##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.control.4d.R.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24119721
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	73-150
%GC	44
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.37027248366596	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.69155049513218	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
3	34.80438310210968	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.81795083782271	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.69662733660974	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.69115588028568	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
7	34.713424960429684	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.84189804683064	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.80340709579518	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
10-14	34.784018372351824	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
15-19	34.79913357206743	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
20-24	34.787560942350865	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.78074235601647	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.76623062928464	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.753739481480736	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.71260483485692	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.613961463318745	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.587048166933606	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.57425744684194	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.54892561153589	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
65-69	34.510972892265215	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
70-74	34.514761916264774	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
75-79	34.49846743637155	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.48414346187986	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.46428181650947	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.441045595724475	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.42611483797089	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.38595373161145	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.36232350886326	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.3259341013402	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.29175342411913	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.25296529775644	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.2396773518376	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
130-134	34.18578441933369	35.0	34.0	37.0	29.4	39.0
135-139	34.15380056963427	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.10707390028848	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.14425333676881	35.0	34.0	37.0	29.2	39.0
150	35.01268922886285	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	11.0
22	200.0
23	2711.0
24	19210.0
25	78243.0
26	203583.0
27	376335.0
28	561256.0
29	736119.0
30	928008.0
31	1168835.0
32	1500295.0
33	1982118.0
34	2753988.0
35	4328773.0
36	8535793.0
37	944234.0
38	9.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	34.95493169261783	10.76040224511718	15.72011550216522	38.56455056009976
2	22.25897700957992	12.899835803740132	37.06445628806831	27.77673089861164
3	21.045012910481447	17.977153449908133	28.641538781049718	32.3362948585607
4	26.08118350379356	25.864941205951002	22.404935914841072	25.648939375414365
5	25.55075178547937	31.335401876465113	24.463077151871584	18.650769186183933
6	18.971404183556547	36.506336289103224	26.017108741367075	18.50515078597315
7	15.817936315496942	24.772258908210933	40.721515188778774	18.688289587513353
8	18.417237886959494	24.161478240117997	31.810745801731926	25.610538071190582
9	19.515190246241993	23.047445721520113	32.837253118697056	24.60011091354084
10-14	20.266273233206398	29.258759231347685	27.138257735362494	23.336709800083423
15-19	20.405553980953826	27.962288752478194	27.941939394103223	23.690217872464757
20-24	20.566018058805334	28.151294748718065	27.643289427285083	23.639397765191518
25-29	20.536932689169973	28.338956155585286	27.53556154321591	23.58854961202883
30-34	20.518089580844425	28.058623378431673	27.568196360063634	23.855090680660265
35-39	20.630503342096958	28.05014233340279	27.592327488950612	23.727026835549644
40-44	20.673344387318586	28.118469131722406	27.501399769396677	23.70678671156233
45-49	20.754231821891654	27.911054085853138	27.459823434490993	23.874890657764215
50-54	20.867672764443707	27.869449834875205	27.54796154817336	23.71491585250773
55-59	20.86872523258051	27.90315288784714	27.480902035444004	23.74721984412835
60-64	20.82822933910544	27.824234094062305	27.455184299355313	23.892352267476937
65-69	20.924632883479727	27.752936311092107	27.53655831368112	23.78587249174705
70-74	21.036201838769355	27.688574946576605	27.527944260808752	23.747278953845292
75-79	21.043942760383487	27.598668115353277	27.518456458870045	23.838932665393195
80-84	21.10298237054964	27.591128302269414	27.48991968618364	23.815969640997313
85-89	21.077038176110655	27.6032921684443	27.55951875782686	23.76015089761819
90-94	21.074927787381213	27.48634148569385	27.50565274545599	23.933077981468955
95-99	21.154211306469946	27.399254792940653	27.62244078392822	23.824093116661178
100-104	21.224334987934203	27.454796990905084	27.48970663132252	23.831161389838194
105-109	21.186783339198072	27.271284067295774	27.605732546758503	23.936200046747643
110-114	21.28164180140134	27.26876971631852	27.630770677946153	23.818817804333985
115-119	21.313171817079947	27.315456187014075	27.574542223607363	23.796829772298615
120-124	21.26907643030558	27.235643856542936	27.576177749437818	23.91910196371366
125-129	21.30297679573282	27.14362314213501	27.654387139053494	23.89901292307868
130-134	21.391277716156008	27.2486411909999	27.54828869028615	23.811792402557945
135-139	21.388466821980508	27.10733747017416	27.636435743908937	23.867759963936397
140-144	21.442750117253436	27.040926978358353	27.73989799038222	23.77642491400599
145-149	21.060294199796218	27.152254285952367	27.871148404904254	23.91630310934716
150	21.036648763087154	25.779274918063305	28.514261742933062	24.669814575916476
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	1.0
9	1.5
10	3.0
11	7.0
12	13.5
13	18.0
14	37.0
15	83.0
16	168.5
17	382.5
18	702.0
19	1250.5
20	2335.0
21	3863.0
22	5990.5
23	9577.0
24	15329.0
25	24111.5
26	35721.5
27	49850.5
28	68069.5
29	95330.0
30	128525.5
31	163389.0
32	197730.5
33	233908.5
34	273938.0
35	322645.5
36	397280.0
37	496712.5
38	616385.5
39	766788.5
40	935057.5
41	1098938.5
42	1268352.5
43	1440370.5
44	1577537.0
45	1656614.5
46	1674676.0
47	1630723.0
48	1538807.5
49	1408480.5
50	1240488.5
51	1058743.0
52	877420.5
53	701292.5
54	541837.0
55	407716.0
56	305652.0
57	229789.5
58	172747.0
59	128038.0
60	89596.5
61	63015.5
62	45734.0
63	31098.5
64	21456.5
65	17082.0
66	15590.0
67	11541.5
68	6405.0
69	4114.0
70	3327.0
71	2719.0
72	2152.0
73	1419.0
74	724.0
75	207.5
76	52.0
77	40.0
78	24.0
79	5.0
80	0.0
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.5
88	0.5
89	0.0
90	0.5
91	0.5
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0017164377647651892
3	0.16448780647172492
4	7.462772890283432E-5
5	3.3167879512370806E-5
6	1.6583939756185403E-5
7	2.902189457332446E-5
8	5.3897804207602566E-5
9	1.368175029885296E-4
10-14	1.2603794214700908E-4
15-19	1.7247297346432823E-4
20-24	2.1724961080602884E-4
25-29	1.7496056442775602E-4
30-34	1.9320289815955995E-4
35-39	5.721459215883964E-5
40-44	1.4013429093976667E-4
45-49	1.6003501864718918E-4
50-54	1.003328355249217E-4
55-59	1.252087451591998E-4
60-64	2.0315326201327118E-4
65-69	0.0670040917969159
70-74	1.8739852235270089E-4
75-79	1.3267153235089178E-4
80-84	9.369930934736599E-5
85-89	8.789500752294198E-5
90-94	1.2106318484966879E-4
95-99	8.457870992176677E-5
100-104	6.63365648638102E-5
105-109	9.950531595541537E-5
110-114	5.141149513599991E-5
115-119	4.8924343577521476E-5
120-124	9.867893942993824E-5
125-129	1.1775295551003934E-4
130-134	4.229250486506854E-5
135-139	4.0636057802155025E-5
140-144	5.06064028365735E-5
145-149	4.312642388547685E-5
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
72-73	2.0
74-75	0.0
76-77	1.0
78-79	2.0
80-81	8.0
82-83	8.0
84-85	4.0
86-87	19.0
88-89	19.0
90-91	19.0
92-93	34.0
94-95	35.0
96-97	51.0
98-99	43.0
100-101	46.0
102-103	50.0
104-105	35.0
106-107	55.0
108-109	68.0
110-111	96.0
112-113	120.0
114-115	90.0
116-117	89.0
118-119	96.0
120-121	106.0
122-123	123.0
124-125	130.0
126-127	158.0
128-129	204.0
130-131	239.0
132-133	309.0
134-135	447.0
136-137	786.0
138-139	2422.0
140-141	5419.0
142-143	8819.0
144-145	74286.0
146-147	774523.0
148-149	1384183.0
150-151	2.1866577E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	warn
#Total Deduplicated Percentage	52.037476622555076
#Duplication Level	Percentage of total
1	40.924648999279455
2	10.034619780367889
3	6.22703360505201
4	4.51417051753722
5	3.407567289899801
6	2.6310046199953936
7	2.065325937377103
8	1.8589835321199086
9	1.6478073472556107
>10	17.593618100457476
>50	4.2437688945254495
>100	4.204944667819019
>500	0.3493641026976394
>1k	0.29714260561603456
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	4.145984939046352E-6	1.6583939756185407E-5	0.0	0.0	2.114452318913639E-4	2.902189457332446E-5
2	8.291969878092703E-6	1.1194159335425148E-4	0.0	0.0	0.0021559121683041027	5.3897804207602566E-5
3	1.2437954817139053E-5	1.1608757829329784E-4	0.0	0.0	0.003441167499408472	1.0364962347615879E-4
4	3.316787951237081E-5	1.2437954817139053E-4	0.0	4.145984939046352E-6	0.004875678288318509	1.1608757829329784E-4
5	4.145984939046351E-5	1.2437954817139053E-4	0.0	8.291969878092703E-6	0.006098743845337182	1.285255331104369E-4
6	6.633575902474163E-5	1.2437954817139053E-4	0.0	8.291969878092703E-6	0.007243035688513976	1.3681750298852959E-4
7	7.048174396378797E-5	1.616934126228077E-4	0.0	8.291969878092703E-6	0.008457809275654557	1.4096348792757595E-4
8	8.291969878092703E-5	1.782773523789931E-4	0.0	8.291969878092703E-6	0.010315210528347322	1.53401442744715E-4
9	1.0779560841520513E-4	1.782773523789931E-4	0.0	8.291969878092703E-6	0.013955385304830018	1.5754742768376136E-4
10-11	1.6791239003137722E-4	1.803503448485163E-4	0.0	8.291969878092703E-6	0.018501457790494343	2.1559121683041027E-4
12-13	2.1351822436088707E-4	1.8449632978756263E-4	0.0	8.291969878092703E-6	0.0226122018575588	2.653430360989665E-4
14-15	2.1766420929993346E-4	1.9693428460470169E-4	0.0	8.291969878092703E-6	0.026994507938130793	3.109488704284764E-4
16-17	2.4461311140373473E-4	2.2388318670850296E-4	0.0	8.291969878092703E-6	0.031513631521691315	3.233868252456154E-4
18-19	2.922919382027677E-4	2.4254011893421157E-4	0.0	1.2437954817139053E-5	0.03539012743969966	3.233868252456154E-4
20-21	3.876495918008338E-4	2.922919382027677E-4	0.0	1.2437954817139053E-5	0.03893287157011476	3.254598177151386E-4
22-23	4.830072453988999E-4	3.005839080808605E-4	2.072992469523176E-6	1.6583939756185407E-5	0.042983498855563046	3.461897424103703E-4
24-25	5.493430044236416E-4	3.150948553675227E-4	4.145984939046352E-6	1.6583939756185407E-5	0.04741762974787312	3.565547047579862E-4
26-27	5.949488387531514E-4	3.1924084030656905E-4	4.145984939046352E-6	1.6583939756185407E-5	0.05162787745347469	3.7935762192274115E-4
28-29	6.447006580217077E-4	3.1924084030656905E-4	4.145984939046352E-6	3.316787951237081E-5	0.05617187694666949	4.063065240265424E-4
30-31	7.131094095159724E-4	3.1924084030656905E-4	4.145984939046352E-6	3.938685692094034E-5	0.06029091298361204	4.187444788436815E-4
32-33	7.545692589064359E-4	3.233868252456154E-4	4.145984939046352E-6	4.767882679903304E-5	0.06412802204469945	4.7471527552080724E-4
34-35	8.105400555835616E-4	3.2753281018466177E-4	4.145984939046352E-6	5.597079667712574E-5	0.06763552530313266	4.8093425292937674E-4
36-37	8.333429727483166E-4	3.2753281018466177E-4	4.145984939046352E-6	7.048174396378797E-5	0.07116583147873062	5.016641776246086E-4
38-39	8.602918748521178E-4	3.378977725322776E-4	4.145984939046352E-6	7.877371384188068E-5	0.0754403419508874	5.078831550331781E-4
40-41	9.183356639987668E-4	3.4411674994084716E-4	4.145984939046352E-6	7.877371384188068E-5	0.07900796199093679	5.161751249112708E-4
42-43	9.287006263463827E-4	3.4411674994084716E-4	4.145984939046352E-6	8.084670631140385E-5	0.08244705649787575	5.265400872588866E-4
44-45	9.660144907977998E-4	3.461897424103703E-4	4.145984939046352E-6	8.291969878092703E-5	0.08665730420347731	5.493430044236415E-4
46-47	0.001015766310066356	3.6484667463607893E-4	4.145984939046352E-6	8.291969878092703E-5	0.09063744974496181	5.534889893626879E-4
48-49	0.0010592991519263427	3.835036068617875E-4	4.145984939046352E-6	8.291969878092703E-5	0.09430457342354831	5.804378914664892E-4
50-51	0.0010821020690910976	3.980145541484497E-4	4.145984939046352E-6	8.291969878092703E-5	0.0982930109349109	5.949488387531514E-4
52-53	0.001146364835646316	3.980145541484497E-4	4.145984939046352E-6	8.291969878092703E-5	0.10239546303209726	5.970218312226746E-4
54-55	0.0012085546097320113	4.021605390874961E-4	4.145984939046352E-6	8.913867618949655E-5	0.10570395901345625	6.01167816161721E-4
56-57	0.001237576504305336	4.1459849390463514E-4	6.2189774085695275E-6	9.121166865901973E-5	0.10973800235914835	6.094597860398137E-4
58-59	0.001264525406409137	4.3118243366082053E-4	8.291969878092703E-6	9.121166865901973E-5	0.11371192892322428	6.1360577097886E-4
60-61	0.0013163502181472164	4.3532841859986686E-4	8.291969878092703E-6	9.121166865901973E-5	0.11704530081421755	6.177517559179063E-4
62-63	0.0013515910901291104	4.415473960084364E-4	8.291969878092703E-6	9.743064606758926E-5	0.12036001577298511	6.177517559179063E-4
64-65	0.0013681750298852957	4.477663734170059E-4	8.291969878092703E-6	1.0364962347615879E-4	0.12477963571800851	6.239707333264759E-4
66-67	0.0013826859771719582	4.684962981122377E-4	8.291969878092703E-6	1.0779560841520513E-4	0.12863332871885208	6.301897107350454E-4
68-69	0.0014428027587881304	4.767882679903304E-4	8.291969878092703E-6	1.0986860088472831E-4	0.13149405832679406	6.447006580217077E-4
70-71	0.0015298684425081037	4.767882679903304E-4	8.291969878092703E-6	1.2023356323234419E-4	0.13435478793473604	6.592116053083699E-4
72-73	0.0015962042015328453	4.8093425292937674E-4	8.291969878092703E-6	1.3059852557996009E-4	0.13727148833935515	6.633575902474162E-4
74-75	0.0016231531036366466	4.871532303379463E-4	8.291969878092703E-6	1.3681750298852959E-4	0.14033744420177996	6.71649560125509E-4
76-77	0.0016583939756185406	4.892262228074695E-4	8.291969878092703E-6	1.4096348792757595E-4	0.1428271081576773	6.757955450645553E-4
78-79	0.00171021878735662	4.892262228074695E-4	8.291969878092703E-6	1.4718246533614547E-4	0.14505142907747565	6.799415300036016E-4
80-81	0.0017371676894604212	4.995911851550854E-4	8.291969878092703E-6	1.4925545780566864E-4	0.14768205652130056	6.882334998816943E-4
82-83	0.0017744815539118383	5.058101625636549E-4	8.291969878092703E-6	1.53401442744715E-4	0.1501820854395455	6.882334998816943E-4
84-85	0.0018491092828146725	5.099561475027012E-4	8.291969878092703E-6	1.5754742768376136E-4	0.15263858151593046	6.882334998816943E-4
86-87	0.0019320289815955999	5.223941023198402E-4	8.291969878092703E-6	1.5754742768376136E-4	0.15485668345832027	6.903064923512174E-4
88-89	0.001996291748150818	5.223941023198402E-4	8.291969878092703E-6	1.5962042015328453E-4	0.15700430365674628	6.923794848207406E-4
90-91	0.0020336056126022354	5.286130797284098E-4	8.291969878092703E-6	1.616934126228077E-4	0.15971992379182165	6.944524772902639E-4
92-93	0.002083357431870792	5.410510345455488E-4	8.291969878092703E-6	1.616934126228077E-4	0.1625246826030865	7.048174396378798E-4
94-95	0.002151766183365056	5.43124027015072E-4	8.291969878092703E-6	1.616934126228077E-4	0.1653791932336199	7.06890432107403E-4
96-97	0.0022181019423897982	5.451970194845952E-4	8.291969878092703E-6	1.616934126228077E-4	0.1675807112362535	7.089634245769261E-4
98-99	0.0023113866035183407	5.514159968931648E-4	8.291969878092703E-6	1.6376640509233086E-4	0.169504448247971	7.089634245769261E-4
100-101	0.0023984522872383144	5.555619818322111E-4	8.291969878092703E-6	1.6583939756185405E-4	0.17171840420542178	7.131094095159724E-4
102-103	0.0024378391441592547	5.617809592407806E-4	8.291969878092703E-6	1.6583939756185405E-4	0.17359238939787075	7.131094095159724E-4
104-105	0.0024875909634278106	5.679999366493501E-4	8.291969878092703E-6	1.699853825009004E-4	0.1753793089065997	7.172553944550188E-4
106-107	0.0025539267224525524	5.845838764055356E-4	8.291969878092703E-6	1.7413136743994675E-4	0.17701075398011445	7.172553944550188E-4
108-109	0.002607824526660155	5.887298613445819E-4	8.291969878092703E-6	1.782773523789931E-4	0.17867536693314157	7.172553944550188E-4
110-111	0.002672087293215373	5.949488387531514E-4	8.291969878092703E-6	1.782773523789931E-4	0.18033168791629056	7.172553944550188E-4
112-113	0.0027487880145877306	5.970218312226746E-4	8.291969878092703E-6	1.803503448485163E-4	0.18202324977142148	7.193283869245419E-4
114-115	0.002829634720899135	5.970218312226746E-4	8.291969878092703E-6	1.8864231472660897E-4	0.18379773132533334	7.214013793940651E-4
116-117	0.0029104814272105386	6.053138011007672E-4	8.291969878092703E-6	1.9486129213517852E-4	0.18538357056451854	7.214013793940651E-4
118-119	0.0030390069603209754	6.281167182655222E-4	8.291969878092703E-6	2.0729924695231757E-4	0.18690307404467904	7.214013793940651E-4
120-121	0.0031260726440409487	6.426276655521844E-4	8.291969878092703E-6	2.1559121683041027E-4	0.18840599358508334	7.214013793940651E-4
122-123	0.003291912041602803	6.48846642960754E-4	8.291969878092703E-6	2.1559121683041027E-4	0.1899296430501829	7.214013793940651E-4
124-125	0.003389342687670392	6.509196354302772E-4	8.291969878092703E-6	2.1973720176945663E-4	0.19144914653034334	7.214013793940651E-4
126-127	0.0034287295445913323	6.550656203693235E-4	8.291969878092703E-6	2.1973720176945663E-4	0.19280902959035057	7.234743718635883E-4
128-129	0.003490919318677028	6.550656203693235E-4	8.291969878092703E-6	2.218101942389798E-4	0.19418549659011397	7.296933492721579E-4
130-131	0.0035696930325189082	6.550656203693235E-4	8.291969878092703E-6	2.2388318670850296E-4	0.19544380301911451	7.296933492721579E-4
132-133	0.0036463937538912658	6.61284597777893E-4	8.291969878092703E-6	2.2595617917802612E-4	0.19651968611079706	7.296933492721579E-4
134-135	0.0038308900836788286	6.633575902474162E-4	8.291969878092703E-6	2.3217515658659568E-4	0.19776348159251095	7.296933492721579E-4
136-137	0.0040153864134663915	6.757955450645552E-4	8.291969878092703E-6	2.3424814905611884E-4	0.19896789021730393	7.296933492721579E-4
138-139	0.004046481300509239	6.84087514942648E-4	8.291969878092703E-6	2.3632114152564204E-4	0.19999816747465693	7.296933492721579E-4
>>END_MODULE
