##FastQC	0.12.1
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	sesquia21.lowPi.2d.R.2.R1.clean.fq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	24083933
Total Bases	3.6 Gbp
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	66-150
%GC	45
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	35.483985070046494	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
2	34.802572528332476	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
3	34.970319424157175	35.0	34.0	38.0	31.0	39.0
4	34.923099686417494	36.0	34.0	38.0	31.0	39.0
5	34.790418907078006	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
6	34.77418434937516	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
7	34.756557867853225	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
8	34.91843300676845	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
9	34.90355649137539	35.0	34.0	37.0	32.0	39.0
10-14	34.880741729351264	35.0	34.0	37.0	31.6	39.0
15-19	34.87941405583548	35.0	34.0	37.0	31.2	39.0
20-24	34.887693060763795	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
25-29	34.87388278318163	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
30-34	34.86044868169996	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
35-39	34.86086030882082	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
40-44	34.79401584450513	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
45-49	34.70201133676962	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
50-54	34.661241691712064	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
55-59	34.64904653239153	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
60-64	34.620065277544164	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
65-69	34.601432480146116	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
70-74	34.57258070751112	35.0	34.0	37.0	30.4	39.0
75-79	34.54942060815041	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
80-84	34.52460769699072	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
85-89	34.50186912577999	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
90-94	34.47582756629053	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
95-99	34.44124728916053	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
100-104	34.40291503577507	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
105-109	34.348386601288404	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
110-114	34.31012249312355	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
115-119	34.25892240784669	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
120-124	34.22373878964059	35.0	34.0	37.0	30.0	39.0
125-129	34.16960534906708	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
130-134	34.11055658121049	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
135-139	34.062817838252364	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
140-144	34.02925488323642	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
145-149	34.035824902377854	35.0	34.0	37.0	29.0	39.0
150	34.950160610443575	35.0	34.0	37.0	31.0	39.0
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	pass
#Quality	Count
21	17.0
22	314.0
23	3482.0
24	23286.0
25	91117.0
26	221769.0
27	385925.0
28	556824.0
29	720969.0
30	902788.0
31	1133985.0
32	1454781.0
33	1924591.0
34	2672929.0
35	4195073.0
36	8703302.0
37	1092772.0
38	9.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	fail
#Base	G	A	T	C
1	35.22995185213313	10.713528392559471	15.340285160235249	38.71623459507216
2	22.37180948151294	12.953263921261254	36.984484945730756	27.69044165149505
3	21.214969208292057	17.885129077207075	28.397255446673775	32.50264626782709
4	26.23380206085984	25.76169053486624	22.30544369672588	25.699063707548035
5	25.605672763998854	31.215411311139906	24.514754055205547	18.664161869655693
6	19.00427476216178	36.445788522820195	26.06945972608355	18.48047698893448
7	15.946119999717654	24.599639011804157	40.63965165095838	18.81458933751981
8	18.571322632303257	24.090459224398426	31.72569306846828	25.612525074830035
9	19.682794005026093	23.014151191741806	32.75325997757507	24.54979482565703
10-14	20.34961236297618	29.19632697642457	27.10111203516793	23.35294862543132
15-19	20.493422931480822	27.912785586953415	27.923048878796607	23.670742602769153
20-24	20.64640097812733	28.067068973615367	27.625040051654093	23.66148999660321
25-29	20.619139355607892	28.27132884754271	27.508932285236014	23.60059951161338
30-34	20.6097546280959	27.991827090054272	27.528517370448114	23.869900911401714
35-39	20.700951095786664	27.974807020559066	27.57276509995708	23.75147678369719
40-44	20.765468738709938	28.039220983165535	27.470110277749164	23.725200000375356
45-49	20.837305935825064	27.82188560296636	27.45130978250841	23.889498678700164
50-54	20.9687967339696	27.790870815074687	27.524305660657355	23.716026790298354
55-59	20.974639463188186	27.825463995347523	27.446514638435282	23.753381903029013
60-64	20.918688287478865	27.742934123133356	27.433327717125977	23.905049872261802
65-69	21.043945480589457	27.656206572308186	27.51739989270987	23.78244805439249
70-74	21.146836489656145	27.619510043370248	27.483806588333692	23.749846878639914
75-79	21.16563295330609	27.51649565831088	27.461015331583745	23.856856056799288
80-84	21.215149147712292	27.517500175512055	27.44080634797752	23.826544328798132
85-89	21.193812943358846	27.508384683270197	27.50829499618917	23.789507377181785
90-94	21.182727753905773	27.408871186863752	27.47572394751787	23.932677111712604
95-99	21.273271965216004	27.327835130960555	27.575113145758735	23.82377975806471
100-104	21.320395134359213	27.391680183530443	27.441112628884877	23.84681205322547
105-109	21.281439071893388	27.218887703167695	27.541116862996617	23.9585563619423
110-114	21.37188330738164	27.210938102215486	27.59344108901745	23.82373750138542
115-119	21.41247256881645	27.240996667955063	27.543930379293645	23.802600383934834
120-124	21.36357495666456	27.148784697138918	27.545913666662784	23.941726679533737
125-129	21.405828388641407	27.078108553393786	27.608484378771013	23.90757867919379
130-134	21.479914186375698	27.183452713128865	27.505843897715682	23.830789202779755
135-139	21.482399145412668	27.017936252257517	27.601155511234367	23.898509091095445
140-144	21.52254518717204	26.968358098247506	27.730167321155562	23.778929393424892
145-149	21.12323041156908	27.18402774289267	27.81137007725295	23.881371768285298
150	21.05875333111924	25.782943219530246	28.508929588267744	24.649373861082772
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	0.0
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.5
9	0.5
10	1.5
11	8.5
12	12.5
13	16.0
14	40.5
15	84.0
16	162.5
17	312.5
18	615.5
19	1176.0
20	2149.0
21	3592.0
22	5651.5
23	9037.0
24	14320.5
25	22309.0
26	32972.0
27	46570.0
28	63757.5
29	89238.0
30	121157.0
31	155533.0
32	189714.0
33	226918.5
34	267727.0
35	314956.5
36	386788.0
37	484584.5
38	601202.5
39	745011.5
40	912456.5
41	1080796.0
42	1252956.0
43	1427464.0
44	1570001.0
45	1657185.0
46	1682090.5
47	1641880.0
48	1551984.0
49	1422994.5
50	1257822.0
51	1077926.0
52	894835.5
53	714484.0
54	551537.0
55	416100.5
56	312497.0
57	235549.5
58	177352.0
59	132579.5
60	93559.5
61	65628.5
62	47910.0
63	32260.0
64	21837.0
65	17430.0
66	16362.0
67	12300.0
68	6700.5
69	4122.0
70	3186.5
71	2526.0
72	1969.5
73	1194.0
74	589.5
75	178.5
76	45.5
77	33.0
78	16.5
79	2.0
80	0.5
81	0.0
82	0.0
83	0.0
84	0.0
85	0.0
86	0.0
87	0.0
88	0.0
89	0.0
90	0.0
91	0.0
92	0.0
93	0.0
94	0.0
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	1.4117295543049385E-4
3	5.813004047137982E-5
4	2.0760728739778507E-5
5	4.9825748975468415E-5
6	8.304291495911403E-5
7	1.7854226716209517E-4
8	8.719506070706974E-5
9	1.0380364369889255E-4
10-14	1.5113810522558754E-4
15-19	1.752205505637306E-4
20-24	1.403425262809027E-4
25-29	2.5992432382202695E-4
30-34	7.191516435459275E-4
35-39	7.299472224906123E-4
40-44	0.0010513233033823837
45-49	9.325719349908506E-4
50-54	5.813004047137982E-4
55-59	3.3881509303318523E-4
60-64	2.6739818616834714E-4
65-69	3.1971523055761443E-4
70-74	3.8365831171525316E-4
75-79	2.6988964843402093E-4
80-84	3.0144634204040194E-4
85-89	4.2102924660146354E-4
90-94	4.160477713857191E-4
95-99	3.296841094750549E-4
100-104	4.559141330823486E-4
105-109	2.6657479220432666E-4
110-114	2.7737389702352894E-4
115-119	2.657510171080373E-4
120-124	2.50806477779879E-4
125-129	1.586263180113349E-4
130-134	1.2457974373066352E-4
135-139	1.1960527170534384E-4
140-144	1.8031643373647352E-4
145-149	1.3553993017355535E-4
150	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
66-67	1.0
68-69	1.0
70-71	1.0
72-73	1.0
74-75	4.0
76-77	13.0
78-79	9.0
80-81	16.0
82-83	14.0
84-85	23.0
86-87	24.0
88-89	26.0
90-91	26.0
92-93	33.0
94-95	46.0
96-97	70.0
98-99	66.0
100-101	76.0
102-103	70.0
104-105	68.0
106-107	96.0
108-109	91.0
110-111	142.0
112-113	134.0
114-115	129.0
116-117	120.0
118-119	142.0
120-121	168.0
122-123	195.0
124-125	245.0
126-127	251.0
128-129	286.0
130-131	358.0
132-133	464.0
134-135	658.0
136-137	1078.0
138-139	2977.0
140-141	6064.0
142-143	10151.0
144-145	75869.0
146-147	774083.0
148-149	1415918.0
150-151	2.1793726E7
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	fail
#Total Deduplicated Percentage	49.64481505348432
#Duplication Level	Percentage of total
1	38.14801864182013
2	10.587962068832384
3	6.240418653203602
4	4.509519120738692
5	3.3291829653861766
6	2.8159674162331862
7	2.3063140878315522
8	1.882353068799208
9	1.6573031189172032
>10	18.50549706661193
>50	4.633879577690577
>100	4.687692412999304
>500	0.41661122901332104
>1k	0.2792805719226052
>5k	0.0
>10k+	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	PolyA	PolyG
1	0.0	3.3217165983645615E-5	0.0	4.152145747955702E-6	2.3667230763347498E-4	2.906502023568991E-5
2	4.152145747955702E-6	1.6608582991822806E-4	0.0	2.0760728739778507E-5	0.001963964938783047	4.1521457479557015E-5
3	8.304291495911404E-6	1.7439012141413945E-4	0.0	2.4912874487734208E-5	0.0031058050194708647	7.473862346320263E-5
4	3.3217165983645615E-5	1.9515085015391797E-4	0.0	2.4912874487734208E-5	0.004675316112198119	8.304291495911403E-5
5	3.7369311731601315E-5	1.9515085015391797E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.0058462212131216275	8.304291495911403E-5
6	6.643433196729123E-5	1.9515085015391797E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.006851040484126907	8.719506070706972E-5
7	7.058647771524692E-5	2.2836801613756357E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.008009489147806548	9.134720645502543E-5
8	9.134720645502543E-5	2.325201618855193E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.010168604936743512	9.549935220298114E-5
9	1.2041222669071534E-4	2.325201618855193E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.013540147284083542	1.0795578944684823E-4
10-11	1.5985761129629452E-4	2.4082445338143068E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.018115811898330725	1.432490283044717E-4
12-13	2.159115788936965E-4	2.4082445338143068E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.0218859602374745	1.80618340036073E-4
14-15	2.2836801613756357E-4	2.532808906252978E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.026100388171649537	2.0760728739778507E-4
16-17	2.7196554649109846E-4	2.78193765113032E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.030549412340584073	2.1591157889369646E-4
18-19	3.1556307684463335E-4	2.927262752308769E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.03430502816961001	2.2421587038960787E-4
20-21	3.986059918037473E-4	3.363238055844118E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.03791739497033146	2.4082445338143068E-4
22-23	4.920292711327506E-4	3.529323885762346E-4	0.0	2.906502023568991E-5	0.04184324877502358	2.574330363732535E-4
24-25	6.165936435714217E-4	3.695409715680574E-4	0.0	3.529323885762346E-5	0.046109578531048065	2.574330363732535E-4
26-27	7.07940850026447E-4	3.695409715680574E-4	0.0	3.7369311731601315E-5	0.05047763585789746	2.698894736171206E-4
28-29	7.536144532539599E-4	3.695409715680574E-4	0.0	4.1521457479557015E-5	0.05483531282037697	2.864980566089434E-4
30-31	8.470377325829632E-4	3.695409715680574E-4	0.0	4.9825748975468415E-5	0.05897292605821483	2.9895449385281046E-4
32-33	8.864831171885423E-4	3.736931173160131E-4	0.0	4.9825748975468415E-5	0.0626683357738954	3.529323885762346E-4
34-35	9.446131576599221E-4	3.736931173160131E-4	0.0	5.190182184944626E-5	0.06592777018604062	3.633127529461239E-4
36-37	9.570695949037892E-4	3.75769190189991E-4	0.0	5.3977894723424115E-5	0.0694633222904249	3.653888258201017E-4
38-39	9.819824693915234E-4	3.882256274338581E-4	0.0	5.813004047137982E-5	0.07342239326110067	3.7369311731601316E-4
40-41	0.001027656072619036	3.923777731818138E-4	0.0	5.813004047137982E-5	0.07663615407001838	3.9030170030783593E-4
42-43	0.0010359603641149474	3.986059918037473E-4	0.0	6.228218621933552E-5	0.07991012099228145	3.986059918037473E-4
44-45	0.001073329675846549	4.0898635617363655E-4	0.0	6.228218621933552E-5	0.08392316985768064	4.0691028329965876E-4
46-47	0.001127307570569973	4.1521457479557015E-4	0.0	6.228218621933552E-5	0.0878158064963891	4.089863561736366E-4
48-49	0.001152220445057707	4.2767101203943723E-4	0.0	6.643433196729123E-5	0.09156934625254107	4.2351886629148154E-4
50-51	0.001166752955175552	4.4427959503126006E-4	0.0	6.643433196729123E-5	0.09575263309360643	4.338992306613708E-4
52-53	0.0012435676515127325	4.4843174077921575E-4	0.0	7.266255058922477E-5	0.0995331617971201	4.380513764093265E-4
54-55	0.0013120780563540017	4.4843174077921575E-4	0.0	7.473862346320263E-5	0.10256422819312776	4.4012744928330436E-4
56-57	0.0013702080968253814	4.5258388652717144E-4	0.0	7.681469633718048E-5	0.10674751503419314	4.4843174077921575E-4
58-59	0.0014158817000528943	4.650403237710386E-4	0.0	8.304291495911403E-5	0.11070658600486888	4.5673603227512714E-4
60-61	0.001459479230406429	4.650403237710386E-4	0.0	9.134720645502543E-5	0.11421722523476543	4.5673603227512714E-4
62-63	0.0015072289065079197	4.7749676101490566E-4	0.0	9.134720645502543E-5	0.11764897369545083	4.5673603227512714E-4
64-65	0.0015529025097354324	4.795728338888835E-4	0.0	9.549935220298114E-5	0.12226823584005153	4.5673603227512714E-4
66-67	0.0015778153842231665	5.107139269985513E-4	0.0	9.549935220298114E-5	0.1261795571346258	4.5673603227512714E-4
68-69	0.0016421736433164798	5.29398582864352E-4	0.0	9.757542507695898E-5	0.12870613782225687	4.650403237710386E-4
70-71	0.0017376729955194611	5.397789472342412E-4	0.0	1.0380364369889254E-4	0.13128462033173732	4.650403237710386E-4
72-73	0.0017833465987469738	5.480832387301526E-4	0.0	1.0795578944684823E-4	0.13396690648491671	4.7749676101490566E-4
74-75	0.001847704857840287	5.56387530226064E-4	0.0	1.0795578944684823E-4	0.13702911397403406	4.8164890676286135E-4
76-77	0.0018954545339417777	5.56387530226064E-4	0.0	1.1003186232082609E-4	0.13935431559288924	4.8164890676286135E-4
78-79	0.0019681170845310026	5.56387530226064E-4	0.0	1.1626008094275964E-4	0.14154457247493588	4.8164890676286135E-4
80-81	0.0020200189063804487	5.56387530226064E-4	0.0	1.1833615381673749E-4	0.14400887097634757	4.837249796368392E-4
82-83	0.0020636164367339835	5.56387530226064E-4	0.0	1.2041222669071534E-4	0.14626556219036152	4.899531982587728E-4
84-85	0.00214458327881912	5.584636031000418E-4	0.0	1.224882995646932E-4	0.14846827550965203	4.899531982587728E-4
86-87	0.0022421587038960787	5.667678945959532E-4	0.0	1.2456437243867104E-4	0.1504945226346544	4.961814168807063E-4
88-89	0.002291984452871547	5.688439674699311E-4	4.152145747955702E-6	1.2456437243867104E-4	0.15252699797827873	5.024096355026399E-4
90-91	0.0023168973273592812	5.813004047137982E-4	4.152145747955702E-6	1.2456437243867104E-4	0.155124165143625	5.065617812505956E-4
92-93	0.0023376580560990597	5.83376477587776E-4	4.152145747955702E-6	1.2456437243867104E-4	0.1576382893940122	5.086378541245734E-4
94-95	0.0023999402423183955	5.875286233357317E-4	4.152145747955702E-6	1.2871651818662674E-4	0.1605904650208087	5.127899998725291E-4
96-97	0.0024829831572775094	5.896046962097096E-4	4.152145747955702E-6	1.2871651818662674E-4	0.1627620372469895	5.14866072746507E-4
98-99	0.0025452653434968452	6.041372063275546E-4	4.152145747955702E-6	1.307925910606046E-4	0.16466371999955323	5.14866072746507E-4
100-101	0.0026511450600697154	6.207457893193773E-4	4.152145747955702E-6	1.3286866393458246E-4	0.16679584684112847	5.14866072746507E-4
102-103	0.0027051229547931394	6.228218621933552E-4	4.152145747955702E-6	1.3286866393458246E-4	0.16850445481641224	5.14866072746507E-4
104-105	0.0027736333596344084	6.290500808152887E-4	4.152145747955702E-6	1.3286866393458246E-4	0.17028572534228525	5.169421456204848E-4
106-107	0.0028400676916017	6.415065180591559E-4	4.152145747955702E-6	1.3702080968253815E-4	0.1717514327913136	5.210942913684405E-4
108-109	0.00297501242841026	6.435825909331338E-4	4.152145747955702E-6	1.3702080968253815E-4	0.1733479328314026	5.231703642424183E-4
110-111	0.0030414467603775515	6.518868824290452E-4	4.152145747955702E-6	1.3702080968253815E-4	0.1748260967176748	5.273225099903741E-4
112-113	0.003114109310966776	6.601911739249565E-4	4.152145747955702E-6	1.3702080968253815E-4	0.17633124955130874	5.314746557383298E-4
114-115	0.0031743154243121336	6.643433196729122E-4	4.152145747955702E-6	1.39096882556516E-4	0.1780585421824583	5.314746557383298E-4
116-117	0.0032407497562794247	6.788758297907572E-4	4.152145747955702E-6	1.4532510117844954E-4	0.1796259772023116	5.314746557383298E-4
118-119	0.0033341730356084283	7.058647771524692E-4	4.152145747955702E-6	1.4740117405242739E-4	0.18120794473228272	5.314746557383298E-4
120-121	0.0034753459910389223	7.203972872703142E-4	4.152145747955702E-6	1.4947724692640526E-4	0.182684032545681	5.314746557383298E-4
122-123	0.0036725729140668177	7.245494330182699E-4	4.152145747955702E-6	1.515533198003831E-4	0.18408122958986806	5.314746557383298E-4
124-125	0.0037618440476478656	7.266255058922477E-4	4.152145747955702E-6	1.5362939267436095E-4	0.1855697738405102	5.314746557383298E-4
126-127	0.003797137286505489	7.328537245141813E-4	4.152145747955702E-6	1.5362939267436095E-4	0.18694621015595753	5.314746557383298E-4
128-129	0.0038469630354809573	7.37005870262137E-4	4.152145747955702E-6	1.5362939267436095E-4	0.18815033242286466	5.314746557383298E-4
130-131	0.003919625586070182	7.432340888840705E-4	4.152145747955702E-6	1.557054655483388E-4	0.18934199825252795	5.335507286123077E-4
132-133	0.004031733521264986	7.432340888840705E-4	4.152145747955702E-6	1.5778153842231665E-4	0.1904049475640046	5.377028743602634E-4
134-135	0.004189515059687303	7.432340888840705E-4	4.152145747955702E-6	1.5778153842231665E-4	0.19143260363662362	5.397789472342412E-4
136-137	0.004351448743857575	7.577665990019156E-4	4.152145747955702E-6	1.5778153842231665E-4	0.1926367259035308	5.397789472342412E-4
138-139	0.0043763616183453095	7.598426718758934E-4	4.152145747955702E-6	1.5985761129629452E-4	0.19369759914213347	5.397789472342412E-4
>>END_MODULE
