##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	Col0.lowPi.4d.S.3.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24025985
Total Bases	3.5 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	66-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.35870454426738	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.83727793054062	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.97190679175068	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.97190163067196	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.87488284039135	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.813719895354964	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.784722790761755	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.923415959845144	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.899013838558545	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.92096284085751	35.2	34.0	37.0	31.4	39.0
15-19	34.918846215878354	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.91995260131895	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.91013487272218	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.89251331839256	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.88125932818155	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.82461609794562	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.73389468943729	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.71502139870644	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.698498971009926	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.68674682016159	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.664018991506154	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.66068245338617	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
75-79	34.64193221333251	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
80-84	34.62601609425518	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
85-89	34.614416425072164	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
90-94	34.59894359937551	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.57644345608083	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.54133400185646	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.514810988806026	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.48102336431467	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.45757809927742	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.431578085581094	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.40144564657553	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.37336819256417	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.3419465713935	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
140-144	34.309781594296695	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.33270916538022	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
150	35.10680765148966	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	3.0
22	190.0
23	2419.0
24	18051.0
25	77673.0
26	200034.0
27	361649.0
28	520214.0
29	669400.0
30	833900.0
31	1049182.0
32	1362857.0
33	1844530.0
34	2664687.0
35	4349238.0
36	8650059.0
37	1421895.0
38	4.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.88187123233449	10.779924319439974	15.55340186885158	37.78480257937395
2	23.524664693967303	11.439350482615431	34.986711458213406	30.04927336520386
3	21.965722514903142	15.634370717525512	27.664812770345428	34.73509399722592
4	27.093782536427792	22.72813297119719	22.085519597452006	28.09256489492301
5	27.569426772588752	28.765004289942688	24.084625622899093	19.580943314569467
6	20.65659811304106	35.560730975994296	25.137588674916632	18.645082236048008
7	16.822790964866225	25.235472557121795	39.201039443115285	18.740697034896698
8	19.139408605372864	24.476074173226248	30.941054494479296	25.443462726921588
9	19.945394072237605	22.93658322873468	32.403321356983696	24.71470134204402
10-14	20.851555018506655	28.5804608283576	26.8836647971327	23.68431935600304
15-19	21.167599667822415	27.347758134687723	27.490751892959974	23.993890304529888
20-24	21.21259617828287	27.44771758074622	27.283064805668072	24.056621435302837
25-29	21.151262565700925	27.65475766628355	27.029526197500548	24.164453570514972
30-34	21.136795585261478	27.541383803343766	27.114321907392796	24.207498704001953
35-39	21.341719835661635	27.27505635556351	27.097432629672735	24.285791179102116
40-44	21.433075080097932	27.34878912553581	26.993063028104547	24.22507276626171
45-49	21.6421162095749	27.2644674103869	26.91824653378098	24.175169846257216
50-54	21.66683490178241	27.41089286829451	26.845788533970232	24.076483695952845
55-59	21.596681136987584	27.347109302604718	26.981332694155558	24.074876866252144
60-64	21.798536512078726	27.222167114752	26.744280460595892	24.23501591257338
65-69	21.71634578045038	27.284086170824786	26.889772677421135	24.1097953713037
70-74	21.985174693305577	27.115221379805103	26.828671660568155	24.070932266321165
75-79	21.83254595306102	27.08394012705052	26.817079502827678	24.266434417060772
80-84	22.088731455919422	27.042604845997374	26.775166121874367	24.093497576208836
85-89	21.942715267263075	27.063323138492585	26.860346997516594	24.133614596727746
90-94	21.939627331682622	26.855286088483055	26.80735183560144	24.39773474423289
95-99	22.154053838834386	26.89814833390575	26.901483091323126	24.046314735936743
100-104	22.125809283203736	26.725889790308592	26.96824521149547	24.180055714992196
105-109	22.244139771255643	26.6808318361108	26.913021686286438	24.16200670634712
110-114	22.172207824526232	26.713250509368656	26.914770341221494	24.199771324883613
115-119	22.248560640181054	26.882733023186056	26.825497771458835	24.043208565174048
120-124	22.149357692957935	26.777349333798135	26.90892321304121	24.16436976020272
125-129	22.456543126410157	26.724015034874892	26.844783989323545	23.974657849391406
130-134	22.235579860758005	26.881011187084013	26.759668597146096	24.123740355011883
135-139	22.366629572618574	26.689968891765925	26.82930071987528	24.114100815740215
140-144	22.29929744078857	26.542987451860395	27.093873972045312	24.06384113530572
145-149	21.825027469623034	26.76676738805268	27.321739218592555	24.086465923731726
150	21.840781515303025	25.37836255796222	27.794758685080158	24.986097241654598
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.5
7	0.5
8	0.0
9	1.0
10	2.0
11	6.0
12	9.0
13	15.0
14	24.0
15	61.0
16	124.5
17	260.5
18	574.0
19	1039.5
20	1729.0
21	2768.5
22	4513.0
23	7285.5
24	11665.0
25	17491.0
26	24372.0
27	33996.0
28	50477.0
29	74234.0
30	101211.5
31	129151.0
32	159161.0
33	192654.0
34	227967.0
35	274718.5
36	340718.5
37	416333.5
38	499221.5
39	610488.5
40	759116.0
41	922441.0
42	1084156.5
43	1242859.0
44	1386350.5
45	1488899.0
46	1546418.5
47	1556846.5
48	1512195.0
49	1449159.0
50	1351159.0
51	1203722.0
52	1031837.5
53	873547.0
54	725501.5
55	595742.5
56	502911.0
57	416827.0
58	344199.5
59	276843.5
60	210698.5
61	147397.0
62	88312.0
63	50112.0
64	31130.5
65	19270.0
66	12876.5
67	6252.0
68	2580.5
69	1406.5
70	1187.5
71	903.5
72	456.0
73	182.5
74	94.0
75	56.5
76	33.5
77	21.0
78	11.0
79	3.5
80	2.5
81	3.0
82	1.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.5
89	0.5
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.5
95	0.5
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	9.572968600454881E-5
3	4.1621602610673404E-5
4	1.2486480783202022E-4
5	9.572968600454881E-5
6	1.0405400652668351E-4
7	1.7897289122589563E-4
8	2.705404169693771E-4
9	9.156752574348148E-5
10-14	1.373512886152222E-4
15-19	1.714810027559744E-4
20-24	1.2902696809308754E-4
25-29	2.788647374915118E-4
30-34	4.1621602610673403E-4
35-39	5.85199732706068E-4
40-44	3.4962146192965657E-4
45-49	2.1143774126222085E-4
50-54	3.5544848629515087E-4
55-59	4.92799774910373E-4
60-64	8.499131253099509E-4
65-69	5.252646424365833E-4
70-74	2.663782921870023E-4
75-79	4.1288648349584926E-4
80-84	1.9562172116664234E-4
85-89	2.772003395029888E-4
90-94	3.7459550552987043E-4
95-99	5.610618793648367E-4
100-104	3.8208929540045156E-4
105-109	4.63669971801124E-4
110-114	3.188265478192289E-4
115-119	3.579531691700163E-4
120-124	3.1133768391951105E-4
125-129	3.5879091092550294E-4
130-134	3.2716214782899073E-4
135-139	2.847168419827271E-4
140-144	2.781418859553812E-4
145-149	3.3482888256319425E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
66-67	1.0
68-69	1.0
70-71	1.0
72-73	1.0
74-75	4.0
76-77	6.0
78-79	3.0
80-81	6.0
82-83	5.0
84-85	9.0
86-87	6.0
88-89	13.0
90-91	11.0
92-93	18.0
94-95	20.0
96-97	18.0
98-99	28.0
100-101	39.0
102-103	30.0
104-105	33.0
106-107	43.0
108-109	40.0
110-111	45.0
112-113	47.0
114-115	40.0
116-117	54.0
118-119	47.0
120-121	56.0
122-123	67.0
124-125	110.0
126-127	98.0
128-129	128.0
130-131	151.0
132-133	233.0
134-135	328.0
136-137	597.0
138-139	1815.0
140-141	4861.0
142-143	7108.0
144-145	62481.0
146-147	745159.0
148-149	1181414.0
150-151	2.202081E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.3107600753169
#Duplication Level	Percentage of total
1	33.012793964733724
2	9.610071492759454
3	5.700550583265587
4	3.8867580063350413
5	2.866363338821942
6	2.334763615741068
7	1.9360062005116783
8	1.564702822567097
9	1.3671398392375915
>10	16.794029341639874
>50	5.283504211699626
>100	10.391832011119039
>500	3.0361766091887494
>1k	2.161779902602378
>5k	0.05352805977701129
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	8.32432052213468E-6	4.5783762871740746E-5	0.0	0.0	2.372431348808384E-4	8.32432052213468E-6
2	1.248648078320202E-5	1.456756091373569E-4	0.0	1.664864104426936E-5	0.001760593790431485	2.0810801305336702E-5
3	2.0810801305336702E-5	1.6232425018162627E-4	0.0	2.0810801305336702E-5	0.0032631336446767947	3.745944234960606E-5
4	4.1621602610673404E-5	1.9978369253123232E-4	0.0	2.913512182747138E-5	0.004778159979705306	4.5783762871740746E-5
5	5.410808339387542E-5	1.9978369253123232E-4	0.0	3.329728208853872E-5	0.005951889173326296	4.5783762871740746E-5
6	8.740536548241414E-5	1.9978369253123232E-4	0.0	3.329728208853872E-5	0.007387834463394529	4.994592313280808E-5
7	1.1237832704881819E-4	2.1643233357550168E-4	0.0	3.329728208853872E-5	0.009040212087038263	5.410808339387542E-5
8	1.7064857070376094E-4	2.1643233357550168E-4	0.0	3.329728208853872E-5	0.011957886430046468	6.659456417707744E-5
9	2.4140529514190574E-4	2.1643233357550168E-4	0.0	3.329728208853872E-5	0.01491302021540428	6.659456417707744E-5
10-11	2.871890580136465E-4	2.2683773422817004E-4	0.0	3.537836221907239E-5	0.025665961249871756	8.32432052213468E-5
12-13	3.288106606243199E-4	2.289188143587037E-4	0.0	4.1621602610673404E-5	0.03457714636881693	9.364860587401515E-5
14-15	3.6002686258232496E-4	2.3099989448923736E-4	0.0	4.786484300227441E-5	0.04246027790327847	9.989184626561616E-5
16-17	3.891619844097963E-4	2.4140529514190574E-4	0.0	4.994592313280808E-5	0.0473820324119906	1.0405400652668351E-4
18-19	4.370268274120707E-4	2.538917759251077E-4	0.0	4.994592313280808E-5	0.05109467936486267	1.0821616678775084E-4
20-21	6.430537603349041E-4	2.809458176220455E-4	0.0	5.410808339387542E-5	0.05395616454434647	1.1029724691828452E-4
22-23	8.844590554768098E-4	2.871890580136465E-4	0.0	5.410808339387542E-5	0.05694251453166228	1.1237832704881819E-4
24-25	9.448103792622862E-4	2.934322984052475E-4	0.0	6.035132378547643E-5	0.05960005385835378	1.1237832704881819E-4
26-27	9.989184626561618E-4	2.9551337853578113E-4	0.0	7.491888469921213E-5	0.06235540395118036	1.186215674404192E-4
28-29	0.0010800805877469748	2.9551337853578113E-4	0.0	8.532428535188048E-5	0.06549159170789459	1.2070264757095287E-4
30-31	0.0012153507962316633	2.9551337853578113E-4	0.0	1.2278372770148653E-4	0.06856742814082337	1.331891283541549E-4
32-33	0.0012507291584507357	2.996755387968485E-4	0.0	1.4567560913735693E-4	0.07152672408644224	1.5608100979002526E-4
34-35	0.0013048372418446113	3.0383769905791583E-4	0.0	1.8313505148696298E-4	0.07490847929855945	1.6024317005109258E-4
36-37	0.0013277291232804815	3.0383769905791583E-4	0.0	2.01864772661766E-4	0.07796974817057448	1.7064857070376097E-4
38-39	0.001350621004716352	3.163241798411179E-4	0.0	2.2059449383656903E-4	0.080752152305098	1.810539713564293E-4
40-41	0.0013901615271964918	3.204863401021852E-4	0.0	2.3308097461977105E-4	0.08338888083048415	1.8313505148696298E-4
42-43	0.0014026480079796936	3.2464850036325254E-4	0.0	2.4140529514190574E-4	0.08596525803208485	1.8313505148696298E-4
44-45	0.0014109723285018283	3.3297282088538724E-4	0.0	2.4972961566404044E-4	0.08880801349039383	1.8313505148696298E-4
46-47	0.0014276209695460976	3.3297282088538724E-4	0.0	2.580539361861751E-4	0.09258309284718191	1.872972117480303E-4
48-49	0.001456756091373569	3.4129714140752193E-4	0.0	2.580539361861751E-4	0.0952884970168757	1.89378291878564E-4
50-51	0.0014775668926789057	3.4545930166858925E-4	0.0	2.580539361861751E-4	0.0981083605937488	1.9770261240069866E-4
52-53	0.0015171074151590453	3.4545930166858925E-4	0.0	2.580539361861751E-4	0.10065976483378308	1.9978369253123232E-4
54-55	0.00156497225816132	3.4545930166858925E-4	0.0	2.580539361861751E-4	0.10291357461515105	2.0394585279229967E-4
56-57	0.001633647902468931	3.4962146192965657E-4	0.0	2.580539361861751E-4	0.10503419526816486	2.0602693292283333E-4
58-59	0.0016856749057322729	3.621079427128586E-4	0.0	2.726214970999108E-4	0.10718186996287561	2.0810801305336702E-4
60-61	0.0017918099923894901	3.766755036265943E-4	0.0	2.788647374915118E-4	0.10914224744583834	2.1227017331443436E-4
62-63	0.0018542423963055	3.78756583757128E-4	0.0	2.830268977525791E-4	0.11137316534577042	2.1643233357550168E-4
64-65	0.0018958639989161735	3.78756583757128E-4	0.0	2.851079778831128E-4	0.11425962348682062	2.1643233357550168E-4
66-67	0.0019229180406131112	3.870809042792626E-4	0.0	2.975944586663148E-4	0.1172189194324395	2.1643233357550168E-4
68-69	0.0019437288419184478	3.9332414467086363E-4	0.0	3.059187791884495E-4	0.11929791848284264	2.1643233357550168E-4
70-71	0.0019811882842680536	4.016484651929983E-4	0.0	3.1632417984111784E-4	0.12134570133128778	2.1643233357550168E-4
72-73	0.002026972047139795	4.03729545323532E-4	0.0	3.1632417984111784E-4	0.12319994372759327	2.1643233357550168E-4
74-75	0.0020457017683145977	4.09972785715133E-4	0.0	3.225674202327189E-4	0.12534969950243455	2.1643233357550168E-4
76-77	0.0020644314894894007	4.2037818636780135E-4	0.0	3.329728208853872E-4	0.1270208068472531	2.1643233357550168E-4
78-79	0.002072755810011535	4.245403466288687E-4	0.0	3.4962146192965657E-4	0.1286773466311579	2.1643233357550168E-4
80-81	0.0021102152523611415	4.245403466288687E-4	2.08108013053367E-6	3.537836221907239E-4	0.13037550801767336	2.1851341370603534E-4
82-83	0.0021289449735359444	4.245403466288687E-4	4.16216026106734E-6	3.537836221907239E-4	0.1320695072439278	2.2059449383656903E-4
84-85	0.0021851341370603536	4.3286466715100337E-4	4.16216026106734E-6	3.537836221907239E-4	0.13383634427475086	2.2059449383656903E-4
86-87	0.002226755739671027	4.370268274120707E-4	4.16216026106734E-6	3.558647023212576E-4	0.1355511543023106	2.2059449383656903E-4
88-89	0.002253809781367965	4.4535114793420544E-4	4.16216026106734E-6	3.78756583757128E-4	0.13723058596765128	2.2059449383656903E-4
90-91	0.0022621341018900995	4.5159438832580645E-4	4.16216026106734E-6	3.829187440181953E-4	0.1396925037620726	2.2059449383656903E-4
92-93	0.0022933503038481042	4.578376287174074E-4	4.16216026106734E-6	3.891619844097963E-4	0.14194839462357112	2.2059449383656903E-4
94-95	0.0023516205475030473	4.599187088479411E-4	4.16216026106734E-6	3.9124306454033E-4	0.14358412360617057	2.2059449383656903E-4
96-97	0.0024223772719411917	4.6408086910900846E-4	4.16216026106734E-6	3.9124306454033E-4	0.14515117694446242	2.2059449383656903E-4
98-99	0.002516025877815207	4.703241095006094E-4	4.16216026106734E-6	3.9956738506246464E-4	0.1465475817120505	2.2059449383656903E-4
100-101	0.0026512960862998956	4.869727505448788E-4	4.16216026106734E-6	4.0789170558459933E-4	0.14796479728094394	2.2059449383656903E-4
102-103	0.0027137284902159055	4.890538306754125E-4	4.16216026106734E-6	4.0789170558459933E-4	0.14909066163156265	2.2059449383656903E-4
104-105	0.00273870145178231	4.911349108059461E-4	4.16216026106734E-6	4.1413494597620034E-4	0.1503538772707966	2.2059449383656903E-4
106-107	0.002776160894131916	4.994592313280808E-4	4.16216026106734E-6	4.2870250688993605E-4	0.151583795627942	2.2059449383656903E-4
108-109	0.0028240257371341905	5.015403114586145E-4	4.16216026106734E-6	4.3702682741207074E-4	0.1526722005362111	2.2059449383656903E-4
110-111	0.002865647339744864	5.036213915891481E-4	4.16216026106734E-6	4.3702682741207074E-4	0.1536981730405642	2.2475665409763638E-4
112-113	0.0029405662244440757	5.057024717196818E-4	8.32432052213468E-6	4.4118898767313806E-4	0.15483236171170506	2.2475665409763638E-4
114-115	0.0029801067469242158	5.140267922418165E-4	8.32432052213468E-6	4.495133081952727E-4	0.1562329286395542	2.2475665409763638E-4
116-117	0.00302797158992649	5.161078723723502E-4	8.32432052213468E-6	4.619997889784748E-4	0.1573275767882149	2.2475665409763638E-4
118-119	0.003059187791884495	5.161078723723502E-4	8.32432052213468E-6	4.786484300227441E-4	0.15839308981504818	2.289188143587037E-4
120-121	0.0031320255964531734	5.202700326334175E-4	8.32432052213468E-6	4.994592313280809E-4	0.15949606228423102	2.289188143587037E-4
122-123	0.0033588633306813435	5.202700326334175E-4	8.32432052213468E-6	5.223511127639512E-4	0.1605969536732833	2.289188143587037E-4
124-125	0.0034858092186438976	5.244321928944849E-4	8.32432052213468E-6	5.285943531555522E-4	0.16178525042781805	2.289188143587037E-4
126-127	0.0035336740616461718	5.244321928944849E-4	8.32432052213468E-6	5.285943531555522E-4	0.16304846606705198	2.3516205475030474E-4
128-129	0.0035752956642568453	5.244321928944849E-4	8.32432052213468E-6	5.389997538082206E-4	0.16402865480853335	2.4140529514190574E-4
130-131	0.0036731064303919276	5.348375935471533E-4	8.32432052213468E-6	5.410808339387542E-4	0.16471124909134838	2.4140529514190574E-4
132-133	0.0037625928760048758	5.369186736776869E-4	8.32432052213468E-6	5.49405154460889E-4	0.16536470825233596	2.4140529514190574E-4
134-135	0.003841673920965155	5.389997538082206E-4	8.32432052213468E-6	5.535673147219562E-4	0.1663011943110761	2.4140529514190574E-4
136-137	0.003926998206317036	5.49405154460889E-4	8.32432052213468E-6	5.535673147219562E-4	0.16730843709425441	2.4140529514190574E-4
138-139	0.003933241446708637	5.49405154460889E-4	8.32432052213468E-6	5.535673147219562E-4	0.16830735555691057	2.4140529514190574E-4
>>END_MODULE
