##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SnRK1a1OE.control.4d.S.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	22996710
Total Bases	3.4 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	73-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.46299114090668	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.79088413081697	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.95378699822714	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.9209722608147	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.78574900496636	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.763960062113235	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.768249762683446	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.92095543232054	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.89701048541291	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.876184271576236	35.0	34.0	37.4	31.2	39.0
15-19	34.87910396748057	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.88324458585598	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.87896071220622	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.861343905280364	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.85519714776592	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.78785708042585	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.6918652537689	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.65365555333785	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.65050518095849	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.61872459147418	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
65-69	34.60144465012604	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.574701251957435	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.556912441803775	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.52900321758363	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.51338410325858	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.48448657071303	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.45109606622789	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.41312744640931	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.35984617765344	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.329286121830066	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.284599087775035	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.244790928136936	35.0	34.0	37.0	29.4	39.0
125-129	34.19236787073724	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.14534368557127	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.09609431814622	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.06857070417087	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.07886991757688	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	35.00385929418841	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	11.0
22	270.0
23	3233.0
24	20949.0
25	82814.0
26	206563.0
27	372465.0
28	545178.0
29	706435.0
30	885764.0
31	1105919.0
32	1406201.0
33	1839148.0
34	2512556.0
35	3810192.0
36	7966300.0
37	1532701.0
38	11.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.194229522396896	10.528497337227803	15.39100593084837	37.88626720952693
2	23.13972277737482	12.118879768731833	35.83548581795285	28.90591163594049
3	21.997413106535525	16.634712074930764	27.554398577708668	33.81347624082504
4	27.312179573590996	24.185900585736213	21.682180486765493	26.819739353907302
5	27.087634675868223	29.90048657424527	23.748376723334516	19.263502026551986
6	20.261027164478083	35.79167294836861	25.142499874003587	18.80480001314972
7	17.119171977616066	24.3217312347747	39.24954274907505	19.30955403853418
8	19.495590821408317	23.878587380869256	30.75777393500203	25.8680478627204
9	20.21786178793557	22.76741131006245	32.0672018451351	24.94752505686688
10-14	21.225640983048457	28.316302678444433	26.58415964503381	23.873896693473302
15-19	21.44890203747582	27.32355999295723	27.19736765034511	24.03017031922184
20-24	21.381237850954196	27.389773350584534	27.121990139264557	24.106998659196712
25-29	21.343579688965146	27.578236196280205	26.80030944696951	24.277874667785138
30-34	21.312925366193625	27.354349305801158	27.050695390330766	24.282029937674455
35-39	21.644399991250832	27.079926560912188	26.942413299639473	24.333260148197507
40-44	21.821545250125535	27.195221469340936	26.72712696390203	24.2561063166315
45-49	22.080911005668867	27.18797958435023	26.614436055333	24.1166733546479
50-54	22.065020592552102	27.423358690219796	26.514672616262008	23.996948100966097
55-59	21.95730764346436	27.400640153661648	26.596229192731748	24.045823010142247
60-64	22.15337345088634	27.229418830747793	26.396909755143383	24.220297963222485
65-69	21.97010150840133	27.331650351122622	26.61629710192773	24.081951038548315
70-74	22.360557074642802	27.112156558932483	26.509151710091793	24.018134656332922
75-79	22.199731110281597	26.976266332614387	26.516986190304202	24.307016366799814
80-84	22.449399440880914	27.01334209196005	26.539079014259304	23.99817945289973
85-89	22.33036574725025	27.00994597522036	26.52603356509207	24.13365471243732
90-94	22.303507880581858	26.796502179204335	26.513579280712328	24.386410659501475
95-99	22.515052690690123	26.791380796136156	26.73174116492241	23.96182534825131
100-104	22.474884587054017	26.63439399066034	26.754840999242617	24.135880423043027
105-109	22.53655366527422	26.62585402106408	26.656345920985657	24.181246392676044
110-114	22.487215314586663	26.680001248557005	26.671741603873755	24.161041832982573
115-119	22.567979211941264	26.8690439132225	26.575105468909264	23.987871405926967
120-124	22.492198199275094	26.70889215334223	26.593394992584013	24.20551465479867
125-129	22.909432464503567	26.64038017794651	26.511176592019503	23.93901076553042
130-134	22.617342226199256	26.940021461813433	26.398767215150404	24.043869096836907
135-139	22.705591780725715	26.749641853609273	26.461710412995355	24.08305595266966
140-144	22.663341294004162	26.58159173047172	26.758389818936152	23.996677156587964
145-149	22.083753358375006	26.86270261166438	26.985421429406415	24.068122600554204
150	21.80986518646373	25.39496724077988	27.726682034809848	25.068485537946543
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.5
10	1.0
11	1.5
12	4.0
13	11.5
14	22.5
15	44.0
16	87.5
17	201.0
18	485.0
19	895.5
20	1436.5
21	2256.0
22	3708.5
23	6006.0
24	9572.5
25	14667.5
26	20975.0
27	30367.0
28	46753.0
29	68965.0
30	94142.0
31	119137.5
32	144022.0
33	173850.0
34	206384.0
35	248583.0
36	311165.5
37	379398.5
38	446632.5
39	543297.0
40	676538.5
41	826943.5
42	985246.0
43	1141784.0
44	1282426.0
45	1391767.5
46	1470263.0
47	1498252.5
48	1461745.5
49	1419160.5
50	1344289.5
51	1204076.5
52	1029014.0
53	871743.0
54	733906.5
55	609905.0
56	517577.5
57	423539.5
58	349373.0
59	288494.5
60	219817.0
61	153899.5
62	93173.5
63	53429.5
64	33356.0
65	19698.0
66	12480.0
67	5880.0
68	2329.0
69	1180.5
70	954.5
71	687.0
72	338.0
73	146.5
74	90.5
75	66.5
76	41.0
77	26.0
78	12.5
79	2.5
80	2.5
81	2.0
82	0.5
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.3045344312295106E-4
3	6.522672156147553E-5
4	4.3484481040983684E-5
5	6.087827345737716E-5
6	1.0001430639426248E-4
7	1.6089257985163965E-4
8	1.0001430639426248E-4
9	8.696896208196737E-5
10-14	1.7828637226803313E-4
15-19	3.0004291918278743E-4
20-24	2.0872550899672172E-4
25-29	3.122185738742629E-4
30-34	8.740380689237721E-4
35-39	0.0010305822006713135
40-44	0.0012410470889096744
45-49	0.0010175368563590183
50-54	6.226977685068863E-4
55-59	4.6267487827606645E-4
60-64	2.6003719662508244E-4
65-69	3.113488842534432E-4
70-74	3.4178802692712176E-4
75-79	2.635160651134108E-4
80-84	3.026524723584801E-4
85-89	3.609222692840703E-4
90-94	3.565745338659838E-4
95-99	3.191786335317384E-4
100-104	4.3311058027137994E-4
105-109	2.696081999716372E-4
110-114	2.5047611988068884E-4
115-119	2.078620651687581E-4
120-124	1.9046989035013698E-4
125-129	1.3567949740417727E-4
130-134	1.591668466208774E-4
135-139	1.7918268912908976E-4
140-144	1.5488734621285427E-4
145-149	1.6405757917327873E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
72-73	2.0
74-75	4.0
76-77	6.0
78-79	10.0
80-81	14.0
82-83	17.0
84-85	6.0
86-87	16.0
88-89	15.0
90-91	26.0
92-93	24.0
94-95	31.0
96-97	22.0
98-99	40.0
100-101	44.0
102-103	35.0
104-105	41.0
106-107	44.0
108-109	56.0
110-111	47.0
112-113	65.0
114-115	81.0
116-117	84.0
118-119	105.0
120-121	112.0
122-123	117.0
124-125	185.0
126-127	182.0
128-129	236.0
130-131	276.0
132-133	386.0
134-135	552.0
136-137	889.0
138-139	2256.0
140-141	5600.0
142-143	8628.0
144-145	66374.0
146-147	734900.0
148-149	1373710.0
150-151	2.0801472E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	42.05862964020897
#Duplication Level	Percentage of total
1	32.63444887615101
2	8.774203908667554
3	5.174793493180055
4	3.5464108960719534
5	2.623896084466192
6	2.0823465978393445
7	1.7053711299896714
8	1.46245264992511
9	1.2474968217949973
>10	15.891606389427492
>50	5.3775262912606845
>100	11.263791733783176
>500	3.7632077315833943
>1k	3.9173750223760644
>5k	0.4663905268101085
>10k+	0.06868184667311929
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.348448104098369E-6	8.696896208196738E-6	0.0	0.0	2.7395223055819726E-4	1.3045344312295107E-5
2	4.348448104098369E-6	6.087827345737717E-5	0.0	1.3045344312295107E-5	0.0022916321508598403	1.7393792416393476E-5
3	4.348448104098369E-6	6.95751696655739E-5	0.0	1.3045344312295107E-5	0.004461507754804927	7.827206587377064E-5
4	3.478758483278695E-5	7.827206587377064E-5	0.0	1.3045344312295107E-5	0.006561808189084439	8.696896208196738E-5
5	3.913603293688532E-5	7.827206587377064E-5	0.0	1.7393792416393476E-5	0.007579345045443457	8.696896208196738E-5
6	5.65298253532788E-5	7.827206587377064E-5	0.0	1.7393792416393476E-5	0.009323072735186903	8.696896208196738E-5
7	7.392361776967227E-5	1.0001430639426248E-4	0.0	1.7393792416393476E-5	0.010936346981807397	8.696896208196738E-5
8	1.826348203721315E-4	1.0001430639426248E-4	0.0	1.7393792416393476E-5	0.014362924087836912	9.131741018606574E-5
9	2.0437706089262333E-4	1.0001430639426248E-4	0.0	1.7393792416393476E-5	0.017241596732750032	9.131741018606574E-5
10-11	2.522099900377054E-4	1.108854266545084E-4	0.0	1.7393792416393476E-5	0.0312001151469058	9.78400823422133E-5
12-13	3.043913672868858E-4	1.130596507065576E-4	0.0	1.7393792416393476E-5	0.04087106373042057	1.1523387475860678E-4
14-15	3.391789521196728E-4	1.130596507065576E-4	0.0	2.1742240520491845E-5	0.047982950604673454	1.2175654691475433E-4
16-17	3.739665369524597E-4	1.2175654691475433E-4	0.0	2.1742240520491845E-5	0.05242054189490584	1.3262766717500027E-4
18-19	4.6745817119057465E-4	1.3262766717500027E-4	0.0	2.1742240520491845E-5	0.05566448418056322	1.41324563383197E-4
20-21	8.153340195184442E-4	1.5436990769549208E-4	0.0	2.1742240520491845E-5	0.0585192403609038	1.4349878743524617E-4
22-23	0.0012306108134598386	1.5871835579959047E-4	0.0	2.1742240520491845E-5	0.061189187496820195	1.4567301148729535E-4
24-25	0.0013501931363225435	1.65241027955738E-4	0.0	2.6090688624590214E-5	0.06365910601994806	1.521956836434429E-4
26-27	0.001426290978144265	1.65241027955738E-4	0.0	2.6090688624590214E-5	0.065955086618912	1.565441317475413E-4
28-29	0.0015176083883303307	1.65241027955738E-4	0.0	3.261336078073777E-5	0.06850327720791366	1.6306680390368883E-4
30-31	0.0017111143289627081	1.65241027955738E-4	0.0	4.783292914508206E-5	0.07146457036680465	1.674152520077872E-4
32-33	0.0018176513075131183	1.6958947605983637E-4	0.0	5.218137724918043E-5	0.07418017620781407	2.0002861278852496E-4
34-35	0.0019263625101155774	1.6958947605983637E-4	0.0	8.044628992581982E-5	0.0770284097159985	2.0437706089262333E-4
36-37	0.001956801646844266	1.7176370011188558E-4	0.0	1.000143063942625E-4	0.07947006332644974	2.0655128494467253E-4
38-39	0.001978543887364758	1.7393792416393476E-4	0.0	1.1740809881065596E-4	0.08223350209660425	2.0872550899672172E-4
40-41	0.0020133314721975447	1.7393792416393476E-4	0.0	1.2393077096680352E-4	0.08464254234627475	2.1524818115286926E-4
42-43	0.002024202592457791	1.7393792416393476E-4	0.0	1.3045344312295106E-4	0.08706897638836164	2.1959662925696762E-4
44-45	0.00205246750513443	1.7393792416393476E-4	0.0	1.3045344312295106E-4	0.0897106586116014	2.261193014131152E-4
46-47	0.0020937777621233646	1.804605963200823E-4	0.0	1.3045344312295106E-4	0.09391778215231657	2.261193014131152E-4
48-49	0.0021220426748000043	1.826348203721315E-4	0.0	1.3262766717500027E-4	0.09641596558812109	2.261193014131152E-4
50-51	0.0021437849153204958	1.826348203721315E-4	0.0	1.3480189122704945E-4	0.09924463107983708	2.261193014131152E-4
52-53	0.0021763982761012334	1.826348203721315E-4	0.0	1.391503393311478E-4	0.1017123753789129	2.2829352546516437E-4
54-55	0.002209011636881971	1.826348203721315E-4	0.0	1.391503393311478E-4	0.10347784530917684	2.3046774951721355E-4
56-57	0.002276412582495496	1.8915749252827903E-4	0.0	1.391503393311478E-4	0.10540203359524036	2.3481619762131192E-4
58-59	0.0023220712875885287	2.0437706089262335E-4	0.0	1.41324563383197E-4	0.10739362282691742	2.3481619762131192E-4
60-61	0.0024351309382950864	2.0872550899672172E-4	0.0	1.4349878743524617E-4	0.10932215956108504	2.3481619762131192E-4
62-63	0.0025025318839086113	2.0872550899672172E-4	0.0	1.6089257985163965E-4	0.1115529134384875	2.3481619762131192E-4
64-65	0.0025242741244291033	2.0872550899672172E-4	0.0	1.7176370011188558E-4	0.1140815360110207	2.3481619762131192E-4
66-67	0.0025329710206372998	2.1742240520491844E-4	0.0	1.7393792416393476E-4	0.11633403212894367	2.3916464572541028E-4
68-69	0.002574281277626234	2.2829352546516437E-4	0.0	1.7611214821598394E-4	0.11813211541998833	2.500357659856562E-4
70-71	0.0026242884308233655	2.3046774951721355E-4	0.0	1.7828637226803313E-4	0.12012370465166539	2.522099900377054E-4
72-73	0.002656901791604103	2.369904216733611E-4	0.0	1.7828637226803313E-4	0.12162174502352727	2.5873266219385294E-4
74-75	0.0026851667042807428	2.4786154193360703E-4	0.0	1.804605963200823E-4	0.123289374871449	2.609068862459021E-4
76-77	0.0027047347207491855	2.609068862459021E-4	0.0	1.913317165803282E-4	0.1246286968875113	2.609068862459021E-4
78-79	0.0027416965296340216	2.609068862459021E-4	0.0	2.217708533090168E-4	0.12585713347691907	2.630811102979513E-4
80-81	0.0027656129942065623	2.630811102979513E-4	0.0	2.2394507736106598E-4	0.12729212135127155	2.652553343500005E-4
82-83	0.002780832562570907	2.7395223055819726E-4	0.0	2.261193014131152E-4	0.12898149343971377	2.652553343500005E-4
84-85	0.0028395366119762346	2.82649126766394E-4	0.0	2.261193014131152E-4	0.13078392517886256	2.696037824540989E-4
86-87	0.0029047633335377103	2.82649126766394E-4	0.0	2.261193014131152E-4	0.13231457891150517	2.696037824540989E-4
88-89	0.002937376694318448	2.82649126766394E-4	0.0	2.3046774951721355E-4	0.13377130902637813	2.696037824540989E-4
90-91	0.002961293158890989	2.82649126766394E-4	0.0	2.3481619762131192E-4	0.1358216023074605	2.696037824540989E-4
92-93	0.002987383847515579	2.82649126766394E-4	0.0	2.3481619762131192E-4	0.13783493377965805	2.696037824540989E-4
94-95	0.0030700043614934483	2.82649126766394E-4	0.0	2.3481619762131192E-4	0.13924383096538592	2.696037824540989E-4
96-97	0.003185238236252055	2.8699757487049234E-4	0.0	2.3916464572541028E-4	0.14065925082326994	2.696037824540989E-4
98-99	0.0032613360780737767	2.9569447107868907E-4	0.0	2.3916464572541028E-4	0.14178332465817936	2.696037824540989E-4
100-101	0.003380918400936482	2.9569447107868907E-4	0.0	2.3916464572541028E-4	0.14297262521465026	2.696037824540989E-4
102-103	0.0034113575376651705	2.9569447107868907E-4	0.0	2.4351309382950867E-4	0.14409669904955968	2.717780065061481E-4
104-105	0.003433099778185662	2.9569447107868907E-4	0.0	2.500357659856562E-4	0.14533165831112363	2.7395223055819726E-4
106-107	0.0035026749478512358	3.043913672868858E-4	0.0	2.5655843814180375E-4	0.14655139800432324	2.7395223055819726E-4
108-109	0.0035439852048401704	3.043913672868858E-4	0.0	2.6742955840204966E-4	0.14770156252785727	2.7395223055819726E-4
110-111	0.003596166582089351	3.087398153909842E-4	0.0	2.696037824540989E-4	0.14876475808930928	2.7395223055819726E-4
112-113	0.0036896582163274657	3.1526248754713175E-4	0.0	2.696037824540989E-4	0.14992796795715563	2.7395223055819726E-4
114-115	0.003728794249264351	3.1743671159918094E-4	0.0	2.9569447107868907E-4	0.1511651014427716	2.7395223055819726E-4
116-117	0.0037788014024614826	3.1743671159918094E-4	0.0	3.130882634950826E-4	0.15210436623325685	2.7395223055819726E-4
118-119	0.0038135889872942695	3.2613360780737766E-4	0.0	3.2613360780737766E-4	0.1529153518046712	2.7395223055819726E-4
120-121	0.003924474413948778	3.30482055911476E-4	0.0	3.30482055911476E-4	0.1537654734090224	2.7395223055819726E-4
122-123	0.004163639059674188	3.30482055911476E-4	0.0	3.348305040155744E-4	0.154630814581738	2.7395223055819726E-4
124-125	0.004278872934432795	3.30482055911476E-4	0.0	3.348305040155744E-4	0.15549615575445358	2.7612645461024644E-4
126-127	0.004318008967369681	3.30482055911476E-4	0.0	3.348305040155744E-4	0.15624626305241054	2.783006786622956E-4
128-129	0.004374538792722959	3.30482055911476E-4	0.0	3.3700472806762357E-4	0.1570529001757208	2.783006786622956E-4
130-131	0.004496295339637713	3.30482055911476E-4	2.1742240520491845E-6	3.3917895211967275E-4	0.15767907670271097	2.783006786622956E-4
132-133	0.004568044733355337	3.30482055911476E-4	4.348448104098369E-6	3.3917895211967275E-4	0.15836830572721056	2.783006786622956E-4
134-135	0.004659362143541402	3.30482055911476E-4	4.348448104098369E-6	3.3917895211967275E-4	0.15933148698226834	2.783006786622956E-4
136-137	0.004778944466404107	3.30482055911476E-4	6.522672156147554E-6	3.3917895211967275E-4	0.16012073031316218	2.783006786622956E-4
138-139	0.004787641362612304	3.3700472806762357E-4	8.696896208196738E-6	3.3917895211967275E-4	0.16085344381870276	2.783006786622956E-4
>>END_MODULE
