##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.4d.S.1.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24211874
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	71-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.390501990882655	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.72911196382403	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.877413247731255	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.84092524188751	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.70765224534045	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.69040252728888	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.70117439071424	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.840675323190595	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
9	34.824338752134594	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.79762727990406	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
15-19	34.80079448620953	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.803159804978336	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.80105379699233	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.77920152731672	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.775785525730065	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.703630127928136	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.60676384653249	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
50-54	34.56796105084637	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
55-59	34.56274890576417	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
60-64	34.52876366364702	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
65-69	34.513160187435304	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.48434266881892	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.46665756174661	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.43629346885793	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.4194917807564	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.391624806506556	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.35637917035734	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.31916635351117	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.26553403257584	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.233824203194665	35.0	34.0	37.0	29.4	39.0
115-119	34.18564867206008	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
120-124	34.14682306386395	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
125-129	34.09411899844398	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.046334836938954	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	33.99536073391199	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	33.96927604049928	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	33.980437120546405	35.0	34.0	37.0	28.4	39.0
150	34.928309994511466	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	20.0
22	324.0
23	3859.0
24	25378.0
25	97875.0
26	239736.0
27	420467.0
28	603604.0
29	776569.0
30	965012.0
31	1199907.0
32	1519584.0
33	1973971.0
34	2682977.0
35	4096602.0
36	8233700.0
37	1372287.0
38	2.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.75975985997614	11.032706514167387	15.380015607218178	37.827518018638294
2	23.21250832288838	12.602578398913556	35.71879088778316	28.466122390414906
3	21.79131362175641	17.006882122205962	27.744345819237452	33.457458436800174
4	27.02762088383045	24.44069045332781	21.836223163514777	26.695465499326964
5	26.954351800423133	30.074929381727898	23.91349133631347	19.0572274815355
6	20.057637054244708	35.992388852485696	25.349813139059357	18.60016095421024
7	16.96488857763616	24.315124222714875	39.52700654341125	19.19298065623772
8	19.314243944885494	24.09109986904757	30.958461407692745	25.63619477837419
9	20.215496157728076	22.991166266662763	32.04825720235222	24.745080373256943
10-14	21.09690131933586	28.56499582555363	26.631287657877245	23.706815197233265
15-19	21.349203457398488	27.486686883971345	27.27144307545447	23.892666583175696
20-24	21.272045285781154	27.565163997334132	27.183712299468404	23.979078417416314
25-29	21.22520151523854	27.751062191109703	26.889799209325766	24.133937084325993
30-34	21.21302843779954	27.54309817225213	27.094013201002472	24.14986018894586
35-39	21.509180253148024	27.296868616064646	26.99199723359652	24.20195389719081
40-44	21.651098066629846	27.393767509517392	26.83194962986819	24.123184793984567
45-49	21.89222943539693	27.321497550902535	26.725707601188315	24.060565412512215
50-54	21.871153130591683	27.53478654336722	26.657201283361253	23.936859042679846
55-59	21.796397255289076	27.499691906092398	26.725281069658763	23.97862976895976
60-64	21.982832661915932	27.327501959766405	26.544485873346908	24.14517950497076
65-69	21.847052075918473	27.42846257017107	26.727642955558295	23.99684239835216
70-74	22.182387896933815	27.211806218972235	26.64962207242738	23.956183811666566
75-79	22.050855037488716	27.07417668981976	26.66182142435536	24.21314684833616
80-84	22.29142934403993	27.08273445096513	26.665486083658895	23.960350121336045
85-89	22.17337818556462	27.087256933654498	26.66250383295893	24.076861047821954
90-94	22.183075991574377	26.851868663458152	26.656615700221636	24.308439644745835
95-99	22.378997450710166	26.868734389098094	26.835176102488635	23.917092057703105
100-104	22.34175378471847	26.71171294298046	26.87756995578465	24.06896331651642
105-109	22.41109445686056	26.668219105321178	26.7781038412944	24.142582596523866
110-114	22.367689617344997	26.72836701740034	26.767695049535114	24.13624831571955
115-119	22.48550514588283	26.866812556239918	26.70133244360024	23.94634985427702
120-124	22.404516009021272	26.740333529076093	26.692761148766753	24.162389313135886
125-129	22.776269416105794	26.691586418246892	26.615294923108802	23.91684924253851
130-134	22.523947988139003	26.962391096063325	26.496895017161435	24.016765898636233
135-139	22.61212950577742	26.800873628329803	26.5373581580629	24.049638707829875
140-144	22.610439219153605	26.6134104643319	26.78357857823242	23.992571738282074
145-149	22.07034180856387	26.704710022403837	27.086398010003563	24.13855015902873
150	21.797345885286315	25.353875331499125	27.84988650483216	24.9988922783824
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.5
6	0.5
7	0.0
8	1.0
9	1.0
10	1.5
11	4.0
12	5.5
13	8.0
14	20.5
15	48.0
16	94.0
17	223.5
18	530.5
19	921.0
20	1520.5
21	2490.0
22	4021.0
23	6508.0
24	10500.5
25	16311.5
26	23455.0
27	34007.0
28	51792.5
29	76373.5
30	104570.0
31	132385.0
32	159442.5
33	192206.0
34	228009.5
35	274256.0
36	342261.5
37	415290.5
38	490026.5
39	598428.0
40	744800.5
41	905333.5
42	1075109.5
43	1243794.0
44	1390378.0
45	1502157.0
46	1574825.5
47	1589756.0
48	1541466.5
49	1481934.0
50	1388738.0
51	1236232.0
52	1049869.0
53	879513.5
54	732130.0
55	602952.5
56	506632.5
57	414891.5
58	342008.0
59	279114.5
60	209793.0
61	143332.5
62	85727.5
63	50274.0
64	32085.0
65	19152.5
66	12347.5
67	5955.5
68	2335.0
69	1134.5
70	927.5
71	697.5
72	367.0
73	156.0
74	94.5
75	73.0
76	41.0
77	30.5
78	18.5
79	2.0
80	2.5
81	2.0
82	0.5
83	0.0
84	0.5
85	0.5
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.1151553159412608E-4
3	4.5432253612421735E-5
4	5.369266336013478E-5
5	4.130204873856522E-5
6	7.847389260327392E-5
7	1.5694778520654784E-4
8	1.1564573646798261E-4
9	1.1151553159412608E-4
10-14	1.676863178785748E-4
15-19	3.064612016401539E-4
20-24	2.2137898123870956E-4
25-29	3.395028406310061E-4
30-34	8.161284830740488E-4
35-39	9.144273590718339E-4
40-44	0.0010565064067324982
45-49	9.094711132232061E-4
50-54	5.823588872137696E-4
55-59	4.138465283604235E-4
60-64	2.4698625145662E-4
65-69	3.3124243088329306E-4
70-74	3.7419658320852063E-4
75-79	2.891144820739976E-4
80-84	3.2546053119487153E-4
85-89	4.022830180808457E-4
90-94	3.799806312307634E-4
95-99	3.039855244736598E-4
100-104	4.5598038471511126E-4
105-109	2.841632030559043E-4
110-114	2.436879835249741E-4
115-119	2.379077637877916E-4
120-124	2.4286736547262714E-4
125-129	1.3382715774834088E-4
130-134	1.6522364329517376E-4
135-139	1.5532086187777585E-4
140-144	1.8100584052950706E-4
145-149	1.4574621434107197E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
70-71	1.0
72-73	3.0
74-75	5.0
76-77	5.0
78-79	5.0
80-81	9.0
82-83	13.0
84-85	17.0
86-87	12.0
88-89	17.0
90-91	26.0
92-93	28.0
94-95	33.0
96-97	35.0
98-99	41.0
100-101	54.0
102-103	58.0
104-105	52.0
106-107	42.0
108-109	56.0
110-111	70.0
112-113	78.0
114-115	97.0
116-117	100.0
118-119	139.0
120-121	128.0
122-123	138.0
124-125	165.0
126-127	212.0
128-129	274.0
130-131	304.0
132-133	465.0
134-135	614.0
136-137	1057.0
138-139	2518.0
140-141	6180.0
142-143	9542.0
144-145	71398.0
146-147	776421.0
148-149	1472249.0
150-151	2.1869213E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.858906796237875
#Duplication Level	Percentage of total
1	34.37608435020623
2	8.8068068139501
3	5.200781956830552
4	3.5560580244696745
5	2.6167573083183187
6	2.1502098178300155
7	1.6877300845123386
8	1.5051517476266512
9	1.2729140783125579
>10	16.25139099230484
>50	5.394097034511935
>100	10.269231959380708
>500	3.2412389192168973
>1k	3.24470575651081
>5k	0.3330109441086423
>10k+	0.09383021190983955
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	1.2390614621569566E-5	0.0	0.0	3.5106741427780433E-4	2.8911434116995652E-5
2	1.2390614621569566E-5	5.7822868233991304E-5	0.0	1.6520819495426086E-5	0.002515294768178622	4.130204873856522E-5
3	3.304163899085217E-5	7.021348285556087E-5	0.0	1.6520819495426086E-5	0.004881902160898409	6.195307310784783E-5
4	1.1151553159412609E-4	8.260409747713044E-5	0.0	2.065102436928261E-5	0.007087431563537791	6.608327798170434E-5
5	1.321665559634087E-4	8.673430235098695E-5	0.0	2.065102436928261E-5	0.008351274254937887	6.608327798170434E-5
6	1.9411962907125651E-4	8.673430235098695E-5	0.0	2.065102436928261E-5	0.010300730955398166	6.608327798170434E-5
7	2.3955188268367828E-4	1.321665559634087E-4	0.0	2.065102436928261E-5	0.01189912024158064	6.608327798170434E-5
8	3.758486435209435E-4	1.3629676083726523E-4	0.0	2.065102436928261E-5	0.016074757369049585	6.608327798170434E-5
9	4.543225361242174E-4	1.4042696571112175E-4	0.0	2.065102436928261E-5	0.019176541229315832	7.021348285556087E-5
10-11	5.2247091654285E-4	1.4455717058497826E-4	0.0	2.4781229243139132E-5	0.03381605240470027	9.292960966177174E-5
12-13	5.947495018353391E-4	1.4662227302190652E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.043924728833464106	1.1771083890491088E-4
14-15	6.794187017493978E-4	1.5694778520654784E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.05104520203599275	1.259712486526239E-4
16-17	7.558274919157435E-4	1.6107799008040436E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.05561320862647807	1.2803635108955217E-4
18-19	9.189705844330761E-4	1.734686047019739E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.05923126809597638	1.2803635108955217E-4
20-21	0.001290689023080163	2.0238003881896957E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.062091434971122024	1.3423165840033697E-4
22-23	0.0016913188958442458	2.0238003881896957E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.0649247555145876	1.4455717058497826E-4
24-25	0.001860657295672363	2.065102436928261E-4	0.0	3.304163899085217E-5	0.06773742503368388	1.4868737545883478E-4
26-27	0.001984563441888059	2.065102436928261E-4	0.0	3.923694630163696E-5	0.07017631101169616	1.6520819495426087E-4
28-29	0.0021642273539008174	2.106404485666826E-4	0.0	4.3367151175493476E-5	0.07292496235524767	1.693383998281174E-4
30-31	0.0025648572266648998	2.1477065344053912E-4	0.0	4.7497356049350006E-5	0.07606391805937864	1.9205452663432826E-4
32-33	0.0027631070606100134	2.1477065344053912E-4	0.0	5.162756092320652E-5	0.07912026966603246	2.3129147293596524E-4
34-35	0.002891143411699565	2.1477065344053912E-4	0.0	6.608327798170434E-5	0.0818627257022732	2.3955188268367828E-4
36-37	0.0029345105628750586	2.168357558774674E-4	0.0	7.640879016634566E-5	0.0841797706365067	2.3955188268367828E-4
38-39	0.0029489662799335563	2.271612680621087E-4	0.0	9.086450722484348E-5	0.0867962554240948	2.436820875575348E-4
40-41	0.0029943985335459783	2.271612680621087E-4	0.0	9.086450722484348E-5	0.08939828449462442	2.478122924313913E-4
42-43	0.0030047240457306197	2.271612680621087E-4	0.0	9.086450722484348E-5	0.09192390477498769	2.478122924313913E-4
44-45	0.0030253750700999023	2.3335657537289347E-4	0.0	9.086450722484348E-5	0.09459821243080978	2.519424973052478E-4
46-47	0.0030563516066538263	2.3542167780982173E-4	0.0	9.086450722484348E-5	0.09924675801633528	2.519424973052478E-4
48-49	0.0030893932456446784	2.3748678024675E-4	0.0	9.705981453562827E-5	0.10204910202324693	2.5400759974217606E-4
50-51	0.00312243488463553	2.45747189994463E-4	0.0	9.912491697255653E-5	0.104954701152005	2.643331119268174E-4
52-53	0.003163736933374096	2.478122924313913E-4	0.0	1.0738532672026956E-4	0.10754433960791304	2.643331119268174E-4
54-55	0.003198843674801876	2.478122924313913E-4	0.0	1.0945042915719782E-4	0.1093100021914867	2.684633168006739E-4
56-57	0.003287643079589791	2.5400759974217606E-4	0.0	1.1151553159412609E-4	0.11140814626740582	2.705284192376022E-4
58-59	0.0033537263575714954	2.705284192376022E-4	0.0	1.1358063403105435E-4	0.11350835544576185	2.7259352167453046E-4
60-61	0.0034631767867286936	2.849841362961E-4	0.0	1.1564573646798261E-4	0.11557139278025319	2.808539314222435E-4
62-63	0.003520999654962685	2.849841362961E-4	0.0	1.1564573646798261E-4	0.11808255734355796	2.808539314222435E-4
64-65	0.003535455372021183	2.891143411699565E-4	0.0	1.1771083890491088E-4	0.12084566440416797	2.808539314222435E-4
66-67	0.003554041293953537	3.0357005822845436E-4	0.0	1.1977594134183914E-4	0.12330107120167567	2.829190338591717E-4
68-69	0.003568497011012035	3.1802577528695214E-4	0.0	1.2390614621569565E-4	0.1252319419802036	2.9324454604381304E-4
70-71	0.0035912131378182457	3.3041638990852175E-4	0.0	1.321665559634087E-4	0.12734454177318122	2.994398533545978E-4
72-73	0.0036366453914306674	3.428070045300913E-4	0.0	1.3629676083726523E-4	0.1290978137421333	3.015049557915261E-4
74-75	0.0036490360060522373	3.469372094039478E-4	0.0	1.3629676083726523E-4	0.13078293733066676	3.015049557915261E-4
76-77	0.003663491723110735	3.531325167147326E-4	0.0	1.383618632741935E-4	0.13216242575853482	3.015049557915261E-4
78-79	0.003690338054790802	3.5726272158858913E-4	0.0	1.6107799008040436E-4	0.13365342971799704	3.015049557915261E-4
80-81	0.003725444796218583	3.593278240255174E-4	0.0	1.6107799008040436E-4	0.13517334511157625	3.097653655392391E-4
82-83	0.003744030718150937	3.593278240255174E-4	0.0	1.6107799008040436E-4	0.13690390095372212	3.097653655392391E-4
84-85	0.0037873978693264304	3.7171843864708696E-4	0.0	1.6314309251733261E-4	0.13869640986897586	3.138955704130957E-4
86-87	0.0038286999180649956	3.758486435209435E-4	0.0	1.6520819495426087E-4	0.14026175751616748	3.138955704130957E-4
88-89	0.0038638066594927764	3.758486435209435E-4	0.0	1.693383998281174E-4	0.1417899333194944	3.138955704130957E-4
90-91	0.0038989134009205567	3.8204395083172823E-4	0.0	1.693383998281174E-4	0.1439190539319674	3.138955704130957E-4
92-93	0.003929889937474481	3.861741557055848E-4	0.0	1.693383998281174E-4	0.14590774757872935	3.138955704130957E-4
94-95	0.003975322191086902	3.9030436057944126E-4	0.0	1.693383998281174E-4	0.1474235327674347	3.1596067285002396E-4
96-97	0.004043470571505534	3.9236946301636955E-4	0.0	1.693383998281174E-4	0.14880921650261356	3.221559801608087E-4
98-99	0.004130204873856522	4.0476007763793915E-4	0.0	1.734686047019739E-4	0.14995534835510874	3.221559801608087E-4
100-101	0.004266501634693787	4.0889028251179567E-4	0.0	1.8379411688661522E-4	0.1512295165586935	3.24221082597737E-4
102-103	0.004297478171247711	4.0889028251179567E-4	0.0	1.9205452663432826E-4	0.15234054166976088	3.2628618503466523E-4
104-105	0.004336715117549348	4.0889028251179567E-4	0.0	1.9411962907125651E-4	0.15345776208813905	3.2628618503466523E-4
106-107	0.004371821858977129	4.212808971333652E-4	0.0	1.9824983394511306E-4	0.15454607107240026	3.2628618503466523E-4
108-109	0.004411058805278765	4.212808971333652E-4	0.0	2.168357558774674E-4	0.15561372903229215	3.2628618503466523E-4
110-111	0.004473011878386612	4.212808971333652E-4	0.0	2.1890085831439567E-4	0.15672062393848574	3.2835128747159346E-4
112-113	0.004580397205106883	4.212808971333652E-4	0.0	2.1890085831439567E-4	0.15786262558610706	3.3041638990852175E-4
114-115	0.004634089868467018	4.212808971333652E-4	0.0	2.2096596075132393E-4	0.15901495274591304	3.3041638990852175E-4
116-117	0.004691912736701009	4.2747620444414996E-4	0.0	2.271612680621087E-4	0.15989468638404447	3.3041638990852175E-4
118-119	0.0047724517317412115	4.4193192150264785E-4	0.0	2.3335657537289347E-4	0.1607888757392344	3.3041638990852175E-4
120-121	0.004886032365772265	4.501923312503609E-4	0.0	2.3955188268367828E-4	0.16174295306509526	3.3041638990852175E-4
122-123	0.005055370765600383	4.501923312503609E-4	0.0	2.45747189994463E-4	0.16264127262515904	3.3041638990852175E-4
124-125	0.005162756092320652	4.5225743368728917E-4	0.0	2.478122924313913E-4	0.16348383441942577	3.3041638990852175E-4
126-127	0.00519992793618536	4.543225361242174E-4	0.0	2.478122924313913E-4	0.16436150295512028	3.3041638990852175E-4
128-129	0.005245360189797783	4.543225361242174E-4	0.0	2.478122924313913E-4	0.16521439026157164	3.3041638990852175E-4
130-131	0.0053692663360134785	4.543225361242174E-4	0.0	2.5607270217910434E-4	0.16599499898273054	3.3041638990852175E-4
132-133	0.005445675126179824	4.5638763856114563E-4	4.1302048738565215E-6	2.6020290705296086E-4	0.1667157197332185	3.3041638990852175E-4
134-135	0.005548930248026237	4.584527409980739E-4	4.1302048738565215E-6	2.6020290705296086E-4	0.16756860703966986	3.3248149234545003E-4
136-137	0.005674901496678861	4.6464804830885866E-4	4.1302048738565215E-6	2.6020290705296086E-4	0.16836160637545033	3.4074190209316306E-4
138-139	0.005679031701552717	4.729084580565717E-4	4.1302048738565215E-6	2.6020290705296086E-4	0.16922894939896022	3.448721069670195E-4
>>END_MODULE
