##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.control.2d.R.3.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24032968
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	69-150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.40826297442746	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.727060344773065	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.845777267293826	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.85188296343589	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.73466136184262	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.72730051485942	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.74159978908972	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.87459830179943	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.838925970358716	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.8166762923331	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
15-19	34.829234799463805	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.82015399845746	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.814095495820574	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.79968744601166	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.789545818893444	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.74599799741755	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.65006905514126	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.62390800004394	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.610712676020704	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.58697123051967	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.55050740299741	35.0	34.0	37.0	30.8	39.0
70-74	34.55279835853953	35.0	34.0	37.0	30.2	39.0
75-79	34.535497056292876	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.52470720410893	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.50288566645141	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.48171366008742	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.46589420149449	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.426497550320036	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.402648689337596	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.36893230650108	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.3344342206554	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.29465042610703	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.282708869123915	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.23161917082252	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
135-139	34.20012470083749	35.0	34.0	37.0	29.8	39.0
140-144	34.154502524767864	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.19066618581839	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	35.05037079358317	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	8.0
22	194.0
23	2510.0
24	18147.0
25	75390.0
26	196788.0
27	370922.0
28	555279.0
29	729309.0
30	911071.0
31	1140779.0
32	1459152.0
33	1921181.0
34	2673391.0
35	4276459.0
36	8731967.0
37	970414.0
38	7.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.49348960977271	10.816362756360347	15.562709524682926	38.12743810918402
2	22.239331886185038	13.100306617457855	36.66336392406433	27.99699757229278
3	21.41268725470056	17.97976809606175	28.29284716316238	32.3146974860753
4	26.300851647496593	25.713899102182552	22.283225511909734	25.702023738411118
5	25.6057723402814	31.142889788505418	24.478070862360834	18.773267008852343
6	19.086277683714776	36.49049365439868	26.010026985038497	18.413201676848036
7	15.994400686923635	24.513080958690544	40.530071466887875	18.962446887497947
8	18.609701206456187	24.336759504628418	31.54491777101512	25.50862151790028
9	19.735512953370034	23.310561111241718	32.48120547906446	24.472720456323792
10-14	20.34851745893177	29.288816239278866	27.053287583530118	23.309378718259254
15-19	20.495764473573395	27.993255413494765	27.87346880759812	23.63751130533372
20-24	20.659942737599454	28.170800885936526	27.56698294040833	23.60227343605569
25-29	20.636476122367146	28.343973127824956	27.47413929303298	23.54541145677492
30-34	20.631441872123553	28.05020084757974	27.500147402096818	23.818209878199887
35-39	20.697996110853904	28.038757910903954	27.557506685346254	23.70573929289589
40-44	20.772025079954982	28.09675387462636	27.440536717627644	23.690684327791015
45-49	20.857274172245084	27.872732982773112	27.408836847759527	23.861155997222276
50-54	20.96242483932203	27.855678016799757	27.480918298413503	23.70097884546471
55-59	20.9764250479775	27.867845766562176	27.418100377202425	23.737628808257895
60-64	20.927558745922894	27.786184715891082	27.403230952214336	23.883025585971687
65-69	21.01657916841672	27.703558197955587	27.495194785758738	23.784667847868963
70-74	21.133062834363244	27.630194377215826	27.46390746465943	23.772835323761495
75-79	21.156482808418453	27.537267467921122	27.45730718475733	23.8489425389031
80-84	21.188455371601446	27.531877724751453	27.446112054770193	23.83355484887691
85-89	21.168728870796514	27.53207973955647	27.510488513371968	23.78870287627505
90-94	21.1683672206236	27.414208590698024	27.458324031830593	23.959100156847782
95-99	21.261672861332077	27.325030921314745	27.568358626916783	23.844937590436395
100-104	21.31492188211272	27.376136433049503	27.433879540218864	23.875062144618912
105-109	21.29721011991553	27.210787178145235	27.533328510978095	23.95867419096114
110-114	21.380135319511716	27.1784072328349	27.58503270272992	23.856424744923466
115-119	21.4195472490883	27.242050048240056	27.520840478463686	23.817562224207954
120-124	21.377776162514053	27.137807618101366	27.522741755968084	23.961674463416497
125-129	21.416811156111468	27.065604008656436	27.586797988234878	23.93078684699722
130-134	21.493446876825193	27.166799464498688	27.4911827693602	23.84857088931592
135-139	21.464992347844962	27.040338858798513	27.58293358022644	23.91173521313008
140-144	21.52921534847888	26.975474525198795	27.68516281831018	23.81014730801215
145-149	21.151862286679282	27.07004047895858	27.827304203192494	23.950793031169646
150	21.11250872245709	25.712053624975876	28.48940138613506	24.68603626643197
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.5
7	1.0
8	1.5
9	2.5
10	3.5
11	6.0
12	9.0
13	14.5
14	31.5
15	63.5
16	141.0
17	331.0
18	649.5
19	1177.0
20	2201.0
21	3784.5
22	5952.5
23	9472.0
24	15211.5
25	23862.0
26	35394.5
27	49619.0
28	67410.5
29	94137.0
30	127020.0
31	160663.0
32	193458.5
33	229385.0
34	269109.0
35	316039.0
36	387007.0
37	483581.5
38	601173.5
39	745857.0
40	910915.5
41	1076569.0
42	1246563.5
43	1419886.5
44	1559725.5
45	1642775.5
46	1667000.0
47	1629267.0
48	1540348.5
49	1412356.5
50	1250538.5
51	1074982.0
52	897163.5
53	718124.0
54	554018.5
55	419231.0
56	315089.5
57	237181.5
58	178025.5
59	131031.5
60	92355.0
61	65125.5
62	46901.5
63	32439.0
64	23062.5
65	17868.0
66	15433.5
67	11474.0
68	6941.5
69	4871.5
70	3959.5
71	3216.5
72	2688.0
73	1780.5
74	899.5
75	275.0
76	71.5
77	39.5
78	14.0
79	1.0
80	1.5
81	0.5
82	0.5
83	0.5
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0017309555773552397
3	0.14246263715742474
4	8.321901814207883E-5
5	4.99314108852473E-5
6	8.737996904918277E-5
7	8.321901814207883E-5
8	7.905806723497489E-5
9	1.3731137993443007E-4
10-14	2.0222221408525156E-4
15-19	2.6630085805465226E-4
20-24	3.9529033617487447E-4
25-29	3.287151216612114E-4
30-34	2.787837107759641E-4
35-39	1.3231823884590535E-4
40-44	2.912665634972759E-4
45-49	1.8807498100109816E-4
50-54	9.23731101377075E-5
55-59	1.5312299338142505E-4
60-64	1.6893460682842E-4
65-69	0.05893487645803881
70-74	1.9639689262167996E-4
75-79	1.3814358965934647E-4
80-84	1.1900326229551484E-4
85-89	8.654791211275895E-5
90-94	1.3148649401108561E-4
95-99	1.06521085187217E-4
100-104	8.738104163444491E-5
105-109	1.0818663766199555E-4
110-114	6.324807650740327E-5
115-119	5.742315919951717E-5
120-124	1.06525179036161E-4
125-129	9.570757278513056E-5
130-134	3.994835942158171E-5
135-139	3.745343133980787E-5
140-144	4.8290779096370446E-5
145-149	3.8187682189719034E-5
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
68-69	1.0
70-71	0.0
72-73	1.0
74-75	1.0
76-77	1.0
78-79	3.0
80-81	7.0
82-83	4.0
84-85	12.0
86-87	15.0
88-89	11.0
90-91	25.0
92-93	29.0
94-95	37.0
96-97	39.0
98-99	45.0
100-101	67.0
102-103	57.0
104-105	49.0
106-107	42.0
108-109	67.0
110-111	94.0
112-113	120.0
114-115	83.0
116-117	79.0
118-119	88.0
120-121	117.0
122-123	112.0
124-125	144.0
126-127	157.0
128-129	202.0
130-131	212.0
132-133	310.0
134-135	421.0
136-137	739.0
138-139	2353.0
140-141	5198.0
142-143	9012.0
144-145	74665.0
146-147	767159.0
148-149	1369707.0
150-151	2.1801483E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	51.69088502428213
#Duplication Level	Percentage of total
1	40.59576823118635
2	10.040386314666067
3	6.188997366162651
4	4.376307177383786
5	3.3641073990507615
6	2.6735021282119567
7	2.235192874165113
8	1.8733938915044268
9	1.593522465585389
>10	17.73427401483282
>50	4.396488701257451
>100	4.32015115510636
>500	0.35363477700313006
>1k	0.2542735038838834
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	2.0804754535519707E-5	0.0	1.6643803628415766E-5	2.3301325079782073E-4	2.496570544262365E-5
2	4.1609509071039415E-6	6.241426360655912E-5	0.0	2.496570544262365E-5	0.0020222221408525156	4.160950907103941E-5
3	4.1609509071039415E-6	7.489711632787095E-5	0.0	2.496570544262365E-5	0.0031623226893989958	1.0818472358470248E-4
4	2.912665634972759E-5	9.154091995628671E-5	0.0	2.496570544262365E-5	0.004789254494076637	1.1650662539891036E-4
5	4.5770459978143354E-5	9.154091995628671E-5	0.0	2.496570544262365E-5	0.005987608355322572	1.206675763060143E-4
6	6.657521451366306E-5	9.98628217704946E-5	0.0	2.496570544262365E-5	0.007144352707497467	1.206675763060143E-4
7	7.905806723497489E-5	1.3315042902732613E-4	0.0	2.496570544262365E-5	0.008326062765114987	1.289894781202222E-4
8	9.98628217704946E-5	1.3731137993443007E-4	0.0	2.496570544262365E-5	0.010506401040437452	1.5395518356284583E-4
9	1.206675763060143E-4	1.4563328174863795E-4	0.0	2.496570544262365E-5	0.014126428329617882	1.6643803628415765E-4
10-11	1.622770853770537E-4	1.4771375720218992E-4	0.0	2.496570544262365E-5	0.019065477056350262	2.4549610351913255E-4
12-13	2.0804754535519709E-4	1.5187470810929386E-4	0.0	2.496570544262365E-5	0.023170255126208298	3.1623226893989954E-4
14-15	2.0804754535519709E-4	1.560356590163978E-4	0.0	2.496570544262365E-5	0.027686967335869627	3.474394007431791E-4
16-17	2.288522998907168E-4	1.6851851173770962E-4	0.0	2.496570544262365E-5	0.032440853747235876	3.53680827103835E-4
18-19	2.642203826011003E-4	1.768404135519175E-4	0.0	2.496570544262365E-5	0.036399998535345285	3.620027289180429E-4
20-21	3.3495654802186733E-4	2.205303980765089E-4	0.0	2.496570544262365E-5	0.03999089916817598	3.7448558163935477E-4
22-23	4.223365170710501E-4	2.3925467715847664E-4	0.0	2.496570544262365E-5	0.04422258624070069	3.932098607213225E-4
24-25	4.930726824918171E-4	2.558984807868924E-4	0.0	2.496570544262365E-5	0.048859966026668034	4.056927134426343E-4
26-27	5.534064706448242E-4	2.579789562404444E-4	0.0	2.704618089617562E-5	0.05364297909438401	4.410607961530178E-4
28-29	6.012574060765195E-4	2.579789562404444E-4	0.0	2.912665634972759E-5	0.05826787602763005	4.6602650159564146E-4
30-31	6.636716696830786E-4	2.642203826011003E-4	0.0	3.952903361748744E-5	0.06265559875917115	4.889117315847131E-4
32-33	7.09442129661222E-4	2.683813335082042E-4	0.0	5.201188633879927E-5	0.06691641248804558	5.534064706448242E-4
34-35	7.364883105573976E-4	2.704618089617562E-4	0.0	6.033378815300715E-5	0.07040953077455936	5.804526515409998E-4
36-37	7.593735405464694E-4	2.704618089617562E-4	0.0	6.657521451366306E-5	0.07363218725211135	5.908550288087597E-4
38-39	7.822587705355411E-4	2.767032353224121E-4	0.0	6.657521451366306E-5	0.07796789809731366	5.991769306229676E-4
40-41	8.217878041530285E-4	2.8086418622951605E-4	0.0	6.865568996721503E-5	0.08155463777923724	6.137402587978314E-4
42-43	8.342706568743403E-4	2.9334703895082787E-4	0.0	7.0736165420767E-5	0.08512057270662533	6.241426360655912E-4
44-45	8.654777886776199E-4	3.0999084257924363E-4	2.0804754535519707E-6	7.0736165420767E-5	0.08942091546911726	6.283035869726951E-4
46-47	9.050068222951073E-4	3.1623226893989954E-4	4.1609509071039415E-6	7.0736165420767E-5	0.0935423373426037	6.40786439694007E-4
48-49	9.320530031912829E-4	3.3079559711476333E-4	4.1609509071039415E-6	7.0736165420767E-5	0.09756389639431967	6.574302433224227E-4
50-51	9.611796595410105E-4	3.5160035165028304E-4	4.1609509071039415E-6	7.0736165420767E-5	0.10183719297591542	6.615911942295267E-4
52-53	0.0010194329722404657	3.599222534644909E-4	4.1609509071039415E-6	7.0736165420767E-5	0.10609800670478986	6.657521451366306E-4
54-55	0.0010756058094863689	3.620027289180429E-4	4.1609509071039415E-6	7.489711632787095E-5	0.10932066318234185	6.657521451366306E-4
56-57	0.0011130543676503043	3.620027289180429E-4	4.1609509071039415E-6	7.489711632787095E-5	0.11350866027034198	6.886373751257023E-4
58-59	0.001144261499453584	3.7656605709290674E-4	4.1609509071039415E-6	7.905806723497489E-5	0.11803161390636396	6.907178505792543E-4
60-61	0.0011775491067104154	3.869684343606666E-4	4.1609509071039415E-6	7.905806723497489E-5	0.12154345647195969	6.969592769399102E-4
62-63	0.001212917189420799	3.994512870819784E-4	4.1609509071039415E-6	8.321901814207883E-5	0.12509066712026579	7.011202278470141E-4
64-65	0.0012378828948634226	4.056927134426343E-4	4.1609509071039415E-6	8.321901814207883E-5	0.1301940734078288	7.032007033005661E-4
66-67	0.0012586876493989423	4.1817556616394614E-4	4.1609509071039415E-6	8.321901814207883E-5	0.13419066675410213	7.05281178754118E-4
68-69	0.0013273433393661573	4.368998452459139E-4	4.1609509071039415E-6	8.946044450273474E-5	0.13711581524179617	7.260859332896377E-4
70-71	0.0013751942747978526	4.577045997814336E-4	4.1609509071039415E-6	9.362139540983869E-5	0.13998479089224436	7.323273596502937E-4
72-73	0.0013959990293333723	4.618655506885375E-4	4.1609509071039415E-6	9.778234631694263E-5	0.143032687431698	7.572930650929174E-4
74-75	0.0014355280629508597	4.6602650159564146E-4	4.1609509071039415E-6	9.98628217704946E-5	0.14632191912376366	7.656149669071253E-4
76-77	0.0014625742438470354	4.7226792795629737E-4	4.1609509071039415E-6	1.0610424813115051E-4	0.1489537205725069	7.656149669071253E-4
78-79	0.001500022802010971	4.764288788634013E-4	4.1609509071039415E-6	1.2274805175956628E-4	0.15161464867759988	7.697759178142292E-4
80-81	0.0015582761147104262	4.785093543169533E-4	4.1609509071039415E-6	1.2482852721311825E-4	0.1545793261989114	7.822587705355411E-4
82-83	0.0016061270501421215	4.785093543169533E-4	8.321901814207883E-6	1.2482852721311825E-4	0.15735676092940332	7.822587705355411E-4
84-85	0.0016831046419235444	4.889117315847131E-4	8.321901814207883E-6	1.2482852721311825E-4	0.1598346071945837	7.822587705355411E-4
86-87	0.0017684041355191752	4.99314108852473E-4	8.321901814207883E-6	1.289894781202222E-4	0.1620003821417313	7.822587705355411E-4
88-89	0.0018100136445902146	5.034750597595769E-4	8.321901814207883E-6	1.289894781202222E-4	0.16419736422068218	7.84339245989093E-4
90-91	0.0018370598254863902	5.076360106666809E-4	8.321901814207883E-6	1.289894781202222E-4	0.16704553511659484	7.86419721442645E-4
92-93	0.0018703474327432218	5.159579124808887E-4	8.321901814207883E-6	1.3106995357377416E-4	0.16987290125797197	7.86419721442645E-4
94-95	0.0019140374172678131	5.180383879344407E-4	8.321901814207883E-6	1.3315042902732613E-4	0.1729915339628464	7.86419721442645E-4
96-97	0.0019785321563279244	5.367626670164085E-4	8.321901814207883E-6	1.3315042902732613E-4	0.17534039074990654	7.86419721442645E-4
98-99	0.0020367854690273796	5.534064706448242E-4	8.321901814207883E-6	1.3939185538798204E-4	0.17754153377976453	7.86419721442645E-4
100-101	0.0021408092417049777	5.638088479125841E-4	8.321901814207883E-6	1.41472330841534E-4	0.17991327579681377	7.86419721442645E-4
102-103	0.0021720163735082574	5.67969798819688E-4	8.321901814207883E-6	1.4355280629508598E-4	0.18162134614417996	7.86419721442645E-4
104-105	0.002205303980765089	5.7005027427324E-4	8.321901814207883E-6	1.4563328174863795E-4	0.18341055503423465	7.86419721442645E-4
106-107	0.0022510744407432323	5.742112251803439E-4	8.321901814207883E-6	1.4563328174863795E-4	0.1850707744461691	7.86419721442645E-4
108-109	0.002332212983431759	5.742112251803439E-4	8.321901814207883E-6	1.497942326557419E-4	0.1868038104989779	7.86419721442645E-4
110-111	0.0024341562806558057	5.742112251803439E-4	8.321901814207883E-6	1.497942326557419E-4	0.1885014784690763	7.905806723497489E-4
112-113	0.0025381800533334042	5.825331269945518E-4	8.321901814207883E-6	1.497942326557419E-4	0.19011176647012554	7.905806723497489E-4
114-115	0.0025901919396722033	5.929355042623116E-4	8.321901814207883E-6	1.5395518356284583E-4	0.1920757352982786	7.926611478033009E-4
116-117	0.0026484452523716584	5.950159797158636E-4	8.321901814207883E-6	1.5395518356284583E-4	0.1938212542038087	7.989025741639568E-4
118-119	0.0027254228441530816	6.220621606120392E-4	8.321901814207883E-6	1.622770853770537E-4	0.19538369126942623	7.989025741639568E-4
120-121	0.0028710561259017195	6.324645378797991E-4	8.321901814207883E-6	1.705989871912616E-4	0.19679841457784158	7.989025741639568E-4
122-123	0.0030915865239782288	6.345450133333511E-4	8.321901814207883E-6	1.705989871912616E-4	0.19815488457355745	8.009830496175088E-4
124-125	0.003203932198470035	6.36625488786903E-4	8.321901814207883E-6	1.705989871912616E-4	0.19956752740651926	8.030635250710608E-4
126-127	0.0032413807566339706	6.38705964240455E-4	8.321901814207883E-6	1.705989871912616E-4	0.20081373220319687	8.030635250710608E-4
128-129	0.003297553593879874	6.428669151475589E-4	8.321901814207883E-6	1.705989871912616E-4	0.20211819031257394	8.030635250710608E-4
130-131	0.003345404529311569	6.449473906011109E-4	8.321901814207883E-6	1.705989871912616E-4	0.20347882125919697	8.051440005246127E-4
132-133	0.0034223821210929923	6.449473906011109E-4	8.321901814207883E-6	1.768404135519175E-4	0.2047063017767926	8.093049514317167E-4
134-135	0.003570095878295182	6.491083415082148E-4	8.321901814207883E-6	1.7892088900546947E-4	0.2057382176017544	8.155463777923726E-4
136-137	0.0037261315373115795	6.699130960437346E-4	1.2482852721311825E-5	1.7892088900546947E-4	0.20681174293578722	8.155463777923726E-4
138-139	0.0037448558163935474	6.844764242185983E-4	1.2482852721311825E-5	1.7892088900546947E-4	0.20788526826982	8.155463777923726E-4
>>END_MODULE
