	1.994132564050167E-4	0.0	3.240465416581521E-5	0.06930856992926862	1.1964795384301002E-4
30-31	0.0013410541493237373	2.0938391922526754E-4	0.0	4.2375316986066044E-5	0.07276340459648553	1.2712595095819816E-4
32-33	0.0014258047832958693	2.0938391922526754E-4	0.0	4.736064839619147E-5	0.07572469145410002	1.3709661377844898E-4
34-35	0.001498092088742688	2.0938391922526754E-4	0.0	5.73313112164423E-5	0.079142136135741	1.3958927948351169E-4
36-37	0.0015354820743186284	2.0938391922526754E-4	0.0	6.480930833163043E-5	0.08229535825264533	1.3958927948351169E-4
38-39	0.0015604087313692556	2.1436925063539295E-4	0.0	6.480930833163043E-5	0.08518685047051808	1.3958927948351169E-4
40-41	0.0015953060512401336	2.1436925063539295E-4	0.0	6.480930833163043E-5	0.08783406144929468	1.420819451885744E-4
42-43	0.0016202327082907608	2.1686191634045566E-4	0.0	6.979463974175584E-5	0.09038405846557382	1.5205260800882524E-4
44-45	0.0016351887025211368	2.1935458204551836E-4	0.0	7.727263685694397E-5	0.09325560935780605	1.5454527371388795E-4
46-47	0.0016501446967515131	2.2184724775058107E-4	0.0	8.47506339721321E-5	0.09757290635897467	1.5454527371388795E-4
48-49	0.001660115359571764	2.2683257916070648E-4	0.0	8.973596538225751E-5	0.10065633383613724	1.719939336493269E-4
50-51	0.001692520013737579	2.3431057627589462E-4	0.0	8.973596538225751E-5	0.10371483465624919	1.7448659935438961E-4
52-53	0.0017324026650185826	2.3431057627589462E-4	0.0	9.472129679238294E-5	0.10634708964079541	1.7448659935438961E-4
54-55	0.0017772706477097115	2.3929590768602003E-4	0.0	9.472129679238294E-5	0.10858051811253158	1.7947193076451503E-4
56-57	0.0018495579531565298	2.4178857339108274E-4	4.985331410125417E-6	9.472129679238294E-5	0.11088124855830447	1.7947193076451503E-4
58-59	0.0019019039329628467	2.6172989903158446E-4	4.985331410125417E-6	9.970662820250835E-5	0.11303491172747865	1.7947193076451503E-4
60-61	0.0019816692355248532	2.6920789614677255E-4	4.985331410125417E-6	9.970662820250835E-5	0.11497420564601744	1.7947193076451503E-4
62-63	0.0020240445525109194	2.6920789614677255E-4	4.985331410125417E-6	9.970662820250835E-5	0.11729238475172576	1.7947193076451503E-4
64-65	0.0020414932124463584	2.7668589326196064E-4	4.985331410125417E-6	1.0469195961263376E-4	0.12003930235870486	1.7947193076451503E-4
66-67	0.0020439858781514213	2.8665655608221146E-4	4.985331410125417E-6	1.1964795384301002E-4	0.12288343392818141	1.8196459646957773E-4
68-69	0.0020689125352020485	2.9662721890246234E-4	4.985331410125417E-6	1.2463328525313543E-4	0.12505953108870116	1.9193525928982858E-4
70-71	0.0020963318579577377	3.041052160176505E-4	4.985331410125417E-6	1.2463328525313543E-4	0.12742257817710062	1.994132564050167E-4
72-73	0.0021187658493033025	3.041052160176505E-4	4.985331410125417E-6	1.2463328525313543E-4	0.12938679875269002	2.019059221100794E-4
74-75	0.0021387071749438043	3.090905474277759E-4	4.985331410125417E-6	1.2961861666326087E-4	0.13145571128789207	2.043985878151421E-4
76-77	0.00218108249192987	3.215538759530894E-4	4.985331410125417E-6	1.420819451885744E-4	0.13313576797310434	2.043985878151421E-4
78-79	0.0022035164832754344	3.2903187306827753E-4	4.985331410125417E-6	1.719939336493269E-4	0.1349230092836343	2.043985878151421E-4
80-81	0.0022458918002615006	3.34017204478403E-4	4.985331410125417E-6	1.7947193076451503E-4	0.1366130366316668	2.043985878151421E-4
82-83	0.0022633404601969396	3.439878672986538E-4	4.985331410125417E-6	1.8196459646957773E-4	0.13835042462809555	2.043985878151421E-4
84-85	0.0023007304457728804	3.439878672986538E-4	4.985331410125417E-6	1.8944259358476587E-4	0.14028722588092923	2.0938391922526754E-4
86-87	0.002338120431348821	3.5395853011890464E-4	4.985331410125417E-6	2.043985878151421E-4	0.14217666648536678	2.0938391922526754E-4
88-89	0.0023580617569893226	3.5395853011890464E-4	4.985331410125417E-6	2.1436925063539295E-4	0.1439464591359613	2.0938391922526754E-4
90-91	0.0023904664111551377	3.5395853011890464E-4	4.985331410125417E-6	2.1436925063539295E-4	0.14627710157019494	2.0938391922526754E-4
92-93	0.0024203783996158902	3.5395853011890464E-4	4.985331410125417E-6	2.1436925063539295E-4	0.14828120479706536	2.1187658493033025E-4
94-95	0.00244779772237158	3.5894386152903005E-4	4.985331410125417E-6	2.1436925063539295E-4	0.1501556894072725	2.1686191634045566E-4
96-97	0.002500143702177897	3.614365272340928E-4	4.985331410125417E-6	2.1436925063539295E-4	0.15179835610690884	2.2184724775058107E-4
98-99	0.002577416339034841	3.689145243492809E-4	4.985331410125417E-6	2.1436925063539295E-4	0.1531643369132832	2.2433991345564377E-4
100-101	0.002719498284223415	3.7888518716953175E-4	4.985331410125417E-6	2.1935458204551836E-4	0.1546150683536297	2.2433991345564377E-4
102-103	0.0027593809355044184	3.7888518716953175E-4	4.985331410125417E-6	2.2433991345564377E-4	0.15582899655199522	2.2433991345564377E-4
104-105	0.0027618736012094813	3.7888518716953175E-4	4.985331410125417E-6	2.2683257916070648E-4	0.15720245535548477	2.2433991345564377E-4
106-107	0.00280674158390061	3.7888518716953175E-4	4.985331410125417E-6	2.3181791057083192E-4	0.15837650090256933	2.293252448657692E-4
108-109	0.0028516095665917385	3.7888518716953175E-4	4.985331410125417E-6	2.6422256473664714E-4	0.15959790709805005	2.3431057627589462E-4
110-111	0.0028615802294119897	3.9134851569484525E-4	4.985331410125417E-6	2.6422256473664714E-4	0.16082180595923584	2.3431057627589462E-4
112-113	0.0029288822034486827	3.93841181399908E-4	4.985331410125417E-6	2.6422256473664714E-4	0.16208060214029252	2.3431057627589462E-4
114-115	0.0029587941919094352	3.93841181399908E-4	4.985331410125417E-6	2.667152304417098E-4	0.16353881157775418	2.3431057627589462E-4
116-117	0.002993691511780313	4.038118442201588E-4	4.985331410125417E-6	2.7917855896702337E-4	0.1648549390700273	2.3431057627589462E-4
118-119	0.003031081497356254	4.1128984133534694E-4	4.985331410125417E-6	2.916418874923369E-4	0.1659442339831397	2.3431057627589462E-4
120-121	0.0031432514540840756	4.1627517274547235E-4	4.985331410125417E-6	3.0161255031258775E-4	0.16708587487605842	2.3431057627589462E-4
122-123	0.003322723384848591	4.212605041555978E-4	4.985331410125417E-6	3.215538759530894E-4	0.16821754510615688	2.3431057627589462E-4
124-125	0.0033950106902954093	4.237531698606605E-4	4.985331410125417E-6	3.240465416581521E-4	0.16955610658977557	2.4178857339108274E-4
126-127	0.003442371338691601	4.237531698606605E-4	4.985331410125417E-6	3.240465416581521E-4	0.17087971207916386	2.4428123909614544E-4
128-129	0.0034697906614472905	4.262458355657232E-4	4.985331410125417E-6	3.34017204478403E-4	0.17200390431214715	2.4926657050627085E-4
130-131	0.0035570339611244854	4.337238326809113E-4	4.985331410125417E-6	3.365098701834657E-4	0.1728688593118039	2.4926657050627085E-4
132-133	0.003611872606635865	4.337238326809113E-4	4.985331410125417E-6	3.439878672986538E-4	0.1736789756659493	2.5175923621133353E-4
134-135	0.0037016085720181224	4.337238326809113E-4	4.985331410125417E-6	3.439878672986538E-4	0.1746885052764997	2.5425190191639627E-4
136-137	0.0038387051857965713	4.486798269112876E-4	4.985331410125417E-6	3.464805330037165E-4	0.17573542487262603	2.5425190191639627E-4
138-139	0.0038536611800269478	4.586504897315384E-4	4.985331410125417E-6	3.5146586441384196E-4	0.17663029186074353	2.5425190191639627E-4
>>END_MODULE
