##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.2d.R.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24210249
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	74-150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	36.079918302368554	37.0	35.0	38.0	32.0	39.0
2	35.04422973923151	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
3	35.34821467552853	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
4	35.3798877491925	36.0	35.0	38.0	32.0	39.0
5	35.18434221804162	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
6	35.076670793431326	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	35.04252703059766	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	35.21098911456879	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	35.2122381723542	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
10-14	35.22987345565921	35.4	34.0	37.8	32.0	39.0
15-19	35.234496316002364	35.8	34.0	38.0	32.0	39.0
20-24	35.22736862392452	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
25-29	35.21236078984566	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
30-34	35.20132993262482	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
35-39	35.18779189755545	36.0	34.0	38.0	32.0	39.0
40-44	35.167520846233344	35.8	34.0	38.0	32.0	39.0
45-49	35.12844715475664	35.4	34.0	38.0	32.0	39.0
50-54	35.10457357956129	35.2	34.0	38.0	32.0	39.0
55-59	35.09055875468278	35.4	34.0	38.0	32.0	39.0
60-64	35.07262759668437	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
65-69	35.04352463289411	35.2	34.0	38.0	32.0	39.0
70-74	35.02671628036539	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
75-79	35.01345300628178	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
80-84	34.991374126924136	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
85-89	34.9732416689593	35.0	34.0	37.8	31.4	39.0
90-94	34.95072575675282	35.0	34.0	37.8	31.0	39.0
95-99	34.9248615773258	35.0	34.0	37.8	31.0	39.0
100-104	34.89619238920781	35.0	34.0	37.4	31.0	39.0
105-109	34.865948136490694	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
110-114	34.83177855501668	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
115-119	34.79893339225241	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
120-124	34.76326740477744	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
125-129	34.73242139014884	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
130-134	34.69333713698834	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
135-139	34.65091147609435	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
140-144	34.605005770111404	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
145-149	34.61477152109059	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
150	35.30455128310686	35.0	34.0	38.0	32.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	3.0
22	128.0
23	1612.0
24	12284.0
25	54746.0
26	147035.0
27	281063.0
28	424128.0
29	556369.0
30	701478.0
31	894541.0
32	1167943.0
33	1587272.0
34	2308707.0
35	3935551.0
36	1.0447771E7
37	1689612.0
38	6.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	30.477113225890406	10.497678070142937	10.243855814948455	48.7813528890182
2	19.80357396515304	12.075541090842973	44.206927633172185	23.913957310831805
3	17.06946519301856	16.773520618056114	30.941622293989905	35.21539189493542
4	23.3856053028812	25.235934306296492	23.928367485900075	27.450092904922236
5	24.642469467465006	30.420532799344407	26.625097479413668	18.311900253776912
6	17.418867068504948	34.976018615596374	28.925739140843604	18.679375175055082
7	14.771034290819326	24.115183322627807	42.55611499282473	18.557667393728135
8	16.38695295335897	22.938815533764032	35.12889386015746	25.545337652719528
9	18.350638620507173	21.573288582004857	35.63205985106049	24.444012946427485
10-14	19.807506445334937	28.85903375134462	27.729639803904995	23.603819999415453
15-19	20.12210419368299	27.722651675128485	28.164918000747836	23.990326130440693
20-24	20.27483730766676	27.842018498099065	27.94662066204755	23.936523532186627
25-29	20.196164616236555	28.128210093910916	27.876181154089373	23.799444135763157
30-34	20.28891877881026	27.739010181317457	27.75309104223707	24.21897999763521
35-39	20.390490485575256	27.80144812179553	27.897154776166346	23.910906616462874
40-44	20.494128579921323	27.881978196253677	27.678741752121194	23.945151471703806
45-49	20.5630148139632	27.628049175352192	27.650972546468815	24.157963464215797
50-54	20.75709910313001	27.582126659054513	27.74118675715308	23.9195874806624
55-59	20.756650437634352	27.681558366445845	27.622019907961402	23.9397712879584
60-64	20.690942716067884	27.53544607409092	27.628654617736547	24.14495659210465
65-69	20.855857150324137	27.502259108802875	27.721880525744275	23.920003215128713
70-74	20.934733961096068	27.48526988372494	27.68105158588788	23.89894456929112
75-79	20.961538679183274	27.32367087773237	27.65175781440551	24.06303262867885
80-84	21.00667447840853	27.378564989083493	27.673854316755648	23.940906215752328
85-89	21.036387059543294	27.407938019262936	27.64849276911145	23.907182152082328
90-94	20.98476519586387	27.210946215673033	27.644166867649805	24.160121720813294
95-99	21.149136083135907	27.151655877314468	27.7692104070766	23.929997632473025
100-104	21.181751078091306	27.297634852573864	27.57736874511173	23.943245324223096
105-109	21.128696719133526	27.05563574873471	27.66161993217907	24.154047599952694
110-114	21.22895633312444	27.071137502653787	27.7816622103477	23.918243953874075
115-119	21.30009437746356	27.144170270486	27.647393926470436	23.908341425580005
120-124	21.236656767055763	27.001937968726075	27.66646747381148	24.094937790406682
125-129	21.283474471131353	26.94653407566078	27.797381668690218	23.972609784517655
130-134	21.349887465619474	27.123397578553877	27.62604021218727	23.900674743639378
135-139	21.324210709746012	26.923525922255465	27.748208655654526	24.004054712343994
140-144	21.43956717627704	26.970714930944396	27.839544525041493	23.750173367737073
145-149	21.080063317431076	27.16128547039617	27.936565915703277	23.82208529646948
150	21.45601824837638	25.311343949103872	28.456513871357824	24.776123931161923
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.5
3	0.5
4	0.5
5	0.5
6	1.0
7	2.5
8	4.5
9	4.5
10	5.5
11	17.0
12	23.0
13	27.0
14	55.5
15	125.5
16	226.5
17	429.5
18	792.0
19	1379.0
20	2475.0
21	4208.5
22	6624.5
23	10281.0
24	16038.5
25	24529.5
26	35843.5
27	50337.0
28	67608.0
29	93406.0
30	126296.0
31	161343.5
32	193055.0
33	227743.0
34	268559.5
35	315895.5
36	391861.0
37	499667.0
38	627704.5
39	776766.5
40	945838.0
41	1116250.0
42	1289045.0
43	1463947.0
44	1605943.0
45	1688040.0
46	1700521.5
47	1644866.0
48	1544973.5
49	1412791.0
50	1242029.5
51	1058167.0
52	875048.0
53	693963.5
54	533653.5
55	400116.5
56	294926.5
57	218529.0
58	164008.5
59	121645.0
60	86101.0
61	63442.5
62	46586.5
63	29558.5
64	18911.0
65	14043.5
66	13013.0
67	9684.5
68	4900.5
69	2445.0
70	1802.5
71	1161.0
72	500.5
73	232.0
74	111.5
75	60.5
76	27.0
77	18.0
78	10.0
79	3.5
80	4.0
81	2.5
82	1.5
83	1.5
84	1.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	9.087060608092053E-4
3	0.04873555823403551
4	5.782674932422215E-5
5	3.717433885128567E-5
6	4.956578513504756E-5
7	3.304385675669837E-5
8	7.847915979715862E-5
9	7.434867770257133E-5
10-14	1.0491424520251733E-4
15-19	1.668714766213268E-4
20-24	1.7513244081050137E-4
25-29	3.8330873837770117E-4
30-34	3.370473389183234E-4
35-39	8.34357383106634E-5
40-44	9.995766668901257E-5
45-49	9.417499175659035E-5
50-54	1.1895788432411415E-4
55-59	6.278332783772691E-5
60-64	9.087060608092052E-5
65-69	0.019356265191654988
70-74	7.930525621607609E-5
75-79	6.608772334046643E-5
80-84	5.2870203130872644E-5
85-89	5.2044140171821E-5
90-94	1.2556697516517365E-4
95-99	2.2882985170503847E-4
100-104	8.674090933997941E-5
105-109	1.272206635304405E-4
110-114	9.748132301222013E-5
115-119	4.874098524118837E-5
120-124	8.839545170868903E-5
125-129	1.230941432930165E-4
130-134	4.29597606249092E-5
135-139	2.891642847309501E-5
140-144	3.30578343009444E-5
145-149	6.897575454281259E-5
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
74-75	2.0
76-77	4.0
78-79	3.0
80-81	5.0
82-83	8.0
84-85	5.0
86-87	6.0
88-89	12.0
90-91	16.0
92-93	18.0
94-95	25.0
96-97	32.0
98-99	33.0
100-101	50.0
102-103	52.0
104-105	56.0
106-107	38.0
108-109	58.0
110-111	60.0
112-113	52.0
114-115	67.0
116-117	78.0
118-119	86.0
120-121	87.0
122-123	113.0
124-125	105.0
126-127	128.0
128-129	147.0
130-131	180.0
132-133	262.0
134-135	356.0
136-137	653.0
138-139	2060.0
140-141	4890.0
142-143	7288.0
144-145	65518.0
146-147	752006.0
148-149	1028058.0
150-151	2.2347632E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	44.08654227298499
#Duplication Level	Percentage of total
1	31.9198639372617
2	11.084795361823248
3	6.751724887601787
4	4.597884805458509
5	3.607146948145407
6	2.9361158450605767
7	2.391262836949495
8	1.988888144785841
9	1.7502705901697346
>10	20.378833953413615
>50	5.2609843540330585
>100	6.1024404269752495
>500	0.6732349993605506
>1k	0.5351647265745442
>5k	0.021388182386571662
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	8.260964189174593E-6	8.260964189174593E-6	0.0	0.0	1.197839807430316E-4	0.0
2	8.260964189174593E-6	1.4456687331055538E-4	0.0	0.0	0.0016356709094565694	1.2391446283761889E-5
3	8.260964189174593E-6	1.4456687331055538E-4	0.0	0.0	0.002635247576346695	1.6521928378349185E-5
4	3.304385675669837E-5	1.5695831959431728E-4	0.0	0.0	0.004101568719925185	2.8913374662111075E-5
5	3.717433885128567E-5	1.5695831959431728E-4	0.0	8.260964189174593E-6	0.005192015992896232	3.717433885128567E-5
6	4.9565785135047556E-5	1.5695831959431728E-4	0.0	8.260964189174593E-6	0.006100722053705437	4.1304820945872964E-5
7	5.369626722963485E-5	1.9000217635101565E-4	0.0	8.260964189174593E-6	0.007178777880392721	4.543530304046026E-5
8	8.674012398633323E-5	1.9413265844560294E-4	0.0	8.260964189174593E-6	0.009268801820253893	4.9565785135047556E-5
9	1.1152301655385701E-4	1.9413265844560294E-4	0.0	8.260964189174593E-6	0.01257318749592373	4.9565785135047556E-5
10-11	1.672845248307855E-4	2.0239362263477752E-4	0.0	1.0326205236468241E-5	0.01747606974219885	8.467488293903959E-5
12-13	2.0032838158748388E-4	2.0652410472936483E-4	0.0	1.2391446283761889E-5	0.021561116533745685	1.0945777550656335E-4
14-15	2.0858934577665846E-4	2.1065458682395212E-4	0.0	1.6521928378349185E-5	0.026013776231710792	1.280449449322062E-4
16-17	2.2924175624959494E-4	2.2924175624959494E-4	0.0	2.0652410472936482E-5	0.030175236942007494	1.3217542702679348E-4
18-19	2.478289256752378E-4	2.3750272043876954E-4	0.0	2.0652410472936482E-5	0.03364690714250812	1.3424066807408714E-4
20-21	2.829380234792298E-4	2.99459951857579E-4	0.0	2.0652410472936482E-5	0.03681705215010386	1.4456687331055538E-4
22-23	3.1391663918863455E-4	3.077209160467536E-4	0.0	2.0652410472936482E-5	0.040548942722563486	1.5902356064161093E-4
24-25	3.738086295601503E-4	3.242428444251028E-4	4.130482094587296E-6	2.0652410472936482E-5	0.04478268686951547	1.631540427361982E-4
26-27	4.564182714518962E-4	3.34569049661571E-4	4.130482094587296E-6	2.4782892567523778E-5	0.04916512837187259	2.065241047293648E-4
28-29	4.956578513504756E-4	3.34569049661571E-4	4.130482094587296E-6	2.6848133614817426E-5	0.05331213239483824	2.354374793914759E-4
30-31	5.328321902017613E-4	3.34569049661571E-4	4.130482094587296E-6	2.8913374662111075E-5	0.057667725763580535	2.7674230033734886E-4
32-33	5.762022521949279E-4	3.386995317561583E-4	4.130482094587296E-6	3.304385675669837E-5	0.061932448526241926	3.34569049661571E-4
34-35	6.133765910462135E-4	3.386995317561583E-4	4.130482094587296E-6	4.1304820945872964E-5	0.06536074866474938	3.428300138507456E-4
36-37	6.257680373299753E-4	3.386995317561583E-4	4.130482094587296E-6	5.16310261823412E-5	0.06875393970545285	3.469604959453329E-4
38-39	6.464204478029119E-4	3.386995317561583E-4	4.130482094587296E-6	7.021819560798405E-5	0.07311779403838432	3.5315621908721384E-4
40-41	6.856600277014912E-4	3.386995317561583E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.07658946423888495	3.6967814746556306E-4
42-43	7.001167150325467E-4	3.428300138507456E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.07980297930847385	3.8826531689120587E-4
44-45	7.455520180730071E-4	3.5728670118180116E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.08415031171302699	4.0065676317496777E-4
46-47	7.930525621607609E-4	3.75873870607444E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.08830557670018181	4.130482094587296E-4
48-49	8.15770213680991E-4	3.800043527020313E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.09220681703851952	4.2543965574249156E-4
50-51	8.384878652012212E-4	3.9033055793849953E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.0958870765847968	4.3989634307354706E-4
52-53	8.963146145254434E-4	3.9652628108038045E-4	4.130482094587296E-6	7.847915979715864E-5	0.09941657353462163	4.419615841208407E-4
54-55	9.417499175659037E-4	3.985915221276741E-4	4.130482094587296E-6	8.054440084445228E-5	0.10216334412752219	4.419615841208407E-4
56-57	9.768590153698955E-4	4.0891772736414235E-4	4.130482094587296E-6	8.260964189174593E-5	0.1055400132398473	4.5022254831001535E-4
58-59	0.0010016419079374194	4.233744146951979E-4	4.130482094587296E-6	9.293584712821417E-5	0.10938342682886079	4.543530304046026E-4
60-61	0.0010305552825995304	4.3989634307354706E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.11268161678138874	4.543530304046026E-4
62-63	0.001067729621450816	4.5848351249918993E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.1160128505906734	4.5848351249918993E-4
64-65	0.0011069692013493955	4.6054875354648354E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.12037257444151028	4.626139945937772E-4
66-67	0.0011482740222952684	4.915273692558883E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.12373685210755164	4.626139945937772E-4
68-69	0.0012308836641870143	4.977230923977692E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.12653938420872912	4.915273692558883E-4
70-71	0.001344471921788165	5.059840565869438E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.12910028310737326	5.018535744923565E-4
72-73	0.0013940377069232126	5.163102618234121E-4	4.130482094587296E-6	9.500108817550782E-5	0.13205564304605044	5.039188155396501E-4
74-75	0.001408494394254268	5.183755028707058E-4	4.130482094587296E-6	1.0326205236468242E-4	0.13488295803979547	5.039188155396501E-4
76-77	0.0014312120457744982	5.328321902017613E-4	4.130482094587296E-6	1.0326205236468242E-4	0.13712374457610907	5.039188155396501E-4
78-79	0.0014477339741528475	5.369626722963486E-4	4.130482094587296E-6	1.3424066807408714E-4	0.13927159526529445	5.121797797288248E-4
80-81	0.0014869735540514266	5.410931543909359E-4	4.130482094587296E-6	1.3630590912138077E-4	0.14182216795870212	5.204407439179993E-4
82-83	0.0015158869287135376	5.410931543909359E-4	4.130482094587296E-6	1.3837115016867443E-4	0.1442364347429884	5.245712260125866E-4
84-85	0.0016005618116525775	5.452236364855231E-4	4.130482094587296E-6	1.404363912159681E-4	0.14635330681646438	5.245712260125866E-4
86-87	0.0016790409714497359	5.534846006746977E-4	4.130482094587296E-6	1.4456687331055538E-4	0.1483256120166298	5.287017081071739E-4
88-89	0.0017306719976320772	5.555498417219914E-4	4.130482094587296E-6	1.4869735540514267E-4	0.15029791721679525	5.287017081071739E-4
90-91	0.0017699115775306564	5.63810805911166E-4	4.130482094587296E-6	1.507625964524363E-4	0.15281338081239892	5.390279133436422E-4
92-93	0.0018339340499967595	5.700065290530469E-4	4.130482094587296E-6	1.5282783749972996E-4	0.1554816722455023	5.431583954382294E-4
94-95	0.001920674173983093	5.741370111476342E-4	4.130482094587296E-6	1.5282783749972996E-4	0.15848246748722	5.452236364855231E-4
96-97	0.0019908923695910767	5.762022521949279E-4	4.130482094587296E-6	1.5282783749972996E-4	0.1606241224532635	5.452236364855231E-4
98-99	0.0020900239398611723	5.782674932422215E-4	4.130482094587296E-6	1.5489307854702362E-4	0.16235685969194286	5.452236364855231E-4
100-101	0.0021746988228002117	5.823979753368088E-4	4.130482094587296E-6	1.5695831959431728E-4	0.16433329537420288	5.493541185801104E-4
102-103	0.0022036121974623227	5.844632163841025E-4	4.130482094587296E-6	1.5695831959431728E-4	0.16585537802605832	5.493541185801104E-4
104-105	0.002238721295266315	5.92724180573277E-4	4.130482094587296E-6	1.6521928378349185E-4	0.16740637405257583	5.493541185801104E-4
106-107	0.002271765152023013	6.009851447624517E-4	4.130482094587296E-6	1.6521928378349185E-4	0.16903171875679593	5.514193596274041E-4
108-109	0.0023151352140161796	6.113113499989198E-4	4.130482094587296E-6	1.6521928378349185E-4	0.1706260848453066	5.534846006746977E-4
110-111	0.002356440034962053	6.154418320935072E-4	8.260964189174593E-6	1.6521928378349185E-4	0.17211718888145264	5.555498417219914E-4
112-113	0.0024039405790498066	6.175070731408008E-4	8.260964189174593E-6	1.6521928378349185E-4	0.17362688008702432	5.57615082769285E-4
114-115	0.002436984435806505	6.237027962826818E-4	8.260964189174593E-6	1.672845248307855E-4	0.17526255099648086	5.596803238165787E-4
116-117	0.0024762240157050843	6.319637604718564E-4	8.260964189174593E-6	1.7348024797266646E-4	0.17689409142384285	5.617455648638724E-4
118-119	0.0025361160060766	6.546814119920866E-4	8.260964189174593E-6	1.7761073006725375E-4	0.17836660829056322	5.617455648638724E-4
120-121	0.002600138478542703	6.608771351339674E-4	8.260964189174593E-6	1.7761073006725375E-4	0.17969455828397304	5.617455648638724E-4
122-123	0.0026806828793871553	6.629423761812611E-4	8.260964189174593E-6	1.7761073006725375E-4	0.18112990081184213	5.617455648638724E-4
124-125	0.002763292521278901	6.650076172285547E-4	8.260964189174593E-6	1.796759711145474E-4	0.18250122086724513	5.658760469584596E-4
126-127	0.0028045973422247744	6.670728582758484E-4	8.260964189174593E-6	1.8380645320913467E-4	0.18379819224494554	5.658760469584596E-4
128-129	0.002852097886312528	6.69138099323142E-4	8.260964189174593E-6	1.9413265844560294E-4	0.18511168555102428	5.658760469584596E-4
130-131	0.0029161203587786313	6.69138099323142E-4	8.260964189174593E-6	1.9619789949289657E-4	0.18638593927720445	5.679412880057532E-4
132-133	0.0029925342775284965	6.732685814177294E-4	8.260964189174593E-6	1.9826314054019023E-4	0.1875342132994997	5.741370111476342E-4
134-135	0.0031040572940823534	6.732685814177294E-4	8.260964189174593E-6	1.9826314054019023E-4	0.18863498677770724	5.741370111476342E-4
136-137	0.0032672113368185517	6.98051473985253E-4	8.260964189174593E-6	1.9826314054019023E-4	0.1896841292297324	5.741370111476342E-4
138-139	0.0032754723010077263	7.45552018073007E-4	8.260964189174593E-6	1.9826314054019023E-4	0.1907002278250009	5.741370111476342E-4
>>END_MODULE
