##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.control.2d.S.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24134792
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	70-150
%GC	46
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.439765090993944	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.77740309508364	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.890146722623506	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.89562230327073	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.76143254103868	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.747438262571315	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.776474477178006	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.90410002290469	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.868453931569	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.851023468526265	35.0	34.0	37.4	31.2	39.0
15-19	34.86696254104863	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.855249956162865	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.8591442180235	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.83433783063057	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.82742749968593	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.78096787409645	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.67668692566317	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.65443134542034	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.64491683209866	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.61317264304577	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
65-69	34.58308555549184	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
70-74	34.58212088931538	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.56671275831436	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.54747920350057	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.533035367586194	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.509028556997634	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.487495124656576	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.4484377594551	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.41866843976029	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.390787837137914	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.3523171416957	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.310695308008206	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.28991622365636	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.246026428745914	35.0	34.0	37.0	29.6	39.0
135-139	34.205297428142885	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.16456760119411	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.19724077436517	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	35.07578751931052	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	11.0
22	225.0
23	2688.0
24	19421.0
25	78547.0
26	204425.0
27	376388.0
28	557477.0
29	730584.0
30	915050.0
31	1146134.0
32	1461589.0
33	1915714.0
34	2635040.0
35	4113423.0
36	8516948.0
37	1461126.0
38	2.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	36.200150388700266	10.749191457709683	15.38306607324397	37.66759208034608
2	23.276156040467704	12.16202710769016	35.6689367038907	28.892880147951434
3	21.955994649069883	16.61844517491469	27.609733939679142	33.815826236336285
4	27.18547817579654	24.153992141791818	21.841986936354544	26.8185427460571
5	27.087493911790727	30.000345973950854	23.84251928701191	19.069640827246506
6	20.25815698611116	35.996188404017246	25.195875063580463	18.549779546291134
7	16.950564036677694	24.51649234146674	39.37488465814767	19.15805896370789
8	19.316027627519723	24.22740115756616	30.89480092957979	25.561770285334322
9	20.02618215929683	23.044070677328193	32.14096020448519	24.788786958889784
10-14	21.064001777288276	28.608745133064467	26.62923719924553	23.698015890401727
15-19	21.32550301366512	27.576007059038403	27.174259900627856	23.92423002666862
20-24	21.24913647206863	27.619542910356543	27.11184433986921	24.01947627770561
25-29	21.177063261702354	27.815470983442093	26.75812892224062	24.249336832614933
30-34	21.20783012416249	27.580816695662502	27.011301274888183	24.200051905286823
35-39	21.497165805245086	27.30394743076835	26.90360694918802	24.295279814798544
40-44	21.676777989583243	27.378751343727753	26.711605566571773	24.232865100117237
45-49	21.955094927760683	27.314816786767615	26.620616998747415	24.109471286724286
50-54	21.9243465723662	27.5662435385232	26.51097095646534	23.998438932645264
55-59	21.817616869172507	27.497200863057248	26.623502534348738	24.061679733421514
60-64	22.07616586674118	27.29629329463063	26.369360061269337	24.258180777358852
65-69	21.87747844555079	27.429354844460143	26.590111630841733	24.10305507914733
70-74	22.278381098915414	27.144072225839416	26.5106724571574	24.066874218087765
75-79	22.13030682425341	27.002184865821548	26.50612926891852	24.361379041006526
80-84	22.391821305876665	26.96630954643744	26.556741562470354	24.085127585215538
85-89	22.257122043509547	26.933601876903502	26.56404233129532	24.245233748291632
90-94	22.266688598029923	26.66014869069836	26.55136254367396	24.521800167597757
95-99	22.492808407156065	26.706179832129585	26.752701347590886	24.04831041312347
100-104	22.443094332719827	26.479032153823557	26.83123790265411	24.246635610802507
105-109	22.534465794133688	26.429429398023707	26.703215449501023	24.332889358341582
110-114	22.467050771853334	26.475779058040004	26.69866173106949	24.358508439037173
115-119	22.60619839326157	26.66200193542646	26.60064950998693	24.131150161325042
120-124	22.569175224609882	26.490009367700402	26.581375088321234	24.359440319368485
125-129	22.98634572776675	26.441390644331047	26.483280207640036	24.088983420262167
130-134	22.678889237724718	26.72316818169918	26.369669204486705	24.228273376089394
135-139	22.781411130175975	26.55172314053357	26.3904991566843	24.27636657260615
140-144	22.76419499247196	26.339079583929507	26.681693447990284	24.21503197560824
145-149	22.213816638184177	26.333367011024933	27.067740248988898	24.38507610180199
150	22.00258348930062	24.946476658881675	27.754767639134247	25.29617221268346
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.5
7	0.5
8	0.5
9	1.0
10	0.5
11	2.0
12	4.5
13	11.0
14	21.5
15	53.0
16	97.0
17	221.0
18	514.5
19	954.5
20	1581.5
21	2559.0
22	4260.0
23	6987.5
24	11504.5
25	17893.5
26	25439.5
27	37077.5
28	57500.5
29	85239.5
30	115762.5
31	145199.0
32	173549.0
33	206670.5
34	241903.5
35	286135.5
36	349544.5
37	415547.5
38	478944.5
39	574400.0
40	710065.5
41	857689.5
42	1011548.5
43	1168683.5
44	1312974.5
45	1431788.0
46	1522792.0
47	1553523.5
48	1515171.5
49	1473385.5
50	1396461.0
51	1251297.0
52	1073079.0
53	916215.0
54	767933.5
55	631495.0
56	540631.0
57	451863.0
58	375525.5
59	308506.0
60	233192.0
61	157208.5
62	91045.0
63	52516.5
64	34653.5
65	22275.5
66	14849.5
67	7323.0
68	3373.0
69	2138.0
70	1586.5
71	1364.0
72	1327.5
73	978.0
74	489.5
75	162.5
76	56.5
77	33.5
78	15.5
79	2.0
80	1.0
81	0.5
82	0.0
83	0.5
84	1.0
85	1.0
86	0.5
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0015993508458660014
3	0.13596139548250508
4	1.1601508726489128E-4
5	1.1187169129114516E-4
6	8.286791947492234E-5
7	5.800754363244564E-5
8	6.629433557993787E-5
9	1.5330565102860633E-4
10-14	1.9308225237656904E-4
15-19	2.48603758424767E-4
20-24	3.215275275626987E-4
25-29	3.5550337454741686E-4
30-34	2.6351998393025306E-4
35-39	1.4750489666536177E-4
40-44	2.767788510462406E-4
45-49	1.6407848056034625E-4
50-54	9.52981073961607E-5
55-59	1.3010263357562807E-4
60-64	1.8230942284482916E-4
65-69	0.055198321162245774
70-74	2.0302641112574787E-4
75-79	1.3424605847357226E-4
80-84	1.1270044986953473E-4
85-89	1.1435788997759995E-4
90-94	1.5662078053465893E-4
95-99	7.955364241199583E-5
100-104	7.54105703642856E-5
105-109	1.0855865407091265E-4
110-114	5.469408776302822E-5
115-119	4.806492915594073E-5
120-124	9.944558341404791E-5
125-129	9.447456240087112E-5
130-134	4.723825910473521E-5
135-139	3.8124003010702245E-5
140-144	5.4717375635281165E-5
145-149	4.137583465824667E-5
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
70-71	1.0
72-73	1.0
74-75	2.0
76-77	2.0
78-79	4.0
80-81	6.0
82-83	7.0
84-85	5.0
86-87	13.0
88-89	10.0
90-91	10.0
92-93	18.0
94-95	33.0
96-97	44.0
98-99	32.0
100-101	60.0
102-103	50.0
104-105	47.0
106-107	54.0
108-109	70.0
110-111	83.0
112-113	100.0
114-115	83.0
116-117	77.0
118-119	71.0
120-121	100.0
122-123	125.0
124-125	129.0
126-127	137.0
128-129	200.0
130-131	217.0
132-133	309.0
134-135	416.0
136-137	822.0
138-139	1921.0
140-141	4993.0
142-143	7782.0
144-145	68468.0
146-147	748451.0
148-149	1363615.0
150-151	2.1936224E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	43.54841382296679
#Duplication Level	Percentage of total
1	34.753286918216304
2	8.144844203006413
3	4.784266257001164
4	3.293839829762569
5	2.485488171385783
6	1.9058840813835656
7	1.6684435170238776
8	1.3442926562523523
9	1.168009908308654
>10	15.42443510692105
>50	5.257369785982216
>100	10.84921039759894
>500	3.91852931441964
>1k	4.442784644589176
>5k	0.45441142627258385
>10k+	0.10490378187571327
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.143395973746117E-6	4.143395973746117E-6	0.0	4.143395973746117E-6	2.81750926214736E-4	2.900377181622282E-5
2	2.4860375842476704E-5	4.143395973746117E-5	0.0	1.657358389498447E-5	0.002407313060746494	4.143395973746117E-5
3	3.314716778996894E-5	4.143395973746117E-5	0.0	2.4860375842476704E-5	0.004665463866438128	7.0437731553684E-5
4	5.800754363244564E-5	4.972075168495341E-5	0.0	2.4860375842476704E-5	0.00661700337007255	8.286791947492234E-5
5	7.0437731553684E-5	4.972075168495341E-5	0.0	2.4860375842476704E-5	0.007934603289723815	9.52981073961607E-5
6	1.0358489934365292E-4	4.972075168495341E-5	0.0	2.4860375842476704E-5	0.009741123934277122	9.52981073961607E-5
7	1.243018792123835E-4	7.872452350117623E-5	0.0	2.4860375842476704E-5	0.01140676911572306	9.52981073961607E-5
8	2.0716979868730585E-4	9.115471142241458E-5	0.0	2.4860375842476704E-5	0.015218693411569489	1.0772829531739904E-4
9	3.0246790608346656E-4	9.115471142241458E-5	0.0	2.4860375842476704E-5	0.018541696982513876	1.1187169129114516E-4
10-11	3.5218865776841994E-4	9.736980538303376E-5	0.0	2.4860375842476704E-5	0.03385983189745327	1.5330565102860636E-4
12-13	4.143395973746117E-4	1.0565659733052598E-4	0.0	2.4860375842476704E-5	0.04463887652315379	1.7816602687108305E-4
14-15	4.4748676516458065E-4	1.1601508726489128E-4	0.0	2.4860375842476704E-5	0.05267084961826064	2.0509810070043282E-4
16-17	4.785622349676766E-4	1.2223018122551046E-4	0.0	2.4860375842476704E-5	0.05789981533712824	2.1131319466105198E-4
18-19	5.262112886657568E-4	1.243018792123835E-4	4.143395973746117E-6	2.4860375842476704E-5	0.06193962641153071	2.1131319466105198E-4
20-21	8.51467872604827E-4	1.4709055706798717E-4	4.143395973746117E-6	2.6932073829349764E-5	0.06510518093547274	2.1338489264792503E-4
22-23	0.0012160867182944854	1.5537734901547939E-4	4.143395973746117E-6	2.900377181622282E-5	0.0682230864057167	2.2374338258229033E-4
24-25	0.001305169731730027	1.6780753693671776E-4	6.215093960619176E-6	3.107546980309588E-5	0.07127884093635445	2.2788677855603643E-4
26-27	0.0013611055773755996	1.7402263089733692E-4	8.286791947492234E-6	3.729056376371506E-5	0.07386224832598516	2.3824526849040173E-4
28-29	0.001452260288798014	1.7609432888420997E-4	8.286791947492234E-6	3.9362261750588117E-5	0.07699672738012409	2.48603758424767E-4
30-31	0.0016490715975509547	1.7816602687108305E-4	8.286791947492234E-6	4.143395973746117E-5	0.08040674226651714	2.631056443328784E-4
32-33	0.0017257244230652578	1.7816602687108305E-4	8.286791947492234E-6	5.593584564557258E-5	0.08366552319986847	2.9210941614910127E-4
34-35	0.0018106640405270533	1.7816602687108305E-4	8.286791947492234E-6	8.701131544866847E-5	0.08655761358954327	3.1489809400470493E-4
36-37	0.001870743282146372	1.802377248579561E-4	8.286791947492234E-6	1.1187169129114516E-4	0.08921767380468826	3.273282819259433E-4
38-39	0.0018790300740938641	1.8852451680544834E-4	8.286791947492234E-6	1.243018792123835E-4	0.0923293641809716	3.418301678340547E-4
40-41	0.001901818751949468	1.905962147923214E-4	8.286791947492234E-6	1.305169731730027E-4	0.09521731117467265	3.646188456896583E-4
42-43	0.001905962147923214	1.905962147923214E-4	8.286791947492234E-6	1.3258867115987575E-4	0.09807625439655747	3.729056376371505E-4
44-45	0.001912177241883833	2.0716979868730585E-4	8.286791947492234E-6	1.346603691467488E-4	0.10116308439699832	3.729056376371505E-4
46-47	0.0019142489398707061	2.0716979868730585E-4	8.286791947492234E-6	1.40875463107368E-4	0.1058326916594102	3.770490336108967E-4
48-49	0.0019370376177263097	2.1131319466105195E-4	8.286791947492234E-6	1.450188590811141E-4	0.1088470122303105	3.853358255583889E-4
50-51	0.0019515395036344212	2.154565906347981E-4	8.286791947492234E-6	1.450188590811141E-4	0.11199392147237068	3.853358255583889E-4
52-53	0.001974328181490025	2.154565906347981E-4	8.286791947492234E-6	1.450188590811141E-4	0.11474720809692497	3.853358255583889E-4
54-55	0.002009547047266867	2.154565906347981E-4	8.286791947492234E-6	1.450188590811141E-4	0.11672360797640186	3.853358255583889E-4
56-57	0.0020696262888861856	2.1959998660854422E-4	8.286791947492234E-6	1.450188590811141E-4	0.11894032482235604	3.915509195190081E-4
58-59	0.0021359206244661233	2.2788677855603643E-4	8.286791947492234E-6	1.450188590811141E-4	0.12118811713811331	3.956943154927542E-4
60-61	0.0022395055238097765	2.3617357050352867E-4	8.286791947492234E-6	1.450188590811141E-4	0.12325152833303887	4.019094094533734E-4
62-63	0.0022850828795209837	2.403169664772748E-4	8.286791947492234E-6	1.450188590811141E-4	0.12566298478975912	4.060528054271195E-4
64-65	0.0022954413694553488	2.403169664772748E-4	8.286791947492234E-6	1.5123395304173328E-4	0.1286110110250795	4.060528054271195E-4
66-67	0.002305799859389714	2.5067545641164004E-4	8.286791947492234E-6	1.5330565102860633E-4	0.13116127124692023	4.101962014008656E-4
68-69	0.002338947027179683	2.610339463460054E-4	8.286791947492234E-6	1.5330565102860633E-4	0.13324125602574077	4.1848299334835786E-4
70-71	0.0023824526849040174	2.7346413426724376E-4	8.286791947492234E-6	1.5330565102860633E-4	0.13538546344215438	4.1848299334835786E-4
72-73	0.0024114564567202404	2.81750926214736E-4	8.286791947492234E-6	1.5330565102860633E-4	0.13702624824775783	4.205546913352309E-4
74-75	0.0024404602285364634	2.9418111413597435E-4	8.286791947492234E-6	1.6366414096297163E-4	0.13883069719432428	4.2262638932210396E-4
76-77	0.0024611772084051934	2.9832451010972045E-4	8.286791947492234E-6	1.6573583894984468E-4	0.14027259899318792	4.2262638932210396E-4
78-79	0.0024818941882739243	2.9832451010972045E-4	8.286791947492234E-6	1.7609432888420997E-4	0.14180358380548713	4.2262638932210396E-4
80-81	0.0025336866379457503	2.9832451010972045E-4	8.286791947492234E-6	1.8230942284482916E-4	0.14328691956408823	4.2262638932210396E-4
82-83	0.002568905503722593	2.9832451010972045E-4	8.286791947492234E-6	1.8230942284482916E-4	0.14502921757104847	4.2262638932210396E-4
84-85	0.0026144828594337997	2.9832451010972045E-4	8.286791947492234E-6	1.8230942284482916E-4	0.14678187406794307	4.2262638932210396E-4
86-87	0.002651773423197515	3.0246790608346656E-4	8.286791947492234E-6	1.8230942284482916E-4	0.1484102286856253	4.2262638932210396E-4
88-89	0.0026745621010531187	3.0661130205721267E-4	8.286791947492234E-6	1.905962147923214E-4	0.1498956361422133	4.2262638932210396E-4
90-91	0.00268906398696123	3.0661130205721267E-4	8.286791947492234E-6	1.905962147923214E-4	0.1518388888539002	4.2262638932210396E-4
92-93	0.002720139456764326	3.0868300004408575E-4	8.286791947492234E-6	1.905962147923214E-4	0.15366612647832226	4.2262638932210396E-4
94-95	0.0027802186983836444	3.2318488595219714E-4	8.286791947492234E-6	1.905962147923214E-4	0.1553006961899651	4.2469808730897704E-4
96-97	0.0028423696379898363	3.397584698471816E-4	8.286791947492234E-6	1.905962147923214E-4	0.15681096402239555	4.2676978529585007E-4
98-99	0.0029128073695435207	3.563320537421661E-4	8.286791947492234E-6	1.905962147923214E-4	0.15802497904270318	4.2676978529585007E-4
100-101	0.003043324342716523	3.604754497159122E-4	8.286791947492234E-6	1.905962147923214E-4	0.15922449217710266	4.2676978529585007E-4
102-103	0.003082686604467111	3.646188456896583E-4	8.286791947492234E-6	2.0095470472668666E-4	0.16025412607657857	4.2676978529585007E-4
104-105	0.003109618678296461	3.646188456896583E-4	8.286791947492234E-6	2.1752828862167114E-4	0.16123196752638266	4.2676978529585007E-4
106-107	0.0031717696179026527	3.646188456896583E-4	8.286791947492234E-6	2.361735705035287E-4	0.16226160142585858	4.2676978529585007E-4
108-109	0.003209060181666368	3.729056376371505E-4	8.286791947492234E-6	2.5067545641164004E-4	0.16325601645955762	4.2676978529585007E-4
110-111	0.003275354517246306	3.729056376371505E-4	8.286791947492234E-6	2.568905503722593E-4	0.16419242394962427	4.2676978529585007E-4
112-113	0.0033768677186030854	3.749773356240236E-4	8.286791947492234E-6	2.568905503722593E-4	0.16524898992292952	4.2676978529585007E-4
114-115	0.0033996563964586893	3.770490336108967E-4	8.286791947492234E-6	2.610339463460054E-4	0.16652515588284333	4.288414832827231E-4
116-117	0.00344109035619615	3.791207315977697E-4	8.286791947492234E-6	2.7760753024098987E-4	0.16742841620511997	4.309131812695962E-4
118-119	0.003503241295802342	3.89479221532135E-4	8.286791947492234E-6	2.81750926214736E-4	0.16820115955422363	4.309131812695962E-4
120-121	0.003635829966962218	3.89479221532135E-4	8.286791947492234E-6	2.900377181622282E-4	0.16901740856105163	4.309131812695962E-4
122-123	0.0038637167455182544	3.936226175058811E-4	8.286791947492234E-6	2.9832451010972045E-4	0.16979015191015528	4.309131812695962E-4
124-125	0.003977660134796272	3.936226175058811E-4	8.286791947492234E-6	2.9832451010972045E-4	0.1705318197894558	4.309131812695962E-4
126-127	0.0040004488126518765	4.019094094533734E-4	8.286791947492234E-6	2.9832451010972045E-4	0.1713418537023232	4.3298487925646926E-4
128-129	0.004048097866349957	4.060528054271195E-4	8.286791947492234E-6	3.0039620809659353E-4	0.17207316309168938	4.3505657724334234E-4
130-131	0.004168256349588594	4.081245034139925E-4	8.286791947492234E-6	3.0661130205721267E-4	0.1726635970179482	4.3919997321708844E-4
132-133	0.004234550685168531	4.101962014008656E-4	8.286791947492234E-6	3.0661130205721267E-4	0.17331203848783946	4.3919997321708844E-4
134-135	0.004313275208669708	4.101962014008656E-4	8.286791947492234E-6	3.0661130205721267E-4	0.17407235164902188	4.3919997321708844E-4
136-137	0.004412716712039615	4.309131812695962E-4	8.286791947492234E-6	3.0661130205721267E-4	0.1748243780182568	4.3919997321708844E-4
138-139	0.004416860108013361	4.3298487925646926E-4	8.286791947492234E-6	3.0661130205721267E-4	0.1754686760921743	4.3919997321708844E-4
>>END_MODULE
